עבודה זו נתמכה על ידי NIA R00 AG053412 (KEF).

כל ההליכים בוצעו בהתאם להמלצות במדריך לטיפול ושימוש בחיות מעבדה של המכונים הלאומיים לבריאות ובהתאם לעקרונות המנחים הבינלאומיים למחקר ביו-רפואי הכוללים בעלי חיים. הפרוטוקול אושר על ידי אוניברסיטת צפון קרוליינה בוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים בשארלוט (פרוטוקול #19-020).
1. הכנה לתרבות
הערה: נהלים אלה צריכים להיעשות בתנאים סטריליים בארון biosafety ייעודי לתרבות הרקמות. ראה טבלה 1 לקבלת מדיה ופתרונות.
<ol><li>לעקר את כל כלי הניתוח על ידי autoclaving בשקיות עיקור עצמי.</li>
	<li>הכינו מלאי עובד של פולי-די-לידין לטיפול במנות תרבות של 12 בארות.<ol>
<li>להמיס פולי-D-ליצין ב 1x בוראט חוצץ לריכוז של 100 מיקרוגרם / מ"ל (מרוכז 10x). לאחסן כ 1 מ"ל aliquots ב -20 מעלות צלזיוס עד הצורך.</li>
		<li>לדלל 10x מרוכז פולי-D-ליסין ב dPBS ל 10 מיקרוגרם / מ"ל (1x) ומסנן לעקר.</li>
		<li>לטפל צלחות תרבות 12-well עם 0.5 מ"ל לכל באר של 1x פולי-D-לידין בטמפרטורת החדר לפחות 1 שעה או לילה לשימוש למחרת. ודא שנפח הפולי-די-לידין מספיק כדי לכסות באופן מלא את החלק התחתון של אזור התרבות.</li>
		<li>רגע לפני השימוש, יש להסיר פולי-די-ליסין מלוח התרבות, לשטוף פי 3 במים סטריליים ולשמור במים סטריליים עד שהם מוכנים לצלחת. הסר את כל העקבות של נוזל על ידי שאיפה יסודית לפני ציפוי תאים.</li>
	</ol>
</li>
	<li>הכן מדיה צמיחה נוירון ומאגר FACS. מסננים מעוקרים ומאחסנים ב-4°C עד לשימוש. נוירון צמיחה מדיה ניתן לשמור על כ 2 wks; ניתן לשמור מאגר FACS למשך כ- 4 wks.</li>
</ol>2. ניתוח היפוקמפוס עוברי
הערה: הליך זה יכול להתבצע על הספסל כפי שהוא דורש שימוש במיקרוסקופ סטריאו להסרת קרום ומיקרו-דיסקציה של ההיפוקמפוס. לדבוק בטכניקה אספטית קפדנית כדי למזער את הזיהום הפוטנציאלי.
<ol><li>המתת חסד עכבר נקבה C57BL/6J מתוזמן בהריון ביום העוברי 18 בתא CO2.</li>
	<li>לרסס את עור הבטן ואת הפרווה עם 70% EtOH, ואז לצבוט את העור עם מלקחיים רקמה ולעשות חתך קטן עם מספריים כירורגיים. להסית את הצפק כדי לחשוף את הקרביים והרחם.</li>
	<li>לתפוס את הרחם עם מלקחיים דפוס סטנדרטי, להרים מתוך החלל, לחתוך את החיבור mesometrium עם מספריים בסדר. מעבירים את הרחם עם עוברים לתרבית פלסטיק סטרילית 100 מ"מ המונחת על קרח.</li>
	<li>בעזרת מספריים עדינות ומלקחיים עדינים, חותכים בזהירות את הרחם ומסירים את השק העוברי כדי לשחרר עוברים. מעבירים עוברים לתבשיל חדש של תרבית פלסטיק סטרילית 100 מ"מ המכיל dPBS המונח על קרח.</li>
	<li>ערפו את ראשם של גורים עובריים באמצעות מספריים דקים, והעבירו ראשים לתבנית חדשה של 100 מ"מ בתרבית פלסטיק סטרילית המכילה מדיום Hibernate-E המונח על קרח.</li>
	<li>כדי להסיר את המוח, להחזיק את הראש עם זוג מלקחיים בסדר ביד אחת. באמצעות מלקחיים #7 מעוקלים של Dumont ביד השנייה, הכנס את קצה המלקחיים בבסיס הגולגולת וצבוט את העצם ואת העור overlying נע במהירות לאורך קו האמצע מבלי לנקב את המוח.</li>
	<li>שימוש במלקחיים מעוגלים מפרק את העור והגולגולת כדי לחשוף את המוח. לטאטא את המלקחיים המעוקלים מתחת למוח מנורת הריח החשופה למוח הקטן כדי להרים את המוח מהגולגולת. מעבירים את המוח לתבשיל חדש של 100 מ"מ בתרבית פלסטיק סטרילית המכילה מדיום Hibernate-E המונח על קרח. חזור על הפעולה עבור כל מוח. הערה: ניתן לאסוף את כל המוחות בצלחת תרבות אחת, אלא אם כן יש צורך להפריד למטרות ספציפיות לניסוי.</li>
	<li>תחת מיקרוסקופ ניתוח סטריאו, עובד עם מוח אחד בכל פעם ושני זוגות של מלקחיים #5 דומונט סטריליים, לצבוט את נורות הריח ולהרחיק קרום המוח. הסרה יסודית של קרום המוח יש צורך למנוע זיהום תרבות על ידי תאים אחרים כדי לאפשר ניתוח נוסף.</li>
	<li>לאחר קרום המוח מוסרים כראוי, הצד העליון של קליפת המוח נפתח לרוחב, אשר יחשוף את ההיפוקמפוס. באמצעות מלקחיים #5 Dumont, לצבוט את ההיפוקמפוס הרחק קליפת המוח המצורפת, ולהעביר בזהירות היפוקמפוס מבודד לצינור חרוט סטרילי 15 מ"ל המכיל 5 מ"ל של מדיום Hibernate-E על קרח.</li>
	<li>חזור על הניתוח עבור שתי ההמיספרות במוח עבור כל גור עכבר עוברי ולשלב את כל ההיפוקמפי לתוך צינור חרוט אחד 15 מ"ל, אלא אם כן יש צורך בנפרד למטרות ספציפיות לניסוי.<ol>
<li>לנוירונים קליפתיים תרבותיים, קליפת המוח עשויה להיות מופרדת מתת-קליפת המוח ומעובדת באופן זהה לנוירונים בהיפוקמפוס. הערה: בשלב זה, ניתן להשהות את הפרוטוקול. אחסן מוחות או היפוקמפי מנותח במדיום Hibernate-E בתוספת B27 (2%) ב 4 °C (69 °F) עד חודש אחד, אם כי עיכוב ממושך עלול לסכן את מספר התאים קיימא.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. ניתוק ופולחן נוירונים בהיפוקמפוס
הערה: כל ההליכים צריכים להתבצע בתנאים סטריליים בארון biosafety ייעודי לתרבות רקמות.
<ol><li>הכן 0.5 מ"ל של פתרון דיסוציאציה פפאין לכל עובר לניתוק ההיפוקמפוס. נפח פתרון הדיסוציאציה הדרוש ישתנה בהתאם למספר המוחות העובריים המנותחים. הערה: לתרבות הנוירונים בקליפת המוח, הכינו 1.0 מ"ל של תמיסת פפאין לעובר.<ol>
<li>להמיס 20 μL של השעיית פפאין לכל 1 מ"ל של מדיום E תרדמה על ידי מערבולת במשך כ 3 דקות.</li>
		<li>לאחר פפאין מומס, להוסיף 1 μL של DNase אני לכל 1 מ"ל של הפתרון. אל מערבולת הפתרון לאחר DNase אני נוסף כמו זה יכול להשבית את האנזים.</li>
	</ol>
</li>
	<li>צינור חרוט צנטריפוגה 15 מ"ל המכיל רקמת היפוקמפוס (שלב 2.10) ב 1, 000 x g במשך 5 דקות. הסר את supernatant ולהוסיף פתרון פפאין. Resuspend את הרקמה על ידי היפוך מספר פעמים. דגירה ב 37 מעלות צלזיוס במשך 30 דקות, היפוך כדי resuspend הרקמה כל 10 דקות.<ol>
<li>אם אתם מטפחים נוירונים קליפתיים, העבירו את כל קליפות המוח לתבשיל תרבות סטרילי חדש של 100 מ"מ, שאפתו בזהירות מדיה מהצלחת, וטחנו רקמת בשר טחון עם מספריים עדינות או סכין גילוח. הוסף פתרון פפאין לצלחת התרבות ולהעביר רקמת קליפת המוח עם פתרון פפאין לצינור חרוט 15 מ"ל באמצעות פיפטה העברה סטרילית. דגירה רקמה ותמיסת אנזים ב 37 °C (60 °F) במשך 30 דקות, נסער כל 10 דקות.</li>
	</ol>
</li>
	<li>במהלך 30 דקות דגירה, להכין 3 פיפטות פסטר זכוכית מלוטשת אש: 1 פתוח לחלוטין, 1 חצי פתוח, ו 1 רבע פתוח.</li>
	<li>לאחר הדגירה של 30 דקות, צנטריפוגה צינור חרוט 15 מ"ל המכיל רקמות מוח מתעכל ב 125 x g במשך 10 דקות. הסר את פתרון האנזים והחלף בנפח שווה של מדיום Hibernate E טרי.</li>
	<li>באמצעות פיפטה פסטר פתוחה לחלוטין, triturate הרקמה 10x. תן לרקמה להסתפק 2 דקות, ולאחר מכן להעביר את השעיית התא supernatant לצינור חרוט סטרילי 50 מ"ל. הוסף נפח שווה של מדיום Hibernate E בחזרה לרקמה.</li>
	<li>שימוש חצי פתוח פסטר פיפטה, רקמת triturate 10x. תן לרקמה להסתפק 2 דקות, ולאחר מכן להעביר את ההשעיה תא supernatant לאותו צינור חרוט 50 מ"ל כמו בשלב הקודם. הוסף נפח שווה של מדיום Hibernate E בחזרה לרקמה.</li>
	<li>באמצעות רבע פתוח פסטר פיפטה, רקמת triturate 10x. תן לרקמה להסתפק 2 דקות, ואז להעביר את השעיית התא supernatant שוב לאותו חרוט 50 מ"ל כמו בשלבים קודמים. השלך את כל הרקמות שנותרו שלא ניתזו.</li>
	<li>צנטריפוגה הצינור חרוט 50 מ"ל המכיל את supernatant מן התא השעיה ב 125 x g במשך 5 דקות. אם עדיין לא נעשה, לשטוף צלחות מצופות פולי-D-ליצין עם מים סטריליים ולהסיר את כל עקבות של נוזל על ידי שאיפה יסודית במהלך צנטריפוגה.</li>
	<li>לאחר צנטריפוגה, להשליך את supernatant ו resuspend גלולה התא ב 5 מ"ל של נוירון צמיחה מדיה. לספור תאים חיים באמצעות כחול trypan ו hemocytometer.<ol>
<li>אם culturing נוירונים קליפת המוח, להוסיף לפחות 10 מ"ל של נוירון צמיחה מדיה עבור תאים צפופים פחות ספירה מדויקת יותר.</li>
	</ol>
</li>
	<li>לדלל תאים עם נוירון צמיחה מדיה עבור צפיפות ציפוי סופית של 5 x 105 תאים קיימא לכל מיליליטר ולהוסיף 1 מ"ל של השעיית תא מדולל לכל באר של צלחת 12 היטב. לשמור על נוירונים ב 37 °C (69 °F) עם 5% CO2. הערה: בדרך כלל, ההיפוקמפי ממוח עכבר עוברי אחד, כלומר, 2 היפוקמפי, מניב כ 1 x 106 תאים קיימא. מספר זה מסופק למטרות תכנון ניסויים בלבד ואין לראות בו תחליף לספירת תאים עבור כל תרבות.</li>
