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Visualizzazione dei microrganismi del suolo tramite il test su vetrino a contatto e microscopia

Panoramica

Fonte: Laboratori del Dr. Ian Pepper e del Dr. Charles Gerba - Università dell'Arizona
Autore dimostrativo: Bradley Schmitz

Il suolo comprende il sottile strato sulla superficie terrestre, contenente fattori biotici e abiotici che contribuiscono alla vita. La porzione abiotica comprende particelle inorganiche di dimensioni e forma variabili che determinano la consistenza del suolo. La porzione biotica incorpora residui vegetali, radici, materia organica e microrganismi. L'abbondanza e la diversità dei microbi del suolo è espansiva, poiché un grammo di terreno contiene 10batteri 7-8, 10 6-8 actinomiceti,10 funghi 5-6, 10 3 lieviti,10 4-6 protozoi,10 3-4 alghe e 53 nematodi. Insieme, i fattori biotici e abiotici formano architetture attorno alle radici delle piante, note come rizosfera, che forniscono condizioni favorevoli per i microrganismi del suolo.

I fattori biotici e abiotici promuovono la vita nei suoli. Tuttavia, contribuiscono anche a dinamiche stressanti che limitano i microbi. Lo stress biotico comporta la competizione tra la vita per adattarsi e sopravvivere in condizioni ambientali. Ad esempio, i microbi possono secernere sostanze inibitorie o tossiche per danneggiare i microrganismi vicini. Penicillium notatum è un fungo famigerato, in quanto riduce la competizione per i nutrienti producendo un antimicrobico, che gli esseri umani raccolgono per creare la penicillina farmaceutica. Gli stress abiotici derivano da proprietà fisiche o chimiche che limitano la sopravvivenza microbica, come luce, umidità, temperatura, pH, sostanze nutritive e consistenza.

Procedura

1. Preparazione del microcosmo del scivolo del suolo

  1. Raccogliere il terreno del giardino dalla superficie (profondità 0-6 ") e pesare 150 g di terreno in due tazze separate.
    1. Se il terreno ha un'alta densità di materia organica, pesare 100 g.
  2. Etichettare una tazza "Trattamento" e l'altra "Controllo".
  3. Calcola la quantità di acqua necessaria per alterare il contenuto di umidità.
    1. Il contenuto di umidità è spesso vicino alla capacità del campo.
      Equation 1</div><style data-emotion=.css-f1q1l5{display:-webkit-box;display:-webkit-flex;display:-ms-flexbox;display:flex;-webkit-align-items:flex-end;-webkit-box-align:flex-end;-ms-flex-align:flex-end;align-items:flex-end;background-image:linear-gradient(180deg, rgba(255, 255, 255, 0) 0%, rgba(255, 255, 255, 0.8) 40%, rgba(255, 255, 255, 1) 100%);width:100%;height:100%;position:absolute;bottom:0px;left:0px;font-size:var(--chakra-fontSizes-lg);color:#676B82;}

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Risultati

I funghi mostrano ife spesse e filamentose (Figura 2). Gli actinomiceti mostrano ife sottili e filamentose. I batteri mostrano piccoli cocchi o forme di bastoncello. Si trovano spesso in ciuffi, particelle di terreno o ife fungine di rivestimento. Le particelle del suolo mostrano forme irregolari e scure (Figura 3).

Figure 2
Figura 2. Immagine della diapositiva a contatto utilizzando l'obiettiv

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Riferimenti
  1. Pepper, I. L., & Gerba, C P. 'Contact Slide Assay.' Environmental Microbiology A Laboratory Manual. 2nd ed. Elsevier 19-25 (2004).
  2. Pepper, I. L., Gerba, C. P., & Gentry, T. J. 'Earth Environments.' Environmental Microbiology. 3rd ed. Elsevier 59-88 (2014).
  3. Rossi, G., Ricardo, S., Gesue, G., Stanganelli, M., and Want, T.K. Direct Microscopic and bacteriological investigations of the soil. Soil Science. 41, 52 – 66 (1936).
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Soil MicroorganismsContact Slide AssayMicroscopyVisualizationSoil ChangesEnvironmental StressesRhizosphereAbiotic ComponentsInorganic ParticlesBiotic ComponentsPlant ResiduesRootsOrganic MatterMicroorganismsWater In Soil PoresBacteriaCocciBacilliFilamentous FormsFungal SpeciesYeastMolds

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Overview

1:12

Principles of Soil Microorganisms

2:41

Soil Slide Microcosm Preparation

5:12

Slide Staining and Microscopy

6:47

Microscopy Results

7:32

Applications

9:40

Summary

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