A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Method Article
מחקר זה מספק פרוטוקול להערכת האינטראקציה של Mycobacterium tuberculosis עם החיישן המיקרוביאלי SLAMF1. הבדיקות נערכו על מקרופאגים אנושיים שמקורם במונוציטים באמצעות ציטומטריית זרימה ומיקרוסקופיה פלואורסצנטית. הכלים המתוארים רלוונטיים לחקר אינטראקציות בין פתוגנים לקולטני חיסון.
הערכת האינטראקציה הישירה בין פתוגנים לקולטנים חיסוניים כרוכה בדרך כלל בטכניקות מתוחכמות או מרמזת על שימוש בזנים טרנסגניים ותאים מהונדסים גנטית. כאן, מתוארת שיטה חלופית לאיתור אינטראקציה ביוכימית בין חיישן המיקרוביאלי של המקרופאגים SLAMF1 ו-Mycobacterium tuberculosis . פותחו שתי גישות טכניות המשתמשות בזרימה ציטומטרית ומיקרוסקופיה פלואורסצנטית. סך כל תמציות חלבון התאים ממקרופאגים אנושיים נוצרו, ולאחר מכן הודגרו עם תאים שלמים של אנטיגנים של M. tuberculosis (WCMtb) או M. tuberculosis (Mtb Ags) למשך הלילה ב-4 מעלות צלזיוס ולבסוף צולבו באמצעות טיפול בפורמלדהיד/גליצין/אתילן גליקול ביס (succinimidyl succinate). אינטראקציה של SLAMF1 עם WCMtb על ידי זרימה ציטומטרית זוהתה עם נוגדן אנטי-SLAMF1 ספציפי ל-PE. קיומה של אינטראקציה על ידי מיקרוסקופיה פלואורסצנטית בוצע על ידי הצמדת Mtb Ags מוכתמים ברודמין-PE לשקופיות מצופות פולי-D-ליזין, שהודגרו עם תמצית החלבון הכוללת ממקרופאגים שמקורם במונוציטים. לאחר טיפול צולב, SLAMF1 הודגם באמצעות נוגדנים ראשוניים (anti-SLAMF1) ומשניים (Alexa Fluor 488). הבדיקות סיפקו כלי ביוכימי חזק למדידת אינטראקציות פתוגנים-קולטנים חיסוניים, והתגברו על הקשיים הקשורים לקווי תאים טרנסגניים וניסויי אפנון ביטוי גנים של חלבונים.
Mycobacterium tuberculosis, הפתוגן הגורם לשחפת שזוהה לפני 142 שנים, נותר אתגר עולמי, וכיום מדביק לפחות רבע מאוכלוסיית העולם1. מועבר באמצעות טיפות הנישאות באוויר מאנשים נגועים, M. tuberculosis מגיע למקרופאגים המכתשית בריאות שם הוא יכול לשרוד לתקופות ארוכות במצב סמוי 2,3. לא רק שהתגובה המקרופאגית המקומית מופעלת, אלא שבשנים האחרונות תוארה כי ניתן לגייס מונוציטים היקפיים לדרכי הנשימה ולהתמיין למקרופאגים מכתשית, מה שיוצר תגובה חזקה עוד יותר נגד M. tuberculosis מאשר מקבילם ממקור עוברי 2,4.
מקרופאגים הם שחקנים בסיסיים של מערכת החיסון המולדת. עם בליעת M. tuberculosis, מקרופאגים מציגים פונקציות חיידקיות רבות, כגון הפרשת ציטוקינים פרו-דלקתיים, איחוי של הפגוליזוזום והפעלת תאים חיסוניים אחרים על מנת להרוג M. tuberculosis 2,3. עם זאת, המבנה הארכיטקטוני המורכב של פתוגן זה מספק אפקטורים (למשל, חלבונים ושומנים) המסוגלים לווסת את חילוף החומרים והתפקודים של המקרופאגים, וכתוצאה מכך, את התהליך הדלקתי3. מניפולציה זו של תגובות מקרופאגים, באמצעות הפרשת גורמי אלימות או ניצול גורמים מארחים, מובילה לאסטרטגיות בריחה שונות המופעלות על ידי M. tuberculosis. כמה מנגנוני התחמקות מרכזיים כוללים אינדוקציה של ציטוקינים אנטי דלקתיים, עיכוב התבגרות והחמצה של פגוליזוזום, שינויים בעקה חמצונית, הפרעה באוטופגיה וליקויים במהלך עיבוד אנטיגןוהצגתו 3,5.
