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Eliminación de compuestos ramificados y cíclicos por aducción de Urea para Uk'Paleothermometry37

Visión general

Fuente: Laboratorio de Jeff Salacup - Universidad de Massachusetts Amherst

Como se mencionó en anteriores videos, el producto de una extracción con disolvente orgánico, un extracto total de lípidos (TLE), suele ser una mezcla compleja de cientos, si no miles, de diferentes compuestos. El investigador a menudo solamente está interesado en un puñado de compuestos. En el caso de nuestros dos paleothermometers orgánicos (Uk'37 y MBT/TCC), el interés es de sólo 6 compuestos (2 alkenones y 4 isoprenoidal glicerol thioureas glicerol tetraethers). Como comentamos en los anteriores dos videos de esta serie, pueden aplicarse técnicas de purificación con el fin de comparar el número de compuestos en una muestra analizada. Estas técnicas pueden químicamente alterar los componentes no deseados (saponificación), tomar ventaja de la química compuesto diferentes (cromatografía de columna) o usar las diferentes formas y tamaños de las moléculas para incluir o excluir ciertos componentes de los análisis (aducción de urea). La estructura atómica de los diferentes productos químicos lleva algunos compuestos orgánicos para formar largos, estrechos, cadenas rectas (n-alcanos y alkenones), otros compuestos orgánicos para formar estructuras cíclicas complejas, otras para formar estructuras muy ramificadas, y otros que forman ambos cíclico y las estructuras (GDGTs) (figura 1). Las diferentes formas y tamaños de los compuestos en una muestra pueden utilizarse para separar uno del otro, en la misma forma como un clasificador de monedas separa monedas de diferentes denominaciones (tamaños).

Figure 1
Figura 1. Comparación de estructuras químicas diferentes. Decano, un alcano de cadena recta (A; de http://www.bpc.edu/mathscience/chemistry), ciclohexano, un alcano cíclico (B; http://www.bpc.edu/mathscience/chemistry), un esteroide, un hidrocarburos poli cíclicos (C; www.wikiwand.com) y 2, 2-dimetilbutano, un alcano ramificado (D; www.wikimedia.com). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Procedimiento

1. configuración y preparación de materiales

  1. Obtener un total de lípidos extracto (TLE) utilizando un método de extracción por solvente (sonicación, Soxhlet o extracción acelerada de disolvente (ASE)).
  2. Comprar los siguientes materiales a cualquier distribuidor de productos químico: combustión de borosilicato de vidrio pipetas y bulbos; agua pura; hexano; Diclorometano (DCM); metanol; de la urea.
    1. Los reactivos deben ser puro y libre de hidrocarburos. Alternativamente, el agua pura se puede

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Resultados

Esta técnica de purificación produce dos frascos diferentes. una marcada aducción, que contienen compuestos de cadena recta y raramente ramificadas, y otro con la etiqueta no aducción, que contengan compuestos altamente ramificados y cíclicos. Este procedimiento ha disminuido enormemente la complejidad de cualquier muestra para su análisis en un instrumento. Esta disminución en complejidad es a menudo crucial para el análisis preciso de los compuestos objetivo. Por ejemplo, en lug...

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Aplicación y resumen

Aducción de urea es a menudo utilizada en la purificación de los n-alcanos, componentes comunes de la cera de la hoja, para eliminar compuestos Co liberador antes de isótopos. Las proporciones de isótopo de carbono e hidrógeno de ceras de la hoja en plantas contienen información sobre las rutas metabólicas y las condiciones ambientales de la planta utilizado y vivido, respectivamente. Para determinar los cocientes del isótopo, cantidades muy grandes de compuesto se deben cargar en un GC. Tales grandes cantidades ...

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Overview

0:56

Principles of Urea Adduction

3:10

Size Exclusion with Urea Crystals

4:40

Separating the Included and Excluded Organic Compounds

5:30

Applications

7:23

Summary

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