Sign In

זיהוי בקטריופאג'ים בדגימות סביבתיות

Overview

מקור: מעבדות של ד"ר איאן פפר וד"ר צ'ארלס גרבה - אוניברסיטת אריזונה
מפגין מחבר: אלכס ווסימי

וירוסים הם קבוצה ייחודית של ישויות ביולוגיות המדביקות הן אורגניזמים אאוקריוטים והן אורגניזמים פרוקריוטים. הם טפילים מחייבים שאין להם יכולת מטבולית, וכדי לשכפל, להסתמך על חילוף החומרים המארח לייצר חלקים ויראליים כי הרכבה עצמית בתוך תאים מארחים.

וירוסים הם אולטרה מיקרוסקופיים – קטנים מכדי שניתן לצפותם במיקרוסקופ האור, הנראים רק ברזולוציה גדולה יותר של מיקרוסקופ האלקטרונים. חלקיק נגיפי מורכב מגנום חומצת גרעין, DNA או RNA, מוקף במעיל חלבון, המכונה קבסיד, המורכב מתת-units חלבון או קאפסומרים. בכמה וירוסים מורכבים יותר, capsid מוקף במעטפה שומנים נוספת, וחלקם יש נספחי משטח דמוי ספייק או זנבות.

וירוסים המדביקים את מערכת העיכול של בני אדם ובעלי חיים ידועים בשם וירוסים אנטריים. הם מופרשים בצואה וניתן לבודד אותם ממי שפכים מקומיים. וירוסים שמדביקים חיידקים ידועים בשם בקטריופאג'ים, ואלה שמדביקים חיידקים קוליפורמיים נקראיםקוליפג'ים (איור 1). הפאג'ים של חיידקי קוליפורם נמצאים בכל מקום בו נמצאים חיידקי קוליפורם.

Figure 1
איור 1. קוליפייג' טי-2.

Procedure
  1. להשיג מדגם של ביוב או מים המכילים קוליפייג '.
  2. לדלל את המדגם 1: 10 ו 1: 100 באמצעות מאגר טריס. עשה זאת על-ידי העברת 1.0 מ"ל של תרבות ל- 9 מ"ל של חיץ טריס, ולאחר מכן ביצוע דילול כפול שני.
  3. ממיסים שלושה צינורות של אגר רך (0.7% אגר או אגר סויה טריפטיאז לכל צינור 3 מ"ל) על ידי הצבתם באמבט אדים או אוטוקלבה.
  4. מניחים את אגר באמבט מים ב 45-48 °C (55 °F) במשך 15 דקות כדי לאפשר את הטמפרטורה של אגר כדי להתאים ל 45 °C (5 °F).
  5. לצינור הראשון, להוסיף 1 מ"ל של תרבות מרק שלב בול עץ של E. coli1 ו 1

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

דילול דגימת ביוב = 10-1

מספר הלוחות שהושגו = 9

לכן, ריכוז פאג' בדגימת ביוב
= 10 x 9 ÷ 1 מ"ל
= 90 יחידות יוצרות פלאק / מ"ל

ביוב גולמי מכיל בדרך כלל 103 - 104 קוליפייג ' למ"ל, עם טווח של 102 – 108 למ"ל.

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

ישנם יישומים פוטנציאליים רבים של coliphages כאינדיקטורים סביבתיים. אלה כוללים את השימוש בהם כאינדיקטורים לזיהום ביוב, יעילות הטיפול במים ושפכים, והישרדות של וירוסים וחיידקים אנטריים בסביבה. השימוש בבקטריופאג'ים כאינדיקטורים לנוכחותם והתנהגותם של חיידקים אנטריים ווירוסים מן החי תמיד היה אטר...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Tags
DetectionBacteriophagesEnvironmental SamplesVirusesDiseasesColdFluHepatitisHIVDNARNA GenomeProtein CoatCapsidLipid EnvelopeMetabolic AbilityReproductive AbilityInvade Living CellsHijack Cellular MachineryProkaryotic CellsEukaryotic CellsBacteriaHumansSpecific Classes Of VirusesBacteriophagesColiphagesE ColiFood PoisoningFecal ContaminationWater SupplyPathogenic In HumansSurrogate IndicatorsEnterovirusesFecally transmitted DiseasesAssay MethodsPhage EnumerationPlaque Assay

Skip to...

0:00

Overview

1:52

Principles of Phage Enumeration

4:03

Performing a Phage Plaque Assay with Environmental Samples

6:09

Representative Results

6:37

Applications

8:44

Summary

Videos from this collection:

article

Now Playing

זיהוי בקטריופאג'ים בדגימות סביבתיות

Environmental Microbiology

40.6K Views

article

קביעת תכולת הלחות בקרקע

Environmental Microbiology

358.7K Views

article

טכניקה אספטית במדעי הסביבה

Environmental Microbiology

126.1K Views

article

כתמי גרם של חיידקים ממקורות סביבתיים

Environmental Microbiology

99.8K Views

article

הדמיית מיקרואורגניזמים קרקע באמצעות מצג שקופיות מגע ומיקרוסקופיה

Environmental Microbiology

42.1K Views

article

פטריות נלאמנטיות

Environmental Microbiology

57.1K Views

article

הפקת דנ"א קהילתי ממושבות חיידקים

Environmental Microbiology

28.8K Views

article

זיהוי מיקרואורגניזמים סביבתיים עם תגובת שרשרת פולימראז ואלקטרופורזה ג'ל

Environmental Microbiology

44.5K Views

article

ניתוח RNA של דגימות סביבתיות באמצעות RT-PCR

Environmental Microbiology

40.3K Views

article

כימות מיקרואורגניזמים סביבתיים ווירוסים באמצעות qPCR

Environmental Microbiology

47.7K Views

article

ניתוח איכות מים באמצעות אורגניזמים מחוון

Environmental Microbiology

29.4K Views

article

בידוד חיידקים צואתיים מדגימות מים על ידי סינון

Environmental Microbiology

39.2K Views

article

פולחן ופירום חיידקים מדגימות קרקע

Environmental Microbiology

183.6K Views

article

ניתוח עקומת גדילה חיידקית והיישומים הסביבתיים שלה

Environmental Microbiology

295.5K Views

article

1 200 אצות באמצעות מתודולוגיה של Culturable

Environmental Microbiology

13.7K Views

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved