Method Article
В данной работе представлена стратегия построения конечно-элементных моделей волокнистых проводящих материалов, подвергающихся воздействию электрического поля (EF). Модели могут быть использованы для оценки электрического входа, который получают клетки, засеянные в таких материалах, и оценки влияния изменения свойств, структуры или ориентации составляющего материала каркаса.
Клинические исследования показывают, что электрическая стимуляция (ЭС) является потенциальной терапией для заживления и регенерации различных тканей. Таким образом, понимание механизмов клеточного ответа при воздействии электрических полей может направлять оптимизацию клинических применений. Эксперименты in vitro направлены на то, чтобы помочь выявить их, предлагая преимущество более широких диапазонов ввода и вывода, которые могут быть этически и эффективно оценены. Тем не менее, достижения в экспериментах in vitro трудно воспроизвести непосредственно в клинических условиях. Главным образом, это связано с тем, что устройства ES, используемые in vitro, значительно отличаются от тех, которые подходят для использования пациентами, а путь от электродов к целевым клеткам отличается. Поэтому перевод результатов in vitro в процедуры in vivo не является простым. Мы подчеркиваем, что структура и физические свойства клеточной микросреды играют определяющей роль в реальных условиях экспериментального тестирования, и предполагаем, что меры распределения заряда могут быть использованы для преодоления разрыва между in vitro и in vivo. Рассматривая это, мы показываем, как в силико-конечно-элементное моделирование (МКЭ) может быть использовано для описания клеточной микросреды и изменений, генерируемых воздействием электрического поля (EF). Мы расскаем, как EF связывается с геометрической структурой для определения распределения заряда. Затем мы показываем влияние зависящих от времени входов на движение заряда. Наконец, мы демонстрируем актуальность нашей новой методологии модели in silico с использованием двух тематических исследований: (i) in vitro волокнистый поли(3,4-этилендиокситиофен) поли(стиронесульфонат) (PEDOT-PSS) каркасы и (ii) коллаген in vivo во внеклеточном матриксе (ECM).
ES - это использование ЭФ с целью контроля биологических клеток и тканей. Его механизм основан на физическом стимуле, трансдуцированном в клетку, когда биомолекулы внутри и вокруг нее подвергаются воздействию внешне генерируемого градиента напряжения. Заряженные частицы участвуют в организованном движении, управляемом законом Кулона, создавая силы сопротивления на незаряженных частицах. Результирующий поток жидкости и распределение заряда изменяют активность и функции клеток, такие как адгезия, сокращение, миграция, ориентация, дифференцировка и пролиферация1, поскольку клетка пытается адаптироваться к изменениям условий микросреды.
Поскольку ЭФ являются контролируемыми, неинвазивными, нефармакологическими и, как показано, оказывают эффективное влияние на поведение основных клеток, ЭС является ценным инструментом для тканевой инженерии и регенеративной медицины. Он был успешно использован для руководства развитием нервной2,скелетной3,сердечной мышцы4,кости5 и кожи6. Более того, поскольку он усиливает ионофорез7,он используется в качестве альтернативного или дополнительного лечения к обычным фармакологическим. Его эффективность в лечении боли все еще обсуждается, поскольку ожидается более высокое качество клинических испытаний8,9,10. Тем не менее, не было зарегистрировано никаких побочных эффектов, и это может улучшить благосостояние пациентов11,12,13,14,15.
В то время как только клинические испытания могут дать окончательный вердикт об эффективности процедуры, модели in vitro и in silico необходимы для информирования о разработке предсказуемого лечения ЭС, поскольку они предлагают более сильный контроль над более широким спектром экспериментальных условий. Исследуемыми клиническими применениями ЭС являются регенерация костей16,17,восстановление денервированных мышц18,19,аксональная регенерация после операции20,21,обезболивание22,заживление ран23,24,25 и доставка ионофоретического препарата26. Для того, чтобы устройства ES были широко внедрены во всех возможных целевых приложениях, клинические испытания еще не установили более убедительных доказательств эффективности лечения. Даже в областях, где исследования in vivo на животных и людях постоянно сообщают о положительных результатах, большое количество зарегистрированных методов в сочетании со слишком малым количеством указаний о том, как выбирать между ними, и высокой ценой приобретения удерживает клиницистов от инвестирования в устройства ES27. Чтобы преодолеть это, ткань-мишень больше не может рассматриваться как черный ящик (предел экспериментов in vivo), а должна рассматриваться как сложная синергия нескольких подсистем(рисунок 1).
Многочисленные эксперименты с ЭС были проведены in vitro в течение28,29,30,31,32,33,34лет. Большинство из них характеризуют ЭС только через падение напряжения между электродами, деленное на расстояние между ними - грубое приближение величины электрического поля. Однако само электрическое поле воздействовало только на заряженные частицы, а не на клетки напрямую. Кроме того, когда между устройством и ячейками вставляются несколько материалов, грубое приближение может не удерживаться.
Лучшая характеристика входного сигнала требует четкого представления о том, как стимул трансдуцируется в клетку. Основными способами доставки ЭС являются прямая, емкостная и индуктивнаясвязь 35,36. Устройства для каждого способа различают по типу электрода (стержень, планар или обмотка) и размещению относительно ткани-мишени (контактной или изолированной)35. Устройства, используемые in vivo для более длительных процедур, должны быть носимыми, поэтому электроды и в большинстве случаев источник энергии либо имплантируются, либо прикрепляются к коже в виде раневых повязок или электроактивных пластырей. Генерируемый градиент напряжения вытесняет заряженные частицы в зоне обработки.
Поскольку структура каркаса влияет на результирующий поток заряженных частиц в непосредственной близости от ячеек, она имеет первостепенное значение при разработке протоколов ES. Различные конфигурации переноса заряда возникают при изменении материала платформы, метода синтеза, структуры или ориентации относительно градиента напряжения. In vivo на доступность и движение заряженных частиц влияют не только клетки, но и коллагеновая сеть и интерстициальная жидкость, составляющая поддерживающий ECM. Инженерные каркасы все чаще используются для лучшего воссоздания естественных клеточных микросред in vitro1,35. В то же время ECM представляет собой сложный естественный каркас.
Искусственные леса основаны на металлах, проводящих полимерах и углероде, спроектированы с акцентом на балансировку биосовместимости с электрохимическими характеристиками и долгосрочной стабильностью36. Одним из универсальных типов каркасов является электрорасплесковый волокнистый мат, который предлагает контролируемую наноразмерную топографию. Это может быть спроектировано так, чтобы напоминать ECM, таким образом, доставлять аналогичные механические сигналы, которые помогают регенерации широкого спектра тканей37. Чтобы значительно повлиять на ES, коврики должны быть в некоторой степени проводящими. Однако проводящие полимеры трудно электроспинировать и смешивание с изолирующими носителями ограничивает проводимость полученных волокон38. Одним из решений является полимеризация проводящего мономера на поверхности диэлектрического волокна, что приводит к хорошей механической прочности и электрическим свойствам конечного продукта38. Примером может быть покрытие шелковых электропрядных волокон полупроводящим PEDOT-PSS39. Сочетание механических и электромагнитных сигналов значительно ускоряет рост нейритов40,41,42. Нейриты следуют за выравниванием волокон каркасов и удлиняются больше после воздействия EF параллельно волокнам, чем вертикального43. Аналогичным образом, выравнивание волокнистых каркасов к EF также способствует миогенному созреванию33.
ECM в основном состоит из волокнистых белков44,из которых коллаген типа I является основным компонентом во всех тканях животных, кроме хряща (богатого коллагеном типа II)44. Тропоколлаген (TC), тройная спиральная конформация полипептидных нитей, является структурным мотивом коллагеновых фибрилл45. Просвечивающая электронная микроскопия и атомно-силовая микроскопия изображений коллагеновых фибрилл показывают D-периодический полосатый паттерн46, объясненный моделью Ходжа и Петруски47 как регулярные массивы TC зазоров и перекрытий45. Сухожилия состоят из выровненной коллагеновой фибриллярной матрицы, экранированной неколлагеновой высокогидрофильной протеогликановой матрицей48,49. Декорин представляет собой небольшой богатый лейцином протеогликан (SLRP), способный связывать области разрыва коллагеновых фибрилл и соединяться с другими SLRP через их боковые цепи гликозаминогликана (GAG)49. Исследования, проведенные на сухожилиях, показывают, что их электрические свойства значительно изменяются при гидратации50,51,механизм переноса заряда изменяется от протонического к ионическому по мере повышения уровня гидратациина 51. Это говорит о том, что электрическая проводимость вдоль фибриля коллагенового типа I может быть включена с помощью слоя Декорин-вода, с зазорами и перекрывающимися областями, имеющими различную электрическую проводимость и диэлектрические постоянные.
Поскольку идентичное воссоздание ECM искусственными каркасами невероятно, знания, создающие синергию между in vivo и in vitro, обеспечиваемые переводимыми результатами, похоже, зайдут в тупик. Моделирование in silico не только позволяет повторно транслировать между ними, но и добавляет важные преимущества в характеристике неизвестных процессов, связанных с ES. Сравнение наблюдений in vivo с наблюдениями in vitro может принести информацию о силе связи между тканью-мишенью и остальной частью организма, но не раскрывает текущих пределов знаний. Неизвестное можно разоблачить, наблюдая разницу между тем, что ожидается на основе текущих знаний, и тем, что происходит. Эксперименты in silico, основанные на математическом моделировании, позволяют разделить процесс на известные и неизвестные подпроцессы. Таким образом, явления, не учтенные в модели, выявляются, когда прогнозы in silico сравниваются с экспериментами in vitro и in vivo.
Формированию и проверке гипотез относительно основного механизма (механизмов) того, как клетки и ткани подвергаются воздействию электрических полей, препятствует большое количество параметров52, которые необходимо проверить отдельно. Чтобы определить репрезентативные экспериментальные условия, процесс ES должен быть разделен на подпроцессы(рисунок 1)и должны быть идентифицированы доминирующие входные сигналы, влияющие на поведение клеток. Модели, представляющие фундаментальные физические эффекты ЭС на клетки, описывают область, которая связывает EF с клеткой - область заряженных частиц53. Поведение частиц по отношению к клетке зависит от микросреды и может быть исследовано отдельно от клетки. Доминирующим входным сигналом для ячейки является подмножество выходов устройства ES, которое вызывает наибольшую степень изменчивости в реакции клетки. Наименьшее подмножество полных экспериментальных параметров, которое может генерировать вариации во всех доминирующих входных сигналах ячейки, может быть использовано для уменьшения размерности пространства параметров и количества тестовых случаев.
Входные данные биологической целевой модели ES должны представлять собой подмножество выходных сигналов, производимых устройством ES, которые полезны для описания физического воздействия ES на клетки. Простой биореактор с прямой связью имеет ту же структуру, что и электролитические электрохимические элементы. Модели из них показывают первичное (с учетом сопротивления раствора), вторичное (также учитывая фарадические реакции) или третичное (также учитывая диффузию ионов) распределение плотности тока. Поскольку сложность приводит к вычислительной стоимости, простейшая модель наиболее подходит для исследования параметров космоса. Моделирование волокнистых композитов, мотивированных свойствами материала54, фокусируется на свойствах сыпучих материалов в результате сложной микроамхитектерии, следовательно, не может описывать локальные эффекты воздействия EF. Существующие в силико модели, мотивированные ES, фокусируются на биологическом образце, будь то одна клетка, погруженная в однороднуюсреду 55,56,57,или сложные ткани с однородным внеклеточным пространством58. Плотность заряда и тока(рисунок 2)могут выступать в качестве интерфейсных сигналов между моделями устройства ES и биологическим образцом или между различными компонентами устройства ES. Предлагаемый протокол на основе МКЭ использует уравнения, описанные на рисунке 2, и был использован для изучения того, как зависящие от каркаса параметры могут быть использованы для модуляции этих двух сигналов, независимо от EF, генерируемого установкой прямой связи. Результаты подчеркивают, что необходимо учитывать электрические свойства каркаса или ECM при исследовании того, как ES влияет на клетки-мишени.
1. Построение модели в COMSOL
2. Выполните моделирование
3. Анализ
Предложенная модель описывает особенности композитного мата с параллельными волокнами, погруженного в проводящее вещество и подвергающегося воздействию внешне генерируемого градиента электрического потенциала. Моделирование показывает, что учет различных компонентов каркаса важен в микромасштабе, и исследует, как изменение угла выравнивания (входного сигнала) волокон к EF может генерировать изменчивость тока и плотности заряда (выходные сигналы) в непосредственной близости от волокон.
Представлены пять различных стадий геометрической сложности, каждая из которых влияет на результат моделирования: гладкая проводячая плита (SC), гладкая плита с непроводящими встроенными волокнами (SNC), грубый проводящий композит (RC), грубый композит с непроводящими встроенными волокнами (RNC), грубый композит с непроводящими встроенными волокнами и два типа периодического покрытия (RNCd)(рисунок 3). В разделе 1.5 протокола представлены шаги по импорту геометрий в проекте, а в разделе 1.6 показано, как их пошагово построить. Первые две модели не учитывают морфологию поверхности. SC и RC не учитывают диэлектрические свойства волоконной сердечника. RNC является предлагаемой моделью для нановолокнистых искусственных лесов, в то время как RNCd является предлагаемой моделью для сегмента ECM.
Минимизация вычислительных затрат была достигнута за счет сведения геометрии устройства ES к объему единицы модели, представляющей микросреду. В то время как ширина и длина устройства ES и каркаса могут легко составлять порядка нескольких сантиметров, диаметр содержащих волокон обычно ниже микрона. Здесь мы используем разрез каркаса, сопоставимый с диаметром волокна, чтобы снизить вычислительные затраты, вызванные соотношением сторон, и подчеркнуть влияние волокнистой природы каркаса на электрическую микросреду. Остальная часть устройства ES заменяется граничными условиями электрического потенциала, выбранными таким образом, что грубое приближение величины электрического поля составляет 100 В/м, часто сообщаемый параметр стимуляции. Более того, единичный объем с пятью параллельными волокнами, как тот, который используется в моделировании, представленном на рисунке 3, предполагается репрезентативным для целого планарного волокнистого мата. В массиве 1D можно выделить три типа волокон: внутренние центральные (с продольной плоскостью симметрии каркаса, разделяющей их пополам), внутренние переходные (с боковой поверхностью, окруженной другими волокнами, но с асимметричными сторонами) и внешняя (на краю каркаса). Пять - это минимальное количество волокон, необходимое для того, чтобы включить все три определенных типа.
Размер элемента сетки модели требует особого внимания, так как он может повлиять на результаты моделирования и, следовательно, не выявить важные эффекты (рисунок 4). Это общее правило метода конечных элементов и следствие теоремы Найквиста-Шеннона о выборке. Чем быстрее основные сигналы моделирования колеблются в пространстве, тем меньше должны быть элементы сетки, чтобы создать лояльное представление явления. С другой стороны, чем меньше элемент, тем больше общее количество строительных блоков модели и вычислительные затраты. Адаптивная очистка сетки, установленная в разделе 2.1, является хорошим и легким методом для уравновешивания этих противоположных целей путем уменьшения размера элемента только там, где и до тех пор, пока эта операция приводит к значительным изменениям.
Слишком упрощенная модель может потерпеть неудачу, представляя важные эффекты(рисунок5,6). Моделирование показывает, что учет морфологии поверхности и электрических свойств компонентов каркаса не является избыточным при прогнозировании электрических микросред. В то время как морфология поверхности оказывает непосредственное влияние на стационарный EF (сравните SC и SNC с RC, RNC и RNCd), сравнение между предсказаниями RC и RNC показывает, что непроводящие волоконные сердечники усиливают этот эффект. С точки зрения моделирования клеточных электрических микросред на нановолокнистых каркасах, модели SC, SNC и RC являются, таким образом, неоптимальными. Тем не менее, хорошей практикой является постепенное добавление сложности, поскольку сравнения между различными этапами помогают указать, какие особенности приводят к конкретным эффектам.
Сложность модели влияет на изменение тока и плотности заряда при выравнивании волокон по EF. Предлагаемый протокол помогает выделить эффект(рисунок 5,6). В то время как модель SC не показывает никаких изменений в предлагаемых метриках при изменении ее выравнивания с градиентом электрического потенциала, моделирование модели RNC предсказывает мощный контраст между матовым блоком с волокнами, выровненными к EF, и блоком с перпендикулярными волокнами(рисунок 7). Когда непроводящие керны ступают на пути течения тока, они образуют периодические плотины, которые приводят к чередованию областей с высокой и низкой плотностью заряда.
Динамические режимы ЭС могут быть смоделированы с помощью зависимых от времени исследований. Видео в дополнительных файлах показывают прогнозы, сделанные для синусоидального входного напряжения на полной модели искусственного каркаса (RNC), с волокнами, параллельными или перпендикулярными градиенту электрического потенциала. Небольшие токи вдоль волокон, перпендикулярных EF, появляются, когда заряд высвобождается из каркаса по мере уменьшения величины EF. Это показывает, что стимуляция может происходить не только при наличии внешнего EF, но и сразу после его отключения - см. дополнительные файлы для видео.
Рисунок 1:Иерархическая блок-схема моделирования - преимущества и ограничения моделирования с моделями in vivo и in silico. Цветом блока помечают блоки на одном иерархическом уровне. Блоки более низкого ранга включаются в блоки более высокого ранга. Цветовые метки обводки блока могут включать блок в определенный тип модели - связь с другими системными блоками не имеет желтого цвета в их обводке, так как они не являются компонентами для моделей in vitro. Пули действуют как клапаны и означают управляемость блока. Когда клапан включен, сигнал может проходить через все стрелковые пути в подчиненных подсистемах, которые имеют цвет клапана в их ходу. Интерпретация диаграммы: процесс ES состоит из стимулирующего устройства и биологической мишени, каждая из которых имеет несколько взаимосвязанных детерминированных или стохастических подпроцессов, которые не могут быть разделены in vivo или in vitro, поэтому они не имеют красного или желтого клапана. Стохастические процессы также вмешиваются на границе между устройством моделирования и биологическим образцом, когда они оба стимулируются. Модель in vitro отделяет интересуящей систему (т.е. сегмент кожи) от остальной части организма. Таким образом, можно наблюдать только внутренние процессы интересующих систем, увенчанные стохастическими процессами различной природы. Однако различные внутренние процессы, связанные с этим, не могут быть стимулированы и идентифицированы отдельно. Модели in silico являются параметрическими для известных компонентов - их поведение, как ожидается, будет определенной формы - и непараметрическим для неизвестного - поскольку нет механистических оснований доверять определенной экстраполяции. Все компоненты in silico могут быть смоделированы отдельно или в разных комбинациях, что позволяет изобразить различные гипотезы. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 2:(A) Закон Кулона (B) Поле электрического потенциала и заряд подвижного зонда (C) Электрический ток (D) Плотность заряда (E) Плотность тока (F) Уравнение непрерывности (G) Закон сохранения заряда. (A) Электрически заряженные стационарные частицы q и Q взаимодействуют электростатически через силу Кулона. (В1) Каждая заряженная частица Q генерирует скалярное поле, называемое электрическим потенциалом во всех положениях
в пространстве:
. Максимальная работа, необходимая для перемещения другой заряженной частицы q из ее
положения, представляется произведением между зарядом q и электрическим потенциалом, генерируемым Q в
положении. Электрическое потенциальное поле, генерируемое несколькими частицами, является суммой полей, генерируемых каждой отдельной частицей. (В2) Стационарное поле с неподвижными частицами генератора q и Q, действует с
частицей на зонд с положительным зарядом qp. В ответ qp движется, чтобы минимизировать электрический потенциал своего положения. Чтобы описать движение qp,можно вывести
и электрическое поле
из электрического потенциального поля:
. (C) Множественные подвижные положительно заряженные частицы зонда, равномерно высвобождаемые в неподвижном электрическом поле, следуют за организованным движением. Чтобы отслеживать конфигурацию заряда, не отслеживая каждую частицу, можно в каждый момент времени указать: (D) как пространство занято частицами, присваивая плотность
заряда каждому бесконечно малому объему, согласно закону Гаусса, и (E) как частицы проходят через граничные поверхности между соседними бесконечно малыми объемами, присваивая плотность тока
каждой границе в соответствии с законом Ома. (F) Плотность заряда и тока развиваются в зависимости от уравнения непрерывности, поскольку неравномерное смещение частиц приводит либо к накоплению, либо к потере частиц в определенном объеме. (G) В изолированной системе преобладает закон сохранения заряда, и нет притока или оттока заряженных частиц. Используемые обозначения:- q,Q,qp заряд и название заряженной частицы;
- евклидова норма вектора положения; k - постоянная Кулона;
- оператор градиента, εа - абсолютная диэлектрическая проницаемость среды; σ - проводимость среды. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 3:Пять различных уровней сложности для волокнистого мата. SC- гладкая с проводящими встроенными волокнами, простейшая модель, не учитывающая морфологию поверхности или различные свойства составляющих компонентов; SNC- гладкие с непроводящими встроенными волокнами; RC- шероховатая с проводящими встроенными волокнами, учитывающая морфологию поверхности, но не различные свойства компонентов; RNC- шероховатая с непроводящими встроенными волокнами, полностью предложенная модель нановолокнистых искусственных лесов; RNCd- грубые с непроводящими встроенными волокнами, покрытыми двумя различными материалами, полностью предлагаемая модель для листа коллагеновых волокон. Используемая единица измерения длины: нанометры. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 4:Пример результатов адаптивной уточнения сетки и результирующей плотности заряда после моделирования. (Слева) Автоматически генерируемая сетка с экстрагрубыми тетраэдрическими элементами; (Справа) Начальная сетка адаптивно отладелывался при стационарном исследовании; меньшие элементы требуются для точного результата в областях, где моделируемые сигналы имеют резкие пространственные изменения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 5:Угол выравнивания волокна к электрическому градиенту потенциала влияет на прочность EF в окружающих средах клеточных культур, когда учитывается достаточная сложность. SC, SNC, RC, RNC и RNCd - это различные уровни сложности для модели волокнистого мата, представленной на рисунке 3. Вертикальная ось отмечает угол выравнивания волокон до градиента электрического потенциала. Абстрактные электроды - нижняя сторона с высоким электрическим потенциалом и верхняя сторона с низким электрическим потенциалом. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 6:Угол выравнивания волокна к электрическому градиенту потенциала влияет на плотность заряда пространства в окружающих средах клеточных культур, когда учитывается достаточная сложность. SC, SNC, RC, RNC и RNCd - это различные уровни сложности для модели волокнистого мата, представленной на рисунке 3. Вертикальная ось отмечает угол выравнивания волокон до градиента электрического потенциала. Абстрактные электроды -нижняя сторона с высоким электрическим потенциалом и верхняя сторона с низким электрическим потенциалом. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 7:На движение заряда влияет выравнивание волокна каркаса относительно EF. Обе панели иллюстрируют прогнозы модели RNC в устойчивом состоянии. С левой стороны волокна параллельны EF, в то время как с правой стороны они перпендикулярны. Объем от светло-красного до синего цвета отмечает плотность заряда, а объем стрелки отмечает ориентацию плотности тока. Цвет стрелок соответствует текущей норме плотности. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Имя | Выражение | Описание |
Ws | 10 * Rc * med_ratio | Ширина строительных лесов |
Лс | 10 * Rc * med_ratio | Длина строительных лесов |
Хс | 2 * Rf | Высота строительных лесов |
med_ratio | 1.5 | Соотношение среды клеточного культивирования к каркасу |
РК | 278.5[нм] | Радиус сердцевины волокна |
r | 1.5 | Отношение сердечника волокна к покрытию |
Рф | Рк*р | Волокно с радиусом покрытия |
Тета | 90[ог] | Угол ориентации волокна |
Если | 1.3*(Ls*cos(тета)+Ws*sin(тета)) | Длина волокна |
тес | 1 | Отношение радиуса сердцевины волокна к расстоянию между волокнами |
n_1 | 2*(fix((Ws/(2*cos(theta))-Rf)/(2*tes*Rc))+3)*(cos(theta)!=0)+1*(cos(theta)==0) | Максимальное количество волокон, если тета<=45 |
n_2 | 2*(fix((Ls/(2*sin(theta))-Rf)/(2*tes*Rc))+3)*(sin(theta)!=0)+1*(sin(theta)==0) | Максимальное количество волокон, если тета>45 |
избыток | 1,2 + 0,3 * абс (грех (2 * тета)) | Первое относительное смещение волокна от каркаса |
D | Лф/5 | Периодичность шерсти |
подпорка | 0.46 | Длина первого слоя относительно периодичности D |
E | 100[мВ/мм] | Величина электрического поля |
В0 | Е*ЛС*med_ratio | Напряжение клеммы |
омега | 500[Гц] | Зависящий от времени исследование Частота напряжения |
p_sigma | 0.5 | Относительная проводимость второго покрытия |
p_eps | 1.5 | Второе покрытие относительной диэлектрической проницаемоем |
Таблица 1: Параметры, используемые для моделирования
Культура Медиа | ПЕДОТ:ПСС 1 | ПЕДОТ:ПСС 2 | Коллаген Гидратированный 1 | Коллаген Гидратированный 2 | Фиброин шелка | Коллаген сухой | |
Электропроводность (С/м) | 1.7014 | 1.00Е-01 | p_sigma * 0.1 | 2.00Е-05 | p_sigma * 2e-5 | 1.00Е-08 | 2.50Е-08 |
Относительная диэлектриктность | 80.1 | 2.2 | p_eps * 2.2 | 9.89 | p_eps * 9.89 | 7.81E+00 | 4.97 |
Таблица 2: Свойства материала, используемые при моделировании
Дополнительные файлы. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.
Предлагаемый протокол предлагает единообразное решение для моделирования естественных и искусственных каркасов и подчеркивает необходимость учитывать наноструктуру волокнистых каркасов при проверке воздействия EF на клетки, засеянные на такие материалы. Хотя грубое приближение к напряженности EF (разность потенциалов электродов, деленная на расстояние между электродами) привело бы нас к ожиданию напряженности поля 100 мВ/ мм, моделирование предсказывает напряженность стационарного поля до 30% выше в различных областяхмата (рисунок 5). Этот результат должен представлять интерес при разработке эксперимента ЭС и интерпретации данных, так как гибель клеток может быть вызвана слишком сильными ЭФ. Воздействие электрической микросреды позволит напрямую корреляцию между ЭС и клеточным развитием. Хотя в нескольких исследованиях представлен подробный морфологический анализ используемых каркасов33,43,59,они не исследуют взаимодействие между структурой, электрическими свойствами материалов и EF. Этот протокол может включать эту связь, поскольку такие параметры, как радиус волокна, толщина слоя покрытия, расстояние между волокнами и электрические свойства компонентных материалов, могут быть изменены в соответствии с каждым экспериментом путем изменения глобальных определений на этапах 1.2 и 1.3. Следовательно, настраиваемые 3D-прогнозы пространственного разрешения заряда и плотности тока могут быть сделаны как для статических, так и для динамических режимов ES.
Оптимизация конструкции каркаса может быть нацелена на модели RNC и RNCd с широким диапазоном параметров, масштабированием предлагаемых морфологий или их частей. Альтернативно, другие конфигурации каркасов могут быть исследованы с помощью предлагаемого протокола путем изменения типов массивов с линейных на трехмерные в разделе 1.6.5 и адаптации геометрии строительных лесов в разделе 1.6.2. Однако оптимизация строительных лесов не может быть выполнена без цели. В то время как для целей тканевой инженерии основное внимание уделяется судьбе клеток, более четкая картина того, какие стимулы являются ее основными детерминантами, необходима, если желательен ее надежный контроль. Плотность заряда и тока являются хорошими дескрипторами клеточных электрических микросред, поскольку они показывают взаимодействие между EF и электрическими свойствами различных компонентных материалов сложных каркасов, таких как ECM. Протокол показывает, как вычислять прогнозы для этих метрик с учетом геометрии нановолокнистого каркаса, и подчеркивает важность угла выравнивания волокон с EF. Затем предсказания заряда и плотности тока могут быть связаны с клеточным развитием и, таким образом, каркасные и ES-режимы могут быть оптимизированы для конкретных задач.
Интересно, что исследование показывает, что воздействие EF генерировало механическое напряжение более чем в два раза по прочности в композитных пленках с нановолокнами, перпендикулярными внешнему EF, по сравнению с пленками с параллельным выравниванием60. Зарегистрированное механическое напряжение может быть результатом кулоновых сил, действующих между заряженными волокнами, предсказанных грубыми моделями моделирования (RC, RNC, RNCd)(рисунок 6). Хотя эти симуляции могут быть полезны при исследовании этой гипотезы, следует отметить, что сообщенные экспериментальные результаты были получены в системе с емкостной связью, и моделирование представляет собой прямую связь.
Ограничивающим фактором для будущего возможного использования протокола для оценки входного сигнала сотовой связи является неопределенность параметров. Геометрическими неопределенными параметрами являются толщина слоя покрытия и расстояние между сердечниками волокна. Первый можно вывести, найдя значение, которое приводит к объему импеданса, которое может быть экспериментально проверено. Второй может быть извлечен из сканирования материалов высокого разрешения. Параметры, описывающие физические свойства материалов, также подвержены влиянию неопределенности. Однако электропроводность и диэлектрическая проницаемость образцовых материалов отличаются гораздо больше, чем экспериментальная точность измерения(таблица 2). Таким образом, сообщаемые эффекты будут сохранены, несмотря на умеренные погрешности измерений.
Результаты показывают, как недостаток сложности модели может скрывать соответствующую информацию. Важно признать, что протокол имитирует упрощенную версию происходящего физического явления, поскольку он не учитывает различную природу материалов, участвующих в процессе - проводник (электроды), полупроводник (покрытие), диэлектрик (волоконные сердечники) и электролитический (окружающее вещество) - которые способны влиять на перенос заряда. Эта проблема может быть учтена в будущих расширениях модели путем добавления задержек передачи энергии на границах раздела (т.е. реакций Фарада) и задержек переноса ионов внутри электролита. Однако добавление сложности должно основываться на экспериментальной проверке, поскольку простая модель, которая воспроизводит большую часть наблюдаемого, более полезна, чем удивительно точная, которая добавляет немного больше информации, но глубоко чувствительна к неопределенности многих составляющих параметров.
Поскольку конечной целью тканевой инженерии является создание биореакторов, которые не только имитируют один или два аспекта сред in vivo, но и реплицируют и контролируют все клеточные сигналы развития61,электромагнитные и механические модели in silico, а также модели теплопередачи между компонентами биореактора должны быть объединены. На последующей фазе моделирования также могут быть добавлены явления связи между этими взаимодействиями, такие как омический нагрев, поток электролитической жидкости, морфологические деформации каркаса в ответ на электрическую стимуляцию60 и пьезоэлектричество62. Однако модели следует объединять только после того, как каждая из них была экспериментально проверена. Таким образом, мы можем лучше понять влияние каждого компонента в клеточной микросреде и то, как стимулы могут быть оптимизированы.
Если предложенная модель экспериментально валидирована, ее можно комбинировать с моделями биологических клеток - рисунок 1. Паттерны плотности заряда и модуляции могут асимметрично влиять на активность специфических ионных насосов, влиять на присоединение к волокну белков, управляя адгезией мембраны63 и, следовательно, направлять миграцию, паттерны пролиферации и морфогенез64. Изучение этих гипотез является путем вперед в понимании механизмов, лежащих в основе тканевых и клеточных реакций на ЭС.
Авторам нечего раскрывать.
Эта работа была поддержана 4-летней программой Wellcome Trust PhD в области количественной и биофизической биологии.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Comsol multiphysics 5.2 AC/DC module | COMSOL | - | FEM modelling software |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены