JoVE Logo

Sign In

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • תוצאות
  • Discussion
  • Disclosures
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

כתב יד זה מתאר את zWEDGI (דג זברה Wounding והתקן מלכודת צמיחה, הדמיה), אשר הוא מכשיר ממודר שנועדה אוריינט לרסן את הזחלים דג זברה. העיצוב מאפשרת חיתוך זנב ארוך טווח אוסף של תמונות מיקרוסקופ פלואורסצנטי ברזולוציה גבוהה של ריפוי הפצע והתחדשות.

Abstract

הזחל דג זברה היא אורגניזם מודל חשוב ביולוגיה התפתחותית וגם ריפוי הפצע. עוד יותר, הזחל דג זברה היא מערכת חיה דימות ברזולוציה מיקרוסקופיים התופעות ביולוגית דינאמית במרחב ובזמן עם רזולוציה הסלולר יקר. עם זאת, השיטה המסורתית של כימוס agarose עבור הדמיה חיה לטרפד פיתוח זחל, רקמות לצמיחה מחודשת. לכן, כתב יד זה מתאר את zWEDGI (דג זברה Wounding והתקן מלכודת צמיחה, הדמיה), אשר היה מיועד, מפוברק כהתקן פונקציונלית ממודר כדי להציב את הזחלים של מיקרוסקופ ברזולוציה גבוהה בזמן המתיר סנפיר סימטרית חיתוך בתוך המכשיר, הזנב ערככם עוקבות התפתחות וצמיחה re. התקן זה מאפשר ופצעו והדמיה לטווח ארוך תוך שמירה על יכולת הקיום. בהתחשב בכך כייר zWEDGI הוא 3D מודפס, ביכולת ההתאמה האישית של גיאומטריות שלה לעשות את זה בקלות שונה עבור יישומי הדמיה דג זברה מגוונות. יתר על כן, zWEDGI מציע שיתרונות רבים, כגון גישה הזחל במהלך ניסויים עבור ופצעו או היישום של ריאגנטים, הוקרב הכיוון של הזחלים מרובים עבור הדמיה יעיל, שימושית של המכשיר.

Introduction

יכולת ההתחדשות של דג זברה הזחלים רזבורה rerio להפוך אותם אורגניזם מודל אידיאלי בחינת הפצע התגובה, כמו גם לריפוי, לצמיחה מחודשת1,2,3,4. גישה למערך של דג זברה מהונדס קווים ושקיפות של דג זברה אנטומיים נוספים לשפר את השירות שלהם ללימודי אין ויוו של הפצע התגובה לאירועים, כמו גם לתהליכי הרגנרציה וקהילותיהם4. חקר תהליכים ביולוגיים אלה באמצעות מיקרוסקופ ברזולוציה גבוהה זריחה זמן לשגות ולכן תובע חיה הדמיה דג זברה התקן המאפשר תנועה מינימלית של הזחל דג זברה והיציבות גבוהה תוך שמירה על יכולת הקיום. . זה המפתח כי המכשיר מאפשר ופצעו יעיל בעת ריפוי, התחדשות להתרחש לא מושפע על ידי המכשיר

חיה הדמיה מייצב השיטה הרגילה הטבעה הזחל ב- agarose במהלך דימות בשידור חי מגבילה את הצמיחה, פצע התחדשות5 , עשוי להגדיל את שיעורי התמותה מאז מתחילים הזחלים להראות סימן לב לב מתח, רקמת נמק אחרי 4 שעות4. לכן, הסרת agarose מאזורים עניין לעתים קרובות יש צורך לאפשר להתפתחות התקינה, התחדשות6, לחשוף את הזחלים נזק פוטנציאלי כמו agarose זה לחתוך. יתר על כן, עם agarose טכניקת הטבעה, המשתמש חייב אוריינט הזחלים בזמן הקצר לפני agarose עפור5,6,7. במהירות מניפולציה הזחל לא רק דורש מיומנות של המשתמש, גם סיכון לפגיעה הזחל. למרות שיטות לייצב את הזחל עבור הדמיה חיה תוארו לעקוף חסרונות אלה, כמו אגר מחורץ בארות3 או divets8, שימוש סיליקון בוואקום משמנים ליצירת תא הדמיה עם צנרת PVC או אחרים חומרים6וסבב אבובים9, מרבית השיטות האלה הם עבודה אינטנסיבית, מבולגן, לעיתים קרובות ללא הניתן וגם לא מאפשרים מניפולציות סביבתיות (תרופות טיפולים, ופצעו וכו.) אחרי הדגים יש לטעון.

לכן, המכשיר zWEDGI (איור 1) תוכנן כדי להתגבר על חלק החסרונות של אגר הרכבה עבור הדמיה חיים לטווח ארוך של דג זברה הזחלים בזמן המתיר מניפולציה של הדגימה. ZWEDGI מורכב שלוש פתוח למחצה ממודר צ'יימברס (איור 1 א') כדי לאפשר טעינה, איפוק, ופצעו, הדמיה של 2-4 ימים לאחר ההפריה דג זברה הזחלים. המכשיר מפוברק מן Polydimethylsiloxane (PDMS), להציב על גבי בתגית כיסוי זכוכית 60 מ מ בתחתית צלחתי הדמיה. העיצוב המובאת כאן נועד ללימודי ריפוי הפצע, אולם השימוש העיצוב המודולרי וטכנולוגיות ייצור רגיל לעשות עיצוב zWEDGI לשינוי, נוטה מגוון פרוצדורות ניסיוני, במיוחד עבור שגרות זה מחייבים ריסון מינימלי עם מניפולציה ניסויית והדמיה לטווח ארוך.

Protocol

הערה: העיצוב zWEDGI הבסיס גובשה עבור הזחלים דג זברה 2-4 ימים לאחר ההפריה (dpf), עקוב אחר ההנחיות של מרכז המשאבים חיות מחקר באוניברסיטת ויסקונסין-מדיסון.

1. הדפסת תלת-ממד של תבניות ועיצוב

  1. מודל PDMS רכיב של המכשיר עם הרצוי גיאומטריות ותכונות ב- 3D מידול תוכנה 5. ליצור הרכבה של תבנית ריקה ואת החלק PDMS וליצור תבנית שלילי עבור החלק PDMS על-ידי יצירת חלל ב כייר המתאים לחלק PDSM. לשמור את התבנית כקובץ .stl עבור הדפסת תלת-ממד ( איור 2, שלב 1.1).
    הערה: קובץ בתבנית (.stl) stereolithography של עיצוב כייר המובאת כאן ( איור 1) זמין להורדה בכתובת https://morgridge.org/designs/.
  2. תבניות
  3. הדפסה באמצעות מדפסת תלת-ממד photopolymer ( איור 2, שלב 1.2). להכין תבניות מרובות בהדפסה אחת, אם אפשר, אז יותר מהתקן אחד שאפשר לעצב עם אצווה בודדת של PDMS.
    הערה: הדוגמה המוצג הודפס במצב hi-res עם 0.075 ק מ מ קרן קוטר ו 0.05 מ"מ שכבת עובי, באמצעות שרף photopolymer 5.
    1. בתבניות נקי בעזרת מברשת בסדר, אלכוהול מפוגל בקבוק ספריי, ולאחר באוויר דחוס כדי לשפשף בעדינות ולהסיר שרף משומרים. להסיר כל חומר מן האזורים microchannel.
    2. פוסט-לרפא את תבניות מנגנון התרופה פוסט UV עבור 60 דקות בכל צד כפי היכנע משומרים רעיל דג זברה הזחלים 10.
  4. חול לצד חלל התבנית עם נייר זכוכית 200 חצץ על משטח שטוח עד כל המשטחים איטום נמצאים נייר זכוכית (טעינת ערוץ גיאומטריות וההיקף עובש). בקלילות חול בנייר חצץ חול 400, 600, בהדרגה, כדי לייצר משטחים חלקים סומק על פני כל facings גיאומטריה ( איור 2, שלב 1.3). למדוד את העומק של החלל לאחר מלטש עם מחוון חיוג כדי לוודא כי זה קרוב העומק מעוצב.
    1. לנקות תבניות ולכסות דיסקים (בקוטר סנטימטר ¾ 1 x ¼ אינץ זכוכית בורוסיליקט עבה או אקריליק; כוס אחת לכסות לכל עובש) על-ידי הצבת קולי מלא מנקה במים למשך 30 דקות או על ידי שטיפה תחת מים זורמים.
    2. למצוץ יבש עם אוויר דחוס לנקות את שתי התבניות, מכסה עם אלכוהול איזופרופיל ואוויר דחוס מסוננים. השתמש ספסל נקי כמקום כדי לפברק את ההתקנים כדי למזער את הזיהום מפני פסולת באוויר. עזוב תבניות נקי ואת זכוכית מכסה הספסל נקי או מכוסה פטרי עד שהוא נדרש.

2. PDMS ייצור של מכשיר zWEDGI

  1. להפוך PDMS על ידי שפיכת 184 סיליקון elastomer polydimethylsiloxane (PDMS) ביחס של 5:1 (בסיס activator) לתוך כוס פלסטיק. מערבבים היטב למשך 2 דקות עם מקל מעץ קרפט, תוך ערבוב את הג'ל על עצמה, כמו לישה לחם. לשימוש בתבניות 5, 10 גרם של בסיס ו- g 2 של מפעיל.
    1. דה-גז תערובת ב desiccator ואקום למשך 25-45 דקות עד כל הבועות נעלמו.
    2. למלא את חלל הבטן של כל התבניות מודפס 3D עם-0.75 מ ל PDMS בעזרת מזרק 10 מ"ל עד העובש מעט מלאה מניסקוס ( איור 2, שלב 2.1).
    3. דה-גז התבניות מלא למשך 45 דקות להסיר בועות נוספות שאולי נוצר בעת מילוי.
  2. להחיל דיסק כיסוי זכוכית מעל כייר מלא PDMS, לוחץ את הדיסק בזווית כדי למנוע בועות מלהיות לכוד ( איור 2, שלב 2.2). לאפשר PDMS עודף להיות מגורש כפי בעטיפת הדיסק זכוכית מוחל.
  3. שימוש קלאמפ רעשן קטן להחזיק את הדיסק כיסוי בחוזקה על העובש.
    הערה: זה יוצר משטח שטוח, ברגע PDMS נרפאה ומייצרת דרך חורים איפה גיאומטריות מודפס 3D מיושר עם תגית כיסוי זכוכית. לחלופין, כדי להגדיל את מספר התקנים יכולים להירפא בבת אחת, לבנות מכשיר מהדק מרובה (למשל. איור 2, שלב 2.3).
  4. לרפא את המתקן PDMS התבניות בחוזקה-100 o C בתנור למשך 90 דקות ( איור 2, שלב 2.4). מוציאים את התבניות מהתנור, להתקרר עד שהם ניתן לטפל בקלות. אם ההתקן clamping מתכת, להסיר את מכלול דיסק עובש ולכסות המלחציים כדי למנוע ממשיכים לרפא את PDMS עקב חום שיורי המתכת.
    הערה: המכשיר היא הקלה ביותר להסרת העובש ואילו עדיין מעט חם לא נרפא לחלוטין. עם זאת, לאחר העובש יוסר מן התנור, התקליטור כיסוי יוסר, המכשיר יכול לשבת כמה ימים לפני שימשיך demolding. אם המכשיר הוא demolded זמן קצר לאחר הסרת מהתנור ריפוי, להניחו בצלחת פטרי מכוסה כדי למזער מזהמים בעוד הוא מאפשר לרפא לחלוטין.

3. פלזמה-מליטה zWEDGI על צלחת זכוכית

  1. מהדק התבנית המכילה את המכשיר PDMS בתוך מלחציים ספסל כך העובש ' s גיאומטריות פונים למעלה, במקביל לספסל תחנת עבודה.
    1. התחלה כדי להסיר את ההתקן PDMS על ידי שחרור הכרטיסיה למשוך PDMS של העובש באמצעות פינצטה שקצהו שטוח. העבודה בהיקף של העובש עם הפינצטה (כמו הסרת עוגה מתוך מחבת ( איור 2, שלב 3.1)).
    2. שימוש סינון אוויר דחוס, פינצטה להוציא בעדינות את המכשיר מחוץ העובש על ידי מחזיק לשונית משיכה ונשף אוויר תחת המכשיר. לעבוד לאט, ומאפשר באוויר כדי לעזור נפרד PDMS של כייר, לוקח טיפול מיוחד עם קצות הפינצטה סביב הסעיפים המנהרה דק.
  2. המקום את המכשיר PDMS במהופך על החלק הפנימי של השער של תבשיל bottomed זכוכית כך הפרוסות המנהרה הרחקה נוגעות הפלסטיק ( איור 2, שלב 3.2).
  3. למקם את השער צלחת עם הפוך zWEDGI, המנה המתאימה של bottomed זכוכית פלזמה מנקה עם הזכוכית הפנימית פונה כלפי מעלה ( איור 2, שלב 3.3).
    1. לפנות פלזמה ניקוי החדר עד הלחץ מגיע 500 mTorr.
    2. צריכת חשמל גבוהה
    3. סט בתדר רדיו (RF). לחשוף את המכשיר ואת המנה לתדר RF עבור 2 דק לאט לחץ האוויר התא ולחזור המכשיר ואת המנה ברדס חדר נקי.
  4. להסיר את ההתקן PDMS כיסוי המנה. נהפוך את zWEDGI PDMS לכיוון הנכון על הזכוכית על-ידי הצבת אותם בזהירות על המרכז טוב של המנה התחתון זכוכית ( איור 2, שלב 3.4)
    1. שימוש בקצה האחורי של הפינצטה, בקלילות לחץ כלפי מטה PDMS התקן כדי להבטיח בועות אוויר לא לכוד מתחת. הפעילו לחץ סביב גיאומטריות דקה הערוצים מיקרו, להחליק את PDMS את הקצוות ( איור 5C).
      הערה: קשר מלא בין PDMS את הזכוכית מבטיחה הדבקות טובה יותר מפלזמה מליטה. המכשיר zWEDGI ניתן פלזמה בונדד על גבי תבניות צלחת זכוכית עם תחתית אחרות, כגון זכוכית עם תחתית 6-ובכן plate ( איור 2C).
    2. מיקום כיסוי מעל המנה התקן לפני הסרת מהשכונה חדר נקי.
      הערה: לאחר המכשירים תוקנו לזכוכית, הפרוטוקול ניתן להשהות עד שיהיו מוכנים לשימוש.

4. ערוץ הכנה וזחלים טעינת

הערה: גידול כללי דג זברה נערך לכל דג זברה הספר, זמין באינטרנט ב- http://zfin.org/zf_info/zfbook/zfbk.html. דג זברה למבוגרים, העוברים היו נשמרים כפי שתואר לעיל 1. המתח פראי סוג AB שימש. בצע את המוסד ’ s פרוטוקול טיפול בעלי חיים עבור הפרטים המדויקים בנוגע לדרישות הדמיה הזחלים בשידור חי-

  1. יש לשטוף הערוצים עם מינימום של אתנול 70% 100 µL לכל ערוץ, באמצעות micropipette לשטוף דרך הרחקה מנהרה. הסר אתנול ולשטוף 2 או 3 פעמים עם מים מזוקקים כפול. לאפשר לאוויר יבש.
  2. למלא את הערוצים עם חלב רזה (בריכוז 1% מדולל במים) למשך 10 דקות בטמפרטורת החדר, כדי למזער את הדבקות של הזחלים coverslip זכוכית של המנה. ואז, בעדינות להטביע את המכשיר מספר פעמים ב זוגי מים מזוקקים לשטוף. לאפשר לאוויר יבש הפוך.
    הערה: פרוטוקול אפשר לעצור כאן. זו הכנה של המכשיר zWEDGI ניתן לעשות מספר ימים לפני השימוש. החנות מכוסה בטמפרטורת החדר.
  3. הכן 1% ההיתוך לנקודת השפל (LMP) agarose על ידי שילוב 100 µL 2% נמס LMP agarose עם 100 µL 2 x Tricaine (0.4 מ"ג/מ"ל Tricaine - אתיל 3-aminobenzoate) ב- E3 מאגר 11 מראש התחמם עד 38 o C. לשמור על 1% agarose/tricaine פתרון 38 o C בתוך גוש חם כדי למנוע ג'לי.
    הערה: מיקרוסקופ multiphoton 11, להשתמש או דג זברה פיגמנט משולחים שאינם משתנים (כגון קספר 12) או לשמור על הזחלים ב- E3 המכיל 0.2 מ מ N-phenylthiourea כדי למנוע היווצרות פיגמנט 11 למינימום קליטת ליד אורכי הגל האינפרא-אדום על-ידי הפיגמנט.
    התראה: N-phenylthiourea הוא רעיל. בצע את המוסד ' s כללים עבור סילוק.
  4. הזחלים
  5. Anesthetize ב E3 מאגר המכיל 0.2 מ"ג/מ"ל tricaine (Tricaine/E3) 11. המתן עד הזחלים הם ללא תנועה לא מגיב לגירוי מגע.
  6. רטוב מראש את הערוצים עם כמה microliters של Tricaine/E3.
    1. לבחור את זחל בודד באמצעות טיפ פיפטה דיזה רחב. להפקיד את הזחלים לתוך התעלה טעינה ( איור 3 א). באמצעות פיפטה עצה או כלי דומה, אוריינט הזחל בבית הבליעה הטעינה כך הצד הגבי פונה קצה ישר לתא הטעינה ואת פניהן הזנב לכיוון המנהרה הרחקה ( איור 3B).
    2. לסגת בקפידה נוזל מן החדר wounding, המאפשר הזחל לזרום לתוך המנהרה הרחקה ( איור 3C). הסר את רוב הנוזל תוך שמירה על לחות סביב הזחל ( דמות תלת-ממד). תהליך זה יכול להיות בסיוע הטיית המנה מעט לכיוון תא wounding.
  7. מקום 1% LMP agarose Tricaine/E3 (~ 38 o C) מעל הזחל ' זה הראש, מילוי החדר טעינה ( איור 3E). לאפשר agarose לגבש עם הזחל במצב תקין. להוסיף Tricaine/E3 תא wounding לפי הצורך כדי לשמור על לחות. חזור על פעולה זו טוען תהליך ביתר הערוצים 2.
  8. באמצעות מחט מזרק, הסר בזהירות את כל agarose אשר מחלחלים דרך המנהרה הרחקה אל החדר wounding ( איור 3F). הוסף tricaine נוספים/E3 אחד קצת יותר agarose (עבור ופצעו, הדמיה לטווח קצר, או פצע הטיפול בידוד) או כדי למלא את הצלחת תרבות (עבור הדמיה לטווח ארוך). החלף את המכסה מאכל תרבות כדי למנוע התאיידות. הזחלים ניתן עם תמונה בנקודה זו (unwounded) או פצועים.

5. הזחלים ופצעו, הדמיה

  1. באמצעות להב האזמל סטרילי, transect סנפיר הזנב האחורי מיתר הגב 11 בבית הבליעה wounding ( איור 3 G, H). להוסיף tricaine נוספים/E3 במידת הצורך ולהחליף את המכסה מאכל תרבות.
    הערה: לחלופין, בהתאם של חלון הזמן התפתחותית של עניין, הזחלים יכולים להיות פצועים, מותר להתאושש ב E3 ומתוחזק בתוך אינקובטור (28.5 o C) עד למועד ההדמיה הרצויה, באיזה שלב הם ניתן לטעון לתוך ערוצים כמו המתואר לעיל-
  2. הוספה
  3. להתקין ההתקן zWEDGI עם ומורדמת הזחלים על גבי מיקרוסקופ הפוכה בשלב אשר יוכל להכיל את הצלחת התחתונה של זכוכית 60 מ מ. אתר את הזנב של הזחל בתעלה העליונה ביותר, סיבוב המנה לפי הצורך כדי לקבל את הזנב במיקום הרצוי. תמונה כנדרש לניסוי מסוים.
    הערה: zWEDGI ישימה בהרחבה על מיקרוסקופ אור ברזולוציה גבוהה, כולל widefield פלורסצנטיות, סריקת מיקרוסקופ לייזר. ישנם מספר שיקולים פרמטר הדמיה הזחלים דג זברה, אך ספציפיות הדמיה הפרמטרים הם כלי, דוגמת הניסוי תלויות. כאן, זחל זנב היה עם תמונה של מבנה מותאם אישית מיקרוסקופ multiphoton 5 , 11 ניצול הפרמטרים הבאים: 40 X זמן עבודה מרחק מים טבילה אובייקטיבי, עירור 890 ננומטר לייזר, 445/20 ננומטר מסנן פליטה והרזולוציה 512 x 512.

6. סוף הניסוי

  1. להסיר המנה zWEDGI של מיקרוסקופ. המתת חסד הזחלים על-ידי הצבת את zWEDGI או על אמבט מים קרים או בבית 4 o C למשך 20 דקות לפחות, ולגשת להיעדרות של פעימות הלב ומחזור הדם.
    הערה: מכיוון הזחלים נשמרים בתאים נפרדים, הזחלים ניתן בנפרד לשחזר בעדינות על ידי משיכה של אגר עם מלקחיים או פיפטה. ניתן להסיר את אגר אזור הראש, הזחל המשמש הליכים נוספים, כגון קיבוע של נוגדן מכתים או מעובד לחילוץ RNA או החלבון.
  2. בעקבות ההסרה של הזחלים, אגר, לנקות את zWEDGI עם אתנול, מים מזוקקים, כפי שמתואר בשלב 4.1 והגדר הפוך אוויר יבש. החנות מכוסה במקום קריר, יבש. מעיל מחדש עם חלב רזה (שלב 4.2) כנדרש לפני השימוש הבא.
    הערה: zWEDGIs יכול להיות שימוש חוזר מספר פעמים, עד PDMS מתחילה לגמור הזכוכית.

תוצאות

ZWEDGI PDMS microfluidic המכשיר הוא מכשיר באופן פונקציונלי ממודר נועד להכיל ארבע פונקציות עיקריות (המפורטות להלן) המשויך הדמיה חיה של פין סימטרית ופצעו לריפוי, לצמיחה מחודשת של הזחלים דג זברה. PDMS נבחרה עבור ייצור zWEDGI כי זה לא רק זמינים, של תעשיית תקני עבור הביו, אלא גם עובד גם בתבניות...

Discussion

המטרה של המכשיר zWEDGI הוא לכידת תלת-ממד זמן לשגות הדמיה על ידי ייצוב המכוונת את הדגים בתוך המרחק עבודה קטן של מטרה מיקרוסקופ ברזולוציה גבוהה. תוך עמידה מפרטים אלה עיצוב, זה גם שיפור מעל המסורתית מבוססת אגר הכנה עבור הדמיה בשידור חי. ישנם שלושה שלבים קריטיים (להלן) בייצור של zWEDGI, אשר, אם לא נעשה ...

Disclosures

המחברים אין לחשוף.

Acknowledgements

המחברים רוצה להכיר הפרוייקט העיקרי למימון ממכון Morgridge המעבדה ומחקר עבור אופטיות ומכשור חישובית. אנו גם להכיר מימון NIH # R01GM102924 (AH ו- KWE). ח', JMS, ר', AH, KWE נוצר ועוצב על המחקר. ח', JMS ביצע ניסויים כל עם תמיכה DL, KP, ר'. ח', JS, ר', AH KWE תרמו הכתיבה של כתב היד.

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
Fabricate molds
Solidworks Professional Accedemic Research 3D modeling softwareDassault SystemesSPX0117-01Fisher Unitech
Viper Si2 SLA 3D printer3D Systems Inc.23200-9023D Systems Inc.
Accura 60 photopolymer resin3D Systems Inc.24075-9023D Systems Inc.
denatured alcoholSunnyside5613735Menards
UV post cure apparatus3D Systems Inc.23363-101-003D Systems Inc.
TouchNTuff nitrile glovesAnsell92-600McMaster Carr
220B, 400B, 600 grit T414 blue-bak sandpaper Norton66261139359, 54, 52MSC
borosilicate glass disc, 2" diameterMcMaster-CarrMIL-G-47033McMaster-Carr
ultrasonicator cleanerBranson1510R-MTH
isopropyl rubbing alcohol 70%Hydrox54845T43McMaster-Carr
10oz clear plastic cupWNA Masterpiece557405Amazon
6"craft stickPerfect StixCraft WTD-500Amazon
NameCompanyCatalog NumberComments
Fabricate zWEDGI PDMS device
Sylgard 184 silicon elastomeric kit Dow-Corning4019862Ellworth Adhesives 
10mL syringeBecton Dickinson305219Vitality Medical Inc
desiccatorBel-Art SciencewareF42027-0000Amazon
4 in ratcheting bar clampPittsburgh68974Harbor Freight
lab ovenQuincy Lab Inc.20GCGlobal Industrial
tweezer setAven549825McMaster-Carr
compressed air filtered nozzleInnotechTA-N2-2000FTCleanroom Supply
vacuum bench viseWilton Tool Group63500MSC Industrial
55mm glass bottom dish; 30mm micro-well #1.5 cover glassCellvisD60-30-1.5-NCellvis
plasma cleanerHarrick PlasmaPDC-001Harrick Plasma
NameCompanyCatalog NumberComments
Loading Larvae
Pipetteman, P200GilsonF123601
100% ethanol (diluted to 70% with water prior to use)Pharmco-aaper111000200
Transfer pipetteFisherbrand13-711-5AFisher Scientific
powdered skim milk2902887MP Biomedicals
double distilled water
N-phenylthiorureaSigma-AldrichP7629Sigma-Aldrich
tricaine (ethyl 3-aminobenzoate)C-FINQ-UEWestern Chemical
low melting point agaroseSigma-AldrichA0701Sigma-Aldrich
heat block (dry bath incubator)Fisher Scientific11-718-2Fisher Scientific
E3 buffer 
large orifice pipette tip, 200 uLFisherbrand02-707-134Fisher Scientific
General purpose pipette tip, 200 uLFisherbrand21-197-8EFisher Scientific
#15 scalpel blade Feather2976Amazon
25G syringe needleBD BD305122Fisher Scientific
NameCompanyCatalog NumberComments
Imaging
inverted microscope
Imaris imaging softwareBitplane

References

  1. Yoo, S. K., Freisinger, C. M., LeBert, D. C., Huttenlocher, A. Early redox, Src family kinase, and calcium signaling integrate wound responses and tissue regeneration in zebrafish. J. Cell Biology. 199 (2), 225-234 (2012).
  2. Kawakami, A., Fukazawa, T., Takeda, H. Early fin primordia of zebrafish larvae regenerate by a similar growth control mechanism with adult regeneration. Dev. Dynam. 231 (4), 693-699 (2004).
  3. Konantz, J., Antos, C. L. Reverse genetic morpholino approach using cardiac ventricular injection to transfect multiple difficult-to-target tissues in the zebrafish larva. JoVE. (88), (2014).
  4. Hall, C., Flores, M. F., Kamei, M., Crosier, K., Crosier, P., Sampath, K., Roy, S. Live Imaging Innate Immune Cell Behavior During Normal Development, Wound Healing and Infection. Live Imaging in Zebrafish: Insights into Development and Disease. , (2010).
  5. Huemer, K., Squirrell, J. M., Swader, R., LeBert, D. C., Huttenlocher, A., Eliceiri, K. W. zWEDGI: Wounding and Entrapment Device for Imaging Live Zebrafish Larvae. Zebrafish. , (2016).
  6. Lisse, T. S., Brochu, E. A., Rieger, S. Capturing tissue repair in zebrafish larvae with time-lapse brightfield stereomicroscopy. JoVE. (95), (2015).
  7. Kamei, M., Isogai, S., Pan, W., Weinstein, B. M. Imaging blood vessels in the zebrafish. Methods Cell Biol. 100, 27-54 (2010).
  8. Graeden, E., Sive, H. Live imaging of the zebrafish embryonic brain by confocal microscopy. JoVE. (26), (2009).
  9. Petzold, A. M., Bedell, V. M., et al. SCORE imaging: specimen in a corrected optical rotational enclosure. Zebrafish. 7 (2), 149-154 (2010).
  10. Macdonald, N. P., Zhu, F., et al. Assessment of biocompatibility of 3D printed photopolymers using zebrafish embryo toxicity assays. Lab Chip. 16 (2), 291-297 (2016).
  11. LeBert, D. C., Squirrell, J. M., Huttenlocher, A., Eliceiri, K. W. Second harmonic generation microscopy in zebrafish. Methods Cell Biol. 133, 55-68 (2016).
  12. White, R. M., Sessa, A., et al. Transparent Adult Zebrafish as a Tool for In Vivo Transplantation Analysis. Cell Stem Cell. 2 (2), 183-189 (2008).
  13. LeBert, D. C., Squirrell, J. M., et al. Matrix metalloproteinase 9 modulates collagen matrices and wound repair. Development. 142 (12), 2136-2146 (2015).
  14. Campagnola, P. J., Millard, A. C., Terasaki, M., Hoppe, P. E., Malone, C. J., Mohler, W. A. Three-dimensional high-resolution second-harmonic generation imaging of endogenous structural proteins in biological tissues. Biophys. J. 82 (1 Pt 1), 493-508 (2002).
  15. Schindelin, J., Arganda-Carreras, I., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat. Methods. 9 (7), 676-682 (2012).

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Explore More Articles

128multiphoton

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved