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Method Article
Diese Studie liefert ein Protokoll zur Bewertung der Interaktion von Mycobacterium tuberculosis mit dem mikrobiellen Sensor SLAMF1. Die Assays wurden an humanen Monozyten-abgeleiteten Makrophagen mittels Durchflusszytometrie und Fluoreszenzmikroskopie durchgeführt. Die beschriebenen Werkzeuge sind relevant für die Untersuchung von Wechselwirkungen zwischen Krankheitserregern und Immunrezeptoren.
Die Bewertung der direkten Interaktion zwischen Krankheitserregern und Immunrezeptoren erfordert in der Regel ausgeklügelte Techniken oder impliziert den Einsatz von transgenen Stämmen und gentechnisch veränderten Zellen. Hier wird eine alternative Methode zum Nachweis der biochemischen Interaktion zwischen dem mikrobiellen Makrophagensensor SLAMF1 und Mycobacterium tuberculosis beschrieben. Es wurden zwei technische Ansätze entwickelt, die Durchflusszytometrie und Fluoreszenzmikroskopie. Es wurden Gesamtzellproteinextrakte aus menschlichen Makrophagen erzeugt, dann über Nacht bei 4 °C mit ganzen Zellen von M. tuberculosis (WCMtb) oder M. tuberculosis Antigenen (Mtb Ags) inkubiert und schließlich mittels Formaldehyd/Glycin/Ethylenglykol-Bis-Behandlung (Succinimidylsuccinat) vernetzt. Eine SLAMF1-Wechselwirkung mit WCMtb wurde mittels Durchflusszytometrie mit einem PE-spezifischen Anti-SLAMF1-Antikörper nachgewiesen. Das Vorhandensein einer Wechselwirkung durch Fluoreszenzmikroskopie wurde durch Anhängen von Rhodamin-PE-gefärbten Mtb-Ags an Poly-D-Lysin-beschichtete Objektträger durchgeführt, die mit dem Gesamtproteinextrakt aus Monozyten-abgeleiteten Makrophagen inkubiert wurden. Nach der Vernetzungsbehandlung wurde SLAMF1 mit primären (anti-SLAMF1) und sekundären (Alexa Fluor 488) Antikörpern sichtbar gemacht. Die Assays stellten ein starkes biochemisches Werkzeug zur Messung von Erreger-Immunrezeptor-Interaktionen dar und überwanden die Schwierigkeiten, die mit transgenen Zelllinien und Experimenten zur Modulation der Proteingenexpression verbunden sind.
Mycobacterium tuberculosis, der vor 142 Jahren identifizierte Tuberkulose-Erreger, ist nach wie vor eine globale Herausforderung und infiziert derzeit mindestens ein Viertel der Weltbevölkerung1. M. tuberculosis wird durch Tröpfchen in der Luft von infizierten Personen übertragen und gelangt in die Alveolarmakrophagen in der Lunge, wo es über lange Zeiträume in einem latenten Zustand überleben kann 2,3. Nicht nur wird die lokale makrophagische Reaktion aktiviert, sondern in den letzten Jahren wurde beschrieben, dass periphere Monozyten in die Atemwege rekrutiert werden und sich zu Alveolarmakrophagen differenzieren können, was eine noch robustere Reaktion gegen M. tuberculosis hervorruft als ihr Gegenstück fetalen Ursprungs 2,4.
Makrophagen sind grundlegende Akteure der angeborenen Immunität. Bei der Aufnahme von M. tuberculosis zeigen Makrophagen zahlreiche mikrobizide Funktionen, wie z.B. die Sekretion von proinflammatorischen Zytokinen, die Fusion des Phagolysosoms und die Aktivierung anderer Immunzellen, um M. tuberculosis abzutöten 2,3. Die komplexe architektonische Struktur dieses Erregers stellt jedoch Effektoren (z. B. Proteine und Lipide) zur Verfügung, die in der Lage sind, den Stoffwechsel und die Funktionen der Makrophagen und damit den Entzündungsprozess zu regulieren3. Diese Manipulation der Makrophagenreaktionen durch die Sekretion von Virulenzfaktoren oder die Ausnutzung von Wirtsfaktoren führt zu unterschiedlichen Fluchtstrategien von M. tuberculosis. Zu den wichtigsten Evasionsmechanismen gehören die Induktion von entzündungshemmenden Zytokinen, die Hemmung der Phagolysosomenreifung und -ansäuerung, Veränderungen des oxidativen Stresses, Störungen der Autophagie und Defizite während der Antigenprozessierung und -präsentation 3,5.
Eine streng regulierte Interaktion zwischen Makrophagen und M. tuberculosis ist entscheidend für die Entwicklung einer richtigen Immunantwort. Daher ist die Untersuchung dieser Synapsen der Schlüssel zur Identifizierung immunprotektiver oder immunpathogener Mechanismen, die durch Wirt-Pathogen-Crosstalk induziert werden, sowie zur Identifizierung potenzieller therapeutischer Ziele. Viele Rezeptoren vermitteln die Erkennung und/oder Internalisierung von M. tuberculosis, darunter TLRs 6,7,8, NLRs 7,8, Komplementrezeptoren 6,8, C-Typ-Lektinrezeptoren 6,8 und Scavenger-Rezeptoren 6,8. Immer mehr Daten deuten darauf hin, dass sowohl oberflächengebundene als auch intrazelluläre PRRs eine wichtige Rolle während der Infektion spielen, wobei opsonisierte und nicht-opsonisierte M. tuberculosis erkannt werden können.
Zihad und Sifat et al. haben kürzlich die Beteiligung der PRRs an M. tuberculosis-induzierten Reaktionen angeborener Zellen überprüft9. Insbesondere sind die meisten Mitglieder der TLR-Familie an der Interaktion mit M. tuberculosis-Liganden beteiligt 6,7. Surface TLR2 erkennt mykobakterielle Antigene wie acylierte Lipoproteine, 19-kDa-Lipoproteine, LprA-Lipoproteine, LprG-Lipoproteine, 30-kDa-Antigene, 38-kDa-Antigene, MymA, Prolin-Prolin-Glutaminsäure (PPE)-57, LAM, LM, PIM, Hitzeschockprotein 60, Signaturprotein Rv1509 und das sezernierte Protein ESAT-67. Membran TLR4 interagiert mit Hitzeschockproteinen, 38-kDa-Antigen, RpfE, Rv0652, Rv0335c, Rv2659c, Rv1738, Rv2627c, Rv2628, GrpE und HBHA. Auf der anderen Seite umfassen Liganden für endosomale TLRs (TLR 3, 7, 8 und 9) dsRNA, tRNA, ssRNA, phagosomale RNA und dsDNA von M. tuberculosis. Darüber hinaus spielt TLR2 eine aktive Rolle bei der Initiierung von Immunantworten, wenn es in Verbindung mit TLR1 und TLR6, TLR4 und TLR9wirkt 6,7. NOD2 und NLRP3 sind die am besten charakterisierten zytoplasmatischen NLRs bei Tuberkulose. Obwohl ihre spezifischen Liganden noch untersucht werden, werden diese Rezeptoren durch Muramyldipeptid bzw. ESAT-6 aktiviert 7,8. C-Typ-Lektinrezeptoren sind klassischerweise an der Endozytose von M. tuberculosis beteiligt. Während Dectin-2 als direkter PRR für ManLAM der M. tuberculosis-Zellwand wirkt, wurde der Dectin-1-Ligand bisher nicht entdeckt8. Mincle und MCL erkennen beide das Glykolipid Trehalose-6,6′-dimycolat (TDM), auch Nabelschnurfaktor7 genannt. DCAR interagiert mit den mykobakteriellen Glykolipiden Phosphatidyl-Myo-Inositol-Mannoside (PIMs)7. CR3 erkennt mykobakterielle LAM und PIM, DC-SIGN ligiert ManLAM, MR erkennt eine Reihe von M. tuberculosis-Komponenten, einschließlich ManLAM, PIM, LM, 38-kDa-Glykoprotein, 19-kDa-Antigen und andere mannosylierte Proteine, während der DCIR-Ligand noch nicht identifiziert ist.
Zu den löslichen CLRs gehören SP-A, das ManLam, LM, 60-kDa-Glykoprotein und Glykoprotein Apa erkennt; SP-D interagiert mit LAM, LM und PILAM; und MBL, das sich auf die ManLAM-Erkennungspezialisiert hat 6,7. Scavenger-Rezeptoren sind auch phagozytäre PRRs. SR-A und MARCO haben TDM als Liganden, SR-B1 erkennt ESAT-6 und CD36 bindet ManLAM und LM 7,8. Darüber hinaus können Dectin-1, Mincle und MARCO auch mit TLR2 oder TLR4 kombiniert werden, um Signale nach dem Nachweis von M. tuberculosis PAMPs 6,7 auszulösen. CD14 ist ein Oberflächenrezeptor, der die Fähigkeit hat, nicht-opsonisierte Bakterien zu internalisieren und auch das Hitzeschockprotein Chaperonin 60.1 erkennt. Insbesondere fungiert CD14 zusammen mit MARCO und TLR2 als Co-Rezeptor6. AIM2 ist ein zytosolischer Rezeptor, der ssDNA erkennen kann, wenn M. tuberculosis aus dem Phagosomentweicht 8. Schließlich ist AhR ein ligandenaktivierter Transkriptionsfaktor, der den pigmentierten Virulenzfaktor Naphthochinon Phthiocol von M. tuberculosisbindet 6.
Viele der oben beschriebenen Wechselwirkungen wurden postuliert und nicht streng nachgewiesen. Selbst die Liganden für bestimmte Rezeptoren sind noch unbekannt, was die Notwendigkeit verstärkt, das Gebiet der Immunerkennung von M. tuberculosis besser zu verstehen. In diesem Zusammenhang wurde kürzlich das kostimulatorische Molekül SLAMF1 (Signaling Lymphocytic Activation Molecule) von Barbero et al.10 als M. tuberculosis-Rezeptor beschrieben. Da SLAMF1 nicht nur als Signalmolekül, sondern auch als M. tuberculosis-Sensor fungiert, spielt es eine besonders interessante Rolle bei der Tuberkulose. SLAMF1 kann die Aktivierung von Immunzellen induzieren, indem es Schutzfunktionen wie die Produktion von IFN-γ durch T-Zellen durch Erk/CREB-Phosphorylierung 11,12,13, Autophagie in Neutrophilen14 und bakterielle Clearance in Makrophagen15 moduliert.
Rezeptor-Liganden-Wechselwirkungen wurden im Laufe der Jahre mit Techniken wie ELISA, Oberflächenplasmonenresonanz (SPR), isothermer Titrationskalorimetrie (ITC), Fluoreszenzpolarisation (FP), Röntgenkristallographie, Kernspinresonanzspektroskopie (NMR), mikroskaliger Thermophorese (MST), Resonanzenergietransfer (z. B. BRET oder FRET) konfokaler Mikroskopie, Elektronenmikroskopie, Kryo-Elektronenmikroskopie (Kryo-EM) und Rasterkraftmikroskopie (AFM) untersucht16,17, 18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28. Einige dieser Ansätze implizieren die Verwendung von Reportergenen, markierten rekombinanten Proteinen oder chimären Molekülen, Knockout-, Knockdown- oder Überexpressionsmodellen. Alternativ können computergestützte Werkzeuge Rezeptor-Liganden-Wechselwirkungen und Bindungsstellen vorhersagen und werden häufig in Kombination mit biologischen Ansätzen verwendet, um ein umfassendes Verständnis der Wechselwirkungen zu erlangen 29,30,31. Hier werden zwei Alternativen zum Nachweis biochemischer Wechselwirkungen und auch ein Abschnitt zur fluoreszierenden Markierung von Bakterien beschrieben. Es wird ein Protokoll vorgestellt, das die Untersuchung von Rezeptor-Pathogen-Wechselwirkungen in vitro ermöglicht, insbesondere die Bewertung des SLAMF1-M. tuberculosis-Engagements durch Durchflusszytometrie und Fluoreszenzmikroskopie, zwei üblicherweise verfügbare und routinemäßig verwendete Techniken.
Alle Verfahren mit humanen Monozyten-abgeleiteten Makrophagen wurden in Übereinstimmung mit der Deklaration von Helsinki (2013) und in Übereinstimmung mit der Ethikkommission der UNNOBA (COENOBA) durchgeführt. Vor der Probenentnahme wurde eine schriftliche Einverständniserklärung eingeholt. Die Verteilung der männlichen/weiblichen Gruppe betrug 13/6 und das mediane Alter 32 Jahre, mit einem Interquartilsabstand (IQR) von 18-75 Jahren. Das Vorliegen früherer Pathologien, Komorbiditäten oder eine positive Diagnose für Tuberkulose wurden als Ausschlusskriterien definiert. Die Details zu den Reagenzien und Geräten sind in der Materialtabelle aufgeführt.
1. Aus Monozyten gewonnene Makrophagenkultur und Stimulation
2. Zubereitung des Gesamtzellproteinextrakts
3. M . tuberculosis-SLAMF1-Wechselwirkung durch Durchflusszytometrie
4. Markierung von M. tuberculosis-Antigenen
5. M . tuberculosis-SLAMF1-Interaktion durch Fluoreszenzmikroskopie
In dieser Arbeit wird ein Protokoll zur Verfügung gestellt, das die Bewertung der Interaktion von M. tuberculosis mit dem Immunrezeptor SLAMF1 in humanen Makrophagen ermöglicht (Abbildung 1). Zu diesem Zweck wurde peripheres Blut von gesunden Spendern gewonnen. Anschließend wurden die PBMCs durch Zentrifugation über dem Dichtegradientenmedium getrennt und die Monozyten durch magnetische positive Selektion isoliert (≥95% Reinheit,
Diese Studie bietet einen nützlichen Leitfaden für die Untersuchung der biochemischen Interaktion zwischen M. tuberculosis und mikrobiellen Sensoren, die in menschlichen Makrophagen exprimiert werden, einem Schlüsselzelltyp, der an der Wirtsreaktion während der Tuberkulose beteiligt ist. Die bereitgestellten Protokolle werden relevant sein, um Moleküle zu entschlüsseln, die eine Rolle beim Eintritt von M. tuberculosis in Phagozyten spielen.
Die Autoren erklären, dass keine Interessenkonflikte bestehen.
Diese Arbeit wurde unterstützt von der Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires (Fördernummern SIB 0618/2019, SIB 2582/2012 an V.P.), Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCyT, Förderkennzeichen PICT-2012-2459 und PICT A 2017-1896 an V.P. und PICT-2021-I-INVI-00584 an A.B.); Florencio Fiorini Stiftung; und Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET, Fördernummer PIO 15720150100010CO an V.P.). Wir danken Natalia Menite und Gastón Villafañe für die technische Unterstützung. Wir danken Dr. Paula Barrionuevo und Dr. Luciana Balboa für die wissenschaftliche Diskussion während der Publikation, die zur Entwicklung der in dieser Arbeit vorgestellten Assays geführt hat. Abschließend danken wir Dr. Estermann für seine Ratschläge zu Cross-Linking-Protokollen, Lic. Moroni für seine Ratschläge zur Arbeit mit Poly-Lysin und Lic. Moriconi für seine Hilfe bei der Erstellung schematischer Figuren.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Alexa Fluor 488 secondary antibody | Invitrogen | A21121 | For fluorescence microscopy |
anti-SLAMF1 FITC antibody | eBioscience | 11-1509-42 | For flow cytometry |
anti-SLAMF1 PE antibody | BioLegend | 306308 | For flow cytometry |
anti-SLAMF1 primary antibody | BioLegend | 306302 | For fluorescence microscopy |
Aqua-Poly/Mount | Polysciences | 18606-20 | Mounting media |
CD14 MicroBeads | Miltenyi Biotec | 130-097-052 | For monocytes isolation |
Coverslips 12mm | HDA | - | For interaction assay by microscopy |
EGS | ThermoFisher Scientific | 21565 | For crosslinking treatment |
FACSCanto II | BD Biosciences | 338960 | Flow cytometer with BD FACSDiva software |
Fetal Bovine Serum | Natocor | - | Inactivated and irradiated, for macrophages culture |
Ficoll-Paque PLUS | Cytiva | 17144003 | For PBMCs separation |
Fiji/ImageJ | Open Source software | - | For micrographs analysis |
FlowJo 7.6.2 | Tree Star | - | For flow cytometry analysis |
Formaldehyde | Merck | K47740803613 | For crosslinking treatment |
Glass slides | Glass Klass | - | For interaction assay by microscopy |
Glycine | Sigma | G8898 | For crosslinking treatment |
Imager.A2 | Carl Zeiss | 430005-9901-000 | Fluorescence microscope with Colibri 7 illumination module |
iMark | BIO-RAD | 1681130 | Microplate absorbance reader |
L-glutamine | Sigma Aldrich | 49419 | For macrophages culture |
M. tuberculosis, strain H37Rv, gamma-irradiated whole cells | BEI Resources, NIAID, NIH | NR-14819 | For interaction assay |
M. tuberculosis, strain H37Rv, whole cell lysate | BEI Resources, NIAID, NIH | NR-14822 | For macrophages stimulation and interaction assay |
Neofuge 13R | Heal Force | Neofuge 13R | High Speed Refrigerated Centrifuge for protein extraction |
Penicillin/Streptomycin | Gibco | 15140122 | For macrophages culture |
PMSF | ThermoFisher Scientific | 36978 | For proteins isolation |
Poly-D-Lysine | Sigma Aldrich | A-003-M | For coverslips treatment |
Protease Inhibitor Cocktail | Sigma Aldrich | P8340 | For proteins isolation |
Rhodamine B | Sigma Aldrich | 21955 | For M. tuberculosis staining |
RPMI 1640 | Gibco | 11875093 | For macrophages culture |
Sorvall ST 16/16R centrifuge | ThermoFisher Scientific | 75004240 | For PBMCs and monocytes isolation |
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