פרוטוקול פשוט, מהיר ואוטומטי חלקית לבידוד גרעינים בודדים מרקמות יונקים קפואים לצורך ריצוף גרעין יחיד

מחקר זה מתמקד בתמיכה במחקרי גילוי תרופות המשתמשים בריצוף RNA של גרעינים בודדים כדי לחקור את היעילות והבטיחות של טיפולים פוטנציאליים. לכן, אנו מפתחים פרוטוקולים סטנדרטיים למיצוי גרעינים עבור דגימות רקמות קפואות טריות מאיברים שונים. מטרתנו הייתה להפוך את מיצוי הגרעינים לאוטומטי ולתקנן אותו כדי להשיג תוצאות עקביות ואמינות על ידי הפחתת השונות הלא ביולוגית.

היתרון הוא אוטומציה חלקית באמצעות שימוש בדיסוציאטור רובוטי וזרימת העבודה הפשוטה והקצרה שניתן ליישם על דגימות רקמה שונות של מינים שונים. פרוטוקולים סטנדרטיים יכולים לעזור לנו לענות על שאלות בנוגע להפצה ביולוגית של תרופות, כמו גם לחקור את המנגנונים העומדים בבסיס כל אותות הבטיחות שאנו עשויים לראות. בעתיד, נבדוק את תחולת הפרוטוקול שלנו עבור יישומים אחרים במורד הזרם, כגון ATAC-seq או multiomics.

כמו כן, ננסה לקבוע פרוטוקולים לזיהוי טרנסגנים המתבטאים באופן ויראלי בגרעינים בודדים.