לתמיכה כספית אנו בתודה להכיר EPSRC (Fellowship קריירה ההאצה לדקירה; EP/J001538/1), רמזי זיכרון הנאמנות (מחקר אחוות 2009-2011 לדקירה), ואימפריאל קולג&#39; בלונדון. תודה לפרופ &#39;אלן ארמסטרונג לתמיכה וייעוץ נדיבים.

1. הכנת Iodoaziridines עם Diiodomethyllithium <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להבה לייבש בקבוק עגול תחתון 100 מיליליטר המכיל בר בוחש ומצויד במחץ, תחת זרם של ארגון, ולאחר מכן להתקרר לטמפרטורת חדר תחת אווירת ארגון. הערה: כלי זכוכית מיובשות בלילה בתנור (125 ° C) ומקוררות לטמפרטורת חדר באופן מקביל היא גם מתאימה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לבקבוק, להוסיף THF נטול מים 5.7 מיליליטר וEt נטול מים 2.7 מיליליטר 2 O באמצעות מזרק, וhexamethyldisilazane טרי מזוקק (1.50 מילימול, μl 315) באמצעות microsyringe. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מערבבים את הפתרון ומגניב וכתוצאה מכך ל-78 מעלות צלזיוס באמבט הקרח / אצטון יבש בדיואר גודל מתאים כדי לאפשר את הבקבוק כדי להיות שקוע היטב. כסה דיואר ברדיד אלומיניום, כדי לצמצם את החשיפה של כלי התגובה לאור. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוספת n BuLi (1.50 מילימול, 0.60 מיליליטר, 2.5 M בhexanes) dropwise באמצעות מזרק מעל 2-3 דקות לפתרון ב-78 ° C.אפשר התערובת לבחוש ב-78 מעלות צלזיוס במשך 30 דקות נוספות כדי ליצור פתרון 0.17 M של LiHMDS. זהירות: פתרון n BuLi הוא דליק, מאכל לעור וpyrophoric. מגיב עודף במזרק צריך להיות הרווה בהתאם. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר 30 דקות, להוסיף 1 מיליליטר THF נטול מים בבקבוק 10 מיליליטר עגול מיובש להבה תחתונה באמצעות מזרק, ואחריו diiodomethane (1.70 מילימול, μl 135) באמצעות microsyringe ולוודא שהם גם מעורבים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף את dropwise פתרון diiodomethane מעל 2 דקות לפתרון hexamethyldisilazane ליתיום ב-78 ° C. השאר את הפתרון הזה עבור 20 דקות ב-78 ° C. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> במהלך תקופה זו, לשקול את N - [(E)-4-methylphenylmethylidene]-4-methylbenzenesulfonamide (137 מ&quot;ג, 0.50 מילימול) לתוך מיובש להבת 10 מיליליטר עוד סיבוב בקבוק תחתון ולהתמוסס ב2.0 מיליליטר THF נטול מים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר זמן deprotonation 20 דקות, מוסיף את dropwise פתרון imine לפתרון diiodomethyllithium מעל 5 דקות ב-78 &amp; #176; ג </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מייד לאחר תוספת dropwise היא מוחלטת, להרים את כלי התגובה מחוץ לאמבט הקרח היבש, ולהעביר לאמבט קרח / מים ב 0 ° C. Re-לכסות עם נייר אלומיניום ולהשאיר למשך 15 דקות ב 0 ° C. הערה: הפתרון צריך להיות בצבע כתום. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר 15 דקות ב 0 מעלות צלזיוס, להרוות את התגובה על ידי התוספת של 30 מיליליטר תמיסת סודיום ביקרבונט מימיים רווי. מעביר את התערובת למשפך מפריד ולהוסיף 30 מיליליטר CH 2 Cl 2. לנער את התערובת ולהסיר את שכבת 2 CH 2 Cl נמוך יותר. חזור על תהליך החילוץ הזה שתי פעמים נוספות, ולשלב את 2 שכבות CH 2 Cl. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להוסיף נתרן גופרתי לשכבות אורגניות כדי להסיר כל מים נוכחי בפתרון, ואז לסנן את נתרן גופרתי ולאסוף את התסנין ב250 מיליליטר סיבוב הבקבוק תחתון. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את הממס תחת לחץ מופחת על מאייד סיבובי להרשות לעצמו מדגם טמא של מוצר iodoaziridine הרצוי. </li></ol> 2. הערכה של מוצרי יציבות לשלבים נייחים עבור כרומטוגרפיה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ממיסים את מדגם aziridine הגולמי בCH 2 Cl 2 (16 מיליליטר) ולהוסיף 1,3,5-trimethoxybenzene (מ&quot;ג 28.0, 0.167 מילימול) כסטנדרט פנימי, הבטחה זו נמס לגמרי. קח aliquot (2 מיליליטר) מתערובת זו, הסר את הממס תחת לחץ מופחת ולנתח מדגם זה על ידי ספקטרוסקופית NMR H 1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פתח את ספקטרום NMR H 1 נרשם באמצעות תוכנת עיבוד NMR סטנדרטית. בMestrenova, לחץ לחיצה ימנית על הספקטרום ובחר &quot;אינטגרציה&quot;, ואז &quot;ידני&quot; כדי לספק את כלי האינטגרציה. לחץ וגרור כדי לכסות את הרוחב של הפסגות ב6.08 עמודים לדקה וב4.87 עמודים לדקה לשלב את האותות של התקן הפנימי ואות CHI aziridine בהתאמה. לחץ לחיצה ימנית על נפרד לשיא ב6.08 עמודים לדקה, בחר באפשרות &quot;עריכה נפרד&quot; ושנה את הערך &quot;המנורמל&quot; ל3.0. איןTE: ניתן ליישם צעדים דומים עם חבילות תוכנה אחרות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש בערך המעודכן של נפרד לאות CHI aziridine (4.87 עמודים לדקה) כדי לקבוע את התשואה של iodoaziridine, כאן על ידי שימוש × (100/3) (נפרד מאות CHI), אשר מעניקה תשואה מחושבת של 59%. הערה: בהתחשב בכמות הידועה של תקן פנימי (0.167 מילימול), ושיא המוצר המתאים לפרוטון 1, התשואה של iodoaziridine מחושבת על ידי המשוואה הבאה: 100 × × (נפרד משיא המוצר) (שומות לסטנדרטים פנימיים) / שומות חומר מוצאות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן slurries של השלבים הבאים נייחים (25 ז): סיליקה, סיליקה + 1% נטו, 3 (triethylamine), אלומינה הניטרלית, אלומינה הבסיסית (אני פעילות), אלומינה הבסיסית (IV פעילות) וFlorisil, כל אחד ב5% EtOAc / הקסאן (50 מיליליטר), בשש צלוחיות חרוטי 250 מיליליטר נפרדים המכילות ברים בוחש. בעוד בקבוק חרוטי להכין 5% EtOAc פתרון / הקסאן (50 מיליליטר), כדי לשמש כניסוי בקרה. זהירות: silicג &#39;ל, אלומינה ושלבים נייחים אחרים מועסקים הם מסוכנים אם בשאיפה, ולכן תמיד צריך להיות מטופלים במנדף יעיל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 2 מיליליטר aliquots של iodoaziridine / הפתרון הסטנדרטי הפנימי לכל אחת מצלוחיות חרוטי ב RT. מערבבים את תערובות התרחיף ל30 דקות. הערה: זה מייצג את משך המתחם עלול להיות חשוף לשלב נייח במהלך הליך כרומטוגרפיה פלאש טור רגיל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> סנן את תערובות slurry באמצעות משפך sintered, ולאסוף את התסנין ב250 מיליליטר סיבוב הבקבוק תחתון. שטוף את השאריות על משפך sintered עם CH 2 Cl 2 (2 × 30 מיליליטר). חזור על תהליך סינון זה לslurries הנותר. הערה: מן ראוי לקזז את תחילתו של כל שלב נייח כדי לאפשר זמן לסינון וכך לשמור על אותו הזמן לכל אחד מחומרי השלב נייחים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את הממס מהדגימות תחת לחץ מופחת וכתוצאה מכך, ולנתח על ידי 1 ספקטרו H NMRscopy כדי לחשב את כמות iodoaziridine התאושש בכל מקרה, כפי שתואר בסעיף 2.2. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להשוות את התשואות של iodoaziridine המתקבלות מכל שלב נייח נבדק עם זה שהושג בסעיף 2.1. הערה: המדגם נותן את התשואה הגבוהה ביותר, באופן אידיאלי כמו ב2.1, מציין את השלב נייח האופטימלי לכרומטוגרפיה. בדוגמא זו, אלומינה הבסיסית (IV פעילות) נחשבה השלב נייח הטוב ביותר לטיהור. </li></ol> 3. שחרור משרות של יסוד אלומינה וטיהור של Iodoaziridine <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חזור על סעיף 1 כדי ליצור את תערובת iodoaziridine הגולמי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי ליצור אלומינה הבסיסית (IV פעילות), להוסיף של אלומינה הבסיסית (אני פעילות) 100 גרם ל500 מיליליטר סיבוב בקבוק תחתון ולאחר מכן להוסיף 10 מיליליטר מים לבקבוק ולהשתלב עם פקק זכוכית. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לנער את הבקבוק במרץ עד אין גושים גלויים, המצביעים גם הפצה של מים לאורך כל אלומינה. לאפשר אלומינה להתקרר RT. זהירות: adsorption של מים הוא אקסותרמית, אז את הבקבוק עשוי לקבל חם ועלול לגרום להצטברות של לחץ. לשחרר את כל לחץ לבנות בתדירות גבוהה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לטהר את iodoaziridine הגולמי על ידי כרומטוגרפיה עמודה באמצעות אלומינה הבסיסית (IV פעילות) כשלב נייח, משחררי עם הקסאן, ואת הדירוג ל -5% EtOAc / הקסאן. הערה: אין להשתמש בריכוזים גבוהים של EtOAc עם אלומינה הבסיסית. במקרים אלה, diethyl אתר ניתן להשתמש במקום. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשלב את המוצר המכיל שברים ולהסיר הממס תחת לחץ מופחת להשיג iodoaziridine הטהור. </li></ol>

