Méthode EPA 1615. Mesure de entérovirus et Norovirus présence dans l'eau par Culture et RT-qPCR. I. Prélèvement des échantillons de virus

Résumé

EPA Method 1615 uses an electropositive filter to concentrate enteroviruses and noroviruses in environmental and drinking waters. This manuscript describes the procedure for collecting samples for Method 1615 analyses.

Résumé

EPA Method 1615 was developed with a goal of providing a standard method for measuring enteroviruses and noroviruses in environmental and drinking waters. The standardized sampling component of the method concentrates viruses that may be present in water by passage of a minimum specified volume of water through an electropositive cartridge filter. The minimum specified volumes for surface and finished/ground water are 300 L and 1,500 L, respectively. A major method limitation is the tendency for the filters to clog before meeting the sample volume requirement. Studies using two different, but equivalent, cartridge filter options showed that filter clogging was a problem with 10% of the samples with one of the filter types compared to 6% with the other filter type. Clogging tends to increase with turbidity, but cannot be predicted based on turbidity measurements only. From a cost standpoint one of the filter options is preferable over the other, but the water quality and experience with the water system to be sampled should be taken into consideration in making filter selections.

Introduction

Les virus entériques humains répliquent dans le tractus gastro-intestinal et se propagent par la voie fécale-orale. Ces virus sont souvent trouvés dans les eaux usées à forte concentration ^{de 1 à 3.} Ils peuvent persister dans les effluents d'eaux usées ^4,5, et ^6,7 surface, ^rez-de-8-10 et ¹¹ eaux potable traitée. Lorsqu'il est présent, la concentration du virus dans les eaux environnementales aux États-Unis est généralement trop faible pour la mesure directe ^12,13. Cela exige que les virus soient concentrées à partir de grands volumes d'eau. Au cours de la Règle de collecte de l'information (ICR) de suivi menées par l'Environmental Protection Agency des États-Unis (EPA) ^14, les concentrations de virus d'échantillons positifs dans l'eau de source de grands services publics à l'échelle nationale à distance de 0,009 à 19,7 nombre le plus probable d'unités infectieuses (NPP) / L. Les concentrations médianes et moyennes des échantillons positifs étaient 0,03 et 0,17 MPN / L pour les eaux de source de ruisseaux, 0,01à 0,07 MPN / L pour ceux des lacs et des réservoirs, et de 0,04 à 0,74 MPN / L pour ceux qui utilisent les eaux souterraines ¹¹ (données de la base de données d'accès de 18 mois ICR Aux1 datée du 25.04.2000). concentrations de virus d'échantillons positifs d'une étude de l'EPA des eaux souterraines nationales allaient de 0,009 à 2,12 unités infectieuses / L avec la médiane et les concentrations moyennes de 0,13 et 0,29 unités infectieuses / L ^8. La concentration du virus dans des échantillons d'eau souterraine positifs était plus élevé que ceux des ruisseaux. La plupart des installations utilisant des eaux souterraines dans ces études obtenu l'eau des aquifères situés dans des régions karstiques. Ceux-ci, ainsi que ceux situés dans le calcaire et cristallin paramètres (du substratum rocheux fracturé) sont susceptibles d'avoir des concentrations de virus plus élevés que dans d'autres contextes ^8,15,16. Méthodes de virus EPA précisent volumes d'échantillonnage de 200 L (ICR) à 300 L (Méthode 1615) de l'eau de surface et 1000 L (ICR) pour 1500 L (Méthode 1615) des eaux souterraines ^17,18. Cependant, même avec l'utilisation degrands volumes d'échantillons, la plupart des échantillons de surface et des eaux souterraines sont négatifs pour le virus ^8,11,19,20.

Les virus présents dans les eaux de surface présentent un risque sanitaire potentiel pour les consommateurs d'eau potable. La Surface Water Treatment Rule exige que tous les usines de traitement utilisant l'eau de surface pour réduire les concentrations de virus d'au moins 4 log. Même avec une réduction de 4 log, les concentrations de virus infectieux dans la source d'eau aussi petit que 0,0044 MPN / L pourraient conduire à une infection par jour en supposant une telle exposition et de traitement des conditions moyennes et les paramètres de dose-réponse pour le rotavirus ^11,21. Le risque de virus dans les eaux souterraines non traitées pourrait être encore plus grande en raison de l'absence de traitement et l'apparition virale. Borchardt et ses collègues estiment que jusqu'à 22% des gastro-entérite aiguë chez les adultes et 63% chez les enfants de moins de cinq ans pourraient être attribuables au virus dans l'eau potable dans les communautés en utilisant les eaux souterraines non traitées ^19.

EPA Méthode 1615 a été développé pour détecter et entérovirus norovirus au cours de troisième cycle de suivi de la surveillance de la contamination non réglementée règlement (UCMR3) ²² comme un ressortissant suivi des conclusions de Borchardt et collègues ^19,23. La méthode EPA a été conçu principalement pour mesurer le virus dans les systèmes utilisant les eaux souterraines non traitées, mais a été écrit plus généralement à d'autres types de matrice de l'eau. La nouvelle méthode est un hybride en préservant de nombreux éléments de la méthode du virus utilisé lors de la précédente IC ^17, l'ajout de procédures moléculaires basée sur la méthode de Borchardt et al. ^19,23 et jeux d'amorces supplémentaires pour les norovirus ^24. Le but de cet article est de décrire la procédure d'échantillonnage et les mesures nécessaires pour maintenir l'intégrité de l'échantillon lors de la collecte et l'expédition. Une évaluation de la méthode globale est décrite dans Cashdollar et al. ^25. Ce protocole couvre collectio simple sur le terrainn des eaux de surface et souterraines où une pompe et pré-filtre ne sont pas nécessaires et où les ajustements ne sont pas nécessaires pour le pH ou la présence d'un désinfectant dans l'eau à échantillonner. Les exigences d'échantillonnage plus complexes sont décrits dans Fout et al. ^17,18.

Protocole

1. Procédures préliminaires

1. Assembler un dispositif de filtre standard, comme illustré sur la figure 1 consistant en un module d'entrée, un module de logement de cartouche, et un module de décharge comme décrit dans Matériels supplémentaires.
2. Étalonner le débitmètre / totalisateur les débits utilisés pour l'échantillonnage avant la première utilisation. Vérifier l'étalonnage après la première utilisation et après un mois d'utilisation. Si l'étalonnage de débit a changé après soit la première utilisation ou après le premier mois d'utilisation, déterminer la fréquence des contrôles d'étalonnage comme décrit dans Matériels supplémentaires.
   1. Connectez un module de décharge à un module d'admission, puis connecter le module d'admission à un robinet. Réglez le débitmètre / totalisateur de lire le débit. Ouvrez le robinet complètement et ensuite ajuster le débit à 10 L / min en utilisant la vanne bronze globe. Une fois le débit est stable à 10 L / min, réinitialiser le débitmètre / totalisateur à lire volume total.
   2. Placez le surlaisser du module de décharge dans une 4 L ou plus graduée et réinitialiser simultanément le totalisateur à zéro. Mesurer la lecture du compteur à la marque de 4-L et le temps nécessaire pour atteindre la barre des 4 L sur le cylindre. Changez le réglage de retour au débit du débitmètre / totalisateur.
      NOTE: Si le débit a chuté au-dessous de 9,95 L ou augmenté à plus de 10,05 L après avoir terminé l'étape 1.2.2, attendez jusqu'à ce que le débit est stable et répétez l'étape 1.2.2. Un compteur correctement calibré atteindra la marque de 4 L sur le cylindre gradué à 24 ± 1 sec avec une lecture de compteur de 4,0 ± 0,04 L.
   3. Si la lecture du compteur est inférieure à 3,96 ou plus de 4,04 L, calculer un facteur de correction nécessaires pour tenir compte de la différence observée. Par exemple, si le débitmètre / totalisateur lit 3,9 L à la marque de 4 L sur l'éprouvette graduée, le facteur de correction serait 1,026 (4 ÷ 3,9). Ainsi, si le volume souhaité d'un échantillon de terrain ont été 300 L, le volume collecté selon la ra lecture sur le débitmètre / totalisateur doit être de 300 ÷ 1,026 = 292,4 L.
3. Stériliser l'appareil de filtre standard et de le préparer pour la collecte de l'échantillon.
   1. Stériliser les modules de boîtier d'admission et de la cartouche avec de l'hypochlorite de sodium 0,525% pendant au moins 30 min avant chaque utilisation, soit en immergeant complètement les modules dans les solutions, soit par la circulation de l'hypochlorite de sodium si les modules en utilisant une pompe. Rincer les modules avec dH ₂ O stérile puis déchlorer dans une solution contenant 50 ml de 1 M de thiosulfate de sodium par litre d'eau de qualité réactif stérile pendant 5 min. Couvrir le module d'appareil d'échantillonnage de filtre se termine par une feuille d'aluminium stérile.
   2. Ajoutez un filtre à cartouche électropositif au module de logement de cartouche de manière aseptique.
      REMARQUE: Veillez à ce que le filtre de la cartouche est bien en place dans les logements. Correctement assis filtres ne fuient pas et le filtre ne se déplace pas dans le logement quand on les secoue. Les joints sur aproperly filtre assis aura indentations visibles montrant où les contacts de les filtrer. Les joints d'étanchéité doivent toujours être vérifiées pour indentations immédiatement après le filtre est retiré du boîtier.
   3. Enregistrer un numéro unique d'échantillon sur une feuille de données de l'échantillon (voir Matériaux supplémentaires pour un exemple), puis prendre ou expédier l'appareil d'échantillonnage de filtre et l'échantillon Fiche technique à la personne qui viendra chercher l'échantillon sur le terrain, avec les instructions nécessaires concernant l'échantillon collection (par exemple, le volume de l'échantillon, l'emplacement d'échantillonnage, etc.).

