We thank K. Delaney for comments on the manuscript. This work was supported by the National, Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI) Intramural Program.

1.組織収集および解剖<ol><li>乾燥酵母を含む各バイアルにおいて、培養10成人女性は、2〜3日間10雄と飛びます。 注：よく給餌女性のハエを維持することは、全体的な品質と卵巣生産の歩留まりを向上させ、解剖を容易にするであろう。 </li><li>二酸化炭素（CO 2）のメスのハエパッドフライ麻酔。 </li><li>ステレオスコープの下で、RT媒体解剖パッド上の（10％ウシ胎児血清（FBS）を補充したシュナイダーのショウジョウバエ培地）の数滴を置きます。生きていると健康な組織を維持するために培地中のすべての解剖の手続きを行っています。 </li><li>肥育女性がその下胸部に鋭い微鼻の鉗子で飛ぶグラブ。腹部の組織が露出するまでフライの極端な後方で軽く引っ張るために鉗子の別のセットを使用してください。他の組織（ 例えばガッツ）から2卵巣を外します。 注：各卵巣は、コンポーズある不透明な構造が表示されます16-20添付ovariolesのd-。 </li><li>試薬の浸透を高めるために、それらを離れて引っ張り、数回卵巣管各々の間に鉗子の先端を渡すことによって卵巣を開きます。以下の手順の間に組織の損失を最小限にするために卵巣内で接続ovariolesを保管してください。 </li><li> 10％FBSとシュナイダーのショウジョウバエ培地500μlを含む1.5 mlのマイクロ遠心チューブにすぐに卵巣を転送します。 </li><li>解剖を繰り返し、各マイクロチューブに10-15卵巣を集めます。 </li></ol> 2. EDUのラベリング<ol><li>各チューブ内の培地を吸引し、7μMのアフィディコリンを含む10％FBSをシュナイダーのショウジョウバエ培地500μlと交換してください。 注：アフィジコリンがミトコンドリアDNAの複製7,12に影響を与えることなく、DNAポリメラーゼαを阻害することにより、核DNA合成をブロックするために使用されます。アフィジコリン濃度までを増加させることが可能です70μMに優れた抑制を実現しています。アフィジコリンDMSO中3-30 mMのストック溶液は、最大6週間-20℃で暗所に保存することができます。 </li><li>健康卵巣を維持するために、培地を交換しながら、彼らはソリューションの下に浸漬されていることを確認してください。ステップ2.6を介して10％FBSとシュナイダーのショウジョウバエ培地を使用してください。 </li><li>穏やかに回転とベンチトップロッカー上で室温で3時間、卵巣をインキュベートします。 <ol><li>薬物治療のために、 例えば、ミトコンドリア脱共役剤カルボニルシアニド4-トリフルオロメトキシフェニルヒドラゾン（FCCP）、アフィディコリン処置の2時間後に培地中への薬剤の適切な濃度（ 例えば、10μMのFCCP）を追加します。さらに1時間インキュベートし続けます。 </li></ol></li><li>または薬剤を含まない培地を含むアフィジコリンを削除します。簡単に言えば二回（アフィジコリンは必要ありません）媒体と卵巣をすすぎます。 </li><li> 10μMのEDUを含む1ミリリットル中・7μMのアフィジコリンを追加し、incubatinを続けます2時間室温でグラム。 -20℃（DMSO中）の10mM EDU原液を保管してください。 </li><li> EDUとアフィジコリンを含む培地を除去します。 3分間ずつ二回（アフィジコリンなし）培地で洗浄します。 </li></ol> 3.組織固定および透過処理<ol><li>リン酸緩衝生理食塩水（PBS、pH7.4）中の4％パラホルムアルデヒド溶液を調製します。 注：私たちは、事前に決めたアンプルに保存されている市販のパラホルムアルデヒドを使用していました。新しいアンプルを開き、使用前に4％に希釈します。 注意：ホルムアルデヒドは有毒です。それは、皮膚や眼の保護とドラフト内で処理する必要があります。 </li><li>穏やかに回転させながら室温で20分間、4％パラホルムアルデヒドで卵巣を修正しました。 </li><li>固定液を取り出して、5分間、PBS中3％BSAの1ミリリットルで2回、時間を卵巣を洗います。 </li><li>組織を透過性にするために、洗浄溶液を除去し、PBS中の0.5％トリトンX-100の1ミリリットルを追加します。 RTで20分間インキュベートします。 </li><li>透過性溶液を除去し、1ミリリットルで二度洗いPBS中3％BSAの。 </li></ol> 4. EDU検出注：EDU検出を「クリック」化学に基づいており、銅（I）は、EDUの末端アルキン基に蛍光アジドを追加し、[3 + 2]環13を 、 -触媒、および蛍光分子は、その後の検出に供されます。簡単に非触媒のCu（II）種に酸化されたCu（I）は、反応を触媒するために必要とされるので、銅（I）を得るために、 その場でのCu（II）、硫酸を低減することが推奨されます。それは、Cu（II）、硫酸銅（I）を生成する（本明細書では「バッファー添加剤」）、アスコルビン酸などの還元剤の存在下で使用されます。 <ol><li>実験の前に、（「染料アジ」以下のように命名されている好適なフルオロフォア、に応じて、アレクサフルオロ488アジ、アレクサフルオロ555アジ等）エドゥ反応バッファーとEDUバッファの添加剤をアレクサフルオロアジドのワーキング溶液を調製メーカーのに従って指示。 <ol><li> 70μlのDMSO中の色素アジドを再構成します。 1年まで-20℃での作業溶液を保管してください。 </li><li>脱イオン水で10倍EDU反応緩衝液を希釈することにより、新鮮なエドゥ反応緩衝液を準備します。 注意：使用後、4℃で、残りの1倍のソリューションを格納します。 1X溶液は、最大6ヶ月間安定です。 </li><li>完全に2ミリリットルの脱イオン水に粉末を溶解させてEDUバッファ添加物の10倍のストック溶液を作ります。 注：このストック溶液は-20℃で最長1年間安定です。ソリューションは茶色を開発した場合、それが劣化していると、廃棄されるべきです。 </li></ol></li><li>新鮮なたびにEDUの反応カクテルを用意し、準備の15分以内に使用します。再現性のある結果を達成するために、反応成分が同じ比率で維持されていることを確認してください。 <ol><li>新鮮な1×EDUが10倍原液（ステップ4.1.3で調製した）を脱イオン水で1:10に希釈して添加液をバッファリングしてください。これはSが使用さ同じ日にolution。 </li><li> 860μlの1×EDU反応緩衝液、40μlののCuSO 4、2.5μlの色素アジ、100μlの1×EDUバッファ添加物：順序で以下の成分を組み合わせることにより、EDUの反応カクテルの1ミリリットルを準備します。 注：成分が最適な性能を確保するために添加されることが重要です。 </li></ol></li><li> 3％BSAを含むPBSを削除し、各チューブにEDUの反応カクテルの0.5ミリリットルを追加します。穏やかに回転させながら室温で30分間インキュベートします。光から保護されたサンプルを保管してください。 </li><li> EDUの反応カクテルを削除し、PBS中3％BSA 1mlで1回洗浄。 </li><li> 1mlのPBSで一回のサンプルを洗ってください。 </li></ol> 5.抗体ラベリング注：EDU染色した後、抗体標識を実行します。追加の染色が必要ない場合は、1が直接取り付けおよびイメージングに進むことができます。サンプルはすべて、以下の手順で光から保護することが重要です。 <ol><li>洗浄液を除去します。 30分間、PBS中0.2％BSAおよび0.1％トリトンX-100を含むブロッキング溶液1mlに卵巣を遮断します。 </li><li>ブロッキング溶液を除去し、ブロッキング溶液中で希釈した一次抗体（抗体α 例えば、マウスのATP合成酵素サブユニット、1：1,000希釈）と交換してください。 4°CO / Nの暗所でインキュベートします。 </li><li>ブロッキング溶液の1ミリリットル3回、10分ずつでサンプルを洗浄します。バックグラウンドを最小限にするために、30分毎にさらに2回洗浄します。ブロッキング溶液を除去します。 </li><li>室温で2時間（200希釈例えば、ヤギ抗マウスアレクサフルオロ568二次抗体を、1）ブロッキング溶液で希釈した二次抗体と共にインキュベートします。 注：EDUに結合された1つとは異なる色を使用してください。 </li><li>ステップ5.3で行われた洗浄手順を繰り返します。 </li><li>界面活性剤を除去するためにPBSで1回の1ミリリットルで洗い流してください。 </li></ol> 6.取付け・イメージング<ol><li>慎重にすべてのPBSおよびIMMを削除ediately（またはDAPIなし）メディアをマウントする50μlのと卵巣をカバーしています。 注：ovariolesが互いに分離されている間に硬化しないマウンティング培地を使用してください。卵巣は週まで4℃でマウンティング媒体に格納することができます。 </li><li>ピペットチップの先端をカットし、顕微鏡スライド上に慎重に卵巣を転送するためにそれを使用。 </li><li>実体顕微鏡下での鋭い微鼻ピンセットで完全に分離し、それぞれ卵巣管。後端とステージ14または成熟卵室で接続する組織を削除してください。若い卵室は、前端と透明です。 </li><li>彼らはお互いに重ならないようにピンセットで卵室を合わせます。 </li><li>ゆっくりとサンプルの上に＃1.5カバーガラスを下げます。封入剤は室温で数時間重合させました。透明マニキュアで密封します。 </li><li>画像は翌日にスライド、または撮像前に4℃で保存します。 </li><li>共焦点マイルの下で可視化63X油浸対物レンズでcroscope。 3次元のzスタック画像をキャプチャします。 注意：強いEDU信号は、上皮鞘の後の段階の卵室とバックグラウンド蛍光にあります。特に胚腺におけるEDUのラベリングを調べるとき、人はによってオーバーラップまたは他の組織もしくは後段の卵室の近くにされているgermariumsを避ける必要があります。 </li></ol>

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The authors have nothing to disclose.

EDUの標識が新たに合成されたDNAへの組み込みおよびヌクレオシド類縁体の染色に基づいて増殖している細胞においてDNA合成を検出するための新規かつ効率的な方法です。この方法は、迅速かつ高感度であることをBrdU標識方法よりも優れています。さらに重要なのは、それが良好な構造保全とホールマウント組織9、10の効率的なEDU-染料浸透を可能にします。歴史的には、BrdU標識に優れた代替手段として、EDUのラベリングは、のS期の間に核DNAの複製を研究するために使用しました細胞周期。アフィジコリンは、S期における核DNAの複製のための主要なポリメラーゼ12 15であるDNAポリメラーゼαの阻害剤です。ミトコンドリアDNAの複製は、治療をアフィジコリンの影響を受けないDNAポリメラーゼγによって行われます。したがって、前とエドゥのインキュベーション中アフィジコリンによる治療は大幅に核DNAにEDUの取り込みを阻害しました。そうすべきアフィジコリンが適切に保存されている場合は、数週間安定であってもよく、核DNAの複製を阻害するのにアフィジコリンの有効性は、私たちの手で変動したことが注目されます。強い核DNA標識とovariolesまたは卵室は、データ分析から除外されるべきです。 ミトコンドリアDNAの複製が容易に細胞質の総体積に正規化されたEDUの涙点の数を、カウントすることにより、ミトコンドリアDNA複製のレベルを定量化するための簡単な方法を提供する細胞質に斑点として可視化することができます。イメージングソフトウェアは自動的に大きなデータセットの計算分析に特に有用である顕微鏡画像でEDUの涙点を特定するために適用することができます。核DNA複製の不完全な阻害は、染色体上の異なる遺伝子座におけるEDUの取り込みにつながり、核内部の斑点として表示することができますので、しかし、注意事項は、注意が必要です。また、他の例では、EDUの強度はREPLIに組み込みます背景とノイズが高くなる可能性がながらcatingのmtDNAは、弱いかもしれません。そのため、自動画像解析のための個々のパラメータは、慎重に定義する必要があります。また、画像は適切なEDUの斑点が識別されていることを確認するために、専門家の目で検証されなければならないことをお勧めします。 ショウジョウバエの卵形成の間に新たに合成されたミトコンドリアDNAの可視化は、ミトコンドリアDNAの複製が、薬理学的または遺伝的摂動の多様にさらさハエで実験を行うことにより、生理学的または病理学的条件の下で規制されているかを調査する機会を提供します。 COI T300I 11：以前の研究では、EDUの取り込みアッセイは、ミトコンドリアDNAの変異体ショウジョウバエのmtで行いました。また、ミトコンドリア膜電位を破壊するために、卵巣は、ミトコンドリアの脱共役剤FCCP又は2,4-ジニトロフェノール（DNP）前EDUの取り込みの種々の濃度で処理しました。実験の目的に応じておよび薬物の特性、異なる方法が効果的な送達のために採用される可能性があります。成体ハエのために、薬物は、蒸気（例えば、エタノール、コカイン）として提示することができる16,17または薬物は、それがすぐに本体18全体に拡散腹部に注入することができます。最も一般的な方法は、薬物は、フライ食品またはスクロース/薬物飽和濾紙に追加されることです。例えば、微小管集合の阻害剤、コルヒチンは、卵巣解剖19の前に2~3日間ハエに供給しました。したがって、薬物送達方法を評価し、適切な濃度を選択することが重要です。 ショウジョウバエ卵巣におけるミトコンドリアDNA複製の成功イメージングを確保するために、いくつかの重要なステップは、慎重に実行する必要があります。まず、解剖とEDUの取り込み中に卵巣の生存能力と健康を維持することが不可欠である（ステップ1及び2）。 FBSとシュナイダーのショウジョウバエ培地を室温に温めする必要があります使用前に。一つは卵室と解剖ツールやピペットチップとの間の直接的な接触を最小限に抑える必要があります。卵巣は脱水を避けるために、ソリューションの下にすべての回浸漬する必要があります。組織を誤操作することは容易に蛍光シグナルを失神またはNOにつながることはできません。組織実装工程時に、ovariolesが互いに分離されるべきであり、顕微鏡スライド上に広げ。卵室は、互いの上に積み重ねられていないことを確認します。私たちは、ステージ14を越えて卵室は少しEDUの取り込みを表示していることに気づきました。また、ためにサイズが大きい、後期卵室は、多くの場合、隣接若い卵室の焦点が合ってにさせます。したがって、後期卵室が破棄されることをお勧めします。 ここでは、 ショウジョウバエの大人の卵巣でのmtDNAの複製を標識するための詳細なプロトコルを提供します。この方法は、様々な遺伝的および薬理学的摂動下でのmtDNAの複製の簡単な定量を可能にします、および発生ミトコンドリア生合成およびミトコンドリアDNAの継承のメカニズムを解剖するために有用であろう。

核ゲノムのほかに、各真核細胞はまた、ミトコンドリアマトリックス中の小さな環状DNAのコピー数千人が含まれています。ミトコンドリアDNA（mtDNAの）は電子伝達鎖の必須のサブユニットをコードするが、ミトコンドリアDNAの複製および転写のためのすべての因子を含むミトコンドリアプロテオームの大部分は、核ゲノムによってコードされています。継承のメンデル法則を次の核ゲノムとは対照的に、動物のミトコンドリアゲノムは母方の家系が独占的に継承されます。したがって、ミトコンドリアDNAが増殖し、女性の卵母細胞を介して、世代から世代へと伝達され、どのように理解することが基本的に重要です。しかし、ミトコンドリアDNAの複製は女性の生殖細胞系列に調節されている方法を超える継続的な議論があります。また、mtDNAの伝送のための広く受け入れられたmtDNAのボトルネック理論は、始原生殖細胞におけるミトコンドリアDNAの集団は比較的少数ドゥリンにサブサンプリングされることを示唆していますグラムの開発1 2。また、ミトコンドリアDNAの複製は、時間的および空間的に卵形成の間に調節されることを意味します。したがって、生殖系列発達中のミトコンドリアDNA複製のその場での検出は、ミトコンドリアDNAの継承のメカニズムの理解を容易にします。 ショウジョウバエの卵形成は、ミトコンドリアDNAの複製および送信を研究するための遺伝的に扱いやすいシステムを提供します。 2 ショウジョウバエ卵巣の各々において、産卵の機能単位であるovarioles 3と呼ばれる卵室16-20独立した文字列は、（ 図1Aを参照）があります。各卵巣管は、前方先端が胚腺と呼ばれる構造で構成されている卵形成の漸進的な線形組織を、含まれています。胚腺はさらに、異なる発生段階の胚細胞を含む4つの領域に分割されています。領域1においては、生殖細胞系列幹細胞は、Cとして知られている娘細胞を産生するために、非対称分裂を経ますystoblasts。領域2aは、それらの最終的な分裂を完了したcystoblastsが含まれています。 Cystoblasts除算産16セル群の4ラウンドを受けます。 16細胞は、リング運河と呼ばれる細胞質ブリッジによって相互に接続されたまま。他の15の倍数体ナース細胞として発展しつつ細胞のみの1は、卵母細胞などの分化にコミットします。 fusomeとして知られている本質的な細胞質の構造は、リング運河の形成を促進する嚢胞極性及びナース細胞-卵母細胞相互作用4,5を決定することが提案されています。嚢胞は、領域2bに向かって移動すると、嚢胞構造が胚腺の幅全体に及ぶ、そしてより多くの毛包細胞に関連になります。胚腺の構成は、第1の新進卵室を含む領域3で終了します。その後、卵室は14の形態学的に異なる段階で卵巣管を経て進行胚腺の後端に組み付けられています。卵母細胞の成長はWH、ナース細胞に依存します卵母細胞へリング運河を経由してICH輸送タンパク質、mRNAおよび内膜構造（ 例えば 、ゴルジ）。 ショウジョウバエの卵形成時には、それが各16セル嚢胞内のミトコンドリアの画分はfusomeに関連していたことが判明した、リング運河を通って移動し、Balbiani本体6と呼ばれる大きな塊で、単一の卵母細胞に送達しました。この現象は、女性の卵巣を介してミトコンドリア遺伝の品質管理に貢献することが提案されました。 ミトコンドリアDNA合成の検出は、細胞DNAへの標識DNA前駆体の取り込みに依存しています。伝統的に、チミジン、5-ブロモ-2&#39;-デオキシウリジン（BrdU）のヌクレオシド類似体は、組織培養細胞7,8内のmtDNAの複製を標識するために使用しました。しかし、抗体ベースのBrdU標識は、特に、全マウント組織染色のために、いくつかの制限を示します。 BrdU標識の1つの主要な欠点は、それが露出するようにDNAの変性を必要とすることですBrdUのエピトープは、抗BrdU抗体によって検出することができます。試料は、化学物質（ 例えば、塩酸またはメタノールと酢酸の混合物）のような過酷な変性条件下で処理する必要があり、熱、または消化試料の構造を破壊し、以下の染色手順9を複雑にし得るDNアーゼと、 10。 ここでは、代替チミジンアナログ5エチニル-2&#39;-デオキシウリジン（EDU）は、ショウジョウバエの大人の卵巣で複製ミトコンドリアDNAを標識するために使用されます。この方法は、より速く、より高感度です。 EDUを容易にDNA複製の間に細胞のDNAに組み込まれます。以下の検出を「クリック」反応に基づいており、銅（I）は、末端アルキン基と蛍光アジド10との間の共有結合反応を触媒による。反応は、試料の変性を必要としないので、それは良好な構造保存を可能にします。色素Aのさらに、サイズzideは1/500ホールマウント組織の迅速かつ効率的な浸透を可能にする抗体分子10のそれのです。私たちは、 ショウジョウバエの卵形成時にミトコンドリアDNAの複製を検出するために、このメソッドを使用し、複製依存ミトコンドリアDNAの選択的継承機構を提案する私たちを導くショウジョウバエ卵巣 11、の胚腺領域での印象的な空間パターンを発見しました。ここでは、ショウジョウバエの卵巣におけるミトコンドリアDNA複製のEDUのラベリングに関する詳細なプロトコルを提示します。 11、ならびにミトコンドリア膜電位を放散し、潜在的にミトコンドリアDNAの複製を妨害するミトコンドリア脱共役剤の多様な治療で：プロトコルの適用を実証するために、我々はまた、ミトコンドリアDNAの変異体ショウジョウバエ （COI T300I MT）でのmtDNAの複製をテストしました。

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Schneider&#8217;s Drosophila medium</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>21720-024</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FBS</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>10100-147</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pair of Dumont #5 Forceps</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>11252-20</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Aphidicolin</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A0781</td>
			<td>Aliquot after dissolving in DMSO. Avoid repetitive thawing and freezing. Protect from light. May be used within 6 weeks after dissolving.&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FCCP</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C2920</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DMSO</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>D2650</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paraformaldehyde, 16% EM grade</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>15710</td>
			<td>Formaldehyde is toxic; it should be handled in a fume hood with skin and eye protection.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBS</td>
			<td>KD Medical</td>
			<td>RGF-3190</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BSA</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A7030</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>T9284</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Click-iT EdU Alexa Fluor 488 Imaging Kit</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>C10337</td>
			<td>EdU, CuSO4, Alexa Fluor 488 azide, EdU reaction buffer and Edu buffer additive are included</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mouse ATP synthase subunit &#945; antibody, (15H4C4)</td>
			<td>MitoSciences</td>
			<td>Ab14748</td>
			<td>1:1000 dilution</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mouse Hts antibody (clone RC)</td>
			<td>Developmental Studies Hybridoma Bank (DSHB)</td>
			<td>hts RC</td>
			<td>1:1000 dilution</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat anti-mouse Alexa Fluor 568 secondary antibody</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>A-11004</td>
			<td>1:200 dilution</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vectashield mounting medium with DAPI</td>
			<td>Vector Laboratories</td>
			<td>H-1500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass coverslips, #1.5 22 x 22 mm</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>12-541-B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope slide</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>22-038-103</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nail polish</td>
			<td>Elf</td>
			<td></td>
			<td>Many of the pigments used in nail polishes are fluorescent and leach into specimens. Only clear nail polish should be used.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

in situ labeling of mitochondrial dna replication in drosophila adult ovaries by edu staining

The mitochondrial genome is inherited exclusively through the maternal line. Understanding of how the mitochondrion and its genome are proliferated and transmitted from one generation to the next through the female oocyte is of fundamental importance. Because of the genetic tractability, and the elegant, ordered simplicity by which oocyte development proceeds, Drosophila oogenesis has become an invaluable system for mitochondrial study. An EdU (5-ethynyl-2&#180;-deoxyuridine) labeling method was utilized to detect mitochondrial DNA (mtDNA) replication in Drosophila ovaries. This method is superior to the BrdU (5-bromo-2'-deoxyuridine) labeling method in that it allows for good structural preservation and efficient fluorescent dye penetration of whole-mount tissues.
Here we describe a detailed protocol for labeling replicating mitochondrial DNA in Drosophila adult ovaries with EdU. Some technical solutions are offered to improve the viability of the ovaries, maintain their health during preparation, and ensure high-quality imaging. Visualization of newly synthesized mtDNA in the ovaries not only reveals the striking temporal and spatial pattern of mtDNA replication through oogenesis, but also allows for simple quantification of mtDNA replication under various genetic and pharmacological perturbations.

上記のプロトコルは、 ショウジョウバエの卵形成時にミトコンドリアDNAの複製を示すミトコンドリア（ 図1B-C）、関連付けられている点状の構造の可視化を可能にします。 EDUの斑点は、ATP合成酵素αサブユニット（ 図2）のために染色することによってマークされ、ミトコンドリアに局在します。観察された信号は、これらの斑点が実際にmtDNA.Aphidicolinを複製するラベルがミトコンドリアDNAの複製（ 図2）に影響を与えることなく、核DNAの染色を阻害するために使用されたことを検証し、エチジウムブロマイド11、mtDNAの複製14用の阻害剤で処理卵巣に存在しませんでした。アフィジコリン処理をせず、強烈なEDU信号は（ 図3）核を標識し、ミトコンドリアDNAの斑点がほとんど検出されました。しかし、アフィジコリンの存在下では、核の取り込みを劇的に減少し、ミトコンドリアに関連する多くの斑点が観察されました。 図1B）があります。しかし、特に、ミトコンドリアDNAの複製は、胚腺内の空間パターンを示しました。 EDUの涙点の数によって示されるように、胚腺の領域1におけるミトコンドリアDNA複製の適度なレベルが、領域2A（ 図1C）をほとんどEDUの取り込みがあります。嚢胞は、胚腺に領域2Bまで移動すると、ミトコンドリアDNAの複製が再開され、領域2Bの後部嚢胞におけるEDUの涙点の数は、領域2A（ 図1C）よりもはるかに高かったです。 HUのli太極拳シャオ（HTS）タンパク質によって染色として具体的には、集中的なEDUの取り込みは、リング運河やfusome構造の周りに濃縮しました。ミトコンドリアDNAは、胚腺の領域3に高レベルで複製し続ける（ 図1C） specifの関連性を実証するために、IC遺伝子もしくはミトコンドリアDNAの増殖での処理は、 ショウジョウバエ卵巣は、遺伝子操作または薬物処理を施すことができます。私たちは、FCCP、ミトコンドリア膜電位を放散させる古典的なミトコンドリアプロトノフォア、異なる濃度の卵巣を処理しました。対照として、DMSOは、ミトコンドリアDNAの複製（ 図4A）に影響を及ぼしませんでした。 FCCPの高用量（10μM）をほぼ完全に胚腺（ 図4D）全体のmtDNAの複製を枯渇します。それにもかかわらず、FCCP（2または5μM）の低濃度は、地域2Bおよび3はミトコンドリアの混乱に対してより敏感である示唆し、地域2Bおよび3（ 図4B-C）における領域1におけるミトコンドリアDNAの複製に与える影響は軽微ますが阻害さ複製を持っていた、または彼らは相対的に遅い複製速度を維持します。上記の結果は、ミトコンドリアDNA複製がミトコンドリア活性と関連していることが示されました。特に、胚腺の異なる領域は、ミトコンドリアIMPに対して異なる回答しましたairment。 <img alt="図1" src="/files/ftp_upload/54516/54516fig1.jpg" /> ショウジョウバエの卵形成の間に 、図1 のmtDNA複製。 ショウジョウバエ卵巣管と胚腺の拡大図の（A）図。卵巣管は、右後部に前部、卵室の連続した発達段階に左から示しています。胚腺において、fusome（赤）、生殖系列幹細胞（青）、ミトコンドリア（緑）、将来の卵母細胞（位置決め、fusome構造およびミトコンドリアクラスターによって認識破線）、現像嚢胞（モモ）と4つの発達領域が示されています。 （B）HTS-RC、リング運河とfusomeためのマーカーに対するEDUと抗体によって標識野生型卵巣管の代表zスタック投影。アフィジコリンの存在下では、EDUは、ミトコンドリアDNA（矢じり）および核（矢印）に組み込まれました。スケールバーは10μm。（C）Bに箱入りの地域で概説germariaの拡大図。 4発達領域が示されています。スケールバー、5μmの11。 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54516/54516fig1large.jpg" target="_blank">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。</a> <img alt="図2" src="/files/ftp_upload/54516/54516fig2.jpg" /> アフィジコリン処理とEDUの取り込みによって可視化ショウジョウバエ胚腺における 図2 のmtDNA複製 （A） - （D）EDUの取り込みを示す野生型胚腺の代表的な共焦点セクション（緑、b）は、ミトコンドリア、ATP合成酵素αサブユニット染色によってマーク（赤、C）、および核、DNAポリメラーゼαインヒビターアフィジコリンとのプレインキュベーションでDAPI染色（青色、D）で標識しました。 （A＆＃39 ;-D &#39;）中の四角で囲まれた領域のA拡大画像（A）EDUの取り込み（Bを示す&#39;）、ミトコンドリア（C &#39;）と核（D&#39;）。アフィジコリンの存在下では、核の取り込み（矢印）が低減され、多くの斑点はミトコンドリア（矢印）内に局在しました。スケールバーは10μm。図は、11から変更されている。 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54516/54516fig2large.jpg" target="_blank">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。</a> <img alt="図3" src="/files/ftp_upload/54516/54516fig3.jpg" /> 図3.ミトコンドリアDNAの複製は、かろうじてアフィジコリン処理を行わずに、ショウジョウバエの胚腺内で検出された （A） - 。でマークされたEDUの取り込み（緑）を示す野生型胚腺の（D）代表共焦点セクション、ミトコンドリア、DNAポリメラーゼαインヒビターアフィジコリンの非存在下でのDAPI染色（青色）で標識したATP合成酵素αサブユニットの染色（赤）、及び核。 （A&#39;-D &#39;）A拡大（A）中の四角で囲まれた領域の画像EDU取り込み（Bを示す&#39;）、ミトコンドリア（C &#39;）および核（D&#39;）。アフィジコリンことなく、強烈なEDU信号ラベル核（矢印）、およびミトコンドリアDNAの斑点はほとんど検出されました。スケールバーは10μm。図は、11から変更されている。 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54516/54516fig3large.jpg" target="_blank">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。</a> <img alt="図4" src="/files/ftp_upload/54516/54516fig4.jpg" /> 図4.ミトコンドリア脱共役剤は、ミトコンドリアDNAの複製を阻害する。DMSOで処理された野生型胚腺を示す代表的zスタックのプロジェクトを（A）または2μM（B）、5μM（C）、EDUの取り込み中に10μM（D）の濃度でミトコンドリアの脱共役剤FCCP。 2μMFCCP（B）で処理された領域2Bの減損EDUのラベリングをメモし、領域2Bと5μMのFCCPで処理された3の両方で（ボックスに概説）。フォー発達領域が示されています。アローズ、核DNA;矢じり、mtDNAを。スケールバーは10μm。図は、11から変更されている。 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54516/54516fig4large.jpg" target="_blank">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。</a>

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In Situ Labeling of Mitochondrial DNA Replication in Drosophila Adult Ovaries by EdU Staining

Drosophila oogenesis continues to be exceptionally useful in the study of mitochondrial proliferation and inheritance. This manuscript describes a detailed protocol used to label the replicating mitochondrial DNA (mtDNA) in Drosophila adult ovaries with 5-ethynyl-2&#180;-deoxyuridine (EdU), which facilitates uncovering mechanisms associated with mitochondrial inheritance that were previously debatable.

EDU染色によりショウジョウバエアダルト卵巣内のミトコンドリアDNA複製のその場の標識で

The mitochondrial genome is inherited exclusively through the maternal line. Understanding of how the mitochondrion and its genome are proliferated and ...

in-situ-labeling-mitochondrial-dna-replication-drosophila-adult

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Genetics

In Situ Labeling of Mitochondrial DNA Replication in Drosophila Adult Ovaries by EdU Staining

9.0K ビュー.  National Institutes of Health. Drosophila oogenesis continues to be exceptionally useful in the study of mitochondrial proliferation and inheritance. This manuscript describes a detailed protocol used to label the replicating mitochondrial DNA (mtDNA) in Drosophila adult ovaries with 5-ethynyl-2´-deoxyuridine (EdU), which facilitates uncovering mechanisms associated with mitochondrial inheritance that were previously debatable.

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Genome-wide Determination of Mammalian Replication Timing by DNA Content Measurement

Replication of the genome occurs during S phase of the cell cycle in a highly regulated process that ensures the fidelity of DNA duplication. Each genomic region is replicated at a distinct time during S phase through the simultaneous activation of multiple origins of replication. Time of replication (ToR) correlates with many genomic and epigenetic features and is linked to mutation rates and cancer. Comprehending the full genomic view of the replication program, in health and disease is a major future goal and challenge.
This article describes in detail the &#34;Copy Number Ratio of S/G1 for mapping genomic Time of Replication&#34; method (herein called: CNR-ToR), a simple approach to map the genome wide ToR of mammalian cells. The method is based on the copy number differences between S phase cells and G1 phase cells. The CNR-ToR method is performed in 6 steps: 1. Preparation of cells and staining with propidium iodide (PI); 2. Sorting G1 and S phase cells using fluorescence-activated cell sorting (FACS); 3. DNA purification; 4. Sonication; 5. Library preparation and sequencing; and 6. Bioinformatic analysis. The CNR-ToR method is a fast and easy approach that results in detailed replication maps.

We describe here a relatively fast and simple approach for mapping genome-wide mammalian replication timing, from cell isolation to the basic analysis of the sequencing results. A genomic map of a representative replication program will be provided following the protocol.

DNA含有量測定法による哺乳類の複製タイミングのゲノムワイドな決意

Replication of the genome occurs during S phase of the cell cycle in a highly regulated process that ensures the fidelity of DNA duplication. Each genomic ...

遺伝学

Targeted in Situ Mutagenesis of Histone Genes in Budding Yeast

We describe a PCR- and homologous recombination-based system for generating targeted mutations in histone genes in budding yeast cells. The resulting mutant alleles reside at their endogenous genomic sites and no exogenous DNA sequences are left in the genome following the procedure. Since in haploid yeast cells each of the four core histone proteins is encoded by two non-allelic genes with highly homologous open reading frames (ORFs), targeting mutagenesis specifically to one of two genes encoding a particular histone protein can be problematic. The strategy we describe here bypasses this problem by utilizing sequences outside, rather than within, the ORF of the target genes for the homologous recombination step. Another feature of this system is that the regions of DNA driving the homologous recombination steps can be made to be very extensive, thus increasing the likelihood of successful integration events. These features make this strategy particularly well-suited for histone gene mutagenesis, but can also be adapted for mutagenesis of other genes in the yeast genome.

Targeted in Situ Mutagenesis of Histone Genes in Budding Yeast

A strategy for generating mutations in histone genes at their endogenous location in Saccharomyces cerevisiae is presented.

ターゲットを絞りました<em&gt;その場で</em出芽酵母におけるヒストン遺伝子の&gt;突然変異誘発

We describe a PCR- and homologous recombination-based system for generating targeted mutations in histone genes in budding yeast cells. The resulting ...

Kinetics of Lagging-strand DNA Synthesis In Vitro by the Bacteriophage T7 Replication Proteins

Here we provide protocols for the kinetic examination of lagging-strand DNA synthesis in vitro by the replication proteins of bacteriophage T7. The T7 replisome is one of the simplest replication systems known, composed of only four proteins, which is an attractive feature for biochemical experiments. Special emphasis is placed on the synthesis of ribonucleotide primers by the T7 primase-helicase, which are used by DNA polymerase to initiate DNA synthesis. Because the mechanisms of DNA replication are conserved across evolution, these protocols should be applicable, or useful as a conceptual springboard, to investigators using other model systems. The protocols described here are highly sensitive and an experienced investigator can perform these experiments and obtain data for analysis in about a day. The only specialized piece of equipment required is a rapid-quench flow instrument, but this piece of equipment is relatively common and available from various commercial sources. The major drawbacks of these assays, however, include the use of radioactivity and the relative low throughput.

Kinetics of Lagging-strand DNA Synthesis In Vitro by the Bacteriophage T7 Replication Proteins

We describe sensitive, gel-based discontinuous assays to examine the kinetics of lagging-strand initiation using the replication proteins of bacteriophage T7.

遅行本鎖DNA合成の動態<em&gt;インビトロ</em&gt;バクテリオファージT7複製タンパク質によって

Here we provide protocols for the kinetic examination of lagging-strand DNA synthesis in vitro by the replication proteins of bacteriophage T7. The T7 ...

High Resolution Fluorescent In Situ Hybridization in Drosophila Embryos and Tissues Using Tyramide Signal Amplification

In our efforts to determine the patterns of expression and subcellular localization of Drosophila RNAs on a genome-wide basis, and in a variety of tissues, we have developed numerous modifications and improvements to our original fluorescent in situ hybridization (FISH) protocol. To facilitate throughput and cost effectiveness, all steps, from probe generation to signal detection, are performed using exon 96-well microtiter plates. Digoxygenin (DIG)-labelled antisense RNA probes are produced using either cDNA clones or genomic DNA as templates. After tissue fixation and permeabilization, probes are hybridized to transcripts of interest and then detected using a succession of anti-DIG antibody conjugated to biotin, streptavidin conjugated to horseradish peroxidase (HRP) and fluorescently conjugated tyramide, which in the presence of HRP, produces a highly reactive intermediate that binds to electron dense regions of immediately adjacent proteins. These amplification and localization steps produce a robust and highly localized signal that facilitates both cellular and subcellular transcript localization. The protocols provided have been optimized to produce highly specific signals in a variety of tissues and developmental stages. References are also provided for additional variations that allow the simultaneous detection of multiple transcripts, or transcripts and proteins, at the same time.

High Resolution Fluorescent In Situ Hybridization in Drosophila Embryos and Tissues Using Tyramide Signal Amplification

The described RNA in situ hybridization protocol allows the detection of RNA in whole Drosophila embryos or dissected tissues. Using 96-well microtiter plates and tyramide signal amplification, transcripts can be detected at high resolution, sensitivity, and throughput, and at a relatively low cost.

ショウジョウバエの胚とパスチラミドシグナル信号増幅を利用した生体表面の高解像度蛍光In Situハイブリダイゼーション

In our efforts to determine the patterns of expression and subcellular localization of Drosophila RNAs on a genome-wide basis, and in a variety of ...

Profiling DNA Replication Timing Using Zebrafish as an In Vivo Model System

DNA replication timing is an important cellular characteristic, exhibiting significant relationships with chromatin structure, transcription, and DNA mutation rates. Changes in replication timing occur during development and in cancer, but the role replication timing plays in development and disease is not known. Zebrafish were recently established as an in vivo model system to study replication timing. Here is detailed the protocols for using the zebrafish to determine DNA replication timing. After sorting cells from embryos and adult zebrafish, high-resolution genome-wide DNA replication timing patterns can be constructed by determining changes in DNA copy number through analysis of next generation sequencing data. The zebrafish model system allows for evaluation of the replication timing changes that occur in vivo throughout development, and can also be used to assess changes in individual cell types, disease models, or mutant lines. These methods will enable studies investigating the mechanisms and determinants of replication timing establishment and maintenance during development, the role replication timing plays in mutations and tumorigenesis, and the effects of perturbing replication timing on development and disease.

Profiling DNA Replication Timing Using Zebrafish as an In Vivo Model System

Zebrafish were recently used as an in vivo model system to study DNA replication timing during development. Here is detailed the protocols for using zebrafish embryos to profile replication timing. This protocol can be easily adapted to study replication timing in mutants, individual cell types, disease models, and other species.

In Vivoモデル システムとしてゼブラフィッシュを用いた DNA 複製タイミングのプロファイリング

DNA replication timing is an important cellular characteristic, exhibiting significant relationships with chromatin structure, transcription, and DNA ...

Genome-wide Surveillance of Transcription Errors in Eukaryotic Organisms

Accurate transcription is required for the faithful expression of genetic information. Surprisingly though, little is known about the mechanisms that control the fidelity of transcription. To fill this gap in scientific knowledge, we recently optimized the circle-sequencing assay to detect transcription errors throughout the transcriptome of Saccharomyces cerevisiae, Drosophila melanogaster, and Caenorhabditis elegans. This protocol will provide researchers with a powerful new tool to map the landscape of transcription errors in eukaryotic cells so that the mechanisms that control the fidelity of transcription can be elucidated in unprecedented detail.

This protocol provides researchers with a new tool to monitor the fidelity of transcription in multiple model organisms.

真核生物の転写エラーのゲノム全体の監視

Accurate transcription is required for the faithful expression of genetic information. Surprisingly though, little is known about the mechanisms that ...

Visualization of Microbiota in Tick Guts by Whole-mount In Situ Hybridization

Infectious diseases transmitted by arthropod vectors continue to pose a significant threat to human health worldwide. The pathogens causing these diseases, do not exist in isolation when they colonize the vector; rather, they likely engage in interactions with resident microorganisms in the gut lumen. The vector microbiota has been demonstrated to play an important role in pathogen transmission for several vector-borne diseases. Whether resident bacteria in the gut of the Ixodes scapularis tick, the vector of several human pathogens including Borrelia burgdorferi, influence tick transmission of pathogens is not determined. We require methods for characterizing the composition of the bacteria associated with the tick gut to facilitate a better understanding of potential interspecies interactions in the tick gut. Using whole-mount in situ hybridization to visualize RNA transcripts associated with particular bacterial species allows for the collection of qualitative data regarding the abundance and distribution of the microbiota in intact tissue. This technique can be used to examine changes in the gut microbiota milieu over the course of tick feeding and can also be applied to analyze expression of tick genes. Staining of whole tick guts yield information about the gross spatial distribution of target RNA in the tissue without the need for three-dimensional reconstruction and is less affected by environmental contamination, which often confounds the sequencing-based methods frequently used to study complex microbial communities. Overall, this technique is a valuable tool that can be used to better understand vector-pathogen-microbiota interactions and their role in disease transmission.

Visualization of Microbiota in Tick Guts by Whole-mount In Situ Hybridization

Here, we present a protocol to spatially and temporally assess the presence of viable microbiota in tick guts using a modified whole-mount in situ hybridization approach.

ホール マウントIn Situハイブリダイゼーションによる目盛りの腸内微生物叢の可視化

Infectious diseases transmitted by arthropod vectors continue to pose a significant threat to human health worldwide. The pathogens causing these ...

Methodology for Accurate Detection of Mitochondrial DNA Methylation

Quantification of DNA methylation can be achieved using bisulfite sequencing, which takes advantage of the property of sodium bisulfite to convert unmethylated cytosine into uracil, in a single-stranded DNA context. Bisulfite sequencing can be targeted (using PCR) or performed on the whole genome and provides absolute quantification of cytosine methylation at the single base-resolution. Given the distinct nature of nuclear- and mitochondrial DNA, notably in the secondary structure, adaptions of bisulfite sequencing methods for investigating cytosine methylation in mtDNA should be made. Secondary and tertiary structure of mtDNA can indeed lead to bisulfite sequencing artifacts leading to false-positives due to incomplete denaturation poor access of bisulfite to single-stranded DNA. Here, we describe a protocol using an enzymatic digestion of DNA with BamHI coupled with bioinformatic analysis pipeline to allow accurate quantification of cytosine methylation levels in mtDNA. In addition, we provide guidelines for designing the bisulfite sequencing primers specific to mtDNA, in order to avoid targeting undesirable NUclear MiTochondrial segments (NUMTs) inserted into the nuclear genome.

Here, we present a protocol to allow accurate quantification of mitochondrial DNA (mtDNA) methylation. In this protocol, we describe an enzymatic digestion of DNA with BamHI coupled with a bioinformatic analysis pipeline which can be used to avoid overestimation of mtDNA methylation levels caused by the secondary structure of mtDNA.

ミトコンドリア DNA のメチル化の正確な検出のための方法論

Quantification of DNA methylation can be achieved using bisulfite sequencing, which takes advantage of the property of sodium bisulfite to convert ...

Characterizing Histone Post-translational Modification Alterations in Yeast Neurodegenerative Proteinopathy Models

Neurodegenerative diseases, such as amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and Parkinson&#39;s disease (PD), cause the loss of hundreds of thousands of lives each year. Effective treatment options able to halt disease progression are lacking. Despite the extensive sequencing efforts in large patient populations, the majority of ALS and PD cases remain unexplained by genetic mutations alone. Epigenetics mechanisms, such as the post-translational modification of histone proteins, may be involved in neurodegenerative disease etiology and progression and lead to new targets for pharmaceutical intervention. Mammalian in vivo and in vitro models of ALS and PD are costly and often require prolonged and laborious experimental protocols. Here, we outline a practical, fast, and cost-effective approach to determining genome-wide alterations in histone modification levels using Saccharomyces cerevisiae as a model system. This protocol allows for comprehensive investigations into epigenetic changes connected to neurodegenerative proteinopathies that corroborate previous findings in different model systems while significantly expanding our knowledge of the neurodegenerative disease epigenome.

This protocol outlines experimental procedures to characterize genome-wide changes in the levels of histone post-translational modifications (PTM) occurring in connection with the overexpression of proteins associated with ALS and Parkinson&#39;s disease in Saccharomyces cerevisiae models. After SDS-PAGE separation, individual histone PTM levels are detected with modification-specific antibodies via Western blotting.

酵母神経変性認知症予備モデルにおけるヒストン翻訳後修飾変化の特性

Neurodegenerative diseases, such as amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and Parkinson&#39;s disease (PD), cause the loss of hundreds of thousands of lives ...

In Vivo Functional Study of Disease-associated Rare Human Variants Using Drosophila

Advances in sequencing technology have made whole-genome and whole-exome datasets more accessible for both clinical diagnosis and cutting-edge human genetics research. Although a number of in silico algorithms have been developed to predict the pathogenicity of variants identified in these datasets, functional studies are critical to determining how specific genomic variants affect protein function, especially for missense variants. In the Undiagnosed Diseases Network (UDN) and other rare disease research consortia, model organisms (MO) including Drosophila, C. elegans, zebrafish, and mice are actively used to assess the function of putative human disease-causing variants. This protocol describes a method for the functional assessment of rare human variants used in the Model Organisms Screening Center Drosophila Core of the UDN. The workflow begins with gathering human and MO information from multiple public databases, using the MARRVEL web resource to assess whether the variant is likely to contribute to a patient&#39;s condition as well as design effective experiments based on available knowledge and resources. Next, genetic tools (e.g., T2A-GAL4 and UAS-human cDNA lines) are generated to assess the functions of variants of interest in Drosophila. Upon development of these reagents, two-pronged functional assays based on rescue and overexpression experiments can be performed to assess variant function. In the rescue branch, the endogenous fly genes are &#34;humanized&#34;&#160;by replacing the orthologous Drosophila gene with reference or variant human transgenes. In the overexpression branch, the reference and variant human proteins are exogenously driven in a variety of tissues. In both cases, any scorable phenotype (e.g., lethality, eye morphology, electrophysiology) can be used as a read-out, irrespective of the disease of interest. Differences observed between reference and variant alleles suggest a variant-specific effect, and thus likely pathogenicity. This protocol allows rapid, in vivo assessments of putative human disease-causing variants of genes with known and unknown functions.

In Vivo Functional Study of Disease-associated Rare Human Variants Using Drosophila

The goal of this protocol is to outline the design and performance of in vivo experiments in Drosophila melanogaster to assess the functional consequences of rare gene variants associated with human diseases.

ショウジョウバエを用した疾患関連希少ヒト変異体の生体内機能的研究

Advances in sequencing technology have made whole-genome and whole-exome datasets more accessible for both clinical diagnosis and cutting-edge human ...

EDU染色によりショウジョウバエアダルト卵巣内のミトコンドリアDNA複製のその場の標識で

要約

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この動画の章

DNA含有量測定法による哺乳類の複製タイミングのゲノムワイドな決意

ターゲットを絞りました

遅行本鎖DNA合成の動態

ショウジョウバエの胚とパスチラミドシグナル信号増幅を利用した生体表面の高解像度蛍光In Situハイブリダイゼーション

In Vivoモデルシステムとしてゼブラフィッシュを用いた DNA 複製タイミングのプロファイリング

真核生物の転写エラーのゲノム全体の監視

ホールマウントIn Situハイブリダイゼーションによる目盛りの腸内微生物叢の可視化

ミトコンドリア DNA のメチル化の正確な検出のための方法論

酵母神経変性認知症予備モデルにおけるヒストン翻訳後修飾変化の特性

ショウジョウバエを用した疾患関連希少ヒト変異体の生体内機能的研究

EDU染色によりショウジョウバエアダルト卵巣内のミトコンドリアDNA複製のその場の標識で

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DNA含有量測定法による哺乳類の複製タイミングのゲノムワイドな決意

ターゲットを絞りました

遅行本鎖DNA合成の動態

ショウジョウバエの胚とパスチラミドシグナル信号増幅を利用した生体表面の高解像度蛍光In Situハイブリダイゼーション

In Vivoモデル システムとしてゼブラフィッシュを用いた DNA 複製タイミングのプロファイリング

真核生物の転写エラーのゲノム全体の監視

ホール マウントIn Situハイブリダイゼーションによる目盛りの腸内微生物叢の可視化

ミトコンドリア DNA のメチル化の正確な検出のための方法論

酵母神経変性認知症予備モデルにおけるヒストン翻訳後修飾変化の特性

ショウジョウバエを用した疾患関連希少ヒト変異体の生体内機能的研究

In Vivoモデルシステムとしてゼブラフィッシュを用いた DNA 複製タイミングのプロファイリング

ホールマウントIn Situハイブリダイゼーションによる目盛りの腸内微生物叢の可視化