	<li>לשנות את מדיה הצמיחה יום אחרי תרבות על ידי הסרת מחצית נפח המדיה מכל באר, כלומר, 0.5 מ"ל, ולהוסיף נפח שווה של מדיה טרייה לצד של הבאר, כדי למנוע שיבוש התאים התרבותיים. חצי מדיה שלמה משתנה פעמיים בשבוע לתוחלת החיים של התרבות.</li>
</ol>4. הערכת ביטוי MHCI על ידי ציטומטריית זרימה
<ol><li>הכן טיפול על ידי דילול אינטרפרון בטא (IFNβ) או נפח שווה של diluent במדיה צמיחה נוירון. מאז שינוי מדיה יהיה שינוי חצי נפח, להכין את מדיית הטיפול עם 2x מרוכז IFNβ. כלומר, כדי לטפל 3 בארות של צלחת 12 גם עם 100 U / mL של IFNβ, להכין 1.5 מ"ל עם 200 U / mL IFNβ או נפח שווה של IFNβ diluent עבור פקדים שטופלו במדיה.</li>
	<li>הסר 0.5 מ"ל מכל באר של נוירונים ולהוסיף 0.5 מ"ל של נוירון צמיחה מדיה עם או בלי IFNβ לכל באר. דגירה בתנאי צמיחה רגילים (37 °C (37 °C, 5% CO2) עבור 6-72 שעות, בהתאם לתנאים ניסיוניים ואופטימיזציה אות.</li>
	<li>לאחר זמן הטיפול, להסיר את כל המדיה התרבותית בעדינות לשטוף פעם אחת במדיה נוירובאסלית קרה חסר תוספי מזון (B27, L-גלוטמין, עט-סטרפטוקוקוס).</li>
	<li>הוסף 0.5 מ"ל של מדיה נוירובסלית קרה ללא תוספת המכילה 1 מיקרוגרם / מ"ל של בלוק Fc ו 1 מיקרוגרם / מ"ל של נוגדן פלואורסצנטי מצומד נגד MHCI לכל באר. דגירה ב 4 מעלות צלזיוס מוגן מפני אור במשך 45 דקות.</li>
	<li>הסר מדיה המכילה נוגדנים ולשטוף בזהירות פעם אחת dPBS קר. הוסיפו 0.5 מ"ל של מאגר ניתוק תאים ללא אנזימים בטמפרטורת חדר לכל באר והתסיסו כדי לעקור תאים. היזהר דיסוציאציה באמצעות מיקרוסקופ תרבית רקמות הפוכה.</li>
	<li>לאחר התאים מנותקים צלחת תרבות, להוסיף 0.5 מ"ל של מאגר FACS לכל באר, תאים triturate לפזר גושים, ולהעביר את הנפח הכולל של כל באר בודדים 1.7 mL microcentrifuge צינורות.</li>
	<li>צנטריפוגה ב 1, 000 x g במשך 5 דקות. הסר את supernatant, resuspend גלולת התא ב 100 μL של מאגר FACS, ולהעביר את הנפח הכולל של כל צינור בארות בודדות של צלחת 96 גם U-bottom.</li>
	<li>הוסף 100 μL של מגיב מתקנת לכל באר. Triturate מספר פעמים כדי למנוע תאים גושים דגירה במשך 15 דקות בטמפרטורת החדר מוגן מפני אור.</li>
	<li>צנטריפוגה ב 500 x גרם במשך 5 דקות. הסר את supernatant ו לשימוש חוזר ב 200 μl של מאגר FACS.</li>
	<li>צנטריפוגה ב 500 x גרם במשך 5 דקות. הסר את supernatant ו resuspend ב 100 μL של ריאגנט permeabilization המכיל נוגדן פלואורסצנטי מצומד נגד NeuN (1:100 דילול) לכל באר. מערבבים היטב, ואז דגירה בטמפרטורת החדר מוגן מפני אור עם נדנדה במשך 20 דקות.</li>
	<li>לאחר הדגירה, צנטריפוגה ב 500 x g במשך 5 דקות. הסר את supernatant ו לשימוש חוזר ב 100 μL של מאגר FACS. חזור על 2x.</li>
	<li>לאחר הכביסה הסופית, resuspend תאים ב 100 μL של 2% paraformaldehyde מדולל במאגר FACS. מערבבים היטב כדי למנוע תאים מגושם. יש לאחסן ב-4°C מוגן מפני אור עד שהוא מוכן לקריאה על ציטומטר זרימה. קרא דגימות בהקדם האפשרי, בתוך שבוע.</li>
</ol>5. כימות והערכת נתונים
<ol><li>למדוד את פקדי הפיצוי עבור כל צבע פלואורסצנטי ולתקן כל חפיפה ספקטרלית. בקרות פיצוי אידיאליות כוללות נוירונים תרבותיים שאינם מוכתמים, מוכתמים באנטי-MHCI בלבד ומוכתמים באנטי-נויN בלבד.</li>
	<li>במידת האפשר, רשום 100,000 אירועים עבור כל מדגם (לפחות 10,000) ושמור כקבצי FCS.</li>
	<li>כדי לנתח נתונים, באמצעות תוכנת ניתוח מתאימה, הגדר שערים רציפים, כמתואר באיור 1A-C לבחירה עבור נוירונים חיוביים של NeuN.<ol>
<li>התווה SSC-A (יומן) לעומת FSC-A (ליניארי). צייר שער על האוכלוסייה הסלולרית (P1) כדי לחסל פסולת הסלולר מהניתוח.</li>
		<li>בתוך אוכלוסיית הסלולר P1, התווה FSC-H (ליניארי) לעומת FSC-A (ליניארי). צייר שער על אוכלוסיית תא יחיד.</li>
		<li>בתוך אוכלוסיית התאים הבודדים, התווה SSC-A (יומן) לעומת NeuN (יומן רישום). צייר שער על אוכלוסייה חיובית של NeuN באמצעות תאים מוכתמים או מוכתמים ב- MHCI בלבד כמדריך.</li>
		<li>התווה היסטוגרמה של פלואורסצנטיות MHCI עם אירועים סלולריים מנורמלים למצב על ציר y. באמצעות נוירונים מוכתמים או מוכתמים ב- NeuN בלבד כמדריך, צייר שער אופקי כדי לכמת את אחוז הנוירונים החיוביים עבור MHCI.</li>
		<li>יצא את תאי האחוזים החיוביים עבור MHCI, כמו גם את עוצמת הפלואורסצנטיות החציונית (MFI) עבור MHCI באוכלוסייה החיובית של NeuN להערכה סטטיסטית ולציור גרפי.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol>
	<li>Galea, I., Bechmann, I., Perry, V. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=What+is+immune+privilege+(not).">What is immune privilege (not).</a> Trends in Immunology. 28 (1), 12-18 (2007).</li><li>Morimoto, K., Nakajima, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Role+of+the+Immune+System+in+the+Development+of+the+Central+Nervous+System.">Role of the Immune System in the Development of the Central Nervous System.</a> Frontiers in Neuroscience. 13, 916 (2019).</li><li>Klein, R. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neuroinflammation+During+RNA+Viral+Infections.">Neuroinflammation During RNA Viral Infections.</a> Annual Review of Immunology. 37, 73-95 (2019).</li><li>Janeway, C. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+T+cell+receptor+as+a+multicomponent+signalling+machine:+CD4/CD8+coreceptors+and+CD45+in+T+cell+activation.">The T cell receptor as a multicomponent signalling machine: CD4/CD8 coreceptors and CD45 in T cell activation.</a> Annual Review of Immunology. 10, 645-674 (1992).</li><li>Peaper, D. R., Cresswell, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+MHC+class+I+assembly+and+peptide+binding.">Regulation of MHC class I assembly and peptide binding.</a> Annual Review of Cell and Developmental Biology. 24, 343-368 (2008).</li><li>Donaldson, J. G., Williams, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intracellular+Assembly+and+Trafficking+of+MHC+Class+I+Molecules.">Intracellular Assembly and Trafficking of MHC Class I Molecules.</a> Traffic. 10 (12), 1745-1752 (2009).</li><li>Charles, A., Janeway, J., Travers, P., Walport, M., Shlomchik, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=T+cell-mediated+cytotoxicity.">T cell-mediated cytotoxicity.</a> Immunobiology: The Immune System in Health and Disease. 5th edition. , (2001).</li><li>Guidotti, L. G., Chisari, F. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Noncytolytic+control+of+viral+infections+by+the+innate+and+adaptive+immune+response.">Noncytolytic control of viral infections by the innate and adaptive immune response.</a> Annual Review of Immunology. 19, 65-91 (2001).</li><li>Chevalier, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neurons+are+MHC+class+I-dependent+targets+for+CD8+T+cells+upon+neurotropic+viral+infection.">Neurons are MHC class I-dependent targets for CD8 T cells upon neurotropic viral infection.</a> PLoS Pathogens. 7 (11), 1002393 (2011).</li><li>Shrestha, B., Diamond, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Role+of+CD8++T+Cells+in+Control+of+West+Nile+Virus+Infection.">Role of CD8+ T Cells in Control of West Nile Virus Infection.</a> Journal of Virology. 78 (15), 8312-8321 (2004).</li><li>Plaisted, W. C., Weinger, J. G., Walsh, C. M., Lane, T. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=T+cell+mediated+suppression+of+neurotropic+coronavirus+replication+in+neural+precursor+cells.">T cell mediated suppression of neurotropic coronavirus replication in neural precursor cells.</a> Virology. 449, 235-243 (2014).</li><li>Marten, N. W., Stohlman, S. A., Zhou, J., Bergmann, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinetics+of+virus-specific+CD8++-T-cell+expansion+and+trafficking+following+central+nervous+system+infection.">Kinetics of virus-specific CD8+ -T-cell expansion and trafficking following central nervous system infection.</a> Journal of Virology. 77 (4), 2775-2778 (2003).</li><li>Shatz, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MHC+class+I:+an+unexpected+role+in+neuronal+plasticity.">MHC class I: an unexpected role in neuronal plasticity.</a> Neuron. 64 (1), 40-45 (2009).</li><li>Corriveau, R. A., Huh, G. S., Shatz, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+class+I+MHC+gene+expression+in+the+developing+and+mature+CNS+by+neural+activity.">Regulation of class I MHC gene expression in the developing and mature CNS by neural activity.</a> Neuron. 21 (3), 505-520 (1998).</li><li>Goddard, C. A., Butts, D. A., Shatz, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+CNS+synapses+by+neuronal+MHC+class+I.">Regulation of CNS synapses by neuronal MHC class I.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104 (16), 6828-6833 (2007).</li><li>Needleman, L. A., Liu, X. B., El-Sabeawy, F., Jones, E. G., McAllister, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MHC+class+I+molecules+are+present+both+pre-+and+postsynaptically+in+the+visual+cortex+during+postnatal+development+and+in+adulthood.">MHC class I molecules are present both pre- and postsynaptically in the visual cortex during postnatal development and in adulthood.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (39), 16999-17004 (2010).</li><li>Syken, J., Grandpre, T., Kanold, P. O., Shatz, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PirB+restricts+ocular-dominance+plasticity+in+visual+cortex.">PirB restricts ocular-dominance plasticity in visual cortex.</a> Science. 313 (5794), 1795-1800 (2006).</li><li>Atwal, J. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PirB+is+a+functional+receptor+for+myelin+inhibitors+of+axonal+regeneration.">PirB is a functional receptor for myelin inhibitors of axonal regeneration.</a> Science. 322 (5903), 967-970 (2008).</li><li>Takai, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Paired+immunoglobulin-like+receptors+and+their+MHC+class+I+recognition.">Paired immunoglobulin-like receptors and their MHC class I recognition.</a> Immunology. 115 (4), 433-440 (2005).</li><li>Lee, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synapse+elimination+and+learning+rules+co-regulated+by+MHC+class+I+H2-Db.">Synapse elimination and learning rules co-regulated by MHC class I H2-Db.</a> Nature. 509 (7499), 195-200 (2014).</li><li>Ribic, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Activity-dependent+regulation+of+MHC+class+I+expression+in+the+developing+primary+visual+cortex+of+the+common+marmoset+monkey.">Activity-dependent regulation of MHC class I expression in the developing primary visual cortex of the common marmoset monkey.</a> Behavioral and Brain Functions. 7, 1 (2011).</li><li>Sahu, M. P., Nikkil&#228;, O., L&#229;gas, S., Kolehmainen, S., Castr&#233;n, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Culturing+primary+neurons+from+rat+hippocampus+and+cortex.">Culturing primary neurons from rat hippocampus and cortex.</a> Neuronal Signaling. 3 (2), (2019).</li><li>Gordon, J., Amini, S., White, M. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=General+overview+of+neuronal+cell+culture.">General overview of neuronal cell culture.</a> Methods in Molecular Biology. 1078, 1-8 (2013).</li><li>Zhang, X., Hu, D., Shang, Y., Qi, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Using+induced+pluripotent+stem+cell+neuronal+models+to+study+neurodegenerative+diseases.">Using induced pluripotent stem cell neuronal models to study neurodegenerative diseases.</a> Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease. 1866 (4), 165431 (2020).</li><li>Berry, B. J., Smith, A. S. T., Young, J. E., Mack, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advances+and+Current+Challenges+Associated+with+the+Use+of+Human+Induced+Pluripotent+Stem+Cells+in+Modeling+Neurodegenerative+Disease.">Advances and Current Challenges Associated with the Use of Human Induced Pluripotent Stem Cells in Modeling Neurodegenerative Disease.</a> Cells, Tissues, Organs. 205 (5-6), 331-349 (2018).</li><li>Ho, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Guide+to+Single-Cell+Transcriptomics+in+Adult+Rodent+Brain:+The+Medium+Spiny+Neuron+Transcriptome+Revisited.">A Guide to Single-Cell Transcriptomics in Adult Rodent Brain: The Medium Spiny Neuron Transcriptome Revisited.</a> Frontiers in Cellular Neuroscience. 12, 159 (2018).</li><li>Panchision, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimized+Flow+Cytometric+Analysis+of+Central+Nervous+System+Tissue+Reveals+Novel+Functional+Relationships+Among+Cells+Expressing+CD133,+CD15,+and+CD24.">Optimized Flow Cytometric Analysis of Central Nervous System Tissue Reveals Novel Functional Relationships Among Cells Expressing CD133, CD15, and CD24.</a> Stem Cells. 25 (6), 1560-1570 (2007).</li><li>Snaidero, N., Simons, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Myelination+at+a+glance.">Myelination at a glance.</a> Journal of Cell Science. 127 (14), 2999-3004 (2014).</li><li>Martin, D., Xu, J., Porretta, C., Nichols, C. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neurocytometry:+Flow+Cytometric+Sorting+of+Specific+Neuronal+Populations+from+Human+and+Rodent+Brain.">Neurocytometry: Flow Cytometric Sorting of Specific Neuronal Populations from Human and Rodent Brain.</a> ACS Chemical Neuroscience. 8 (2), 356-367 (2017).</li><li>Lv, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neuronal+MHC+Class+I+Expression+Is+Regulated+by+Activity+Driven+Calcium+Signaling.">Neuronal MHC Class I Expression Is Regulated by Activity Driven Calcium Signaling.</a> PLoS One. 10 (8), 0135223 (2015).</li><li>Barco, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+expression+profiling+of+facilitated+L-LTP+in+VP16-CREB+mice+reveals+that+BDNF+is+critical+for+the+maintenance+of+LTP+and+its+synaptic+capture.">Gene expression profiling of facilitated L-LTP in VP16-CREB mice reveals that BDNF is critical for the maintenance of LTP and its synaptic capture.</a> Neuron. 48 (1), 123-137 (2005).</li><li>Glynn, M. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MHCI+negatively+regulates+synapse+density+during+the+establishment+of+cortical+connections.">MHCI negatively regulates synapse density during the establishment of cortical connections.</a> Nature Neuroscience. 14 (4), 442-451 (2011).</li><li>Facci, L., Skaper, S. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Culture+of+Rodent+Cortical,+Hippocampal,+and+Striatal+Neurons.">Culture of Rodent Cortical, Hippocampal, and Striatal Neurons.</a> Methods Molecular Biology. 1727, 39-47 (2018).</li></ol>

למחברים אין מה לחשוף.

פרוטוקול זה מתאר את הניתוח והתרבות של נוירונים היפוקמפוס ראשוניים מגורים עכבר טרום לידתי ביום העוברי 18. השימוש בנוירונים ראשוניים בתרבית מכרסמים הוא אחת המתודולוגיות הבסיסיות ביותר שפותחו בנוירוביולוגיה המודרנית22. למרות קווי תאים מונצחים יכולים מודל היבטים מסוימים של נוירונים, הטבע שלהם כמו תאים שמקורם בגידול, כישלון לפתח אקסונים מוגדרים, וחלוקת תאים מתמשכת מעלה ספקות אם הם בנאמנות recapitulate מאפיינים של נוירונים פוסט מיטוטיים vivo23. חלופה נוספת לנוירונים ראשוניים היא השימוש בתאי גזע פלוריפוטנטיים הנגרמים על ידי בני אדם (HiPSCs). הטכנולוגיה לשימוש HiPSCs, במיוחד אלה שמקורם בחולה, התקדם במהירות בשנים האחרונות24. עם זאת, ישנן עדיין מגבלות לעבודה עם HiPSCs כולל שונות בין קווי תאים, חוסר בגרות תפקודית, והבדלים בפרופילים אפיגנטיים25. אמנם יש גם מגבלות לעבודה עם המודל הרדוקציוניסטי של נוירונים מכרסמים ראשוניים, נוירונים תרבותיים לשמור על הטבע הפוסט מיטוטי של נוירונים vivo. כמו כן, כלי הביולוגיה המולקולרית הנרחבים ושינויים גנטיים הזמינים לעכברים מעדיפים את השימוש בנוירונים ראשוניים על פני HiPSCs עבור יישומים רבים, ומחקרי עכברים יכולים להיות מתורגמים בקלות לאורגניזם המורכב יותר ב- vivo מבלי לאבד את המערכת הגנטית הניסיונית. מסיבות אלה, חוקרים רבים משתמשים נוירונים מכרסמים ראשוניים כדי לאמת היבטים מרכזיים, אם לא את עיקר, של המחקר שלהם.
עבור מבחנים מסוימים, נוירונים עשויים להיות מנותחים ישירות לאחר בידוד מן המוח ex vivo. זה רצוי במיוחד עבור ניסויים מעורבים עכברים בוגרים שיכולים להיות כפופים לתנאים ניסיוניים ספציפיים או שעשויים להיות תלויים באינטראקציות של סוגי תאים מרובים; עם זאת, ישנן מספר בעיות המגבילות את סוג הניתוחים שניתן לבצע. זה מאתגר מבחינה טכנית להכין השעיית תא יחיד של נוירונים ממוחם של עכברים בוגרים כי נוירונים מחוברים באופן ייחודי מעוגנת על ידי מיאלין26. שיטות לא אנזימטיות של טריטורציה של רקמות אינן יעילות בניתוק הרקמה ולגרום למוות של תאים, ואילו תכשירים אנזימטיים לעתים קרובות cleave תא אנטיגנים27. יתר על כן, בעוד המיאלין נעדר במידה רבה מעכברים עובריים, הוא מהווה כ -20% מהמוח הבוגר, ויכול לפגוע בבידוד תאים בר קיימא ולעכב ניתוח ציטומטריה זרימה28. רבות מהטכניקות שפותחו בסופו של דבר מפשיטות נוירונים של הציטוסול שלהם ומשאירות גופי תאים קטנים מעוגלים המורכבים בעיקר מגרעינים29. למרות שזה מקובל על כמה ניתוחים, זה לא מתאים לכימות ביטוי חלבון ציטופלזמי או חוץ תאי. יתר על כן, מערכת תרבות התאים ההקציוניסטית מאפשרת לבחון שאלות מקניסטיות ספציפיות בקנה מידה קצר יותר ממה שניתן לעתים קרובות עם מערכת in vivo.
בפרוטוקול זה מתוארות גם שיטות לגירוי ביטוי MHCI תרופתי עם IFNβ, וכימות של ביטוי MHCI חוץ-תאי על ידי ציטומטריית זרימה. גירוי על ידי IFNβ הוא שליטה חיובית שימושית לבדיקת תנאים ניסיוניים אחרים, אבל ניתן לציין כי IFNγ וחומצה kainic יכול גם לעורר ביטוי MHCI בנוירונים9,30, בעוד טטרודוטוקסין מקטין ביטוי MHCI14. שיטות קודמות לגילוי ביטוי MHCI הסתמכו על הכלאה situ וניתוח אימונוהיסטוכימי14,15,20,31. בעוד מבחנים מבוססי mRNA, כגון באתרו הכלאה ו qRT-PCR, יכול לקבוע את לוקליזציה spatiotemporal, ספציפיות סוג התא, ורמות של שעתוק גנים, מבחנים אלה אינם יכולים להעריך תרגום חלבון או להעביר לקרום הפלזמה. ניתוח כתמים אימונוהיסטוכימיים ומערביים יכול לקבוע הבדלים בביטוי החלבון ופוטנציאל לוקליזציה הסלולר אבל יכול להיות קשה לכמת במדויק. יתר על כן, נוגדני MHCI רבים מזהים את המבנה השלישוני של המתחם, והם רגישים מאוד לשינויים קונפורמיים. לכן תנאי חדירה או דנטיזציה לגרום לאובדן של חיסוניות MHCI32. השיטה המוצגת כאן משתמשת ב- situ immunostaining עבור MHCI, המאפשרת הכרה בחלבון על ידי הנוגדן בקונפורמציה הטבעית שלו, ואחריו קיבעון ושיטות חדירה.
עם שינויים קלים, השיטות המתוארות כאן יכולות לשמש לתרבות אוכלוסיות עצביות אחרות או כדי להעריך ביטוי של חלבונים חוץ תאיים אחרים בעלי עניין. ציין בפרוטוקול זה הם שינויים קלים שניתן לבצע על מנת תרבות נוירונים קליפת המוח, אבל השיטות המתוארות כאן עשוי לשמש גם לתרבות אוכלוסיות עצביות אחרות, כגון נוירונים סטריאטליים33. יתר על כן, למרות פרוטוקול זה מציין immunostaining של MHCI ו- NeuN, סמנים סלולריים אחרים ניתן לזהות באופן דומה. באופן כללי, סמנים חוץ תאיים ניתן להתייחס כמו MHCI סמנים תאיים ניתן להתייחס כמו NeuN. עם זאת, יש לציין כי במהלך שלב הניתוק התאי, תחזיות אקסונליות מנותקות מהסומה. מכיוון שאסטרטגיית הגיהוק המוגדרת כאן מסננת פסולת תאית ומתמקדת בסמן גרעיני עצבי NeuN, חלבונים המתבטאים אך ורק בתחזיות אקסונליות לא יזוהו.
עד לאחרונה, נוירונים נחשבו להביע MHCI רק בתגובה נזק, זיהום, או גירוי ציטוקינים במבחנה על מנת לעסוק CD8 ציטוטוקסי+ תאי T9. מחקר חדש הבהיר פונקציה אחרת של MHCI בוויסות קשרים סינפטיים במהלך הפיתוח13. הפרוטוקול המתואר כאן משתמש ב- IFNβ כדי לעורר ביטוי MHCI בנוירונים תרבותיים מסוג בר, אך ניתן להשתמש בשיטות דומות עם מגוון גירויים תאיים או שינויים גנטיים כדי לבדוק השערות ספציפיות. שיטה זו תאפשר לחוקרים לחקור את המנגנונים המולקולריים המווסתים את ביטוי MHCI, אשר ישפרו את ההבנה של התפקיד הדיכוטומי של MHCI בשתי פונקציות תאיות נפרדות אלה.

מערכת העצבים המרכזית (CNS) נחשבה פעם נטולת מעקב חיסוני, המכונה "חיסון מיוחס1." עכשיו ברור כי זכות זו אינה משתווה להיעדר מוחלט של מרכיבים חיסוניים, אלא, תקנה מיוחדת הפועלת כדי להגביל את הנזק הקשורים אימונופתולוגיה1. למעשה, תקשורת בין מערכת העצבים המרכזית לבין המערכת החיסונית היא שיחה מתמשכת הדרושה להתפתחות מוחית בריאה ותגובה לזיהומים2,3.
מולקולות מורכבות היסטו-תאימות עיקריות מסוג I (MHCI) הן חלבוני טרנסממברן פוליגניים ופולימורפיים הידועים בעיקר בשל תפקידם בהצגת פפטידים אנטיגניים לתאי CD8+ T במהלך זיהום4. קומפלקסים קלאסיים של MHCI מורכבים משרשרת α טרנסממבראן ושרשרת אור חוץ-תאית, הנקראת β2-מיקרוגלובולין. שרשרת α מכילה חריץ פולימורפי שקושר פפטיד אנטיגני למצגת5. ביטוי נכון של MHCI על קרום חוץ תאי דורש פעולה מתואמת של מלווים מולקולריים ברשתית אנדופלזמית כדי להבטיח קיפול נאות של שרשרת α ו β2-microglobulin יחד עם טעינה של ליגנד פפטיד זיקה גבוהה5. רק לאחר קומפלקסים MHCI מורכבים, הם מיוצאים מן reticulum אנדופלזמה לקרום הפלזמה6. עם מעורבות של קולטן תא T קוגנייט עם קומפלקס MHCI טעון פפטיד, CD8+ תאי T לתווך הרג תאים על ידי שחרור גרגירים lytic המכילים פרפורין ו granzymes או על ידי גרימת אפופטוזיס באמצעות קשירת קולטן פאס על קרום תא היעד7. בנוסף, תאי CD8+ T מייצרים ציטוקינים, כגון אינטרפרון גמא (IFNγ) וגורם נמק הגידול אלפא (TNFα), אשר יכול להפעיל מנגנונים אנטי ויראליים בתאים נגועים ללא השפעות ציטופתיות8,9. עבור וירוסים נוירוטרופיים רבים, CD8+ תאי T נחוצים כדי לנקות את הזיהום מן מערכת העצבים המרכזית10,11,12.
בעבר חשבו כי נוירונים מבטאים MHCI רק בתנאים של נזק, זיהום ויראלי, או עם גירוי ציטוקינים במבחנה. לאחרונה, מחקר זיהה תפקיד לביטוי עצבי של MHCI בשיפוץ סינפטי פלקסיות13,14. למרות המנגנונים המדויקים שבבסיס ויסות הסינפסה אינם מובנים היטב, הנתונים מצביעים על כך שרמת הביטוי MHCI מוסדרת על ידי פעילות סינפטית15,16. השערה אחת מניחה כי נוירונים מבטאים קולטן B דמוי אימונוגלובולין מזווג (PirB) presynaptically, אשר קושר MHCI transynaptically13,17. אינטראקציה זו יוזמת מפל איתות על ידי PirB המתנגד למסלולים המעורבים בשיפוץ סינפטי, ובכך מחזק ומייצב את החיבור הסינפטי17,18,19. בהיעדר פעילות עצבית, ביטוי MHCI הוא ירד14, ואובדן MHCI תוצאות חיסול סינפסה פגומה ומעגלים סינפטיים מאורגנים20,21.
ההסמכה המתוארת כאן, אשר הותאמה שבלייה ואח'9, משתמש ניתוח ציטומטרי זרימה כדי להעריך כמותית ביטוי חלבון חוץ תאי של MHCI על תרבויות ראשוניות של נוירונים היפוקמפוס מורין. פרוטוקול זה ממחיש את הטכניקות הראשוניות למיקרו-הבחנה של רקמת ההיפוקמפוס מגורי עכבר עובריים. לאחר מכן הוא מפרט תהליכים לניתוק אנזימטי ומכאני של רקמה לתוך השעיית תא יחיד ושיטות לשמירה על התרבויות במבחנה. מכיוון שהם אינם מתחלקים, ברגע שהם בתרבות, נוירונים חייבים להיות מצופים בצלחת וצפיפות המתאימה לנקודת הקצה הניסיונית שלהם. לאחר מכן, הוא מתאר שלבים לגרימת ביטוי MHCI עם אינטרפרון בטא (IFNβ), אימונולה עבור MHCI וסמן גרעיני עצבי NeuN, וניתוח תאים על ידי cytometry זרימה. לבסוף, הוא מתאר נהלים להערכת נתוני cytometry זרימה כדי לזהות נוירונים חיוביים MHCI וכימות רמת הביטוי MHCI. כמו כן צוין בפרוטוקול זה התאמות קטנות שניתן לבצע על מנת תרבות נוירונים קליפת המוח בנוסף או במקום נוירונים בהיפוקמפוס. פרוטוקול זה ניתן לשנות בקלות כדי לבדוק השערות ספציפיות באמצעות וריאציות גנטיות או טיפולים תרופתיים.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>1.5 ml Microcentrifuge Tubes</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>05-408-129</td>
			<td>Laboratory Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>100 mm sterile culture dish</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>FB012924</td>
			<td>Tissue Culture Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>15 ml Centrifuge Tubes</td>
			<td>Genesee</td>
			<td>21-103</td>
			<td>Laboratory Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 ml centrifuge tube</td>
			<td>Genesee</td>
			<td>21-108</td>
			<td>Laboratory Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>500 mM EDTA</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM9260G</td>
			<td>FACS Buffer Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>70% Ethanol</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>BP82031Gal</td>
			<td>Tissue Culture Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96 well U-bottom plate</td>
			<td>Genesee</td>
			<td>25-221</td>
			<td>Flow Cytometry Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>B27</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>17504044</td>
			<td>Neuron Culture Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Borate Buffer</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>28341</td>
			<td>Tissue Culture Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Borosilicate Glass Pasteur Pipette</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>13 678 20C</td>
			<td>Laboratory Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cell Dissociation Buffer</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>13 151 014</td>
			<td>Flow Cytometry Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DNase I</td>
			<td>Thermo</td>
			<td>90083</td>
			<td>Dissociation Solution Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>dPBS</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>14190-235</td>
			<td>Tissue Culture Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dumont #5 Forceps</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>91150-20</td>
			<td>Dissection Tool</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dumont #7 Forceps</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>91197-00</td>
			<td>Dissection Tool</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal Bovine Serum</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>26140079</td>
			<td>Tissue Culture Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fine Forceps</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>91113-10</td>
			<td>Dissection Tool</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fine Scissors</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>91460-11</td>
			<td>Dissection Tool</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fix and Perm Cell Permeabilization Kit</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>GAS003</td>
			<td>Flow Cytometry Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glutamax</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>35050061</td>
			<td>Neuron Culture Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hibernate-E Medium</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>A1247601</td>
			<td>Neuron Culture Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Instant Sealing Sterilization Pouches</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>181254</td>
			<td>Tissue Culture Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Interferon Beta</td>
			<td>PBL Assay Science</td>
			<td>12405-1</td>
			<td>Flow Cytometry Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Milli-Mark Anti-NeuN-PE Antibody, clone A60</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>FCMAB317PE</td>
			<td>Flow Cytometry Antibody</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Neurobasal Media</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>21103049</td>
			<td>Neuron Culture Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pacific Blue anti-mouse H-2Kb Antibody</td>
			<td>BioLegend</td>
			<td>116513</td>
			<td>Flow Cytometry Antibody</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Papain Solution</td>
			<td>Worthington</td>
			<td>LS003126</td>
			<td>Dissociation Solution Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paraformaldehyde</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>15714</td>
			<td>Fixative</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Penicillin-Streptomycin</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>15140122</td>
			<td>Neuron Culture Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Poly-D-Lysine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P7280</td>
			<td>Neuron Culture Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Standard Pattern Forceps</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>91100-12</td>
			<td>Dissection Tool</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stereo dissection microscope</td>
			<td>Swift</td>
			<td>M29TZ-SM99CL-BTW1</td>
			<td>Dissection Tool</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Surgical Scissors</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>91401-10</td>
			<td>Dissection Tool</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Transfer Pipets</td>
			<td>Corning</td>
			<td>357575</td>
			<td>Laboratory Supplies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TruStain FcX (anti-mouse CD16/32) Antibody</td>
			<td>BioLegend</td>
			<td>101319</td>
			<td>Flow Cytometry Antibody</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trypan Blue</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>T8154-100ML</td>
			<td>Tissue Culture Supplies</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

assessing the expression of major histocompatibility complex class i on primary murine hippocampal neurons by flow cytometry

הגדלת הראיות תומכת בהשערה כי אינטראקציות נוירו-חיסוניות משפיעות על תפקוד מערכת העצבים הן במצבים הומיאוסטטיים והן במצבים פתולוגיים. פונקציה נחקרת היטב של המעמד המורכב העיקרי histocompatibility I (MHCI) היא הצגת פפטידים שמקורם בתא למערכת החיסון האדפטיבית, במיוחד בתגובה לזיהום. לאחרונה הוכח כי הביטוי של מולקולות MHCI על נוירונים יכול לווסת שינויים תלויי פעילות בקישוריות הסינפטית במהלך התפתחות נורמלית והפרעות נוירולוגיות. החשיבות של פונקציות אלה לבריאות המוח תומכת בצורך במהלך בדיקה רגישה המזהה בקלות ביטוי MHCI על נוירונים. כאן אנו מתארים שיטה לתרבות העיקרית של נוירונים בהיפוקמפוס מורין ולאחר מכן הערכה של ביטוי MHCI על ידי ניתוח ציטומטרי זרימה. ההיפוקמפוס המורי הוא microdissected מגורי עכבר טרום לידתי ביום העוברי 18. רקמה מנותקת לתוך השעיית תא יחיד באמצעות טכניקות אנזימטיות ומכאניות, ולאחר מכן מתורבת במדיה ללא סרום המגבילה את הצמיחה של תאים לא עצביים. לאחר 7 ימים במבחנה, ביטוי MHCI מגורה על ידי טיפול בתאים מתורבתים פרמקולוגית עם אינטרפרון בטא. מולקולות MHCI מסומנות במקום עם נוגדן מתויג פלואורסצנטי, ואז התאים מנותקים באופן לא אנזימטי להשעיית תא אחד. כדי לאשר את הזהות העצבית, התאים קבועים עם paraformaldehyde, מחלחל, ומסומן עם נוגדן מתויג פלואורסצנטי המזהה אנטיגן גרעיני עצבי NeuN. ביטוי MHCI מכומת לאחר מכן על נוירונים על ידי ניתוח ציטומטרי זרימה. תרבויות עצביות יכול בקלות להיות מניפולציה על ידי שינויים גנטיים או התערבויות תרופתיות כדי לבדוק השערות ספציפיות. עם שינויים קלים, שיטות אלה יכולות לשמש לתרבות אוכלוסיות עצביות אחרות או כדי להעריך ביטוי של חלבונים אחרים של עניין.

באמצעות ההליך שהוצג כאן, רקמת ההיפוקמפוס נותחה מגורי עכבר טרום לידתיים ביום העוברי 18. הרקמה נותקה להשעיית תא בודד בשיטות אנזימטיות ומכאניות, ואז תרביתה ב-12 לוחות באר שטופלו מראש בפולי-די-ליצין. לאחר 7 ימים במבחנה, התאים טופלו עם 100 U / mL של IFNβ או מדיה רק עבור 72 שעות, אשר עורר את הביטוי של MHCI. נוירונים הוכתמו במקום עבור MHCI לפני שהם נותקו באופן לא אנזימטי להשעיה של תא אחד. נוירונים תוקנו וחלחלו, ואז הוכתמו תאית עבור סמן גרעינים עצביים NeuN. דגימות הוערכו על ידי cytometry זרימה ונתונים נותחו באמצעות התוכנה המשויכת. נוירונים זוהו באמצעות גיטינג רציף של סך האירועים כדי לא לכלול פסולת סלולרית וכפולים(איור 1A,B). נוירונים זוהו באופן סופי על ידי חיוביות NeuN (איור 1C). תאים של NeuN+ נותחו עוד יותר עבור חיוביות MHCI על-ידי התוויית תאים בהיסטוגרמה כאשר מספר התאים מנורמל למצב בציר y ופלואורסצנטיות MHCI בציר ה- x. שער MHCI+ נמשך בנקודה שבה פסגות חיוביות ושליליות התפצלו (איור 1D). מתוך זה, אחוז הנוירונים החיוביים לכתמי MHCI (איור 1E) ועוצמת הפלואורסצנטיות החציונית (MFI; איור 1F) חושבו. התוצאות מראות כי טיפול IFNβ באופן משמעותי upregulated אחוז הנוירונים חיובי עבור כתמים חוץ תאיים של MHCI, כמו גם את רמת הביטוי, כפי שצוין על ידי MFI. ניתוח סטטיסטי וייצוג גרפי נעשו באמצעות תוכנה סטטיסטית זמינה מסחרית.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61436/61436fig1v2.jpg"> איור 1: אסטרטגיית גיטינג ייצוגית וכימות MHCI. נוירונים היפוקמפוס ראשוני טופלו עם 100 U / mL של IFNβ או מדיה בלבד. לאחר 72 שעות, נוירונים הוכתמו באופן חוץ-תאי עם MHCI עם מצומד כחול האוקיינוס השקט (1 מיקרוגרם / מ"ל H2-Kb), ולאחר מכן מתויגים תאית עם NEUN מצומד PE (1:100 דילול). פלואורסצנטיות תאית הוערכה על ידי ציטומטריית זרימה, ונתונים נותחו. (A) סה"כ אירועים הותוו כ- SSC-A (יומן) לעומת FSC-A (ליניארי), ותאים (P1) היו מגודרים כדי לא לכלול פסולת. (B) בתוך אוכלוסיית P1, תאים הותוו כ- FSC-H (ליניארי) לעומת FSC-A (ליניארי) כדי לשער את אוכלוסיית התאים הבודדים. (C) בתוך אוכלוסיית התאים הבודדים, תאים הותוו SSC-A (יומן) לעומת NeuN-PE (יומן רישום). תאי NeuN+ היו מגודרים לזיהוי נוירונים. (D) בתוך אוכלוסיית הנוירונים, תאים הותוו על היסטוגרמה עם MHCI-PacBlu על ציר x ומספרי תאים מנורמלים למצב על ציר y. שער אופקי צויר כדי לכמת את אחוז הנוירונים החיוביים עבור כתמי MHCI. (ה)כימות של אחוז MHCI+ של NeuN+ תאים במדיה בלבד ותאי עצב שטופלו IFNβ. (F) כימות של עוצמת הפלואורסצנטיות החציונית (MFI) של MHCI על NeuN+ תאים בתאי מדיה (שחורים) ו- IFNβ שטופלו (אדום). מובהקות סטטיסטית חושבה על ידי מבחן t לא משועבד. **, פי < 0.01. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61436/61436fig1v2large.jpg" target="_blank">לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td colspan="4">נוירון צמיחה מדיה (50 מ"ל)</td>
		</tr>
<tr>
<td>מגיב</td>
			<td>ריכוז סופי</td>
			<td>ריכוז מלאי</td>
			<td>עבור 50 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>תוספת B27</td>
			<td>2%</td>
			<td>100%</td>
			<td>1.0 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>ל-גלוטמין</td>
			<td>2 מ"מ</td>
			<td>200 מ"מ</td>
			<td>0.5 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>פניצילין-סטרפטומיצין</td>
			<td>100 יו/מ"ל</td>
			<td>10,000 יו/מ"ל</td>
			<td>0.5 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>מדיה נוירובסלית</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>48.0 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4"></td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">מאגר FACS (500 מ"ל)</td>
		</tr>
<tr>
<td>מגיב</td>
			<td>ריכוז סופי</td>
			<td>ריכוז מלאי</td>
			<td>עבור 500 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>סרום שור עוברי</td>
			<td>2%</td>
			<td>100%</td>
			<td>10 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>אדטה (EDTA)</td>
			<td>1 מ"מ</td>
			<td>500 מ"מ</td>
			<td>1 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>dPBS</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>489 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4"></td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">פתרון ניתוק פפאין</td>
		</tr>
<tr>
<td>מגיב</td>
			<td>ריכוז סופי</td>
			<td>ריכוז מלאי</td>
			<td>עבור 1 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>השעיית פפאין</td>
			<td>20 יו/מ"ל</td>
			<td>1000 יו/מ"ל</td>
			<td>0.020 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>DNase I</td>
			<td>2.5 יו/מ"ל</td>
			<td>2500 יו/מ"ל</td>
			<td>0.001 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td>שנת חורף-E</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>1.0 מ"ל</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">הערה: הנפח של פתרון ניתוק Papain הדרוש ישתנה בהתאם למספר המוחות העובריים להיות מנותח. הכינו 0.5 מ"ל למוח לנוירונים בהיפוקמפוס או 1.0 מ"ל למוח לנוירונים קליפתיים.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">הערה: הכן פתרון דיסוציאציה על ידי השעיית פפאין מערבולת בתרדמת חורף-E במשך כ 3 דקות. לאחר פפאין הוא מומס ביסודיות, להוסיף DNase אני. אל מערבולת DNase אני.</td>
		</tr>
</tbody></table>טבלה 1: מדיה ופתרונות.

Watch this Scientific Journal Video about Assessing the Expression of Major Histocompatibility Complex Class I on Primary Murine Hippocampal Neurons by Flow Cytometry at JoVE.com

Assessing the Expression of Major Histocompatibility Complex Class I on Primary Murine Hippocampal Neurons by Flow Cytometry

פרוטוקול זה מתאר שיטה לתיבוי נוירונים ראשוניים בהיפוקמפוס ממוחו של העכבר העוברי. הביטוי של המעמד המורכב histocompatibility גדול אני על פני השטח החוץ תאיים של נוירונים מתורבתים מוערך לאחר מכן על ידי ניתוח ציטומטרי זרימה.

הערכת הביטוי של קומפלקס היסטו-תאימות גדול מחלקה I על נוירונים היפוקמפוס מורין ראשי על ידי Cytometry זרימה

Increasing evidence supports the hypothesis that neuro-immune interactions impact nervous system function in both homeostatic and pathologic conditions. A ...

assessing-expression-major-histocompatibility-complex-class-i-on

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

3.3K Views.  University of North Carolina at Charlotte. פרוטוקול זה מתאר שיטה לתיבוי נוירונים ראשוניים בהיפוקמפוס ממוחו של העכבר העוברי. הביטוי של המעמד המורכב histocompatibility גדול אני על פני השטח החוץ תאיים של נוירונים מתורבתים מוערך לאחר מכן על ידי ניתוח ציטומטרי זרימה.

Video: Assessing the Expression of Major Histocompatibility Complex Class I on Primary Murine Hippocampal Neurons by Flow Cytometry

Flow Cytometry Analysis of Immune Cells Within Murine Aortas

Atherosclerosis is a chronic inflammatory process of medium and large size vessels that is characterized by the formation of plaques consisting of foam cells, immune cells, vascular endothelial and smooth muscle cells, platelets, extracellular matrix, and a lipid-rich core with extensive necrosis and fibrosis of surrounding tissues.1 The innate and adaptive arms of the immune response are involved in the initiation, development and persistence of atherosclerosis.2, 3 There is a significant body of evidence that different subsets of the immune cells, such as macrophages, dendritic cells, T and B lymphocytes, are present within the aortas of healthy and atherosclerosis-prone mice4. Additionally, immune cells are found in the surrounding aortic adventitia which suggests an important role of this tissue in atherogenesis.2
For some time, the quantitative detection of different types of immune cells, their activation status, and the cellular composition within the aortic wall was limited by RT-PCR and immunohistochemical methods for the study of atherosclerosis. Few attempts were made to perform flow cytometry using human aortas, and a number of problems, such as a high autofluorescence, have been reported5,6. Human atherosclerotic plaques were digested with collagenase 1, and free cells were collected and stained for CD14+/CD11c+ to highlight macrophage-derived foam cells. In this study, a "mock" channel was used to avoid false-positive staining.6 Necrotic materials accumulating during the digestion process give rise in a large amount of debris that generates a high autofluorescence in aortic samples. To resolve this problem, a panel of negative and positive controls has been proposed, but only double staining could be applied in these samples. We have developed a new flow cytometry-based method7 to analyze the immune cell composition and characterize the activation, proliferation, differentiation of immune cells in healthy and atherosclerosis-prone aorta. This method allows the investigation of the immune cell composition of the aortic wall and opens possibilities to use a broad spectrum of immunological methods for investigations of immune aspects of this disease.

This paper presents a flow cytometry-based method to investigate the immune composition of aortas. The paper also illustrates an additional technique that allows examining surrounding adventitia and vessel wall separately. This method opens possibilities to perform phenotypical analyses of aortic leukocytes and apply several immunological assays for atherosclerosis studies.

ניתוח תזרים cytometry של תאים חיסוניים בתוך Aortas Murine

Atherosclerosis is a chronic inflammatory process of medium and large size vessels that is characterized by the formation of plaques consisting of foam ...

Human In Vitro Suppression as Screening Tool for the Recognition of an Early State of Immune Imbalance

Regulatory T cells (Tregs) are critical mediators of immune tolerance to self-antigens. In addition, they are crucial regulators of the immune response following an infection. Despite efforts to identify unique surface marker on Tregs, the only unique feature is their ability to suppress the proliferation and function of effector T cells. While it is clear that only in vitro assays can be used in assessing human Treg function, this becomes problematic when assessing the results from cross-sectional studies where healthy cells and cells isolated from subjects with autoimmune diseases (like Type 1 Diabetes-T1D) need to be compared. There is a great variability among laboratories in the number and type of responder T cells, nature and strength of stimulation, Treg:responder ratios and the number and type of antigen-presenting cells (APC) used in human in vitro suppression assays. This variability makes comparison between studies measuring Treg function difficult. The Treg field needs a standardized suppression assay that will work well with both healthy subjects and those with autoimmune diseases. We have developed an in vitro suppression assay that shows very little intra-assay variability in the stimulation of T cells isolated from healthy volunteers compared to subjects with underlying autoimmune destruction of pancreatic &beta;-cells. The main goal of this piece is to describe an in vitro human suppression assay that allows comparison between different subject groups. Additionally, this assay has the potential to delineate a small loss in nTreg function and anticipate further loss in the future, thus identifying subjects who could benefit from preventive immunomodulatory therapy1. Below, we provide thorough description of the steps involved in this procedure. We hope to contribute to the standardization of the in vitro suppression assay used to measure Treg function. In addition, we offer this assay as a tool to recognize an early state of immune imbalance and a potential functional biomarker for T1D.

Human In Vitro Suppression as Screening Tool for the Recognition of an Early State of Immune Imbalance

Tregs are potent suppressors of the immune system. There is a lack of unique surface markers to define them, hence, definitions of Tregs are primarily functional. Here we describe an optimized in vitro assay capable of identifying immune imbalance in subjects at risk to develop T1D.

אנושי במבחנה דיכוי ככלי מיון עבור הכרה של מדינת מוקדם של חוסר איזון החיסון

Regulatory T cells (Tregs) are critical mediators of immune tolerance to self-antigens. In addition, they are crucial regulators of the immune response ...

Detection of Fluorescent Nanoparticle Interactions with Primary Immune Cell Subpopulations by Flow Cytometry

Engineered nanoparticles are endowed with very promising properties for therapeutic and diagnostic purposes. This work describes a fast and reliable method of analysis by flow cytometry to study nanoparticle interaction with immune cells. Primary immune cells can be easily purified from human or mouse tissues by antibody-mediated magnetic isolation. In the first instance, the different cell populations running in a flow cytometer can be distinguished by the forward-scattered light (FSC), which is proportional to cell size, and the side-scattered light (SSC), related to cell internal complexity. Furthermore, fluorescently labeled antibodies against specific cell surface receptors permit the identification of several subpopulations within the same sample. Often, all these features vary when cells are boosted by external stimuli that change their physiological and morphological state. Here, 50 nm FITC-SiO2 nanoparticles are used as a model to identify the internalization of nanostructured materials in human blood immune cells. The cell fluorescence and side-scattered light increase after incubation with nanoparticles allowed us to define time and concentration dependence of nanoparticle-cell interaction. Moreover, such protocol can be extended to investigate Rhodamine-SiO2 nanoparticle interaction with primary microglia, the central nervous system resident immune cells, isolated from mutant mice that specifically express the Green Fluorescent Protein (GFP) in the monocyte/macrophage lineage. Finally, flow cytometry data related to nanoparticle internalization into the cells have been confirmed by confocal microscopy.

Analysis of nanoparticle interaction with defined subpopulations of immune cells by flow cytometry.

איתור של פלורסנט אינטראקציות Nanoparticle עם אוכלוסיות ראשוניות של תא חיסון על ידי זרימת cytometry

Engineered nanoparticles are endowed with very promising properties for therapeutic and diagnostic purposes. This work describes a fast and reliable ...

In Situ Detection of Autoreactive CD4 T Cells in Brain and Heart Using Major Histocompatibility Complex Class II Dextramers

This report demonstrates the use of major histocompatibility complex (MHC) class II dextramers for detection of autoreactive CD4 T cells in situ in myelin proteolipid protein (PLP) 139-151-induced experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) in SJL mice and cardiac myosin heavy chain-&#945; (Myhc) 334-352-induced experimental autoimmune myocarditis (EAM) in A/J mice. Two sets of cocktails of dextramer reagents were used, where dextramers+ cells were analyzed by laser scanning confocal microscope (LSCM): EAE, IAs/PLP 139-151 dextramers (specific)/anti-CD4 and IAs/Theiler&#8217;s murine encephalomyelitis virus (TMEV) 70-86 dextramers (control)/anti-CD4; and EAM, IAk/Myhc 334-352 dextramers/anti-CD4 and IAk/bovine ribonuclease (RNase) 43-56 dextramers (control)/anti-CD4. LSCM analysis of brain sections obtained from EAE mice showed the presence of cells positive for CD4 and PLP 139-151 dextramers, but not TMEV 70-86 dextramers suggesting that the staining obtained with PLP 139-151 dextramers was specific. Likewise, heart sections prepared from EAM mice also revealed the presence of Myhc 334-352, but not RNase 43-56-dextramer+ cells as expected. Further, a comprehensive method has also been devised to quantitatively analyze the frequencies of antigen-specific CD4 T cells in the &#8216;Z&#8217; serial images.

In Situ Detection of Autoreactive CD4 T Cells in Brain and Heart Using Major Histocompatibility Complex Class II Dextramers

The protocol to detect self-reactive CD4 T cells in brain and heart by direct staining with major histocompatibility complex class II dextramers has been described in this report. For comprehensive analysis, a reliable method to enumerate the frequencies of antigen-specific CD4+ T cells in situ is also devised.

באתרו איתור של תאים אוטוריאקטיבים T מסוג CD4 במוח ולב באמצעות מחלקה מורכבת השני Dextramers סרן histocompatibility

This report demonstrates the use of major histocompatibility complex (MHC) class II dextramers for detection of autoreactive CD4 T cells in situ in myelin ...

Fluorescence-activated Cell Sorting for Purification of Plasmacytoid Dendritic Cells from the Mouse Bone Marrow

Fluorescence-activated cell sorting (FACS) is a technique to purify specific cell populations based on phenotypes detected by flow cytometry. This method enables researchers to better understand the characteristics of a single cell population without the influence of other cells. Compared to other methods of cell enrichment, such as magnetic-activated cell sorting (MCS), FACS is more flexible and accurate for cell separation due to the ability of phenotype detection by flow cytometry. In addition, FACS is usually capable of separating multiple cell populations simultaneously, which improves the efficiency and diversity of experiments. Although FACS has some limitations, it has been broadly used to purify cells for functional studies in both in vitro and in vivo settings. Here we report a protocol using fluorescence-activated cell sorting to isolate a very rare population of immune cells, plasmacytoid dendritic cells (pDC), with high purity from the bone marrow of lupus-prone mice for in vitro functional studies of pDC.

We report a protocol using fluorescence-activated cell sorting to isolate plasmacytoid dendritic cells (pDC) with high purity from the bone marrow of lupus-prone mice for functional studies of pDC.

מיון תא מופעל קרינה עבור טיהור של תאי דנדריטים Plasmacytoid ממח עצם העכבר

Fluorescence-activated cell sorting (FACS) is a technique to purify specific cell populations based on phenotypes detected by flow cytometry. This method ...

Assessing Retinal Microglial Phagocytic Function In Vivo Using a Flow Cytometry-based Assay

Microglia are the tissue resident macrophages of the central nervous system (CNS) and they perform a variety of functions that support CNS homeostasis, including phagocytosis of damaged synapses or cells, debris, and/or invading pathogens. Impaired phagocytic function has been implicated in the pathogenesis of diseases such as Alzheimer's and age-related macular degeneration, where amyloid-&#946; plaque and drusen accumulate, respectively. Despite its importance, microglial phagocytosis has been challenging to assess in vivo. Here, we describe a simple, yet robust, technique for precisely monitoring and quantifying the in vivo phagocytic potential of retinal microglia. Previous methods have relied on immunohistochemical staining and imaging techniques. Our method uses flow cytometry to measure microglial uptake of fluorescently labeled particles after intravitreal delivery to the eye in live rodents. This method replaces conventional practices that involve laborious tissue sectioning, immunostaining, and imaging, allowing for more precise quantification of microglia phagocytic function in just under six hours. This procedure can also be adapted to test how various compounds alter microglial phagocytosis in physiological settings. While this technique was developed in the eye, its use is not limited to vision research.

Assessing Retinal Microglial Phagocytic Function In Vivo Using a Flow Cytometry-based Assay

Microglial phagocytosis is critical for the maintenance of tissue homeostasis and inadequate phagocytic function has been implicated in pathology. However, assessing microglia function in vivo is technically challenging. We have developed a simple but robust technique for precisely monitoring and quantifying the phagocytic potential of microglia in a physiological setting.

להערכת תפקוד רשתית microglial Phagocytic<em&gt; In vivo</em&gt; שימוש cytometry זרימה מבוסס Assay

Microglia are the tissue resident macrophages of the central nervous system (CNS) and they perform a variety of functions that support CNS homeostasis, ...

Fluorescence-based Neuraminidase Inhibition Assay to Assess the Susceptibility of Influenza Viruses to The Neuraminidase Inhibitor Class of Antivirals

The neuraminidase (NA) inhibitors are the only class of antivirals approved for the treatment and prophylaxis of influenza that are effective against currently circulating strains. In addition to their use in treating seasonal influenza, the NA inhibitors have been stockpiled by a number of countries for use in the event of a pandemic. It is therefore important to monitor the susceptibility of circulating influenza viruses to this class of antivirals. There are different types of assays that can be used to assess the susceptibility of influenza viruses to the NA inhibitors, but the enzyme inhibition assays using either a fluorescent substrate or a chemiluminescent substrate are the most widely used and recommended. This protocol describes the use of a fluorescence-based assay to assess influenza virus susceptibility to NA inhibitors. The assay is based on the NA enzyme cleaving the 2&#8242;-(4-Methylumbelliferyl)-&#945;-D-N-acetylneuraminic acid (MUNANA) substrate to release the fluorescent product 4-methylumbelliferone (4-MU). Therefore, the inhibitory effect of an NA inhibitor on the influenza virus NA is determined based on the concentration of the NA inhibitor that is required to reduce 50% of the NA activity, given as an IC50 value.

We describe the use of a phenotypic fluorescence-based neuraminidase inhibition assay to assess the susceptibility of influenza A and B viruses to the neuraminidase inhibitor class of antivirals.

קרינה המבוססת Assay Neuraminidase העיכוב להעריך את הרגישות של שפעת וירוסים אל Neuraminidase המונע המחלקה של תרופות אנטי-ויראליות

The neuraminidase (NA) inhibitors are the only class of antivirals approved for the treatment and prophylaxis of influenza that are effective against ...

Isolation and In Vitro Culture of Murine and Human Alveolar Macrophages

Alveolar macrophages are terminally differentiated, lung-resident macrophages of prenatal origin. Alveolar macrophages are unique in their long life and their important role in lung development and function, as well as their lung-localized responses to infection and inflammation. To date, no unified method for identification, isolation, and handling of alveolar macrophages from humans and mice exists. Such a method is needed for studies on these important innate immune cells in various experimental settings. The method described here, which can be easily adopted by any laboratory, is a simplified approach to harvesting alveolar macrophages from bronchoalveolar lavage fluid or from lung tissue and maintaining them in vitro. Because alveolar macrophages primarily occur as adherent cells in the alveoli, the focus of this method is on dislodging them prior to harvest and identification. The lung is a highly vascularized organ, and various cell types of myeloid and lymphoid origin inhabit, interact, and are influenced by the lung microenvironment. By using the set of surface markers described here, researchers can easily and unambiguously distinguish alveolar macrophages from other leukocytes, and purify them for downstream applications. The culture method developed herein supports both human and mouse alveolar macrophages for in vitro growth, and is compatible with cellular and molecular studies.

Isolation and In Vitro Culture of Murine and Human Alveolar Macrophages

This communication describes methodologies for isolation and culture of alveolar macrophages from humans and murine models for experimental purposes.

בידוד והתרבות במבחנה של מקרופאגים מכתשי מאתר ואנושי

Alveolar macrophages are terminally differentiated, lung-resident macrophages of prenatal origin. Alveolar macrophages are unique in their long life and ...

Characterization of Human Monocyte Subsets by Whole Blood Flow Cytometry Analysis

Monocytes are key contributors in various inflammatory disorders and alterations to these cells, including their subset proportions and functions, can have pathological significance. An ideal method for examining alterations to monocytes is whole blood flow cytometry as the minimal handling of samples by this method limits artifactual cell activation. However, many different approaches are taken to gate the monocyte subsets leading to inconsistent identification of the subsets between studies. Here we demonstrate a method using whole blood flow cytometry to identify and characterize human monocyte subsets (classical, intermediate, and non-classical). We outline how to prepare the blood samples for flow cytometry, gate the subsets (ensure contaminating cells have been removed), and determine monocyte subset expression of surface markers &#8212; in this example M1 and M2 markers. This protocol can be extended to other studies that require a standard gating method for assessing monocyte subset proportions and monocyte subset expression of other functional markers.

Here we present a protocol for characterizing monocyte subsets by whole blood flow cytometry. This includes outlining how to gate the subsets and assess their expression of surface markers and giving an example of the assessment of the expression of M1 (inflammatory) and M2 markers (anti-inflammatory).

אפיון של קבוצות משנה מונוציט האנושית על ידי דם לזרום Cytometry ניתוח

Monocytes are key contributors in various inflammatory disorders and alterations to these cells, including their subset proportions and functions, can ...

Stability and Structure of Bat Major Histocompatibility Complex Class I with Heterologous &beta;2-Microglobulin

The major histocompatibility complex (MHC) plays a pivotal role in antigen peptide presentation and T cell immune responses against infectious disease and tumor development. The hybrid MHC I complexed with heterologous &#946;2-microglobulin (&#946;2m) substitution from different species can be stabilized in vitro. This is a feasible means to study MHC I of mammals, when the homologous &#946;2m is not available. Meanwhile, it is indicated that mammalian &#946;2m substitution does not significantly affect peptide presentation. However, there is limited summarization regarding the methodology and the technology for the hybrid MHC I complexed with heterologous &#946;2-microglobulin (&#946;2m). Herein, methods to evaluate the feasibility of heterologous &#946;2m substitution in MHC I study are presented. These methods include preparation of expression constructs; purification of inclusion bodies and refolding of the MHC complex; determination of protein thermostability; crystal screening and structure determination. This study provides a recommendation for understanding function and structure of MHC I, and is also significant for T cell response evaluation during infectious disease and tumor immunotherapy.

Stability and Structure of Bat Major Histocompatibility Complex Class I with Heterologous &#946;2-Microglobulin

The protocol describes experimental methods to obtain stable major histocompatibility complex (MHC) class I through potential &#946;2-microglobulin (&#946;2m) substitutions from different species. The structural comparison of MHC I stabilized by homologous and heterologous &#946;2m were investigated.

יציבות ומבנה של בת גדולה Histocompatibility קומפלקס מחלקה I עם β הטרולוגי2-מיקרוגלובולין

The major histocompatibility complex (MHC) plays a pivotal role in antigen peptide presentation and T cell immune responses against infectious disease and ...