<ol>
	<li>Sweeney, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aziridines:+epoxides'+ugly+cousins.">Aziridines: epoxides' ugly cousins.</a> Chem. Soc. Rev. 31 (5), 247-258 (2002).</li><li>Lu, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recent+developments+in+regioselective+ring+opening+of+aziridines.">Recent developments in regioselective ring opening of aziridines.</a> Tetrahedron. 66 (14), 2549-2560 (2010).</li><li>Wu, B., Parquette, J. R., RajanBabu, T. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regiodivergent+ring+opening+of+chiral+aziridines.">Regiodivergent ring opening of chiral aziridines.</a> Science. 326 (5960), (2009).</li><li>Liew, S. K., He, Z., St Denis, J. D., Yudin, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stereocontrolled+synthesis+of+1,2-+and+1,3-diamine+building+blocks+from+aziridine+aldehyde+dimers.">Stereocontrolled synthesis of 1,2- and 1,3-diamine building blocks from aziridine aldehyde dimers.</a> J. Org. Chem. , (2013).</li><li>Stankovi&#263;, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regioselectivity+in+the+ring+opening+of+non-activated+aziridines.">Regioselectivity in the ring opening of non-activated aziridines.</a> Chem. Soc. Rev. 41 (2), 643-665 (2012).</li><li>Cardoso, A. L., Pinho e Melo, T. M. V. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aziridines+in+formal+[3+2]+cycloadditions:+synthesis+of+five-membered+heterocycles.">Aziridines in formal [3+2] cycloadditions: synthesis of five-membered heterocycles.</a> Eur. J. Org. Chem. 2012 (33), 6479-6501 (2012).</li><li>Dauban, P., Malik, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+masked+1,3-dipole+revealed+from+aziridines.">A masked 1,3-dipole revealed from aziridines.</a> Angew. Chem., Int. Ed. 48 (48), 9026-9029 (2009).</li><li>Florio, S., Luisi, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aziridinyl+anions:+generation,+reactivity,+and+use+in+modern+synthetic+chemistry.">Aziridinyl anions: generation, reactivity, and use in modern synthetic chemistry.</a> Chem. Rev. 110 (9), 5128-5157 (2010).</li><li>Vedejs, E., Moss, W. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lithiated+aziridine+reagents.">Lithiated aziridine reagents.</a> J. Am. Chem. Soc. 115 (4), 1607-1608 (1993).</li><li>Satoh, T., Fukuda, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+synthesis+of+enantiomerically+pure+&#945;-+and+&#946;-amino+acid+derivatives+using+aziridinyl+anions.">A new synthesis of enantiomerically pure &#945;- and &#946;-amino acid derivatives using aziridinyl anions.</a> Tetrahedron. 59 (49), 9803-9810 (2003).</li><li>Satoh, T., Matsue, R., Fujii, T., Morikawa, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cross-coupling+of+nonstabilized+aziridinylmagnesiums+with+alkylhalides+catalyzed+by+Cu(I)+iodide:+a+new+synthesis+of+amines+bearing+a+quaternary+chiral+center+and+an+asymmetric+synthesis+of+both+enantiomers+of+the+amines+from+one+chiral+starting+material.">Cross-coupling of nonstabilized aziridinylmagnesiums with alkylhalides catalyzed by Cu(I) iodide: a new synthesis of amines bearing a quaternary chiral center and an asymmetric synthesis of both enantiomers of the amines from one chiral starting material.</a> Tetrahedron. 57 (18), 3891-3898 (2001).</li><li>Hodgson, D. M., Humphreys, P. G., Hughes, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Widening+the+usefulness+of+epoxides+and+aziridines+in+synthesis.">Widening the usefulness of epoxides and aziridines in synthesis.</a> Pure. Appl. Chem. 79 (2), 269-279 (2007).</li><li>Musio, B., Clarkson, G. J., Shipman, M., Florio, S., Luisi, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+of+optically+active+arylaziridines+by+regio-+and+stereospecific+lithiation+of+N-Bus-phenylaziridine.">Synthesis of optically active arylaziridines by regio- and stereospecific lithiation of N-Bus-phenylaziridine.</a> Org. Lett. 11 (2), 325-328 (2009).</li><li>Beak, P., Wu, S., Yum, E. K., Jun, Y. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intramolecular+cyclizations+of+-lithioamine+synthetic+equivalents:+convenient+syntheses+of+3-,+5-,+and+6-membered-ring+heterocyclic+nitrogen+compounds+and+elaborations+of+3-membered+ring+systems.">Intramolecular cyclizations of -lithioamine synthetic equivalents: convenient syntheses of 3-, 5-, and 6-membered-ring heterocyclic nitrogen compounds and elaborations of 3-membered ring systems.</a> J. Org. Chem. 59 (2), 276-277 (1994).</li><li>Aggarwal, V. K., Alonso, E., Ferrara, M., Spey, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Highly+diastereoselective+aziridination+of+imines+with+trimethylsilyldiazomethane.+Subsequent+silyl+substitution+with+electrophiles,+ring+opening,+and+metalation+of+C-silylaziridines+&#8722;+a+cornucopia+of+highly+selective+transformations.">Highly diastereoselective aziridination of imines with trimethylsilyldiazomethane. Subsequent silyl substitution with electrophiles, ring opening, and metalation of C-silylaziridines &#8722; a cornucopia of highly selective transformations.</a> J. Org. Chem. 67 (7), 2335-2344 (2002).</li><li>Nelson, J. M., Vedejs, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Metalated+aziridines+for+cross-coupling+with+aryl+and+alkenyl+halides+via+palladium+catalysis.">Metalated aziridines for cross-coupling with aryl and alkenyl halides via palladium catalysis.</a> Org. Lett. 12 (22), 5085-5087 (2010).</li><li>Theddu, N., Vedejs, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stille+coupling+of+an+aziridinyl+stannatrane.">Stille coupling of an aziridinyl stannatrane.</a> J. Org. Chem. 78 (10), 5061-5066 (2013).</li><li>Hughes, M., Boultwood, T., Zeppetelli, G., Bull, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Palladium-catalyzed+cross-coupling+of+aziridinylmetal+species,+generated+by+sulfinyl&#8722;magnesium+exchange,+with+aryl+bromides:+reaction+optimization,+scope,+and+kinetic+investigations.">Palladium-catalyzed cross-coupling of aziridinylmetal species, generated by sulfinyl&#8722;magnesium exchange, with aryl bromides: reaction optimization, scope, and kinetic investigations.</a> J. Org. Chem. 78 (3), 844-854 (2013).</li><li>Singh, G. S., D'hooghe, M., De Kimpe, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+and+reactivity+of+C-heteroatom-substituted+aziridines.">Synthesis and reactivity of C-heteroatom-substituted aziridines.</a> Chem. Rev. 107 (5), 2080-2135 (2007).</li><li>Bull, J. A., Boultwood, T., Taylor, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Highly+cis-selective+synthesis+of+iodo-aziridines+using+diiodomethyllithium+and+in+situ+generated+N-Boc-imines.">Highly cis-selective synthesis of iodo-aziridines using diiodomethyllithium and in situ generated N-Boc-imines.</a> Chem. Commun. 48 (100), 12246-12248 (2012).</li><li>Boultwood, T., Affron, D. P., Trowbridge, A. D., Bull, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+of+cis-C-iodo-N-tosyl-aziridines+using+diiodomethyllithium:+reaction+optimization,+product+scope+and+stability,+and+a+protocol+for+selection+of+stationary+phase+for+chromatography.">Synthesis of cis-C-iodo-N-tosyl-aziridines using diiodomethyllithium: reaction optimization, product scope and stability, and a protocol for selection of stationary phase for chromatography.</a> J. Org. Chem. 78 (13), 6632-6647 (2013).</li><li>Bull, J. A., Charette, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+procedure+for+the+synthesis+of+gem-diiodoalkanes+by+the+alkylation+of+diiodomethane.+scope+and+limitations.">Improved procedure for the synthesis of gem-diiodoalkanes by the alkylation of diiodomethane. scope and limitations.</a> J. Org. Chem. 73 (20), 8097-8100 (2008).</li><li>Bull, J. A., Charette, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intramolecular+Simmons-Smith+cyclopropanation.+Studies+into+the+reactivity+of+alkyl-substituted+zinc+carbenoids,+effect+of+directing+groups+and+synthesis+of+bicyclo[n.1.0]alkanes.">Intramolecular Simmons-Smith cyclopropanation. Studies into the reactivity of alkyl-substituted zinc carbenoids, effect of directing groups and synthesis of bicyclo[n.1.0]alkanes.</a> J. Am. Chem. Soc. 132 (6), 1895-1902 (2010).</li><li>Lim, D. S. W., Anderson, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=One-step+preparation+of+functionalized+(E)-vinylsilanes+from+aldehydes.">One-step preparation of functionalized (E)-vinylsilanes from aldehydes.</a> Org. Lett. 13 (18), 4806-4809 (2011).</li><li>Bull, J. A., Mousseau, J. J., Charette, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Convenient+one-pot+synthesis+of+(E)-&#946;-aryl+vinyl+halides+from+benzyl+bromides+and+dihalomethanes.">Convenient one-pot synthesis of (E)-&#946;-aryl vinyl halides from benzyl bromides and dihalomethanes.</a> Org. Lett. 10 (23), 5485-5488 (2008).</li><li>Bull, J. A., Mousseau, J. J., Charette, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation+of+(E)-(2-iodovinyl)benzene+from+benzyl+bromide+and+diiodomethane.">Preparation of (E)-(2-iodovinyl)benzene from benzyl bromide and diiodomethane.</a> Org. Synth. 87, 170-177 (2010).</li><li>Boxer, M. B., Yamamoto, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Super+silyl+group+for+a+sequential+diastereoselective+aldol-polyhalomethyllithium+addition+reaction.">Super silyl group for a sequential diastereoselective aldol-polyhalomethyllithium addition reaction.</a> Org. Lett. 10 (3), 453-455 (2008).</li><li>Seyferth, D., Lambert, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Halomethyl-metal+compounds:+LXII.+Preparation+of+diiodomethyl-metal+compounds.">Halomethyl-metal compounds: LXII. Preparation of diiodomethyl-metal compounds.</a> J. Organomet. Chem. 54, 123-130 (1973).</li><li>Still, W. C., Kahn, M., Mitra, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+chromatographic+technique+for+preparative+separations+with+moderate+resolution.">Rapid chromatographic technique for preparative separations with moderate resolution.</a> J. Org. Chem. 43 (14), 2923-2925 (1978).</li><li>Armarego, W. L. F., Chai, L. L. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Purification of laboratory chemicals. , (2003).</li></ol>

The authors declare that they have no competing financial interests.

הליך להכנת diastereoselective של ציס - N-TS-iodoaziridines מתואר, יחד עם פרוטוקול מחקר יציבות כדי לציין את השלב נייח הטוב ביותר לטיהור של תרכובות שעלולים להיות לא יציבים בכרומטוגרפיה בעמודת הבזק כמותית. זה שחזה כי גישה לiodoaziridines דרך גישה זו תאפשר שיטות לגשת למגוון רחב של aziridines...

מטרתה של שיטה זו היא להכין iodoaziridines המציעים פוטנציאל לfunctionalization נוסף לנגזרי aziridine. השיטה משלבת פרוטוקול לבחירת כמותי של השלב נייח האופטימלי לכרומטוגרפיה. Aziridines, כמו טבעות שלוש membered, מתח טבעת הגלום posses שגורם להם אבני בניין חשובים בכימיה אורגנית 1. הם מציגים מגוון רחב של תגובתיות לעתים קרובות כרוכים בפתיחת טבעת aziridine 2,3, בעיקר כחומרי ביניים בסינתזה של אמינים פונקציונליות 4,5, או היווצרות של heterocycles חנקן המכיל האחר 6,7. הסינתזה של מגוון רחב של נגזרי aziridine ידי functionalization של מבשר המכיל טבעת aziridine שלמה התפתחה כאסטרטגיה מעשית 8. מטבע פונקציונלי קבוצת מתכת, כדי ליצור אניון aziridinyl, ותגובה עם electrophiles הוכח כיעיל <sup&gt; 9,10,11, ולאחרונה deprotonation Regio-וstereoselective של aziridines המוגן-N גם הושג 12-15. ממש לאחרונה, פלדיום זרז שיטות צימוד צולב כדי ליצור aziridines aryl ממבשרי aziridine פונקציונליות פותח על ידי Vedējs 16,17, ואת עצמנו 18. הכימיה של aziridines heteroatom להחליף פותחת שאלות מרתקות של תגובתיות ויציבות 19. אנחנו כבר מתעניינים בהכנת iodoaziridines כקבוצה פונקציונלית חדשנית שמציעה את הפוטנציאל לספק סימנים מקדימים למגוון רחב של מכשירים פיננסיים נגזרים עם תגובתיות משלימה לתגובות functionalization aziridine קיימות. בשנת 2012 דיווחנו ההכנה הראשונה של aryl N-BOC-iodoaziridines 20, ודיווחתי לאחרונה על הכנת aryl ואלקיל להחליף N-TS-iodoaziridines 21 מאוד. השיטה לacceiodoaziridines ss משתמש diiodomethyllithium, מגיב שלאחרונה גם הועסקו בהכנת diiodoalkanes 22,23, diiodomethylsilanes 22,24, וiodides יניל 25-27. הטבע כמו carbenoid של מגיב זה דורש הכנה ושימוש בטמפרטורות נמוכות 22,28. הטכניקות ותנאי שימוש עבור הדור של diiodomethyllithium בהכנת iodoaziridines מתוארים להלן. בעוד סיליקה התפתחה כחומר המועדף על כרומטוגרפיה 29, זה הוכיח את עצמו אינו מתאים לטיהור של N-TS-iodoaziridines. סיליקה ג&#39;ל הוא בדרך כלל חומר השלב הראשון ורק מוצק מועסק בבזק כרומטוגרפיה בכימיה אורגנית בשל ההפרדות הזמינות ויעילה. עם זאת, אופי חומצי של סיליקה ג&#39;ל יכול לגרום לפירוק של מצעים רגישים במהלך טיהור, מניעת בידוד של החומר המבוקש. בעוד st האחרשלבי ationary או ג &#39;ל סיליקה שונה זמינים עבור כרומטוגרפיה 30, לא הייתה שום דרך להעריך תאימות של מולקולת המטרה לחומרים שונים. בשל האופי הרגיש של iodoaziridines, הקמנו פרוטוקול להעריך את היציבות של מתחם למערך של שלבים נייחים 21, אשר באו לידי הביטוי כאן. זו יש פוטנציאל ליישום בסינתזה של מגוון רחב של תרכובות עם קבוצות פונקציונליות רגישות. הפרוטוקול הבא מספק גישה יעילה לiodoaziridines N-Ts, המאפשר את הסינתזה של שניהם diastereoselective אלקיל וcis-iodoaziridines ארומטיים בתשואה גבוהה.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="871">
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:209px;">Hexamethyldisilazane</td>
			<td style="width:273px;">999-97-3</td>
			<td style="width:197px;">Alfa Aesar</td>
			<td style="width:192px;">Distill from KOH under argon prior to use.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:209px;">n-Butyllithium</td>
			<td style="width:273px;">109-72-8</td>
			<td style="width:197px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:192px;">2.5 M in hexanes, titrate prior to use.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:209px;">Diiodomethane</td>
			<td style="width:273px;">75-11-6</td>
			<td style="width:197px;">Alfa Aesar</td>
			<td style="width:192px;">Contains copper as a stabilizer.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">1,3,5-Trimethoxybenzene</td>
			<td style="width:273px;">621-23-8</td>
			<td style="width:197px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">Silica</td>
			<td style="width:273px;">112945-52-5</td>
			<td style="width:197px;">Merck</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">Basic alumina</td>
			<td style="width:273px;">1344-28-1</td>
			<td style="width:197px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">Neutral alumina</td>
			<td style="width:273px;">1344-28-1</td>
			<td style="width:197px;">Merck</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">Florisil</td>
			<td style="width:273px;">1343-88-0</td>
			<td style="width:197px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:209px;">THF</td>
			<td colspan="3" rowspan="3" style="width:663px;">All anhydrous solvents were dried through activated alumina purification columns.&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:209px;">Et2O</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:209px;">CH2Cl2</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">NMR spectrometer</td>
			<td>Bruker AV 400&#160;</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">NMR processing software</td>
			<td>MestReNova&#160;</td>
			<td>7.0.2-8636</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

synthesis and purification of iodoaziridines involving quantitative selection of the optimal stationary phase for chromatography

הכנת diastereoselective מאוד של ציס - N-TS-iodoaziridines דרך תגובה של diiodomethyllithium עם aldimines N-TS היא מתוארת. Diiodomethyllithium הוא הוכן על ידי deprotonation של diiodomethane עם LiHMDS, בתערובת אתר THF / diethyl, ב-78 ° C בחושך. תנאים אלה הם חיוניים ליציבות של המגיב ליצ&#39;י 2 שנוצר. בנוסף dropwise הבא של aldimines N-Ts לפתרון diiodomethyllithium preformed מקנה אמין diiodide ביניים, שאינו מבודד. התחממות מהירה של תערובת התגובה ל0 ° C מקדמת cyclization להרשות לעצמם iodoaziridines עם cis-diastereoselectivity הבלעדי. השלבים נוספים וcyclization של התגובה מתווכים בבקבוק אחד תגובה על ידי בקרת טמפרטורה זהירה. בשל הרגישות של iodoaziridines לטיהור, הערכה של שיטות מתאימות של purification נדרש. פרוטוקול להעריך את היציבות של תרכובות רגישות לשלבים נייחים לכרומטוגרפיה בעמודה מתואר. שיטה זו מתאימה ליחול על iodoaziridines החדש, או תרכובות רומן שעשוי להיות רגישות אחרות. כתוצאה מכך בשיטה זו עלולה למצוא את היישום במגוון הרחב של פרויקטים סינטטיים. ההליך כרוך בראשית ההערכה של תשואת התגובה, לפני הטיהור, על ידי ספקטרוסקופית NMR H 1 עם השוואה לרמה פנימית. חלקים מהתערובת של מוצר טמא לאחר מכן נחשפו לslurries של שלבים נייחים שונים מתאימים לכרומטוגרפיה, במערכת ממס מתאימה כeluent בבזק כרומטוגרפיה. לאחר ערבוב במשך 30 דקות לחקות כרומטוגרפיה, ואחרי סינון, הדגימות מנותחות 1 ספקטרוסקופיה H NMR. תשואות מחושבים לכל שלב נייח לאחר מכן בהשוואה לזו שהושגה בתחילה מתערובת התגובה גולמי. התוצאות שהתקבלו לספק הערכה כמותית של tהוא היציבות של המתחם לשלבים נייחים השונים; מכאן האופטימלי ניתן לבחור. הבחירה של אלומינה הבסיסית, הותאם לפעילות IV, כשלב נייח מתאים אפשר בידוד של iodoaziridines מסוים בתשואות ובטהרה מצוינות.

ההליך מתואר cis מקנה - (±)-2-iodo-3-(4 tolyl-) -1 - aziridine (4 tolylsulfonyl-) כdiastereoisomer יחיד ועם טוהר מצוין (איור 1). לפני הטיהור, תשואה של 59% מתוצר iodoaziridine חושב על ידי ספקטרוסקופית NMR H 1. עם זאת, iodoaziridine זה היה מאתגר במיוחד כדי לטהר ועבר פירוק באופן משמעותי על סיליקה. טיהור על ?...

Watch this Scientific Journal Video about Synthesis and Purification of Iodoaziridines Involving Quantitative Selection of the Optimal Stationary Phase for Chromatography at JoVE.com

Synthesis and Purification of Iodoaziridines Involving Quantitative Selection of the Optimal Stationary Phase for Chromatography

פרוטוקול להכנת diastereoselective בסיר אחד של ציס - N-TS-iodoaziridines מתואר. הדור של diiodomethyllithium, בנוסף לaldimines N-Ts וcyclization של אמין פנינה-diiodide ביניים לiodoaziridines מודגם. כן נכלל בפרוטוקול במהירות וכמותית להעריך את השלב נייח המתאים ביותר לטיהור על ידי כרומטוגרפיה.

סינתזה וטיהור של Iodoaziridines עירוב כמותי בחירת האופטימלית נייח השלב לכרומטוגרפיה

The highly diastereoselective preparation of cis-N-Ts-iodoaziridines through reaction of diiodomethyllithium with N-Ts aldimines is described. ...

synthesis-purification-iodoaziridines-involving-quantitative

Research

JoVE Journal

Chemistry

12.4K Views.  Imperial College London.  פרוטוקול להכנת diastereoselective בסיר אחד של ציס - N-TS-iodoaziridines מתואר. הדור של diiodomethyllithium, בנוסף לaldimines N-Ts וcyclization של אמין פנינה-diiodide ביניים לiodoaziridines מודגם. כן נכלל בפרוטוקול במהירות וכמותית להעריך את השלב נייח המתאים ביותר לטיהור ?...

Video: Synthesis and Purification of Iodoaziridines Involving Quantitative Selection of the Optimal Stationary Phase for Chromatography

Determination of the Gas-phase Acidities of Oligopeptides

Amino acid residues located at different positions in folded proteins often exhibit different degrees of acidities. For example, a cysteine residue located at or near the N-terminus of a helix is often more acidic than that at or near the C-terminus 1-6. Although extensive experimental studies on the acid-base properties of peptides have been carried out in the condensed phase, in particular in aqueous solutions 6-8, the results are often complicated by solvent effects 7. In fact, most of the active sites in proteins are located near the interior region where solvent effects have been minimized 9,10. In order to understand intrinsic acid-base properties of peptides and proteins, it is important to perform the studies in a solvent-free environment.
We present a method to measure the acidities of oligopeptides in the gas-phase. We use a cysteine-containing oligopeptide, Ala3CysNH2 (A3CH), as the model compound. The measurements are based on the well-established extended Cooks kinetic method (Figure 1) 11-16. The experiments are carried out using a triple-quadrupole mass spectrometer interfaced with an electrospray ionization (ESI) ion source (Figure 2). For each peptide sample, several reference acids are selected. The reference acids are structurally similar organic compounds with known gas-phase acidities. A solution of the mixture of the peptide and a reference acid is introduced into the mass spectrometer, and a gas-phase proton-bound anionic cluster of peptide-reference acid is formed. The proton-bound cluster is mass isolated and subsequently fragmented via collision-induced dissociation (CID) experiments. The resulting fragment ion abundances are analyzed using a relationship between the acidities and the cluster ion dissociation kinetics. The gas-phase acidity of the peptide is then obtained by linear regression of the thermo-kinetic plots 17,18.
The method can be applied to a variety of molecular systems, including organic compounds, amino acids and their derivatives, oligonucleotides, and oligopeptides. By comparing the gas-phase acidities measured experimentally with those values calculated for different conformers, conformational effects on the acidities can be evaluated.

The determination of the gas-phase acidities of cysteine-containing oligopeptides is described. The experiments are performed using a triple quadrupole mass spectrometer. The relative acidities of the peptides are measured using collision-induced dissociation experiments, and the quantitative acidities are determined using the extended Cooks kinetic method.

קביעת Acidities גז השלב של Oligopeptides

Amino acid residues located at different positions in folded proteins often exhibit different degrees of acidities. For example, a cysteine residue ...

Split-and-pool Synthesis and Characterization of Peptide Tertiary Amide Library

Peptidomimetics are great sources of protein ligands. The oligomeric nature of these compounds enables us to access large synthetic libraries on solid phase by using combinatorial chemistry. One of the most well studied classes of peptidomimetics is peptoids. Peptoids are easy to synthesize and have been shown to be proteolysis-resistant and cell-permeable. Over the past decade, many useful protein ligands have been identified through screening of peptoid libraries. However, most of the ligands identified from peptoid libraries do not display high affinity, with rare exceptions. This may be due, in part, to the lack of chiral centers and conformational constraints in peptoid molecules. Recently, we described a new synthetic route to access peptide tertiary amides (PTAs). PTAs are a superfamily of peptidomimetics that include but are not limited to peptides, peptoids and N-methylated peptides. With side chains on both &#945;-carbon and main chain nitrogen atoms, the conformation of these molecules are greatly constrained by sterical hindrance and allylic 1,3 strain. (Figure 1) Our study suggests that these PTA molecules are highly structured in solution and can be used to identify protein ligands. We believe that these molecules can be a future source of high-affinity protein ligands. Here we describe the synthetic method combining the power of both split-and-pool and sub-monomer strategies to synthesize a sample one-bead one-compound (OBOC) library of PTAs.

Peptide tertiary amides (PTAs) are a superfamily of peptidomimetics that include but are not limited to peptides, peptoids and N-methylated peptides. Here we describe a synthetic method which combines&#160;both split-and-pool and sub-monomer strategies to synthesize a one-bead one-compound library of PTAs.

סינתזה מפוצלת וברכה ואפיון של הספרייה אמידה השלישון פפטיד

Peptidomimetics are great sources of protein ligands. The oligomeric nature of these compounds enables us to access large synthetic libraries on solid ...

Quantitative Detection of Trace Explosive Vapors by Programmed Temperature Desorption Gas Chromatography-Electron Capture Detector

The direct liquid deposition of solution standards onto sorbent-filled thermal desorption tubes is used for the quantitative analysis of trace explosive vapor samples. The direct liquid deposition method yields a higher fidelity between the analysis of vapor samples and the analysis of solution standards than using separate injection methods for vapors and solutions, i.e., samples collected on vapor collection tubes and standards prepared in solution vials. Additionally, the method can account for instrumentation losses, which makes it ideal for minimizing variability and quantitative trace chemical detection. Gas chromatography with an electron capture detector is an instrumentation configuration sensitive to nitro-energetics, such as TNT and RDX, due to their relatively high electron affinity. However, vapor quantitation of these compounds is difficult without viable vapor standards. Thus, we eliminate the requirement for vapor standards by combining the sensitivity of the instrumentation with a direct liquid deposition protocol to analyze trace explosive vapor samples.

Trace explosive vapors of TNT and RDX collected on sorbent-filled thermal desorption tubes were analyzed using a programmed temperature desorption system coupled to GC with an electron capture detector. The instrumental analysis is combined with direct liquid deposition method to reduce sample variability and account for instrumentation drift and losses.

כמותי איתור של אדי נפץ Trace ידי טמפרטורת מתוכנת Desorption גלאי גז לכידת כרומטוגרפיה-אלקטרונים

The direct liquid deposition of solution standards onto sorbent-filled thermal desorption tubes is used for the quantitative analysis of trace explosive ...

Supercritical Nitrogen Processing for the Purification of Reactive Porous Materials

Supercritical fluid extraction and drying methods are well established in numerous applications for the synthesis and processing of porous materials. Herein, nitrogen is presented as a novel supercritical drying fluid for specialized applications such as in the processing of reactive porous materials, where carbon dioxide and other fluids are not appropriate due to their higher chemical reactivity. Nitrogen exhibits similar physical properties in the near-critical region of its phase diagram as compared to carbon dioxide: a widely tunable density up to ~1 g ml-1, modest critical pressure (3.4 MPa), and small molecular diameter of ~3.6 &#197;. The key to achieving a high solvation power of nitrogen is to apply a processing temperature in the range of 80-150 K, where the density of nitrogen is an order of magnitude higher than at similar pressures near ambient temperature. The detailed solvation properties of nitrogen, and especially its selectivity, across a wide range of common target species of extraction still require further investigation. Herein we describe a protocol for the supercritical nitrogen processing of porous magnesium borohydride.

Nitrogen is an effective supercritical fluid for extraction or drying processes due to its small molecular size, high density in the near-liquid supercritical regime, and chemical inertness. We present a supercritical nitrogen drying protocol for the purification treatment of reactive, porous materials.

עיבוד חנקן סופר קריטי עבור הטיהור של חומרים נקבוביים ריאקטיבי

Supercritical fluid extraction and drying methods are well established in numerous applications for the synthesis and processing of porous materials. ...

A Quantitative Glycomics and Proteomics Combined Purification Strategy

There is a growing desire in the biological and clinical sciences to integrate and correlate multiple classes of biomolecules to unravel biology, define pathways, improve treatment, understand disease, and aid biomarker discovery. N-linked glycosylation is one of the most important and robust post-translational modifications on proteins and regulates critical cell functions such as signaling, adhesion, and enzymatic function. Analytical techniques to purify and analyze N-glycans have remained relatively static over the last decade. While accurate and effective, they commonly require significant expertise and resources. Though some high-throughput purification schemes have been developed, they have yet to find widespread adoption and often rely on the enrichment of glycopeptides. One promising method, developed by Thomas-Oates et al., filter aided N-glycan separation (FANGS), was qualitatively demonstrated on tissues. Herein, we adapted FANGS to plasma and coupled it to the individuality normalization when labeling with glycan hydrazide tags strategy in order to achieve accurate relative quantification by liquid chromatography mass spectrometry and enhanced electrospray ionization. Furthermore, we designed new functionality to the protocol by achieving tandem, shotgun proteomics and glycosylation site analysis on hen plasma. We showed that N-glycans purified on filter and derivatized by hydrophobic hydrazide tags were comparable in terms of abundance and class to those by solid phase extraction (SPE); the latter is considered a gold standard in the field. Importantly, the variability in the two protocols was not statistically different. Proteomic data that was collected in-line with glycomic data had the same depth compared to a standard trypsin digest. Peptide deamidation is minimized in the protocol, limiting non-specific deamidation detected at glycosylation motifs. This allowed for direct glycosylation site analysis, though the protocol can accommodate 18O site labeling as well. Overall, we demonstrated a new in-line high-throughput, unbiased, filter based protocol for quantitative glycomics and proteomics analysis.

A high-throughput protocol was developed for combined proteomics and glycomics purification and LC-MS/MS quantification in plasma. Deamidation analysis of N-linked glycosylation motifs was specific to deglycosylated sites. Accurate quantitation of N-glycans was achieved by coupling filter aided N-glycan separation to the individuality normalization when labeling with glycan hydrazide tags strategy.

Glycomics כמוני ואסטרטגית טיהור המשולבת פרוטאומיקה

There is a growing desire in the biological and clinical sciences to integrate and correlate multiple classes of biomolecules to unravel biology, define ...

Protocol for the Synthesis of Ortho-trifluoromethoxylated Aniline Derivatives

Molecules bearing trifluoromethoxy (OCF3) group often show desired pharmacological and biological properties. However, facile synthesis of trifluoromethoxylated aromatic compounds remains a formidable challenge in organic synthesis. Conventional approaches often suffer from poor substrate scope, or require use of highly toxic, difficult-to-handle, and/or thermally labile reagents. Herein, we report a user-friendly protocol for the synthesis of methyl 4-acetamido-3-(trifluoromethoxy)benzoate using 1-trifluoromethyl-1,2-benziodoxol-3(1H)-one (Togni reagent II). Treating methyl 4-(N-hydroxyacetamido)benzoate (1a) with Togni reagent II in the presence of a catalytic amount of cesium carbonate (Cs2CO3) in chloroform at RT afforded methyl 4-(N-(trifluoromethoxy)acetamido)benzoate (2a). This intermediate was then converted to the final product methyl 4-acetamido-3-(trifluoromethoxy)benzoate (3a) in nitromethane at 120 &#176;C. This procedure is general and can be applied to the synthesis of a broad spectrum of ortho-trifluoromethoxylated aniline derivatives, which could serve as useful synthetic building blocks for the discovery and development of new pharmaceuticals, agrochemicals, and functional materials.

Protocol for the Synthesis of Ortho-trifluoromethoxylated Aniline Derivatives

An operationally simple procedure for the synthesis of ortho-trifluoromethoxylated aniline derivatives via a two-step sequence of O-trifluoromethylation of N-aryl-N-hydroxyacetamide followed by thermally induced intramolecular OCF3-migration is reported.

פרוטוקול לסינתזה של<em&gt; Ortho</em&gt; נגזרי אנילין -trifluoromethoxylated

Molecules bearing trifluoromethoxy (OCF3) group often show desired pharmacological and biological properties. However, facile synthesis of ...

Synthesis of Protein Bioconjugates via Cysteine-maleimide Chemistry

The chemical linking or bioconjugation of proteins to fluorescent dyes, drugs, polymers and other proteins has a broad range of applications, such as the development of antibody drug conjugates (ADCs) and nanomedicine, fluorescent microscopy and systems chemistry. For many of these applications, specificity of the bioconjugation method used is of prime concern. The Michael addition of maleimides with cysteine(s) on the target proteins is highly selective and proceeds rapidly under mild conditions, making it one of the most popular methods for protein bioconjugation.
We demonstrate here the modification of the only surface-accessible cysteine residue on yeast cytochrome c with a ruthenium(II) bisterpyridine maleimide. The protein bioconjugation is verified by gel electrophoresis and purified by aqueous-based fast protein liquid chromatography in 27% yield of isolated protein material. Structural characterization with MALDI-TOF MS and UV-Vis is then used to verify that the bioconjugation is successful. The protocol shown here is easily applicable to other cysteine - maleimide coupling of proteins to other proteins, dyes, drugs or polymers.

Synthesis of Protein Bioconjugates via Cysteine-maleimide Chemistry

This protocol details the important steps required for the bioconjugation of a cysteine containing protein to a maleimide, including reagent purification, reaction conditions, bioconjugate purification and bioconjugate characterization.

סינתזה של חלבון Bioconjugates<em&gt; דרך</em&gt; כימיה ציסטאין-maleimide

The chemical linking or bioconjugation of proteins to fluorescent dyes, drugs, polymers and other proteins has a broad range of applications, such as the ...

Facile Synthesis of Worm-like Micelles by Visible Light Mediated Dispersion Polymerization Using Photoredox Catalyst

Presented herein is a protocol for the facile synthesis of worm-like micelles by visible light mediated dispersion polymerization. This approach begins with the synthesis of a hydrophilic poly(oligo(ethylene glycol) methyl ether methacrylate) (POEGMA) homopolymer using reversible addition-fragmentation chain-transfer (RAFT) polymerization. Under mild visible light irradiation (&#955; = 460 nm, 0.7 mW/cm2), this macro-chain transfer agent (macro-CTA) in the presence of a ruthenium based photoredox catalyst, Ru(bpy)3Cl2 can be chain extended with a second monomer to form a well-defined block copolymer in a process known as Photoinduced Electron Transfer RAFT (PET-RAFT). When PET-RAFT is used to chain extend POEGMA with benzyl methacrylate (BzMA) in ethanol (EtOH), polymeric nanoparticles with different morphologies are formed in situ according to a polymerization-induced self-assembly (PISA) mechanism. Self-assembly into nanoparticles presenting POEGMA chains at the corona and poly(benzyl methacrylate) (PBzMA) chains in the core occurs in situ due to the growing insolubility of the PBzMA block in ethanol. Interestingly, the formation of highly pure worm-like micelles can be readily monitored by observing the onset of a highly viscous gel in situ due to nanoparticle entanglements occurring during the polymerization. This process thereby allows for a more reproducible synthesis of worm-like micelles simply by monitoring the solution viscosity during the course of the polymerization. In addition, the light stimulus can be intermittently applied in an ON/OFF manner demonstrating temporal control over the nanoparticle morphology.

This article describes a process for producing polymeric self-assembled nanoparticles using visible light mediated dispersion polymerization. Using low energy visible light to control the polymerization allows for the reproducible formation of self-assembled worm-like micelles at high solids content.

סינתזה קלילה של Micelles תולעת דמוית ידי גלוי אור מתווכת פילמור נפיצה שימוש Photoredox Catalyst

Presented herein is a protocol for the facile synthesis of worm-like micelles by visible light mediated dispersion polymerization. This approach begins ...

Protocol for the Solid-phase Synthesis of Oligomers of RNA Containing a 2'-O-thiophenylmethyl Modification and Characterization via Circular Dichroism

Solid-phase synthesis has been used to obtain canonical and modified polymers of nucleic acids, specifically of DNA or RNA, which has made it a popular methodology for applications in various fields and for different research purposes. The procedure described herein focuses on the synthesis, purification, and characterization of dodecamers of RNA 5&#39;-[CUA CGG AAU CAU]-3&#39; containing zero, one, or two modifications located at the C2&#39;-O-position. The probes are based on 2-thiophenylmethyl groups, incorporated into RNA nucleotides via standard organic synthesis and introduced into the corresponding oligonucleotides via their respective phosphoramidites. This report makes use of phosphoramidite chemistry via the four canonical nucleobases (Uridine (U), Cytosine (C), Guanosine (G), Adenosine (A)), as well as 2-thiophenylmethyl functionalized nucleotides modified at the 2&#39;-O-position; however, the methodology is amenable for a large variety of modifications that have been developed over the years. The oligonucleotides were synthesized on a controlled-pore glass (CPG) support followed by cleavage from the resin and deprotection under standard conditions, i.e., a mixture of ammonia and methylamine (AMA) followed by hydrogen fluoride/triethylamine/N-methylpyrrolidinone. The corresponding oligonucleotides were purified via polyacrylamide electrophoresis (20% denaturing) followed by elution, desalting, and isolation via reversed-phase chromatography (Sep-pak, C18-column). Quantification and structural parameters were assessed via ultraviolet-visible (UV-vis) and circular dichroism (CD) photometric analysis, respectively. This report aims to serve as a resource and guide for beginner and expert researchers interested in embarking in this field. It is expected to serve as a work-in-progress as new technologies and methodologies are developed. The description of the methodologies and techniques within this document correspond to a DNA/RNA synthesizer (refurbished and purchased in 2013) that uses phosphoramidite chemistry.

Protocol for the Solid-phase Synthesis of Oligomers of RNA Containing a 2&#039;-O-thiophenylmethyl Modification and Characterization via Circular Dichroism

This article provides a detailed procedure on the solid-phase synthesis, purification, and characterization of dodecamers of RNA modified at the C2&#39;-O-position. UV-vis and circular dichroism photometric analyses are used to quantify and characterize structural aspects, i.e., single-strands or double-strands.

Protocol עבור שלב מוצק סינתזה של אוליגומרים של רנ&quot;א המכיל 2 &#39;<em&gt; הו</em&gt; שינוי ואפיון של תיאופנילמתיל באמצעות דיכרואיזם מעגלי

Solid-phase synthesis has been used to obtain canonical and modified polymers of nucleic acids, specifically of DNA or RNA, which has made it a popular ...

Synthesis and Mass Spectrometry Analysis of Oligo-peptoids

Peptoids are sequence-controlled peptide-mimicking oligomers consisting of N-alkylated glycine units. Among many potential applications, peptoids have been thought of as a type of molecular information storage. Mass spectrometry analysis has been considered the method of choice for sequencing peptoids. Peptoids can be synthesized via solid phase chemistry using a repeating two-step reaction cycle. Here we present a method to manually synthesize oligo-peptoids and to analyze the sequence of the peptoids using tandem mass spectrometry (MS/MS) techniques. The sample peptoid is a nonamer consisting of alternating N-(2-methyloxyethyl)glycine (Nme) and N-(2-phenylethyl)glycine (Npe), as well as an N-(2-aminoethyl)glycine (Nae) at the N-terminus. The sequence formula of the peptoid is Ac-Nae-(Npe-Nme)4-NH2, where Ac is the acetyl group. The synthesis takes place in a commercially available solid-phase reaction vessel. The rink amide resin is used as the solid support to yield the peptoid with an amide group at the C-terminus. The resulting peptoid product is subjected to sequence analysis using a triple-quadrupole mass spectrometer coupled to an electrospray ionization source. The MS/MS measurement produces a spectrum of fragment ions resulting from the dissociation of charged peptoid. The fragment ions are sorted out based on the values of their mass-to-charge ratio (m/z). The m/z values of the fragment ions are compared against the nominal masses of theoretically predicted fragment ions, according to the scheme of peptoid fragmentation. The analysis generates a fragmentation pattern of the charged peptoid. The fragmentation pattern is correlated to the monomer sequence of the neutral peptoid. In this regard, MS analysis reads out the sequence information of the peptoids.

A protocol is described for the manual synthesis of oligo-peptoids followed by sequence analysis by mass spectrometry.

סינתזה וניתוח ספקטרומטר מסה של Oligo-peptoids

Peptoids are sequence-controlled peptide-mimicking oligomers consisting of N-alkylated glycine units. Among many potential applications, peptoids have ...