Intégration du fonctionnement du réseau moléculaire à la 2D-HPLC-MS pour l’analyse d’échantillons de pendule d’aconit

Pour commencer la préparation des données, exportez les données spectrales de masse brutes HPLC-MS 2D. Ensuite, pour vous connecter au serveur FTP GNPS dans l’interface WINSCP sur la page Configuration de la session, remplissez les informations de connexion. Après avoir rempli les informations, cliquez sur le bouton Démarrer pour établir une connexion au serveur FTP GNPS.

Créez des réseaux moléculaires en ouvrant un navigateur Web et en visitant le site Web du GNPS. Les nouveaux utilisateurs doivent créer un compte, puis se connecter. Sur l’interface principale du site Web du GNPS, cliquez sur Créer un réseau moléculaire sous Analyse des données.

Sur la page Création de tâche, cliquez sur le bouton Sélectionner les fichiers d’entrée, puis sélectionnez et téléchargez le fichier de données. Dans les onglets Option de flux de travail, définissez les différents paramètres qui génèrent le réseau moléculaire ou MN. Ces paramètres incluent l’algorithme d’extraction de pic, la valeur de pic sur la course, la méthode de calcul de similarité, etc. Après avoir défini les paramètres appropriés selon vos besoins, cliquez sur le bouton Envoyer en bas de la page pour exécuter la tâche.

Une fois la tâche exécutée, recherchez les tâches créées dans l’onglet Tâches et cliquez sur le nom du flux de travail pour afficher les résultats de l’analyse. Le site Web fournit des diagrammes MN, des substituts, des réseaux symbiotiques et d’autres informations connexes. Quatre des composants alcaloïdes dans les échantillons APB identifiés par le MN étaient l’aconitine, la 14-benzoylaconine, la 14-O-acétylnéoline et l’hypaconitine.

Les quatre composés avaient le même noyau parent. L’aconitine, la 14-benzyl aconine, la 14-benzoylaconine et l’hypaconitine étaient similaires, et seuls les substituants étaient différents.