Method Article
מאמר זה מציג אסטרטגיה לבניית מודלים אלמנט סופי של חומרים מוליכים סיביים החשופים לשדה חשמלי (EF). ניתן להשתמש במודלים כדי להעריך את הקלט החשמלי שהתאים שזורעים בחומרים כאלה מקבלים ולהעריך את ההשפעה של שינוי תכונות החומר המרכיבות את הפיגומים, המבנה או הכיוון שלו.
מחקרים קליניים מראים גירוי חשמלי (ES) להיות טיפול פוטנציאלי לריפוי והתחדשות של רקמות שונות. הבנת המנגנונים של תגובת התא כאשר נחשפים לשדות חשמליים יכולה אפוא להנחות את האופטימיזציה של יישומים קליניים. ניסויי במבחנה שואפים לעזור לחשוף אותם, ומציעים את היתרון של טווחי קלט ותפוקה רחבים יותר שניתן להעריך באופן אתי ויעיל. עם זאת, ההתקדמות בניסויים במבחנה קשה לשחזר ישירות בהגדרות קליניות. בעיקר, הסיבה לכך היא כי מכשירי ES המשמשים במבחנה שונים באופן משמעותי מאלה המתאימים לשימוש המטופל, ואת הנתיב מן האלקטרודות לתאים ממוקדים שונה. תרגום תוצאות במבחנה לתוך הליכי vivo ולכן לא פשוט. אנו מדגישים כי המבנה של microenvironment התאי ואת המאפיינים הפיזיים לשחק תפקיד מכריע בתנאי הבדיקה הניסיוני בפועל ומציעים כי ניתן להשתמש במדדים של חלוקת המטען כדי לגשר על הפער בין במבחנה ו in vivo. בהתחשב בכך, אנו מראים כיצד ב סיליקו אלמנט סופי מודלים (FEM) ניתן להשתמש כדי לתאר את microenvironment הסלולר ואת השינויים שנוצרו על ידי חשיפה לשדה חשמלי (EF). אנו מדגישים כיצד זוגות EF עם מבנה גיאומטרי כדי לקבוע את התפלגות המטען. לאחר מכן אנו מראים את ההשפעה של תשומות תלויות זמן על תנועת הטעינה. לבסוף, אנו מדגימים את הרלוונטיות של מתודולוגיית מודל סיליקו החדשה שלנו באמצעות שני מקרי בוחן: (i) בפוליטרו סיבי (3,4-אתילנדיאוקסיאתיופן) פולי (סטירנסולפונט) (PEDOT-PSS) פיגומים ו-(ii) קולגן ויוו במטריצה חוץ-תאית (ECM).
ES הוא השימוש ב- EFs במטרה לשלוט בתאים ביולוגיים וברקמות. המנגנון שלה מבוסס על הגירוי הפיזי המועבר לתא כאשר הביומולקולות בתוכו וסביבתו נחשפות לשיפוע מתח שנוצר חיצונית. חלקיקים טעונים עוסקים בתנועה מאורגנת הנשלטת על ידי החוק של קולון, ומייצרת כוחות גרירה על החלקיקים הלא טעונים. זרימת הנוזלים והתפלגות המטען המתקבלת משנים את פעילויות התאים ואת הפונקציות כגון הידבקות, התכווצות, הגירה, אוריינטציה, בידול והתפשטות1 כאשר התא מנסה להסתגל לשינוי בתנאים המיקרו-נגיפים.
כמו EFs הם נשלטים, לא פולשני, לא פרמקולוגי והוכח שיש השפעה יעילה על התנהגות תאים חיוניים, ES הוא כלי רב ערך עבור הנדסת רקמות ורפואה רגנרטיבית. זה שימש בהצלחה כדי להנחות עצבי2, שלד3, שריר הלב4, עצם5 ופיתוח העור6. יתר על כן, כפי שהוא משפר iontophoresis7, הוא משמש כטיפול חלופי או משלים אלה פרמקולוגיים קונבנציונאליים. היעילות שלה בניהול כאב עדיין בדיון כמו ניסויים קליניים באיכות גבוהה יותר מחכים8,9,10. עם זאת, לא דווחו תופעות לוואי ויש לו פוטנציאל לשפר את רווחת המטופל11,12,13,14,15.
בעוד שרק ניסויים קליניים יכולים לתת פסק דין סופי ליעילות ההליך, במבחנה ובמודלים סיליקו נדרשים ליידע את העיצוב של טיפול ES צפוי כפי שהם מציעים שליטה חזקה יותר על מגוון רחב יותר של תנאים ניסיוניים. השימושים הקליניים שנחקרו של ES הם התחדשות העצם16,17, התאוששות של שרירים denervated18,19, התחדשות אקסונלית לאחר ניתוח20,21, הקלה בכאב22,ריפוי פצעים 23,24,25 ומשלוח סמים יונטפורטי26. כדי שמכשירי ES יוצגו באופן נרחב בכל יישומי היעד האפשריים, ניסויים קליניים טרם ביססו ראיות חזקות יותר לטיפול יעיל. אפילו בתחומים שבהם הן במחקרים בבעלי חיים והן במחקרים בבני אדם מדווחים בעקביות על תוצאות חיוביות, המספר הרב של שיטות שדווחו יחד עם מעט מדי הדרכה כיצד לבחור בינם לבין מחיר רכישה גבוה מרתיע רופאים מלהשקיע במכשירי ES27. כדי להתגבר על כך, כבר לא ניתן להתייחס לרקמת היעד כאל קופסה שחורה (גבול הניסויים ב-in vivo), אך יש לראות בה סינרגיה מורכבת של מערכות משנה מרובות(איור 1).
ניסויי ES מרובים בוצעו במבחנה במהלךהשנים 28,29,30,31,32,33,34. רוב אלה מאפיינים רק את ה- ES דרך ירידת המתח בין האלקטרודות חלקי המרחק ביניהן - קירוב גס של גודל השדה החשמלי. עם זאת, השדה החשמלי עצמו משפיע רק על חלקיקים טעונים, לא על תאים ישירות. כמו כן, כאשר חומרים מרובים משולבים בין ההתקן לתאים, קירוב גס לא יכול להחזיק.
אפיון טוב יותר של אות הקלט דורש תצוגה ברורה על האופן שבו הגירוי מועבר לתא. השיטות העיקריות להעברת ES הן צימוד ישיר, קיבובי וסרקטיבי35,36. התקנים עבור כל שיטה שונים עם סוג אלקטרודה (מוט, מנוור או מתפתל) ומיקום ביחס לרקמת היעד (במגע או מבודד)35. מכשירים המשמשים vivo לטיפולים ארוכים יותר צריכים להיות לבישים, ולכן האלקטרודות ורוב הפעמים מקור האנרגיה מושתלים או מחוברים לעור כתחבושות פצע או טלאים אלקטרואקטיביים. שיפוע המתח שנוצר מזיז חלקיקים טעונים באזור הטיפול.
כפי שהוא משפיע על זרימת החלקיקים הטעונים המתקבלים בקרבת התאים, מבנה הפיגומים הוא בעל חשיבות עליונה בעיצוב פרוטוקולי ES. תצורות שונות של הובלת מטען מתעוררות אם חומר הפלטפורמה, טכניקת הסינתזה, המבנה או הכיוון ביחס לשינוי מעבר הצבע המתח. In vivo, הזמינות והתנועה של חלקיקים טעונים מושפעים לא רק על ידי תאים אלא גם על ידי רשת הקולגן ונוזל interstitial להרכיב את ECM תומך. פיגומים מהונדסים משמשים יותר ויותר כדי לשחזר טוב יותר מיקרו-סביבה של תאים טבעיים במבחנה1,35. במקביל, ECM הוא פיגום טבעי מורכב.
פיגומים מלאכותיים מבוססים על מתכות, מוליכים פולימרים ופחמן, מהונדסים עם דגש על איזון תאימות ביולוגית עם ביצועים אלקטרוכימיים ויציבות לטווח ארוך36. סוג פיגום רב-תכליתי אחד הוא מחצלת סיבית אלקטרו-ספון המציעה טופוגרפיה ננומטרית לשליטה. זה יכול להיות מהונדס כדי להידמות ECM, ובכך לספק רמזים מכניים דומים המסייעים התחדשות של מגוון רחב שלרקמות 37. כדי להשפיע באופן משמעותי על ES, המחצלות צריכות להיות מוליכות במידה מסוימת. עם זאת, פולימרים מוליכים קשה electrospin ומיזוג עם נשאי בידוד מגביל את המוליכות של הסיבים המתקבלים38. פתרון אחד הוא פילמור מונומר מוליך על פני השטח של סיב דיאלקטרי, וכתוצאה מכך כוח מכני טוב ומאפיינים חשמליים של המוצר הסופי38. דוגמה לכך היא ציפוי סיבי אלקטרו-ספון משי עם PEDOT-PSS39מוליך למחצה . השילוב של רמזים מכניים ואלקטרומגנטיים מאיץ באופן משמעותי את צמיחת הנוריט40,41,42. Neurites לעקוב אחר יישור סיבים פיגומים, ולהאריך יותר לאחר חשיפה EF מקביל לסיבים מאשר אנכי אחד43. באופן דומה, יישור של פיגומים סיביים ל- EF גם מקדם התבגרות מיוגנית33.
ה- ECM מורכב בעיקר מחלבונים היוצרים סיביות44, מתוך אותם סוג קולגן אני המרכיב העיקרי בכל רקמות בעלי החיים מלבד סחוס (עשיר בסוג קולגן II)44. טרופוקולגן (TC), קונפורמציה סללית משולשת של גדילי פוליפפטיד, הוא המוטיב המבני של סיבי קולגן45. מיקרוסקופיה אלקטרונית שידור ותמונות מיקרוסקופיה של כוח אטומי של סיבי קולגן מראות תבנית פסים D-תקופתית46 מוסברת על ידי הודג 'ופטרוסקה מודל47 כערכים רגילים של פערי TC וחפיפה45. הגידים מורכבים מטריצת פיברילר קולגנית מיושרת המוגנת על ידי מטריצה פרוטוגליקנית הידרופילית מאוד לא קולגנית48,49. דקורין הוא פרוטאוגליקן קטן עשיר בלאוצין (SLRP) המסוגל לקשור את אזורי הפער של סיבי הקולגן ולהתחבר עם SLRPs אחרים באמצעות שרשראות הצד הגליקוסאמינוגליקניות (GAG) שלהם49. מחקרים שנעשו על גידים מראים כי המאפיינים החשמליים שלהם משתנים באופן משמעותי כאשר hydrated50,51, מנגנון הובלת טעינה משתנה פרוטונית לאיוניק כמו רמת הידרציה עולה51. זה מצביע על כך שהולכה חשמלית לאורך סוג קולגן I fibril יכול להיות מופעל על ידי מעיל מים Decorin, עם פער ואזורי חפיפה בעלי מוליכות חשמלית שונה קבועים דיאלקטריים.
כמו בילוי זהה של ECM על ידי פיגומים מלאכותיים הוא בלתי סביר, הידע לייצר סינרגיה בין in vivo ו במבחנה מופעל על ידי תוצאות מתורגמות נראה במבוי סתום. בדוגמנות סיליקו לא רק מאפשרת מחדש תרגום בין השניים, אלא גם מוסיפה יתרונות חשובים באפיון התהליכים הלא ידועים המעורבים ב- ES. השוואת תצפיות in vivo עם במבחנה יכול להביא מידע על כוח הצימוד בין רקמת היעד לבין שאר האורגניזם, אבל לא לחשוף את מגבלות הידע הנוכחיות. הלא נודע יכול להיחשף על ידי התבוננות בהבדל בין מה שצפוי לקרות על סמך הידע הנוכחי לבין מה שקורה. בניסויי סיליקו המבוססים על מודלים מתמטיים מאפשרים לפצל את התהליך לתת-תהליך ידוע ולא ידוע. בדרך זו, תופעות שאינן בחשבון במודל לצאת לאור כאשר בתחזיות סיליקו משווים במבחנה וניסויים in vivo.
יצירת ובדיקה של השערות לגבי המנגנונים הבסיסיים של האופן שבו תאים ורקמות מושפעים משדות חשמליים מעוכבת על ידי המספר הרב שלפרמטרים 52 שיש לבדוק בנפרד. כדי להגדיר תנאי ניסוי מייצגים, יש לפצל את תהליך ה- ES בתת-תהליך (איור 1) ויש לזהות אותות קלט דומיננטיים המשפיעים על התנהגות התא. מודלים המייצגים השפעות פיזיות בסיסיות של ES על תאים מתארים את התחום שמשתף את ה- EF עם התא - זה של חלקיקיםטעונים 53. ההתנהגות של חלקיקים חיצוניים לתא תלויה microenvironment וניתן לחקור בנפרד מהתא. אות הקלט הדומיננטי עבור התא הוא קבוצת המשנה של פלטי התקן ES הגורמת למידת השונות הגדולה ביותר בתגובת התא. ניתן להשתמש בתת-קבוצה הקטנה ביותר של הפרמטרים הניסיוניים המלאים שיכולים ליצור וריאציות בכל אותות קלט התא הדומיננטיים כדי להקטין את ממד מרחב הפרמטרים ואת מספר מקרי הבדיקה.
הקלט של מודל היעד הביולוגי של ES חייב להיות תת-קבוצה של אותות הפלט המיוצרים על-ידי התקן ה- ES השימושיים בתיאור ההשפעות הפיזיות של ES על תאים. ביו-רקטור פשוט עם צימוד ישיר יש את אותו מבנה כמו תאים אלקטרוליטיים אלקטרוכימיים. מודלים של אלה מראים את התפלגות הצפיפות הנוכחית העיקרית (חשבונאות להתנגדות לפתרונות), משנית (גם אחראית לתגובות פאראדיות) או שלישוני (המהווה גם דיפוזיה של יון). ככל שהמורכבות מתורגמת לעלות חישובית, המודל הפשוט ביותר מתאים ביותר לחקר חלל הפרמטרים. סימולציות של מרוכבים סיביים המונעים על ידי תכונות חומר54 להתמקד תכונות חומר בתפזורת כתוצאה של מיקרו-ארכיטקטורה מורכבת, ולכן לא יכול לתאר השפעות מקומיות של חשיפה EF. קיים במודלים סיליקו, מונע על ידי ES, להתמקד במדגם הביולוגי, בין אם זה תא בודד שקוע במדיום הומוגני55,56,57, או רקמות מורכבות עם מרחב חוץ תאי הומוגני58. טעינה וצפיפות נוכחית (איור 2) יכולות לשמש אותות ממשק בין דגמים של התקן ה-ES לבין המדגם הביולוגי, או בין רכיבים שונים של התקן ה-ES. הפרוטוקול מבוסס FEM המוצע משתמש במשוואות המתוארות באיור 2 ושימש כדי לחקור כיצד ניתן להשתמש בפרמטרים תלויי פיגומים כדי לווסת את שני אותות אלה, ללא תלות ב- EF שנוצר על-ידי הגדרת צימוד ישירה. התוצאות מדגישות כי יש צורך להסביר פיגומים או תכונות חשמליות ECM בעת חקירת איך ES משפיע על תאי היעד.
1. בנה את הדגם ב- COMSOL
2. ביצוע סימולציה
3. ניתוח
המודל המוצע מתאר תכונות של מחצלת מרוכבת עם סיבים מקבילים, שקוע בחומר מוליך ונחשף שיפוע פוטנציאלי חשמלי שנוצר חיצונית. סימולציות מראות כי חשבונאות עבור הרכיבים השונים של פיגום חשובה בקנה מידה מיקרו ולחקור כיצד שינוי בזווית היישור (אות קלט) של הסיבים ל- EF יכול ליצור שונות בצפיפות הנוכחית והמטעינה (אותות פלט) בקרבת הסיבים.
חמישה שלבי מורכבות גיאומטרית שונים מוצגים, שלכל אחד מהם השפעה על תוצאת הסימולציה: לוח מוליך חלק (SC), לוח חלק עם סיבים מוטבעים לא מוליכים (SNC), מרוכבים מוליכים גסים (RC), מרוכבים מחוספסים עם סיבים מוטבעים לא מוליכים (RNC), מרוכבים מחוספסים עם סיבים מוטבעים לא מוליכים ושני סוגים של ציפוי תקופתי (RNCd) (איור 3). סעיף 1.5 של הפרוטוקול מציג את השלבים לייבוא הגיאומטריות בפרוייקט וסעיף 1.6 מראה כיצד לבנות אותם צעד אחר צעד. שני המודלים הראשונים אינם מסבירים את המורפולוגיה של פני השטח. SC ו- RC אינם מסבירים את המאפיינים הדיאלקטריים של ליבת הסיבים. ה- RNC הוא המודל המוצע לפיגומים מלאכותיים ננו-סיביים, ואילו RNCd הוא המודל המוצע עבור מקטע ECM.
מזעור העלות החישובית נעשה על ידי הפחתת הגיאומטריה של התקן ES לנפח יחידת דגם המייצג את המיקרו-סביבה. בעוד שרוחב ופיגומים של התקן ES ואורך הפיגומים יכולים בקלות להיות בסדר גודל של כמה סנטימטרים, קוטר הסיבים המכילים הוא בדרך כלל נמוך יותר ממיקרון. כאן, אנו משתמשים בחתך פיגומים הדומה לקוטר הסיבים כדי להפחית את העלות החישובית הנגרמת על ידי יחס הגובה-רוחב ולהדגיש את השפעת טבעו הסיבי של הפיגומים על המיקרו-סביבה החשמלית. שאר התקן ה-ES מוחלף בתנאי גבול פוטנציאליים חשמליים שנבחרו כך שהערכה גסה לגודל השדה החשמלי היא 100 V/m, פרמטר גירוי שדווח לעתים קרובות. יתר על כן, נפח יחידה עם חמישה סיבים מקבילים - כמו זה המשמש בסימולציות, המוצג באיור 3 - נחשב לנציג מחצלת סיבית מכוונת שלמה. ניתן להבחין בין שלושה סוגים של סיבים במערך 1D: מרכז פנימי (עם מישור הסימטריה האורך של הפיגומים מפצל אותם לשניים), ארעי פנימי (עם משטח לרוחב מוקף סיבים אחרים אך עם צדדים א-סימטריים), וחיצוני (בקצה הפיגומים). חמישה הוא מספר הסיבים המינימלי הנדרש על מנת לכלול את כל שלושת הסוגים המוגדרים.
גודל רכיב רשת הדגם דורש תשומת לב מיוחדת מכיוון שהוא עשוי להשפיע על תוצאות הסימולציה ובכך לא לחשוף אפקטים חשובים (איור 4). זהו כלל כללי של שיטת האלמנט הסופי ומשמעות של משפטי הדגימה של ניקוויסט-שאנון. כמה שהאותות הסימולציה החיוניים מהירים יותר בחלל, כך אלמנטי הרשת צריכים להיות קטנים יותר כדי לייצר ייצוג נאמן של התופעה. מצד שני, כך האלמנט קטן יותר, כך גדל המספר הכולל של אבני בניין מודל ואת העלות החישובית. עידון הרשת האדפטיבית שנקבע בסעיף 2.1 הוא שיטה טובה ומקלה לאיזון המטרות המנוגדות על ידי הקטנת גודל האלמנט רק היכן וכל עוד פעולה זו מייצרת שינוי משמעותי.
מודל פשטני מדי עלול להיכשל בהצגת אפקטים חשובים(איור 5,6). סימולציות מראות כי חשבונאות של מורפולוגיה על פני השטח ומאפיינים חשמליים של רכיבי פיגומים אינה מיותרת בחיזוי מיקרו-סביבה חשמלית. בעוד מורפולוגיה פני השטח יש השפעה ישירה על EF נייח (להשוות SC ו SNC עם RC, RNC ו RNCd), השוואה בין תחזיות RC ו- RNC מראה כי ליבות סיבים לא מוליכים להגביר את האפקט הזה. מנקודת המבט של מידול מיקרו-סביבה חשמלית תאית על פיגומים ננופיים, דגמי SC, SNC ו- RC הם אפוא תת-אופטימליים. עם זאת, זה תרגול טוב להוסיף מורכבות בהדרגה כמו השוואות בין השלבים השונים לעזור לציין אילו תכונות להוליד אפקטים ספציפיים.
מורכבות המודל משפיעה על שינוי צפיפות הזרם והמטען עם יישור סיבים ל- EF. הפרוטוקול המוצע עוזר להדגיש את האפקט ( איור5,6). בעוד שמודל SC אינו מראה שום שונות במדדים המוצעים כאשר היישור שלו לשיפוע הפוטנציאלי החשמלי משתנה, סימולציות מודל RNC מנבאות ניגוד חזק בין יחידת המחצלת עם סיבים המיושרים ל- EF לבין זו עם הסיבים בניצב (איור 7). כאשר הליבות הלא מוליכות מגיעות בדרך של הזרימה הנוכחית, הן יוצרות סכרים תקופתיים המובילים לאזורים מתחלפים של צפיפות טעינה גבוהה ונמוכה.
ניתן לדמות משטרי ES דינמיים עם מחקרים תלויי זמן. סרטונים בקבצים משלימים מראים תחזיות שנעשו עבור מתח כניסה סינוואידלי במודל פיגומים מלאכותי מלא (RNC), עם סיבים מקבילים או בניצב לשיפוע הפוטנציאלי החשמלי. זרמים קטנים לאורך הסיבים בניצב ל- EF מופיעים כאשר המטען משתחרר מהפיגומים כאשר גודל ה- EF פוחת. זה מראה כי גירוי יכול להתרחש לא רק כאשר EF החיצוני קיים, אלא גם מיד לאחר שהוא מנותק - ראה קבצים משלימים עבור קטעי וידאו.
איור 1: דיאגרמת בלוק היררכית של מידול - יתרונות ומגבלות של דוגמנות עם in vivo ובדגמי סיליקו. בלוק סימוני צבע באותה רמה הירארכית. בלוקים בדרגה נמוכה יותר כלולים באלה בדרגה גבוהה יותר. סימוני צבע קו בלוק אפשרות לכלול את הבלוק לתוך סוג מסוים של מודל - צימוד עם בלוקי מערכת אחרים אין צהוב בשבץ שלהם, כפי שהם אינם רכיבים עבור מודלים במבחנה. כדורים מתנהגים כמו שסתומים ומסמלים את השליטה של הבלוק. כאשר שסתום הוא על, אות יכול לעבור דרך כל נתיבי החצים במערכות המשנה הכפופים כי יש את הצבע של השסתום בשבץ שלהם. פרשנות הדיאגרמה: תהליך ES מורכב ממכשיר הגירוי והיעד הביולוגי, כל אחד עם מספר תת-תהליכים דטרמיניסטיים או סטוכאסטיים המחוברים שלא ניתן להפרידם ב- vivo או במבחנה, ולכן אין להם שסתום אדום או צהוב. תהליכים סטוכאסטיים מתערבים גם בממשק שבין מכשיר הסימולציה לדגימה הביולוגית כאשר שניהם מגורים. מודל הפריה מפענח את מערכת העניין (כלומר, מקטע העור) משאר האורגניזם. לכן, ניתן לראות רק תהליכים מהותיים של מערכת העניין שבראשם תהליכים סטוכאסטיים בעלי אופי שונה. עם זאת, לא ניתן לעורר ולהזדהות בנפרד את התהליכים המהותיים השונים המעורבים. המודלים בסיליקו הם פרמטריים עבור רכיבים ידועים - התנהגותם צפויה להיות בצורה מסוימת - ולא פרמטרית עבור הלא נודע - מכיוון שאין סיבה מכנית לתת אמון באקסטרפולציה מסוימת. כל רכיבי סיליקו ניתן לדמות בנפרד או בשילובים שונים, המאפשר תיאור של השערה שונה. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: (A) חוק קולון (B) שדה פוטנציאלי חשמלי ומטען בדיקה נייד (C) זרם חשמלי (D) צפיפות טעינה (E) משוואת הצפיפות הנוכחית (F) של חוק שימור חיובים (G). (A) חלקיקים נייחים טעונים חשמלית q ו- Q אינטראקציה אלקטרוסטטית באמצעות כוחו של קולון . (ב1) כל חלקיק טעון Q מייצר שדה סקלרי הנקרא פוטנציאל חשמלי בכל המיקומים
בחלל:
. העבודה המקסימלית הנדרשת כדי להזיז Q חלקיק טעון אחר ממקומו
היא המוצר בין המטען q לבין הפוטנציאל החשמלי שנוצר על ידי Q במיקום
. השדה הפוטנציאלי החשמלי שנוצר על ידי חלקיקים מרובים הוא סכום השדות הנוצרים על ידי כל חלקיק בודד. (B2) שדה נייח עם חלקיקי גנרטור קבוע q ו- Q, פועל עם
חלקיק בדיקה עם מטען חיובי qp. בתגובה, qp נע כדי למזער את הפוטנציאל החשמלי של מיקומו. כדי לתאר את התנועה של qp, אפשר לגזור
את השדה החשמלי
מהשדה הפוטנציאלי החשמלי:
. (C) חלקיקי בדיקה מרובים טעונים חיובית ניידים המשתחררים באופן אחיד בשדה חשמלי נייח עוקבים אחר תנועה מאורגנת. כדי לעקוב אחר תצורת המטען מבלי לעקוב אחר כל חלקיק, ניתן לציין בכל רגע: (D) כיצד החלל תפוס על ידי חלקיקים, הקצאת צפיפות מטען
לכל נפח אינסופי, על פי חוק גאוס, ו- (E) כיצד חלקיקים עוברים דרך משטחי הגבול בין כרכים אינסופיים שכנים, הקצאת צפיפות נוכחית
לכל גבול על פי חוק אוהם. (ו) המטען והצפיפות הנוכחית מתפתחים בהתאם למשוואת ההמשכיות, שכן תזוזת חלקיקים לא אחידה מובילה להצטברות או לאובדן חלקיקים בנפח מסוים. (ז) בתוך מערכת מבודדת, חוק שימור חיובים גובר ואין זרימה או זרימה של חלקיקים טעונים. התווים בהם נעשה שימוש:- מטען q,Q, qp ושם החלקיק הטעון;
- נורמה אוקלידית של וקטור המיקום; k - הקבוע של קולון;
- אופרטור הדרגתי, ε- מותרות מוחלטת של בינוני; σ - מוליכות של בינוני. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: חמש רמות שונות של מורכבות עבור מחצלת סיבית. SC- חלק עם סיבים מוטבעים מוליכים, המודל הפשוט ביותר, לא בחשבון מורפולוגיה פני השטח או תכונות שונות של הרכיבים המרכיבים; SNC- חלק עם סיבים מוטבעים שאינם מוליכים; RC- מחוספס עם סיבים מוטבעים מוליכים, חשבונאות מורפולוגיה פני השטח אבל לא עבור תכונות רכיבים שונים; RNC- מחוספס עם סיבים מוטבעים שאינם מוליכים, מודל מוצע מלא של פיגומים מלאכותיים ננופיברו; RNCd- מחוספס עם סיבים מוטבעים לא מוליכים מצופים בשני חומרים שונים, מודל מוצע מלא עבור גיליון של סיבי קולגן. יחידת אורך בשימוש: ננומטרים. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: תוצאות לדוגמה של עידון הרשת האדפטיבית וצפיפות המטען שנוצרה לאחר הסימולציה. (משמאל) נוצרה רשת מחדש באופן אוטומטי עם אלמנטים גסים נוספים; (מימין) רשת ראשונית מעודנת באופן אדפטיבי במהלך מחקר נייח; אלמנטים קטנים יותר נדרשים לתוצאה מדויקת באזורים שבהם לאותות מדומים יש שינויים מרחביים פתאומיים. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 5: זווית יישור סיבים למעבר צבע פוטנציאלי חשמלי משפיעה על חוזק ה-EF במדיה הסובבת את תרבית התאים כאשר יש מספיק מורכבות. SC, SNC, RC, RNC ו- RNCd הן רמות המורכבות השונות עבור דגם המחצלת הסיבית המוצג באיור 3. ציר אנכי מסמן את זווית היישור של הסיבים למעבר הצבע הפוטנציאלי החשמלי. אלקטרודות מופשטות בהשתתפות - צד תחתון עם פוטנציאל חשמלי גבוה וצד עליון עם פוטנציאל חשמלי נמוך. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 6: זווית יישור סיבים למעבר צבע פוטנציאלי חשמלי משפיעה על צפיפות מטען החלל במדיה של תרבית התאים הסובבת כאשר יש מספיק מורכבות. SC, SNC, RC, RNC ו- RNCd הן רמות המורכבות השונות עבור דגם המחצלת הסיבית המוצג באיור 3. ציר אנכי מסמן את זווית היישור של הסיבים למעבר הצבע הפוטנציאלי החשמלי. אלקטרודות מופשטות בהשתתפות-צד תחתון עם פוטנציאל חשמלי גבוה וצד עליון עם פוטנציאל חשמלי נמוך. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 7: תנועת הטעינה מושפעת מיישור סיבי פיגומים ביחס ל-EF. שני הפאנלים ממחישים תחזיות מודל RNC מצב יציב. בצד שמאל הסיבים מקבילים ל- EF, ואילו בצד ימין הם מאונכים. עוצמת הצבע האדום-כחול הבהיר מסמנת את צפיפות המטען, בעוד שאמצעי האחסון של החץ מסמנים את כיוון הצפיפות הנוכחי. צבע החצים תואם לנורמה הנוכחית של הצפיפות. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
שם | ביטוי | תיאור |
WS | 10*Rc*med_ratio | רוחב פיגומים |
Ls | 10*Rc*med_ratio | אורך פיגום |
Hs | 2*Rf | גובה פיגום |
med_ratio | 1.5 | יחס מדיה של תרבית תאים לפיגומים |
Rc | 278.5[nm] | רדיוס ליבת סיבים |
r | 1.5 | יחס ליבת סיבים לציפוי |
RF | Rc*r | סיבים עם רדיוס שכבה |
תטא | 90[deg] | זווית כיוון סיבים |
אם | 1.3*(Ls*cos(תטא)+Ws*sin(תטא)) | אורך סיבים |
tes | 1 | יחס רדיוס ליבת סיבים למרחק בין סיבים |
n_1 | 2*(fix((Ws/(2*cos(theta))-Rf)/(2*tes*Rc))+3)*(cos(theta)!=0)+1*(cos(theta)==0) | מספר מרבי של סיבים אם תטא< =45 |
n_2 | 2*(fix((Ls/(2*sin(theta))-Rf)/(2*tes*Rc))+3)*(sin(tta)!=0)+1*(sin(tta)==0) | מספר מרבי של סיבים אם תטא>45 |
עודף | 1.2+0.3*שרירי בטן(sin(2*תטא)) | סיבים ראשונים קיזוז יחסי מפיגומים |
D | אם/5 | תקופתיות של מעיל |
משען | 0.46 | אורך המעיל הראשון ביחס לתקופה D |
E | 100[mV/מ"מ] | גודל שדה חשמלי |
V0 | med_ratio | מתח מסוף |
אומגה | 500[הרץ] | תדר מתח של לימודים תלוי זמן |
p_sigma | 0.5 | מוליכות יחסית של ציפוי שני |
p_eps | 1.5 | קבוע דיאלקטרי יחסי ציפוי שני |
טבלה 1: פרמטרים המשמשים לסימולציה
מדיה תרבותית | פדו:נ.ב.ז' 1 | פדו:נ.ב.ב. 2 | קולגן hydrated 1 | קולגן hydrated 2 | פיברון משי | יובש בקולגן | |
מוליכות חשמלית (S/m) | 1.7014 | 1.00E-01 | p_sigma * 0.1 | 2.00E-05 | p_sigma * 2e-5 | 1.00E-08 | 2.50E-08 |
מותרות יחסית | 80.1 | 2.2 | p_eps * 2.2 | 9.89 | p_eps * 9.89 | 7.81E+00 | 4.97 |
טבלה 2: מאפייני חומר המשמשים בסימולציה
קבצים משלימים. נא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
הפרוטוקול המוצע מציע פתרון מידול אחיד לפיגומים טבעיים ומלאכותיים ומדגיש את הצורך לשקול את הננו-מבנה של פיגומים סיביים בעת בדיקת ההשפעות של EF על תאים שנזרעו על חומרים כאלה. למרות קירוב גס לעוצמת EF (הפרש פוטנציאל אלקטרודה חלקי המרחק בין האלקטרודות) יוביל אותנו לצפות לעוצמת שדה של 100 mV/מ"מ, סימולציות מנבאות עוצמות שדה נייחות גבוהות עד 30% באזורים שונים של המחצלת (איור 5). תוצאה זו צריכה לעניין בעיצוב ניסוי ES ופרשנות נתונים, כמו מוות תאים יכול להיגרם על ידי EFs חזק מדי. חשיפת המיקרו-סביבה החשמלית תאפשר מתאם ישיר בין ES להתפתחות התאית. בעוד מספר מחקרים מציגים ניתוח מורפולוגי מפורט של הפיגומים המשומשים33,43,59, הם אינם חוקרים את יחסי הגומלין בין המבנה, תכונות חשמליות של החומרים ואת EF. פרוטוקול זה יכול לאפשר קישור זה, כמו פרמטרים כגון רדיוס סיבים, עובי שכבת ציפוי, מרחק בין סיבים ומאפיינים חשמליים של חומרי הרכיב ניתן לשנות על פי כל ניסוי על ידי שינוי ההגדרות הגלובליות בשלבים 1.2 ו 1.3. לפיכך, ניתן לבצע טעינה תלת-ממדית מותאמת אישית ותחזיות צפיפות נוכחיות עבור משטרי ES סטטיים ודינמיים כאחד.
ניתן למקד את מיטוב עיצוב הפיגומים באמצעות דגמי RNC ו- RNCd עם מחקרים רחבים בטווח הפרמטרים, תוך הרחבת המורפולוגיות המוצעות או חלקים מהם. לחלופין, ניתן לחקור תצורות פיגומים אחרות באמצעות הפרוטוקול המוצע על-ידי שינוי סוגי המערך מלווים-ממדיים בסעיף 1.6.5 והתאמת גיאומטריית פיגומים בסעיף 1.6.2. עם זאת, אופטימיזציה פיגומים לא יכול להיעשות ללא מטרה. בעוד למטרות הנדסת רקמות המוקד העיקרי הוא גורל התא, תמונה ברורה יותר על מה גירויים הם הגורמים העיקריים שלה חיוני אם השליטה האמינה שלה רצויה. המטען וצפיפות הזרם הם מתארים טובים של מיקרו-סביבה חשמלית תאית כשהם מראים את יחסי הגומלין בין ה- EF לבין המאפיינים החשמליים של החומרים המרכיבים השונים של פיגומים מורכבים כגון ECM. הפרוטוקול מראה כיצד לחשב תחזיות עבור מדדים אלה בהתחשב בגיאומטריית פיגומים ננופיברו ומדגיש את החשיבות של זווית היישור של הסיבים עם EF. לאחר מכן ניתן לקשר תחזיות של מטען וצפיפות נוכחית להתפתחות תאית ולכן משטרי פיגומים ו- ES עשויים להיות מותאמים למשימות ספציפיות.
מעניין, מחקר מראה כי חשיפה EF יצר מתח מכני יותר מכפול כוח בסרטים מרוכבים עם nanofibers בניצב EF החיצוני לעומת סרטים עם יישור מקביל60. הלחץ המכני המדווח יכול להיות תוצאה של כוחות קולון הפועלים בין סיבים טעונים, הצפויים על ידי סימולציות המודל הגס (RC, RNC, RNCd) (איור 6). בעוד סימולציות אלה יכול להיות שימושי בחקירת השערה זו, יש לציין כי תוצאות הניסוי שדווחו התקבלו במערכת עם צימוד קיבוליות, ואת הסימולציה מציג צימוד ישיר.
גורם מגביל לשימושים אפשריים עתידיים בפרוטוקול להערכת אות קלט סלולרי הוא אי-ודאות הפרמטר. פרמטרים גיאומטריים לא בטוחים הם ציפוי עובי שכבת ומרחק בין ליבות סיבים. הראשון יכול להסיק על ידי מציאת הערך שמוביל לעכבה בתפזורת שניתן לאמת באופן ניסיוני. השני ניתן לחלץ מתוך סריקות חומר ברזולוציה גבוהה. פרמטרים המתארים את המאפיינים הפיזיים של החומרים מושפעים גם מחוסר הוודאות. עם זאת, המוליכות החשמלית וקבוע הדיאלקטרי של חומרים מופת שונים בהרבה מדיוק המדידה הניסיוני(טבלה 2). לכן, ההשפעות המדווחות יישמרו למרות שגיאות מדידה מתונות.
התוצאות מראות כיצד לא מספיק מורכבות מודל עשויה להסתיר מידע רלוונטי. חשוב להכיר בכך שהפרוטוקול מדמה גרסה פשוטה יותר של התופעה הפיזית המתרחשת מכיוון שהוא אינו מסביר את אופיים השונה של החומרים המעורבים בתהליך - מוליך (אלקטרודות), מוליכים למחצה (ציפוי), דיאלקטרי (ליבות סיבים) ואלקטרוליטיים (החומר שמסביב) - המסוגלים להשפיע על הובלת המטען. ניתן להסביר בעיה זו בהרחבות מודל עתידיות על ידי הוספת עיכובים בהעברת אנרגיה בממשקים (כלומר, תגובות פאראדיות) ועיכובים בהובלה יונים בתוך האלקטרוליט. עם זאת, הוספת מורכבות צריכה להיות מונחית על ידי אימות ניסיוני, כמודל פשוט שמשחזר את רוב מה שנצפו הוא שימושי יותר מאשר אחד מדויק להפליא שמוסיף מעט יותר מידע אבל הוא רגיש מאוד לאי הוודאות של פרמטרים מכוננים רבים.
כמו המטרה הסופית של הנדסת רקמות היא ליצור bioreactors כי לא רק לחקות היבט אחד או שניים של סביבות in vivo, אבל לשכפל ולשלוט בכל רמזים התפתחותיים הסלולר61, אלקטרומגנטי ומכאני במודלים סיליקו, כמו גם מודלים של העברת חום בין רכיבי bioreactor יהיה צורך לשלב. בשלב הדוגמנות הבא, ניתן להוסיף גם תופעות צימוד בין אינטראקציות כגון חימום אוהמי, זרימת נוזלים אלקטרוליטיים, עיוותי פיגומים מורפולוגיים בתגובה לגירוי חשמלי60 ופיזואלקטריות62. עם זאת, מודלים יש למזג רק לאחר כל אחד מהם אומת באופן ניסיוני. בדרך זו, אנו יכולים לקבל הבנה טובה יותר של ההשפעה של כל רכיב במיקרו-סביבה התאית, וכיצד ניתן למטב גירויים.
אם המודל המוצע מאומת באופן ניסיוני, ניתן לשלב אותו עם מודלים של תאים ביולוגיים - איור 1. דפוסי צפיפות מטען ואפנונים יכולים להשפיע באופן לא סימטרי על פעילות משאבות היון הספציפיות, להשפיע על ההתקשרות לסיבי החלבונים המניעים הידבקות ממברנה63 ומכאן הגירה מנחה, דפוסי התפשטות ומורפוגנזה64. חקר השערות אלה הוא הדרך קדימה בהבנת המנגנונים העומדים בבסיס תגובות הרקמות והתאים ל- ES.
למחברים אין מה לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי תוכנית הדוקטורט של Wellcome Trust ל-4 שנים בביולוגיה כמותית וביופיזית
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Comsol multiphysics 5.2 AC/DC module | COMSOL | - | FEM modelling software |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved