Para comenzar la fusión de genes asociados a enfermedades, coloque los archivos TXT previamente guardados de cinco bases de datos que contengan el nombre de la hierba, la identificación del ingrediente, la identificación del gen y el script Disease. R en la misma carpeta. Abre el código R.
Copie y pegue la ruta donde se almacena el archivo TXT en la línea donde se encuentra el setwd en el código R. Abra el software R. Ejecute el código R modificado y haga clic en Guardar.
Establezca el gen y asigne un nombre al archivo Disease.txt. Abre el sitio web del diagrama de Venn. En la sección Entrada, copie y pegue el contenido de texto ya guardado en la lista.
Asigne un nombre al contenido con la base de datos respectiva. y haga clic en Enviar. Haga clic en Guardar imagen como PNG debajo de la imagen y guarde el resultado del texto en la misma carpeta.
Coloque el archivo alltargets.symbol. txt y la enfermedad. txt en la misma carpeta.
Abre el código R. Copie y pegue la ruta donde se almacena el archivo txt en la línea donde se encuentra el setwd en el código R. Abra el software R.
Ejecute el código R modificado y haga clic en Guardar. Establezca el gen y asigne un nombre al archivo Drug_Disease.txt. Abre el sitio web del diagrama de Venn.
En la sección Entrada, copie y pegue alltargets.symbol. txt y Enfermedad. txt en la lista y asigne un nombre a los archivos.
Haga clic en Guardar imagen como PNG debajo de la imagen y guarde los resultados del texto en la misma carpeta. Abra el sitio web de cadenas y haga clic en Proteína múltiple. Haga clic en Examinar y cargue el DrugDisease.
Txt. y, a continuación, seleccione Homo sapiens en Organismos. Haga clic en BUSCAR, seguido de CONTINUAR.
Ahora, haga clic en Configuración y establezca la puntuación de interacción mínima requerida en la confianza más alta. En la opción Visualización de red, marque Ocultar nodos desconectados en la red y, a continuación, haga clic en ACTUALIZAR>Ajuste los nodos en el diagrama de red para que no haya superposición ni oclusión. Haga clic en Exportaciones, seguido de Descargar como mapa de bits de alta resolución para obtener el mapa de la red de interfuncionamiento de proteínas en formato PNG, descargue el archivo TSV como una salida de texto tabular breve.
Guarde los archivos PNG y TSV en una carpeta unificada.