אינטראקציה מווסתת היטב בין מקרופאגים ל-M. tuberculosis היא חיונית להתפתחות תגובה חיסונית תקינה. לכן, חקר סינפסות אלו הוא המפתח לזיהוי מנגנונים חיסוניים או אימונופתוגניים המושרים על ידי הצלבה של מארח-פתוגן, כמו גם זיהוי מטרות טיפוליות פוטנציאליות. קולטנים רבים מתווכים את הזיהוי ו/או ההפנמה של M. tuberculosis, כולל TLRs 6,7,8, NLRs 7,8, קולטני משלים 6,8, קולטני לקטין מסוג C 6,8 וקולטני נבלות 6,8. נתונים מצטברים מצביעים על כך שגם PRRs הקשורים לפני השטח וגם תוך-תאיים ממלאים תפקיד חשוב במהלך ההדבקה, בזיהוי M. tuberculosis אופסוני ולא אופסוני.
Zihad ו-Sifat et al. סקרו לאחרונה את השתתפות ה-PRRs בתגובות הנגרמות על ידי M. tuberculosis על ידי תאים מולדים9. בפרט, רוב בני משפחת TLR היו מעורבים באינטראקציה עם ליגנדים של M. tuberculosis 6,7. Surface TLR2 מזהה אנטיגנים מיקובקטריאליים כגון ליפופרוטאינים אצילטים, ליפופרוטאין 19-kDa, ליפופרוטאין LprA, ליפופרוטאין LprG, אנטיגן 30-kDa, אנטיגן 38-kDa, MymA, חומצה פרולין-פרולין-גלוטמית (PPE)-57, LAM, LM, PIM, חלבון הלם חום 60, חלבון חתימה Rv1509 והחלבון המופרש ESAT-67. ממברנה TLR4 מקיימת אינטראקציה עם חלבוני הלם חום, אנטיגן 38-kDa, RpfE, Rv0652, Rv0335c, Rv2659c, Rv1738, Rv2627c, Rv2628, GrpE ו-HBHA. מצד שני, ליגנדים עבור TLRs אנדוזומיים (TLR 3, 7, 8 ו-9) כוללים dsRNA, tRNA, ssRNA, RNA פגוזומי ו-dsDNA של M. tuberculosis. בנוסף, ל-TLR2 יש תפקיד פעיל בהתחלת תגובות חיסוניות כאשר הוא פועל בשילוב עם TLR1 ו-TLR6, TLR4 ו-TLR9 6,7. NOD2 ו-NLRP3 הם ה-NLRs הציטופלזמיים המאופיינים ביותר בשחפת. למרות שהליגנדים הספציפיים שלהם עדיין במחקר, קולטנים אלה מופעלים על ידי מורמיל דיפפטיד או ESAT-6, בהתאמה 7,8. קולטני לקטין מסוג C מעורבים באופן קלאסי באנדוציטוזיס של M. tuberculosis. בעוד ש-Dectin-2 פועל כ-PRR ישיר ל-ManLAM של דופן התא של M. tuberculosis, ליגנד Dectin-1 עדיין לא התגלה8. מינקל ו-MCL שניהם מזהים את הגליקוליפיד טרהלוז-6,6′-דימיקולט (TDM), הנקרא גם פקטור חבל הטבור7. DCAR מקיים אינטראקציה עם הגליקוליפידים המיקובקטריאליים פוספטידיל-מיו-אינוזיטול מנוזידים (PIMs)7. CR3 מזהה LAM ו-PIM, DC-SIGN קושר את ManLAM, MR מזהה מספר מרכיבי M. tuberculosis, כולל ManLAM, PIM, LM, גליקופרוטאין 38-kDa, אנטיגן 19-kDa וחלבונים מנוסיליים אחרים בעוד שליגנד DCIR עדיין לא מזוהה.
CLRs מסיסים כוללים SP-A, המזהה ManLam, LM, גליקופרוטאין 60-kDa וגליקופרוטאין Apa; SP-D באינטראקציה עם LAM, LM ו-PILAM; ו-MBL, המתמחה בזיהוי ManLAM 6,7. קולטני נבלות הם גם PRRs פגוציטים. ל-SR-A ו-MARCO יש TDM כליגנד שלהם, SR-B1 מזהה ESAT-6, ו-CD36 קושר את ManLAM ו-LM 7,8. בנוסף, Dectin-1, Mincle ו-MARCO יכולים גם להשתלב עם TLR2 או TLR4 כדי להפעיל אותות לאחר זיהוי Pamps של M. tuberculosis 6,7. CD14 הוא קולטן פני השטח שיש לו את היכולת להפנים חיידקים לא אופסוניים ומזהה גם את חלבון הלם החום Chaperonin 60.1. בפרט, CD14 מתפקד כקולטן משותף יחד עם MARCO ו-TLR26. AIM2 הוא קולטן ציטוזולי שיכול לחוש ssDNA כאשר M. tuberculosis בורח מהפאגוזום8. לבסוף, AhR הוא גורם שעתוק המופעל על ידי ליגנד הקושר את גורם האלימות הפיגמנטי נפתוקינון פתיוקול מ-M. tuberculosis6.
רבות מהאינטראקציות שתוארו לעיל הוצגו ולא הוכחו במדויק. אפילו הליגנדים של קולטנים מסוימים נותרו לא ידועים, מה שמחזק את הצורך להבין טוב יותר את תחום הזיהוי החיסוני של M. tuberculosis. בהקשר זה, המולקולה הקוסטימולטורית SLAMF1 (מולקולת הפעלה לימפוציטית איתות) תוארה לאחרונה כקולטן M. tuberculosis על ידי Barbero et al.10. בכך שהוא פועל לא רק כמולקולת איתות אלא גם כחיישן שחפת, ל-SLAMF1 יש תפקיד מסקרן במיוחד בשחפת. SLAMF1 יכול לגרום להפעלה של תאי חיסון על ידי ויסות פונקציות הגנה כגון ייצור IFN-γ על ידי תאי T באמצעות זרחון Erk/CREB 11,12,13, אוטופגיה בנויטרופילים 14 ופינוי חיידקים במקרופאגים15.
אינטראקציות קולטנים-ליגנדים נחקרו לאורך השנים באמצעות טכניקות כגון ELISA, תהודה פלזמון פני השטח (SPR), קלורימטריית טיטרציה איזותרמית (ITC), קיטוב פלואורסצנטי (FP), קריסטלוגרפיה של קרני רנטגן, ספקטרוסקופיה של תהודה מגנטית גרעינית (NMR), תרמופורזיס בקנה מידה מיקרו (MST), העברת אנרגיית תהודה (למשל, BRET או FRET), מיקרוסקופיה קונפוקלית, מיקרוסקופיה אלקטרונית, מיקרוסקופ אלקטרונים קריו-אלקטרונים (Cryo-EM) ומיקרוסקופ כוח אטומי (AFM)16,17, 18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28. חלק מהגישות הללו מרמזות על שימוש בגנים מדווחים, חלבונים רקומביננטיים מסומנים או מולקולות כימריות, מודלים של נוק-אאוט, נוקדאון או ביטוי יתר. לחלופין, כלים חישוביים יכולים לחזות אינטראקציות קולטן-ליגנד ואתרי קשירה ומשמשים לעתים קרובות בשילוב עם גישות ביולוגיות כדי להשיג הבנה מקיפה של האינטראקציות 29,30,31. כאן מתוארות שתי חלופות לזיהוי אינטראקציה ביוכימית וגם סעיף על איך לתייג חיידקים פלואורסצנטיים. מוצג פרוטוקול המאפשר לחקור אינטראקציות קולטן-פתוגן במבחנה, במיוחד הערכת מעורבות השחפת SLAMF1-M. באמצעות ציטומטריית זרימה ומיקרוסקופיה פלואורסצנטית, שתי טכניקות זמינות בדרך כלל ונמצאות בשימוש שגרתי.
כל ההליכים הכוללים מקרופאגים שמקורם במונוציטים אנושיים בוצעו בהתאם להצהרת הלסינקי (2013) ובהסכמה עם ועדת האתיקה של UNNOBA (COENOBA). הסכמה מדעת בכתב הושגה לפני איסוף הדגימה. התפלגות קבוצת הזכר/נקבה הייתה 13/6, והגיל החציוני היה 32 שנים, עם טווח בין-רבעוני (IQR) של 18-75 שנים. נוכחות של פתולוגיות קודמות, מחלות נלוות או אבחנה חיובית לשחפת הוגדרו כקריטריונים לאי-הכללה. פרטי הריאגנטים והציוד מפורטים בטבלת החומרים.
1. תרבית וגירוי מקרופאגים שמקורם במונוציטים
2. הכנת תמצית חלבון תאים כוללת
3. אינטראקציה של M. tuberculosis -SLAMF1 על ידי ציטומטריית זרימה
4. תיוג אנטיגנים של M. tuberculosis
5. אינטראקציה של M. tuberculosis -SLAMF1 על ידי מיקרוסקופ פלואורסצנטי
בעבודה הזו מסופק פרוטוקול שמאפשר להעריך את האינטראקציה של M. tuberculosis עם הקולטן החיסוני SLAMF1 במקרופאגים אנושיים (איור 1). לשם כך הושג דם היקפי מתורמים בריאים. לאחר מכן, PBMCs הופרדו על ידי צנטריפוגה על פני מדיית שיפוע הצפיפות, והמונוציטים בודדו על ידי ברירה ...
מחקר זה מספק מדריך שימושי לחקר האינטראקציה הביוכימית בין M. tuberculosis וחיישנים מיקרוביאליים המתבטאים במקרופאגים אנושיים, סוג תא מפתח המעורב בתגובת המארח במהלך שחפת. הפרוטוקולים שיסופקו יהיו רלוונטיים לפענוח מולקולות הממלאות תפקיד בכניסת M. tuberculosis לפגוציטים.
המחברים מצהירים שאין ניגודי אינטרסים.
עבודה זו נתמכה על ידי האוניברסיטה הלאומית של נורואסטה דה לה פרובינציה של בואנוס איירס (מספרי מענק SIB 0618/2019, SIB 2582/2012 לסמנכ"ל), Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCyT, מספרי מענק PICT-2012-2459 ו-PICT A 2017-1896 לסמנכ"ל ו-PICT-2021-I-INVI-00584 ל-A.B.); קרן פלורנסיו פיוריני; ו-Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET, מספר מענק PIO 15720150100010CO ל-V.P.). אנו מודים לנטליה מניטה ולגסטון וילאפאנה על התמיכה הטכנית. אנו מודים לד"ר פאולה בארינואבו ולד"ר לוסיאנה בלבואה על הדיון המדעי במהלך הפרסום שהוליד את פיתוח המבחנים שהוצגו בעבודה זו. לבסוף אנו מודים לד"ר אסטרמן על עצתו לגבי פרוטוקולי קישור צולב, ליק. מורוני על עצתו בעבודה עם פולי-ליזין וליק. מוריקוני על עזרתו במספרים סכמטיים.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Alexa Fluor 488 secondary antibody | Invitrogen | A21121 | For fluorescence microscopy |
anti-SLAMF1 FITC antibody | eBioscience | 11-1509-42 | For flow cytometry |
anti-SLAMF1 PE antibody | BioLegend | 306308 | For flow cytometry |
anti-SLAMF1 primary antibody | BioLegend | 306302 | For fluorescence microscopy |
Aqua-Poly/Mount | Polysciences | 18606-20 | Mounting media |
CD14 MicroBeads | Miltenyi Biotec | 130-097-052 | For monocytes isolation |
Coverslips 12mm | HDA | - | For interaction assay by microscopy |
EGS | ThermoFisher Scientific | 21565 | For crosslinking treatment |
FACSCanto II | BD Biosciences | 338960 | Flow cytometer with BD FACSDiva software |
Fetal Bovine Serum | Natocor | - | Inactivated and irradiated, for macrophages culture |
Ficoll-Paque PLUS | Cytiva | 17144003 | For PBMCs separation |
Fiji/ImageJ | Open Source software | - | For micrographs analysis |
FlowJo 7.6.2 | Tree Star | - | For flow cytometry analysis |
Formaldehyde | Merck | K47740803613 | For crosslinking treatment |
Glass slides | Glass Klass | - | For interaction assay by microscopy |
Glycine | Sigma | G8898 | For crosslinking treatment |
Imager.A2 | Carl Zeiss | 430005-9901-000 | Fluorescence microscope with Colibri 7 illumination module |
iMark | BIO-RAD | 1681130 | Microplate absorbance reader |
L-glutamine | Sigma Aldrich | 49419 | For macrophages culture |
M. tuberculosis, strain H37Rv, gamma-irradiated whole cells | BEI Resources, NIAID, NIH | NR-14819 | For interaction assay |
M. tuberculosis, strain H37Rv, whole cell lysate | BEI Resources, NIAID, NIH | NR-14822 | For macrophages stimulation and interaction assay |
Neofuge 13R | Heal Force | Neofuge 13R | High Speed Refrigerated Centrifuge for protein extraction |
Penicillin/Streptomycin | Gibco | 15140122 | For macrophages culture |
PMSF | ThermoFisher Scientific | 36978 | For proteins isolation |
Poly-D-Lysine | Sigma Aldrich | A-003-M | For coverslips treatment |
Protease Inhibitor Cocktail | Sigma Aldrich | P8340 | For proteins isolation |
Rhodamine B | Sigma Aldrich | 21955 | For M. tuberculosis staining |
RPMI 1640 | Gibco | 11875093 | For macrophages culture |
Sorvall ST 16/16R centrifuge | ThermoFisher Scientific | 75004240 | For PBMCs and monocytes isolation |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved