Los autores desarrollaron este enfoque utilizando nuestras observaciones del trabajo llevado a cabo por Walter Boynton y Pete Sampou y el trabajo cooperativo en la desnitrificación con Todd Kana en la Universidad de Maryland Centro de Ciencia Ambiental. Desarrollo de nuestros enfoques de desnitrificación no habría sido posible sin el apoyo del Programa Sea Grant de Maryland y la Fundación Nacional de Ciencia. Los datos representativos utilizados aquí fueron recogidos con fondos de Maryland Sea Grant (R / AQ-5c) y la escritura de los esfuerzos fueron apoyados por Maryland Sea Grant (R / SV-2), la Oficina de NOAA Chesapeake Bay (NA13NMF4570210), la Asociación para la Recuperación de la ostra , la Fundación Nacional de Ciencia (OCE1427019), Exelon Corporation, y el Servicio de Medio Ambiente de Maryland / Maryland Administración de los Puertos.

Nota: La colección de núcleos con interfaces de sedimentos de aguas inalteradas es esencial para hacer buenas mediciones experimentales de intercambio; núcleos altamente perturbadas es probable que el intercambio de solutos agua de los poros con agua suprayacente y han mejorado la captación de oxígeno a través de la oxidación de Fe (II) y compuestos de azufre reducido. En este trabajo, hacemos hincapié en los procedimientos de incubación de sedimentos de sedimentos con sólo una somera inclusión de técnicas de muestreo de sedimentos y de los análisis químicos de los solutos y gases. Antes de la toma de muestras, o sobre la base de los resultados iniciales, determinar el grado de replicación de las necesidades generales del proyecto, el diseño estadístico o cantidad esperada de la variabilidad espacial pequeña escala. núcleos duplicados son el mínimo utilizado por muchos estudios y triplicados son útiles para permitir un mejor análisis estadístico. 1. Recolección y Manejo de Sedimentos Nota: La colección de sedimentos para los experimentos de cambio se lleva a cabo por medio de 1) la inserción manual de núcleos USIng buzos o en aguas poco profundas o humedales, vadeando, 2) polo de extracción de muestras utilizando una pértiga de aluminio con una válvula de cierre manual para retener sedimentos, o 3) Caja de extracción de muestras. <ol><li> En cada sitio, registrar la ubicación del sitio a través de GPS, determinar la parte inferior de oxígeno del agua, la temperatura, la salinidad y el uso de una sonda de calidad de agua, y determinar la radiación fotosintéticamente activa (PAR) en la superficie y el fondo usando un sensor de PAR / metro. <ol><li> Bajar la calidad del agua sonde a ~ 1 m por encima del sedimento y registrar las características del agua de fondo (profundidad, temperatura, oxígeno disuelto, temperatura y salinidad / conductividad). </li><li> Bajar un sensor PAR con una sonda submarina a la interfase agua-sedimento usando un marco de descenso. Comparar PAR lecturas cerca de la superficie del sedimento a las lecturas PAR inmediatamente por debajo de la interfase aire-agua para estimar la atenuación de la luz en las condiciones de luz ambiental. </li><li> Desplegar un nucleador de caja sobre el lado de la embarcación / nave, bajándolo lentamente para minimizar las perturbacionesal penetrar el sedimento. Examina la caja de machos correspondiente a la alteración visible o resuspensión excesiva. <ol><li> Para un nucleador de caja, insertar tubos centrales en el sedimento, y el uso de tapones de caucho butílico para cubrir la parte superior del núcleo. Para los experimentos de flujo, mientras que el equilibrio ideal sedimento / agua dentro del núcleo es de 15 cm de agua y 15 cm de sedimento, en grueso o sedimentos altamente compactados recogida de menos profundidad de sedimentos es un resultado aceptable. Si las tasas de agotamiento del oxígeno son excesivos, cambiar el equilibrio hacia una mayor altura de la columna de agua. </li><li> Típicamente utilizar de 6,35 cm de diámetro núcleos internos para estudios de aguas profundas y de los sedimentos con microalgas bentónicas o grandes poblaciones de animales, utilizar 10 cm núcleos de identificación. El límite principal para el tamaño del núcleo es la capacidad de limitar la parte inferior del núcleo. </li><li> Tapar el fondo con una placa de fondo de acrílico que tiene una junta tórica incrustada. Repita este proceso hasta que se recogen suficientes repeticiones. Con el extractor de polos, en primer lugar la placa de fondo de acrílico en el núcleo de liner, retire el núcleo de la descorazonador, y añadir el tapón. </li></ol></li></ol></li><li> Coloque los núcleos en un enfriador de agua con aislamiento de altura que se inunda con agua a temperatura ambiente desde el sitio; esto ayuda a mantener las temperaturas in situ. Asegúrese de que el refrigerador permanece en posición vertical. Desechar núcleos que están perturbados durante el transporte. </li><li> Bombear el agua residual tomada cerca de la superficie del sedimento en 20 bombonas L para su uso en los experimentos. Utilice una bomba de diafragma con 10-20 L / min o capacidad de una bomba peristáltica de alta velocidad. <ol><li> En aguas poco profundas no estratificado, llenar la bombona de &quot;mojar&quot; en el agua. La filtración del agua de fondo utilizando un filtro de cartucho en línea de alta capacidad puede ser útil en sitios con altas tasas de captación de columna de agua de oxígeno o la fotosíntesis (a la luz), lo que minimiza la corrección de la columna de agua sólo núcleos de control. </li></ol></li><li> Transportar los núcleos lo más rápidamente posible a la instalación de incubación. En el caso del transporte prolongado, aerOBIC núcleos pueden llegar a ser burbujeo o circulación anóxica y artificial son necesarios. </li></ol> 2. Configuración inicial <ol><li> En las instalaciones de incubación, lugar núcleos en una bañera de incubación o bien en una sala de ambiente con temperatura controlada, o en un incubador de doble pared con control de temperatura a través de un circulador de calefacción / refrigeración. Ajuste la temperatura a la temperatura del agua de fondo medidos en 1.1.1. </li><li> Añadir agua del fondo de la incubadora, sumergiendo completamente los núcleos de sedimentos. También añadir agua a 5 L bombonas con grifos que serán utilizados para dispensar agua de repuesto. </li><li> Añadir un núcleo de sólo agua (sin sedimento) a la incubadora. El uso de espacios en blanco de columna de agua es importante en la mayoría de los entornos para compensar cualquier procesos de columna de agua que afectan a los gases y los solutos. Para la medición de la desnitrificación, estas piezas en bruto pueden reflejar no sólo los procesos de columna de agua, pero el intercambio de gases con las paredes de acrílico del núcleo. </li><li> núcleos de burbujas waire ITH durante un mínimo de 2 horas para asegurar el equilibrio térmico y completo oxigenación de agua situada por encima. Ellos pueden mantenerse durante la noche y cursos de tiempo iniciaron la mañana siguiente. Largos períodos de preincubación no han sido evaluadas para la eficacia. <ol><li> Para la aireación, utilizar una pequeña burbujeador de &quot;T&quot; que consiste en ½ &quot;tubo de PVC con un acoplador de tres vías; un&quot; tubo de 1/8 insertado a la parte inferior de los resultados T en el arrastre de agua hacia arriba durante el burbujeo y no solamente asegura la oxigenación, pero la circulación del agua en el núcleo con el agua en la bañera de incubación. </li></ol></li></ol> 3. Procedimientos de incubación de sedimentos de aguas <ol><li> Después de comprobar la temperatura para asegurarse de que coincide con las condiciones de campo, adjuntar trompos a las copas de los núcleos. En este punto, sellar el núcleo desde el tanque de agua. Deje la válvula de toma de muestras en el núcleo abierto durante este proceso. barrer manualmente las burbujas de aire suavemente desde el lado inferior de la peonza. </li><li> Elevados el agua de reemplazo bombona ~ 30-40 cm más alto que las copas de los núcleos de incubación y purga de los conductos hacia abajo para eliminar el aire de la línea. Mientras que aún fluye, fije las líneas a la parte superior del núcleo y cerrar las válvulas. </li><li> Girar en el plato giratorio de agitación central y ajustar la velocidad de rotación de modo que los núcleos giran ~ 40 veces por minuto, o a una velocidad que es suficiente para mezclar la columna de agua, pero no volver a suspender el sedimento. </li><li> Aproximadamente 5 minutos después de todos los núcleos están selladas, abra la válvula de agua de reposición y la válvula de la muestra, y luego coloque un trozo corto de tubo a la válvula de muestra usando un adaptador Luer. Coloque este tubo de muestreo en la parte inferior de un tubo de vidrio 7 ml, que se llena a rebosar. Antes de tapar el tubo, añadir 10 l de 30 g L -1 HgCl 2 como conservante. <ol><li> Almacenar estas muestras bajo el agua a temperaturas cercanas a la temperatura de incubación. Otros laboratorios han utilizado con éxito 12 ml &quot;exeteiners&quot; para sample de almacenamiento. </li></ol></li><li> Para el muestreo de soluto, adjuntar un tubo de la jeringa 20 ml a la válvula de muestra y abrir la válvula de agua de repuesto. El cuerpo de la jeringa llena hasta la total utilizando sólo la gravedad. Adjuntar un émbolo y un disco de filtro, y luego filtrar las muestras en viales. Estas muestras para análisis de nutrientes se congelan a -20 ° C hasta su análisis. Nota: El curso del tiempo de toma de muestras en la oscuridad implica típicamente 4 periodos de muestreo con los intervalos entre muestreo que van desde 0,5 a&gt; 2 hr, dependiendo de la tasa de consumo de oxígeno. Con bajas tasas de consumo de oxígeno, los intervalos de tiempo son largos; en los sedimentos con altas tasas de respiración, los intervalos deben ser breves. Excesivamente grandes volúmenes de muestra tomadas en cada punto de muestra puede resultar en un muestreo demasiado grande una proporción de todo el volumen de la muestra; en nuestro trabajo estos volúmenes de muestra dan lugar a una corrección insignificante. Si es necesario un mayor volumen de la muestra, núcleos de mayor diámetro o una mayor altura de columna de aguapuede ser necesario. </li><li> No continúe con un curso de tiempo de muestreo por debajo de un umbral de agotamiento del oxígeno del 50%, con agotamiento de oxígeno del 25% por lo general proporcionan suficiente señal en las concentraciones de nutrientes. A continuación, utilice optodes calibrados para el análisis directo de las concentraciones de oxígeno y la saturación de oxígeno. <ol><li> Si los sedimentos son de ambientes de poca profundidad, sistema de iluminación, en la 4ª toma de muestras, encender las luces y tomar 3 muestras posteriores. Tenga en cuenta que en los sedimentos altamente fotosintéticos, la sobresaturación de O 2 y la formación de burbujas limita la medición de los flujos de gases en algunos casos. El monitoreo continuo de oxígeno es una alternativa cada vez más viable y valiosa, con la tecnología de medición de fibra óptica que tiene relativamente pequeñas sondas que son altamente confiable y precisa. </li></ol></li><li> Al término de las incubaciones de sedimentos, ya sea medir la altura de la columna de agua o un sifón en la columna de agua a un cilindro graduado para determ directamenteINE el volumen de agua, y tomar fotos de cada núcleo. </li></ol> Análisis 4. Muestra <ol><li> Muestras de bombeo para el análisis de N2, O2 y Ar en una membrana de entrada espectrómetro de masas, y determinar las proporciones de N 2: Ar y O2: Ar a &lt;0,03% de precisión 12,23. <ol><li> Pareja de un espectrómetro de masas de cuadrupolo a una entrada de la membrana. Empuje la muestra en el tubo de membrana usando una bomba peristáltica. Recoger los residuos de la muestra en un bidón de plástico y el tratamiento como residuos químicos debido a la conservación de Hg. Calibrar con agua desionizada equilibrada con aire a la temperatura de incubación. </li></ol></li><li> Realizar análisis de nutrientes en forma manual ≤ 5 ml de muestras o en volúmenes más pequeños usando analizadores automatizados. Tras la descongelación de la muestra, inicio analiza inmediatamente. La elección del procedimiento de análisis de nutrientes debe ceder una precisión suficiente para observar los cambios en la concentración de nutrientes durante la incubación. detección típicalímites son &lt;tendencias 0,05 mol L -1 y transcurso del tiempo pueden ser difíciles de observar en ambas concentraciones extremadamente bajas y muy altas de nutrientes. <ol><li> Para los análisis colorimétricos de fósforo reactivo soluble, utilizar la técnica de fosfomolibdato ácido ascórbico. Para los análisis de amonio, utilizar un desarrollo de color durante la noche utilizando un reactivo de hipoclorito de fenol 24. Automatizado de análisis colorimétricos, ya sea utilizando el flujo segmentado o un analizador discreto, son una gran alternativa y utilizar un volumen de muestra menor. </li><li> Para los análisis de nitrato más nitrito, utilizar el desarrollo de color durante la noche utilizando cloruro de vanadio como un reductor 25, o utilizar un analizador automático </li><li> Comparación de absorbancias determinaron en un espectrofotómetro UV / VIS a las curvas de calibración y determinar las concentraciones de una regresión de las concentraciones de normalización y absorbancias. </li></ol></li></ol> 5. Cálculo de intercambio agua-sedimento tarifas <ol><li> Una regresión de las concentraciones de gas o de nutrientes en función del tiempo de forma independiente para ambas incubaciones oscuridad como de iluminación, con la pendiente expresada en mol L -1 -1 hr. Corregir las laderas de los núcleos de incubación para la pendiente de los núcleos de la columna de sólo agua. Sólo utilice regresiones significativas (P &lt;0,05) para los cálculos; identificar los datos no significativos en las hojas de cálculo de datos finales. </li><li> Calcular las tasas de cambio de agua y sedimento de la pendiente del cambio de las concentraciones de constituyentes químicos en el agua suprayacente: <img alt="Ecuación 1" src="/files/ftp_upload/54098/54098equation1.jpg" /> Donde F es el flujo (mol m -2 -1 hr),? C / Dt es la pendiente del cambio de concentración en el agua suprayacente (mol L -1 hr -1), V es el volumen del agua suprayacente (L) y A es el área del núcleo se incubaron (m -2) .Para estimar el flujo diario, multiplicar la tasa iluminada por las horas de luzy añadir a la tasa oscuro multiplicado por las horas de oscuridad. </li></ol> 6. Presentación de informes <ol><li> Al informar sobre los resultados de las mediciones de cambio de sedimento-agua, proporcionar información suficiente para que otros científicos a entender el ambiente que ha sido muestreada. La información esencial incluye: 1) la ubicación del sitio y de la profundidad del agua, 2) las características físicas, tales como el campo y la temperatura de incubación, y el PAR, 3) las características del agua de fondo, como el oxígeno, la concentración de nutrientes y salinidad, y 4) las características del sedimento, como el tamaño de grano, las concentraciones de materia orgánica, y la presencia de animales bentónicos. </li></ol>

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Distribution, abundance and primary production.</a> Estuaries. 19, 186-201 (1996).</li><li>Aller, R. C., Mackin, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Open-incubation,+diffusion+methods+for+measuring+solute+reaction+rates+in+sediments.">Open-incubation, diffusion methods for measuring solute reaction rates in sediments.</a> J. Mar. Res. 47, 411-440 (1989).</li></ol>

Los autores no tienen nada que revelar.

La técnica descrita aquí se ha aplicado a numerosos tipos de sistemas acuáticos, tanto superficiales y profundas, y hemos encontrado que funciona bien en la mayoría de las circunstancias. Este enfoque fue adaptado de los enfoques utilizados por los colegas y presentados en la literatura; que está optimizado para la medición de desnitrificación a través de membrana de espectrometría de masas de entrada. Uno de los puntos fuertes de este método es la capacidad de manejar un gran número de núcleos de forma simultánea. Replicación de cada sitio con duplicado o triplicado núcleos aumenta la confianza en las mediciones, aunque un enfoque alternativo es el de maximizar los sitios con menos de replicación, bajo estas circunstancias, el valor medio para un segmento del medio ambiente puede ser más representativo de la variabilidad en la naturaleza. Para dilucidar las diferencias estacionales, una serie de tiempo de medición en un menor número de sitios puede ser una estrategia útil. En este protocolo, hay varios pasos críticos. De suma importancia para hacer smediciones Uccessful es la colección de núcleos con una interfaz agua-sedimento intactos. Aunque el rechazo de los núcleos que no cumplan este criterio en el campo puede ser agotador, núcleos pobres conducirán a una mala exactitud y precisión. Mantener núcleos aeróbicas airea y cerca de la temperatura colección original reducirá al mínimo los artefactos y mantener las poblaciones microbianas y metazoos sanas, intactas. Por último, para O 2 y N 2 muestras, la adición de conservante cloruro de mercurio es crítica. Hemos observado que la preservación inadecuada de las muestras de gas, incluyendo el calentamiento excesivo y el enfriamiento de los viales, puede poner en peligro estas mediciones de flujo. Otros laboratorios han empleado con éxito 7.0 M ZnCl2 como conservante menos tóxico que tiene menores costes de eliminación de residuos; para un 7 ml de muestra de una adición de 30 l es la adecuada. El análisis preciso y exacto de la relación de N 2 y Ar es clave para la determinación de la N 2 </sub&gt; fundentes. Observada N 2: Ar proporciones cambian en función de la concentración de oxígeno que lleva a algunos investigadores a abogar por la eliminación de oxígeno antes del análisis, en general, el uso de cobre calentada 28. La instrumentación utilizada en nuestro laboratorio se utilizó para determinar el efecto del oxígeno en N 2: Ar relaciones 23 y se encontró que el efecto sea muy pequeño, &lt;0,03% para el agotamiento del oxígeno modesto. Las diferencias en el enfoque para evaluar el oxígeno &quot;efecto&quot; parecen conducir a conclusiones diferentes por diferentes investigadores 23,28,29. Una gran efecto del oxígeno en N 2: relaciones Ar erróneamente conducirían a altas tasas de flujo de salida de N 2 N; en nuestra experiencia, tenemos muchas observaciones de N 2 insignificante -N flujo de salida a alta tasa de agotamiento de oxígeno. En los laboratorios en los que el efecto del oxígeno en N 2: relaciones de Ar aparecen grande, una alternativa útil es la medición independiente de las concentraciones de oxígeno usando electrodos o optodes y oxígenola eliminación a partir del análisis de espectrometría de masas utilizando Cu climatizada en línea. Solución de problemas de esta técnica es posible sólo después de un examen de los datos de flujo de sedimentos. Los factores clave a considerar cuando se regresiones son pobres si están agitación fue continua, se tomaron muestras y se conservan correctamente, y si el tiempo cursos eran demasiado corto para permitir la estimación de las tasas bajas. La longitud de experimentos generalmente se establece mediante el curso temporal de oxígeno, con bajas tasas de metabolismo que requiere incubaciones más largas para aumentar la relación señal a ruido incorporado en las regresiones del curso de tiempo. Las altas tasas de producción de oxígeno que producen O 2 burbujas hacen que los flujos de gases difícil, pero los flujos de soluto no pueden ser afectados. Es necesario comprender las limitaciones de este enfoque. Los pequeños núcleos cubren el 0,3% de un metro cuadrado y los núcleos más grandes cubren el 0,6%. En sitios con una heterogeneidad significativa en la escala del medidor, las distribuciones heterogéneas de animELA o plantas pueden sugerir que uno o dos núcleos pueden no ser una representación suficiente. También hay algunos entornos que presentan dificultades de medición. Para la medición de la desnitrificación, la presencia de metano o de oxígeno burbujas puede invalidar la técnica, con N 2: relaciones de Ar influenciados por la incorporación diferencial de los gases en las burbujas. En sedimentos colonizados por microalgas bentónicas, la formación de los resultados de burbujas de oxígeno en un decapado preferencial de N 2 con respecto a Ar, y la disminución de la N 2: relación de Ar. En general, no podemos medir la desnitrificación en el punto donde se forman burbujas. ambientes anaeróbicos plantean diferentes desafíos, y la aireación de núcleos cambia la dinámica redox en la interfase agua-sedimento. Sellamos hasta núcleos con las tapas de agitación inmediatamente después de la recolección y comenzamos los flujos sin tener que reemplazar la columna de agua por completo 30. Nuestros experimentos con sedimentos iluminados típicamente han saturación o casi saturacing niveles de iluminación 31, y por lo tanto maximizar el efecto de microalgas bentónicas. mediciones de cambio de sedimentos de agua son una medida del flujo neto de materiales a través de la interfaz agua-sedimento. Sin embargo, estas mediciones solo a menudo no pueden identificar los mecanismos que controlan estos intercambios interfaciales. Si la pregunta de investigación implica la comprensión de los mecanismos, otra información sobre la reactividad de la materia orgánica, la terminal de zonificación receptor de electrones, bioirrigation y bioturbación y organismos fotosintéticos que sean necesarias. Modelado esfuerzos 7 pueden requerir la determinación de la composición química del agua de los poros, las mediciones directas de la reactividad de la materia orgánica de 32 años, el número de poblaciones de animales, los sedimentos bio-irrigación, la acumulación de sedimentos, o manipulaciones experimentales de redox o que recubre la química del agua 13. En nuestros estudios, el intercambio de datos buena sedimento-agua es un componente clave de la comprensión de la química de los sedimentos acuáticos,y en conjunción con otras mediciones, se identifica el papel de los procesos de reciclaje de sedimentos en los ciclos biogeoquímicos acuáticos. Con el cuidado con respecto a la manipulación de sedimentos, control de temperatura, y la mezcla de columna de agua, las incubaciones núcleo son un enfoque útil para la estimación de la intercambio de solutos y gases en la interfase agua-sedimento. Sin embargo, las técnicas utilizadas aquí pueden necesitar modificaciones para algunos ambientes y para la logística difíciles, como los períodos de tiempo prolongados antes de la incubación. Hasta el momento, hemos aplicado con éxito este enfoque, a las desembocaduras de incubación,, humedal, lago, embalse, río y laguna de retención ambientes costeros con modificaciones mínimas.

Los sedimentos son componentes críticos biogeoquímicos de los ecosistemas acuáticos y, a menudo son importantes sumideros de nutrientes y contaminantes. Estudios pioneros de nutrientes, el gas y la biogeoquímica de metales de transición en los sedimentos lacustres revelan el intercambio de sedimentos de solutos y gases con agua suprayacente que había diferentes condiciones redox 1,2. Para los elementos de nutrientes, los sedimentos pueden ser una fuente de fósforo y nitrógeno fijado después de la remineralización de la materia orgánica, y un sumidero de oxígeno en ambientes no fotosintéticos 3,4. La fotosíntesis de los macrófitos sumergidos, macroalgas y microalgas bentónicas puede tener una profunda influencia sobre el intercambio de sustancias disueltas a través de la interfase agua-sedimento 5,6. Las mediciones del intercambio de solutos y gases a través de la interfase agua-sedimento se llevan a cabo tanto para la ciencia básica y ciencia aplicada propósitos, incluyendo la calibración de la ingeniería y científica water modelos de calidad 7,8. El objetivo de estos métodos, en la mayor medida posible, es proporcionar los tipos de cambio de sedimentos de agua fiable y precisa. Una amplia variedad de enfoques se han utilizado para evaluar intercambio químico en la interfase agua-sedimento. La acumulación de agua de fondo de los gases y solutos en sistemas estratificados puede ser útil 9, pero no es válido para el intercambio de sedimento-agua por encima de la termoclina o pycnoclines. correlación Eddy requiere mediciones de alta frecuencia de los gases, generalmente oxígeno, en combinación con la medición de alta frecuencia de las velocidades verticales de agua; esta técnica tiene una enorme promesa, pero actualmente no pueden proporcionar datos para estudios de intercambio de nutrientes. En cúpulas situ o cámaras son un método muy preferida, con la ventaja de cubrir una mayor superficie de los sedimentos y el mantenimiento de las temperaturas in situ, las presiones de aguas profundas y los niveles de luz 10. En la práctica, se trata de medidas muy costosas que requieren tiempo extensoen los buques de investigación más grandes; la mayoría de las aplicaciones son las zonas costeras o en los sedimentos oceánicos profundos. Utilizando técnicas de incubación núcleo flujo a través de las cámaras que alcanzan el estado estacionario son excelentes para mantener la química del agua suprayacente relativamente constante, incluyendo oxígeno, durante las incubaciones 11. Debido a que la tasa se determina en estado estacionario por las diferencias de concentración entre entrante y el agua que fluye hacia fuera, y por los tipos de cambio de agua, estas incubaciones pueden tomar una cantidad considerable de tiempo. El enfoque básico de incubación del curso del tiempo utilizado por nuestro laboratorio fue adaptado de enfoques utilizados por un número de diferentes laboratorios en América del Norte y Europa, y hay una cantidad considerable de la literatura sobre la base de este enfoque general. Se adaptó este método para la medición de los flujos de N 2 N 12, a menudo referida como la desnitrificación, y hemos aplicado a entornos fotosintéticos y sedimentos no fotosintética, incluyendo estuaries 13, lagos, embalses y humedales 14. A través de estos estudios hemos encontrado muchos entornos en los que nuestro enfoque general funciona bien, y algunos en los que no ocurre. La medición de la desnitrificación se ha realizado en muchos entornos terrestres y acuáticos diferentes porque este proceso representa una pérdida clave de nitrógeno a los ecosistemas. Numerosos enfoques se han utilizado para realizar mediciones de desnitrificación, algunos directa y algunos indirecta 15. Mediciones de flujo N 2 directos son muy difícil debido a la alta contenido atmosférico N 2, y altas concentraciones posteriores disueltos en agua 16. Dos enfoques han surgido como tener la mejor representación de las tasas relativas al medio ambiente: el emparejamiento de isótopos usando N isótopos 17 y la N proporción de 2: Ar utilizado en nuestro laboratorio. El método de isótopos de emparejamiento se ha utilizado con éxito en muchos entornos y tiene una sensibilidad muy alta a tasas bajas. Empleamos el N2: Enfoque Ar relación debido a su simplicidad, y porque es lo suficientemente sensible en los entornos afectados a menudo estudio. En este trabajo se describe el enfoque técnico que hemos utilizado durante las últimas dos décadas para hacer la medición del cambio de agua-sedimento de gases y solutos. Cualquier medida de intercambio de agua-sedimento deben tener en cuenta las condiciones de campo y una serie de parámetros experimentales. Estos factores incluyen la temperatura, condiciones de luz / oscuridad de 18, el flujo de la mezcla / física en la interfase agua-sedimento 19, 20 concentraciones de oxígeno disuelto, y otros factores que son elementos clave de la toma de buenas mediciones. Por ejemplo, si los núcleos son recogidos de las zonas que reciben la suficiente iluminación para el crecimiento de microalgas bentónicas, es necesario diseñar experimentos que incluyen tanto condiciones de luz y oscuridad de 21. Del mismo modo, la adición de agua oxigenada al suprayacente anóxica núcleosno replica las condiciones del campo. Recinto experimental de cualquier parte de los ecosistemas acuáticos pueden dar lugar a artefactos inevitables 22; es fundamental que los enfoques utilizados en un programa de medición de intercambio agua-sedimento 1) reconocen los factores que controlan el intercambio de agua-sedimento en cada ecosistema y 2) reducir al mínimo los artefactos derivados de la manipulación experimental.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="638">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="64">
			<td height="64" style="height:64px;width:179px;">Multiparameter sonde - temperature, oxygen, salinity</td>
			<td style="width:135px;">YSI</td>
			<td style="width:123px;">&#34;</td>
			<td style="width:203px;">Any high quality equipment will suffice</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">PAR Measurement</td>
			<td style="width:135px;">Li-Cor</td>
			<td align="right" style="width:123px;">6050000</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Pole corer</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="49">
			<td height="49" style="height:49px;width:179px;">Box corer</td>
			<td style="width:135px;">DK-Denmark</td>
			<td style="width:123px;">HAPS Corer</td>
			<td style="width:203px;">We also use light box coring equipment</td>
		</tr>
		<tr height="67">
			<td height="67" style="height:67px;width:179px;">Small core tubes with o-ring fitted bottom, 3&#39; OD, 2.5&#39; Id.</td>
			<td style="width:135px;">various plastics companies</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Clear acrylic</td>
		</tr>
		<tr height="67">
			<td height="67" style="height:67px;width:179px;">Medium core tubes with o-ring, 4.5&#34; od, 4&#34; id</td>
			<td style="width:135px;">various plastics companies</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Clear acrylic</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Butyl stopper size 13.5</td>
			<td style="width:135px;">generic</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Stirring turntable</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Incubation tub</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Replacement water carboy</td>
			<td style="width:135px;">Nalgene</td>
			<td style="width:123px;">2320-0050</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">7 mL glass stoppered tube</td>
			<td style="width:135px;">Chemglass</td>
			<td style="width:123px;">not on inventory</td>
			<td style="width:203px;">&#34;Exetainers&#34; used by other labs</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">20 mL plastic syringe</td>
			<td style="width:135px;">generic</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Syringe filters</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Plastic tubing</td>
			<td style="width:135px;">Tygon</td>
			<td style="width:123px;">ACF00004-CP</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:179px;">Compact Fluorescent Lights</td>
			<td style="width:135px;">Apollo Horticulture</td>
			<td style="width:123px;">CFL 8U 250W</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the benthic exchange of o2, n2 and dissolved nutrients using small core incubations

The measurement of sediment-water exchange of gases and solutes in aquatic sediments provides data valuable for understanding the role of sediments in nutrient and gas cycles. After cores with intact sediment-water interfaces are collected, they are submerged in incubation tanks and kept under aerobic conditions at in situ temperatures. To initiate a time course of overlying water chemistry, cores are sealed without bubbles using a top cap with a suspended stirrer. Time courses of 4-7 sample points are used to determine the rate of sediment water exchange. Artificial illumination simulates day-time conditions for shallow photosynthetic sediments, and in conjunction with dark incubations can provide net exchanges on a daily basis. The net measurement of N2 is made possible by sampling a time course of dissolved gas concentrations, with high precision mass spectrometric analysis of N2:Ar ratios providing a means to measure N2 concentrations. We have successfully applied this approach to lakes, reservoirs, estuaries, wetlands and storm water ponds, and with care, this approach provides valuable information on biogeochemical balances in aquatic ecosystems.

Los resultados de las mediciones de flujo de sedimentos cerca de una instalación de acuicultura en el río Choptank (Chesapeake Bay, MD) se muestran en la Figura 1 y la interpretación de estos resultados en el contexto del ecosistema se presentan en otro lugar 26. Las incubaciones se llevaron a cabo durante 7 horas, con incubaciones oscuro seguido de datos incubaciones iluminados. Los datos de los dos núcleos se muestran, así como la columna de agua solamente a controlar. La rápida disminución de oxígeno en la oscuridad fue atenuada en cierta medida por la iluminación; la tasa de fotosíntesis de la producción de microalgas no fue tan alta como la respiración, con el principal efecto de la iluminación de ser una disminución de la tasa de cambio de oxígeno. El núcleo de control experimentó una pequeña disminución en la concentración de oxígeno en la oscuridad y pequeños aumentos en la luz. Las concentraciones de N 2 se determinaron por el N 2: relación de Ar y lavalores de la literatura saturación calculados Ar para la temperatura y la salinidad observada 27. En una precisión típica de 0,02% para el N 2: relación de Ar, estos datos son precisos a ~ 0,1 mol L -1 N 2. Los núcleos de sedimentos y los núcleos en blanco la columna de agua tuvieron aumentos en N2 a través del tiempo, con tasas mucho más altas de aumento de los núcleos. Bajo iluminación, pistas fueron generalmente similares a la tasa oscura de N2 cambio. Flujos de disuelto NH 4 + eran bastante alto en este sitio, con aumento oscuro de&gt; 20 mol L -1 para un núcleo. Iluminadas NH 4 + flujos eran mucho más bajos. Ambos núcleos y en blanco la columna de agua habían disminución de NOx - concentración con el tiempo, la nivelación durante la iluminación. Para todos los flujos, los datos de concentración y los datos sobre el volumen del núcleo y otros parámetros relevantes se muestran en la <st<html> rong&gt; Tablas 1 y 2. <img alt="Figura 1" src="/files/ftp_upload/54098/54098fig1.jpg" /> Figura 1. Tiempo de datos de cursos de un sitio de aguas poco profundas en el río Choptank que estaba cubierto con flotadores que contienen ostras cultivadas. Los datos proceden de núcleos repetidas (A y B) y los datos de una columna en blanco de agua se muestran. Las concentraciones de oxígeno N 2, NH 4 + y NO x - (la suma de NO 3 - y NO 2 - se presentan tanto para la parte oscura de la incubación (área sombreada) y para la parte iluminada de la incubación, el cuarto tiempo. punto de la incubación oscura es también el primer punto de la serie temporal iluminada tiempo; las luces se encendieron en el momento de la toma de muestras las líneas son regresiones lineales y las pendientes se presentan en la Tabla 1..98 / 54098fig1large.jpg &quot;target =&quot; _ blank &quot;&gt; Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura. <table fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td fo:width="1.8in" style="width:220px"> Oxígeno - Dark </td><td> Tiempo (h) </td><td> Core A </td><td> núcleo B </td><td> Controlar </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 235.1 </td><td> 221,7 </td><td> 235.2 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 204.3 </td><td> 170,6 </td><td> 235.3 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 162,7 </td><td> 138,9 </td><td> 232 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 145,3 </td><td> 77.9 </td><td> 222,2 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,943 </td><td> 0,999 </td><td> 0,836 </td></tr><tr><td> Pendiente (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> -23.5 </td><td> -35.9 </td><td> -3,4 </td></tr><tr><td> Pendiente corregida (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> -20.1 </td><td> -32.5 </td><td></td></tr><tr><td> Tasa (mol m -2 h -1) </td><td></td><td> -3095 </td><td> -4875 </td><td></td></tr><tr><td> Oxígeno - Luz </td><td> Tiempo (h) </td><td> Core A </td><td> núcleo B </td><td> Controlar </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 145,3 </td><td> 77.9 </td><td> 222,2 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 133,5 </td><td> 68.8 </td><td> 224.3 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 122,8 </td><td> 40.3 </td><td> 221,6 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 116 </td><td> 49.2 </td><td> 230,5 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,981 </td><td> 0,999 </td><td> 0,994 </td></tr><tr><td> Pendiente (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> -10.1 </td><td> -9.8 </td><td> 2.9 </td></tr><tr><td> Pendiente corregida (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> -13 </td><td> -12.7 </td><td></td></tr><tr><td> Tasa (mol m -2 h -1) </td><td></td><td> -2.000 </td><td> -1905 </td><td></td></tr><tr><td> N 2 - Dark </td><td> Tiempo (h) </td><td> Core A </td><td> núcleo B </td><td> Controlar </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 466.46 </td><td> 466,40 </td><td> 466,62 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 466,74 </td><td> 467,49 </td><td> 466,11 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 467,55 </td><td> 468,18 </td><td> 466,74 </td></tr><tr><td&gt; </td><td> 3.97 </td><td> 468,24 </td><td> 468,98 </td><td> 467,12 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,963 </td><td> 0.98 </td><td> 0,854 </td></tr><tr><td> Pendiente N 2 (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> 0,471 </td><td> 0,645 </td><td> 0.12 </td></tr><tr><td> Pendiente corregida N2 (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> 0,351 </td><td> 0,525 </td><td></td></tr><tr><td> La dosis de N 2 -N (mol m -2 h -1) </td><td></td><td> 108.1 </td><td> 157,5 </td><td></td></tr><tr><td> N 2 - Luz </td><td> Tiempo (h) </td><td> Core A </td><td> núcleo B </td><td> Controlar </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 468,24 </td><td> 468,98 </td><td> 467,12 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 468,84 </td><td> 469,21 </td><td> 467,26 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 469,39 </td><td> 469,71 </td><td> 467,47 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 469,62 </td><td> 470,04 </td><td> 467,41 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0.96 </td><td> 0,987 </td><td> 0,967 </td></tr><tr><td> Pendiente N 2 (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> 0,481 </td><td> 0,378 </td><td> 0,096 </td></tr><tr><td> Pendiente corregida N2 (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> 0,386 </td><td> 0,282 </td><td></td></tr><tr><td> La dosis de N 2 -N (mol m -2 h -1) </td><td></td><td> 118,9 </td><td> 84.6 </td><td></td></tr><tr><td> Núcleo Superficie (m 2) </td><td></td><td> 0.003165 </td><td> 0.003165 </td><td></td></tr&gt; <tr><td> Volumen del núcleo (L) </td><td></td><td> 0.4874 </td><td> 0.4747 </td><td></td></tr></tbody></table> . Tabla 1. Datos del campo Tiempo de O 2 y N 2 de los sedimentos por debajo de los flotadores de ostras de la acuicultura en el río Choptank, un subestuary de la Bahía de Chesapeake Las concentraciones de gas se derivan de O 2: Ar y N2: Ar proporciones determinadas por la entrada de membrana espectrometría de masas. Los valores de tiempo de 2 curso de regresión R son significativas para valores&gt; 0.9025 (P &lt;0,05). Las pendientes son determinados por regresión lineal y las pendientes corregidas se determinan restando la velocidad de cambio de la columna de agua solamente en blanco. tasas positivas son flujos netos fuera de los sedimentos, las tasas negativas indican flujo en el sedimento. Los datos de flujo N 2 se expresan como N 2 -N, haciendo compaRison en NH 4 + y NO x - flujos más fácil. Este sitio tenía sedimentos que consiste principalmente de limo y arcilla con las condiciones de la columna de agua totalmente aeróbicas. El área de los núcleos fue 31,65 cm -2 y las profundidades de columna de agua fueron de 15,4 cm de núcleo A y 15,0 para el núcleo B. Todas las concentraciones de N2 y O2 son mol L -1. La tasa final de N2 flujo se expresa en N 2 -N. <table fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td fo:width="1.8in" style="width:220px"> NH4 + - Dark </td><td> Tiempo (h) </td><td> Core A </td><td> núcleo B </td><td> Controlar </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 10.84 </td><td> 14.09 </td><td> 6.91 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 16.19 </td><td> 20.26 </td><td> 5.83 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 17.07 </td><td> 24.93 </td><td> 5.42 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 22.83 </td><td> 35.43 </td><td> 4.67 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,968 </td><td> 0,993 </td><td> 0,853 </td></tr><tr><td> Pendiente (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> 2.88 </td><td> 5.36 </td><td> -0.53 </td></tr><tr><td> Pendiente corregida (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> 3.41 </td><td> 5.89 </td><td></td></tr><tr><td> Tasa (mol m -2 h -1) </td><td></td><td> 525 </td><td> 884 </td><td></td></tr><tr><td> NH4 + - Luz </td><td> Tiempo (h) </td><td> Core A </td><td> núcleo B </td><td> Controlar </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 22.83 </td&gt; <td> 35.43 </td><td> 4.67 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 24.05 </td><td> 36.45 </td><td> 4.13 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 25.00 </td><td> 37.60 </td><td> 3.79 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 26.96 </td><td></td><td></td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,978 </td><td> 1 </td><td> 0,966 </td></tr><tr><td> Pendiente (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> 1.37 </td><td> 1.13 </td><td> -0.55 </td></tr><tr><td> Pendiente corregida (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> 1.92 </td><td> 1.68 </td><td></td></tr><tr><td> Tasa (mol m -2 h -1) </td><td></td><td> 296 </td><td> 252 </td><td></td></tr><tr><td> NO x - - Dark </td><td> Tiempo (h) </td><td> Core A </td><td> núcleo B </td><td> Controlar </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 4.12 </td><td> 4.01 </td><td> 4.53 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 3.82 </td><td> 3.58 </td><td> 4.43 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 3.70 </td><td> 3.25 </td><td> 4.28 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 3.19 </td><td> 2.64 </td><td> 4.19 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,976 </td><td> 0,992 </td><td> 0,967 </td></tr><tr><td> Pendiente (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> -0,229 </td><td> -0,345 </td><td> -0,089 </td></tr><tr><td> Pendiente corregida (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> -0.14 </td><td> -0,256 </td><td></td></tr><tr><td> Tasa (mol m -2 h -1) </td><td></td><td> -21.6 </td><td> -38.4 </td><td></td></tr><tr><td> NO x - - Luz </td><td> Tiempo (h) </td><td> Core A </td><td> núcleo B </td><td> Controlar </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 3.19 </td><td> 2.64 </td><td> 4.19 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 3.06 </td><td> 2.59 </td><td> 4.06 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 3.18 </td><td> 2.41 </td><td> 4.02 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 2.95 </td><td> 2.35 </td><td> 4.2 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,934 </td><td> 0,909 </td><td> 0,9 </td></tr><tr><td> Pendiente (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> -0,078 </td><td> -0,103 </td><td> 0 </td></tr><tr><td> Pendiente corregida (mol L -1 h -1) </td><td></td><td> -0,078 </td><td> -0,103 </td><td></td></tr><tr><td> Tasa (mol m -2 h -1) </td><td></td><td> -12 </td><td> -15.5 </td><td></td></tr><tr><td> Núcleo Superficie (m 2) </td><td></td><td> 0.003165 </td><td> 0.003165 </td><td></td></tr><tr><td> Volumen del núcleo (L) </td><td></td><td> 0.4874 </td><td> 0.4747 </td><td></td></tr></tbody></table> Tabla 2. Datos de evolución en el tiempo de NH 4 + y NO x - a partir de los mismos núcleos de sedimentos utilizados para la Tabla 1. El tiempo del curso de regresión R 2 valores son significativos para valores&gt; 0.9025 (P &lt;0,05). Las pendientes son determinados por regresión lineal y las pendientes corregidas se determinan restando la velocidad de cambio de la columna de agua solamente en blanco. tasas positivas son flujos netosde los sedimentos, las tasas negativas indican flujo en el sedimento. Todas las concentraciones de NH 4 + y NO 2 - son mol L -1.

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The Benthic Exchange of O2, N2 and Dissolved Nutrients Using Small Core Incubations

Here, we present small core incubations for the measurement of sediment-water gas and solute exchange. These will provide reliable measurements of sediment-water exchange that assess the role of sediment in influencing biological and biogeochemical processes in aquatic ecosystems.

El intercambio de O bentónica<sub&gt; 2</sub&gt;, N<sub&gt; 2</sub&gt; y nutrientes disueltos usando pequeños incubaciones Core

The measurement of sediment-water exchange of gases and solutes in aquatic sediments provides data valuable for understanding the role of sediments in ...

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Research

JoVE Journal

Environment

The Benthic Exchange of O2, N2 and Dissolved Nutrients Using Small Core Incubations

9.5K vistas.  University of Maryland Center for Environmental Science. Here, we present small core incubations for the measurement of sediment-water gas and solute exchange. These will provide reliable measurements of sediment-water exchange that assess the role of sediment in influencing biological and biogeochemical processes in aquatic ecosystems. 

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Measuring Fluxes of Mineral Nutrients and Toxicants in Plants with Radioactive Tracers

Unidirectional influx and efflux of nutrients and toxicants, and their resultant net fluxes, are central to the nutrition and toxicology of plants. Radioisotope tracing is a major technique used to measure such fluxes, both within plants, and between plants and their environments. Flux data obtained with radiotracer protocols can help elucidate the capacity, mechanism, regulation, and energetics of transport systems for specific mineral nutrients or toxicants, and can provide insight into compartmentation and turnover rates of subcellular mineral and metabolite pools. Here, we describe two major radioisotope protocols used in plant biology: direct influx (DI) and compartmental analysis by tracer efflux (CATE). We focus on flux measurement of potassium (K+) as a nutrient, and ammonia/ammonium (NH3/NH4+) as a toxicant, in intact seedlings of the model species barley (Hordeum vulgare L.). These protocols can be readily adapted to other experimental systems (e.g., different species, excised plant material, and other nutrients/toxicants). Advantages and limitations of these protocols are discussed.

In planta measurement of nutrient and toxicant fluxes is essential to the study of plant nutrition and toxicity. Here, we cover radiotracer protocols for influx and efflux determination in intact plant roots, using potassium (K+) and ammonia/ammonium (NH3/NH4+) fluxes as examples. Advantages and limitations of such techniques are discussed.

Flujos de nutrientes minerales y sustancias tóxicas de medición en plantas con Trazadores Radiactivos

Unidirectional influx and efflux of nutrients and toxicants, and their resultant net fluxes, are central to the nutrition and toxicology of plants. ...

Investigación

Medio ambiente

Sediment Core Sectioning and Extraction of Pore Waters under Anoxic Conditions

We demonstrate a method for sectioning sediment cores and extracting pore waters while maintaining oxygen-free conditions. A simple, inexpensive system is built and can be transported to a temporary work space close to field sampling site(s) to facilitate rapid analysis. Cores are extruded into a portable glove bag, where they are sectioned and each 1-3 cm thick section (depending on core diameter) is sealed into 50 ml centrifuge tubes. Pore waters are separated with centrifugation outside of the glove bag and then returned to the glove bag for separation from the sediment. These extracted pore water samples can be analyzed immediately. Immediate analyses of redox sensitive species, such as sulfide, iron speciation, and arsenic speciation indicate that oxidation of pore waters is minimal; some samples show approximately 100% of the reduced species, e.g. 100% Fe(II) with no detectable Fe(III). Both sediment and pore water samples can be preserved to maintain chemical species for further analysis upon return to the laboratory.

A protocol for sectioning sediment cores and extracting pore waters under anoxic conditions in order to permit analysis of redox sensitive species in both solids and fluids is presented.

Sedimentos Core y Secciones Extracción de Pore aguas bajo condiciones anóxicas

We demonstrate a method for sectioning sediment cores and extracting pore waters while maintaining oxygen-free conditions. A simple, inexpensive system is ...

A Protocol for Collecting and Constructing Soil Core Lysimeters

Leaching of nutrients from land applied fertilizers and manure used in agriculture can lead to accelerated eutrophication of surface water. Because the landscape has complex and varied soil morphology, an accompanying disparity in flow paths for leachate through the soil macropore and matrix structure is present. The rate of flow through these paths is further affected by antecedent soil moisture. Lysimeters are used to quantify flow rate, volume of water and concentration of nutrients leaching downward through soils. While many lysimeter designs exist, accurately determining the volume of water and mass balance of nutrients is best accomplished with bounded lysimeters that leave the natural soil structure intact. 
Here we present a detailed method for the extraction and construction of soil core lysimeters equipped with soil moisture sensors at 5 cm and 25 cm depths. Lysimeters from four different Coastal Plain soils (Bojac, Evesboro, Quindocqua and Sassafras) were collected on the Delmarva Peninsula and moved to an indoor climate controlled facility. Soils were irrigated once weekly with the equivalent of 2 cm of rainfall to draw down soil nitrate-N concentrations. At the end of the draw down period, poultry litter was applied (162 kg TN ha-1) and leaching was resumed for an additional five weeks. Total recovery of applied irrigation water varied from 71% to 85%. Nitrate-N concentration varied over the course of the study from an average of 27.1 mg L-1 before litter application to 40.3 mg L-1 following litter application. While greatest flux of nutrients was measured in soils dominated by coarse sand (Sassafras) the greatest immediate flux occurred from the finest textured soil with pronounced macropore development (Quindocqua).

A detailed method for extraction and assembly of intact soil core lysimeters and their use for study of leachate and associated loss of nutrients from surface applied poultry litter is demonstrated.

Un protocolo de recogida y la construcción de Lisímetros testigo del suelo

Leaching of nutrients from land applied fertilizers and manure used in agriculture can lead to accelerated eutrophication of surface water. Because the ...

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and detritus, and excreting particulate and dissolved compounds, they serve as important agents for benthic-pelagic coupling. Accurately measuring the compounds removed and excreted by suspension feeders (such as sponges, ascidians, polychaetes, bivalves) is crucial for the study of their physiology, metabolism, and feeding ecology, and is fundamental to determine the ecological relevance of the nutrient fluxes mediated by these organisms. However, the assessment of the rate by which suspension feeders process particulate and dissolved compounds in nature is restricted by the limitations of the currently available methodologies. Our goal was to develop a simple, reliable, and non-intrusive method that would allow clean and controlled water sampling from a specific point, such as the excurrent aperture of benthic suspension feeders, in situ. Our method allows simultaneous sampling of inhaled and exhaled water of the studied organism by using minute tubes installed on a custom-built manipulator device and carefully positioned inside the exhalant orifice of the sampled organism. Piercing a septum on the collecting vessel with a syringe needle attached to the distal end of each tube allows the external pressure to slowly force the sampled water into the vessel through the sampling tube. The slow and controlled sampling rate allows integrating the inherent patchiness in the water while ensuring contamination free sampling. We provide recommendations for the most suitable filtering devices, collection vessel, and storing procedures for the analyses of different particulate and dissolved compounds. The VacuSIP system offers a reliable method for the quantification of undisturbed suspension feeder metabolism in natural conditions that is cheap and easy to learn and apply to assess the physiology and functional role of filter feeders in different ecosystems.

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

We introduce the VacuSIP, a simple, non-intrusive, and reliable method for clean and accurate point sampling of water. The system was developed and evaluated for the simultaneous collection of the water inhaled and exhaled by benthic suspension feeders in situ, to cleanly measure removal and excretion of particulate and dissolved compounds.

VacuSIP, un método mejorado para InEx<em&gt; In Situ</em&gt; Medición de las partículas y compuestos disueltos procesada por Alimentadores Active Suspension

Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and ...

A Simple Approach to Manipulate Dissolved Oxygen for Animal Behavior Observations

The ability to manipulate dissolved oxygen (DO) in a laboratory setting has significant application to investigate a number of ecological and organismal behavior questions. The protocol described here provides a simple, reproducible, and controlled method to manipulate DO to study behavioral response in aquatic organisms resulting from hypoxic and anoxic conditions. While performing degasification of water with nitrogen is commonly used in laboratory settings, no explicit method for ecological (aquatic) application exists in the literature, and this protocol is the first to describe a protocol to degasify water to observe organismal response. This technique and protocol were developed for direct application for aquatic macroinvertebrates; however, small fish, amphibians, and other aquatic vertebrates could be easily substituted. It allows for easy manipulation of DO levels ranging from 2 mg/L to 11 mg/L with stability for up to a 5 min animal-observation period. Beyond a 5 min observation period water temperatures began to rise, and at 10 min DO levels became too unstable to maintain. The protocol is scalable to the study organism, reproducible, and reliable, allowing for rapid implementation into introductory teaching labs and high-level research applications. The expected results of this technique should relate dissolved oxygen changes to behavioral responses of organisms.

This article describes a simple and reproducible protocol to manipulate dissolved oxygen conditions in a laboratory setting for animal behavior studies. This protocol may be used in both teaching and research laboratory settings to evaluate organismal response of macroinvertebrates, fishes, or amphibians to changes in dissolved oxygen concentration.

Un enfoque simple para manipular el oxígeno disuelto para las observaciones de comportamiento animal

The ability to manipulate dissolved oxygen (DO) in a laboratory setting has significant application to investigate a number of ecological and organismal ...

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. Yet the in situ study of DOM is difficult as the molecular complexity of the DOM pool cannot be easily reproduced for experimental purposes. Nutrient additions to streams however, have been shown to repeatedly alter the in situ and ambient DOM pool. Here we demonstrate an easily replicable field-based method for manipulating the ambient pool of DOM at the ecosystem scale. During nutrient pulse experiments changes in the concentration of both dissolved organic carbon and dissolved organic nitrogen can be examined across a wide-range of nutrient concentrations. This method allows researchers to examine the controls on the DOM pool and make inferences regarding the role and function that certain fractions of the DOM pool play within ecosystems. We advocate the use of this method as a technique to help develop a deeper understanding of DOM biogeochemistry and how it interacts with nutrients. With further development this method may help elucidate the dynamics of DOM in other ecosystems.

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Dissolved organic matter provides an important source of energy and nutrients to stream ecosystems. Here we demonstrate a field-based method to manipulate the ambient pool of dissolved organic matter in situ through easily replicable nutrient pulses.

La comprensión de materia orgánica disuelta Biogeoquímica través<em&gt; In Situ</em&gt; Nutrientes Las manipulaciones en la corriente de los ecosistemas

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. ...

Continuous Instream Monitoring of Nutrients and Sediment in Agricultural Watersheds

Pollutant concentrations and loads in watersheds vary considerably with time and space. Accurate and timely information on the magnitude of pollutants in water resources is a prerequisite for understanding the drivers of the pollutant loads and for making informed water resource management decisions. The commonly used &#34;grab sampling&#34; method provides the concentrations of pollutants at the time of sampling (i.e., a snapshot concentration) and may under- or overpredict the pollutant concentrations and loads. Continuous monitoring of nutrients and sediment has recently received more attention due to advances in computing, sensing technology, and storage devices. This protocol demonstrates the use of sensors, sondes, and instrumentation to continuously monitor in situ nitrate, ammonium, turbidity, pH, conductivity, temperature, and dissolved oxygen (DO) and to calculate the loads from two streams (ditches) in two agricultural watersheds. With the proper calibration, maintenance, and operation of sensors and sondes, good water quality data can be obtained by overcoming challenging conditions such as fouling and debris buildup. The method can also be used in watersheds of various sizes and characterized by agricultural, forested, and/or urban land.

With the advancement of technology and the rise in end-user expectations, the need and use of higher temporal resolution data for pollutant load estimation has increased. This protocol describes a method for continuous in situ water quality monitoring to obtain higher temporal resolution data for informed water resource management decisions.

Caudal continuo monitoreo de nutrientes y sedimentos en las cuencas agrícolas

Pollutant concentrations and loads in watersheds vary considerably with time and space. Accurate and timely information on the magnitude of pollutants in ...

Measuring the Flight Ability of the Ambrosia Beetle, Platypus Quercivorus (Murayama), Using a Low-Cost, Small, and Easily Constructed Flight Mill

The ambrosia beetle, Platypus quercivorus (Murayama), is the vector of a fungal pathogen that causes mass mortality of Fagaceae trees (Japanese oak wilt). Therefore, knowing the dispersal capacity may help inform trapping/tree removal efforts to prevent this disease more effectively. In this study, we measured the flight velocity and duration and estimated the flight distance of the beetle using a newly developed flight mill. The flight mill is low cost, small, and constructed using commonly available items. Both the flight mill arm and its vertical axis comprise a thin needle. A beetle specimen is glued to one tip of the arm using instant glue. The other tip is thick due to being covered with plastic, thus it facilitates the detection of rotations of the arm. The revolution of the arm is detected by a photo sensor mounted on an infrared LED, and is indicated by a change in the output voltage when the arm passed above the LED. The photo sensor is connected to a personal computer and the output voltage data are stored at a sampling rate of 1 kHz. By conducting experiments using this flight mill, we found that P. quercivorus can fly at least 27 km. Because our flight mill comprises cheap and small ordinary items, many flight mills can be prepared and used simultaneously in a small laboratory space. This enables experimenters to obtain a sufficient amount of data within a short period.

Measuring the Flight Ability of the Ambrosia Beetle, Platypus Quercivorus Murayama, Using a Low-Cost, Small, and Easily Constructed Flight Mill

We developed a low cost and small flight mill, constructed with commonly available items and easily used in experimentation. Using this apparatus, we measured the flight ability of an ambrosia beetle, Platypus quercivorus.

Medición de la capacidad de vuelo del escarabajo de ambrosía, Platypus Quercivorus (Murayama), con un bajo costo, pequeño y vuelo fácilmente construido molino

The ambrosia beetle, Platypus quercivorus (Murayama), is the vector of a fungal pathogen that causes mass mortality of Fagaceae trees (Japanese oak wilt). ...

Methods for Image-based Surveys of Benthic Macroinvertebrates and Their Habitat Exemplified by the Drop Camera Survey for the Atlantic Sea Scallop

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the approach more practical than in the past. Image-based surveys allow for initial samples to be revisited and are non-invasive compared to traditional survey methods that typically involve nets or dredges. Protocols for image-based surveys can vary greatly but should be driven by target species behavior and survey objectives. To demonstrate this, we describe our most recent methods for an Atlantic sea scallop (Placopecten magellanicus) drop camera survey to provide a procedural example and representative results. The procedure is divided into three critical steps that include survey design, data collection, and data products. The influence of scallop behavior and the survey goal of providing an independent assessment of the U.S. sea scallop resource on the survey procedure are then discussed in the context of generalizing the method. Overall, the broad applicability and flexibility of the University of Massachusetts Dartmouth School for Marine Science and Technology (SMAST) drop camera survey demonstrates the method could be generalized and applied to a variety of sessile invertebrates or habitat focused research.

Image based surveying is an increasingly practical, non-invasive method to sample the marine environment. We present the protocol of a drop camera survey that estimates the abundance and distribution of the Atlantic sea scallop (Placopecten magellanicus). We discuss how this protocol can be generalized for application to other benthic macroinvertebrates.

Métodos para los estudios basados en imágenes de macroinvertebrados bentónicos y su hábitat ejemplificado por la encuesta de la cámara de caída para la concha de peregrino de mar Atlántico

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the ...

Detection of Viruses from Bioaerosols Using Anion Exchange Resin

This protocol demonstrates a customized bioaerosol sampling method for viruses. In this system, anion exchange resin is coupled with liquid impingement-based air sampling devices for efficacious concentration of negatively-charged viruses from bioaerosols. Thus, the resin serves as an additional concentration step in the bioaerosol sampling workflow. Nucleic acid extraction of the viral particles is then performed directly from the anion exchange resin, with the resulting sample suitable for molecular analyses. Further, this protocol describes a custom-built bioaerosol chamber capable of generating virus-laden bioaerosols under a variety of environmental conditions and allowing for continuous monitoring of environmental variables such as temperature, humidity, wind speed, and aerosol mass concentration. The main advantage of using this protocol is increased sensitivity of viral detection, as assessed via direct comparison to an unmodified conventional liquid impinger. Other advantages include the potential to concentrate diverse negatively-charged viruses, the low cost of anion exchange resin (~$0.14 per sample), and ease of use. Disadvantages include the inability of this protocol to assess infectivity of resin-adsorbed viral particles, and potentially the need for the optimization of the liquid sampling buffer used within the impinger.

An anion exchange resin-based method, adapted to liquid impingement-based bioaerosol sampling of viruses is demonstrated. When coupled with downstream molecular detection, the method allows for facile and sensitive detection of viruses from bioaerosols.