1 200 אצות באמצעות מתודולוגיה של Culturable

Overview

מקור: מעבדות של ד"ר איאן פפר וד"ר צ'ארלס גרבה - אוניברסיטת אריזונה
מחבר מפגין: בראדלי שמיץ

אצות הן קבוצה הטרוגנית מאוד של מיקרואורגניזמים שיש להם תכונה משותפת אחת, כלומר החזקת פיגמנטים פוטוסינתזה. בסביבה, אצות יכולות לגרום לבעיות לבעלי בריכות השחייה על ידי גידול במים. אצות יכולות גם לגרום לבעיות במים על פני השטח, כגון אגמים ומאגרים, בשל פריחת אצות המשחררות רעלים. לאחרונה, אצות מוערכים כמקורות אנרגיה חדשניים באמצעות דלקים ביולוגיים אצות. אצות כחולות-ירוקות הן למעשה חיידקים המסווגים כציאנובקטריה. Cyanobacteria לא רק פוטוסינתזה, אלא גם יש את היכולת לתקן גז חנקן מהאטמוספירה. אצות אחרות הן אאוקריוטיות, החל מאורגניזמים חד-תאיים ועד אורגניזמים רב-תאיים מורכבים, כמו אצות. אלה כוללים את האצות הירוקות, האוגלנואידים, הדינופלגלטים, האצות החומות הזהובות, הצורניות, האצות החומות והאצות האדומות. בקרקעות, אוכלוסיות אצות הן לעתים קרובות 106 לגרם. מספרים אלה נמוכים מהמספרים המתאימים לחיידקים, אקטינומיצטים ופטריות, בעיקר משום שאור השמש הנדרש לפוטוסינתזה אינו יכול לחדור הרחק מתחת לפני הקרקע.

מכיוון שאצות הן פוטוטרופיות, מקבלות אנרגיה מפוטוסינתזה ופחמן לביומסה מפחמן דו חמצני, ניתן לגדלן במדיה של צמיחה המורכבת כולה מחומרים מזינים אנאורגניים וללא מצע פחמן אורגני. היעדר מצע אורגני מונע את צמיחת החיידקים ההטרוטרופיים. באמצעות מדיום צמיחה אנאורגני, אצות במקור נוכחים בקרקע או במים יכול להיות כמות על ידי שיטת המספר סביר ביותר (MPN). שיטת MPN מסתמכת על דילול דוגמה ברציפות, כך שהאצות עצמן מדוללות להכחדה. נוכחות של אצות בכל דילול נקבעת על ידי סימן חיובי של צמיחה במדיום, שהוא בדרך כלל רפש ירוק של אצות הנובעות פוטוסינתזה. שימוש בצינורות שכפול בכל דילול והערכה סטטיסטית של מספר הצינורות החיוביים לצמיחה בכל דילול נתון מאפשר לחשב את מספר האצות הקיימות במדגם המקורי. טבלאות MPN פותחו ופורסמו ספציפית לעיצוב MPN מסוים, כולל מספר המשכפלים המשמשים בכל דילול.

Procedure
  1. לשקול מדגם 10 גרם של אדמה כי נאסף לח מהשדה, או היו מים הוסיף אליו, כך שהוא נשאר לח במשך 2-3 ימים. שים לב כי האדמה צריכה להיות לחה אך לא רוויה.
  2. הכן סדרת דילול פי 10 על-ידי הוספת 10 גרם אדמה ל-95 מ"ל של הפתרון של בריסטול שונה(איור 1). כדי ליצור פתרון בריסטול שונה, להמיס את הדברים הבאים ב 1,000 מ"ל של מים: 0.25 גרם NaNO3, 0.025 גרם CaCl2, 0.075 גרם MgSO-4 · 7H2O, 0.075 גרם K2HPO4,0.018 גרם KH2PO4, 0.025 גרם NaCl, ו

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

איור 2 הוא דוגמה לתוצאות מייצגות.

עמ'1 נבחר להיות מספר הצינורות המשוכפלים של הדילול הגבוה ביותר (הכי פחות מרוכז באדמה) שיש לו את המספר הגבוה ביותר של צינורות חיוביים. כאן, המשכפלים מצינור B אינם נחשבים, כי אלה של Tube C הם מדילול גבוה יותר. לעומת זאת, מספר ה...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

מתודולוגיית MPN שימושית, מכיוון שהיא מאפשרת הערכה של אוכלוסייה פונקציונלית בהתבסס על ייחוס הקשור לתהליך. בדוגמה, התהליך הפונקציונלי היה פוטוסינתזה שבוצעה על ידי אצות, אשר אפשר צמיחה בהיעדר פחמן אורגני. זה איפשר למנות אוכלוסיות אצות מוחלטות בקרקע.

MPN משמש גם להערכת מספר סוג מ?...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Tags
Algae EnumerationCulturable MethodologyPhotosynthetic OrganismsLaboratory CultureConcentration CalculationPhotosynthetic PigmentsAlgal BloomsSurface WatersAlgal OvergrowthEcosystem HealthRisk AssessmentSoil Algae PopulationSunlight RequirementSoil Surface PenetrationAlgae Culturing From SoilAlgae Concentration EnumerationBeneficial Effects Of Algae

Skip to...

0:00

Overview

1:41

Principles of Culturing and Enumerating Algae

4:03

Culturing and Enumerating Algae from Soil

5:34

Representative Results

7:11

Applications

9:02

Summary

Videos from this collection:

article

Now Playing

1 200 אצות באמצעות מתודולוגיה של Culturable

Environmental Microbiology

13.6K Views

article

קביעת תכולת הלחות בקרקע

Environmental Microbiology

357.3K Views

article

טכניקה אספטית במדעי הסביבה

Environmental Microbiology

125.3K Views

article

כתמי גרם של חיידקים ממקורות סביבתיים

Environmental Microbiology

98.2K Views

article

הדמיית מיקרואורגניזמים קרקע באמצעות מצג שקופיות מגע ומיקרוסקופיה

Environmental Microbiology

41.8K Views

article

פטריות נלאמנטיות

Environmental Microbiology

55.5K Views

article

הפקת דנ"א קהילתי ממושבות חיידקים

Environmental Microbiology

28.6K Views

article

זיהוי מיקרואורגניזמים סביבתיים עם תגובת שרשרת פולימראז ואלקטרופורזה ג'ל

Environmental Microbiology

44.1K Views

article

ניתוח RNA של דגימות סביבתיות באמצעות RT-PCR

Environmental Microbiology

40.1K Views

article

כימות מיקרואורגניזמים סביבתיים ווירוסים באמצעות qPCR

Environmental Microbiology

47.6K Views

article

ניתוח איכות מים באמצעות אורגניזמים מחוון

Environmental Microbiology

29.2K Views

article

בידוד חיידקים צואתיים מדגימות מים על ידי סינון

Environmental Microbiology

39.0K Views

article

זיהוי בקטריופאג'ים בדגימות סביבתיות

Environmental Microbiology

40.4K Views

article

פולחן ופירום חיידקים מדגימות קרקע

Environmental Microbiology

182.6K Views

article

ניתוח עקומת גדילה חיידקית והיישומים הסביבתיים שלה

Environmental Microbiology

294.6K Views

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved