, Ramsay Memorial Trust (Araştırma Bursu JAB için 2009-2011), ve Imperial College London; mali destek için biz minnetle EPSRC (EP/J001538/1 JAB Kariyer Hızlanma Fellowship) kabul. Cömert destek ve tavsiye için Prof Alan Armstrong teşekkür ederiz.

Diiodomethyllithium ile Iodoaziridines 1. Hazırlanması <ol><li> Alev, bir argon atmosferi altında oda sıcaklığına kadar soğumaya bırakın, sonra bir argon akımı altında, bir karıştırma çubuğu ve bir septumla donatılmış, ihtiva eden bir 100 ml yuvarlak tabanlı bir şişeye kuru. Not: Züccaciye bir fırında gece boyunca (125 ° C) içinde kurutuldu ve benzer bir şekilde oda sıcaklığına soğutuldu da uygundur. </li><li> Şişeye bir mikroenjektör yoluyla 5.7 ​​ml anhidre THF ekleyin ve 2.7 ml susuz Et 2 O şırınga ile ve yeni damıtılmış heksametildisilazan (1.50 mmol, 315 ul). </li><li> Şişe iyi sokulmasına izin vermek için uygun büyüklükte bir bölmede, bir kuru buz / aseton banyosu içinde -78 ° C&#39;ye kadar elde edilen çözelti ve serin karıştırın. Işığa maruz reaksiyon kabının en aza indirmek için, alüminyum folyo ile Dewar örtün. </li><li> -78 ° C&#39;de çözeltiye, 2-3 dakika boyunca şırıngayla damla damla n ekleyin BuLi (1.50 mmol, 0.60 mi, heksan içinde 2.5 M)Karışım, LiHMDS bir 0.17 M çözelti oluşturmak için başka bir 30 dakika boyunca -78 ° C&#39;de karışmaya bırakın. DİKKAT: n Buli çözüm, yanıcı cilde korozif ve piroforiktir. Şırınga içinde aşırı reaktif göre söndürülür olmalıdır. </li><li> 30 dakika sonra, bir mikroenjektör yoluyla diiyodometan (1.70 mmol, 135 ul) ve ardından şırınga ile alevle kurutulmuş yuvarlak tabanlı bir şişeye 10 mi, 1 ml susuz THF eklemek ve iyi karışmış olduğundan emin olun. </li><li> -78 ° C&#39;de, lityum heksametildisilazan solüsyonuna 2 dakika boyunca diiyotmetan çözeltisi damla damla ekleme -78 ° C&#39;de 20 dakika boyunca bu çözüm bırak </li><li> Başka bir yuvarlak alevle kurutulmuş bir 10 ml&#39;lik dipli bir şişeye [(E)-4-methylphenylmethylidene]-4-metilbenzensülfonamid (137 mg, 0.50 mmol) ve 2.0 ml anhidrid THF içinde çözülür - Bu süre boyunca, N, tartmak. </li><li> 20 dakika deprotonasyon bir süre sonra, -78 ve # &#39;de 5 dakika boyunca diiodomethyllithium çözeltisine imin çözeltisi, damla damla ekleme176; C. </li><li> Damla damla ekleme işlemi tamamlandıktan hemen sonra, kuru buz banyosu üzerinden reaksiyon teknesi kaldırın ve 0 ° C&#39;de bir buz / su banyosuna aktarım Yeniden kapağı alüminyum folyo ile, 0 ° C&#39;de 15 dakika boyunca bırakın Not: Çözelti turuncu bir renk olmalıdır. </li><li> 0 ° C&#39;de 15 dakika sonra, 30 ml doymuş sulu sodyum bikarbonat çözeltisi ilave edilerek reaksiyonun söndürülmesi. Bir ayırma hunisine aktarın ve karışım 30 ml CH 2 Ci 2 ekleyin. Karışım çalkalanır ve alt CH 2 Cl 2 katmanı kaldırın. Bu ekstraksiyon prosedürü diğer iki kez tekrarlayın, ve CH 2 Cl 2 katmanları birleştirir. </li><li> Çözelti içinde mevcut herhangi bir suyu çıkarmak için, organik katmanlar, sodyum sülfat eklenir, daha sonra sodyum sülfat filtre edilerek çıkarılır ve yuvarlak dipli bir şişede, 250 ml filtrat toplamak. </li><li> İstenen iodoaziridine ürünün saf olmayan bir numune elde etmek için bir döner buharlaştırıcı üzerinde düşük basınç altında çözücüyü çıkarın. </li></ol> Kromatografi için Sabit Aşama Ürün stabilitesi 2. Değerlendirilmesi <ol><li> CH 2 Cl 2 (16 ml) içinde ham aziridin örnek çözülür ve bu tamamen eritildi sağlanması, dahili bir standart olarak (28.0 mg, 0.167 mmol) 1,3,5-trimetoksibenzol ekleyin. Bu karışıma, bir kısım (2 mi) alın, indirgenmiş basınç altında çözücüyü çıkarın ve 1 H NMR spektroskopisi ile analiz, bu örnek. </li><li> Standart NMR işlem yazılımı kullanılarak kaydedildi 1H NMR spektrumunu açın. Mestrenova yılında, sağ entegrasyon aracı sağlamak için, daha sonra &quot;el&quot; spektrum tıklayın ve &quot;entegrasyon&quot; seçti. Sırasıyla iç standart ve aziridin CHI sinyalinin sinyalleri entegre 6.08 ppm ve 4.87 ppm zirvelerinden genişliğini kapsayacak için tıklayın ve sürükleyin. 6.08 ppm de zirve için ayrılmaz üzerinde sağ tıklayın, &quot;ayrılmaz düzenlemek&quot; seçin ve 3,0 &quot;normalleştirilmiş&quot; değerini değiştirin. HAYIRTE: Benzer adımlar diğer yazılım paketleri ile uygulanabilir. </li><li> (100/3) x% 59 bir verim elde edilir hesaplanan (CHI sinyalin integrali), buradan, iodoaziridine ve verimi belirlemek için aziridin CHI sinyali (4.87 ppm) için tamamlayıcı bir güncelleştirilmiş değerini kullanın. Not: iç standart (0.167 mmol) ve 1 proton karşılık gelen ürün zirvesinin bilinen bir miktar göz önüne alındığında, iodoaziridine verimi aşağıdaki denklemle hesaplanır: 100 x (ürün zirve integrali) x (dahili standart mol) / mol başlangıç ​​malzemesi. </li><li> Her içinde% 5 EtOAc / heksan, silis +% 1 NEt 3 (trietilamin), nötr alümina, bazik alumina (aktivite I) &#39;in, bazik alumina (aktivite IV) ve Florisil,: Aşağıdaki hareketsiz faz (25 g) içinde harç maddelerin hazırlanması karıştırıcı çubuk içeren altı farklı 250 ml konik şişelerinde (50 ml),. Başka bir konik bir şişe içinde, bir kontrol deneyi olarak kullanılmak üzere, bir% 5 EtOAc / heksan solüsyonu (50 mi) hazırlanır. DİKKAT: silickullanılan bir jel, alüminyum oksit ve diğer sabit fazlar solunduğunda, bu nedenle her zaman etkili bir duman başlığı içinde ele alınmalıdır tehlikelidir. </li><li> Oda sıcaklığında konik şişelere her biri için iodoaziridine / iç standart solüsyonu 2 ml&#39;lik numuneler ekleyin. 30 dakika boyunca bulamaç karışımları karıştırın. NOT: Bu bileşik, normal flaş kolon kromatografisi prosedürü sırasında durağan faz maruz edilebilir süresini temsil etmektedir. </li><li> Bir sinter hunisi kullanılarak bulamacın filtre karışımları ve yuvarlak dipli bir şişede, 250 ml filtrat toplamak. CH2 Cl 2 (2 x 30 mi) ile sinter hunisi üzerinde tortu yıkayın. Kalan çamurları için bu filtreleme işlemini tekrarlayın. NOT: Bu süzme için zaman tanımak ve böylece durağan faz malzemelerinin her biri için aynı anda korumak için, her sabit fazın başlamasından dengelemek için uygundur. </li><li> Indirgenmiş basınç altında elde edilen örneklerinden çözücüyü çıkarın ve 1H NMR ile analiz spectroBölüm 2.2 &#39;de tarif edildiği gibi iodoaziridine, her bir durumda, geri kazanılan miktarını hesaplamak için laparoskopinin ro. </li><li> Bölüm 2.1 &#39;de elde edilmiş olan ile, test edilen her sabit faz elde iodoaziridine verimlerini karşılaştırın. NOT: yüksek verim, 2.1 &#39;de olduğu gibi, ideal olarak aynı veren numune kromatografi için uygun bir durağan fazı gösterir. Bu örnekte, bazik alumina (aktivite IV) arıtma için en iyi hareketsiz faz olarak kabul edilmiştir. </li></ol> Iodoaziridine Temel Alümina ve Arınma 3. Devreden Çıkarma <ol><li> Ham iodoaziridine karışımını oluşturmak için Bölüm 1 tekrarlayın. </li><li> Bazik alumina (aktivite IV) oluşturmak için, bir 500 ml&#39;lik yuvarlak tabanlı bir şişeye bazik alumina (aktivite I) &#39;in 100 g&#39;ı eklenmekte ve daha sonra şişeye 10 ml su eklenir ve bir cam stoper ile uyumludur. </li><li> Hiçbir topaklar bile alümina boyunca su yayılan gösteren, görünür olana kadar şiddetle çalkalanır. Alüminyum oksit oda sıcaklığına soğumaya bırakın. DİKKAT: tutuculuksu tion egzotermiktir, bu nedenle şişe sıcak olabilir ve basınç birikmesi neden olabilir. Herhangi bir basınç sık sık kurmak bırakın. </li><li> % 5 EtOAc / heksan ile sınıflandırma, heksan ile elüt edilerek, hareketsiz faz olarak bazik alümin (IV aktivitesi) kullanılarak kolon kromatografisi ile ham iodoaziridine arındırın. NOT: EtOAc yüksek konsantrasyonlarda bazik alümina ile kullanılmamalıdır. Bu gibi durumlarda, dietil eter yerine kullanılabilir. </li><li> Ürünü içeren parçalar birleştirilir ve saf iodoaziridine elde etmek için indirgenmiş basınç altında çözücüyü çıkarın. </li></ol>

<ol>
	<li>Sweeney, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aziridines:+epoxides'+ugly+cousins.">Aziridines: epoxides' ugly cousins.</a> Chem. Soc. Rev. 31 (5), 247-258 (2002).</li><li>Lu, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recent+developments+in+regioselective+ring+opening+of+aziridines.">Recent developments in regioselective ring opening of aziridines.</a> Tetrahedron. 66 (14), 2549-2560 (2010).</li><li>Wu, B., Parquette, J. R., RajanBabu, T. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regiodivergent+ring+opening+of+chiral+aziridines.">Regiodivergent ring opening of chiral aziridines.</a> Science. 326 (5960), (2009).</li><li>Liew, S. K., He, Z., St Denis, J. D., Yudin, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stereocontrolled+synthesis+of+1,2-+and+1,3-diamine+building+blocks+from+aziridine+aldehyde+dimers.">Stereocontrolled synthesis of 1,2- and 1,3-diamine building blocks from aziridine aldehyde dimers.</a> J. Org. Chem. , (2013).</li><li>Stankovi&#263;, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regioselectivity+in+the+ring+opening+of+non-activated+aziridines.">Regioselectivity in the ring opening of non-activated aziridines.</a> Chem. Soc. Rev. 41 (2), 643-665 (2012).</li><li>Cardoso, A. L., Pinho e Melo, T. M. V. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aziridines+in+formal+[3+2]+cycloadditions:+synthesis+of+five-membered+heterocycles.">Aziridines in formal [3+2] cycloadditions: synthesis of five-membered heterocycles.</a> Eur. J. Org. Chem. 2012 (33), 6479-6501 (2012).</li><li>Dauban, P., Malik, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+masked+1,3-dipole+revealed+from+aziridines.">A masked 1,3-dipole revealed from aziridines.</a> Angew. Chem., Int. Ed. 48 (48), 9026-9029 (2009).</li><li>Florio, S., Luisi, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aziridinyl+anions:+generation,+reactivity,+and+use+in+modern+synthetic+chemistry.">Aziridinyl anions: generation, reactivity, and use in modern synthetic chemistry.</a> Chem. Rev. 110 (9), 5128-5157 (2010).</li><li>Vedejs, E., Moss, W. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lithiated+aziridine+reagents.">Lithiated aziridine reagents.</a> J. Am. Chem. Soc. 115 (4), 1607-1608 (1993).</li><li>Satoh, T., Fukuda, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+synthesis+of+enantiomerically+pure+&#945;-+and+&#946;-amino+acid+derivatives+using+aziridinyl+anions.">A new synthesis of enantiomerically pure &#945;- and &#946;-amino acid derivatives using aziridinyl anions.</a> Tetrahedron. 59 (49), 9803-9810 (2003).</li><li>Satoh, T., Matsue, R., Fujii, T., Morikawa, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cross-coupling+of+nonstabilized+aziridinylmagnesiums+with+alkylhalides+catalyzed+by+Cu(I)+iodide:+a+new+synthesis+of+amines+bearing+a+quaternary+chiral+center+and+an+asymmetric+synthesis+of+both+enantiomers+of+the+amines+from+one+chiral+starting+material.">Cross-coupling of nonstabilized aziridinylmagnesiums with alkylhalides catalyzed by Cu(I) iodide: a new synthesis of amines bearing a quaternary chiral center and an asymmetric synthesis of both enantiomers of the amines from one chiral starting material.</a> Tetrahedron. 57 (18), 3891-3898 (2001).</li><li>Hodgson, D. M., Humphreys, P. G., Hughes, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Widening+the+usefulness+of+epoxides+and+aziridines+in+synthesis.">Widening the usefulness of epoxides and aziridines in synthesis.</a> Pure. Appl. Chem. 79 (2), 269-279 (2007).</li><li>Musio, B., Clarkson, G. J., Shipman, M., Florio, S., Luisi, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+of+optically+active+arylaziridines+by+regio-+and+stereospecific+lithiation+of+N-Bus-phenylaziridine.">Synthesis of optically active arylaziridines by regio- and stereospecific lithiation of N-Bus-phenylaziridine.</a> Org. Lett. 11 (2), 325-328 (2009).</li><li>Beak, P., Wu, S., Yum, E. K., Jun, Y. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intramolecular+cyclizations+of+-lithioamine+synthetic+equivalents:+convenient+syntheses+of+3-,+5-,+and+6-membered-ring+heterocyclic+nitrogen+compounds+and+elaborations+of+3-membered+ring+systems.">Intramolecular cyclizations of -lithioamine synthetic equivalents: convenient syntheses of 3-, 5-, and 6-membered-ring heterocyclic nitrogen compounds and elaborations of 3-membered ring systems.</a> J. Org. Chem. 59 (2), 276-277 (1994).</li><li>Aggarwal, V. K., Alonso, E., Ferrara, M., Spey, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Highly+diastereoselective+aziridination+of+imines+with+trimethylsilyldiazomethane.+Subsequent+silyl+substitution+with+electrophiles,+ring+opening,+and+metalation+of+C-silylaziridines+&#8722;+a+cornucopia+of+highly+selective+transformations.">Highly diastereoselective aziridination of imines with trimethylsilyldiazomethane. Subsequent silyl substitution with electrophiles, ring opening, and metalation of C-silylaziridines &#8722; a cornucopia of highly selective transformations.</a> J. Org. Chem. 67 (7), 2335-2344 (2002).</li><li>Nelson, J. M., Vedejs, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Metalated+aziridines+for+cross-coupling+with+aryl+and+alkenyl+halides+via+palladium+catalysis.">Metalated aziridines for cross-coupling with aryl and alkenyl halides via palladium catalysis.</a> Org. Lett. 12 (22), 5085-5087 (2010).</li><li>Theddu, N., Vedejs, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stille+coupling+of+an+aziridinyl+stannatrane.">Stille coupling of an aziridinyl stannatrane.</a> J. Org. Chem. 78 (10), 5061-5066 (2013).</li><li>Hughes, M., Boultwood, T., Zeppetelli, G., Bull, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Palladium-catalyzed+cross-coupling+of+aziridinylmetal+species,+generated+by+sulfinyl&#8722;magnesium+exchange,+with+aryl+bromides:+reaction+optimization,+scope,+and+kinetic+investigations.">Palladium-catalyzed cross-coupling of aziridinylmetal species, generated by sulfinyl&#8722;magnesium exchange, with aryl bromides: reaction optimization, scope, and kinetic investigations.</a> J. Org. Chem. 78 (3), 844-854 (2013).</li><li>Singh, G. S., D'hooghe, M., De Kimpe, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+and+reactivity+of+C-heteroatom-substituted+aziridines.">Synthesis and reactivity of C-heteroatom-substituted aziridines.</a> Chem. Rev. 107 (5), 2080-2135 (2007).</li><li>Bull, J. A., Boultwood, T., Taylor, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Highly+cis-selective+synthesis+of+iodo-aziridines+using+diiodomethyllithium+and+in+situ+generated+N-Boc-imines.">Highly cis-selective synthesis of iodo-aziridines using diiodomethyllithium and in situ generated N-Boc-imines.</a> Chem. Commun. 48 (100), 12246-12248 (2012).</li><li>Boultwood, T., Affron, D. P., Trowbridge, A. D., Bull, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+of+cis-C-iodo-N-tosyl-aziridines+using+diiodomethyllithium:+reaction+optimization,+product+scope+and+stability,+and+a+protocol+for+selection+of+stationary+phase+for+chromatography.">Synthesis of cis-C-iodo-N-tosyl-aziridines using diiodomethyllithium: reaction optimization, product scope and stability, and a protocol for selection of stationary phase for chromatography.</a> J. Org. Chem. 78 (13), 6632-6647 (2013).</li><li>Bull, J. A., Charette, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+procedure+for+the+synthesis+of+gem-diiodoalkanes+by+the+alkylation+of+diiodomethane.+scope+and+limitations.">Improved procedure for the synthesis of gem-diiodoalkanes by the alkylation of diiodomethane. scope and limitations.</a> J. Org. Chem. 73 (20), 8097-8100 (2008).</li><li>Bull, J. A., Charette, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intramolecular+Simmons-Smith+cyclopropanation.+Studies+into+the+reactivity+of+alkyl-substituted+zinc+carbenoids,+effect+of+directing+groups+and+synthesis+of+bicyclo[n.1.0]alkanes.">Intramolecular Simmons-Smith cyclopropanation. Studies into the reactivity of alkyl-substituted zinc carbenoids, effect of directing groups and synthesis of bicyclo[n.1.0]alkanes.</a> J. Am. Chem. Soc. 132 (6), 1895-1902 (2010).</li><li>Lim, D. S. W., Anderson, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=One-step+preparation+of+functionalized+(E)-vinylsilanes+from+aldehydes.">One-step preparation of functionalized (E)-vinylsilanes from aldehydes.</a> Org. Lett. 13 (18), 4806-4809 (2011).</li><li>Bull, J. A., Mousseau, J. J., Charette, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Convenient+one-pot+synthesis+of+(E)-&#946;-aryl+vinyl+halides+from+benzyl+bromides+and+dihalomethanes.">Convenient one-pot synthesis of (E)-&#946;-aryl vinyl halides from benzyl bromides and dihalomethanes.</a> Org. Lett. 10 (23), 5485-5488 (2008).</li><li>Bull, J. A., Mousseau, J. J., Charette, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation+of+(E)-(2-iodovinyl)benzene+from+benzyl+bromide+and+diiodomethane.">Preparation of (E)-(2-iodovinyl)benzene from benzyl bromide and diiodomethane.</a> Org. Synth. 87, 170-177 (2010).</li><li>Boxer, M. B., Yamamoto, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Super+silyl+group+for+a+sequential+diastereoselective+aldol-polyhalomethyllithium+addition+reaction.">Super silyl group for a sequential diastereoselective aldol-polyhalomethyllithium addition reaction.</a> Org. Lett. 10 (3), 453-455 (2008).</li><li>Seyferth, D., Lambert, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Halomethyl-metal+compounds:+LXII.+Preparation+of+diiodomethyl-metal+compounds.">Halomethyl-metal compounds: LXII. Preparation of diiodomethyl-metal compounds.</a> J. Organomet. Chem. 54, 123-130 (1973).</li><li>Still, W. C., Kahn, M., Mitra, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+chromatographic+technique+for+preparative+separations+with+moderate+resolution.">Rapid chromatographic technique for preparative separations with moderate resolution.</a> J. Org. Chem. 43 (14), 2923-2925 (1978).</li><li>Armarego, W. L. F., Chai, L. L. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Purification of laboratory chemicals. , (2003).</li></ol>

The authors declare that they have no competing financial interests.

Cis diastereoselektif hazırlanması için bir prosedür - N-Ts-iodoaziridines kantitatif flaş kolon kromatografisi ile potansiyel olarak kararsız bileşiklerin saflaştırılması için en hareketsiz faz belirtmek için bir stabilite çalışma protokolü ile birlikte tarif edilmiştir. Bu yaklaşımla iodoaziridines erişim sağlam halkasının derivatizasyon ile, geliştirilecek aziridinler geniş bir erişim için yöntemler sağlayacak öngörülmektedir. Bir α-prot...

Bu yöntemin amacı, aziridin türevlerine daha işlevsellik için bir potansiyel sunmaktadır iodoaziridines hazırlamaktır. Yöntem, kromatografi için uygun sabit fazın nicel seçimi için bir protokol içerir. Aziridinler, organik kimyada 1 bunları önemli yapı taşlarını yapan üç üyeli halkalar, parça bulunmaktadır doğal halka sıkışması gibi. Özellikle işlevselleştirilmiş aminlerin 4,5 sentezinde ara maddeler olarak genellikle aziridin halkası açıklık içeren 2,3 reaktivite geniş bir dizi, veya başka bir azot içeren hetero-6,7 oluşumunu gösterir. Bozulmamış bir aziridin halkası içeren bir ön-madde işlevsellik ile aziridin türevleri bir dizi sentezi, uygun bir strateji 8 olarak ortaya çıkmıştır. Fonksiyonel grup-metal değişimi, aziridinil bir anyon oluşturmak için, ve elektrofiller ile reaksiyon ile etkili olduğu gösterilmiştir <sup&gt; 9,10,11 ve N-korumalı aziridinler son zamanlarda rejyo-ve stereo-seçici proton giderme de 12-15 elde edilmiştir. Çok yakın zamanda, paladyum Vedejs 16,17 tarafından geliştirilmiştir işlevselleştirilmiş aziridin öncülerden aril Aziridin &#39;lerin oluşturulması için çapraz bağlama yöntemleri ile katalize ve kendimizi 18. Heteroatom ikame aziridinlerin kimyası reaktivitesi ve istikrar 19 büyüleyici sorularını açılır. Biz, mevcut aziridin fonksiyonalizasyon reaksiyonları tamamlayıcı reaktivitesi olan türevlerinin geniş bir öncüleri sağlamak için potansiyel sunan yeni bir fonksiyonel grup olarak iodoaziridines hazırlanması ile ilgili olmuştur. 2012 yılında, aril N-Boc-iodoaziridines 20 ilk hazırlanmasını rapor ve çok yakın N-Ts-iodoaziridines 21 ikame edilmiş aril ve alkil preparasyonunu rapor etmiştir. Acce için bir yöntemss iodoaziridines diiodomethyllithium kullanır, yakın zamanda diiodoalkanes 22,23 hazırlanmasında kullanılan olan bir tepkin madde, 22,24 diiodomethylsilanes ve vinil iyodür 25-27. Bu reaktifin karbenoid benzeri doğası, düşük sıcaklıklarda da 22,28 hazırlanmasını ve kullanılmasını gerektirir. Iodoaziridines hazırlanmasında diiodomethyllithium jenerasyonu için kullanılan teknikler ve koşullar aşağıda açıklanmıştır. Silika kromatografisi 29 için tercih edilen bir malzeme olarak ortaya çıkmıştır olsa da, N-Ts-iodoaziridines saflaştırılması için uygun olduğu kanıtlanmıştır. Silika jel kaynaklanmaktadır durumuna ve etkili ayrımları organik kimyada kullanılan flaş kromatografi ilk ve tek fazlı katı malzemedir. Bununla birlikte, silika jel asidik doğası, istenen malzemenin izole önlenmesi, saflaştırma işlemi sırasında hassas alt-tabakaların ayrışmasını neden olabilir. Da diğer stationary fazlar veya modifiye edilmiş silika jeli kromatografisi 30 için kullanılabilir, bu farklı malzemeler için hedef molekülün uyumluluğunu değerlendirmek için bir yöntem yoktu. Nedeniyle iodoaziridines hassas doğası gereği, burada gösterilmektedir durağan fazlar 21, bir dizi bir bileşiğin kararlılığını değerlendirmek için bir protokol kurulmuştur. Bu hassas fonksiyonlu gruplara sahip bileşiklere geniş bir sentezinde uygulama için potansiyele sahiptir. Aşağıdaki protokol, yüksek verimle alkil ve aromatik cis-iodoaziridines hem de diastereoselektif sentezine izin veren, N-Ts iodoaziridines için etkili bir erişim sağlar.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="871">
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:209px;">Hexamethyldisilazane</td>
			<td style="width:273px;">999-97-3</td>
			<td style="width:197px;">Alfa Aesar</td>
			<td style="width:192px;">Distill from KOH under argon prior to use.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:209px;">n-Butyllithium</td>
			<td style="width:273px;">109-72-8</td>
			<td style="width:197px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:192px;">2.5 M in hexanes, titrate prior to use.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:209px;">Diiodomethane</td>
			<td style="width:273px;">75-11-6</td>
			<td style="width:197px;">Alfa Aesar</td>
			<td style="width:192px;">Contains copper as a stabilizer.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">1,3,5-Trimethoxybenzene</td>
			<td style="width:273px;">621-23-8</td>
			<td style="width:197px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">Silica</td>
			<td style="width:273px;">112945-52-5</td>
			<td style="width:197px;">Merck</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">Basic alumina</td>
			<td style="width:273px;">1344-28-1</td>
			<td style="width:197px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">Neutral alumina</td>
			<td style="width:273px;">1344-28-1</td>
			<td style="width:197px;">Merck</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">Florisil</td>
			<td style="width:273px;">1343-88-0</td>
			<td style="width:197px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:192px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:209px;">THF</td>
			<td colspan="3" rowspan="3" style="width:663px;">All anhydrous solvents were dried through activated alumina purification columns.&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:209px;">Et2O</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:209px;">CH2Cl2</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">NMR spectrometer</td>
			<td>Bruker AV 400&#160;</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:209px;">NMR processing software</td>
			<td>MestReNova&#160;</td>
			<td>7.0.2-8636</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

synthesis and purification of iodoaziridines involving quantitative selection of the optimal stationary phase for chromatography

Cis yüksek diastereoselektif hazırlanması - N-Ts aldiminler diiodomethyllithium ile reaksiyona sokulması yoluyla N-Ts-iodoaziridines tarif edilmektedir. Diiodomethyllithium bir THF / dietil eter karışımı içinde, -78 ° C de, LiHMDS ile diiyodometan deprotonasyon ile hazırlanır karanlıkta. Bu koşullar oluşturulan Lichi 2 reaktifinin stabilitesi için gereklidir. Önceden diiodomethyllithium çözeltisine N-Ts aldiminler sonradan Damla damla ekleme izole edilmez ki, bir amino-diiyodür ara madde elde edilir. 0 ° C ile reaksiyon karışımının hızlı ısınma özel cis-diastereo seçicilik ile iodoaziridines vermek üzere siklizasyonunu teşvik etmektedir. Reaksiyonun ilavesi ve siklizasyon aşamaları dikkatli bir ısı kontrolü ile, bir reaksiyon şişesi içerisinde aracılık eder. Nedeniyle arıtma, pu uygun yöntemlerin değerlendirilmesine iodoaziridines hassasiyetinearalığında olacak şekilde yapılır gereklidir. Kolon kromatografisi için durağan faz duyarlı bileşiklerinin stabilitesini değerlendirmek için bir protokolü tarif edilmektedir. Bu yöntem yeni iodoaziridines veya diğer potansiyel olarak hassas yeni bileşikleri uygulamak için uygundur. Dolayısıyla bu yöntem sentetik projelerin aralığında uygulama bulabilirsiniz. Prosedür, ilk olarak, bir iç standart ile karşılaştırıldığında, 1 H NMR spektroskopisi ile saflaştırmadan önce, reaksiyon verimi, değerlendirilmesini içerir. Saf olmayan ürün karışımının kısımları daha sonra flaş kromatografide elüsyon için müsait bir çözücü sistemi içinde, kromatografi için uygun olan çeşitli sabit fazın bulamaçları maruz kalmaktadır. Ardından filtre kromatografisi taklit etmek için 30 dakika boyunca karıştırıldıktan sonra, numuneler, 1 H NMR spektroskopisi ile analiz edilir. Her bir durağan faz için hesaplanan verim daha sonra, ilk olarak ham tepkime karışımından elde edilene karşılaştırılır. Elde edilen sonuçlar, t kantitatif bir değerlendirmesini sağlamakFarklı sabit fazlar için, bileşiğin o stabilitesi; bu nedenle uygun seçilebilir. Uygun bir hareketsiz faz mükemmel verim ve saflıkta bazı iodoaziridines izolasyon izin gibi, IV aktivitesi için modifiye bazik alümin seçim.

(Şekil 1), tek bir diastereoizomer olarak ve mükemmel bir saflıkla (4-tolilsülfonil) aziridin - (±)-2-iyodo-3-(4-tolil) -1 - prosedür tanıyor cis tarif. Önceki saflaştırma, iodoaziridine ürünün% 59 bir verimi 1 H NMR spektroskopisi ile hesaplanmıştır. Bununla birlikte, bu iodoaziridine saflaştırılması için özellikle zor ve silika üzerinde önemli bir ayrışma uygulandı. Durağan faz ekran ile belirlendiği gibi bazik alumina (aktivite IV) üzerinde saflaştı...

Watch this Scientific Journal Video about Synthesis and Purification of Iodoaziridines Involving Quantitative Selection of the Optimal Stationary Phase for Chromatography at JoVE.com

Synthesis and Purification of Iodoaziridines Involving Quantitative Selection of the Optimal Stationary Phase for Chromatography

Cis diastereoselektif tek kap hazırlanması için bir protokol - N-Ts-iodoaziridines tarif edilmektedir. N-Ts aldiminler ve gem-diiyodür iodoaziridines aracılık eden amino gösterilmiştir siklizasyonu için diiodomethyllithium, ilave üretimi. Ayrıca, hızlı ve nicel şekilde kromatografi ile saflaştırma için en uygun bir durağan fazı değerlendirmek için bir protokol dahildir.

Sentez ve Kromatografi için optimal sabit faz kantitatif seçimi dahil edilmesi Iodoaziridines saflaştırılması

The highly diastereoselective preparation of cis-N-Ts-iodoaziridines through reaction of diiodomethyllithium with N-Ts aldimines is described. ...

synthesis-purification-iodoaziridines-involving-quantitative

Research

JoVE Journal

Chemistry

12.4K Görüntüleme.  Imperial College London.  Cis diastereoselektif tek kap hazırlanması için bir protokol - N-Ts-iodoaziridines tarif edilmektedir. N-Ts aldiminler ve gem-diiyodür iodoaziridines aracılık eden amino gösterilmiştir siklizasyonu için diiodomethyllithium, ilave üretimi. Ayrıca, hızlı ve nicel şekilde kromatografi ile saflaştırma için en uygun bir durağan fazı değerlendirmek için bir protokol dahildir. 

