この作品は、米国地質調査所の生態系 (チェサピーク湾環境・水産) と環境衛生 (汚染物質生物学) プログラムおよび天然資源のウェストヴァージニア部によって賄われていた。商号の使用は識別のみを目的のため、米国政府の裏書を意味しません。

ここで説明する方法は、Leetown サイエンス センターの制度的動物ケアおよび使用委員会によって承認されています。
1. 魚のコレクション
<ol><li>ストレスを最小限に抑えて生きてる魚を収集します。ボートやバックパックの魚網、フック、ラインやネットを使用します。</li>
	<li>サンプリングまでライブ井戸や含気容器に魚を保持します。 注: 水産学会魚コレクション、処理および麻酔/安楽死26,27,28のガイドの数を公開しています。魚を処理するときは、手袋を着用します。</li>
</ol>2. 魚剖検
<ol><li>
魚を安楽死させます。
	<ol>
<li>蓋の動きは停止し、魚が平衡を失うまでは、麻酔薬で魚をプレイス.別の 2-10 分後に魚が安楽死します。しかし、これはまた種によって異なるかもしれません。 注: 魚は麻酔薬 (最も一般的に使用される材料の表を参照) 数で安楽死することができます。安楽死法は組織収集29に行われる実験室の測定によって異なります。</li>
	</ol>
</li>
	<li>
生体の特性を測定します。
	<ol>
<li>最も近いグラムに魚の重量を量る。</li>
		<li>最も近いミリメートルに魚の長さを測定します。<ol>
<li>口を閉じてとつままれて一緒に尾の端に鼻の先端から長さの合計を測定します。</li>
			<li>、鼻の先端に尾のフォークからフォークの長さと体 (尾の初め) の末尾に、鼻の先端からの標準の長さを測定します。</li>
		</ol>
</li>
		<li>次の式を使用して条件係数を計算します。 状態による係数 = (総体 - 生殖腺重量)/長さ3の合計します。 注: 生殖腺は合計体重は prespawn 女性魚で特に大きく貢献できるので、生殖腺重量は体内総重量から減算されます。</li>
	</ol>
</li>
	<li>
血液サンプルを取得します。 注: 血尾静脈から撮影は最も一般的がも背側大動脈から撤退したり心臓がパンク30。<ol>
<li>1 に 5 mL 注射器、魚の大きさに応じて 22 または 23 G 針尾静脈から末梢血液サンプルを抽出します。(図 1 aおよび1 b)、側線下尾エリア前方針を挿入します。背骨を押すまで角度を上向きにし、少しを引き出します。静脈穿刺部位の背骨に腹は。 注: 血液塗抹が行われる血清が必要な場合、抗凝固薬は使用されません。ほとんどの場合、プラズマが収集されますそして、それ故に、ナトリウム ヘパリン、EDTA やリチウムなど抗凝固剤コートに針と注射器を使用、また血のコレクションの管 (例えばバキュテナー) は。</li>
		<li>針を削除し、コレクションの管に血液を入れて前に鋭利物廃棄容器に配置します。 注: 血は氷に保持できますが、以降の解析によっては可能な30としてすぐに遠心する必要があります。</li>
		<li>核の異常や差分の血球数を評価する場合すぐに重複するきれいなガラス顕微鏡スライドに血を一滴を配置します。2 番目がバック ドロップでは、毛管作用によって表面を吸引し、45 ° の角度で差し込みます。31を空気乾燥することができます。</li>
		<li>堆積物に 15 分間、1,500-2,500 x gで血液細胞を遠心分離機します。滅菌ピペット、セラム チューブに分注で血漿/血清を外し、-80 ° C で保存</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57946/57946fig1.jpg"> 図 1: 魚から血液サンプルを取得します。(A) 最近安楽死の魚はその左右にある側線に置かれます。(B) A の針は挿入腹側に側線 (矢印)、針のバックボーンに触れるまでに上向きに 。それは少し撤回し、吸引開始血を撤回します。<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57946/57946fig1large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
<ol start="4"><li>
それぞれの魚の死体解剖に基づく健康診断を実施します。 注: を示すと病変や異常を記述する出版物の番号は、使用可能な32,33,34,35です。<ol>
<li>身体の表面とフィン (図 2)、目とエラ (図 3)、蛭 (図 2 D)、幼虫や吸虫メタセルカリア嚢胞 (図 2 Dなどの外部寄生虫に病変を含むドキュメント外部異常3 b) と鰓寄生虫 (図 3 D)。みえるタイプ、場所、データ ・ シート、観測された異常のサイズ同様に、可能であれば。</li>
		<li>はさみを使用して、蓋に肛門部から切断し、筋肉のフラップを削除することによって内臓を公開する腹腔内 (図 4 a) を開きます。 注: 前方の腎臓が収集される場合免疫機能 (下の手順 5. を参照) または細菌やウイルスに対して収集されたサンプル、70% アルコールで身体の外部表面を消毒し、死体解剖が実行される前にこれらのサンプルを取得する必要があります。組織は、目視観測、プラズマ解析および病理組織学的滅菌に使用されている場合、技術は必要ではありません。</li>
		<li>ドキュメント内部異常 (図 4) を含む様々 な臓器 (図 4 b-4D) の存在の一般的または焦点の変色領域 (図 4E)、嚢胞、寄生虫の発生し、サイズの異常 (拡大、萎縮)。</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57946/57946fig2.jpg"> 図 2: 体表面と魚のひれに目に見える病変の例観察。A (A) 小さい、少し侵食された病変部位 (矢印) 外側体。(B) A 大エリアの発赤 (矢印) 尾体表面を含みます。(C) 発生、体表やひれに黒い病変 (矢印)。(D) 蛭 (白い矢印) やフィンの小さな黒い斑点 (黒矢印)。スケール バー = 3 mm (E) は発生すると、ボディ表面の連続、淡い病変 (矢印)。<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57946/57946fig2large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57946/57946fig3.jpg"> 図 3: エラの可視病変と魚の目の例です。(A) は薄い色の目のレンズ内の領域 (矢印)。スケール バー = 5 mm. (B) 白 (白い矢印) の嚢胞と小さな黒い斑点 (黒矢印) カバー (、) のエラ蓋に吸虫の寄生によって引き起こされます。スケール バー = 1 cm. (C) A 淡い、侵食されたエリア (矢印) (、) のギルに。スケール バー = 5 mm. (D) 取り外された寄生虫 (矢印) を示す鰓は鰓に接続されています。スケール バー = 2 mm.<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57946/57946fig3large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57946/57946fig4.jpg"> 図 4:の魚の内部の異常と、剖検例.(A)、剖検時に魚は (白い矢印) に沿って切り開くし、筋肉 (黒矢印) のフラップを削除 (、) の生殖腺や脾臓、鉗子、はさみによって保持されているを公開します。(B) まだら肝 (a)、精巣 (b)、腸で脂肪胃は脂肪 (c) と (d) に囲まれました。スケール バー = 5 mm. (C) (a) と暗い赤の領域 (矢印)、卵巣 (b) (c) 腸肝。スケール バー = 5 mm. (D) 緑がかった変色領域 (矢印) と肝。スケール バー = 1 cm。 (E) (a) 通常の例と (b) 精巣異常発生結節。スケール バー = 1 cm.<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57946/57946fig4large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
<ol start="5"><li>
生殖インデックス (HSI) を取得します。
	<ol>
<li>肝臓を削除するには、肝動脈と前方の結合組織を切断します。トリミングの癒着や腸、内臓脂肪への接続中をそっと取り出します。胆嚢はパンクしないように注意します。肝臓の重量を量る。 注: コイなど、いくつかの魚は離散肝臓ですがラップされた腸および他の器官ではなく肝の組織を持っていません。肝臓重量を取得できないこれらの種の可能性があります。</li>
		<li>数式を使用して生殖インデックス (HSI) を計算します。 HSI = 肝重量/総体重</li>
	</ol>
</li>
	<li>
指数を計算します。
	<ol>
<li>生殖腺を除去し、それの重量を量る。</li>
		<li>数式を使用して指数 (GSI) を計算します。 GSI = 生殖腺重量/総体重</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. 顕微鏡の病理学のためにティッシュを維持します。
注: フィールドに組織の保存の数 10% 中性緩衝ホルマリンと Z の修理、亜鉛、ホルマリン系固定液などの定着剤を使用できます。後者は、最寄りでの in situハイブリダイゼーションや蛍光抗体の汚損などのメソッドを使用する場合。
<ol><li>慎重にカットが、組織サンプルを持って引っ張らないでください。個々 の組織の部分を保つ < 2 cm サイズで、< 適切な固定用板厚 5 mm。親指のルールとして適切な保全のため組織よりもボリュームが約 10 x より多く定着剤を使用します。サンプリング対象魚のサイズに応じて適切なサイズの同じ漏れ防止コンテナーに 1 匹の魚からのすべての組織サンプルを配置します。</li>
	<li>定着性のコンテナーに任意の外部異常の作品を配置します。また、隣接する正常組織片を含めます。 注: 不適切な圧縮または他の機械的損傷、空気や日光への長い露出など処理および凍結アーティファクトが発生することができます。</li>
	<li>様々 な地域から肝臓の少なくとも 5 つの 3-4 mm の厚い部分を切り取り、定着性の容器に。観測された場合正常と異常の領域が含まれます。</li>
	<li>サイズに応じて、固定コンテナーに全体の生殖腺や生殖腺の 1 つに沿って複数の部分を配置します。</li>
	<li>全臓器、小さな場合は、または他のすべての臓器 (脾臓、前部と後部の腎臓、エラ、心臓、腸と胃) の破片を定着性のコンテナーに配置します。異常な組織を観察すると、正常組織と同様の隣接する部分を保持します。</li>
</ol>4. 年齢解析、耳石を削除します。
注: 年齢は、魚病/魚の健康研究に重要な変数をすることができます。構造、スケール、棘などの数は、年齢の決定の使用されてきたが、構造の比較研究のほとんどは、最高の結果36,37を与えるに耳石を発見しました。魚類魚類耳石 - lapillus、サジッタ、asteriscus の 3 つのペアがあります。一般的には、矢状または lapillus 耳石は、種によって異なるかもしれませんが、高齢化の収集されます。除去と高齢化の技術は、上記38をされています。
<ol><li>ギル地峡を切って、頭部を後ろに曲げます。Prootic 嚢胞、上げられた骨領域を検索する脳頭蓋の下の部分の周り離れて結合および筋肉組織をストリップします。</li>
	<li>スコアや骨カッターでカット、耳石を公開するクラックします。彼らは肉眼で見ることができます。</li>
	<li>耳石が、ラベル付きバイアルやコイン封筒リングまたは単位38を数えることによって年齢を分析するまで室温で保管します。一度研究室に戻ってキャップを開き、徹底的にできるように、バイアルに配置する場合は、保存する前に乾燥します。</li>
</ol><img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57946/57946fig5.jpg"> 図 5: 耳石除去します。(A) 峡部はカットし、結合組織と筋肉を引っ張って離れて背骨と neurospinal 領域のベースを公開します。耳石を公開する (B) 骨が割れています。(C) Lapillar 耳石が削除されます。<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57946/57946fig5large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
5. 免疫機能の試金のため組織を取得します。
注: 前方の腎臓は主要な造血器官、リンパ球とマクロファージ機能の試金のためのソースとリンパ、貪食などの殺害能力機能の試金のため培養した培養する細胞も無菌削除される必要があります。マクロファージ39,40。
<ol><li>70% のエタノールと魚の外部表面をスプレーします。滅菌はさみ、メスや鉗子を使用して腹腔内を開き、泳ぐ膀胱の前方に位置する暗い赤い器官である前方の腎臓組織を削除します。</li>
	<li>メディア (例えばリーボビッツの L-15) 細胞を維持するために前腎サンプルを配置します。単一細胞懸濁液を滅菌手持ち組織グラインダー (例えば、 Tenbroeck 組織グラインダー) で腎臓のサンプルを均質化します。研究室に戻るまで濡れた氷の上を保持します。</li>
</ol>6. 核酸解析の組織を維持します。
注: 場合、トラン スクリプト豊富41または定量的 PCR42 (ポリメラーゼの連鎖反応) を使用して遺伝子発現など下流の分子分析が実施した、適切な防腐剤 (で評価される組織の断片を配置します。例えば、RNAlater 安定化ソリューション) できるだけ早く。
<ol><li>RNA の保全のためには、組織への防腐剤のボリュームの 10:1 の比率で適切な防腐剤で 2 ~ 3 小 (2-3 mm) 作品を配置します。 注: サンプル必要があります日光もしくは極端な暑さからシールドし、ウェットの氷上輸送。</li>
	<li>DNA 保存 95% エタノール (ボリュームによって組織にエタノール 10:1) に 2、3 組織の小片を配置します。濡れた氷のサンプルを保持し、-20 ° C で保存</li>
</ol>

著者が明らかに何もありません。

魚の健康の剖検に基づく評価は、調査官が外部と内部の両方の構造体の通常の外観の理解を持っている魚の種に活用できます。標準化されたアプローチを使用してサイトの種と個体群の季節的で、一時的な変化を比較することができます。結果は、点と面源汚染物質に関連した効果を識別するために、管理操作を通知するために使用できます。それは、管理操作が開始されると、改善を追跡する使用できます。方法論は、さまざまな方法で表示に外部異常のマニュアルを強化するために変更できます。目視観測のみに基づいて評価は、非致死的な比較的安価な多数の個人のデータを迅速に生成できます。その結果、探索や初期評価の変更を監視するために役立ちます時間の経過やその他の指標との組み合わせで。長さと魚の重量は、目視観測中に測定条件因子も算出できます。評価は目視のみに基づいて原因や関連するリスク要因、特定の皮膚異常45の長期的な傾向の情報を提供しないし、生体認証パラメーター46いくつかの分野で改善が示されています。水質改善の取り組みに関連付けられています。
剖検に基づく評価は、内臓も調べられ、生殖や指数などその他の条件の要因を計算できますより多くの情報を提供します。Goede とバートン22血液パラメーター、生体認証要因、異常、および特定の異常のインデックス値の割合を含むフィールド剖検手法を開発しました。方法の洗練には、可能性のある健康評価指標の計算に比べて統計的に23を許可いくつかの変数の深刻度の評価が含まれています。この健康評価指数は、米国の地質でプラズマと病理組織学的解析を含む他の生物学的指標地域サイト比較23,47,48との組み合わせに使用されています調査のバイオモニタ リングの環境状態と動向プログラム大河川全国49,50,51汚染物質暴露の潜在的な影響を評価します。魚病インデックスが外部から見える疾患に基づく、肝病変を開発し、北海、バルト海とアイスランド沖を広くが病理組織学的検出の寄生虫、目に見える肝腫瘍など。このインデックスは、生態系の健康指標52として重要なツールであること発見されました。
魚の死体解剖に基づく評価を行う上でいくつかの重要な要因があります。まず、死の直後に魚の評価を実施する必要があります。臓器の色との整合性の変化は、死後後かなり急速に発生します。さらに、いくつかの寄生虫の死の後ですぐにホストのままに可能性があります。第二に、関心の種の正常なものを知ることが重要です。例えば、いくつかの魚は通常脂肪が、その結果、薄い色、肝臓のほとんどの種は淡い肝臓が異常だろうが。また、自然発生する季節の変化を認識することが重要です。いくつかの魚が色の変化または産卵期に繁殖結節を開発します。
魚の健康評価の方法として剖検に基づく評価の制限、1) 一貫して特定の病変の「原因」を特定し、2) 肉眼に目に見えることができない影響を識別することができないことがあります。病理組織、病原体、寄生虫、および遺伝子発現の分子または文化の識別の追加と、これらの欠点を克服できます。例えば、腫瘍や隆起性病変 (腫れ) 可能性があります実際の腫瘍や寄生虫、炎症、浮腫がありますや過形成 (正常な細胞の数の増加) は、化学物質の暴露、感染性病原体または他の刺激によって引き起こされます。代表的な結果のように、決定的な腫瘍や腫瘍の診断、病変の種類と重症度 (すなわち、良性か悪性) を識別するために顕微鏡の病理学が必要です。白い吸盤外部「腫瘍」目視による評価では、有病率、参照サイトで特に過大評価されます。隆起性病変の多くは腫瘍ではなく過形成病変でした。それは現在知られていないこれらの過形成病変が腫瘍とその前かどうか。逆に、肝臓に発生した結節の観察には、肝腫瘍の有病率が過小。したがって、顕微鏡の病理学のための組織のコレクション上場廃止の可能性を適切に対処する必要があります。

人間の活動では、水生環境に、多数悪影響が。魚人間の人口で再作成し、しばしば飲料水の源として使用する様々 な水域に生息する、それ故に水生環境の健康の重要な指標です。住んでいるし、特定の生息地を再現する野生の魚は病原体、寄生虫、悪い水質、汚染物質を含む様々 なストレッサーに生涯を通じて公開されます。化学物質の何千もは、産業と人間の排水、郊外/都市雨水および農業の雨水を通して私たちの水路を入力します。化学物質のこれらの複雑な混合物は、添加、相乗効果を持つことができますかの拮抗効果は生物1,2,3を公開します。さらに、他の環境ストレスなど栄養素、高温、低溶存酸素の上昇や変動の pH は、化学汚染物質4、5の効果を悪化できます。環境ストレスすることができますも感染性病原体6の数を増やす、日和見病原体7の病原性を増加または免疫反応と疾患を抑制することによって直接感染疾患の転帰に影響を与えるホスト8,9,10の抵抗。これらの理由から、監視11,12,13,14, 魚および他の水生生物を識別を利用した生物や副作用の影響に関心が高まってください。集団と生態系リスク。
副作用の監視は、細胞または分子、個体数に影響を与えるし、様々 なストレス要因への曝露の指標となる可能性のある亜致死的影響を識別するために個体から、組織のさまざまなレベルでバイオ マーカーを利用しています。個体レベルの指標には、目に見える異常および条件が含まれます。長さと重量に基づいて条件指標は、幸福や魚の個体数の適性を評価する計算されます。最も一般的なのフルトン条件要因 (K) = (重量/長さ3) 15。別の指標表示異常の存在であります。さまざまな方法は、評価と文書化、および目に見える異常を評価する個々 の研究および監視プログラムで使用されています。外部の異常、すなわち病気、フィンの損傷、腫瘍、骨格奇形を持つ個人の割合のみに基づいて評価は、コミュニティ健康16を評価する生物的整合性 (揖斐) のインデックスの指標の 1 つです。(奇形、びらん、病変、腫瘍) の三角筋と呼ばれる似たような評価は、魚コミュニティ17の正常性の評価に使用されています。ただし、これらのメソッドは外部の視覚異常、内部ではなく病変や早期致死指標のみを評価します。
剖検に基づく評価は、外部および内部の観測が含まれます、追加条件指標の測定を可能にします。生殖インデックス (肝重量/総体重) は、トレーニングの指標として使用されているまたはエネルギー予備15高いインデックス値を健康な魚を意味します。ただし、研究の数は、肥大症や肝臓の大きさの増加が肝18,19,20によって代謝される種々 の汚染物質への暴露が原因で発生を示しています。この場合より高いインデックスは特定の化学クラスへの暴露を示すものでしょう。(生殖腺重量/総体重)、指数は、リプロダクティブ ・ ヘルス21に向けて別の条件インデックスです。剖検に基づく評価中の観察は、個々 の斑型の有病率や通常の個人の割合を比較する使用できます。ただし、もっと定量的な健康評価22,23で使用することができますも。
ここに記載されている標準化された剖検に基づく評価は、答えられる質問、専門知識、他の利用可能なリソースに応じて複数の方法で大いに目に見える評価を強化するために使用できます。日常の取り組みは、生体認証データ (長さ、重量、肝重量、生殖腺重量) を収集、血液の血漿/血清分析、ドキュメント外部および内部表示異常の耳石を収集し、顕微鏡分析のための器官の部分を保存年齢分析。剖検に基づく評価プラス年齢分析と様々 な臓器の病理は、計算と各種条件の指標の比較、顕微鏡による組織変更と同様に、目に見える異常の有病率が性別、年齢、部位、サンプリング期間。追加の組織コレクションは、電子顕微鏡検査、細菌、ウイルス、寄生虫、化学成分の濃度などを含む他の多くの分析のために可能です。魚殺す24の原因を診断するために使用より詳細な分析の一部になることができますこれらのメソッドや捕虜の死亡魚25。2 つの追加分析、遺伝子発現と免疫機能の解析のための組織のコレクションのための方法を示しています。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:855px;" width="856">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Folding tables</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Folding chairs</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Dissecting boards</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Measuring board (in mm increments)</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Battery powered scale (in gm) for fish weight</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Battery powered scale (in mg) for organ weights</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Dissecting forceps</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Bone cutters</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Scalpel and blades</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Disposable gloves</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Buckets</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Leak-proof Nalgene bottles (250 ml)</td>
			<td style="width:215px;">ThermoFischer Scientific</td>
			<td style="width:119px;">02-924-5C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Vacutainer tubes with sodium heparin</td>
			<td style="width:215px;">ThermoFischer Scientific</td>
			<td style="width:119px;">02-689-6</td>
			<td>For blood collection</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Disposable&#160; 3 ml syringes with 23 gauge needle</td>
			<td style="width:215px;">ThermoFischer Scientific</td>
			<td style="width:119px;">14-826-11</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">1 &#8211; 2ml cryovials</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>Used for plasma and RNAlater samples</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Invitrogen RNAlater Stabilization solution</td>
			<td style="width:215px;">ThermoFischer Scientific</td>
			<td style="width:119px;">AM7021</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Z-Fix Formaldehyde Zinc fixative</td>
			<td style="width:215px;">Anatech LTD</td>
			<td style="width:119px;">SKU-174</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Tricaine-S (MS-222)</td>
			<td style="width:215px;">Syndel USA</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>fish anesthetic</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Coin Envelopes</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>for otoliths</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Pencils and pens</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">70% alcohol</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:355px;">Data sheets</td>
			<td style="width:215px;">Any</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

necropsy-based wild fish health assessment

生息地の変化と気候変動に増加栄養素や化学汚染物質から人為の影響は、魚の個体数に重大な影響を持つことができます。副作用モニタリング、分子レベル、個体からバイオ マーカーを利用したは、魚や他の生物に累積的な影響を評価するために使用できます。魚の健康は水生生態系の健康の指標として世界的に使用されています。剖検に基づく魚の健康評価表示異常や病変、寄生虫、条件と organosomatic 指標に関するデータを提供します。これらはサイト、シーズン、セックスでと同様、一時的に、時間の経過とともに変化を比較できます。深刻度の評価より定量的に評価できる魚の健康指数を計算する様々 な観測に割り当てることができます。剖検に基づく評価の欠点は視覚的観察と組織と亜致死的影響の細胞内局在のバイオ マーカーとして、機密ではない条件の要因に基づいています。また、原因や観測の異常に関連するリスク要因を識別するためにほとんど不可能です。だから、例えば隆起性病変やフィン、唇や体の表面に「腫瘍」がある腫瘍。ただし、寄生虫、慢性炎症や刺激に対する正常細胞の過形成を応答可能性があります。逆に、腫瘍、特定の寄生虫、感染性病原体その他、多くの組織の変更は表示されません、ので過小評価されることがあります。しかし、剖検に基づく評価、血液 (血漿)、病理 (顕微鏡の病理学) の組織、ゲノミクス、分子生物学的解析、老化の耳石を収集できます。地理空間解析、生息地評価と共に、これらの下流解析品質と汚染物質の水質分析することができますすべて総合的な生態系評価で重要であります。

