Gli autori hanno sviluppato questo approccio con le nostre osservazioni del lavoro svolto da Walter Boynton e Pete Sampou e lavoro cooperativo su denitrificazione con Todd Kana presso l&#39;Università del Maryland Center for Environmental Science. Sviluppo dei nostri approcci denitrificazione non sarebbe stato possibile senza il sostegno del Mare di Grant Programma Maryland e la National Science Foundation. I dati rappresentativi utilizzati qui sono stati raccolti con un finanziamento da Maryland Sea Grant (R / AQ-5c) e la scrittura sforzi sono stati sostenuti da Maryland Sea Grant (R / SV-2), la Baia Ufficio NOAA Chesapeake (NA13NMF4570210), il Partenariato di recupero Oyster , la National Science Foundation (OCE1427019), Exelon Corporation, e il Servizio ambiente del Maryland / Maryland Port Administration.

Nota: La raccolta di nuclei con interfacce sedimento-acqua indisturbata è essenziale per fare delle buone misure sperimentali di scambio; nuclei altamente disturbati sono suscettibili di scambiare soluti acqua interstiziale con acqua sovrastante e hanno aumentato assorbimento di ossigeno attraverso l&#39;ossidazione di Fe (II) e composti solforati ridotti. In questo articolo, vogliamo sottolineare le procedure di incubazione sedimenti di sedimenti con solo un inserimento rapido di tecniche di campionamento dei sedimenti e le analisi chimiche dei soluti e gas. Prima di campionamento, o in base ai risultati iniziali, determinare il grado di replica da parte delle esigenze del progetto generale, il modello statistico, o la quantità prevista di variabilità spaziale su piccola scala. nuclei duplicati sono il minimo utilizzato da molti studi e triplicato sono utili per consentire una migliore analisi statistica. 1. sedimenti Raccolta e Manipolazione Nota: La raccolta di sedimenti per esperimenti di cambio viene effettuata utilizzando 1) inserimento manuale di nuclei using subacquei o in acque poco profonde o zone umide, guadando, 2) poli carotaggio utilizzando un palo di alluminio con valvola manuale chiusa per trattenere i sedimenti, o 3) scatola di carotaggio. <ol><li> In ogni sito, registrare la posizione del sito utilizzando il GPS, determinare l&#39;ossigeno fondo dell&#39;acqua, la temperatura, la salinità e utilizzando una sonda della qualità delle acque, e determinare la radiazione fotosinteticamente attiva (PAR) in superficie e di fondo con un PAR sensore / metro. <ol><li> Abbassare la qualità dell&#39;acqua sonde a ~ 1 m sopra il sedimento e registrare le caratteristiche dell&#39;acqua inferiore (profondità, temperatura, ossigeno disciolto, temperatura e salinità / conduttività). </li><li> Abbassare un sensore PAR con una sonda sottomarina all&#39;interfaccia acqua-sedimento utilizzando un telaio di abbassamento. Confronto PAR letture vicino alla superficie del sedimento di letture PAR immediatamente sotto l&#39;interfaccia aria-acqua per stimare l&#39;attenuazione della luce in condizioni di luce ambientale. </li><li> Distribuire uno scavino scatola sopra il lato della barca / nave, abbassando lentamente per ridurre al minimo i disturbiupon penetrando il sedimento. Esaminate la cassa d&#39;anima per disturbi visibili o risospensione eccessiva. <ol><li> Per una casella corer, inserire tubi interni nel sedimento, e utilizzare un tappo di materiale per coprire la parte superiore del nucleo. Per gli esperimenti di flusso, mentre il saldo sedimento / acqua ideale all&#39;interno del nucleo è di 15 cm di acqua e 15 cm di sedimento, in grossolano o sedimenti altamente compattati raccolta minore profondità sedimento è un risultato accettabile. Se i tassi di riduzione di ossigeno sono eccessive, spostare l&#39;equilibrio verso una maggiore altezza della colonna d&#39;acqua. </li><li> Tipicamente usare 6.35 cm centri interni di diametro per gli studi di acque profonde e per i sedimenti con microalghe bentoniche o grandi popolazioni di animali, utilizzare 10 core cm ID. Il principale limite di dimensioni del nucleo è la possibilità di ricoprire la parte inferiore del nucleo. </li><li> Cap inferiormente con una piastra di fondo acrilica che ha un O-ring incorporato. Ripetere questo processo fino repliche sufficienti vengono raccolti. Con il corer pole, il primo posto la piastra inferiore in acrilico nella Li nucleoner, rimuovere il nucleo dal carotiere, e aggiungere il tappo. </li></ol></li></ol></li><li> Luogo core in un refrigeratore d&#39;acqua isolato alto che è invaso da acqua ambiente dal sito; Questo aiuta a mantenere in temperatura in situ. Assicurarsi che il dispositivo di raffreddamento rimane in posizione eretta. Scartare nuclei che vengono disturbati durante il trasporto. </li><li> Pompa acqua di fondo prese vicino alla superficie del sedimento in 20 L damigiane per l&#39;uso negli esperimenti. Utilizzare una pompa a membrana con 10-20 L / min capacità o una pompa peristaltica ad alta velocità. <ol><li> In acqua non stratificato poco profondo, riempire la damigiana da &quot;inzuppare&quot; in acqua. La filtrazione delle acque di fondo con un filtro a cartuccia in linea ad alta capacità può essere utile nei siti con alti tassi di colonna d&#39;acqua assorbimento di ossigeno o la fotosintesi (alla luce), riducendo al minimo la correzione della colonna d&#39;acqua solo core di controllo. </li></ol></li><li> Trasportare i nuclei più rapidamente possibile alla struttura di incubazione. In caso di trasporto estesa, aernuclei obic possono diventare spumeggiante o circolazione anossica ed artificiale sono necessari. </li></ol> 2. Configurazione iniziale <ol><li> Nello stabilimento di incubazione, posto nuclei in una vasca di incubazione sia in una camera ambientale con temperatura controllata, o in un incubatore a doppia parete con controllo della temperatura mediante un circolatore di riscaldamento / raffreddamento. Impostare la temperatura a temperature dell&#39;acqua di fondo misurata in 1.1.1. </li><li> Aggiungere acqua basso verso l&#39;incubatore, sommergendo completamente i campioni di sedimenti. Anche aggiungere acqua per 5 L damigiane con attacchi che verranno utilizzati per erogare acqua sostituzione. </li><li> Aggiungere un nucleo solo-acqua (senza sedimenti) per l&#39;incubatrice. L&#39;uso di sbozzati colonna d&#39;acqua è importante nella maggior parte degli ambienti di compensare eventuali processi di colonna dell&#39;acqua che incidono gas e soluti. Per la misura di denitrificazione, questi spazi possono riflettere non solo i processi di colonna d&#39;acqua, ma lo scambio di gas con le pareti acriliche del nucleo. </li><li> nuclei Bubble waria ith per un minimo di 2 ore per assicurare l&#39;equilibrio termico e pieno ossigenazione dell&#39;acqua sovrastante. Essi possono essere tenuti durante la notte e corsi di tempo avviati il ​​mattino successivo. Più lunghi periodi di pre-incubazione non sono state valutate per l&#39;efficacia. <ol><li> Per l&#39;aerazione, utilizzare un piccolo gorgogliatore &quot;T&quot; costituita da ½ &quot;tubo in PVC con tre vie accoppiatore; un &#39;1/8 del tubo inserito sul fondo dei risultati T a trasportare acqua verso l&#39;alto durante gorgogliare e non solo assicura l&#39;ossigenazione, ma circolazione dell&#39;acqua nel nucleo con acqua in incubazione idromassaggio. </li></ol></li></ol> 3. Procedure di incubazione acqua-sedimento <ol><li> Dopo aver controllato la temperatura per garantire che corrisponda alle condizioni di campo, fissare trottole alle cime delle anime. A questo punto, sigillare il nucleo dall&#39;acqua del serbatoio. Lasciare la valvola di campionamento sul nucleo aperto durante questo processo. spazzare manualmente eventuali bolle d&#39;aria delicatamente dal lato inferiore della trottola. </li><li> EleVate l&#39;acqua sostituzione damigiana ~ 30-40 cm più alto le cime dei nuclei di incubazione e svuotare le linee verso il basso per eliminare l&#39;aria nella linea. Mentre ancora scorre, collegare le linee per le cime di base e chiudere le valvole. </li><li> Accendere il giradischi agitazione centrale e regolare la velocità di rotazione in modo che i campioni ruotano ~ 40 volte al minuto, o ad una velocità sufficiente a mescolare la colonna d&#39;acqua, ma non risospendere il sedimento. </li><li> Circa 5 minuti dopo tutti i core sono sigillate, aprire la valvola dell&#39;acqua di sostituzione e la valvola del campione, e poi allegare un breve pezzo di tubo alla valvola campione utilizzando un raccordo Luer. Inserire questo tubo di campionamento sul fondo di un tubo di vetro 7 ml, che viene riempito fino all&#39;orlo. Prima di tappatura tubo, aggiungere 10 ml di 30 g L -1 HgCl2 come conservante. <ol><li> Conservare questi campioni subacqueo a temperature prossime alla temperatura di incubazione. Altri laboratori hanno utilizzato con successo da 12 ml &quot;Exetainers&quot; per Samstoccaggio pio. </li></ol></li><li> Per il campionamento soluto, allegare un 20 ml siringa alla valvola del campione e aprire la valvola dell&#39;acqua di sostituzione. Il corpo della siringa si riempie fino al completo utilizzando solo la gravità. Attaccare un pistone e un disco filtro e quindi filtrare i campioni in fiale. Questi campioni per l&#39;analisi dei nutrienti sono congelati a -20 ° C fino al momento dell&#39;analisi. Nota: La durata di campionamento nel buio comporta tipicamente 4 periodi di campionamento con intervalli tra campionamento da 0,5 a&gt; 2 ore, a seconda del tasso di consumo di ossigeno. Con bassi tassi di assorbimento di ossigeno, gli intervalli di tempo sono lunghi; nei sedimenti con alti tassi di respirazione, gli intervalli devono essere brevi. Eccessivamente elevati volumi di campioni prelevati in ciascun punto di campionamento possono comportare campionamento troppo grande percentuale del volume del campione complesso; nel nostro lavoro questi volumi di campione comportare una rettifica trascurabile. Se è necessaria una maggiore volume di campione, nuclei di diametro maggiore o una maggiore altezza della colonna d&#39;acquapuò essere necessario. </li><li> Non procedere con un corso a tempo di campionamento di sotto di una soglia di consumo di ossigeno del 50%, con perdita di ossigeno del 25% di solito forniscono un segnale sufficientemente in concentrazioni di nutrienti. Qui, usare optodes calibrate per l&#39;analisi diretta delle concentrazioni di ossigeno e la saturazione di ossigeno. <ol><li> Se i sedimenti sono da ambienti illuminati poco profonde, al 4 ° campionamento, accendere le luci e prendere 3 campioni successivi. Si noti che in sedimenti altamente fotosintetici, sovrasaturazione di O 2 e di formazione di bolle limita la misura dei flussi di gas in alcuni casi. Il monitoraggio continuo di ossigeno è un&#39;alternativa sempre valida e prezioso con tecnologia di misura fibra ottica avente relativamente piccole sonde che sono altamente affidabili e precise. </li></ol></li><li> Al termine delle incubazioni sedimenti, sia misurare l&#39;altezza della colonna d&#39;acqua o sifone colonna d&#39;acqua in un cilindro graduato da determ direttamenteine il volume d&#39;acqua, e scattare foto di ogni core. </li></ol> Analisi 4. Campione <ol><li> Campioni pompa per l&#39;analisi di N 2, O 2 e Ar in una membrana Inlet spettrometro di massa, e determinare i coefficienti di N 2: Ar e O 2: Ar al &lt;0,03% precisione 12,23. <ol><li> Coppia un spettrometro di massa a quadrupolo ad un ingresso della membrana. Inserire il campione nel tubo membrana utilizzando una pompa peristaltica. Raccogliere i rifiuti campione in una damigiana di plastica e trattare come rifiuto chimico a causa del conservante Hg. Calibrare con acqua deionizzata equilibrata con aria alla temperatura di incubazione. </li></ol></li><li> Eseguire nutrienti analizza manualmente ≤ 5 ml campioni o su volumi più piccoli che utilizzano analizzatori automatici. Al momento lo scongelamento del campione, inizio analisi immediatamente. La scelta della procedura di analisi dei nutrienti deve cedere una precisione sufficiente per osservare i cambiamenti nella concentrazione di nutrienti durante l&#39;incubazione. rilevazione tipicalimiti sono &lt;tendenze 0,05 micromol L -1 e naturalmente il tempo può essere difficile da osservare sotto le due concentrazioni estremamente basse ed estremamente elevate di nutrienti. <ol><li> Per le analisi colorimetriche di solubili di fosforo reattivo, utilizzare la tecnica fosfomolibdato acido ascorbico. Per analizza l&#39;ammonio, utilizzare un sviluppo del colore durante la notte utilizzando un fenolo ipoclorito di reagente 24. Automatizzata analisi colorimetriche, sia utilizzando il flusso segmentato o un analizzatore discreta, sono una grande alternativa e utilizzare volume del campione inferiore. </li><li> Per le analisi di nitrato oltre il nitrito, utilizzare lo sviluppo del colore durante la notte utilizzando il cloruro di vanadio come riducente 25, o utilizzare un analizzatore automatico </li><li> Confronta assorbanza individuati su UV / VIS a curve standard e determinare le concentrazioni da una regressione delle concentrazioni standard e assorbanza. </li></ol></li></ol> 5. Calcolo dello scambio acqua-sedimento Tariffe <ol><li> Regredire le concentrazioni di gas o sostanze nutritive in funzione del tempo in modo indipendente per entrambe le incubazioni luce e al buio, con la pendenza espressa in micromol L -1 hr -1. Correggere le pendici dei nuclei di incubazione per la pendenza dei nuclei colonna di sola acqua. Utilizzare solo regressioni significative (p &lt;0,05) per i calcoli; identificare i dati non significativi nei fogli di calcolo dei dati finali. </li><li> Calcolare i tassi di cambio sedimenti-acqua dal versante del cambiamento delle concentrazioni di costituenti chimici nell&#39;acqua sovrastante: <img alt="Equazione 1" src="/files/ftp_upload/54098/54098equation1.jpg" /> Dove F è il flusso (mmol m -2 h -1), ΔC / Dt è la pendenza della variazione di concentrazione in acqua sovrastante (mmol L -1 hr -1), V è il volume dell&#39;acqua sovrastante (L) e A è l&#39;area del nucleo incubato (m -2) .To stimare il flusso giornaliero, moltiplicare il tasso illuminata dalle ore di lucee aggiungere al tasso scuro moltiplicata per le ore di buio. </li></ol> 6. report <ol><li> Nel riportare i risultati di misurazioni di scambio sedimenti-acqua, fornire informazioni sufficienti per altri scienziati a capire l&#39;ambiente che è stato campionato. Informazioni essenziali comprende: 1) posizione del sito e l&#39;acqua di profondità, 2) caratteristiche fisiche come campo e temperatura di incubazione, e PAR, 3) caratteristiche dell&#39;acqua di fondo come l&#39;ossigeno, le concentrazioni di nutrienti e la salinità, e 4) le caratteristiche del sedimento come la dimensione del grano, le concentrazioni di materia organica, e la presenza di animali bentonici. </li></ol>

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	<li>Einsele, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ueber+die+Beziehungen+des+Eisenkreislaufes+zum+Phosphatkreislauf+im+Eutrophen+See.">Ueber die Beziehungen des Eisenkreislaufes zum Phosphatkreislauf im Eutrophen See.</a> Arch.Hydrobiol. 29, 664-686 (1936).</li><li>Mortimer, C. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+exchange+of+dissolved+substances+between+mud+and+lake+water.">The exchange of dissolved substances between mud and lake water.</a> J Ecol. 29, 280-329 (1941).</li><li>Cowan, J. L. W., Boynton, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment-water+oxygen+and+nutrient+exchanges+along+the+longitudinal+axis+of+Chesapeake+Bay:+Seasonal+patterns,+controlling+factors+and+ecological+significance.">Sediment-water oxygen and nutrient exchanges along the longitudinal axis of Chesapeake Bay: Seasonal patterns, controlling factors and ecological significance.</a> Estuaries. 19, 562-580 (1996).</li><li>Fisher, T. R., Carlson, P. R., Barber, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment+nutrient+regeneration+in+three+North+Carolina+estuaries.">Sediment nutrient regeneration in three North Carolina estuaries.</a> Estuar. Coast. Shelf S.e. 14, 101-116 (1982).</li><li>McGlathery, K. J., Sundback, K., Anderson, I. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Eutrophication+in+shallow+coastal+bays+and+lagoons:+the+role+of+plants+in+the+coastal+filter.">Eutrophication in shallow coastal bays and lagoons: the role of plants in the coastal filter.</a> Mar. Ecol-Prog Ser. 348, 1-18 (2007).</li><li>Eyre, B. D., Ferguson, A. J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+carbon+production+and+decomposition,+benthic+nutrient+fluxes+and+denitrification+in+seagrass,+phytoplankton,+benthic+microalgae-+and+macroalgae-dominated+warm-temperate+Australian+lagoons.">Comparison of carbon production and decomposition, benthic nutrient fluxes and denitrification in seagrass, phytoplankton, benthic microalgae- and macroalgae-dominated warm-temperate Australian lagoons.</a> Mar. Ecol-Prog Ser. 229, 43-59 (2002).</li><li>DiToro, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Sediment Flux Modeling. , (2001).</li><li>Testa, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment+flux+modeling:+Simulating+nitrogen,+phosphorus,+and+silica+cycles.">Sediment flux modeling: Simulating nitrogen, phosphorus, and silica cycles.</a> Estuar. Coast. Shelf S. 131, 245-263 (2013).</li><li>Kana, T. M., Cornwell, J. C., Zhong, L. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+denitrification+in+the+Chesapeake+Bay+from+measurements+of+N-2+accumulation+in+bottom+water.">Determination of denitrification in the Chesapeake Bay from measurements of N-2 accumulation in bottom water.</a> Estuar. Coasts. 29, 222-231 (2006).</li><li>Hammond, D. E., Cummins, K. M., McManus, J., Berelson, W. M., Smith, G., Spagnoli, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+for+measuring+benthic+nutrient+flux+on+the+California+Margin:+Comparing+shipboard+core+incubations+to+in+situ+lander+results.">Methods for measuring benthic nutrient flux on the California Margin: Comparing shipboard core incubations to in situ lander results.</a> Limnol. Oceanog Methods. 2, 146-159 (2004).</li><li>Miller-Way, T., Boland, G. S., Rowe, G. T., Twilley, R. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment+oxygen+consumption+and+benthic+nutrient+fluxes+on+the+Louisiana+continental+shelf:+a+methodological+comparison.">Sediment oxygen consumption and benthic nutrient fluxes on the Louisiana continental shelf: a methodological comparison.</a> Estuaries. 17, 809-815 (1994).</li><li>Kana, T. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Membrane+inlet+mass+spectrometer+for+rapid+high-precision+determination+of+N2,+O2,+and+Ar+in+environmental+water+samples.">Membrane inlet mass spectrometer for rapid high-precision determination of N2, O2, and Ar in environmental water samples.</a> Anal. Chem. 66, 4166-4170 (1994).</li><li>Gao, Y., Cornwell, J. C., Stoecker, D. K., Owens, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influence+of+cyanobacteria+blooms+on+sediment+biogeochemistry+and+nutrient+fluxes.">Influence of cyanobacteria blooms on sediment biogeochemistry and nutrient fluxes.</a> Limnol. Oceanogr. 59, 959-971 (2014).</li><li>Hopfensperger, K. N., Kaushal, S. S., Findlay, S. E. G., Cornwell, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influence+of+Plant+Communities+on+Denitrification+in+a+Tidal+Freshwater+Marsh+of+the+Potomac+River,+United+States.">Influence of Plant Communities on Denitrification in a Tidal Freshwater Marsh of the Potomac River, United States.</a> J. Environ. Qual. 38, 618-626 (2009).</li><li>Cornwell, J. C., Kemp, W. M., Kana, T. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Denitrification+in+coastal+ecosystems:+environmental+controls+and+aspects+of+spatial+and+temporal+scale.">Denitrification in coastal ecosystems: environmental controls and aspects of spatial and temporal scale.</a> Aquat. Ecol. 33, 41-54 (1999).</li><li>LaMontagne, M. G., Valiela, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Denitrification+measured+by+a+direct+N2+flux+method+in+sediments+of+Waquoit+Bay,+MA.">Denitrification measured by a direct N2 flux method in sediments of Waquoit Bay, MA.</a> Biogeochemistry. 31, 63-83 (1995).</li><li>Nielsen, L. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Denitrification+in+sediment+determined+from+nitrogen+isotope+pairing.">Denitrification in sediment determined from nitrogen isotope pairing.</a> FEMS Microbiol Ecol. 86, 357-362 (1992).</li><li>Ferguson, A. J. P., Eyre, B. D., Gay, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Organic+matter+and+benthic+metabolism+in+euphotic+sediments+along+shallow+sub-tropical+estuaries,+northern+New+South+Wales,+Australia.">Organic matter and benthic metabolism in euphotic sediments along shallow sub-tropical estuaries, northern New South Wales, Australia.</a> Aq. Microb. Ecol. 33, 137-154 (2003).</li><li>Coley, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The effect of flow on the fluxes of oxygen, dinitrogen gas, nitrate and ammonium in diffusively controlled sediments using stirred experimental chambers. , (2003).</li><li>Owens, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Nitrogen cycling and controls on denitrification in mesoahaline sediment of Chesapeake Bay. , (2009).</li><li>Sundback, K., Jonsson, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microphytobenthic+productivity+and+biomass+in+sublittoral+sediments+of+a+stratified+bay,+southeastern+Kattegat.">Microphytobenthic productivity and biomass in sublittoral sediments of a stratified bay, southeastern Kattegat.</a> J. Exp. Mar. Biol. Ecol. 122, 63-81 (1988).</li><li>Petersen, J. E., Cornwell, J. C., Kemp, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Implicit+scaling+in+experimental+enclosed+aquatic+ecosystems.">Implicit scaling in experimental enclosed aquatic ecosystems.</a> Oikos. 85, 3-18 (1999).</li><li>Kana, T. M., Weiss, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comment+on+"Comparison+of+isotope+pairing+and+N-2+:+Ar+methods+for+measuring+sediment+denitrification"+by+B.+D.+Eyre,+S.+Rysgaard,+T.+Daisgaard,+and+P.+Bondo+Christensen.+2002.+Estuaries+25:+1077-1087.">Comment on "Comparison of isotope pairing and N-2 : Ar methods for measuring sediment denitrification" by B. D. Eyre, S. Rysgaard, T. Daisgaard, and P. Bondo Christensen. 2002. Estuaries 25: 1077-1087.</a> Estuaries. 27, 173-176 (2004).</li><li>Parsons, T. R., Maita, Y., Lalli, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A Manual of Chemical and Biological Methods for Seawater Analysis. , (1984).</li><li>Doane, T. A., Horwath, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spectrophotometric+determination+of+nitrate+with+a+single+reagent.">Spectrophotometric determination of nitrate with a single reagent.</a> Analytical Letters. 36, 2713-2722 (2003).</li><li>Testa, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+the+impact+of+floating+oyster+(Crassostrea+virginica)+aquaculture+on+sediment-water+nutrient+and+oxygen+fluxes.">Modeling the impact of floating oyster (Crassostrea virginica) aquaculture on sediment-water nutrient and oxygen fluxes.</a> Aquac. Environ. Interact. 7, 205-222 (2015).</li><li>Hamme, R. C., Emerson, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+solubility+of+neon,+nitrogen+and+argon+in+distilled+water+and+seawater.">The solubility of neon, nitrogen and argon in distilled water and seawater.</a> Deep-Sea Res. Part I-Oceanogr. Res. Papers. 51, 1517-1528 (2004).</li><li>Chong, L. S., Prokopenko, M. G., Berelson, W. M., Townsend-Small, A., McManus, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nitrogen+cycling+within+suboxic+and+anoxic+sediments+from+the+continental+margin+of+Western+North+America.">Nitrogen cycling within suboxic and anoxic sediments from the continental margin of Western North America.</a> Marine Chemistry. 128, 13-25 (2012).</li><li>Eyre, B. D., Rysgaard, S., Dalsgaard, T., Christensen, P. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+isotope+pairing+and+N-2+:+Ar+methods+for+measuring+sediment-denitrification-assumptions,+modifications,+and+implications.">Comparison of isotope pairing and N-2 : Ar methods for measuring sediment-denitrification-assumptions, modifications, and implications.</a> Estuaries. 25, 1077-1087 (2002).</li><li>Lee, D. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Effects+of+Oxygen+Transition+on+Community+Respiration+and+Potential+Chemoautotrophic+Production+in+a+Seasonally+Stratified+Anoxic+Estuary.">The Effects of Oxygen Transition on Community Respiration and Potential Chemoautotrophic Production in a Seasonally Stratified Anoxic Estuary.</a> Estuar.Coasts. 38, 104-117 (2015).</li><li>MacIntyre, H. L., Geider, R. J., Miller, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microphytobenthos:+The+ecological+role+of+the+"secret+garden"+of+unvegetated,+shallow-water+marine+habitats+.1.+Distribution,+abundance+and+primary+production.">Microphytobenthos: The ecological role of the "secret garden" of unvegetated, shallow-water marine habitats .1. Distribution, abundance and primary production.</a> Estuaries. 19, 186-201 (1996).</li><li>Aller, R. C., Mackin, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Open-incubation,+diffusion+methods+for+measuring+solute+reaction+rates+in+sediments.">Open-incubation, diffusion methods for measuring solute reaction rates in sediments.</a> J. Mar. Res. 47, 411-440 (1989).</li></ol>

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

La tecnica qui descritta è stata applicata a numerosi tipi di sistemi acquatici, sia superficiali e profonde, e abbiamo trovato a lavorare bene nella maggior parte delle circostanze. Questo approccio è stato adattato da approcci utilizzati dai colleghi e presentati in letteratura; è ottimizzato per la misurazione di denitrificazione tramite spettrometria di massa membrana ingresso. Uno dei punti di forza di questo approccio è la capacità di gestire un gran numero di nuclei simultaneamente. Replica di ogni sito con doppio o triplo core aumenta la fiducia nelle misure, anche se un approccio alternativo è quello di massimizzare i siti con meno di replica, in queste circostanze il valore medio di un segmento ambientale può essere più rappresentativo della variabilità in natura. Per chiarire differenze stagionali, una serie temporale di misurazione ad un numero minore di siti può essere una strategia utile. In questo protocollo, ci sono diversi passaggi critici. Paramount per fare smisure Uccessful è la raccolta di nuclei con interfaccia sedimento-acqua intatto. Pur respingendo nuclei che non rispettano questo criterio nel campo può essere faticoso, nuclei poveri porterà alla scarsa accuratezza e precisione. Mantenere nuclei aerobici gassose e vicina alla temperatura originale collezione ridurrà al minimo gli artefatti e mantenere sani, intatti popolazioni microbiche e metazoi. Infine, per O 2 e N 2 campioni, l&#39;aggiunta di conservanti mercurico cloruro è critica. Abbiamo osservato che la conservazione impropria dei campioni di gas, tra cui un eccessivo riscaldamento e raffreddamento delle fiale, può compromettere queste misurazioni di flusso. Altri laboratori hanno utilizzato con successo 7,0 M ZnCl 2 come conservante meno tossico che ha minori costi di smaltimento dei rifiuti; per un 7 ml di campione una aggiunta di 30 microlitri è appropriato. L&#39;analisi precisa ed accurata del rapporto di N 2 e Ar è fondamentale per la determinazione della N 2 </sub&gt; flussi. Osservato N 2: rapporti Ar cambia in funzione della concentrazione di ossigeno che porta alcuni ricercatori a sostenere la rimozione di ossigeno prima dell&#39;analisi, generalmente utilizzando il rame riscaldati 28. La strumentazione utilizzata nel nostro laboratorio è stato utilizzato per determinare l&#39;effetto di ossigeno su N 2: Ar rapporti 23 e l&#39;effetto è risultato essere molto piccola, &lt;0,03% di riduzione di ossigeno modesta. Le differenze nell&#39;approccio a valutare l&#39;ossigeno &quot;effetto&quot; sembrano condurre a conclusioni diverse da diversi ricercatori 23,28,29. Un grande effetto dell&#39;ossigeno su N 2: rapporti Ar porterebbero ad erroneamente alti tassi di N 2 -N efflusso; nella nostra esperienza, abbiamo molte osservazioni di N trascurabile 2 -N efflusso sotto alto tasso di consumo di ossigeno. Nei laboratori in cui l&#39;effetto dell&#39;ossigeno N 2: rapporti Ar sembrano grandi, un&#39;utile alternativa è la misura indipendente dalle concentrazioni di ossigeno utilizzando elettrodi o optodes e ossigenorimozione dalla spettrometria di massa utilizzando Cu linea riscaldata. Risoluzione dei problemi di questa tecnica è possibile solo dopo l&#39;esame dei dati di flusso dei sedimenti. I fattori chiave da considerare quando regressioni sono poveri sono se agitazione era continuo, i campioni sono stati raccolti e conservati in modo corretto, e se il tempo corsi erano troppo breve per consentire la stima di tassi bassi. La lunghezza degli esperimenti generalmente è impostato dal corso tempo di ossigeno, con bassi tassi di metabolismo richiedono incubazioni più lunghi per aumentare il rapporto segnale rumore incorporato nelle regressioni corso di tempo. Alti tassi di produzione di ossigeno che producono O 2 bolle di rendere i flussi di gas difficili, ma i flussi di soluti possono essere influenzate. E &#39;necessario comprendere i limiti di questo approccio. I piccoli nuclei coprono 0,3% di un metro quadrato e le anime più grandi coprono 0,6%. In siti con sostanziale eterogeneità a scala metro, distribuzioni eterogenee di animals o le piante possono suggerire che uno o due core possono non essere una rappresentazione sufficiente. Ci sono anche alcuni ambienti che presentano difficoltà di misurazione. Per la misura di denitrificazione, la presenza di metano o di ossigeno bolle può invalidare la tecnica, con N 2: rapporti Ar influenzati per incorporazione differenziale di gas nelle bolle. In sedimenti colonizzata da microalghe bentoniche, la formazione di bolle di ossigeno risultati in strippaggio preferenziale N 2 rispetto a Ar, e diminuzione del N 2: rapporto Ar. In generale, non possiamo misurare denitrificazione nel punto in cui le bolle forma. ambienti anaerobici pongono sfide diverse, e l&#39;aerazione dei nuclei cambia le dinamiche redox all&#39;interfaccia acqua-sedimento. Noi chiudiamo il core con cime di agitazione immediatamente dopo la raccolta e iniziare i flussi senza sostituire completamente il 30 la colonna d&#39;acqua. I nostri esperimenti con sedimenti illuminati in genere sono saturando o quasi saturating livelli di illuminazione 31, e quindi massimizzare l&#39;effetto di microalghe bentonici. misurazioni cambio sedimento-acqua sono una misura del flusso netto di materie livello dell&#39;interfaccia acqua-sedimento. Tuttavia, queste misurazioni sola spesso non possono identificare i meccanismi che controllano questi scambi interfacciali. Se la domanda di ricerca coinvolge meccanismi di comprensione, altre informazioni sulla reattività materia organica, terminale di zonazione accettore di elettroni, bioirrigation e bioturbazione, e organismi fotosintetici può essere necessario. Modellazione sforzi 7 potrebbero richiedere la determinazione della chimica acqua interstiziale, misure dirette di materia organica reattività 32, l&#39;enumerazione delle popolazioni animali, sedimenti bio-irrigazione, accrescimento sedimenti, o manipolazioni sperimentali di redox o sovrastante chimica dell&#39;acqua 13. Nei nostri studi, lo scambio buona acqua-sedimento dei dati è un componente chiave di comprensione della chimica dei sedimenti acquatici,e in combinazione con altre misurazioni, identifica il ruolo dei processi di riciclo sedimenti nei cicli biogeochimici acquatici. Con cura sull&#39;utilizzo in sedimenti, controllo di temperatura e colonna d&#39;acqua di miscelazione, incubazioni nucleo sono un utile approccio alla stima dello scambio di soluti e gas all&#39;interfaccia acqua-sedimento. Tuttavia, le tecniche usate qui possono avere bisogno di modifiche per alcuni ambienti e per la logistica difficili, come ad esempio periodi di tempo prolungati prima dell&#39;incubazione. Finora, abbiamo applicato con successo questo approccio incubazione di estuario, costiere, ambienti umidi, lago, serbatoio, fiume e stagno di ritenzione con modifiche minime.

I sedimenti sono componenti critici biogeochimici degli ecosistemi acquatici e spesso sono importanti pozzi di assorbimento di nutrienti e contaminanti. Studi pionieristici di nutrienti, gas e metallo di transizione biogeochimica nei sedimenti lacustri hanno rivelato lo scambio dei sedimenti di soluti e gas con acqua sovrastante che aveva diverse condizioni redox 1,2. Per gli elementi nutritivi, sedimenti possono essere una fonte di fosforo e azoto fissato dopo rimineralizzazione di materia organica, e un lavandino per l&#39;ossigeno in ambienti non-fotosintetici 3,4. Fotosintesi di macrofite sommerse, macroalghe e microalghe bentoniche può avere profonde influenze sullo scambio di sostanze disciolte attraverso l&#39;interfaccia sedimento-acqua 5,6. Le misurazioni dello scambio di soluti e gas attraverso l&#39;interfaccia sedimento-acqua vengono effettuate sia per la scienza di base e scienza applicata scopi, fra cui tarature di ingegneria e scientifico water modelli di qualità 7,8. L&#39;obiettivo di questi metodi, per quanto possibile, è quello di fornire i tassi di cambio sedimento-acqua affidabili e precisi. Un&#39;ampia varietà di approcci sono stati utilizzati per valutare scambio chimico all&#39;interfaccia acqua-sedimento. Accumulo di acqua inferiore del gas e soluti in sistemi stratificati può essere utile 9, ma non è valida per lo scambio acqua-sedimento sopra termoclini o pycnoclines. correlazione Eddy richiede misurazioni ad alta frequenza di gas, generalmente ossigeno, combinato con la misurazione ad alta frequenza della velocità dell&#39;acqua verticali; questa tecnica ha promessa enorme ma attualmente non possono fornire dati per Studi cambio nutrienti. In cupole situ o camere sono un metodo altamente preferito, con il vantaggio di coprire una maggiore superficie di sedimenti e mantenuto in temperatura situ, pressioni acque profonde e livelli di luce 10. In pratica, si tratta di misure molto costosi che richiedono tempo estesosu navi di ricerca più grandi; maggior parte delle applicazioni sono più profonde delle zone costiere o sedimenti oceanici. Tecniche di incubazione di base che utilizzano il flusso attraverso le camere che raggiungono lo stato stazionario sono eccellenti per mantenere relativamente costante chimica dell&#39;acqua sovrastante, tra cui l&#39;ossigeno, durante l&#39;incubazione di 11. Perché il tasso è determinato a regime da differenze di concentrazione tra flusso di carico e l&#39;acqua effluente, e dai tassi di cambio d&#39;acqua, queste incubazioni possono prendere una notevole quantità di tempo. L&#39;approccio incubazione nucleo decorso temporale utilizzato dal nostro laboratorio è stato adattato da approcci usati da diversi laboratori in Nord America e in Europa, e vi è una notevole quantità di letteratura sulla base di questo approccio generale. Abbiamo adattato questo approccio alla misurazione di N 2 -N flussi 12, spesso indicato come denitrificazione, e abbiamo applicato ad ambienti fotosintetici e non fotosintetica sedimenti, compresi estuaries 13, laghi, bacini e zone umide 14. Attraverso questi studi abbiamo trovato molti ambienti in cui il nostro approccio generale funziona bene, e alcuni in cui non funziona. La misurazione di denitrificazione è stata effettuata in molti ambienti terrestri e acquatici diversi perché questo processo rappresenta una perdita chiave di azoto ecosistemi. Numerosi approcci sono stati utilizzati per effettuare misurazioni di denitrificazione, alcune diretta e indiretta alcuni 15. Diretti N 2 misurazioni di flusso sono molto difficile a causa dell&#39;elevato contenuto atmosferico N 2, e successive concentrazioni elevate disciolti in acqua 16. Due approcci sono emersi come avente la migliore rappresentazione dei tassi di interesse ambientale: isotopo abbinamento con N isotopi 17 e la N rapporto 2: Ar utilizzato nel nostro laboratorio. Il metodo degli isotopi abbinamento è stato utilizzato con successo in molti ambienti e ha sensibilità molto alta a prezzi bassi. Impieghiamo la N2: Ar approccio rapporto causa della sua semplicità, sia perché è sufficientemente sensibile negli ambienti colpite spesso studiare. In questo articolo, si descrive l&#39;approccio tecnico che abbiamo utilizzato nel corso degli ultimi due decenni per rendere la misura dello scambio acqua-sedimento di gas e soluti. Eventuali misure di scambio acqua-sedimento devono prendere in considerazione le condizioni di campo e un certo numero di parametri sperimentali. Questi fattori includono la temperatura, condizioni di oscurità / luce 18, la miscelazione / flusso fisico all&#39;interfaccia acqua-sedimento 19, le concentrazioni di ossigeno disciolto 20, e di altri fattori che sono gli elementi chiave di fare buone misure. Ad esempio, se nuclei sono raccolti da aree che ricevono illuminazione sufficiente per la crescita di microalghe bentonici, è necessario escogitare esperimenti che comprendono entrambe le condizioni 21 chiari e scuri. Allo stesso modo, l&#39;aggiunta di acqua sovrastante ossigenato al anossiche corenon replica condizioni di campo. Recinzione Sperimentale di qualsiasi parte degli ecosistemi acquatici possono condurre ad artefatti inevitabili 22; è fondamentale che gli approcci utilizzati in un sedimento-acqua programma di misura di scambio 1) riconoscere i fattori che controllano lo scambio acqua-sedimento in ogni ecosistema e 2) riducono al minimo gli artefatti derivanti da manipolazione sperimentale.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="638">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="64">
			<td height="64" style="height:64px;width:179px;">Multiparameter sonde - temperature, oxygen, salinity</td>
			<td style="width:135px;">YSI</td>
			<td style="width:123px;">&#34;</td>
			<td style="width:203px;">Any high quality equipment will suffice</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">PAR Measurement</td>
			<td style="width:135px;">Li-Cor</td>
			<td align="right" style="width:123px;">6050000</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Pole corer</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="49">
			<td height="49" style="height:49px;width:179px;">Box corer</td>
			<td style="width:135px;">DK-Denmark</td>
			<td style="width:123px;">HAPS Corer</td>
			<td style="width:203px;">We also use light box coring equipment</td>
		</tr>
		<tr height="67">
			<td height="67" style="height:67px;width:179px;">Small core tubes with o-ring fitted bottom, 3&#39; OD, 2.5&#39; Id.</td>
			<td style="width:135px;">various plastics companies</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Clear acrylic</td>
		</tr>
		<tr height="67">
			<td height="67" style="height:67px;width:179px;">Medium core tubes with o-ring, 4.5&#34; od, 4&#34; id</td>
			<td style="width:135px;">various plastics companies</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Clear acrylic</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Butyl stopper size 13.5</td>
			<td style="width:135px;">generic</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Stirring turntable</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Incubation tub</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Replacement water carboy</td>
			<td style="width:135px;">Nalgene</td>
			<td style="width:123px;">2320-0050</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">7 mL glass stoppered tube</td>
			<td style="width:135px;">Chemglass</td>
			<td style="width:123px;">not on inventory</td>
			<td style="width:203px;">&#34;Exetainers&#34; used by other labs</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">20 mL plastic syringe</td>
			<td style="width:135px;">generic</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Syringe filters</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Plastic tubing</td>
			<td style="width:135px;">Tygon</td>
			<td style="width:123px;">ACF00004-CP</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:179px;">Compact Fluorescent Lights</td>
			<td style="width:135px;">Apollo Horticulture</td>
			<td style="width:123px;">CFL 8U 250W</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the benthic exchange of o2, n2 and dissolved nutrients using small core incubations

The measurement of sediment-water exchange of gases and solutes in aquatic sediments provides data valuable for understanding the role of sediments in nutrient and gas cycles. After cores with intact sediment-water interfaces are collected, they are submerged in incubation tanks and kept under aerobic conditions at in situ temperatures. To initiate a time course of overlying water chemistry, cores are sealed without bubbles using a top cap with a suspended stirrer. Time courses of 4-7 sample points are used to determine the rate of sediment water exchange. Artificial illumination simulates day-time conditions for shallow photosynthetic sediments, and in conjunction with dark incubations can provide net exchanges on a daily basis. The net measurement of N2 is made possible by sampling a time course of dissolved gas concentrations, with high precision mass spectrometric analysis of N2:Ar ratios providing a means to measure N2 concentrations. We have successfully applied this approach to lakes, reservoirs, estuaries, wetlands and storm water ponds, and with care, this approach provides valuable information on biogeochemical balances in aquatic ecosystems.

I risultati di sedimenti misure di flusso vicino a un impianto di acquacoltura sul fiume Choptank (Chesapeake Bay, MD) sono mostrati in figura 1 e l&#39;interpretazione di questi risultati in un contesto ecosistema vengono presentati altrove 26. Le incubazioni sono state effettuate oltre 7 ore, con incubazioni scuro seguiti da dati incubazioni illuminati. I dati provenienti da due nuclei sono mostrati, nonche la colonna d&#39;acqua controllare soltanto. La rapida diminuzione di ossigeno nel buio è stato attenuato un po &#39;per l&#39;illuminazione; il tasso di fotosintesi delle microalghe produzione non era alto come la respirazione, con l&#39;effetto principale di illuminazione essendo una diminuita velocità di variazione di ossigeno. Il nucleo di controllo sperimentato piccole riduzioni della concentrazione di ossigeno nel buio e piccoli aumenti la luce. Le concentrazioni N 2 sono stati determinati dal N rapporto 2: Ar eI valori di saturazione letteratura calcolati Ar per la temperatura osservata e salinità 27. In un tipico precisione di 0,02% per il N rapporto 2: Ar, questi dati sono precisi a ~ 0,1 mmol L -1 N 2. I campioni di sedimenti e la colonna di acqua nuclei vuoti avevano aumenti di N 2 nel tempo, con tassi molto più alti di aumento delle anime. Sotto l&#39;illuminazione, le piste erano generalmente simile al tasso scuro di N 2 cambiamento. Flussi di disciolto NH 4 + erano piuttosto alti in questo sito, con aumento scuro di&gt; 20 micromol L -1 per un core. Illuminati NH 4 + flussi erano molto più bassi. Entrambi i core e il vuoto colonna d&#39;acqua erano in diminuzione NO x - la concentrazione nel corso del tempo, il livellamento durante l&#39;illuminazione. Per tutti i flussi, i dati di concentrazione ei dati sul volume core e altri parametri rilevanti sono mostrati in <st<html> rong&gt; tabelle 1 e 2. <img alt="Figura 1" src="/files/ftp_upload/54098/54098fig1.jpg" /> Figura 1. Tempo dati di rotta da un sito acque poco profonde nel fiume Choptank che è stato coperto con i galleggianti che contengono le ostriche coltivate. I dati provengono da nuclei ripetute (A e B) e i dati da uno spazio vuoto colonna d&#39;acqua sono mostrati. Le concentrazioni di ossigeno N 2, NH 4 + e NO x - (la somma di NO 3 - e NO 2 - sono presentati sia per la parte scura della incubazione (area ombreggiata) e per la parte illuminata dell&#39;incubazione La quarta volta. punto di incubazione buio è anche la prima volta punto della serie storica illuminata; le luci sono state accese al momento del campionamento le linee sono regressioni lineari e le piste sono presentati nella tabella 1..98 / 54098fig1large.jpg &quot;target =&quot; _ blank &quot;&gt; Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura. <table fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td fo:width="1.8in" style="width:220px"> Ossigeno - Dark </td><td> Tempo (h) </td><td> nucleo A </td><td> nucleo B </td><td> Controllo </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 235.1 </td><td> 221,7 </td><td> 235.2 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 204.3 </td><td> 170,6 </td><td> 235.3 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 162.7 </td><td> 138,9 </td><td> 232 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 145,3 </td><td> 77,9 </td><td> 222.2 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,943 </td><td> 0,999 </td><td> 0,836 </td></tr><tr><td> Slope (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> -23,5 </td><td> -35,9 </td><td> -3.4 </td></tr><tr><td> Slope Corretto (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> -20,1 </td><td> -32,5 </td><td></td></tr><tr><td> Rate (mmol m-2 hr -1) </td><td></td><td> -3095 </td><td> -4875 </td><td></td></tr><tr><td> Ossigeno - Luce </td><td> Tempo (h) </td><td> nucleo A </td><td> nucleo B </td><td> Controllo </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 145,3 </td><td> 77,9 </td><td> 222.2 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 133,5 </td><td> 68.8 </td><td> 224,3 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 122,8 </td><td> 40.3 </td><td> 221.6 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 116 </td><td> 49,2 </td><td> 230,5 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0.981 </td><td> 0,999 </td><td> 0,994 </td></tr><tr><td> Slope (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> -10,1 </td><td> -9.8 </td><td> 2.9 </td></tr><tr><td> Slope Corretto (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> -13 </td><td> -12.7 </td><td></td></tr><tr><td> Rate (mmol m-2 hr -1) </td><td></td><td> -2.000 </td><td> -1905 </td><td></td></tr><tr><td> N 2 - Dark </td><td> Tempo (h) </td><td> nucleo A </td><td> nucleo B </td><td> Controllo </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 466,46 </td><td> 466,40 </td><td> 466,62 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 466,74 </td><td> 467,49 </td><td> 466,11 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 467,55 </td><td> 468,18 </td><td> 466,74 </td></tr><tr><td&gt; </td><td> 3.97 </td><td> 468,24 </td><td> 468,98 </td><td> 467,12 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,963 </td><td> 0.98 </td><td> 0,854 </td></tr><tr><td> Slope N 2 (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> 0,471 </td><td> 0.645 </td><td> 0,12 </td></tr><tr><td> Corretto Slope N 2 (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> 0.351 </td><td> 0,525 </td><td></td></tr><tr><td> Tasso di N 2 -N (mmol m-2 hr -1) </td><td></td><td> 108.1 </td><td> 157.5 </td><td></td></tr><tr><td> N 2 - Luce </td><td> Tempo (h) </td><td> nucleo A </td><td> nucleo B </td><td> Controllo </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 468,24 </td><td> 468,98 </td><td> 467,12 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 468,84 </td><td> 469,21 </td><td> 467,26 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 469,39 </td><td> 469,71 </td><td> 467,47 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 469,62 </td><td> 470,04 </td><td> 467,41 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0.96 </td><td> 0,987 </td><td> 0,967 </td></tr><tr><td> Slope N 2 (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> 0.481 </td><td> 0,378 </td><td> 0.096 </td></tr><tr><td> Corretto Slope N 2 (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> 0,386 </td><td> 0,282 </td><td></td></tr><tr><td> Tasso di N 2 -N (mmol m-2 hr -1) </td><td></td><td> 118,9 </td><td> 84,6 </td><td></td></tr><tr><td> Nucleo Superficie (m 2) </td><td></td><td> 0.003165 </td><td> 0.003165 </td><td></td></tr&gt; <tr><td> Volume di base (L) </td><td></td><td> 0,4874 </td><td> 0,4747 </td><td></td></tr></tbody></table> . Tabella 1. Tempo dati di rotta per O 2 e N 2 da sedimenti sotto i galleggianti di ostriche acquacoltura nel fiume Choptank, un subestuary della Chesapeake Bay Le concentrazioni di gas sono derivati ​​da O 2: Ar e N 2: rapporti Ar determinati tramite ingresso membrana spettrometria di massa. Il tempo di corso di regressione R 2 valori sono significativi per i valori&gt; 0,9025 (p &lt;0,05). Piste sono determinati mediante regressione lineare e piste corretti sono determinati sottraendo il tasso di variazione della colonna d&#39;acqua solo vuota. tassi positivi sono flussi netti fuori del sedimento, i tassi negativi indicano il flusso nel sedimento. I dati di N 2 flusso sono espressi in N 2 -N, rendendo compaRison NH 4 + e NO x - fondenti più facile. Questo sito ha avuto sedimenti costituiti principalmente da limo e argilla con le condizioni di colonna d&#39;acqua completamente aerobici. L&#39;area dei nuclei era 31.65 cm -2 e la profondità della colonna d&#39;acqua erano 15,4 cm per anima A e 15,0 per nucleo B. Tutte le concentrazioni di N 2 e O 2 sono mol L -1. Il tasso finale per N 2 flusso è espresso in N 2 -N. <table fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td fo:width="1.8in" style="width:220px"> NH 4 + - Dark </td><td> Tempo (h) </td><td> nucleo A </td><td> nucleo B </td><td> Controllo </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 10.84 </td><td> 14.09 </td><td> 6.91 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 16.19 </td><td> 20.26 </td><td> 5.83 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 17.07 </td><td> 24.93 </td><td> 5.42 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 22.83 </td><td> 35.43 </td><td> 4.67 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,968 </td><td> 0.993 </td><td> 0,853 </td></tr><tr><td> Slope (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> 2.88 </td><td> 5.36 </td><td> -0.53 </td></tr><tr><td> Slope Corretto (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> 3.41 </td><td> 5.89 </td><td></td></tr><tr><td> Rate (mmol m-2 hr -1) </td><td></td><td> 525 </td><td> 884 </td><td></td></tr><tr><td> NH 4 + - Luce </td><td> Tempo (h) </td><td> nucleo A </td><td> nucleo B </td><td> Controllo </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 22.83 </td&gt; <td> 35.43 </td><td> 4.67 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 24.05 </td><td> 36.45 </td><td> 4.13 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 25.00 </td><td> 37.60 </td><td> 3.79 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 26.96 </td><td></td><td></td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,978 </td><td> 1 </td><td> 0,966 </td></tr><tr><td> Slope (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> 1.37 </td><td> 1.13 </td><td> -0.55 </td></tr><tr><td> Slope Corretto (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> 1.92 </td><td> 1.68 </td><td></td></tr><tr><td> Rate (mmol m-2 hr -1) </td><td></td><td> 296 </td><td> 252 </td><td></td></tr><tr><td> NO x - - Dark </td><td> Tempo (h) </td><td> nucleo A </td><td> nucleo B </td><td> Controllo </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 4.12 </td><td> 4.01 </td><td> 4.53 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 3.82 </td><td> 3.58 </td><td> 4.43 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 3.70 </td><td> 3.25 </td><td> 4.28 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 3.19 </td><td> 2.64 </td><td> 4.19 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,976 </td><td> 0.992 </td><td> 0,967 </td></tr><tr><td> Slope (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> -0,229 </td><td> -0,345 </td><td> -0,089 </td></tr><tr><td> Slope Corretto (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> -0.14 </td><td> -0,256 </td><td></td></tr><tr><td> Rate (mmol m-2 hr -1) </td><td></td><td> -21,6 </td><td> -38,4 </td><td></td></tr><tr><td> NO x - - Luce </td><td> Tempo (h) </td><td> nucleo A </td><td> nucleo B </td><td> Controllo </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 3.19 </td><td> 2.64 </td><td> 4.19 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 3.06 </td><td> 2.59 </td><td> 4.06 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 3.18 </td><td> 2.41 </td><td> 4.02 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 2.95 </td><td> 2.35 </td><td> 4.2 </td></tr><tr><td> R 2 </td><td></td><td> 0,934 </td><td> 0.909 </td><td> 0.9 </td></tr><tr><td> Slope (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> -0,078 </td><td> -0,103 </td><td> 0 </td></tr><tr><td> Slope Corretto (mmol L -1 hr -1) </td><td></td><td> -0,078 </td><td> -0,103 </td><td></td></tr><tr><td> Rate (mmol m-2 hr -1) </td><td></td><td> -12 </td><td> -15.5 </td><td></td></tr><tr><td> Nucleo Superficie (m 2) </td><td></td><td> 0.003165 </td><td> 0.003165 </td><td></td></tr><tr><td> Volume di base (L) </td><td></td><td> 0,4874 </td><td> 0,4747 </td><td></td></tr></tbody></table> Tabella 2. Tempo dati del corso per NH 4 + e NO x - dagli stessi campioni di sedimenti per la tavola 1. La durata del corso di regressione R 2 valori sono significativi per i valori&gt; 0,9025 (p &lt;0,05). Piste sono determinati mediante regressione lineare e piste corretti sono determinati sottraendo il tasso di variazione della colonna d&#39;acqua solo vuota. tassi positivi sono flussi nettidal sedimento, tassi negativi indicano flusso nel sedimento. Tutte le concentrazioni di NH 4 + e NO 2 - sono micromol L -1.

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The Benthic Exchange of O2, N2 and Dissolved Nutrients Using Small Core Incubations

Here, we present small core incubations for the measurement of sediment-water gas and solute exchange. These will provide reliable measurements of sediment-water exchange that assess the role of sediment in influencing biological and biogeochemical processes in aquatic ecosystems.

La Borsa bentonici di O<sub&gt; 2</sub&gt;, N<sub&gt; 2</sub&gt; e nutrienti disciolti Utilizzo piccolo nucleo Incubazioni

The measurement of sediment-water exchange of gases and solutes in aquatic sediments provides data valuable for understanding the role of sediments in ...

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Universidad San Sebastian

Research

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The Benthic Exchange of O2, N2 and Dissolved Nutrients Using Small Core Incubations

9.5K Views.  University of Maryland Center for Environmental Science. Here, we present small core incubations for the measurement of sediment-water gas and solute exchange. These will provide reliable measurements of sediment-water exchange that assess the role of sediment in influencing biological and biogeochemical processes in aquatic ecosystems. 

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Measuring Fluxes of Mineral Nutrients and Toxicants in Plants with Radioactive Tracers

Unidirectional influx and efflux of nutrients and toxicants, and their resultant net fluxes, are central to the nutrition and toxicology of plants. Radioisotope tracing is a major technique used to measure such fluxes, both within plants, and between plants and their environments. Flux data obtained with radiotracer protocols can help elucidate the capacity, mechanism, regulation, and energetics of transport systems for specific mineral nutrients or toxicants, and can provide insight into compartmentation and turnover rates of subcellular mineral and metabolite pools. Here, we describe two major radioisotope protocols used in plant biology: direct influx (DI) and compartmental analysis by tracer efflux (CATE). We focus on flux measurement of potassium (K+) as a nutrient, and ammonia/ammonium (NH3/NH4+) as a toxicant, in intact seedlings of the model species barley (Hordeum vulgare L.). These protocols can be readily adapted to other experimental systems (e.g., different species, excised plant material, and other nutrients/toxicants). Advantages and limitations of these protocols are discussed.

In planta measurement of nutrient and toxicant fluxes is essential to the study of plant nutrition and toxicity. Here, we cover radiotracer protocols for influx and efflux determination in intact plant roots, using potassium (K+) and ammonia/ammonium (NH3/NH4+) fluxes as examples. Advantages and limitations of such techniques are discussed.

Flussi di minerali nutrienti e sostanze tossiche in misura Piante con traccianti radioattivi

Unidirectional influx and efflux of nutrients and toxicants, and their resultant net fluxes, are central to the nutrition and toxicology of plants. ...

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Ambiente

Sediment Core Sectioning and Extraction of Pore Waters under Anoxic Conditions

We demonstrate a method for sectioning sediment cores and extracting pore waters while maintaining oxygen-free conditions. A simple, inexpensive system is built and can be transported to a temporary work space close to field sampling site(s) to facilitate rapid analysis. Cores are extruded into a portable glove bag, where they are sectioned and each 1-3 cm thick section (depending on core diameter) is sealed into 50 ml centrifuge tubes. Pore waters are separated with centrifugation outside of the glove bag and then returned to the glove bag for separation from the sediment. These extracted pore water samples can be analyzed immediately. Immediate analyses of redox sensitive species, such as sulfide, iron speciation, and arsenic speciation indicate that oxidation of pore waters is minimal; some samples show approximately 100% of the reduced species, e.g. 100% Fe(II) with no detectable Fe(III). Both sediment and pore water samples can be preserved to maintain chemical species for further analysis upon return to the laboratory.

A protocol for sectioning sediment cores and extracting pore waters under anoxic conditions in order to permit analysis of redox sensitive species in both solids and fluids is presented.

Sedimenti Nucleo sezionamento ed estrazione di Pore acque sotto anossiche condizioni

We demonstrate a method for sectioning sediment cores and extracting pore waters while maintaining oxygen-free conditions. A simple, inexpensive system is ...

A Protocol for Collecting and Constructing Soil Core Lysimeters

Leaching of nutrients from land applied fertilizers and manure used in agriculture can lead to accelerated eutrophication of surface water. Because the landscape has complex and varied soil morphology, an accompanying disparity in flow paths for leachate through the soil macropore and matrix structure is present. The rate of flow through these paths is further affected by antecedent soil moisture. Lysimeters are used to quantify flow rate, volume of water and concentration of nutrients leaching downward through soils. While many lysimeter designs exist, accurately determining the volume of water and mass balance of nutrients is best accomplished with bounded lysimeters that leave the natural soil structure intact. 
Here we present a detailed method for the extraction and construction of soil core lysimeters equipped with soil moisture sensors at 5 cm and 25 cm depths. Lysimeters from four different Coastal Plain soils (Bojac, Evesboro, Quindocqua and Sassafras) were collected on the Delmarva Peninsula and moved to an indoor climate controlled facility. Soils were irrigated once weekly with the equivalent of 2 cm of rainfall to draw down soil nitrate-N concentrations. At the end of the draw down period, poultry litter was applied (162 kg TN ha-1) and leaching was resumed for an additional five weeks. Total recovery of applied irrigation water varied from 71% to 85%. Nitrate-N concentration varied over the course of the study from an average of 27.1 mg L-1 before litter application to 40.3 mg L-1 following litter application. While greatest flux of nutrients was measured in soils dominated by coarse sand (Sassafras) the greatest immediate flux occurred from the finest textured soil with pronounced macropore development (Quindocqua).

A detailed method for extraction and assembly of intact soil core lysimeters and their use for study of leachate and associated loss of nutrients from surface applied poultry litter is demonstrated.

Un protocollo per la raccolta e la costruzione del suolo lisimetri core

Leaching of nutrients from land applied fertilizers and manure used in agriculture can lead to accelerated eutrophication of surface water. Because the ...

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and detritus, and excreting particulate and dissolved compounds, they serve as important agents for benthic-pelagic coupling. Accurately measuring the compounds removed and excreted by suspension feeders (such as sponges, ascidians, polychaetes, bivalves) is crucial for the study of their physiology, metabolism, and feeding ecology, and is fundamental to determine the ecological relevance of the nutrient fluxes mediated by these organisms. However, the assessment of the rate by which suspension feeders process particulate and dissolved compounds in nature is restricted by the limitations of the currently available methodologies. Our goal was to develop a simple, reliable, and non-intrusive method that would allow clean and controlled water sampling from a specific point, such as the excurrent aperture of benthic suspension feeders, in situ. Our method allows simultaneous sampling of inhaled and exhaled water of the studied organism by using minute tubes installed on a custom-built manipulator device and carefully positioned inside the exhalant orifice of the sampled organism. Piercing a septum on the collecting vessel with a syringe needle attached to the distal end of each tube allows the external pressure to slowly force the sampled water into the vessel through the sampling tube. The slow and controlled sampling rate allows integrating the inherent patchiness in the water while ensuring contamination free sampling. We provide recommendations for the most suitable filtering devices, collection vessel, and storing procedures for the analyses of different particulate and dissolved compounds. The VacuSIP system offers a reliable method for the quantification of undisturbed suspension feeder metabolism in natural conditions that is cheap and easy to learn and apply to assess the physiology and functional role of filter feeders in different ecosystems.

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

We introduce the VacuSIP, a simple, non-intrusive, and reliable method for clean and accurate point sampling of water. The system was developed and evaluated for the simultaneous collection of the water inhaled and exhaled by benthic suspension feeders in situ, to cleanly measure removal and excretion of particulate and dissolved compounds.

VacuSIP, un metodo migliorato per Inex<em&gt; In Situ</em&gt; Misura di particolato e sciolto composti elaborati da Alimentatori sospensioni attive

Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and ...

A Simple Approach to Manipulate Dissolved Oxygen for Animal Behavior Observations

The ability to manipulate dissolved oxygen (DO) in a laboratory setting has significant application to investigate a number of ecological and organismal behavior questions. The protocol described here provides a simple, reproducible, and controlled method to manipulate DO to study behavioral response in aquatic organisms resulting from hypoxic and anoxic conditions. While performing degasification of water with nitrogen is commonly used in laboratory settings, no explicit method for ecological (aquatic) application exists in the literature, and this protocol is the first to describe a protocol to degasify water to observe organismal response. This technique and protocol were developed for direct application for aquatic macroinvertebrates; however, small fish, amphibians, and other aquatic vertebrates could be easily substituted. It allows for easy manipulation of DO levels ranging from 2 mg/L to 11 mg/L with stability for up to a 5 min animal-observation period. Beyond a 5 min observation period water temperatures began to rise, and at 10 min DO levels became too unstable to maintain. The protocol is scalable to the study organism, reproducible, and reliable, allowing for rapid implementation into introductory teaching labs and high-level research applications. The expected results of this technique should relate dissolved oxygen changes to behavioral responses of organisms.

This article describes a simple and reproducible protocol to manipulate dissolved oxygen conditions in a laboratory setting for animal behavior studies. This protocol may be used in both teaching and research laboratory settings to evaluate organismal response of macroinvertebrates, fishes, or amphibians to changes in dissolved oxygen concentration.

Un approccio semplice per manipolare ossigeno disciolto per Osservazioni Comportamento animale

The ability to manipulate dissolved oxygen (DO) in a laboratory setting has significant application to investigate a number of ecological and organismal ...

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. Yet the in situ study of DOM is difficult as the molecular complexity of the DOM pool cannot be easily reproduced for experimental purposes. Nutrient additions to streams however, have been shown to repeatedly alter the in situ and ambient DOM pool. Here we demonstrate an easily replicable field-based method for manipulating the ambient pool of DOM at the ecosystem scale. During nutrient pulse experiments changes in the concentration of both dissolved organic carbon and dissolved organic nitrogen can be examined across a wide-range of nutrient concentrations. This method allows researchers to examine the controls on the DOM pool and make inferences regarding the role and function that certain fractions of the DOM pool play within ecosystems. We advocate the use of this method as a technique to help develop a deeper understanding of DOM biogeochemistry and how it interacts with nutrients. With further development this method may help elucidate the dynamics of DOM in other ecosystems.

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Dissolved organic matter provides an important source of energy and nutrients to stream ecosystems. Here we demonstrate a field-based method to manipulate the ambient pool of dissolved organic matter in situ through easily replicable nutrient pulses.

Capire disciolto materia organica Biogeochimica Attraverso<em&gt; In Situ</em&gt; Nutrienti Manipolazioni in Stream ecosistemi

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. ...

Continuous Instream Monitoring of Nutrients and Sediment in Agricultural Watersheds

Pollutant concentrations and loads in watersheds vary considerably with time and space. Accurate and timely information on the magnitude of pollutants in water resources is a prerequisite for understanding the drivers of the pollutant loads and for making informed water resource management decisions. The commonly used &#34;grab sampling&#34; method provides the concentrations of pollutants at the time of sampling (i.e., a snapshot concentration) and may under- or overpredict the pollutant concentrations and loads. Continuous monitoring of nutrients and sediment has recently received more attention due to advances in computing, sensing technology, and storage devices. This protocol demonstrates the use of sensors, sondes, and instrumentation to continuously monitor in situ nitrate, ammonium, turbidity, pH, conductivity, temperature, and dissolved oxygen (DO) and to calculate the loads from two streams (ditches) in two agricultural watersheds. With the proper calibration, maintenance, and operation of sensors and sondes, good water quality data can be obtained by overcoming challenging conditions such as fouling and debris buildup. The method can also be used in watersheds of various sizes and characterized by agricultural, forested, and/or urban land.

With the advancement of technology and the rise in end-user expectations, the need and use of higher temporal resolution data for pollutant load estimation has increased. This protocol describes a method for continuous in situ water quality monitoring to obtain higher temporal resolution data for informed water resource management decisions.

Instream continuo monitoraggio delle sostanze nutrienti e sedimenti nei bacini agricoli

Pollutant concentrations and loads in watersheds vary considerably with time and space. Accurate and timely information on the magnitude of pollutants in ...

Measuring the Flight Ability of the Ambrosia Beetle, Platypus Quercivorus (Murayama), Using a Low-Cost, Small, and Easily Constructed Flight Mill

The ambrosia beetle, Platypus quercivorus (Murayama), is the vector of a fungal pathogen that causes mass mortality of Fagaceae trees (Japanese oak wilt). Therefore, knowing the dispersal capacity may help inform trapping/tree removal efforts to prevent this disease more effectively. In this study, we measured the flight velocity and duration and estimated the flight distance of the beetle using a newly developed flight mill. The flight mill is low cost, small, and constructed using commonly available items. Both the flight mill arm and its vertical axis comprise a thin needle. A beetle specimen is glued to one tip of the arm using instant glue. The other tip is thick due to being covered with plastic, thus it facilitates the detection of rotations of the arm. The revolution of the arm is detected by a photo sensor mounted on an infrared LED, and is indicated by a change in the output voltage when the arm passed above the LED. The photo sensor is connected to a personal computer and the output voltage data are stored at a sampling rate of 1 kHz. By conducting experiments using this flight mill, we found that P. quercivorus can fly at least 27 km. Because our flight mill comprises cheap and small ordinary items, many flight mills can be prepared and used simultaneously in a small laboratory space. This enables experimenters to obtain a sufficient amount of data within a short period.

Measuring the Flight Ability of the Ambrosia Beetle, Platypus Quercivorus Murayama, Using a Low-Cost, Small, and Easily Constructed Flight Mill

We developed a low cost and small flight mill, constructed with commonly available items and easily used in experimentation. Using this apparatus, we measured the flight ability of an ambrosia beetle, Platypus quercivorus.

Misura la capacità di volo del Scarabeo dell'Ambrosia, Platypus Quercivorus (Murayama), utilizzando un basso costo, piccole e facilmente costruito volo Mill

The ambrosia beetle, Platypus quercivorus (Murayama), is the vector of a fungal pathogen that causes mass mortality of Fagaceae trees (Japanese oak wilt). ...

Methods for Image-based Surveys of Benthic Macroinvertebrates and Their Habitat Exemplified by the Drop Camera Survey for the Atlantic Sea Scallop

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the approach more practical than in the past. Image-based surveys allow for initial samples to be revisited and are non-invasive compared to traditional survey methods that typically involve nets or dredges. Protocols for image-based surveys can vary greatly but should be driven by target species behavior and survey objectives. To demonstrate this, we describe our most recent methods for an Atlantic sea scallop (Placopecten magellanicus) drop camera survey to provide a procedural example and representative results. The procedure is divided into three critical steps that include survey design, data collection, and data products. The influence of scallop behavior and the survey goal of providing an independent assessment of the U.S. sea scallop resource on the survey procedure are then discussed in the context of generalizing the method. Overall, the broad applicability and flexibility of the University of Massachusetts Dartmouth School for Marine Science and Technology (SMAST) drop camera survey demonstrates the method could be generalized and applied to a variety of sessile invertebrates or habitat focused research.

Image based surveying is an increasingly practical, non-invasive method to sample the marine environment. We present the protocol of a drop camera survey that estimates the abundance and distribution of the Atlantic sea scallop (Placopecten magellanicus). We discuss how this protocol can be generalized for application to other benthic macroinvertebrates.

Metodi per sondaggi basati su immagine di macroinvertebrati bentonici e loro Habitat esemplificato dall'indagine fotocamera goccia per la cappasanta atlantica

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the ...

Detection of Viruses from Bioaerosols Using Anion Exchange Resin

This protocol demonstrates a customized bioaerosol sampling method for viruses. In this system, anion exchange resin is coupled with liquid impingement-based air sampling devices for efficacious concentration of negatively-charged viruses from bioaerosols. Thus, the resin serves as an additional concentration step in the bioaerosol sampling workflow. Nucleic acid extraction of the viral particles is then performed directly from the anion exchange resin, with the resulting sample suitable for molecular analyses. Further, this protocol describes a custom-built bioaerosol chamber capable of generating virus-laden bioaerosols under a variety of environmental conditions and allowing for continuous monitoring of environmental variables such as temperature, humidity, wind speed, and aerosol mass concentration. The main advantage of using this protocol is increased sensitivity of viral detection, as assessed via direct comparison to an unmodified conventional liquid impinger. Other advantages include the potential to concentrate diverse negatively-charged viruses, the low cost of anion exchange resin (~$0.14 per sample), and ease of use. Disadvantages include the inability of this protocol to assess infectivity of resin-adsorbed viral particles, and potentially the need for the optimization of the liquid sampling buffer used within the impinger.

An anion exchange resin-based method, adapted to liquid impingement-based bioaerosol sampling of viruses is demonstrated. When coupled with downstream molecular detection, the method allows for facile and sensitive detection of viruses from bioaerosols.