連絡先を介して可視化の土壌微生物スライド法と顕微鏡

概要

ソース: ドクターペッパー イアン博士チャールズ Gerba - アリゾナ大学所
示す著者: ブラッドリー ・ シュミッツ

土壌には、生命に寄与する生物的・非生物的要因を含む地球の表面で薄い層が装備されています。非生物的部分には、無機粒子サイズと形状に至るまで土壌のテクスチャを決定するにはが含まれます。生物の部分には、植物残渣、ルーツ、有機物、微生物が組み込まれています。土壌の 1 グラム含まれている 107 8細菌、放線菌 106 8 、105 6菌、103酵母、原生動物4 6 10、103 4藻類と 53線虫は土壌微生物の豊かさと多様性、します広大な。一緒に、生物的・非生物的要因は土壌微生物のための有利な条件を提供する、根圏として知られている植物根の周りのアーキテクチャを形成します。

生物的・非生物的要因は土壌中での生活を促進します。しかし、それらはまた微生物を制限ストレスのダイナミクスを貢献します。生物的ストレスに適応し、環境条件の中で生き残る生活の中で競争が含まれます。たとえば、微生物は、隣接の微生物に害を抑制または有毒物質を分泌できます。ペニシリウム-notatumは悪名高い菌抗菌薬、医薬品のペニシリンを作成する人間が収穫を生産することによって栄養素のための競争を減らします。非生物的ストレスは光、水分、温度、pH、栄養素、およびテクスチャなど、微生物の生存を制限する物理的なまたは化学的特性に起因します。

手順

1. 土壌のスライドの小宇宙の準備

  1. 表面から庭の土を収集 (0-6"深さ)、2 つのカップに土壌 150 g の重量を量る。
    1. 土壌に有機物の高密度がある場合 100 g の重量を量る。
  2. ラベル一杯「治療」と、その他「制御」
  3. 含水率を変更するために必要な水の量を計算します。
    1. 水分含有量が多いフィールドの容量の近くにあります。
      Equation 1 1
  4. メスシリンダーの蒸留水の量を測定。
  5. 2 つのバイアルに蒸留水の量を注ぐ。
  6. ラベル 1 バイアル「治療」と、その他「制御」
  7. 「治療」土壌の乾燥重量ベースによると最終的な土壌のグルコース濃度 1% の十分なブドウ糖を「治療」瓶で水を改正します。
  8. 「治療」のバイアルに 200 mg NH4

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

結果

菌類は、厚さ、糸状の菌糸 (図 2) を表示します。放線菌は、薄い、糸状の菌糸を表示します。細菌は小さい球菌またはロッド図形を表示します。彼らはしばしば土壌粒子、またはライニング菌糸の塊で発見しています。土壌粒子は、不規則な暗い形 (図 3) を表示します。

Figure 2
図 2。スライド ?...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

申請書と概要

スライドの試金、埋葬スライドとも呼ばれますは、土壌生物相を質的観察を活用シンプルな手法です。この試金は質的、土粒子、細菌、放線菌フィラメント菌糸間の空間的相互作用を示しています。個人や業界は、ガーデニング、堆肥化、教育、そして勉強に関しては農業、特定の土壌の健康に関する知識を収集するこのアッセイを使用できます。しかし、この手法としてそれだけ大規模な?...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

参考文献
  1. Pepper, I. L., & Gerba, C P. 'Contact Slide Assay.' Environmental Microbiology A Laboratory Manual. 2nd ed. Elsevier 19-25 (2004).
  2. Pepper, I. L., Gerba, C. P., & Gentry, T. J. 'Earth Environments.' Environmental Microbiology. 3rd ed. Elsevier 59-88 (2014).
  3. Rossi, G., Ricardo, S., Gesue, G., Stanganelli, M., and Want, T.K. Direct Microscopic and bacteriological investigations of the soil. Soil Science. 41, 52 – 66 (1936).
タグ
Soil MicroorganismsContact Slide AssayMicroscopyVisualizationSoil ChangesEnvironmental StressesRhizosphereAbiotic ComponentsInorganic ParticlesBiotic ComponentsPlant ResiduesRootsOrganic MatterMicroorganismsWater In Soil PoresBacteriaCocciBacilliFilamentous FormsFungal SpeciesYeastMolds

スキップ先...

0:00

Overview

1:12

Principles of Soil Microorganisms

2:41

Soil Slide Microcosm Preparation

5:12

Slide Staining and Microscopy

6:47

Microscopy Results

7:32

Applications

9:40

Summary

このコレクションのビデオ:

article

Now Playing

連絡先を介して可視化の土壌微生物スライド法と顕微鏡

Environmental Microbiology

42.0K 閲覧数

article

土壌中の水分の定量

Environmental Microbiology

358.1K 閲覧数

article

無菌環境科学

Environmental Microbiology

125.6K 閲覧数

article

環境ソースから細菌のグラム染色

Environmental Microbiology

99.1K 閲覧数

article

糸状菌

Environmental Microbiology

56.6K 閲覧数

article

細菌のコロニーからコミュニティの DNA の抽出

Environmental Microbiology

28.7K 閲覧数

article

ポリメラーゼ連鎖反応およびゲル電気泳動法と環境微生物の検出

Environmental Microbiology

44.3K 閲覧数

article

RT-PCR 法を用いた環境試料の RNA 解析

Environmental Microbiology

40.2K 閲覧数

article

環境微生物やウイルスを使用しての qPCR の定量化

Environmental Microbiology

47.7K 閲覧数

article

指標生物による水質分析

Environmental Microbiology

29.3K 閲覧数

article

ろ過による水試料からの糞便細菌の分離

Environmental Microbiology

39.0K 閲覧数

article

環境試料中のバクテリオファージの検出

Environmental Microbiology

40.5K 閲覧数

article

養殖および土壌試料からの細菌を列挙します。

Environmental Microbiology

183.2K 閲覧数

article

細菌の成長曲線の解析と環境応用

Environmental Microbiology

295.3K 閲覧数

article

藻類培養手法を介して列挙

Environmental Microbiology

13.7K 閲覧数

JoVE Logo

個人情報保護方針

利用規約

一般データ保護規則

研究

教育

JoVEについて

Copyright © 2023 MyJoVE Corporation. All rights reserved