五大湖地域の懸念 (AOC) は、さまざまな有益な使用の障害のために示された地理的な分野です。多くの AOC で有益な使用障害 (ビュイ) は、魚の腫瘍やその他の奇形があります。数百万ドルは、修復とこれらの各領域の復元のため様々 な BUIs と最終的に AOC43を上場するために費やされています。BUI 異なる状態から別の状態に (epa.ohio.gov/portals/35/lakeerie/ohio_AOC_delisting_guidance.pdf および dnr.wi.gov/topic/GreatLakes/documents/SheboyganRiverFinalReport2008.pdf を参照); 魚腫瘍を上場廃止基準ただし、上場廃止のドキュメントに記載されている、いくつかの場合の皮膚腫瘍、肝腫瘍の有病率を決定する必要があります。多くのケースでは、有病率は非 AOC 参照サイトと比較されます。
魚腫瘍 BUI はスペリオル湖とミシガン州の白い吸盤 (Catostomus commersonii 剖検に基づく評価を利用した 3 AOCs (セントルイス川、ミルウォーキー川、シボイガン川) と非 AOC 参照サイト (ケワニー川) で評価しました。)、皮膚や肝臓組織の顕微鏡の病理学の順。2012 と 2013 の44のミルウォーキー、シボイガン、ケワニー川と 2015 年 (未発行データ) にセントルイス川から魚が採集。200 ホワイト吸盤は、シボイガンから 193 とセント ・ ルイス、ザ ケワニー ミルウォーキーから評価されました。
定義では、腫瘍は、異常な細胞を持つ組織の異常増殖によって引き起こされる腫れが良性か悪性新生物のいずれかであることを一般に考えられている任意の腫れや発生領域をすることができます。すべてのサイトから収集した白い吸盤は、小さな、離散の白い斑点、大きい白い部分、わずかに盛り上がった粘液状病変と体表面と唇 (図 6) で連続発生したエリアを含む外部の隆起病変の様々 な展示。魚、圧迫および条件の係数を取得する測定、外部および内部の異常を記載されていた、および病理組織学的に皮膚や肝臓の組織を採取します。
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57946/57946fig6.jpg"> 図 6: 五大湖から白い吸盤に発生した皮膚病変を観察します。(A) 離散体表に白い斑点。スケール バー = 5 mm. (B) A は少し高くムコイド (矢印) と後方のボディ表面に連続病変 (、)。スケール バー 1 cm。 (C) A 大、連続病変の体表面を =。スケール バー = 1 cm。 (D) 唇に多数の多裂片のある病変。<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/57946/57946fig6large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
外部腫瘍魚のパーセントまたは調達 〜 セントルイス AOC で 15.5% 58.0% ミルウォーキー AOC 地域の変色。一般に、離散の白い斑点が少なくとも共通の視覚的病変連続リップとボディ表面の病変が最も一般的です.魚の観察可能な肝腫瘤の数が低かったケワニーに位置し、セントルイスで 1.5% から 2.5% ミルウォーキー (表 1) に至るまでいます。
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td></td>
			<td colspan="4">河川や年サンプリング</td>
		</tr>
<tr>
<td>目に見える病変</td>
			<td>ケワニー 2013</td>
			<td>セントルイス 2015</td>
			<td>シボイガン 2012</td>
			<td>ミルウォーキー 2013</td>
		</tr>
<tr>
<td>離散の白い斑点</td>
			<td>16</td>
			<td>3</td>
			<td>3.1</td>
			<td>5</td>
		</tr>
<tr>
<td>さき</td>
			<td>20</td>
			<td>9.5</td>
			<td>9.8</td>
			<td>30.5</td>
		</tr>
<tr>
<td>連続</td>
			<td>22.5</td>
			<td>3</td>
			<td>29.5</td>
			<td>40</td>
		</tr>
<tr>
<td>合計発生皮膚の異常、
</td>
			<td>46</td>
			<td>15.5</td>
			<td>38.3</td>
			<td>58</td>
		</tr>
<tr>
<td>目に見える肝腫瘤</td>
			<td>1.5</td>
			<td>1.5</td>
			<td>1.6</td>
			<td>2.5</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="5">
、隆起病変を持つ魚の合計数。いくつかの魚は、複数の種類の異常を持っていた。</td>
		</tr>
</tbody></table>表 1: 白い吸盤の肉眼観測データはパーセント値を示す五大湖領域に対する関心と参照サイト (ケワニー川) で収集されます。 目視検査を使用して、さまざまな異常を持つ魚の割合を文書化できます。しかし、決定的に存在と腫瘍の種類の診断、組織検査されなければならない顕微鏡的 (組織学的)。顕微鏡検査で腫瘍が発生した病変のわけがわかった。離散の白い斑点とケワニーに位置で特に粘液状の病変の多くは、(表 2) 腫瘍ではなく過形成病変でした。また、ケワニー、セントルイスで観察皮膚腫瘍のすべては良性乳頭腫だった。シボイガンでミルウォーキー、乳頭腫、扁平上皮癌、悪性皮膚腫瘍、(表 2) を認められました。
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td></td>
			<td colspan="4">サンプリングの川</td>
		</tr>
<tr>
<td>腫瘍の種類</td>
			<td>ケワニー 2013</td>
			<td>セントルイス 2015</td>
			<td>シボイガン 2012</td>
			<td>ミルウォーキー 2013</td>
		</tr>
<tr>
<td>乳頭腫</td>
			<td>21</td>
			<td>5.2</td>
			<td>30.5</td>
			<td>37.5</td>
		</tr>
<tr>
<td>扁平上皮癌</td>
			<td>0</td>
			<td>0</td>
			<td>2.1</td>
			<td>10.5</td>
		</tr>
<tr>
<td>合計皮膚腫瘍</td>
			<td>21</td>
			<td>5.2</td>
			<td>32.6</td>
			<td>48</td>
		</tr>
<tr>
<td>胆管腫瘍、
</td>
			<td>2.5</td>
			<td>4</td>
			<td>6.2</td>
			<td>9.5</td>
		</tr>
<tr>
<td>肝細胞腫瘍b
</td>
			<td>1</td>
			<td>0</td>
			<td>2.1</td>
			<td>8</td>
		</tr>
<tr>
<td>合計肝腫瘍</td>
			<td>3.5</td>
			<td>4</td>
			<td>8.3</td>
			<td>15.0c
</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">
、Cholangioma 肝門部胆管癌をなど</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">
b肝細胞腺腫と肝細胞癌が含まれています</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">
cいくつかの魚いた胆管と肝腫瘍</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
</tbody></table>表 2: 顕微鏡五大湖地域の懸念や参照サイト (ケワニー川)、パーセント値を示す白い吸盤の腫瘍性病変が収集したことを確認しました。 病理組織学的分析には、目視観察では同定されなかった肝腫瘍も識別されます。ケワニーに位置し、セントルイスから収集した魚のわずか 1.5% が見える肝結節 (表 1)、3.5 〜 4.0%、それぞれ、顕微鏡的識別した腫瘍 (表 2)。大きな違いは、シボイガン (1.6% 8.3% 顕微鏡と表示)、ミルウォーキー (2.5% 15.0% 顕微鏡と表示) で見られました。顕微鏡検査も提供肝細胞由来 (表 2) と胆管の腫瘍の分化と悪性の腫瘍と良性。

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Necropsy-based Wild Fish Health Assessment

野生の魚の健康は、水生生態系の健全性の指標として使用できます。剖検に基づく魚の健康評価が目に見える病変や異常組織の微視的評価、遺伝子発現とその他の詳細を収集する機会と同様、条件の指標を計算するために使用されるデータのドキュメントを提供します。解析。

野生の魚の死体解剖に基づく健康診断

Anthropogenic influences from increased nutrients and chemical contaminants, to habitat alterations and climate change, can have significant effects on ...

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Research

JoVE Journal

Environment

16.9K ビュー.  U.S. Geological Survey. 野生の魚の健康は、水生生態系の健全性の指標として使用できます。剖検に基づく魚の健康評価が目に見える病変や異常組織の微視的評価、遺伝子発現とその他の詳細を収集する機会と同様、条件の指標を計算するために使用されるデータのドキュメントを提供します。解析。

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A Fish-feeding Laboratory Bioassay to Assess the Antipredatory Activity of Secondary Metabolites from the Tissues of Marine Organisms

Marine chemical ecology is a young discipline, having emerged from the collaboration of natural products chemists and marine ecologists in the 1980s with the goal of examining the ecological functions of secondary metabolites from the tissues of marine organisms. The result has been a progression of protocols that have increasingly refined the ecological relevance of the experimental approach. Here we present the most up-to-date version of a fish-feeding laboratory bioassay that enables investigators to assess the antipredatory activity of secondary metabolites from the tissues of marine organisms. Organic metabolites of all polarities are exhaustively extracted from the tissue of the target organism and reconstituted at natural concentrations in a nutritionally appropriate food matrix. Experimental food pellets are presented to a generalist predator in laboratory feeding assays to assess the antipredatory activity of the extract. The procedure described herein uses the bluehead, Thalassoma bifasciatum, to test the palatability of Caribbean marine invertebrates; however, the design may be readily adapted to other systems. Results obtained using this laboratory assay are an important prelude to field experiments that rely on the feeding responses of a full complement of potential predators. Additionally, this bioassay can be used to direct the isolation of feeding-deterrent metabolites through bioassay-guided fractionation. This feeding bioassay has advanced our understanding of the factors that control the distribution and abundance of marine invertebrates on Caribbean coral reefs and may inform investigations in diverse fields of inquiry, including pharmacology, biotechnology, and evolutionary ecology.

This bioassay employs a model predatory fish to assess the presence of feeding-deterrent metabolites from organic extracts of the tissues of marine organisms at natural concentrations using a nutritionally comparable food matrix.

海洋生物の組織からの二次代謝産物のAntipredatory活性を評価するために魚の供給研究所バイオアッセイ

Marine chemical ecology is a young discipline, having emerged from the collaboration of natural products chemists and marine ecologists in the 1980s with ...

環境学

Characterization and Application of Passive Samplers for Monitoring of Pesticides in Water

Five different water passive samplers were calibrated under laboratory conditions for measurement of 124 legacy and current used pesticides. This study provides a protocol for the passive sampler preparation, calibration, extraction method and instrumental analysis. Sampling rates (RS) and passive sampler-water partition coefficients (KPW) were calculated for silicone rubber, polar organic chemical integrative sampler POCIS-A, POCIS-B, SDB-RPS and C18 disk. The uptake of the selected compounds depended on their physicochemical properties, i.e., silicone rubber showed a better uptake for more hydrophobic compounds (log octanol-water partition coefficient (KOW) &#62; 5.3), whereas POCIS-A, POCIS-B and SDB-RPS disk were more suitable for hydrophilic compounds (log KOW &#60; 0.70).

A protocol about the characterization and application of five different passive sampling devices is presented.

水中の農薬のモニタリングのための特性とパッシブサンプラーの応用

Five different water passive samplers were calibrated under laboratory conditions for measurement of 124 legacy and current used pesticides. This study ...

Use of a Battery of Chemical and Ecotoxicological Methods for the Assessment of the Efficacy of Wastewater Treatment Processes to Remove Estrogenic Potency

Endocrine Disrupting Compounds pose a substantial risk to the aquatic environment. Ethinylestradiol (EE2) and estrone (E1) have recently been included in a watch list of environmental pollutants under the European Water Framework Directive. Municipal wastewater treatment plants are major contributors to the estrogenic potency of surface waters. Much of the estrogenic potency of wastewater treatment plant (WWTP) effluents can be attributed to the discharge of steroid estrogens including estradiol (E2), EE2 and E1 due to incomplete removal of these substances at the treatment plant. An evaluation of the efficacy of wastewater treatment processes requires the quantitative determination of individual substances most often undertaken using chemical analysis methods. Most frequently used methods include Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GCMS/MS) or Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LCMS/MS) using multiple reaction monitoring (MRM). Although very useful for regulatory purposes, targeted chemical analysis can only provide data on the compounds (and specific metabolites) monitored. Ecotoxicology methods additionally ensure that any by-products produced or unknown estrogenic compounds present are also assessed via measurement of their biological activity. A number of in vitro bioassays including the Yeast Estrogen Screen (YES) are available to measure the estrogenic activity of wastewater samples. Chemical analysis in conjunction with in vivo and in vitro bioassays provides a useful toolbox for assessment of the efficacy and suitability of wastewater treatment processes with respect to estrogenic endocrine disrupting compounds. This paper utilizes a battery of chemical and ecotoxicology tests to assess conventional, advanced and emerging wastewater treatment processes in laboratory and field studies.

Endocrine Disrupting Compounds (EDC) pose a substantial risk to the aquatic environment. Municipal wastewater treatment plants are major contributors to the estrogenic potency of surface waters. The methodology provided in this paper allows for an assessment of the efficacy and suitability of wastewater treatment processes with respect to EDC removal.

排水処理プロセスの有効性の評価のための化学的および生態毒性メソッドのバッテリーの使用は、エストロゲン効力を削除します

Endocrine Disrupting Compounds pose a substantial risk to the aquatic environment. Ethinylestradiol (EE2) and estrone (E1) have recently been included in ...

Assessment of Labile Organic Carbon in Soil Using Sequential Fumigation Incubation Procedures

Management practices and environmental changes can alter soil nutrient and carbon cycling. Soil labile organic carbon, a readily decomposable C pool, is highly sensitive to disturbance. It is also the primary substrate for soil microorganisms, which is fundamental to nutrient cycling. Due to these attributes, labile organic carbon (LOC) has been identified as an indicator parameter for soil health. Quantifying the turnover rate of LOC also aids in understanding changes in soil nutrient cycling processes. A sequential fumigation incubation method has been developed to estimate soil LOC and potential C turnover rate. The method requires fumigating soil samples and quantifying CO2-C respired during a 10 day incubation period over a series of fumigation-incubation cycles. Labile organic C and potential C turnover rate are then extrapolated from accumulated CO2 with a negative exponential model. Procedures for conducting this method are described.

Labile organic carbon (LOC) and the potential carbon turnover rate are sensitive indicators of changes in soil nutrient cycling processes. Details are provided for a method based on fumigating and incubating soil in a series of cycles and using the CO2 accumulated during the incubation periods to estimate these parameters.

シーケンシャル燻蒸インキュベーション・プロシージャを使用した土壌中の不安定な有機炭素の評価

Management practices and environmental changes can alter soil nutrient and carbon cycling. Soil labile organic carbon, a readily decomposable C pool, is ...

Empirical, Metagenomic, and Computational Techniques Illuminate the Mechanisms by which Fungicides Compromise Bee Health

Growers often use fungicide sprays during bloom to protect crops against disease, which exposes bees to fungicide residues. Although considered &#34;bee-safe,&#34; there is mounting evidence that fungicide residues in pollen are associated with bee declines (for both honey and bumble bee species). While the mechanisms remain relatively unknown, researchers have speculated that bee-microbe symbioses are involved. Microbes play a pivotal role in the preservation and/or processing of pollen, which serves as nutrition for larval bees. By altering the microbial community, it is likely that fungicides disrupt these microbe-mediated services, and thereby compromise bee health. This manuscript describes the protocols used to investigate the indirect mechanism(s) by which fungicides may be causing colony decline. Cage experiments exposing bees to fungicide-treated flowers have already provided the first evidence that fungicides cause profound colony losses in a native bumble bee (Bombus impatiens). Using field-relevant doses of fungicides, a series of experiments have been developed to provide a finer description of microbial community dynamics of fungicide-exposed pollen. Shifts in the structural composition of fungal and bacterial assemblages within the pollen microbiome are investigated by next-generation sequencing and metagenomic analysis. Experiments developed herein have been designed to provide a mechanistic understanding of how fungicides affect the microbiome of pollen-provisions. Ultimately, these findings should shed light on the indirect pathway through which fungicides may be causing colony declines.

Microbial consortia within bumble bee hives enrich and preserve pollen for bee larvae. Using next generation sequencing, along with laboratory and field-based experiments, this manuscript describes protocols used to test the hypothesis that fungicide residues alter the pollen microbiome, and colony demographics, ultimately leading to colony loss.

実証、メタゲノムと計算手法を照らす殺菌剤妥協ミツバチ健康メカニズム

Growers often use fungicide sprays during bloom to protect crops against disease, which exposes bees to fungicide residues. Although considered ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and estimating fish abundance. We developed and implemented a rotating stereo-video camera tool that covers a full 360 degrees of sampling, which maximizes sampling effort compared to stationary camera tools. A variety of studies have detailed the ability of static, stereo-camera systems to obtain highly accurate and precise measurements of fish; the focus here was on the development of methodological approaches to quantify fish density using rotating camera systems. The first approach was to develop a modification of the metric MaxN, which typically is a conservative count of the minimum number of fish observed on a given camera survey. We redefine MaxN to be the maximum number of fish observed in any given rotation of the camera system. When precautions are taken to avoid double counting, this method for MaxN may more accurately reflect true abundance than that obtained from a fixed camera. Secondly, because stereo-video allows fish to be mapped in three-dimensional space, precise estimates of the distance-from-camera can be obtained for each fish. By using the 95% percentile of the observed distance from camera to establish species-specific areas surveyed, we account for differences in detectability among species while avoiding diluting density estimates by using the maximum distance a species was observed. Accounting for this range of detectability is critical to accurately estimate fish abundances. This methodology will facilitate the integration of rotating stereo-video tools in both applied science and management contexts.

We describe a new method for counting fishes, and estimating relative abundance (MaxN) and fish density using rotating stereo-video camera systems. We also demonstrate how to use distance from camera (Z distance) to estimate species-specific detectability.

水中ステレオ ビデオのツールを使用して魚の密度を定量化する新方式の開発

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Collection and Extraction of Occupational Air Samples for Analysis of Fungal DNA

Traditional methods of identifying fungal exposures in occupational environments, such as culture and microscopy-based approaches, have several limitations that have resulted in the exclusion of many species. Advances in the field over the last two decades have led occupational health researchers to turn to molecular-based approaches for identifying fungal hazards. These methods have resulted in the detection of many species within indoor and occupational environments that have not been detected using traditional methods. This protocol details an approach for determining fungal diversity within air samples through genomic DNA extraction, amplification, sequencing, and taxonomic identification of fungal internal transcribed spacer (ITS) regions. ITS sequencing results in the detection of many fungal species that are either not detected or difficult to identify to species level using culture or microscopy. While these methods do not provide quantitative measures of fungal burden, they offer a new approach to hazard identification and can be used to determine overall species richness and diversity within an occupational environment.

Determining the fungal diversity within an environment is a method utilized in occupational health studies to identify health hazards. This protocol describes DNA extraction from occupational air samples for amplification and sequencing of fungal ITS regions. This approach detects many fungal species that can be overlooked by traditional assessment methods.

コレクションと真菌 DNA の分析のための産業大気サンプルの抽出

Traditional methods of identifying fungal exposures in occupational environments, such as culture and microscopy-based approaches, have several ...

A Video Surveillance System to Monitor Breeding Colonies of Common Terns (Sterna Hirundo)

Many waterbird populations have faced declines over the last century, including the common tern (Sterna hirundo), a waterbird species with a widespread breeding distribution, that has been recently listed as endangered in some habitats of its range. Waterbird monitoring programs exist to track populations through time; however, some of the more intensive approaches require entering colonies and can be disruptive to nesting populations. This paper describes a protocol that utilizes a minimally invasive surveillance system to continuously monitor common tern nesting behavior in typical ground-nesting colonies. The video monitoring system utilizes wireless cameras focused on individual nests as well as over the colony as a whole, and allows for observation without entering the colony. The video system is powered with several 12 V car batteries that are continuously recharged using solar panels. Footage is recorded using a digital video recorder (DVR) connected to a hard drive, which can be replaced when full. The DVR may be placed outside of the colony to reduce disturbance. In this study, 3,624 h of footage recorded over 63 days in weather conditions ranging from 12.8 &#176;C to 35.0 &#176;C produced 3,006 h (83%) of usable behavioral data. The types of data retrieved from the recorded video can vary; we used it to detect external disturbances and measure nesting behavior during incubation. Although the protocol detailed here was designed for ground-nesting waterbirds, the principal system could easily be modified to accommodate alternative scenarios, such as colonial arboreal nesting species, making it widely applicable to a variety of research needs.

A Video Surveillance System to Monitor Breeding Colonies of Common Terns Sterna Hirundo

This paper describes a protocol that uses a remote video monitoring surveillance system to continuously monitor breeding colonies of ground-nesting waterbirds. The system includes five cameras monitoring individual nests and one camera monitoring the colony as a whole, and is powered by car batteries that are recharged via solar panels.

繁殖 (おそ燕) アジサシのコロニーを監視するビデオ監視システム

Many waterbird populations have faced declines over the last century, including the common tern (Sterna hirundo), a waterbird species with a widespread ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and toxicological studies. Using automated digital tracking platforms, recent efforts in neuropharmacology are leveraging larval fish locomotor behaviors to identify potential therapeutic targets for novel small molecules. Similar to these efforts, research in the environmental sciences and comparative pharmacology and toxicology is examining various behaviors of fish models as diagnostic tools in tiered evaluation of contaminants and real-time monitoring of surface waters for contaminant threats. Whereas the zebrafish is a popular larval fish model in the biomedical sciences, the fathead minnow is a common larval fish model in ecotoxicology. Unfortunately, fathead minnow larvae have received considerably less attention in behavioral studies. Here, we develop and demonstrate a behavioral profile protocol using caffeine as a model neurostimulant. Though photomotor responses of fathead minnows were occasionally affected by caffeine, zebrafish&#160;were markedly more sensitive for photomotor and locomotor endpoints, which responded at environmentally relevant levels. Future studies are needed to understand comparative behavioral sensitivity differences among fish with age and time of day, and to determine whether similar behavioral effects would occur in nature and be indicative of adverse outcomes at the individual or population levels of biological organization.

Here, we present a protocol to examine larval zebrafish and fathead minnow locomotor activities and photomotor responses (PMR) using an automated tracking software. When incorporated in common toxicology bioassays, analyses of these behaviors provide a diagnostic tool to examine chemical bioactivity. This protocol is described using caffeine, a model neurostimulant.

稚魚の行動応答プロファイルを調べるための実験プロトコル: 神経興奮剤カフェインへの応用

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Measuring Phosphorus Release in Laboratory Microcosms for Water Quality Assessment

Phosphorus (P) is a critical limiting nutrient in agroecosystems requiring careful management to reduce transport risk to aquatic environments. Routine laboratory measures of P bioavailability are based on chemical extractions performed on dried samples under oxidizing conditions. While useful, these tests are limited with respect to characterizing P release under prolonged water saturation. Labile orthophosphate bound to oxidized iron and other metals can rapidly desorb to solution in reducing environments, increasing P mobilization risk to surface runoff and groundwater. To better quantify P desorption potential and mobility during extended saturation, a laboratory microcosm method was developed based on repeated sampling of porewater and overlying floodwater over time. The method is useful for quantifying P release potential from soils and sediments varying in physicochemical properties and can improve site-specific P mitigation efforts by better characterizing P release risk in hydrologically active areas. Advantages of the method include its ability to simulate in situ dynamics, simplicity, low cost, and flexibility.

Accurate quantification of phosphorus (P) desorption potential in saturated soils and sediments is important for P modeling and transport mitigation efforts. To better account for in situ soil-water redox dynamics and P mobilization under prolonged saturation, a simple approach was developed based on repeated sampling of laboratory microcosms.

水質評価のための実験室用微小宇宙におけるリン放出の測定

Phosphorus (P) is a critical limiting nutrient in agroecosystems requiring careful management to reduce transport risk to aquatic environments. Routine ...