Video: Synthesis and Purification of Iodoaziridines Involving Quantitative Selection of the Optimal Stationary Phase for Chromatography

Determination of the Gas-phase Acidities of Oligopeptides

Amino acid residues located at different positions in folded proteins often exhibit different degrees of acidities. For example, a cysteine residue located at or near the N-terminus of a helix is often more acidic than that at or near the C-terminus 1-6. Although extensive experimental studies on the acid-base properties of peptides have been carried out in the condensed phase, in particular in aqueous solutions 6-8, the results are often complicated by solvent effects 7. In fact, most of the active sites in proteins are located near the interior region where solvent effects have been minimized 9,10. In order to understand intrinsic acid-base properties of peptides and proteins, it is important to perform the studies in a solvent-free environment.
We present a method to measure the acidities of oligopeptides in the gas-phase. We use a cysteine-containing oligopeptide, Ala3CysNH2 (A3CH), as the model compound. The measurements are based on the well-established extended Cooks kinetic method (Figure 1) 11-16. The experiments are carried out using a triple-quadrupole mass spectrometer interfaced with an electrospray ionization (ESI) ion source (Figure 2). For each peptide sample, several reference acids are selected. The reference acids are structurally similar organic compounds with known gas-phase acidities. A solution of the mixture of the peptide and a reference acid is introduced into the mass spectrometer, and a gas-phase proton-bound anionic cluster of peptide-reference acid is formed. The proton-bound cluster is mass isolated and subsequently fragmented via collision-induced dissociation (CID) experiments. The resulting fragment ion abundances are analyzed using a relationship between the acidities and the cluster ion dissociation kinetics. The gas-phase acidity of the peptide is then obtained by linear regression of the thermo-kinetic plots 17,18.
The method can be applied to a variety of molecular systems, including organic compounds, amino acids and their derivatives, oligonucleotides, and oligopeptides. By comparing the gas-phase acidities measured experimentally with those values calculated for different conformers, conformational effects on the acidities can be evaluated.

The determination of the gas-phase acidities of cysteine-containing oligopeptides is described. The experiments are performed using a triple quadrupole mass spectrometer. The relative acidities of the peptides are measured using collision-induced dissociation experiments, and the quantitative acidities are determined using the extended Cooks kinetic method.

Oligopeptidlerin Gaz fazlı asitliğe belirlenmesi

Amino acid residues located at different positions in folded proteins often exhibit different degrees of acidities. For example, a cysteine residue ...

Kimya

Split-and-pool Synthesis and Characterization of Peptide Tertiary Amide Library

Peptidomimetics are great sources of protein ligands. The oligomeric nature of these compounds enables us to access large synthetic libraries on solid phase by using combinatorial chemistry. One of the most well studied classes of peptidomimetics is peptoids. Peptoids are easy to synthesize and have been shown to be proteolysis-resistant and cell-permeable. Over the past decade, many useful protein ligands have been identified through screening of peptoid libraries. However, most of the ligands identified from peptoid libraries do not display high affinity, with rare exceptions. This may be due, in part, to the lack of chiral centers and conformational constraints in peptoid molecules. Recently, we described a new synthetic route to access peptide tertiary amides (PTAs). PTAs are a superfamily of peptidomimetics that include but are not limited to peptides, peptoids and N-methylated peptides. With side chains on both &#945;-carbon and main chain nitrogen atoms, the conformation of these molecules are greatly constrained by sterical hindrance and allylic 1,3 strain. (Figure 1) Our study suggests that these PTA molecules are highly structured in solution and can be used to identify protein ligands. We believe that these molecules can be a future source of high-affinity protein ligands. Here we describe the synthetic method combining the power of both split-and-pool and sub-monomer strategies to synthesize a sample one-bead one-compound (OBOC) library of PTAs.

Peptide tertiary amides (PTAs) are a superfamily of peptidomimetics that include but are not limited to peptides, peptoids and N-methylated peptides. Here we describe a synthetic method which combines&#160;both split-and-pool and sub-monomer strategies to synthesize a one-bead one-compound library of PTAs.

Split-ve-havuz Sentezi ve Peptit Tersiyer Amid Kütüphanesi Karakterizasyonu

Peptidomimetics are great sources of protein ligands. The oligomeric nature of these compounds enables us to access large synthetic libraries on solid ...

Quantitative Detection of Trace Explosive Vapors by Programmed Temperature Desorption Gas Chromatography-Electron Capture Detector

The direct liquid deposition of solution standards onto sorbent-filled thermal desorption tubes is used for the quantitative analysis of trace explosive vapor samples. The direct liquid deposition method yields a higher fidelity between the analysis of vapor samples and the analysis of solution standards than using separate injection methods for vapors and solutions, i.e., samples collected on vapor collection tubes and standards prepared in solution vials. Additionally, the method can account for instrumentation losses, which makes it ideal for minimizing variability and quantitative trace chemical detection. Gas chromatography with an electron capture detector is an instrumentation configuration sensitive to nitro-energetics, such as TNT and RDX, due to their relatively high electron affinity. However, vapor quantitation of these compounds is difficult without viable vapor standards. Thus, we eliminate the requirement for vapor standards by combining the sensitivity of the instrumentation with a direct liquid deposition protocol to analyze trace explosive vapor samples.

Trace explosive vapors of TNT and RDX collected on sorbent-filled thermal desorption tubes were analyzed using a programmed temperature desorption system coupled to GC with an electron capture detector. The instrumental analysis is combined with direct liquid deposition method to reduce sample variability and account for instrumentation drift and losses.

Programlı Sıcaklık Sızdırma Gaz Kromatografi-Elektron Yakalama Dedektörü tarafından Trace Patlayıcı Buharlar Nicel Saptanması

The direct liquid deposition of solution standards onto sorbent-filled thermal desorption tubes is used for the quantitative analysis of trace explosive ...

Supercritical Nitrogen Processing for the Purification of Reactive Porous Materials

Supercritical fluid extraction and drying methods are well established in numerous applications for the synthesis and processing of porous materials. Herein, nitrogen is presented as a novel supercritical drying fluid for specialized applications such as in the processing of reactive porous materials, where carbon dioxide and other fluids are not appropriate due to their higher chemical reactivity. Nitrogen exhibits similar physical properties in the near-critical region of its phase diagram as compared to carbon dioxide: a widely tunable density up to ~1 g ml-1, modest critical pressure (3.4 MPa), and small molecular diameter of ~3.6 &#197;. The key to achieving a high solvation power of nitrogen is to apply a processing temperature in the range of 80-150 K, where the density of nitrogen is an order of magnitude higher than at similar pressures near ambient temperature. The detailed solvation properties of nitrogen, and especially its selectivity, across a wide range of common target species of extraction still require further investigation. Herein we describe a protocol for the supercritical nitrogen processing of porous magnesium borohydride.

Nitrogen is an effective supercritical fluid for extraction or drying processes due to its small molecular size, high density in the near-liquid supercritical regime, and chemical inertness. We present a supercritical nitrogen drying protocol for the purification treatment of reactive, porous materials.

Reaktif Gözenekli Malzemelerin Saflaştırılması Süperkritik Azot İşleme

Supercritical fluid extraction and drying methods are well established in numerous applications for the synthesis and processing of porous materials. ...

A Quantitative Glycomics and Proteomics Combined Purification Strategy

There is a growing desire in the biological and clinical sciences to integrate and correlate multiple classes of biomolecules to unravel biology, define pathways, improve treatment, understand disease, and aid biomarker discovery. N-linked glycosylation is one of the most important and robust post-translational modifications on proteins and regulates critical cell functions such as signaling, adhesion, and enzymatic function. Analytical techniques to purify and analyze N-glycans have remained relatively static over the last decade. While accurate and effective, they commonly require significant expertise and resources. Though some high-throughput purification schemes have been developed, they have yet to find widespread adoption and often rely on the enrichment of glycopeptides. One promising method, developed by Thomas-Oates et al., filter aided N-glycan separation (FANGS), was qualitatively demonstrated on tissues. Herein, we adapted FANGS to plasma and coupled it to the individuality normalization when labeling with glycan hydrazide tags strategy in order to achieve accurate relative quantification by liquid chromatography mass spectrometry and enhanced electrospray ionization. Furthermore, we designed new functionality to the protocol by achieving tandem, shotgun proteomics and glycosylation site analysis on hen plasma. We showed that N-glycans purified on filter and derivatized by hydrophobic hydrazide tags were comparable in terms of abundance and class to those by solid phase extraction (SPE); the latter is considered a gold standard in the field. Importantly, the variability in the two protocols was not statistically different. Proteomic data that was collected in-line with glycomic data had the same depth compared to a standard trypsin digest. Peptide deamidation is minimized in the protocol, limiting non-specific deamidation detected at glycosylation motifs. This allowed for direct glycosylation site analysis, though the protocol can accommodate 18O site labeling as well. Overall, we demonstrated a new in-line high-throughput, unbiased, filter based protocol for quantitative glycomics and proteomics analysis.

A high-throughput protocol was developed for combined proteomics and glycomics purification and LC-MS/MS quantification in plasma. Deamidation analysis of N-linked glycosylation motifs was specific to deglycosylated sites. Accurate quantitation of N-glycans was achieved by coupling filter aided N-glycan separation to the individuality normalization when labeling with glycan hydrazide tags strategy.

Nicel Glycomics ve Proteomik Kombine Arıtma Stratejisi

There is a growing desire in the biological and clinical sciences to integrate and correlate multiple classes of biomolecules to unravel biology, define ...

Protocol for the Synthesis of Ortho-trifluoromethoxylated Aniline Derivatives

Molecules bearing trifluoromethoxy (OCF3) group often show desired pharmacological and biological properties. However, facile synthesis of trifluoromethoxylated aromatic compounds remains a formidable challenge in organic synthesis. Conventional approaches often suffer from poor substrate scope, or require use of highly toxic, difficult-to-handle, and/or thermally labile reagents. Herein, we report a user-friendly protocol for the synthesis of methyl 4-acetamido-3-(trifluoromethoxy)benzoate using 1-trifluoromethyl-1,2-benziodoxol-3(1H)-one (Togni reagent II). Treating methyl 4-(N-hydroxyacetamido)benzoate (1a) with Togni reagent II in the presence of a catalytic amount of cesium carbonate (Cs2CO3) in chloroform at RT afforded methyl 4-(N-(trifluoromethoxy)acetamido)benzoate (2a). This intermediate was then converted to the final product methyl 4-acetamido-3-(trifluoromethoxy)benzoate (3a) in nitromethane at 120 &#176;C. This procedure is general and can be applied to the synthesis of a broad spectrum of ortho-trifluoromethoxylated aniline derivatives, which could serve as useful synthetic building blocks for the discovery and development of new pharmaceuticals, agrochemicals, and functional materials.

Protocol for the Synthesis of Ortho-trifluoromethoxylated Aniline Derivatives

An operationally simple procedure for the synthesis of ortho-trifluoromethoxylated aniline derivatives via a two-step sequence of O-trifluoromethylation of N-aryl-N-hydroxyacetamide followed by thermally induced intramolecular OCF3-migration is reported.

Sentezi İçin Protokol<em&gt; Ortho</em&gt; -trifluoromethoxylated Anilin türevleri

Molecules bearing trifluoromethoxy (OCF3) group often show desired pharmacological and biological properties. However, facile synthesis of ...

Synthesis of Protein Bioconjugates via Cysteine-maleimide Chemistry

The chemical linking or bioconjugation of proteins to fluorescent dyes, drugs, polymers and other proteins has a broad range of applications, such as the development of antibody drug conjugates (ADCs) and nanomedicine, fluorescent microscopy and systems chemistry. For many of these applications, specificity of the bioconjugation method used is of prime concern. The Michael addition of maleimides with cysteine(s) on the target proteins is highly selective and proceeds rapidly under mild conditions, making it one of the most popular methods for protein bioconjugation.
We demonstrate here the modification of the only surface-accessible cysteine residue on yeast cytochrome c with a ruthenium(II) bisterpyridine maleimide. The protein bioconjugation is verified by gel electrophoresis and purified by aqueous-based fast protein liquid chromatography in 27% yield of isolated protein material. Structural characterization with MALDI-TOF MS and UV-Vis is then used to verify that the bioconjugation is successful. The protocol shown here is easily applicable to other cysteine - maleimide coupling of proteins to other proteins, dyes, drugs or polymers.

Synthesis of Protein Bioconjugates via Cysteine-maleimide Chemistry

This protocol details the important steps required for the bioconjugation of a cysteine containing protein to a maleimide, including reagent purification, reaction conditions, bioconjugate purification and bioconjugate characterization.

Protein Bioconjugatlar sentezi<em&gt; yoluyla</em&gt; Sistein-maleimid Kimya

The chemical linking or bioconjugation of proteins to fluorescent dyes, drugs, polymers and other proteins has a broad range of applications, such as the ...

Facile Synthesis of Worm-like Micelles by Visible Light Mediated Dispersion Polymerization Using Photoredox Catalyst

Presented herein is a protocol for the facile synthesis of worm-like micelles by visible light mediated dispersion polymerization. This approach begins with the synthesis of a hydrophilic poly(oligo(ethylene glycol) methyl ether methacrylate) (POEGMA) homopolymer using reversible addition-fragmentation chain-transfer (RAFT) polymerization. Under mild visible light irradiation (&#955; = 460 nm, 0.7 mW/cm2), this macro-chain transfer agent (macro-CTA) in the presence of a ruthenium based photoredox catalyst, Ru(bpy)3Cl2 can be chain extended with a second monomer to form a well-defined block copolymer in a process known as Photoinduced Electron Transfer RAFT (PET-RAFT). When PET-RAFT is used to chain extend POEGMA with benzyl methacrylate (BzMA) in ethanol (EtOH), polymeric nanoparticles with different morphologies are formed in situ according to a polymerization-induced self-assembly (PISA) mechanism. Self-assembly into nanoparticles presenting POEGMA chains at the corona and poly(benzyl methacrylate) (PBzMA) chains in the core occurs in situ due to the growing insolubility of the PBzMA block in ethanol. Interestingly, the formation of highly pure worm-like micelles can be readily monitored by observing the onset of a highly viscous gel in situ due to nanoparticle entanglements occurring during the polymerization. This process thereby allows for a more reproducible synthesis of worm-like micelles simply by monitoring the solution viscosity during the course of the polymerization. In addition, the light stimulus can be intermittently applied in an ON/OFF manner demonstrating temporal control over the nanoparticle morphology.

This article describes a process for producing polymeric self-assembled nanoparticles using visible light mediated dispersion polymerization. Using low energy visible light to control the polymerization allows for the reproducible formation of self-assembled worm-like micelles at high solids content.

Photoredox Katalizörü kullanarak görünür ışık aracılığı ile dispersiyon polimerleştirilmesi ile solucan gibi miseller Facile sentezi

Presented herein is a protocol for the facile synthesis of worm-like micelles by visible light mediated dispersion polymerization. This approach begins ...

Protocol for the Solid-phase Synthesis of Oligomers of RNA Containing a 2'-O-thiophenylmethyl Modification and Characterization via Circular Dichroism

Solid-phase synthesis has been used to obtain canonical and modified polymers of nucleic acids, specifically of DNA or RNA, which has made it a popular methodology for applications in various fields and for different research purposes. The procedure described herein focuses on the synthesis, purification, and characterization of dodecamers of RNA 5&#39;-[CUA CGG AAU CAU]-3&#39; containing zero, one, or two modifications located at the C2&#39;-O-position. The probes are based on 2-thiophenylmethyl groups, incorporated into RNA nucleotides via standard organic synthesis and introduced into the corresponding oligonucleotides via their respective phosphoramidites. This report makes use of phosphoramidite chemistry via the four canonical nucleobases (Uridine (U), Cytosine (C), Guanosine (G), Adenosine (A)), as well as 2-thiophenylmethyl functionalized nucleotides modified at the 2&#39;-O-position; however, the methodology is amenable for a large variety of modifications that have been developed over the years. The oligonucleotides were synthesized on a controlled-pore glass (CPG) support followed by cleavage from the resin and deprotection under standard conditions, i.e., a mixture of ammonia and methylamine (AMA) followed by hydrogen fluoride/triethylamine/N-methylpyrrolidinone. The corresponding oligonucleotides were purified via polyacrylamide electrophoresis (20% denaturing) followed by elution, desalting, and isolation via reversed-phase chromatography (Sep-pak, C18-column). Quantification and structural parameters were assessed via ultraviolet-visible (UV-vis) and circular dichroism (CD) photometric analysis, respectively. This report aims to serve as a resource and guide for beginner and expert researchers interested in embarking in this field. It is expected to serve as a work-in-progress as new technologies and methodologies are developed. The description of the methodologies and techniques within this document correspond to a DNA/RNA synthesizer (refurbished and purchased in 2013) that uses phosphoramidite chemistry.

Protocol for the Solid-phase Synthesis of Oligomers of RNA Containing a 2&#039;-O-thiophenylmethyl Modification and Characterization via Circular Dichroism

This article provides a detailed procedure on the solid-phase synthesis, purification, and characterization of dodecamers of RNA modified at the C2&#39;-O-position. UV-vis and circular dichroism photometric analyses are used to quantify and characterize structural aspects, i.e., single-strands or double-strands.

Bir 2&#39;-amino asit içeren RNA Oligomerlerinin Katı Faz Sentezi Protokolü<em&gt; Ç</em&gt; Tiyofenilmetil Değiştirme ve Sirküler Dikroizm ile Karakterizasyonlar

Solid-phase synthesis has been used to obtain canonical and modified polymers of nucleic acids, specifically of DNA or RNA, which has made it a popular ...

Synthesis and Mass Spectrometry Analysis of Oligo-peptoids

Peptoids are sequence-controlled peptide-mimicking oligomers consisting of N-alkylated glycine units. Among many potential applications, peptoids have been thought of as a type of molecular information storage. Mass spectrometry analysis has been considered the method of choice for sequencing peptoids. Peptoids can be synthesized via solid phase chemistry using a repeating two-step reaction cycle. Here we present a method to manually synthesize oligo-peptoids and to analyze the sequence of the peptoids using tandem mass spectrometry (MS/MS) techniques. The sample peptoid is a nonamer consisting of alternating N-(2-methyloxyethyl)glycine (Nme) and N-(2-phenylethyl)glycine (Npe), as well as an N-(2-aminoethyl)glycine (Nae) at the N-terminus. The sequence formula of the peptoid is Ac-Nae-(Npe-Nme)4-NH2, where Ac is the acetyl group. The synthesis takes place in a commercially available solid-phase reaction vessel. The rink amide resin is used as the solid support to yield the peptoid with an amide group at the C-terminus. The resulting peptoid product is subjected to sequence analysis using a triple-quadrupole mass spectrometer coupled to an electrospray ionization source. The MS/MS measurement produces a spectrum of fragment ions resulting from the dissociation of charged peptoid. The fragment ions are sorted out based on the values of their mass-to-charge ratio (m/z). The m/z values of the fragment ions are compared against the nominal masses of theoretically predicted fragment ions, according to the scheme of peptoid fragmentation. The analysis generates a fragmentation pattern of the charged peptoid. The fragmentation pattern is correlated to the monomer sequence of the neutral peptoid. In this regard, MS analysis reads out the sequence information of the peptoids.

A protocol is described for the manual synthesis of oligo-peptoids followed by sequence analysis by mass spectrometry.

Sentez ve kütle spektrometresi analizleri Oligo-peptoids

Peptoids are sequence-controlled peptide-mimicking oligomers consisting of N-alkylated glycine units. Among many potential applications, peptoids have ...