Bactéries étiquetées fluorescentes comme traceur pour révéler de nouvelles voies de flux de carbone organique dans les écosystèmes aquatiques

Cette approche est significative car elle nous permet de visualiser et d’estimer les flux de carbone et d’énergie des procaryotes aux niveaux trophiques plus élevés dans les réseaus alimentaires microbiens à très haute résolution. Il s’agit de la seule technique actuellement disponible pour déterminer quelles espèces protistes consomment des bactéries in situ, tout en quantifiant le taux de ce processus à un niveau unicellique. Étant donné que les bactéries sont les seuls microbes importants qui changent le carbone organique dissous en carbone organique particulaire, les connaissances des acteurs impliqués et les taux auxquels cela se produit forment la base pour comprendre les écosystèmes aquatiques en général. Nous recommandons fortement aux chercheurs de se familiariser avec leur système d’étude avant de mener des expériences de pâturage. Il s’agit de la lumière et de l’épifluorescence de l’inspection par microscopie des échantillons, ainsi que de la connaissance du taxon principal présent et de leur dynamique saisonnière. Jitka Jezberov démontrera la procédure.