2. Préparation pour le recueil des échantillons sur le site d'échantillonnage

1. Se laver les mains à l'arrivée sur le site de collecte et enfiler des gants chirurgicaux pour minimiser la possibilité de contamination des échantillons. Ne pas collecter d'échantillons si des symptômes intestinaux ou respiratoires. Changer de gants fréquemment, et surtout après avoir touché les robinets d'eau et d'autres éléments qui peuvent être suiteaminé.
2. Enregistrez échantillon représentatif des informations de suivi sur une feuille de données échantillon. Les informations pertinentes comprennent le site et l'identification de l'échantillon, le nom de l'échantillonneur, et les modèles d'équipement et de numéros de série.
3. Ouvrez le robinet d'eau pendant 2-3 min pour effacer tous les débris qui se est installé dans la ligne. Si nécessaire, utilisez un tuyau ou un tube jardin pour atteindre un drain pendant cette étape.
4. Si les modules de l'appareil d'échantillonnage sont connectés, débranchez-les et protéger les extrémités ouvertes du module de logement de la cartouche avec du papier stérile. Connecter le module de décharge au module d'admission puis brancher à la fois à la prise d'eau. Connecter un tuyau d'arrosage à l'extrémité du module de décharge et placer l'extrémité libre dans le récipient de polypropylene de 1 L.
5. Tournez le robinet et passer au moins 75 L de l'eau à échantillonner à travers l'appareil.
   1. Mesurer et enregistrer les paramètres de qualité de l'eau pendant la période à plat sur l'eau qui coule dans le récipient polypropylène chlore résiduUAL, le pH, la température et la turbidité.
   2. Après avoir coupé l'eau du robinet, débrancher le module de décharge à partir du module d'admission, puis connecter le module de logement de cartouche à la sortie du module d'entrée et le module de décharge à la sortie du module de logement de cartouche. Réinitialiser le totalisateur lecture à zéro.

3. Champ de prélèvement des échantillons

1. Enregistrez la lecture initiale du totalisateur avec la date et l'heure, puis ouvrir lentement le robinet d'eau.
   1. Assurez-vous que le boîtier de cartouche est en position verticale et qu'il remplit complètement avec de l'eau. Certaines enceintes sont pourvues d'un bouton d'aération qui peut être pressé pour expulser l'air hors du boîtier pendant l'opération de remplissage.
   2. Ouvrez complètement le robinet. Réglez le taux à 10 L / min en utilisant la vanne bronze globe, puis enregistrer le débit initial.
2. Passez 300 L d'eau de surface ou 1500 à 1800 L d'eau souterraine à travers l'appareil à l'aideles lectures des compteurs (ajusté, si nécessaire). Si les sabots de filtre avant le volume requis est atteint et plus de la moitié du volume a été recueilli, utiliser un second module de boîtier de filtre pour recueillir l'échantillon restant, si elle est disponible.
3. Observez le débit que le volume de l'échantillon se rapproche de la fin de la période d'échantillonnage, puis éteindre le débit d'eau à l'échantillon robinet. Enregistrez le taux final de flux, la date, l'heure, la lecture finale du totalisateur, et le volume total de l'échantillon.
4. Déconnecter l'appareil d'échantillonnage de filtre du robinet. Déconnecter le module de logement de cartouche à partir des autres modules.
   1. Tournez le logement (s) de filtre à l'envers et permettre l'excès d'eau se écouler jusqu'à ce que plus l'eau se écouler de deux ports d'entrée et de sortie.
   2. Tourner le boîtier debout et couvrir les raccords rapides à chaque extrémité d'une feuille d'aluminium stérile. Placer le boîtier dans un ou plusieurs sacs en plastique refermables.
   3. Videz l'eau de l'admission et discharge modules. Placez les modules dans un ou plusieurs sacs en plastique hermétiques.

4. L'expédition d'échantillons sur le terrain

1. Placer les modules de l'appareil d'échantillonnage de filtre dans un stockage et le transport glacière.
2. Ajouter briquettes congelées ou des cubes de glace double-ensachées pour le stockage et le transport de refroidisseur pour se assurer que l'échantillon reste entre 1-10 ° C pendant le transport. Deux grandes ou 6-8 petits paquets de glace devraient être suffisantes.
3. Placez un système d'enregistrement de la température dans le stockage et le transport isolé poitrine dans un endroit sans contact avec des packs de glace ou des sacs de glace.
   REMARQUE: le dispositif d'enregistrement de la température est facultatif si le laboratoire d'analyse sera utilisant un thermomètre infrarouge visuel pour mesurer la température du boîtier de la cartouche dès l'arrivée et l'ouverture du récipient.
4. Remplir tout l'espace vide avec le matériel d'emballage et ensuite placer la fiche de données de l'échantillon, protégé dans un sac en plastique refermable, le top. Fermez le stockage et le transport isolé poitrine et du ruban adhésif pour empêcher toute fuite d'eau.
5. Transporter ou expédier l'échantillon au laboratoire d'analyse. Assurez-vous que l'échantillon arrive au laboratoire d'analyse au plus tard 24 heures après le début de la collecte des échantillons sur le terrain (ce est à dire, le temps enregistré à l'étape 3.1).

Résultats

Colmatage du filtre est un problème potentiel majeur qui peut être rencontré avec la méthode 1615. colmatage diminue le débit d'eau à travers le filtre. Dans certains cas, cela peut être surmonté par l'ouverture du robinet à soupape pour permettre un plus grand débit. Dans d'autres cas, le filtre va devenir complètement bouché avant que le volume requis est passé à travers lui. Le tableau 1 montre le pourcentage d'échantillons avec des volumes réduits en fonction du type de filtre, du type de l'eau, et de la turbidité. Colmatage se est produite avec des échantillons à la fois de l'eau souterraine et de l'eau de surface, avec le filtre à base de nanofibres d'oxyde d'aluminium surperforme le filtre à base d'amine quaternaire pour les échantillons d'eau souterraine alors que l'inverse était le cas pour les échantillons d'eau de surface. Dans l'ensemble, 6% des échantillons prélevés en utilisant le filtre à base d'amine quaternaire était déficiente dans le volume tandis que 10% des échantillons prélevés avec les filtres à base de nanofibres d'oxyde d'aluminium n'a pas respecté le volume minimum spécifié nécessaire en raison de l'obstruction. Dans genresl, colmatage augmentait avec la turbidité, mais un certain nombre de différents composants contribuent à la turbidité et certaines d'entre elles ne conduisent pas à l'encrassement. Par exemple, 43% de tous les événements survenus au cours de colmatage l'étude ICR se limitait à deux systèmes fluviaux (données non présentées). Au cours de l'ICR le volume cible minimum pour l'eau de surface est de 200 L. Le volume moyen recueillies au cours de l'étude était de 217 ± 32 L avec un volume médian de 208 L (données de la base de données d'accès de 18 mois ICR Aux1 datés 25/04/2000) . Ainsi, le volume complet peut être recueillis auprès de nombreuses eaux, même avec de hauts turbidité.

L'ICR nécessaire échantillonneurs d'utiliser un préfiltre lorsque la turbidité étaient plus de 75 NTU, mais même avec un préfiltre, 34% des échantillons prélevés dans les eaux dont la turbidité de plus de 75 NTU bouché. Méthode 1615 recommande l'utilisation d'un préfiltre avec des eaux de plus de 50 NTU; Cependant, depuis la publication de la méthode de 1615, plusieurs options de préfiltre en plus à celles énumérées dans la méthode ont ététester. Aucun de ceux-ci conduit à une amélioration significative du volume de l'échantillon (données non présentées).

Figure 1. Filtre standard Appareil. L'appareil de filtre standard se compose d'admission, boîtier de filtre, et des modules de décharge (voir Matériaux supplémentaires pour une description de chaque module). Se il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

^c

Total des échantillons A	Nombre d'échantillons déficients b	Pourcentage échantillons déficients	Turbidité (NTU)
Les eaux souterraines utilisant NanoCeram Filtres c
113	1	1	<20
l'eau de surface en utilisant des filtres de NanoCeram c
83	12	14	<20 d
8	4	50	20 - <50
6	5	83	≥ 50 d
Total NanoCeram c
210	22	10	≥ 0
Les eaux souterraines utilisant 1MDS Filtres c
374	75	20	<20
2693	27	1 e	<20 e
505	36	7 f	20 - <50 f
122	19	16 e	50 - <75 g
175	60	34 e, f	≥ 75 e, f, g
Total des 1MDS c
3869	217	6	≥ 0

ext-align: center "> eau de surface en utilisant 1MDS Filtres

Tableau 1. la capacité de filtre ^un échantillons sont des études suivantes à partir de laquelle les données de volume et de turbidité sont disponibles:. 1) étude de l'EPA (ICR de données provenant de la base de données d'accès de 18 mois ICR Aux1 du 4/25/2000), 2) l'étude EPA des eaux souterraines ^8, 3) EPA-Laurent et Lowell, l'étude MA (données non publiées), 4) une étude EPA fleuve Mississippi (données non publiées), 5) étude EPA potable de l'usine de traitement de l'eau (données non publiées), 6) Méthode EPA 1615 étude d'évaluation ^25, et 7) les trois premiers mois de la surveillance UCMR3 (données non publiées). échantillons ^B où le filtre bouché avant que le volume minimum d'eau spécifié pour chaque étude ont été recueillis. Ce était de 200 L pour les eaux de surface et 1500 L pour les eaux souterraines, mais était de 200 L pour les eaux de source qui étaient souterraine sous l'EPA ICR et 1893 L pour l'étude des eaux souterraines EPA. ^C La capacité de recueillir la pleine volume minimum spécifié est significativement différent pour échantillons prélevés à l'aide de filtres et NanoCeram 1MDS (P = 0,002) et entre les eaux de surface et des eaux souterraines à la fois globale (P <0,001) et pour chaque type de filtre (P <0,001) en utilisant le test de Mann-Whitney Rank Sum. ^{d & #}8211; groupes ^G avec la même valeur en exposant sont significativement différentes (P <0,05) selon le Kruskal-Wallis Une Analyse de variance sur le test des rangs et Pairwise méthode des comparaisons multiples de Dunn. Pour tous les tests statistiques la variable dépendante est le volume ayant traversé le filtre comme une fraction du volume minimum spécifiée, mais avec une valeur maximale de 1,0.

Discussion

Différents types de filtres pour concentrer les virus dans les eaux environnementales ont été utilisés au cours des années ^26. Les méthodes actuelles utilisent des ultrafiltres, filtres ²⁷ électronégatifs ^13,28,29, des filtres en laine de verre ^{23, 30} et des filtres électropositifs. Électronégatif filtres ont été largement utilisés depuis de nombreuses années, mais une exigence pour l'addition de sel et l'ajustement du pH de l'eau dans le champ avant ou pendant l'échantillonnage limite leur utilité ^13. Le choix de filtre le plus pratique pour échantillonnage sur le terrain est filtres électropositifs. Ces filtres permettent l'échantillonnage de grands volumes d'eau à des débits élevés et sans aucun conditionnement de l'eau. Filtres de laine de verre sont l'option la moins coûteuse, mais avoir des débits plus lents que les filtres électropositifs et ne sont pas disponibles dans le commerce. Ultrafiltres fournissent les recouvrements plus élevés de virus sur une large gamme de qualité de l'eau, mais l'équipement requis pour Sampling est pas facilement portable champ et le temps nécessaire pour prélever des échantillons ²⁷ est beaucoup plus longue. Méthodes ont été développées récemment que l'utilisation préconditionné filtres électronégatifs pour éviter la nécessité d'un ajustement dans le domaine, mais ceux-ci peuvent ne pas être applicables pour la collecte de grands volumes d'échantillons ^28,29.

Méthode EPA 1615 utilise des filtres à cartouche électropositifs qui obtiennent leur charge positive soit de nanofibres d'oxyde d'aluminium ou des amines quaternaires. Les avantages du premier sur le second, ce est qu'il est moins cher et recueille efficacement le virus dans les eaux sur une plus large gamme de pH naturel valeurs ^30,31; Toutefois, chaque cartouche, ainsi que les filtres de laine de verre utilisés par Borchardt et ses collègues donnent recouvrements similaires de entérovirus et de norovirus ^23,31,32 de l'eau (Cashdollar, données non publiées). Les filtres à cartouches sont placées dans un appareil d'échantillonnage simple qui est conçu pour simplifier la collecte d'échantillonset réduire la contamination pendant l'échantillonnage.

Les méthodes standard sont inestimables lorsque de grandes études sont effectuées avec plusieurs laboratoires d'analyse. Méthode EPA 1615 prévoit des procédures et des conseils pour minimiser les deux grandes questions de collecte de l'échantillon qui peuvent affecter les données recueillies au cours de ces standards études-faux résultats positifs découlant de la contamination lors de la collecte de l'échantillon ou de composants de l'appareil mal désinfectée, et le colmatage des pores du filtre par des composants en l'eau étant échantillonné.

Tout comme les virus entériques peuvent se propager de personne à personne en raison de manque d'hygiène, les virus peuvent être introduits dans des échantillons provenant de la main ou des mains mal lavées avec des gants contaminés ^33. Il est essentiel que les échantillonneurs à comprendre les voies potentielles de contamination et utilisent une technique aseptique lors de l'échantillonnage. Échantillonneurs doivent comprendre que les gants sont principalement utilisés pour protéger l'échantillonneur de l'exposition et de ne pas protéger l'appareil de contamination. Les mains doivent être lavées avant le début de l'échantillonnage et de soins doivent être prises au cours de l'enfilage de gants pour prévenir main gant contamination. Échantillonneurs de gastro-entérite ou des symptômes respiratoires ne doivent pas prélever des échantillons, car ils pourraient être versaient entérovirus ou norovirus dans les niveaux élevés.

Deuxièmement, il faut veiller à éviter toute contamination du virus à partir des événements d'échantillonnage précédentes. Pour réduire cette source potentielle de contamination, le dispositif d'échantillonnage dans la méthode 1615 a été modifiée de celle de l'ICR par l'exclusion d'un régulateur de pression et de mesure de pression entre l'entrée et le module de logement de cartouche. Ces composants ont été retirés parce que les pressions observées pendant les événements d'échantillonnage étaient toujours en dessous de la note maximale du logement (par exemple, 125 psi pour les boîtiers de cartouches 5 pouces) et parce qu'ils étaient difficiles à désinfecter. Ce dernier problème a été démontrée grâce à l'utilisation de l'équipement témoins à blanc en studies la suite de l'ICR ^6,20. Le degré auquel il affecté les données ICR est inconnue, mais était probablement faible; il n'y avait que deux échantillons de faux positifs d'évaluation des performances négatives pendant l'étude (données non présentées). Pour réduire davantage la possibilité de contamination par transfert, il est également recommandé que le module de tubulure d'entrée est remplacé après chaque événement d'échantillonnage. Il est particulièrement important d'assurer une désinfection adéquate si l'appareil a été utilisé pour un contrôle de qualité ou de rendement qui a été ensemencée avec des virus. Avant de procéder à la désinfection, la concentration de chlore libre doit être mesurée de la perte au cours du stockage. En plus des modifications de la configuration de l'appareil décrit ci-dessus, il est essentiel que les ébauches de l'équipement normal être exécutées pour démontrer que la désinfection est efficace. Méthode 1 615 mandats qui ébauches de matériel être effectuée en utilisant des appareils qui ont été désinfectés après avoir été utilisée pour les contrôles de virus tête de série, ce qui simplifiela procédure en éliminant la nécessité de passer d'une solution de virus tête de série à travers l'appareil avant la désinfection. La concentration de désinfectant a été porté à 0,525% d'hypochlorite pour la méthode 1615, que cette concentration est nécessaire à la fois pour inactiver tout virus viables sur le matériel et à dégrader les acides nucléiques. Par conséquent, les blancs d'équipement doivent être analysés en utilisant à la fois la culture cellulaire et analyses qPCR.

Les deux types de filtres électropositifs ont fait l'objet d'une obstruction pendant les études rapportées dans le tableau 1. Un nombre inconnu d'échantillons avec des volumes réduits peut-être dû à des erreurs d'échantillonnage, comme une lecture erronée du totalisateur ou un arrêt plus tôt intentionnelle de l'échantillonnage de rencontrer un autre date limite, en particulier pour les eaux à turbidité lectures de moins de 20 NTU. Le degré de colmatage dépend à la fois les paramètres de type de filtre et la qualité de l'eau. Préfiltres fournissent une certaine mesure de l'amélioration, mais se il est utilisé, doivent être traitées et analyséesséparément du filtre électropositif. La recommandation actuelle pour la UCMR3 est que l'échantillon soit prélevé sans préfiltres en utilisant des filtres à base de nanofibres d'oxyde-deux aluminium si au moins la moitié du volume peut être recueillie à l'aide du premier filtre.

matériels

Name	Company	Catalog Number	Comments
1-L polypropylene bottle	Nalgene	2104-0032
Aluminum foil squares	Cole-Parmer	06275-40
Autoclave	Steris	Amsco Lab Series
Bubble wrap	U.S. Plastics	50776
Closable bag	Uline	S-12283
Closable bag	Fisher Scientific	S31798C
Commercial ice packs	Cole-Parmer	06345-20
Cool safe box	Diversified Biotech	CSF-BOX
Gauze sponge	Fisher Scientific	22-415-469
Graduated cylinder	Cole-Parmer	06135-90	4-L or larger
Hype Wipe	Fisher Scientific	14-412-56
iButtons temperature data logger	Maxim	DS1921G
Insulated storage and transport chest	Fisher Scientific	11-676-12
Packing tape	U.S. Plastics	50083
Portable chlorine colorimeter II test kit	Hach	5870062
Portable pH and temperature probe	Omega	PHH-830
Portable turbidity meter	Omega	TRB-2020-E
PTFE thread tape	Cole-Parmer	08270-34	Use on all threaded connections
Pump, Centrifugal Magnetic Drive	Cole-Parmer	72010-20
Reduction nipple	Cole-Parmer	06349-87
Sodium hypochlorite (NaClO)			Use locally available household bleach
Sodium thiosulfate (Na2S2O3)	Sigma Aldrich	217247
Surgical gloves	Fisher Scientific	19-058-800
Waterproof marker	Fisher Scientific	22-290546
Media	Composition
0.525% sodium hypochlorite (NaClO)	Prepare a 0.525% NaClO solution by diluting household bleach 1:10 in dH2O.  Store 0.525% NaClO solutions for up to 1 week at room temperature.
[header]
1 M sodium thiosulfate (Na2S2O3) pentahydrate	Prepare a 1 M solution by dissolving 248.2 g of Na2S2O3 in 1 L of dH2O.  Store sodium thiosulfate for up to 6 months at room temperature.