Method Article
שיטה בדיוק להפיק באופן מקיף לאפיין המורפולוגיה של פטריות פילמנטיות אספרגילוס ניז'ר מתוארת, המאפשר קשר מתמטי של המראה הצורני ואת הפרודוקטיביות.
א פטריות פילמנטיות ניז'ר היא זן שימוש נרחב במגוון רחב של תהליכים תעשייתיים, החל מזון כדי תעשיית התרופות. אחד המאפיינים המסקרנים ביותר ובלתי נשלט לעתים קרובות של אורגניזם זה פילמנטיות הוא מורפולוגיה המורכב שלה. זה נע בין כדורי כדוריים צפופים כדי mycelia צמיגה (איור 1). פרמטרים שונים בתהליך וחומרי גלם ידועים להשפיע מורפולוגיה פטרייתי 1. מאז התפוקה האופטימלי וקושרת חזק עם צורה מורפולוגית ספציפית, מורפולוגיה פטרייתי לעיתים קרובות מהווה את צוואר הבקבוק של פריון הייצור התעשייתי.
גישה קדימה אלגנטי ישר לשלוט במדויק צורה מורפולוגית הוא תוספת של מיקרו חלקיקים אורגניים מסיסים (כמו מגנזיום סיליקט להזרקה, אלומיניום אוקסיד או תחמוצת טיטניום סיליקט) עד בינוני תרבות תרומה ייצור האנזים גדל 2-6. מאז יש obvious קשר בין המורפולוגיה החלקיקים מיקרו תלוי ייצור האנזים רצוי מתמטית לקשר את הפרודוקטיביות ואת המראה הצורני. לכן תיאור כמותי מורפולוגי מדויק הוליסטית ממוקדת.
לכן, אנו מציגים שיטה להפקת ולאפיין מיקרו תלויים החלקיקים מבנים מורפולוגיים, כדי לקשר בין המורפולוגיה פטרייתי עם פרודוקטיביות (איור 1) אשר ככל הנראה תורם להבנה טובה יותר של המורפוגנזה של מיקרואורגניזמים פילמנטיות.
א זן רקומביננטי ניז'ר SKAn1015 מעובדת במשך 72 שעות ב L 3 עוררה bioreactor הטנק. על ידי תוספת של חלקיקי טלק מיקרו בריכוז של 1 גר '/ ל', 3 גר '/ ל' ו - 10 גר '/ ל' לפני חיסון מגוון רחב של מבנים מורפולוגיים נוצר reproducibly. דגימות סטריליות נלקחים לאחר 24 שעות, 48 ו 72 לקביעת ההתקדמות הצמיחה והפעילות של האנזים מיוצר.המוצר שנוצר הוא אנזים גבוהה ערך β-fructofuranosidase, biocatalyst חשוב ליצירת ניאו הסוכר במזון או תעשיית התרופות, אשר מזרז בין היתר את התגובה של סוכרוז לגלוקוז 7-9. לכן, כימות של גלוקוז לאחר הוספת סוכרוז מרמז כמות fructofuranosidase-β מיוצר. כימות גלוקוז נעשה על ידי אלוהים / POD-Assay 10, אשר שונה לניתוח תפוקה גבוהה ב 96-גם מיקרו צלחות titer.
מורפולוגיה פטרייתי לאחר 72 שעות נבדק על ידי מיקרוסקופ ומאופיינת על ידי ניתוח תמונה דיגיטלית. בעשותו כן, צורת החלקיקים גורמי המאקרו מורפולוגיה פטרייתי כמו בקוטר של Feret, באזור המוקרן, המערכת, המעגליות, יחס גובה, und מוצקות עגלגלות מחושבים עם התמונה קוד פתוח לעיבוד תוכנית ImageJ. הפרמטרים הרלוונטיים משולבים למספר מורפולוגיה מימדים (Mn) 11, המאפשרת אפיון מקיף שלפטרייתי המורפולוגיה. קשר הדוק של מספר מורפולוגיה ופריון מודגשים על ידי רגרסיה מתמטית.
1. הכור התקנה התחלה של טיפוח
4 cultivations bioreactor בסך הכל מתנהלים.
2. דגימה סטריליים לאחר 24, 48 ו - 72 שעות של טיפוח
3. קביעת משקל יבש ביומסה לאחר 24, 48 ו - 72 שעות של טיפוח
4. קביעת פעילות אנזימתי של תאי β-fructofuranosidase מאמרו-POD אלוהים / אחרי 24, 48 ו - 72 שעות של טיפוח
לאחסן דגימות על הקרח כל הזמן תוך כדי עבודה איתם.
5. מיקרוסקופ ניתוח תמונה אוטומטי לאחר 72 שעות של טיפוח
6. נציג תוצאות
באמצעות תוספת של טלק מיקרו חלקיקים א ניז'ר SKAn 1015 המורפולוגיה היא שונה מורפולוגיה גלולה נאמן מורפולוגיה מפוזרים או mycelial אפילו. בעוד מורפולוגיה גלולה מוצג בתנאים סטנדרטיים מורפולוגיה mycelial נוצר על ידי תוספת של המדיום עם 10 גר '/ ל' של חלקיקי טלק מיקרו (איור 4.). במקביל לפעילות של fructofuranosidase-β עולה סביב 03-05 מרס קיפול. תוספת של 1 או 3 גר '/ ל' של אבקת טלק מוביל מורפולוגיה התפזרו, עם פעילות fructofuranosidase הוכפל (איור 4.).
מורפולוגיה החלקיקים מיקרו תלויה ניתן לתאר באופן מקיף על ידי מורphology מספר אשר ניתן לחשב באמצעות פרמטרים שנקבעו על ידי ניתוח התמונה אוטומטית. כדורי עגול לגמרי וחלק יהיה ב תמונות מיקרוסקופיות מופיעים עיגולים מושלמים. עבור חלקיקים כאלה מספר מורפולוגיה יש ערך של 1. שבר הקטן ביותר של מורפולוגיה mycelial ניתן לפשט כקו חד ממדית מניב מספר מורפולוגיה של 0. כל צורות מורפולוגיות ביניים כמו כדורי סדיר או גושים מאורכים יהיה ולכן יש ערכים בין 0 ל -1. חלקיקים גדולים יחסית תגרום, חלקיקים גבוהים פטריות עם משטח גדול או חלקיקים מאורכים, במספר מורפולוגיה נמוכה ולא 11.
בתנאים סטנדרטיים מורפולוגיה בכור 1 מוצגים מספר מורפולוגיה סביב 0.8. מורפולוגיה בכור 4 עם 10 גר '/ ל' אבקת טלק תכונות Mn סביב 0.1. מספר מורפולוגיה של כורים 2 ו -3, עם ריכוזים אבקת טלק של 1 ו - 3 גר '/ ל', הנמצא בין הקצוות הללו, הוכחת morpho התפזרומשעמם. מאז מורפולוגיה החלקיקים מיקרו תלויה קשורה קשר הדוק עם פרודוקטיביות β-fructofuranosidase, קשר מתמטי של מספר מורפולוגיה ופרודוקטיביות דומה איור 5 מתקבל.
באיור 1. תוכנית כוללת של עיצוב ניסיוני ההליך הטיפולי. א ניז'ר מעובד (עם או בלי חלקיקים זעירים) ב L 3 עוררה bioreactor טנק של 72 שעות. לאחר 24, 48 ו - 72 מדגם חה נלקח לקביעת משקל ביומסה יבשה β-fructofuranosidase הפעילות, אשר שוב משמשים לחישוב יעילות מסוימת. לאחר 48 שעות מורפולוגיה פטרייתי נבדק על ידי מיקרוסקופ ומאופיינת על ידי ניתוח תמונה דיגיטלית. הפרמטרים הרלוונטיים של ניתוח התמונה משולבים למספר מורפולוגיה, שהיא מתמטית בקורלציה עם יעילות מסוימת.
איור 2. שלבים של עיבוד תמונה עבור מיקרוסקופית שנוצר תמונות של מבנים מורפולוגיים של א ' ניז'ר. שלב 1: רכישת התמונה של מיקרוסקופ. שלב 2: שיפור התמונה במידת הצורך. שלב 3: binarization תמונה, שחור ולבן (בינארי) התמונה שנוצר ImageJ. שלב 4: תמונה בינארית מעובד על ידי והאובייקט לא רצוי נמחקים. שלב 5: ניתוח מורפולוגי מתבצע באמצעות הפונקציה "ניתוח חלקיקים" של התוכנית קוד פתוח ImageJ.
איור 3. צורות מורפולוגיות שונות של א ' תלוי בריכוז של חלקיקים זעירים מוסף ניז'ר. עם ריכוז גדל והולך של מיקרו חלקיקים הוסיף בגודל גלולה יכולה להיות ירידה דווקא אל הליבה מעטפת כדוריות קטנות, להקות קטנות תפטיר אפילו התפזרו באופן חופשי. מורפולוגיה של הנדסה כמוpergillus ניז'ר SKAn1015 ע"י תוספת חלקיקים מיקרו בתרבות מתחת למים. ללא microparticles (א), 10 מ"ג / ל '(ב'), 0.1 גר '/ ל' (ג), 0.2 גר '/ ל' (ד '), 0.3 גר' / ל '(ה), 0.6 גר' / ל '(F), 1.0 גר' / ל ' (ז), 1.5 גר '/ ל' (ע), 2.0 גר '/ ל' (אני), 2.5 גר '/ ל' (J), 3.0 גר '/ ל' (K), 3.5 גר '/ ל' (ל '), 4.0 גר' / ל '(M ), 4.5 גר '/ ל' (N), 5.0 גר '/ ל' (O), 10 גר '/ ל' (P), 15 גר '/ ל' (Q), 20 גר '/ ל' (R), 30 גר '/ ל' (S) 40-50 גר '/ ל' (ט). התמונות צולמו על ידי מיקרוסקופ אור לאחר 72 שעות של טיפוח.
איור 4. פעילות Fructofuranosidase ב התלות של טלק החלקיקים מיקרו ריכוז 1 גר '/ ל' (כור 2), 3 גר '/ ל' (בכור 3) ו - 10 גר '/ ל' (הכור 4). הכור 1 לא השלימו עם חלקיקים זעירים, כאן הטיפוח מתבצע בתנאים רגילים.
איור 5. קורלציה טובה נציג (R 2 = 0.91) של מורפולוגיהמספר יעילות מסוימת. מספר מורפולוגיה הוא זמם (abscissa) נגד הפרודוקטיביות ספציפי (לתאם). רגרסיה ליניארית מניב קשר מעריכי.
שינוי של מורפולוגיה פטרייתי כבר עניין בביוטכנולוגיה מאז עשרות שנים. מחקרים שונים ניסו לשנות פרמטרים של התהליך נבחרה כגון ערך ה-pH, כניסת חשמל, טמפרטורה, חומרי מזון בינוני או ריכוז הבידוד 1, אבל סובלים שליטה מדויקת למדי שלם של מורפולוגיה, עלויות האנרגיה הגבוהות, אפקטים עיכוב או חוסר יציבות המוצר, לעומת זאת, תוספת של חלקיקי מיקרו מאפשר הנדסה מדויקת של מורפולוגיה פטרייתי דרך וריאציה מכויל של גודל החלקיקים וריכוז. זה פותח אפשרויות חדשות לשימוש חלקיקי מיקרו לצורך מיטוב לעיצוב תפורים המורפולוגיה לייצור גבוה הייצור הביוטכנולוגי עם א ' ניז'ר ו פילמנטיות מיקרואורגניזמים אחרים.
ניתוח תמונה דיגיטלית היא שיטה לשחזור קל לאפיין את המורפולוגיה מאקרו פטרייתי. עם זאת, מגוון רחב של פרמטרים המאפיינים, גודל, צורה השטחטר של מבנים מורפולוגיים המתואר בספרות עושה הערכה מהירה של מורפולוגיה פטרייתי מסובך. מספר מורפולוגיה הציג כשילוב של הפרמטרים הרלוונטיים, ימנע חוסר זה והוא יכול לשמש לא רק אפיון מקיף של מבנים מורפולוגיים, אלא גם קשר מתמטי ישיר עם פרודוקטיביות. זה שוב הופך את הערכת היעילות של מורפולוגיה נתון ולכן התאמה אישית של המורפולוגיה של התהליך צריך האפשר.
משתמש מספר מורפולוגיה, ניתן להבחין בין גלולה שונים מורפולוגיות גוש 4.5. להמשך פיתוח של מספר מורפולוגיה תמורת מימד פרקטלית נראה מבטיח. מימד פרקטלית נותנת מדידה מורכבות ומסה מילוי המאפיינים של האובייקט 13 והוא predestinated ולכן לאפיון הוליסטי של מורפולוגיה mycelial.
CReation המורפולוגיה גבוהה mycelial לייצור, לעומת זאת, עלול לגרום בעיות עם הביצועים תהליך במיוחד לגידול בקנה מידה גדול, כי צורת הגידול mycelial הוכח בעבר להפגין הרבה יותר מרק viscosities תרבות 2. זה מוביל בעיות עם מעבר חום ומסה היווצרות של מים עומדים באזורים שאינם מעורבים, אשר דורשים תשומת חשמל גבוה ולעשות טיפוח יקר יותר להפעיל 1. לכן הקשר בין המורפולוגיה פטריות מרק צמיגות התרבות יש לשקול בעת שינוי המורפולוגיה להיות משולב בדגמים נוספים.
אין לי מה לחשוף.
החוקרים בתודה להכיר תמיכה כספית הניתנת על ידי קרן המחקר הגרמנית (DFG) באמצעות מחקר משותף במרכז SFB 578 "מאת ג'ין למוצר" על אוניברסיטת Technische בראונשווייג, גרמניה.
Table of Equipment:
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Equipment | Company | Catalogue Number/model | |
autoclave | Systec | V150 | |
Büchner funnel (plastic) | VWR | - | |
cellulose filter (for biomass dry weight) | Sartorius Stedim Biotech | Filter Discs Grade 389 | |
cellulose acetate filter (for air filtration at reactor) | Sartorius stedim biotech | Midisart 200 PTFE | |
cellulose acetate filter (for enzyme activity) | Sartorius Stedim Biotech | Midisart NML | |
centrifuge | Eppendorf | Centrifuge 5415R | |
centrifuge | Heraeus | Biofuge fresco | |
centrifuge | Heraeus sepatech | Varifuge 3.0R | |
compartment dryer (105 °C) | Heraeus | Kelvitran t | |
control unit (temperature) | Jumo | Jumo iTron 08 | |
control unit (pH-value) | meredos | pH Control 2 | |
desiccator | Duran | Vacuum stable | |
Falcon tubes | Omnilab | FALC352070 | |
heating block 40 °C | Biometra | TB1 Thermoblock | |
heating block 95 °C | HLC | HBT 130 | |
micro plate reader | Tecan | Sunrise-Microplate-Reader | |
micro scales | Sartorius | CP 225 | |
microscope (digital inverted) | AMG | EVOS xl | |
micro pipettes and tips (different sizes) | Omnilab | 5283303 5283298 5283299 5283300 | |
micro titer plate | Nunc | MaxiSorp | |
multi pipette and tips | Eppendorf/ Omnilab | 5283611/ 5283611 | |
pH-electrode | Schott | pH-Meter CG840 | |
reaction tubes | Roth | E518.1 | |
scale | Sartorius | CP 3202 S | |
stirred tank bioreactor with equipment | Applikon Biotechnology | 2L Bioreactor set | |
syringe | Eppendorf | Combitips Plus 5 mL |
Table of Reagents:
Name of the reagent | Company |
Acetic acid | Roth |
Disodium hydrogen phosphate | Merck |
Ethanol (95%) | Roth |
Glucose monohydrate, (α-D-) | Roth |
Glucose oxidase (Typ II from Aspergillus niger) | Sigma |
Hydrochloride acid (37 % w/v) | Fiedel-de Haën |
Hydrous magnesium silicate | Roth |
Monopotassium phosphate | Merck |
o-dianoisidine dihydrochloride | Sigma |
Peroxidase (Typ II from horseradish) | Sigma |
Sodium acetate | Roth |
Sodium hydroxide | Merck |
Sucrose, D-(+) | Fluka |
Water (deionized) | - |
Table of Solutions and Medium Composition:
Solution | Components | Amount |
50 mM sodium acetate buffer (pH 6.5) | Sodium acetate Bring to volume with deionized water Adjust at pH 6.5 with acetic acid | 4.1 g L-1 |
0.05 M monopotassium phosphate solution | Monopotassium phosphate Bring to volume with deionized water | 6.805 g L-1 |
0.05 M disodium hydrogen phosphate solution | Disodium hydrogen phosphate Bring to volume with deionized water | 7.1 g L-1 |
0.05 M phosphate buffer (pH 7.0) | 0.05 M disodium hydrogen phosphate solution Bring to volume with 0.05 M monopotassium phosphate solution | 61.2 mL |
0.05 M phosphate buffer (pH 5.4) | 0.05M disodium hydrogen phosphate solution Bring to volume with 0.05 M monopotassium phosphate solution | 3 mL |
1.65 M sucrose solution | D-(+)-sucrose Bring to volume with phosphate buffer (pH 5.4) | 564.8 g L-1 |
reagent solution | o-Dianisidin-Dihydrochlorid Ethanol (95%) | 25 mg 10 mL |
Glucose reagent solution | Glucose oxidase Peroxidase Phosphate buffer (pH 7.0) reagent solution | 10.5 mg 3 mg 90 mL 10 mL |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved