Method Article
* Эти авторы внесли равный вклад
Описанные в настоящем описании протоколы обеспечивают руководство по визуализации и количественной оценке активности нейтрофильных протеаз в мокроте человека. Применение такого анализа простирается от оценки противовоспалительных методов лечения до валидации биомаркеров, скрининга лекарств и крупных когортных клинических исследований.
Протеазы являются регуляторами бесчисленных физиологических процессов, и точное исследование их деятельности остается интригующей биомедицинской проблемой. Среди ~ 600 протеаз, кодируемых геномом человека, нейтрофильные сериновые протеазы (NSP) тщательно исследуются на их участие в возникновении и прогрессировании воспалительных состояний, включая респираторные заболевания. Уникально, что секретируемые НСП не только диффундируют во внеклеточных жидкостях, но и локализуются в плазматических мембранах. Во время формирования внеклеточной ловушки нейтрофилов (NETs) НСП становятся неотъемлемой частью секретируемого хроматина. Такое сложное поведение делает понимание патофизиологии НСП сложной задачей. Здесь показаны подробные протоколы для визуализации, количественной оценки и различения активности свободной и связанной с мембраной нейтрофильной эластазы (NE) и катепсина G (CG) в образцах мокроты. NE и CG являются НСП, деятельность которых имеет плейотропную роль в патогенезе муковисцидоза (МВ) и хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ): они способствуют ремоделированию тканей, регулируют иммунные реакции и коррелируют с тяжестью заболевания легких. Протоколы показывают, как отделить жидкую и клеточную фракцию, а также выделение нейтрофилов из мокроты человека для количественной оценки ферментативной активности с помощью маломолекулярных репортеров на основе резонансного переноса энергии Фёрстера (FRET). Для сбора конкретной информации об относительной роли активности NE и CG показания FRET могут быть измерены с помощью различных технологий: i) измерения считывателя пластин in vitro позволяют высокопроизводительно и объемно обнаруживать активность протеазы; ii) конфокальная микроскопия пространственно-временно разрешает мембранно-связанную активность на поверхности клетки; iii) маломолекулярная проточная цитометрия FRET позволяет быстро оценивать противовоспалительные методы лечения с помощью количественной оценки активности одноклеточной протеазы и фенотипирования. Внедрение таких методов открывает двери для изучения патобиологии НСП и их потенциала в качестве биомаркеров тяжести заболевания муковисцидозом и ХОБЛ. Учитывая их потенциал стандартизации, надежное считывание и простоту передачи, описанные методы немедленно могут быть распределены для внедрения в исследовательских и диагностических лабораториях.
Нейтрофильная эластаза (NE), катепсин G (CG), протеиназа 3 (PR3) и нейтрофильная сериновая протеаза 4 (NSP4) являются четырьмя нейтрофильными сериновыми протеазами (NSP)1. Они хранятся вместе с миелопероксидазой в первичных или азурофильных гранулах нейтрофилов. Из-за их повышенного протеолитического содержания секреция первичных гранул жестко регулируется, и нейтрофилы должны последовательно оспариваться с помощью прайминговых и активирующих стимулов2.
Внутри фаголизосомы НСП функционируют как внутриклеточные бактерицидные агенты3. При секреции НСП становятся сильными медиаторами воспаления: они расщепляют цитокины и поверхностные рецепторы, активируя параллельные провоспалительныепути 3. Важно отметить, что воспалительные состояния имеют неконтролируемую секрецию НСП. Например, в воспаленных дыхательных путях чрезмерная активность NE вызывает гиперсекрецию слизи, метаплазию клеток-шарманов, инактивацию CFTR и ремоделирование внеклеточного матрикса4,5. Катепсин G также участвует в воспалении: он специфически расщепляет и активирует два компонента семейства IL-1, IL-36α и IL-36β6. В сочетании с NE CG расщепляет рецепторы, активированные протеазой, на эпителии дыхательных путей, а также активирует TNF-α и IL-1β.
Эндогенные антипротеазы, такие как альфа-1-антитрипсин, альфа-1-антихимотрипсин и секреторный ингибитор лейкоцитарной протеазы, регулируют активность нейтрофильной эластазы и катепсина G5. Однако в ходе прогрессирования заболевания легких непрерывная секреция протеаз превышает стехиометрически антипротеазный щит, что приводит к неразрешающей нейтрофилии в дыхательных путях, обострению воспаления и повреждению тканей5,7. Хотя было показано, что концентрация и активность NE в растворимых фракциях дыхательных путей пациента являются многообещающим биомаркером тяжести заболевания8,NE и CG также связываются с нейтрофильной плазматической мембраной и внеклеточной ДНК посредством электростатических взаимодействий9,10, где они становятся менее доступными для антипротеаз. Важно отметить, что доклинические исследования определили сценарий, в котором клеточная поверхностно-ассоциированная активность протеазы проявляется раньше и/или независимо от ее растворимогоаналога4,11. Фактически, чтобы стать обнаруживаемой, активность свободной протеазы сначала должна подавить антипротеазный щит. Вместо этого на поверхности клетки мембранно-связанная активность протеазы остается, по меньшей мере, частично неповрежденной из-за недоступности крупных ингибиторов к клеточной плазматической мембране12. Такое сложное поведение протеазы имеет важные последствия для начала и распространения воспаления, опосредованного нейтрофилами, и поэтому должно быть исследовано с помощью точных и информативных инструментов.
На протяжении многих лет зонды на основе резонансного переноса энергии Förster (FRET) находили многочисленные биомедицинские применения в качестве инструментов, которые эффективно и быстро оценивают специфическую активность протеазы в образцах человека13. Для функционирования протеазы репортеры состоят из мотива распознавания (то есть пептида), который распознается ферментом-мишенью и полагается на FRET, физический процесс, где при возбуждении донорский флуорофор передает энергию молекуле-акцептору. Обработка, управляемая ферментом на репортере, а именно расщепление распознаваемой части, приводит к тому, что акцептор диффундирует от донора: поэтому активность фермента измеряется как зависящие от времени изменения донора по сравнению с акцепторной флуоресценцией. Такое считывание является самонормализующимся и ратиометрическим, поэтому на него лишь незначительно влияют условия окружающей среды, такие как рН и концентрация в локальном зонде. NEmo-114 и sSAM15 являются зондами FRET, которые сообщают конкретно об активности NE и CG соответственно. Однако такие репортеры не локализуются конкретно в каком-либо клеточном компартменте, поэтому они используются для мониторинга активности протеазы, присутствующей в жидкостях человека. Чтобы контролировать активность протеазы пространственно локализованным образом, мы и другие разработали зонды FRET, которые связываются с субклеточными компонентами через молекулярные метки14,15,16,17,18,19. Такая синтетическая стратегия позволила разработать NEmo-2 и mSAM, два зонда FRET, оснащенные липидными якорями, которые локализуются на плазматической мембране. Эти репортеры способствовали более глубокому пониманию протеаз NE и CG при муковисцидозе и хронических обструктивных заболеваниях легких14,15.
Здесь представлены подробные протоколы для визуализации и количественной оценки растворимой и связанной с мембраной активности NE и CG в мокроте человека с помощью зондов NEmo и SAM серий FRET. Для решения различных аспектов патофизиологии NSP и предоставления массива методов, которые могут быть использованы в соответствии с потребностями конкретного пользователя, показан анализ с помощью флуоресцентной спектроскопии, флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии.
Следующие протоколы описывают анализ, выполненный на мокроте человека. Обработка образцов человека была одобрена комитетом по этике Гейдельбергского университета, и письменное информированное согласие было получено от всех пациентов или их родителей / законных опекунов (S-370/2011) и здоровых контрольных (S-046/2009).
ПРИМЕЧАНИЕ: Следующие протоколы описывают пробоподготовку и количественную оценку активности нейтрофильных сериновых протеаз (NSP). Экспериментальные процедуры, представленные в настоящем описании, сосредоточены на измерении активности мокроты человека и нейтрофильной эластазы14,20,21 (NE) или катепсина G15 (CG). Однако незначительные изменения в протоколе пробоподготовки делают возможным анализ клеток крови и гомогенатов опухоли. Кроме того, активность матриксной металлопротеиназы 12 и катепсина S может быть исследована аналогичным образом с помощью специализированных зондов FRET22,23,24,25,26.
1. Пробоподготовка: изоляция клеток и разделение супернатантов
ПРИМЕЧАНИЕ: По возможности обработку мокроты следует проводить в течение 120 мин после отхаркивания и хранить мокроту на льду до дальнейшей обработки.
2. Измерение активности нейтрофильной сериновой протеазы
ПРИМЕЧАНИЕ: Здесь представлены различные методы количественной оценки активности НСП с помощью репортеров FRET. Выбор технологии продиктован конкретным биомедицинским вопросом и целью эксперимента. Представленные зонды были тщательно протестированы на их специфичность по отношению к набору легочных соответствующих ферментов14,15. Хотя зонды специфичны для их целевого фермента, всегда проверяйте специфичность зонда на интересуемом клиническом образце. Это может быть достигнуто путем инкубации образца со специфическим ингибитором протеазы перед добавлением зонда, что должно отменить любое увеличение соотношения D/A.
Рисунок 1:Репрезентативные изображения и количественная оценка мембранно-связанной NE-активности на нейтрофилах, выделенных из мокроты пациента с муковисцидозом. a) Репрезентативные конфокальные микроскопические изображения нейтрофилов, предварительно инкубированных (верхняя панель) в течение 10 мин со 100 мкМ Сивелестата (ж/) или оставленных без обработки (без/о) (нижняя панель) перед добавлением репортера NEmo-2 (2 мкМ). В первом столбце слева показано ядерное пятно, во втором — донорский канал, в третьем — акцепторный канал и в последнем — расчетное соотношение D/A, полученное путем деления донорского и акцепторного каналов на попиксельной основе. Границы интересуемой области (одиночный нейтрофил) изображены пунктирной линией. Указаны шкала (10 мкм) и калибровочные стержни (отношение D/A). b)Коробочные и точечные графики, показывающие соотношение D/A нейтрофилов мокроты у репрезентативного пациента с муковисцидозом. Клетки, инкубированные с ингибиторными и необработанными клетками, показаны серым и синим цветом соответственно. Каждая точка представляет одну клетку (N: w/ ингибитор = 113 и без ингибитора = 96). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 2:Стратегия гастировки и репрезентативные графики мембранно-связанной NE активности, измеренные на нейтрофилах, выделенных из мокроты пациента с муковисцидозом. Длязащиты нейтрофилов мокроты используются следующие антитела: CD14 (1:50), CD16 (1:50), CD45 (1:33) и CD66b (1:50). Нейтрофилы закрыты как 7-AAD-CD45+CD14-CD16+CD66b+ события. Закрытые события анализируются для их донора (λexc= 405 нм, λem= 450/50 нм) и акцептора (λexc= 405 нм, λem= 585/42 нм) средней интенсивности флуоресценции (MFIs). b)Репрезентативные гистограммы нейтрофилов мокроты CF, проанализированные на предмет их мембранно-связанной NE активности. Левый столбец показывает сигнал донора, правый столбец показывает сигнал акцептора. Верхняя строка показывает среднюю интенсивность флуоресценции клеток, обработанных Сивелестатом (w/) в течение 10 мин до добавления репортера. В нижнем ряду показаны необработанные (без) клетки, репортерная флуоресценция которых измеряется сразу (0 мин, серый) и 10 мин (синий) после добавления репортера. Нейтрофилы закрыты в соответствии со стратегией, показанной на панели a. c)В таблице данных показан репрезентативный набор данных, состоящий из необработанных МФУ для донора и акцепторного сигнала о нейтрофилах, измеренных в течение нескольких временных точек (0-3-5-10-15-20 мин), а также расчетное соотношение D/A. Соотношение D/A можно нормализовать, т.е. до 0 мин точки времени (белый шрифт). 0 мин указывает на запись, сделанную как можно скорее после добавления репортера в проточную трубку с окрашенными клетками мокроты. Данные МФО показаны как среднее ± стандартного отклонения для 1000 нейтрофилов. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Результаты, показанные на рисунке 1a, иллюстрируют репрезентативный набор данных микроскопии. Ядерный сигнал используется для идентификации нейтрофилов по их характерным сегментодержатым ядрам. Интересуемая область (ROI) выбирается вручную (пунктирная линия на рисунке 1a). Изображение с соотношением D/A рассчитывается путем деления интенсивностей донорского канала на интенсивности акцепторного канала по попикселям. На последнем этапе рассчитывается среднее отношение D/A на ячейку (ROI). На рисунке 1b каждая точка представляет собой среднее значение одного ROI (нейтрофила). Рекомендуется изобразить и оценить около 100 клеток на состояние.
Репрезентативная стратегия гетирования проточной цитометрии показана на рисунке 2а. Такое гатирование позволяет различать и изучать нейтрофилы мокроты. Чтобы избежать флуоресцентных побочных эффектов или компенсационных артефактов, рекомендуется посвятить лазерную линию (например, синий лазер) для обнаружения флуоресценции зонда FRET. Флуоресцентная компенсация проточной цитометрии должна выполняться для антител, а не для зонда FRET. На рисунке 2b показано распределение МФО через 0 и 10 минут после добавления репортера. Каждая строка на рисунке 2c показывает средние значения донорских и акцепторных МФО для 1000 нейтрофилов мокроты. Коэффициент D/A рассчитывается путем деления донорских и акцепторных МФО. Течение времени на рисунке 2c с правой стороны показывает прогрессию измерения: после быстрого начального увеличения соотношение D/A достигает плато, в соответствии с активностью мембранно-связанного фермента.
Представленные протоколы объясняют различные подходы к количественной оценке активности нейтрофильной эластазы и катепсина G в образцах мокроты человека. Критическими точками для успешного измерения активности ферментов являются: i) точное время и стандартизация оперативной процедуры и ii) использование надежных отрицательных и положительных средств контроля. При условии, что эти условия соблюдены, описанные методы не ограничиваются мокротой, но также могут быть легко адаптированы к анализу активности протеазы в крови, жидкостях бронхоальвеолярного лаважа и срезах тканей или гомогенатах.
Каждая из трех техник имеет свои сильные стороны и ограничения, которые часто дополняют друг друга. Например, проточная цитометрия позволяет проводить быстрый анализ редких клеточных популяций, а также фенотипирование клеток, но не имеет пространственной информации о разрешении, что может быть достигнуто с помощью микроскопии. Вместо этого измерения считывателя пластин позволяют проводить параллельную оценку нескольких образцов или условий с высокой пропускной способностью. Поскольку свежие клетки мокроты не могут быть заморожены и сохранены, три метода требуют, чтобы образцы были быстро обработаны после отхаркивания. Это ограничивает гибкость или пропускную способность измерений активности, связанной с мембраной. Разработка протокола проточной цитометрии, позволяющее фиксировать клетки после добавления зонда и ферментативного расщепления, открыла бы параллельное измерение большего числа трубок. Кроме того, особое внимание следует уделять обращению и хранению зондов FRET. Фактически, некоторые аминокислоты, присутствующие в пептидном субстрате, такие как метионин, подвергаются окислению, что приводит к снижению репортерной чувствительности. Для увеличения срока годности репортера (по оценкам, около трех месяцев при 20 °C) их можно хранить в небольших объемных аликвотах (1-2 мкл) под инертным газом, таким как азот или аргон.
При муковисцидозе и других хронических воспалительных заболеваниях легких важно обнаружить воспаление как можно раньше, а надежные биомаркеры имеют потенциал для достижения такой цели. Возможность обнаружения поверхностно-связанной активности НСП, которая, как было показано, вредна для окружающих тканей, также в условиях, когда отсутствует или мало свободной активности NE, добавляет еще один уровень ценной информации, который вряд ли может быть достигнут с помощью других существующих методов4,11.
Репортеры могут быть использованы для изучения связи связанной с мембраной активности НСП с тяжестью и прогрессированием заболевания легких, особенно в его раннем начале. Методы могут быть использованы для мониторинга эффективности лечения (например, противовоспалительных методов лечения или высокоэффективных модуляторов CFTR и потенциаторов28)и исследования результирующего ослабления воспаления, вызванного нейтрофилами. Кроме того, протоколы основаны на неинвазивных процедурах отбора проб, которые несут очень низкий риск для пациента и, следовательно, могут использоваться в очень широком масштабе и открывать двери для многочисленных захватывающих применений.
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Этот проект был поддержан грантами Министерства образования и исследований Германии (FKZ 82DZL004A1 до M.A.M) и Немецкого исследовательского фонда (SFB-TR84TP B08 to M.A.M). Работа, описанная в этой рукописи, была поддержана Немецким центром исследований легких (DZL) и EMBL Heidelberg через стипендию PhD для M.G. Мы благодарим Й. Шаттерни, С. Бутца и Х. Шойермана за экспертную техническую помощь.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
100 µm Nylon cell strainer | Corning Inc. | 431752 | |
2300 EnSpire (Multilabel Plate Reader) | PerkinElmer | ||
35x10mm Dish, Nunclon Delta | Thermo Fisher Scientific | 150318 | |
40 µm Nylon cell strainer | Corning Inc. | 431750 | |
50 mL tubes | Sarstedt | 10535253 | |
7-AAD, viability dye | Bio Legend | 420404 | 5 µL/100 µL |
Balance | OHAUS Instruments (Shanghai) Co., Ltd. | PR124 | |
BD Falcon Round-Bottom Tubes 5 mL | BD Bioscience | 352054 | |
BD LSRFortessa cell analyzer | BD Bioscience | ||
black flat bottom 96 well half area plate | Corning Life Science | 3694 | |
Cathepsin G | Elastin Products Company | SG623 | |
Cathepsin G Inhibitor I | Merck KGaA | 219372 | |
Centrifuge 5418R | Eppendorf AG | EP5401000137 | |
Combitips advanced 1.0 mL | Eppendorf AG | 0030 089 430 | |
cOmplete proteinase inhibitor | Roche | 11697498001 | |
Countig chambers improved Neubauer | Glaswarenfabrik Karl Hecht GmbH & Co KG | 40442 | |
coverslips Ø 25mm | Thermo Fisher Scientific | MENZCB00250RA003 | |
Cytospin 4 | Thermo Fisher Scientific | ||
DRAQ5 (nuclear stain) | BioStatus Limited | DR50050 | 1:10000 |
FACSDiva software, v8.0.1 | BD Bioscience | ||
FcBlock | BD Bioscience | 564219 | |
Fiji (Fiji Is Just ImageJ) | fiji.sc | ||
Flow Jo software, v10 | TreeStar | ||
FluoQ Plugin, v3-97 | |||
Heraeus Megafuge 16R | Thermo Fisher Scientific | ||
Human Sputum Leucocyte Elastase | Elastin Products Company | SE563 | |
Leica SP8 confocal microscope | Leica Microsystems | ||
Mini Rock-Shaker | PEQLAB Biotechnologie GmbH | MR-1 | |
mouse anti-human CD14, Pe-Cy7, clone M5E2 | BD Bioscience | 557742 Lot:8221983 | 1:50 |
mouse anti-human CD16, AF700, clone 3G8 | BD Bioscience | 557820 Lot:8208791 | 1:50 |
mouse anti-human CD45, APC-Cy7, clone 2D1 | BD Bioscience | 557833 Lot:8059688 | 1:33 |
mouse anti-human CD66b, PE/Dazzel 594, clone G10F5 | BioLegend | 305122 Lot:B241921 | 1:50 |
mSAM | in house | 2 mM | |
Multipette plus | Eppendorf AG | ||
NEmo-1 | SiChem | SC-0200 | 1 mM |
NEmo-2E | SiChem | SC-0201 | 2 mM |
Pari Boy SX with an LC Sprint jet nebulizer | Pari | 085G3001 | |
phosphate buffered saline | Gibco | 10010-015 | |
ROTI Histokitt (mounting medium) | Carl Roth GmbH + Co.KG | 6638.1 | |
Salbutamol | Teva GmbH | ||
Sivelestat | Cayman Chemicals | 17779 | |
Sputolysin | Calbiochem | 560000-1SET | |
sSAM | in house | 2 mM | |
SuperFrost Plus Adhesion slides | Thermo Fisher Scientific | 10149870 | |
Trypan Blue solution | Sigma-Aldrich | T8154 |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены