הפרוטוקול הנוכחי מתאר בדיקה לקביעת התגובה ללבמיזול, אגוניסט פרמקולוגי של סוג אחד של קולטני אצטילכולין Caenorhabditis elegans . במבחן השחייה הנוזלי הזה, החוקרים מתבוננים באופן חזותי ומכמתים את השיתוק תלוי הזמן של בעלי חיים המעובדים בצלחות של 24 בארות.
בצומת הנוירומוסקולרי (NMJ), הקשירה של המוליך העצבי המעורר אצטילכולין (ACh) לקולטנים פוסט-סינפטיים מובילה להתכווצות שרירים. כמו בשרירי השלד של בעלי חוליות, איתות כולינרגי בשרירי דופן הגוף של אורגניזם המודל Caenorhabditis elegans נדרש לתנועה. חשיפה ללבמיזול, אגוניסט פרמקולוגי של סוג אחד של קולטני ACh על שרירי דופן הגוף, גורמת לשיתוק תלוי זמן של בעלי חיים מסוג בר. שינוי ברגישות ללבאמיזול מרמז על פגמים באיתות ב-NMJ או בתפקוד השרירים. כאן מוצג פרוטוקול לבדיקת לבאמיזול נוזלי המבוצעת על C. elegans הגדלים בצלחות של 24 בארות. שחייה נמרצת של בעלי החיים בנוזל מאפשרת הערכה וכמות של שיתוק הנגרם על ידי לבאמיזול במאות תולעים בפרק זמן של שעה ללא צורך במניפולציה פיזית. ניתן להשתמש בהליך זה הן עם סוג בר והן עם מוטנטים ששינו את הרגישות ללבמיזול כדי להדגים את ההשלכות התפקודיות של איתות שונה ב- NMJ.
הפעלה של קולטני אצטילכולין פוסט-סינפטיים (AChRs) על שרירי השלד גורמת לאות חשמלי שמוביל להתכווצות שרירים. הפרעה בתפקוד העצבי-שרירי גורמת לתסמונות מיאסטניות ולניוון שרירים בבני אדם 1,2,3,4. הנמטודה Caenorhabditis elegans שימשה רבות כדי ללמוד על תהליכים ביולוגיים בסיסיים שמורים אבולוציונית ומנגנונים של מחלות. שרירי השלד של בעלי החוליות ושרירי דופן הגוף של C. elegans שקולים מבחינה תפקודית בשליטה על תנועה5. כאן, מוצגת בדיקה פשוטה שניתן להשתמש בה כדי להשוות בין סוג פראי C. elegans עם מוטנטים ששינו איתות עצבי-שרירי או תפקוד שרירים.
תשומות מעוררות ומעכבות המתקבלות מנוירונים מוטוריים כולינרגיים ו- GABAergic, בהתאמה, גורמות לשרירים בצד אחד של גוף C. elegans להתכווץ בעוד השרירים בצד השני נרגעים, ומאפשרים תנועה מתואמת6. Levamisole, סוכן anthelmintic המשמש לטיפול בזיהומים נמטודות טפיליות, נקשר ומפעיל באופן מרכיב מחלקה אחת של AChRs על שרירי דופן הגוף, וכתוצאה מכך שיתוק תלוי זמן7. לפיכך, רגישות שונה levamisole ניתן להשתמש כדי לזהות C. elegans עם פגמים במאזן של איתות מעורר ומעכב 7,8,9,10,11,12,13,14,15. לדוגמה, מוטציות בתת-יחידות של ה-AChR הרגיש לבאמיזול (L-AChR), כגון UNC-63, כמו גם הומולוג C. elegans של קובילין, LEV-10, הנדרש לאשכולות L-AChR בסינפסה, פוגעים באיתות מעורר וגורמים להתנגדות לבאמיזול 7,8. מוטציות בקולטן GABAA UNC-49 מפחיתות את האיתות המעכב וגורמות לרגישות יתר ללבאמיזול12.
רגישות יתר או עמידות ללבאמיזול הוערכה באופן מסורתי על ידי העברת בעלי חיים לצלחות אגר המכילות לבאמיזול ולאחר מכן דחיפה קבועה של התולעים כדי לקבוע את נקודת הזמן שבה מתרחש שיתוק13,14,15. פיתחנו בדיקת שחייה נוזלית של levamisole המבטלת את הצורך במניפולציה פיזית של בעלי החיים ומאפשרת הקרנה של מאות בעלי חיים תוך שעה אחת בלבד. כאן מתואר השימוש בבדיקה זו עם בעלי חיים מסוג בר, unc-63(x26), lev-10(x17) ו- unc-49(e407). עם זאת, פרוטוקול זה יכול להתבצע גם על C. elegans שנחשפו ל- RNAi, כפי שנעשה כדי לאמת נוקאאוטים שזוהו במסך RNAi כלל-גנומי עבור רגישות לבאמיזולמשתנה 11.
עבור בדיקה פרמקולוגית זו, תולעים גודלו לבגרות ב -24 צלחות באר, 0.4 mM levamisole בחיץ M9 נוסף לכל באר, ומספר בעלי החיים הנעים נרשם כל 5 דקות במשך שעה אחת. שיתוק המושרה על ידי Levamisole נצפה חזותית לאורך זמן, ולאחר השלמת הבדיקה, הנתונים כומתו. ההערכה של מוטנטים יחד עם סוג פראי C. elegans מאפשרת לתלמידים לבצע תחילה תחזיות לגבי השפעות פנוטיפיות פוטנציאליות ולאחר מכן לבצע ניסויים כדי לבחון את ההשערות שלהם. לסיכום, בדיקת הלבאמיזול הנוזלית הפשוטה, הזולה והזולה הזו היא דרך אידיאלית להדגים את ההשפעה של אובדן גנים ספציפיים על תפקוד NMJ.
1. הכנת צלחות למבחן הלבאמיזול
2. סנכרון C. elegans (יום 1)
3. ציפוי מסונכרן C. elegans (יום 2)
4. ביצוע בדיקת הלבאמיזול (יום 5)
5. ניתוח נתונים
איתות באמצעות קולטני AChRs ו-GABA מאפשר לשרירים בצד אחד של גוף ה-C. elegans להתכווץ בעוד השרירים בצד השני נרגעים, מה שמאפשר תנועה מתואמת 6,16. קשירת הלבאמיזול ל-L-AChRs היונוטרופי גורמת להתכווצות, מה שמוביל לשיתוק תלוי זמן של חיות בר. כאן, הערכנו את הרגישות של סוג פראי, מוטנט unc-63 L-AChR, מוטנט אשכולות lev-10 L-AChR, ומוטנט קולטן unc-49 GABAA C. elegans ללבמיזול. מוטציות בתת-יחידות של L-AChR, כמו גם בגנים הדרושים לסחר ב-L-AChRs לקרום הפלזמה של השריר, התקבצות של L-AChRs פוסט-סינפטי ואיתות Ca 2+ במורד הזרם, גורמות לעמידות לשיתוק הנגרם על-ידי לבאמיזול 7,8,9,10,11,16,17, כפי שנצפה במוטציות unc-63 ו-lev-10 (איור2B ג). אובדן תעלת היונים המגודרת GABA UNC-49 גרם לרגישות יתר של הלבאמיזול (איור 2B,C) עקב הפרעה באיזון הנכון של איתות כולינרגי ו-GABAergic12. כאשר בדיקה זו בוצעה לאחרונה על ידי סטודנטים לתואר ראשון במעבדה גנטית מתקדמת, 100% מהסטודנטים צפו בהתנגדות לבאמיזול עם המוטנטים unc-63 ו- lev-10, בעוד 88% צפו ברגישות יתר של לבאמיזול עם מוטנט unc-49. נתונים אלה שנאספו עם בדיקת השחייה של הלבאמיזול הנוזלי עולים בקנה אחד עם הפנוטיפים שנצפו במבחני לבאמיזול מסורתיים על בסיס צלחת 7,8,11,12,13.
איור 1: סכמת הכנה ויישום של בדיקת לבאמיזול. 24-באר צלחות NGM הם שפכו; יומיים לאחר מכן, OP50 Escherichia coli נזרע לתוך הבארות. C. elegans מסונכרנים באמצעות הכנת אקונומיקה, וחיות שלב הזחל הראשון (L1) עבור כל זן שיש לבחון (סוג פראי, שחור; UNC-63(x26), מגנטה; LEV-10(x17), ירוק; UNC-49(E407), כחול) מוזרמים לתוך הבארות על פי מפת לוחות קבועה מראש למחרת. לאחר 3 ימים של צמיחה ב 20 מעלות צלזיוס, או כאשר בעלי החיים מגיעים לבגרות, 0.4 mM levamisole ב M9 חיץ מתווסף לכל באר, ואת מספר בעלי החיים נעים נספר כל 5 דקות במשך 1 שעה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
איור 2: שיתוק הנגרם על-ידי לבמיזול בסוג בר ומוטציה מייצגת C. elegans. (A) חשיפה ל-0.4 mM levamisole גורמת לשיתוק תלוי זמן; זה לא נצפה עבור בעלי חיים ששוחים במאגר M9 1x במשך שעה אחת. (B) שיתוק תלוי זמן של בעלי חיים מסוג בר (שחור), unc-63(x26 ) (מגנטה), lev-10(x17 ) (ירוק) ו- UNC-49(E407) (כחול) במבחן השחייה Levamisol. אובדן תת-היחידה L-AChR UNC-63 או L-AChR של חלבון האשכולות LEV-10 הביא לעמידות לבאמיזול, ואובדן קולטן GABAA UNC-49 גרם לרגישות יתר של לבאמיזול. n ≥ 50 לכל גנוטיפ, p < 0.0001 עבור כל המוטנטים בהשוואה לסוג הבר בניסוי מייצג זה. (C) באמצעות אותם נתונים כמו בלוח (B), אחוז בעלי החיים הנעים בכל נקודת זמן (ממוצע האחוזים עבור כל באר ± SE) נקבע עבור כל זן. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
תגובה שונה ללבמיזול יכולה לזהות גנים הדרושים לאיתות כולינרגי פוסט-סינפטי ולתפקוד השרירים. הפרוטוקול כאן מתאר בדיקת לבמיזול נוזלי המשמשת לשיתוק כמותי תלוי זמן על פני פרק זמן של שעה. התלמידים מבצעים תחזיות לגבי ההשפעות של מוטציות גנטיות מסוימות, מבצעים ניסוי עם גודל מדגם גדול, ולאחר מכן מכמתים את התוצאות שלהם. בדיקה זו היא דרך פשוטה ויעילה לכמות שיתוק הנגרם על ידי לבאמיזול מבלי לקטוף או לעודד בעלי חיים, מה שהופך אותה למתאימה למעבדות לתואר ראשון, כמו גם לחוקרים החוקרים העברה עצבית-שרירית. נדון כאן בכמה מהמלכודות הנפוצות ביותר, מגבלות הבדיקה, ווריאציה לפרוטוקול המאפשרת את השימוש בה עם חיות RNAi; כמו כן, נדון כאן כיצד ניתן להטמיע מבחן זה בחוויית מחקר לתואר ראשון מבוססת קורסים.
הכנה נכונה של 24 צלחות באר היא חיונית. ראשית, מדשאות חיידקים חייבות להיות יבשות לחלוטין לפני שמזהים חיות L1 בבארות. אם לא מיובשים מספיק, החיידקים מתערבבים עם תמיסת הלבאמיזול במהלך הבדיקה, הופכים את הנוזל לעכור ומונעים מאנשים את היכולת לספור את התולעים. שנית, כאשר מסנכרנים תולעים באמצעות הכנת אקונומיקה, אסור לבעלי החיים להיחשף לתמיסת האקונומיקה למשך זמן רב מדי, שכן הדבר יגרום לציפוי המגן על הביצים להתפורר. שלישית, חשוב מאוד לזהות רק 20-30 L1s לכל באר, מכיוון שתולעים רבות מדי בבארות מקשות מאוד על ספירה מדויקת של המספר הנע בזמן המוקצב. לבסוף, חשוב לשמור על טכניקה אספטית במהלך הכנת הצלחות כמו בארות מזוהמות לא ניתן לבחון.
ישנן מספר מגבלות שיש לקחת בחשבון בעת ביצוע בדיקה זו. ראשית, ספירת מספר התולעים הנעות בכל באר כל 5 דקות עשויה להיות מכריעה עבור אנשים חסרי ניסיון קודם במעבדה, וזה עלול להוביל לאיסוף נתונים לא מדויק. באשר למבחנים אחרים המשמשים לקביעת רגישות לתרופות18,19, ניסוי זה יכול להתבצע עם פחות נקודות זמן. שנית, ציפוי של L1s מורעבים שבודדו מהכנת אקונומיקה הוא שיטה קלה להשגת אוכלוסייה מסונכרנת; עם זאת, יש לבצע התאמות אם התזמון ההתפתחותי שונה בין הזנים הנבדקים. ניתן לבחור חיות שלב זחל רביעיות מאוחרות (L4s) לצלחת בת 24 בארות לצורך בדיקה זו; עם זאת, כאשר מכינים צלחות רבות, זה דורש עבודה רבה מדי. לחלופין, יש לקבוע את משך הזמן שלוקח לכל זן להגיע ל-L4 ולאחר מכן למקם את ה-L1s לתוך הבארות בזמנים שונים כדי להתאים את עצמו להבדלים במהירות ההבשלה. לבסוף, בעוד שניתן להשתמש בבדיקה זו כדי לזהות גנים חדשים החשובים לתפקוד השרירים הפוסט-סינפטיים11, תגובת הלבאמיזול שהשתנתה יכולה להיגרם גם על ידי מוטציה או RNAi של גנים קדם-סינפטיים12. אם נצפתה רגישות לבאמיזול משתנה, יש לבצע ניסויים נוספים כדי לקבוע את הסיבה לפנוטיפ זה.
על ידי ביצוע כמה שינויים בלוחות 24 הבארות, ניתן לבצע את בדיקת השחייה המתוארת של הלבאמיזול גם על חיות RNAi11. ניתן להשיג פגיעה גנטית באמצעות RNAi על ידי הזנת חיידקי C. elegans המבטאים RNA דו-גדילי המתאים לגן המעניין20. להכנת לוחות RNAi, יש להוסיף 1 מ"ל של 1M IPTG ו 1 מ"ל של 25 מ"ג / מ"ל קרבניצ'ילין לליטר מדיה לאחר הסרת autoclave. תרביות חיידקים גדלות על ידי איסוף מושבה אחת לתוך 3 מ"ל של מרק LB בתוספת 3 μL של 25 מ"ג/מ"ל קרבניצילין, ורעידות בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס במהלך הלילה, ומפת הצלחות נעשית כאשר החיידקים השונים מזוהים בבארות. C. elegans מסונכרנים על ידי הכנה אקונומיקה כמתואר; עם זאת, יש להשתמש בזן ה-RNAi הרגיש ל-eri-1(mg366) במקום בזן הפראי כדי להגביר את ההפלה של הגנים. הדחות RNAi גורמות לאותם פנוטיפים של לבאמיזול שנצפו עבור מוטנטים של אובדן תפקוד11.
הפרוטוקול המוצג כאן יכול לשמש במחקר מעבדה, כניסוי עצמאי במעבדה לתואר ראשון, או בשבועות הפתיחה של קורס מתקדם לתואר ראשון כמבוא לטכניקות בסיסיות של C. elegans ולתפקוד עצבי-שרירי. בקורס מתקדם יותר המבוסס על תגליות, התלמידים יכולים להשתמש במבחן זה כדי לקבוע אם אובדן של C. elegans הומולוגים של גנים שעברו מוטציה אצל אנשים עם תסמונות מיאסטניות, דיסטרופיות שרירים או מיופתיות משנה את הרגישות לבאמיזול. לסיכום, מבחן רגישות הלבאמיזול הפשוט והזול הזה מספק גישה מעשית ללמידה על איתות ב- NMJ וצבירת ניסיון בעבודה עם מערכת המודל של C. elegans.
למחברים אין ניגוד עניינים.
אנו מודים לריה דטאני ולורן הוגסטרום, שאספו את הנתונים באיור 2B,C עיוור לגנוטיפ במעבדה לגנטיקה מתקדמת BISC413 (אביב 2022) באוניברסיטת דלאוור. מידע נוסף על חוויית המחקר לתואר ראשון (CURE) המבוססת על קורס BISC413, כמו גם גישה למדריך המעבדה שתוכנן על ידי J. Tanis, זמין על פי בקשה. זני נמטודה סופקו על ידי המרכז לגנטיקה של Caenorhabditis , הנתמך על ידי NIH-ORIP (P40 OD010440). עבודה זו נתמכה על ידי P20 GM103446 דלאוור INBRE מנטורד CURE פרס (ל- J.E.T.).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
60 mm non-vented, sharp edge Petri Dishes | TriTech Research | Cat #: T3308 | |
BD Difco Bacto Agar | Fisher Scientific | Cat#: DF0140-01-0 | |
BioLite 24 Well Multidish | Fisher Scientific | Cat#:12-556-006 | |
Calcium Chloride Dihydrate | Fisher Scientific | Cat#: BP510-500 | |
Cholesterol | MP Biomedicals | Cat#: 02101382-CF | |
eri-1(mg366) | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | GR1373 | |
Gibco Bacto Peptone | Fisher Scientific | Cat#: DF0118-17-0 | |
Gibco Bacto Tryptone | Fisher Scientific | Cat#: DF0123-17-3 | |
GraphPad Prism (Statistical software) | GraphPad Software, Inc. | ||
lev-10(x17) | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | ZZ17 | |
Levamisole hydrochloride | Fisher Scientific | Cat#: AC187870100 | |
Low Splash Regular Bleach - 121oz - up & up | Target | Search target.com | |
Magnesium Sulfate Heptahydrate | Fisher Scientific | Cat#: BP213-1 | |
Microsoft Excel | Microsoft, Inc | ||
N2 wild type | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | Bristol N2 | |
OP50 E. coli | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | OP50 | |
Potassium Phosphate Dibasic | Fisher Scientific | Cat#: BP363-1 | |
Potassium Phosphate Monobasic | Fisher Scientific | Cat#: BP362-500 | |
Sodium Chloride (NaCl) | Fisher Scientific | Cat#: BP358-1 | |
Sodium Hydroxide 10N | Fisher Scientific | Cat#: SS255-1 | |
Sodium Phosphate Dibasic | Fisher Scientific | Cat#: BP332-1 | |
unc-49(e407) | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | CB407 | |
unc-63(x26) | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | ZZ26 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionExplore More Articles
This article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved