Processing the Loblolly Pine PtGen2 cDNA Microarray

PtGen2 is a 26,496 feature cDNA microarray containing amplified loblolly pine ESTs.  The array is produced in our laboratory for use by researchers ...

An Improved Method of RNA Isolation from Loblolly Pine (<em>P. taeda</em> L.) and Other Conifer Species

Tissues isolated from conifer species, particularly those belonging to the Pinaceae family, such as loblolly pine (Pinus taeda L.), contain high ...

University of Georgia (UGA)

&#x6728;&#x6750;&#x5F62;&#x6210;&#x4E86;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x751F;&#x5316;&#x7EA7;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4ECD;&#x7136;&#x5BF9;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x4E0E;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x7406;&#x89E3;&#x5F88;&#x5DEE;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B65;&#x5177;&#x4F53;&#x786E;&#x5B9A;&#x57FA;&#x56E0;&#x53C2;&#x4E0E;&#x6728;&#x6750;&#x5F62;&#x6210;&#x548C;&#x8868;&#x5F81;&#x5B83;&#x4EEC;&#x5728;&#x786E;&#x5B9A;&#x6728;&#x6750;&#x8D28;&#x91CF;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF0C;&#x4E32;&#x884C;&#x5206;&#x6790;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE; (SAGE) &#x7528;&#x4E8E;&#x91CF;&#x5316; lignifying &#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x4ECE;&#x5355;&#x4E00;&#x3001; 10 &#x5C81;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.&#xFF09; &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x4E24;&#x4E2A;&#x5723;&#x4EBA;&#x5E93;&#x751F;&#x6210;&#x57FA;&#x4E8E; lignifying &#x5206;&#x79BB;&#x7684;&#x4E0A;&#x5C42; &#xFF08;&#x5B98;&#x65B9;&#xFF09; &#x6216;&#x8F83;&#x4F4E; &#xFF08;&#x57FA;&#x672C;&#xFF09; &#x90E8;&#x5206;&#x6811;&#x5E72;&#x7684;&#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x3002;&#x4ECE;&#x51A0;&#x6728;&#x5E93;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x5206;&#x6790;&#x4E86;&#x4EE3;&#x8868; 27,398 &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6700;&#x591A;&#x7684;&#x8D85;&#x8FC7; 85,000 &#x6807;&#x8BB0;&#x5E76;&#x8D85;&#x8FC7; 65,000 &#x6807;&#x8BB0;&#xFF0C;&#x4EE3;&#x8868; 25,983 &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x6700;&#x591A;&#x57FA;&#x6728;&#x5E93;&#x4E2D;&#x8FDB;&#x884C;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x7ED3;&#x5408;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CD;&#x6620;&#x5728; lignifying &#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x8868;&#x8FBE;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x603B;&#x548C;&#xFF0C;150,855 &#x6807;&#x8BB0;&#x88AB;&#x7F16;&#x5F55;&#xFF0C;&#x4EE3;&#x8868; 42,641 &#x4E0D;&#x540C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x6700;&#x591A;&#x3002;&#x76EE;&#x524D;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x793A;&#x5176;&#x79CD;&#x9AD8;&#x7B49;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x6700;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#xFF0C;&#x5E76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5B9A;&#x91CF;&#x63CF;&#x8FF0;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4EE3;&#x8868;&#x7684; lignifying &#x6728;&#x8D28;&#x90E8; 10 &#x5C81;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x3002;

SAGE &#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x5DEE;&#x5F02;&#x6CBF;&#x8F74;&#x5411;&#x53D1;&#x5C55;&#x68AF;&#x5EA6;&#x7684; lignifying &#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E;) &#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x793A;&#x8303;&#x3002;

Wood formation has been studied extensively at the cellular and biochemical levels, but remains poorly understood with respect to gene expression and regulation. As a first step toward identifying genes specifically involved in wood formation and characterizing their roles in determining wood quality, serial analysis of gene expression (SAGE) was used to quantify gene expression in lignifying xylem from a single, 10-year-old loblolly pine (Pinus taeda L.). Two SAGE libraries were generated based on lignifying xylem isolated from either the upper (crown) or lower (base) portions of the trunk. Over 85,000 tags representing a maximum of 27,398 expressed genes were analyzed from the crown wood library, and more than 65,000 tags, representing a maximum of 25,983 expressed genes, were analyzed in the base wood library. Combining these data sets to reflect the sum of genes expressed in lignifying xylem, 150,855 tags were cataloged, representing a maximum of 42,641 different genes. Currently, this study represents the most extensive analysis of its kind in a higher plant and provides a quantitative description of the transcriptome representing the lignifying xylem of a 10-year-old loblolly pine.

SAGE profiling and demonstration of differential gene expression along the axial developmental gradient of lignifying xylem in loblolly pine (Pinus taeda).

La formation du bois a &#xE9;t&#xE9; largement &#xE9;tudi&#xE9;e aux niveaux cellulaires et biochimiques, mais reste mal comprise &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;gard de l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes et de la r&#xE9;glementation. En tant que premi&#xE8;re &#xE9;tape vers l&#x26;#39;identification de g&#xE8;nes sp&#xE9;cifiquement impliqu&#xE9;s dans la formation du bois et la caract&#xE9;risation de leurs r&#xF4;les dans la d&#xE9;termination de la qualit&#xE9; du bois, l&#x26;#39;analyse en s&#xE9;rie de l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique (SAGE) a &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;e pour quantifier l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes dans lignification du xyl&#xE8;me &#xE0; partir d&#x26;#39;un seul, le pin &#xE0; encens 10 ans ( Pinus taeda L.). Deux biblioth&#xE8;ques SAGE ont &#xE9;t&#xE9; g&#xE9;n&#xE9;r&#xE9;s sur la base du xyl&#xE8;me lignification isol&#xE9; soit la partie sup&#xE9;rieure (couronne) ou inf&#xE9;rieur (de base) des parties du tronc. Plus de 85.000 &#xE9;tiquettes repr&#xE9;sentant un maximum de 27.398 g&#xE8;nes exprim&#xE9;s ont &#xE9;t&#xE9; analys&#xE9;s &#xE0; partir de la biblioth&#xE8;que bois de la Couronne, et plus de 65.000 tags, repr&#xE9;sentant un maximum de 25,983 g&#xE8;nes exprim&#xE9;s, ont &#xE9;t&#xE9; analys&#xE9;s dans la biblioth&#xE8;que en bois de base. La combinaison de ces ensembles de donn&#xE9;es afin de refl&#xE9;ter la somme des g&#xE8;nes exprim&#xE9;s dans le xyl&#xE8;me lignification, 150,855 balises ont &#xE9;t&#xE9; catalogu&#xE9;s, ce qui repr&#xE9;sente un maximum de 42,641 g&#xE8;nes diff&#xE9;rents. Actuellement, cette &#xE9;tude repr&#xE9;sente l&#x26;#39;analyse la plus vaste de son genre dans une plante sup&#xE9;rieure et fournit une description quantitative du transcriptome repr&#xE9;sentant le xyl&#xE8;me lignification d&#x26;#39;un pin &#xE0; l&#x26;#39;encens de 10 ans.

Profilage SAGE et de d&#xE9;monstration de l&#x26;#39;expression diff&#xE9;rentielle des g&#xE8;nes le long du gradient axial du d&#xE9;veloppement de la lignification du xyl&#xE8;me en pin &#xE0; encens (Pinus taeda)

SAGE-Profiling und Demonstration der differentiellen Genexpression entlang der axialen Entwicklungsst&#xF6;rungen Gef&#xE4;lle von verholzenden Xylem in Loblolly Kiefer (Pinus taeda).

Formazione di legno &egrave; stato ampiamente studiato a livello cellulare e biochimico, ma rimane scarsamente comprensibile rispetto al regolamento ed espressione genica. Come un primo passo verso l&#39;identificazione di geni specificamente coinvolti nella formazione di legno e che caratterizzano il loro ruolo nel determinare la qualit&agrave; di legno, serial analysis of gene expression (SAGE) &egrave; stato utilizzato per quantificare l&#39;espressione genica in lignifying xilema da una singola, 10-year-old loblolly pine (Pinus taeda L.). Due librerie di salvia sono state generate basato su lignifying xilema isolato dalla superiore (corona) o inferiore (base) porzioni del tronco. Oltre 85.000 Tag che rappresenta un massimo di 27.398 geni espressi sono stati analizzati dalla libreria legno corona, e pi&ugrave; di 65.000 Tag, che rappresenta un massimo di 25.983 geni espressi, sono stati analizzati nella libreria base di legna. Combinando questi insiemi di dati in modo da riflettere la somma dei geni espressi in lignifying xilema, 150.855 tag sono stati catalogati, che rappresenta un massimo di 42.641 diversi geni. Attualmente, questo studio rappresenta l&#39;analisi pi&ugrave; estesa del suo genere in una pianta superiore e fornisce una descrizione quantitativa del transcriptome che rappresenta la lignifying xilema di un pino del loblolly 10-year-old.

SALVIA profilatura e dimostrazione di espressione genica differenziale lungo il gradiente dello sviluppo assiale di lignifying xilema loblolly Pine (Pinus taeda).

&#x6728;&#x90E8;&#x5F62;&#x6210;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5B66;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x76DB;&#x3093;&#x306B;&#x7814;&#x7A76;&#x304C;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3068;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x3088;&#x304F;&#x308F;&#x304B;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x307E;&#x307E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7279;&#x306B;&#x6728;&#x6750;&#x306E;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x9023;&#x7D9A;&#x5206;&#x6790;&#xFF08;SAGE&#xFF09;&#x3092;&#x6728;&#x6750;&#x306E;&#x54C1;&#x8CEA;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x4E0A;&#x3067;&#x305D;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B69;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x30EB;&#x3001;10&#x6B73;&#x306E;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF08;&#x304B;&#x3089;&#x6728;&#x90E8;&#x3092;lignifying&#x3067;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x3002;&#x3064;&#x306E;SAGE&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x306F;&#x3001;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x306E;&#x4E0A;&#x90E8;&#xFF08;&#x30AF;&#x30E9;&#x30A6;&#x30F3;&#xFF09;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4E0B;&#xFF08;&#x5E95;&#xFF09;&#x90E8;&#x5206;&#x306E;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x304B;&#x3089;&#x5358;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x305F;lignifying&#x6728;&#x90E8;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002; 27398&#x767A;&#x73FE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x5024;&#x3092;&#x8868;&#x3059;85000&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x30BF;&#x30B0;&#x304C;&#x30AF;&#x30E9;&#x30A6;&#x30F3;&#x6728;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x3001;65,000&#x4EBA;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x30BF;&#x30B0;&#x304C;&#x3001;25983&#x767A;&#x73FE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x5024;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x3001;&#x57FA;&#x672C;&#x6728;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x3067;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x6728;&#x90E8;&#x3092;lignifying&#x306B;&#x767A;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5408;&#x8A08;&#x3092;&#x53CD;&#x6620;&#x3059;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x3057;&#x3001;150855&#x30BF;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;42641&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x5024;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x3001;&#x30AB;&#x30BF;&#x30ED;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x73FE;&#x5728;&#x3001;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x9AD8;&#x7B49;&#x690D;&#x7269;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x6700;&#x3082;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x5206;&#x6790;&#x3092;&#x8868;&#x3057;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;10&#x6B73;&#x306E;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;lignifying&#x6728;&#x90E8;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x306A;&#x8AAC;&#x660E;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x6728;&#x90E8;&#x3092;Lignifying&#x306E;&#x8EF8;&#x65B9;&#x5411;&#x767A;&#x9054;&#x52FE;&#x914D;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF09;&#x306B;&#x6CBF;&#x3063;&#x3066;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;SAGE&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3068;&#x30C7;&#x30E2;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;

&#xB098;&#xBB34; &#xD615;&#xC131; &#xC138;&#xD3EC; &#xBC0F; &#xC0DD;&#xD654;&#xD559; &#xC801;&#xC778; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xACF5;&#xBD80; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xBC0F; &#xC870;&#xC808;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xC81C;&#xB300;&#xB85C; &#xC774;&#xD574; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xB2E4;. &#xCC98;&#xC74C;&#xC73C;&#xB85C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD2B9;&#xBCC4;&#xD788; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB2E8;&#xACC4;&#xB85C; &#xB098;&#xBB34; &#xD615;&#xC131;&#xC5D0; &#xAD00;&#xC5EC; &#xD558; &#xACE0; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; (&#xC138;&#xC774; &#xC9C0;)&#xC758; &#xC9C1;&#xB82C; &#xBD84;&#xC11D; xylem &#xB2E8;&#xC77C;, 10 &#xC0B4;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.)&#xC5D0;&#xC11C; lignifying&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xACC4;&#xB7C9; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBAA9;&#xC7AC; &#xD488;&#xC9C8; &#xACB0;&#xC815;&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654;. &#xC138;&#xC774; &#xC9C0; &#xB3C4;&#xC11C;&#xAD00; xylem &#xC0C1;&#xB2E8; (&#xD06C;&#xB77C;&#xC6B4;) &#xB610;&#xB294; &#xD2B8;&#xB801;&#xD06C;&#xC758; &#xB0AE;&#xC740; (&#xAE30;&#xBCF8;) &#xBD80;&#xBD84;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xB41C; lignifying &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0DD;&#xC131; &#xB41C;. &#xD06C;&#xB77C;&#xC6B4; &#xB098;&#xBB34; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; 27398 &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xCD5C;&#xB300; 85000 &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xD0DC;&#xADF8; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4; &#xACE0; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; 25,983 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xCD5C;&#xB300; 65000 &#xAC1C; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xD0DC;&#xADF8; &#xAE30;&#xBCF8; &#xB098;&#xBB34; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;. Xylem lignifying&#xB85C; &#xD45C;&#xD604; &#xD558;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD569;&#xC744; &#xBC18;&#xC601; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC9D1;&#xD569;&#xC744; &#xC870;&#xD569;, 150,855 &#xD0DC;&#xADF8; &#xD588;&#xB2E4; &#xCE74;&#xD0C8;&#xB85C;&#xADF8;, 42,641 &#xB2E4;&#xB978; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xCD5C;&#xB300;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294;. &#xD604;&#xC7AC;&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xB192;&#xC740; &#xD50C;&#xB79C;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xADF8;&#xAC83;&#xC758; &#xC885;&#xB958;&#xC758; &#xAC00;&#xC7A5; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD558; &#xACE0; 10 &#xC0B4;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; lignifying xylem &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; transcriptome&#xC758; &#xC591;&#xC801; &#xC124;&#xBA85;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC138;&#xC774; &#xC9C0; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xBC0F; xylem&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda)&#xC5D0;&#xC11C; lignifying&#xC758; &#xCD95; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xADF8;&#xB77C;&#xB370;&#xC774;&#xC158; &#xB530;&#xB77C; &#xCC28;&#xB4F1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xB370;&#xBAA8;.

Formaci&#xF3;n de la madera ha sido estudiado ampliamente en los niveles celular y bioqu&#xED;mica, pero sigue siendo dif&#xED;cil de entender con respecto a la expresi&#xF3;n de genes y la regulaci&#xF3;n. Como un primer paso hacia la identificaci&#xF3;n de genes que intervienen espec&#xED;ficamente en la formaci&#xF3;n de la madera y la caracterizaci&#xF3;n de su papel en la determinaci&#xF3;n de calidad de la madera, el an&#xE1;lisis serial de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica (SAGE) se utiliz&#xF3; para cuantificar la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica en lignifying xilema de un pino solo taeda de 10 a&#xF1;os de edad ( Pinus taeda L.). Dos SAGE bibliotecas se generaron sobre la base de xilema lignifying aislado de la parte superior (corona) o inferior (base) partes del tronco. M&#xE1;s de 85.000 etiquetas que representan un m&#xE1;ximo de 27.398 genes que se expresan se analizaron desde la biblioteca de madera de la corona, y m&#xE1;s de 65.000 etiquetas, lo que representa un m&#xE1;ximo de 25.983 genes que se expresan, se analizaron en la biblioteca de la base de madera. La combinaci&#xF3;n de estos conjuntos de datos para reflejar la suma de los genes expresados &#x200B;&#x200B;en lignifying xilema, 150,855 etiquetas fueron catalogados, lo que representa un m&#xE1;ximo de 42,641 genes diferentes. En la actualidad, este estudio representa el an&#xE1;lisis m&#xE1;s extenso de su tipo en una planta superior y proporciona una descripci&#xF3;n cuantitativa de la transcriptoma en representaci&#xF3;n del xilema lignifying de un pino taeda de 10 a&#xF1;os de edad.

SAGE perfil y la demostraci&#xF3;n de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica diferencial en el gradiente axial del desarrollo de Lignifying Xilema de pino taeda (Pinus taeda)

&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7CFB;&#x5217;&#x5206;&#x6790;&#x88AB;&#x7528;&#x5230;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x6839;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x7B54;&#x95EE;&#x5168;&#x6587;&#x7684;&#x6C34;&#x5E73;&#xFF0C;&#x8BC4;&#x4F30;&#x5B83;&#x4EEC;&#x54CD;&#x5E94; 246-&#x4E09;&#x785D;&#x57FA;&#x7532;&#x82EF; (TNT) &#x66DD;&#x5149;&#x3002;SAGE &#x56FE;&#x4E66;&#x9986;&#x4EE3;&#x8868;&#x63A7;&#x5236;&#x548C; TNT &#x66B4;&#x9732;&#x82D7;&#x6839;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x5EFA;&#x9020;&#x7684;&#x548C;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x5E8F;&#x5927;&#x7EA6; 32,000 &#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x6DF1;&#x5EA6;&#x3002;&#x8D85;&#x8FC7; 19,000 &#x7684;&#x552F;&#x4E00;&#x6807;&#x8BB0;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x6574;&#x4F53;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E8C;&#x4E2A;&#x6700;&#x9AD8;&#x81F4;&#x6807;&#x8BB0; &#xFF08;27-fold &#x589E;&#x52A0;&#xFF09; &#x4EE3;&#x8868;&#x8C37;&#x80F1;&#x7518;&#x80BD; S-&#x8F6C;&#x79FB;&#x9176;&#x3002;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8272;&#x7D20; p450 &#x6C27;&#x5316;&#x7684;&#x9176;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA; ABC &#x8F6C;&#x8FD0;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684; nitroreductase&#xFF0C;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x88AB;&#x8BF1;&#x5BFC; TNT &#x66DD;&#x5149;&#x3002;&#x5206;&#x6790;&#x8FD8;&#x663E;&#x793A;&#x5728; TNT &#x66DD;&#x5149;&#x540E;&#x7684;&#x6C27;&#x5316;&#x5E94;&#x6FC0;&#x53CD;&#x5E94;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x6839;&#x636E;&#x5F53;&#x524D;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x5F02;&#x751F;&#x4EE3;&#x8C22;&#x9884;&#x8BA1;&#x7565;&#x6709;&#x589E;&#x52A0;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E5F;&#x6709;&#x4EBA;&#x6307;&#x51FA;&#x610F;&#x5916;&#x7684;&#x5171;&#x8F6D;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x8BC1;&#x636E;&#x3002;&#x786E;&#x5B9A; TNT &#x66DD;&#x5149;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7EC4;&#x7EA7;&#x54CD;&#x5E94;&#x5C06;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x754C;&#x5B9A;&#x690D;&#x7269;&#x7528;&#x4E8E;&#x89E3;&#x6BD2;&#x8FD9;&#x79CD;&#x53D8;&#x6001;&#x53CD;&#x5E94;&#x7684;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#xFF0C;&#x5E94;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x6539;&#x5584;&#x9488;&#x5BF9; TNT &#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x4FEE;&#x590D;&#x6280;&#x672F;&#x6218;&#x7565;&#x548C;&#x5176;&#x4ED6;&#x785D;&#x57FA;&#x82B3;&#x9999;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x4EE3;&#x8C22;&#x9014;&#x5F84;&#x3002;

&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x6839; 246-&#x4E09;&#x785D;&#x57FA;&#x7532;&#x82EF;&#x4F5C;&#x4E1A;&#x4E2D;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x54CD;&#x5E94;&#x5723;&#x4EBA;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

Serial analysis of gene expression was used to profile transcript levels in Arabidopsis roots and assess their responses to 2,4,6-trinitrotoluene (TNT) exposure. SAGE libraries representing control and TNT-exposed seedling root transcripts were constructed, and each was sequenced to a depth of roughly 32,000 tags. More than 19,000 unique tags were identified overall. The second most highly induced tag (27-fold increase) represented a glutathione S-transferase. Cytochrome P450 enzymes, as well as an ABC transporter and a probable nitroreductase, were highly induced by TNT exposure. Analyses also revealed an oxidative stress response upon TNT exposure. Although some increases were anticipated in light of current models for xenobiotic metabolism in plants, evidence for unsuspected conjugation pathways was also noted. Identifying transcriptome-level responses to TNT exposure will better define the metabolic pathways plants use to detoxify this xenobiotic compound, which should help improve phytoremediation strategies directed at TNT and other nitroaromatic compounds.

SAGE analysis of transcriptome responses in Arabidopsis roots exposed to 2,4,6-trinitrotoluene.

L&#x26;#39;analyse s&#xE9;rielle d&#x26;#39;expression g&#xE9;nique a &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9; pour profiler les niveaux de transcription dans les racines d&#x26;#39;Arabidopsis et d&#x26;#39;&#xE9;valuer leurs r&#xE9;ponses au 2,4,6-trinitrotolu&#xE8;ne (TNT) d&#x26;#39;exposition. Biblioth&#xE8;ques SAGE repr&#xE9;sentant le contr&#xF4;le et la TNT-expos&#xE9;s transcriptions des racines des plantules ont &#xE9;t&#xE9; construits, et chacun a &#xE9;t&#xE9; s&#xE9;quenc&#xE9; &#xE0; une profondeur d&#x26;#39;environ 32 000 &#xE9;tiquettes. Plus de 19.000 &#xE9;tiquettes uniques ont &#xE9;t&#xE9; identifi&#xE9;s dans son ensemble. La seconde balise la plus fortement induit (27 fois plus &#xE9;lev&#xE9;e) a repr&#xE9;sent&#xE9; un glutathion S-transf&#xE9;rase. Les enzymes du cytochrome P450, ainsi que d&#x26;#39;un transporteur ABC et un nitror&#xE9;ductase probable, ont &#xE9;t&#xE9; fortement induite par l&#x26;#39;exposition TNT. Les analyses ont aussi r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; une r&#xE9;ponse au stress oxydatif lors de l&#x26;#39;exposition TNT. Bien que certaines augmentations ont &#xE9;t&#xE9; pr&#xE9;vu &#xE0; la lumi&#xE8;re des mod&#xE8;les actuels pour le m&#xE9;tabolisme des x&#xE9;nobiotiques dans les usines, les preuves de voies de conjugaison insoup&#xE7;onn&#xE9;es a &#xE9;galement &#xE9;t&#xE9; not&#xE9;. Identifier transcriptome des r&#xE9;ponses au niveau de l&#x26;#39;exposition TNT permettra de mieux d&#xE9;finir les voies m&#xE9;taboliques des plantes utilisent pour d&#xE9;toxifier ce compos&#xE9; x&#xE9;nobiotique, qui devrait contribuer &#xE0; am&#xE9;liorer les strat&#xE9;gies visant &#xE0; phytorem&#xE9;diation TNT et d&#x26;#39;autres compos&#xE9;s aromatiques nitr&#xE9;s.

Analyse des r&#xE9;ponses SAGE du transcriptome dans les racines d&#x26;#39;Arabidopsis expos&#xE9;s au 2,4,6-trinitrotolu&#xE8;ne

SAGE Analyse von Transkriptom-Reaktionen in Arabidopsis Wurzeln ausgesetzt 2,4,6-Trinitrotoluol.

Serial analysis of gene expression &egrave; stato utilizzato a livelli di trascrizione di profilo in Arabidopsis radici e valutare le loro risposte alla esposizione di 2, 4,6-trinitrotoluene (TNT). SALVIA librerie che rappresenta il semenzale esposte al TNT radice trascrizioni e controllo sono state costruite, e ciascuno &egrave; stato sequenziato per una profondit&agrave; di circa 32.000 Tag. Pi&ugrave; di 19.000 unico tag sono stati identificati nel complesso. La seconda pi&ugrave; altamente indotta tag (27-fold aumento) rappresentato un glutatione S-transferasi. Enzimi di citocromo P450, come pure un trasportatore ABC e un probabile nitroreductase, altamente sono stati indotti dall&#39;esposizione di TNT. Analisi hanno rivelato anche una risposta di stress ossidativo all&#39;esposizione di TNT. Anche se alcuni aumenti erano previsti alla luce dei modelli attuali per Metabolismo xenobiotico in piante, prove per vie insospettate coniugazione inoltre &egrave; stata notata. Identificazione livello transcriptome responses to esposizione TNT definire meglio le vie metaboliche che piante utilizzano per disintossicare questo composto di xenobiotico, che dovrebbe aiutare a migliorare le strategie di phytoremediation diretti a TNT e altri composti nitroaromatic.

SALVIA analisi del transcriptome responses in Arabidopsis radici esposte a 2, 4,6-trinitrotoluene.

&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x9023;&#x7D9A;&#x5206;&#x6790;&#x304C;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3057;&#x3001;2,4,6  - &#x30C8;&#x30EA;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30C8;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#xFF08;TNT&#xFF09;&#x306E;&#x66B4;&#x9732;&#x306B;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5236;&#x5FA1;&#x304A;&#x3088;&#x3073;TNT&#x306B;&#x3055;&#x3089;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x82D7;&#x306E;&#x6839;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x3092;&#x8868;&#x3059;SAGE&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x304C;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x304C;&#x7D04;32000&#x30BF;&#x30B0;&#x306E;&#x6DF1;&#x3055;&#x306B;&#x914D;&#x5217;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002; 19,000&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x30BF;&#x30B0;&#x304C;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x756A;&#x76EE;&#x306E;&#x6700;&#x3082;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306B;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x30BF;&#x30B0;&#xFF08;27&#x500D;&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30C1;&#x30AA;&#x30F3;S-&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x3092;&#x8868;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30C1;&#x30C8;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30E0;P450&#x9175;&#x7D20;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3001;ABC&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068;&#x8003;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x306F;&#x3001;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;TNT&#x66DD;&#x9732;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;TNT&#x306E;&#x66B4;&#x9732;&#x9178;&#x5316;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x304C;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x751F;&#x4F53;&#x7570;&#x7269;&#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x5149;&#x306E;&#x4E2D;&#x3067;&#x4E88;&#x60F3;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x304C;&#x3001;&#x601D;&#x3044;&#x3082;&#x5BC4;&#x3089;&#x306A;&#x3044;&#x62B1;&#x5408;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3082;&#x8A8D;&#x3081;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x3002; TNT&#x66DD;&#x9732;&#x306B;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x512A;&#x308C;&#x305F;&#x690D;&#x7269;&#x306F;TNT&#x3084;&#x4ED6;&#x306E;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x82B3;&#x9999;&#x65CF;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306B;&#x5411;&#x3051;&#x305F;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30C8;&#x30EC;&#x30E1;&#x30C7;&#x30A3;&#x30A8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x6226;&#x7565;&#x3092;&#x6539;&#x5584;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x751F;&#x4F53;&#x7570;&#x7269;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3092;&#x89E3;&#x6BD2;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

2,4,6  - &#x30C8;&#x30EA;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30C8;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#x306B;&#x66B4;&#x9732;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306E;SAGE&#x89E3;&#x6790;

&#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xC9C1;&#xB82C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C; &#xC0AC;&#xBCF8; &#xB808;&#xBCA8; Arabidopsis &#xBFCC;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xD558; &#xACE0; 2,4,6-&#xD1A8;&#xB8E8;&#xC5D4; (TNT) &#xB178;&#xCD9C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC0D0;&#xBE44;&#xC5B4; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC; &#xC81C;&#xC5B4; &#xBC0F; TNT &#xB178;&#xCD9C; &#xC885;&#xBB18; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xB179;&#xCDE8; &#xB85D; &#xAC74;&#xC124; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xAE4A;&#xC774; &#xC57D; 32000 &#xD0DC;&#xADF8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB294; &#xAC01;. 19000 &#xAC1C; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xACE0;&#xC720; &#xD0DC;&#xADF8; &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xB450; &#xBC88;&#xC9F8;&#xB294; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB192;&#xC740; &#xD0DC;&#xADF8;&#xB97C; &#xC720;&#xB3C4; (27-fold &#xC99D;&#xAC00;) &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; glutathione S-&#xC804;&#xC774;. &#xC2DC; &#xD1A0; &#xD06C;&#xB86C; P450 &#xD6A8;&#xC18C;&#xC640; ABC transporter &#xBC0F; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; nitroreductase &#xB192;&#xC740; TNT &#xB178;&#xCD9C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC720;&#xB3C4; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xB294; TNT &#xB178;&#xCD9C; &#xC2DC; &#xC0B0;&#xD654; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC77C;&#xBD80; &#xC99D;&#xAC00; &#xC2DD;&#xBB3C; xenobiotic &#xB300;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD604;&#xC7AC;&#xC758; &#xBAA8;&#xB378;&#xC5D0; &#xBE44;&#xCD94;&#xC5B4; &#xC608;&#xC0C1; &#xD588;&#xB2E4;, &#xBE44;&#xB85D; &#xB73B;&#xBC16;&#xB41C; &#xD65C;&#xC6A9; &#xACBD;&#xB85C; &#xB300; &#xD55C; &#xC99D;&#xAC70;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xC9C0;&#xC801; &#xD588;&#xB2E4;. TNT &#xB178;&#xCD9C; transcriptome &#xC218;&#xC900; &#xC751;&#xB2F5; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB354; &#xB098;&#xC740; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xB3C5; TNT&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC10;&#xB3C5; phytoremediation &#xC804;&#xB7B5;&#xC744; &#xAC1C;&#xC120; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xB3C4;&#xC6C0;&#xC774; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;&#xC774; xenobiotic &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; &#xBC0F; &#xAE30;&#xD0C0; nitroaromatic &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xB300;&#xC0AC; &#xACBD;&#xB85C; &#xC815;&#xC758; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Arabidopsis &#xBFCC;&#xB9AC; 2,4,6-&#xD1A8;&#xB8E8;&#xC5D4;&#xC5D0; &#xB178;&#xCD9C;&#xC5D0;&#xC11C; transcriptome &#xC751;&#xB2F5;&#xC758; &#xC138;&#xC774; &#xC9C0; &#xBD84;&#xC11D; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Serie de an&#xE1;lisis de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica se utiliza para perfilar los niveles de transcripci&#xF3;n en las ra&#xED;ces de Arabidopsis y evaluar sus respuestas al 2,4,6-trinitrotolueno (TNT) de la exposici&#xF3;n. SAGE bibliotecas que representan el control y TNT-expuestos transcripciones de ra&#xED;ces de pl&#xE1;ntulas fueron construidos, y cada uno se secuenci&#xF3; a una profundidad de aproximadamente 32.000 etiquetas. M&#xE1;s de 19.000 etiquetas &#xFA;nicas se identificaron en general. La segunda etiqueta m&#xE1;s alta inducida (27 veces m&#xE1;s) represent&#xF3; una glutati&#xF3;n S-transferasa. Las enzimas del citocromo P450, as&#xED; como un transportador ABC y un nitroreductasa probable, fueron inducidos por la exposici&#xF3;n altamente TNT. Los an&#xE1;lisis tambi&#xE9;n revel&#xF3; una respuesta de estr&#xE9;s oxidativo en la exposici&#xF3;n de TNT. A pesar de algunos aumentos se anticipa a la luz de los modelos actuales para el metabolismo de xenobi&#xF3;ticos en las plantas, las pruebas de las v&#xED;as de conjugaci&#xF3;n insospechados se se&#xF1;al&#xF3;. La identificaci&#xF3;n del transcriptoma respuestas en el nivel de exposici&#xF3;n a TNT definir&#xE1; mejor las rutas metab&#xF3;licas centrales utilizan para desintoxicar este compuesto xenobi&#xF3;tico, que deber&#xED;a ayudar a mejorar las estrategias de fitorremediaci&#xF3;n dirigidas a TNT y otros compuestos nitroarom&#xE1;ticos.

SAGE An&#xE1;lisis de las respuestas transcriptoma en las ra&#xED;ces de Arabidopsis expuesto al 2,4,6-trinitrotolueno

&#x95F4;&#x63A5;&#x9176;&#x8054;&#x514D;&#x75AB;&#x5438;&#x9644;&#x8BD5;&#x9A8C;&#x7528;&#x6765;&#x91CF;&#x5316; (+)-&#x8131;&#x843D;&#x9178; (ABA) &#x5728;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E2D;&#x56FD;&#x5BB6;&#x4ECE;&#x4E24;&#x4E2A;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.&#xFF09; &#x6BCD;&#x4EB2;&#x6811;&#x5408;&#x5B50;&#x80DA;&#x548C;&#x5B50;&#x4F53;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x3002;&#x5E72;&#x91CD;&#x57FA;&#x7840;&#x4E0A;&#x80DA;&#x80CE;&#x548C; megagametophytic &#x963F;&#x575D;&#x6D53;&#x5EA6;&#x5728;&#x65E9;&#x671F;&#x53D1;&#x5C55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x662F;&#x6700;&#x9AD8;&#x548C;&#x7A33;&#x6B65;&#x4E0B;&#x964D;&#x81F3;&#x5176;&#x5728;&#x9525;&#x50AC;&#x719F;&#x7684;&#x6700;&#x4F4E;&#x503C;&#x3002;&#x80DA;&#x80CE;&#x963F;&#x575D;&#x6D53;&#x5EA6;&#x662F;&#x5927;&#x5927;&#x9AD8;&#x4E8E; megagametophytic ABA &#x542B;&#x91CF;&#x3002;ABA &#x542B;&#x91CF;&#x7684;&#x80DA;&#x80CE;&#x662F;&#x6700;&#x4F4E;&#x671F;&#x95F4;&#x65E9;&#x5230; mid-development &#xFF1B;&#x5B83;&#x8FC5;&#x901F;&#x5730;&#x589E;&#x52A0; mid-development&#xFF0C;&#x968F;&#x540E;&#x4E0B;&#x964D;&#xFF0C;&#x7136;&#x540E;&#x8981;&#x4E48;&#x4FDD;&#x6301;&#x4E0D;&#x53D8;&#x6216;&#x4E0B;&#x964D;&#x5728;&#x9525;&#x6210;&#x719F; &#xFF08;&#x540E;&#x671F;&#x53D1;&#x5C55;&#xFF09;&#x3002;&#x603B;&#x963F;&#x575D;&#x6BCF;&#x80DA;&#x80CE;&#x8FC5;&#x901F;&#x589E;&#x52A0;&#xFF0C;&#x53EA;&#x662F;&#x4E4B;&#x524D;&#x8FC5;&#x901F;&#x589E;&#x52A0;&#x80DA;&#x80CE;&#x5E72;&#x91CD;&#x3002;&#x5171;&#x963F;&#x575D;&#x6BCF;&#x5B50;&#x4F53;&#x4ECD;&#x4E0D;&#x65AD;&#x5728;&#x53D1;&#x5C55;&#xFF0C;&#x6574;&#x4E2A;&#x9664;&#x5728; mid-development &#x671F;&#x95F4;&#x5F53;&#x5B83;&#x6682;&#x65F6;&#x4E0B;&#x964D;&#x3002;

&#x8131;&#x843D;&#x9178;&#x4E0E;&#x5408;&#x5B50;&#x80DA;&#x5728;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x3002;

Indirect ELISA was used to quantify (+)-abscisic acid (ABA) in developing zygotic embryo and megagametophyte tissues from two loblolly pine (Pinus taeda L.) mother trees. On a dry weight basis, embryonic and megagametophytic ABA concentrations were highest during early development and decreased steadily to their lowest values at cone ripening. Embryonic ABA concentration was significantly higher than megagametophytic ABA concentration. The ABA content of embryos was lowest during early to mid-development; it increased rapidly during mid-development, subsequently declined, and then either remained constant or declined at cone ripening (late development). Total ABA per embryo increased rapidly just before the rapid increase in embryo dry weight. Total ABA per megagametophyte remained constant throughout development, except during mid-development when it temporarily declined.

Abscisic acid and zygotic embryogenesis in Pinus taeda.

ELISA indirect a &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9; pour quantifier (+)-acide abscissique (ABA) dans le d&#xE9;veloppement de l&#x26;#39;embryon zygotique et les tissus m&#xE9;gagam&#xE9;tophyte de deux pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.) arbres-m&#xE8;res. Sur la base du poids sec, les concentrations d&#x26;#39;ABA embryonnaires et megagametophytic &#xE9;taient les plus &#xE9;lev&#xE9;s au cours du d&#xE9;veloppement pr&#xE9;coce et diminu&#xE9; de fa&#xE7;on constante &#xE0; leurs valeurs les plus faibles &#xE0; la maturation du c&#xF4;ne. Embryonnaire ABA concentration &#xE9;tait significativement plus &#xE9;lev&#xE9;e que la concentration ABA megagametophytic. Le contenu en ABA des embryons &#xE9;tait la plus faible au d&#xE9;but du mois &#xE0; la mi-d&#xE9;veloppement, elle a augment&#xE9; rapidement au cours de la mi-d&#xE9;veloppement, par la suite diminu&#xE9;, puis est demeur&#xE9;e constante ou a diminu&#xE9; au c&#xF4;ne maturation (d&#xE9;veloppement tardif). ABA totale par embryon a augment&#xE9; rapidement juste avant l&#x26;#39;augmentation rapide du poids sec embryon. ABA total par m&#xE9;gagam&#xE9;tophyte est rest&#xE9; constant au cours du d&#xE9;veloppement, sauf pendant la mi-d&#xE9;veloppement quand il temporairement diminu&#xE9;.

L&#x26;#39;acide abscissique et embryogen&#xE8;se zygotique dans Pinus taeda

Abscisins&#xE4;ure und zygotischen Embryogenese in Pinus taeda.

ELISA indiretta &egrave; stata utilizzata per quantificare (+)-acido abscissico (ABA) in via di sviluppo zygotic tessuti dell&#39;embrione e megagametophyte da due alberi di madre loblolly pine (Pinus taeda L.). Sulla base del peso secco, concentrazioni di ABA embrionale e megagametophytic erano pi&ugrave; alte durante lo sviluppo iniziale e diminuito costantemente i valori pi&ugrave; bassi al cono di maturazione. Embrionali ABA concentrazione era significativamente pi&ugrave; alta di megagametophytic concentrazione di ABA. Il contenuto di ABA di embrioni &egrave; stato pi&ugrave; basso durante inizio a mid-development; esso &egrave; aumentato rapidamente durante mid-development, successivamente rifiutato, e poi sia rimasto costante o rifiutato a cono maturazione (ritardo di sviluppo). ABA totale all&#39;embrione &egrave; aumentato rapidamente appena prima che il rapido aumento nell&#39;embrione di peso a secco. Totale ABA per megagametophyte &egrave; rimasto costante per tutto lo sviluppo, tranne durante il mid-development quando si &egrave; rifiutato temporaneamente.

Acido abscissico e l&#39;embriogenesi di zygotic in Pinus taeda.

&#x9593;&#x63A5;ELISA&#x6CD5;&#x306F;&#x4E8C;&#x3064;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x6BCD;&#x6A39;&#x304B;&#x3089;&#x63A5;&#x5408;&#x5B50;&#x80DA;&#x3068;&#x96CC;&#x6027;&#x914D;&#x5076;&#x4F53;&#x7D44;&#x7E54;&#x958B;&#x767A;&#x306B;&#xFF08;+&#xFF09; - &#x30A2;&#x30D6;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x9178;&#xFF08;ABA&#xFF09;&#x3092;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4E7E;&#x71E5;&#x91CD;&#x91CF;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3001;&#x80DA;&#x304A;&#x3088;&#x3073;megagametophytic ABA&#x6FC3;&#x5EA6;&#x306F;&#x521D;&#x671F;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x6642;&#x306B;&#x6700;&#x3082;&#x9AD8;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3068;&#x30B3;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x6210;&#x719F;&#x3067;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x6700;&#x5C0F;&#x5024;&#x306B;&#x7740;&#x5B9F;&#x306B;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x80DA;&#x306E;ABA&#x6FC3;&#x5EA6;&#x306F;megagametophytic ABA&#x6FC3;&#x5EA6;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x6709;&#x610F;&#x306B;&#x9AD8;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x80DA;&#x306E;ABA&#x542B;&#x91CF;&#x306F;&#x4E2D;&#x671F;&#x958B;&#x767A;&#x3078;&#x306E;&#x65E9;&#x671F;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x6700;&#x4F4E;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x200B;&#x200B;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x306F;&#x3001;&#x534A;&#x3070;&#x958B;&#x767A;&#x4E2D;&#x306B;&#x6025;&#x901F;&#x306B;&#x5897;&#x52A0;&#x3057;&#x305D;&#x306E;&#x5F8C;&#x4F4E;&#x4E0B;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x5F8C;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x306E;&#x4E00;&#x5B9A;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30B3;&#x30FC;&#x30F3;&#x719F;&#x6210;&#xFF08;&#x958B;&#x767A;&#x5F8C;&#x671F;&#xFF09;&#x3067;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x80DA;&#x3042;&#x305F;&#x308A;&#x306E;&#x7DCF;ABA&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x80DA;&#x4E7E;&#x71E5;&#x91CD;&#x91CF;&#x304C;&#x6025;&#x6FC0;&#x306B;&#x5897;&#x52A0;&#x3059;&#x308B;&#x524D;&#x306B;&#x3001;&#x6025;&#x901F;&#x306B;&#x5897;&#x52A0;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x96CC;&#x6027;&#x914D;&#x5076;&#x4F53;&#x5F53;&#x305F;&#x308A;&#x306E;&#x7DCF;ABA&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x304C;&#x4E00;&#x6642;&#x7684;&#x306B;&#x4F4E;&#x4E0B;&#x3057;&#x305F;&#x3068;&#x304D;&#x306B;&#x534A;&#x3070;&#x3001;&#x958B;&#x767A;&#x4E2D;&#x4EE5;&#x5916;&#x306F;&#x3001;&#x958B;&#x767A;&#x5168;&#x4F53;&#x306B;&#x4E00;&#x5B9A;&#x306E;&#x307E;&#x307E;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30A2;&#x30D6;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x9178;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x63A5;&#x5408;&#x5B50;&#x80DA;

&#xAC04;&#xC811; &#xC560; &#xB780; (+)&#xB97C; &#xACC4;&#xB7C9; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD55C;-&#xB450;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.) &#xC5B4;&#xBA38;&#xB2C8; &#xB098;&#xBB34;&#xC5D0;&#xC11C; zygotic &#xBC30;&#xC544; &#xBC0F; megagametophyte &#xC870;&#xC9C1; &#xAC1C;&#xBC1C; abscisic &#xC0B0; (ABA). &#xAC74;&#xC870; &#xC911;&#xB7C9; &#xAE30;&#xC900;&#xC73C;&#xB85C; &#xBC30;&#xC544; &#xBC0F; megagametophytic ABA &#xB18D;&#xB3C4; &#xB192;&#xC740; &#xCD08;&#xAE30; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xB418;&#xC5C8;&#xACE0; &#xAFB8;&#xC900;&#xD788; &#xCF58; &#xC219;&#xC131;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB0AE;&#xC740; &#xAC12;&#xC73C;&#xB85C; &#xAC10;&#xC18C;. &#xBC30;&#xC544; ABA &#xB18D;&#xB3C4; megagametophytic ABA &#xB18D;&#xB3C4; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xC0C1;&#xB2F9;&#xD788; &#xB192;&#xC558;&#xB2E4;. &#xBC30;&#xC544;&#xC758; ABA &#xCF58;&#xD150;&#xCE20;&#xB294; &#xC77C;&#xCC0D; &#xD558;&#xACE0;&#xC790;; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB0AE;&#xC740; &#xC774;&#xD6C4;&#xC5D0; &#xAC70;&#xBD80; &#xD558;&#xACE0;&#xC790; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xAE09;&#xC18D; &#xD558; &#xAC8C; &#xC99D;&#xAC00; &#xD558; &#xACE0; &#xC911; &#xD558;&#xB098; &#xB0A8;&#xC544; &#xC0C1;&#xC218; &#xB610;&#xB294; &#xCF58; (&#xD6C4;&#xBC18; &#xAC1C;&#xBC1C;) &#xC219;&#xC131;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC70;&#xC808;. &#xD0DC;&#xC544; &#xB2F9; &#xCD1D; ABA &#xC9C1;&#xC804; &#xD0DC;&#xC544;&#xC758; &#xAE09;&#xC18D; &#xD55C; &#xC99D;&#xAC00; &#xB4DC;&#xB77C;&#xC774; &#xBB34;&#xAC8C; &#xAE09;&#xC18D; &#xD558; &#xAC8C; &#xC99D;&#xAC00; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD1D; ABA megagametophyte &#xB0A8;&#xC544; &#xC0C1;&#xC218; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xB2F9;&#xC744; &#xC81C;&#xC678; &#xD558; &#xACE0; &#xD558;&#xACE0;&#xC790; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC77C;&#xC2DC;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xAC70;&#xBD80; &#xD558;&#xB294; &#xACBD;&#xC6B0;.

Abscisic &#xC0B0;&#xACFC; Pinus taeda zygotic embryogenesis&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

ELISA indirecto se utiliz&#xF3; para cuantificar (+)-&#xE1;cido absc&#xED;sico (ABA) en el desarrollo de embriones cig&#xF3;ticos y los tejidos megagametofito de pino taeda dos (Pinus taeda L.) &#xE1;rboles madre. Sobre una base de peso seco, las concentraciones de ABA embrionarias y megagametophytic fueron m&#xE1;s altas durante el desarrollo temprano y disminuido de manera constante a sus valores m&#xE1;s bajos en la maduraci&#xF3;n del cono. Embrionario concentraci&#xF3;n de ABA fue significativamente mayor que la concentraci&#xF3;n de ABA megagametophytic. El contenido de AAB de los embriones fue m&#xE1;s baja durante principios y mediados de desarrollo, sino que se increment&#xF3; r&#xE1;pidamente durante la mitad del desarrollo, se redujo posteriormente, y luego o bien se mantuvo constante o ha disminuido en el cono de maduraci&#xF3;n (desarrollo tard&#xED;o). ABA total por embri&#xF3;n aumentado r&#xE1;pidamente justo antes de que el r&#xE1;pido aumento en el peso seco del embri&#xF3;n. ABA total por megagametofito se mantuvo constante durante todo el desarrollo, excepto durante la mitad del desarrollo, cuando temporalmente se redujo.

&#xC1;cido absc&#xED;sico y embriog&#xE9;nesis cig&#xF3;ticos en Pinus taeda

&#x6807;&#x8BB0;&#x6240;&#x6709;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;

Tagging all genes.

&#xC9;tiquetage Tous les g&#xE8;nes

Tagging alle Gene.

Codifica tutti i geni.

&#x30BF;&#x30AE;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;

&#xBAA8;&#xB4E0; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xD0DC;&#xADF8;&#xB97C; &#xCD94;&#xAC00; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Etiquetado de todos los genes

&#x5DF2;&#x5B8C;&#x6210;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x5DF2;&#x660E;&#x786E;&#x6709;&#x5173;&#x7684;&#x6F06;&#x9176;&#x6C27;&#x5316;&#x9176;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x5206;&#x5E03;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x9AD8;&#x7B49;&#x690D;&#x7269;&#x9176;&#x5BB6;&#x5EAD;&#xFF0C;multicopper&#x3002;&#x4ECE;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6570;&#x636E;&#x5E93;&#x548C;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x5357;&#x82A5;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x51E0;&#x4E2A;&#x65B0;&#x514B;&#x9686;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x90A3;&#x4E9B;&#x6251;&#x6740;&#x6F06;&#x6837; multicopper &#x6C27;&#x5316;&#x9176; &#xFF08;LMCO&#xFF09; &#x5E8F;&#x5217;&#x88AB;&#x7528;&#x6765;&#x6784;&#x9020;&#x53EF;&#x6E05;&#x695A;&#x5730;&#x5206;&#x4E3A;&#x690D;&#x7269; LMCOs &#x516D;&#x4E2A;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x7C7B;&#xFF0C;&#x81F3;&#x5C11;&#x4E09;&#x79CD;&#x65E9;&#x4E8E;&#x8FDB;&#x5316;&#x7684;&#x88AB;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x548C;&#x88F8;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x5206;&#x6B67;&#x57FA;&#x56E0;&#x53D1;&#x5C55;&#x53F2;&#x3002;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x6C28;&#x57FA;&#x9178;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x5BF9;&#x9F50;&#x65B9;&#x5F0F;&#x7A81;&#x51FA;&#x663E;&#x793A;&#x533A;&#x57DF;&#x7684;&#x4E24;&#x4FA7;&#x662F;&#x9AD8;&#x4FDD;&#x5B88;&#x7684;&#x94DC;&#x7ED3;&#x5408;&#x57DF;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x6B64;&#x9176;&#x5BB6;&#x65CF;&#x6210;&#x5458;&#x53D8;&#x91CF;&#x5E8F;&#x5217;&#x3002;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x9884;&#x6D4B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5305;&#x542B;&#x660E;&#x663E;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5E8F;&#x5217;&#x3002;13 A.&#x5357;&#x82A5; 17 LMCO &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5728;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x4E2D;&#x8BC4;&#x4F30;&#x4F7F;&#x7528; RT-pcr &#x6280;&#x672F;&#x53D1;&#x5C55;&#x7684;&#x5404;&#x4E2A;&#x9636;&#x6BB5;&#x3002;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x6A21;&#x5F0F;&#x7684;&#x591A;&#x6837;&#x6027;&#x8868;&#x73B0;&#x4E0E;&#x67D0;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x6B63;&#x5728;&#x8868;&#x793A;&#x672C;&#x6784;&#x7684;&#x65B9;&#x5F0F;&#xFF0C;&#x800C;&#x53E6;&#x5916;&#x53EA;&#x8868;&#x793A;&#x5728;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x5728;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x9636;&#x6BB5;&#x3002;&#x53EA;&#x6709;&#x5C11;&#x91CF;&#x7684; LMCO &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x6A21;&#x5F0F;&#xFF0C;&#x53EF;&#x89C6;&#x4E3A;&#x7B26;&#x5408;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x9176;&#x6728;&#x8D28;&#x7D20;&#x6C89;&#x79EF;&#x4E2D;&#x53D1;&#x6325;&#x4E3B;&#x8981;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x8868;&#x793A;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x90FD;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x4E86;&#x5176;&#x4ED6;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x751F;&#x7406;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x5982;&#x94C1;&#x4EE3;&#x8C22;&#x5382; LMCOs&#xFF0C;&#x548C;&#x4F24;&#x53E3;&#x6108;&#x5408;&#x3002;

&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x548C;&#x5206;&#x5B50;&#x5206;&#x6790;&#x6F06;&#x6837; multicopper &#x6C27;&#x5316;&#x9176; (LMCO) &#x57FA;&#x56E0;&#x5BB6;&#x65CF;&#x5728;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x4E2D;&#x3002;

Completed genome sequences have made it clear that multicopper oxidases related to laccase are widely distributed as multigene families in higher plants. Laccase-like multicopper oxidase (LMCO) sequences culled from GenBank and the Arabidopsis thaliana genome, as well as those from several newly cloned genes, were used to construct a gene phylogeny that clearly divided plant LMCOs into six distinct classes, at least three of which predate the evolutionary divergence of angiosperms and gymnosperms. Alignments of the predicted amino acid sequences highlighted regions of variable sequence flanked by the highly conserved copper-binding domains that characterize members of this enzyme family. All of the predicted proteins contained apparent signal sequences. The expression of 13 of the 17 LMCO genes in A. thaliana was assessed in different tissues at various stages of development using RT-PCR. A diversity of expression patterns was demonstrated with some genes being expressed in a constitutive fashion, while others were only expressed in specific tissues at a particular stage of development. Only a few of the LMCO genes were expressed in a pattern that could be considered consistent with a major role for these enzymes in lignin deposition. These results are discussed in the context of other potential physiological functions for plant LMCOs, such as iron metabolism and wound healing.

Gene structure and molecular analysis of the laccase-like multicopper oxidase (LMCO) gene family in Arabidopsis thaliana.

S&#xE9;quences du g&#xE9;nome achev&#xE9;s ont clairement fait savoir que multicopper oxydases li&#xE9;e &#xE0; la laccase sont largement distribu&#xE9;s en tant que familles multig&#xE9;niques chez les plantes sup&#xE9;rieures. Oxydase multicopper laccase-like (LMCO) s&#xE9;quences de GenBank abattus et le g&#xE9;nome d&#x26;#39;Arabidopsis thaliana, ainsi que ceux de plusieurs g&#xE8;nes nouvellement clon&#xE9;s, ont &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;s pour construire une phylog&#xE9;nie g&#xE8;ne qui divise clairement LMCOs v&#xE9;g&#xE9;tales en six classes distinctes, au moins trois d&#x26;#39;entre eux ant&#xE9;rieures &#xE0; la divergence &#xE9;volutive des angiospermes et les gymnospermes. Les alignements de la pr&#xE9;dite s&#xE9;quences d&#x26;#39;acides amin&#xE9;s mis en &#xE9;vidence les r&#xE9;gions de s&#xE9;quence variable flanqu&#xE9;s par les tr&#xE8;s conserv&#xE9;es des domaines de liaison en cuivre qui caract&#xE9;risent les membres de cette famille d&#x26;#39;enzymes. Toutes les prot&#xE9;ines pr&#xE9;dites contenaient des s&#xE9;quences de signaux apparents. L&#x26;#39;expression de 13 g&#xE8;nes des OMCl 17 chez A. thaliana a &#xE9;t&#xE9; &#xE9;valu&#xE9;e dans les diff&#xE9;rents tissus &#xE0; diff&#xE9;rents stades de d&#xE9;veloppement en utilisant la RT-PCR. Une diversit&#xE9; de profils d&#x26;#39;expression a &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;montr&#xE9; avec certains g&#xE8;nes exprim&#xE9;s de fa&#xE7;on constitutive, tandis que d&#x26;#39;autres ont &#xE9;t&#xE9; seulement exprim&#xE9;e dans des tissus sp&#xE9;cifiques &#xE0; un stade particulier du d&#xE9;veloppement. Seuls quelques-uns des g&#xE8;nes OMCl ont &#xE9;t&#xE9; exprim&#xE9;es dans un mod&#xE8;le qui pourrait &#xEA;tre consid&#xE9;r&#xE9;e comme compatible avec un r&#xF4;le majeur pour ces enzymes dans le d&#xE9;p&#xF4;t de lignine. Ces r&#xE9;sultats sont discut&#xE9;s dans le contexte d&#x26;#39;autres fonctions physiologiques potentiels pour LMCOs v&#xE9;g&#xE9;taux, tels que le m&#xE9;tabolisme du fer et de la cicatrisation des plaies.

La structure des g&#xE8;nes et de l&#x26;#39;analyse mol&#xE9;culaire de la famille laccase-oxydase comme Gene Multicopper (LMCO) chez Arabidopsis thaliana

Genstruktur und molekulare Analyse der Laccase-&#xE4;hnliches mehrkernigen Oxidase (LMCO)-Genfamilie in Arabidopsis thaliana.

Sequenze di genoma completato hanno messo in chiaro che multicopper ossidasi correlati a laccase ampiamente sono distribuiti come multigene famiglie in pi&ugrave; alte piante. Sequenze simili a Laccase multicopper ossidasi (LMCO) abbattuti da GenBank e il genoma di Arabidopsis thaliana, cos&igrave; come quelli da diversi geni appena clonati, sono stati utilizzati per costruire un phylogeny di gene che chiaramente diviso pianta LMCOs in sei classi distinte, almeno tre dei quali antecedenti la divergenza evolutiva di angiosperme e gimnosperme. Allineamenti di sequenze di aminoacidi predetto evidenziato regioni di sequenza variabile affiancato ai domini di rame-associazione altamente conservato che caratterizzano i membri di questa famiglia di enzimi. Tutte le proteine predetta contenute sequenze segnale apparente. L&#39;espressione di 13 dei 17 geni LMCO in a. thaliana &egrave; stata valutata in diversi tessuti a vari stadi di sviluppo mediante RT-PCR. Una diversit&agrave; di modelli di espressione &egrave; stata dimostrata con alcuni geni espressi in modo costitutivo, mentre gli altri sono stati espressi solo in specifici tessuti in una particolare fase di sviluppo. Solo pochi i geni LMCO sono stati espressi in un modello che potrebbe essere considerato coerenza con un ruolo importante per questi enzimi nella deposizione lignina. Questi risultati sono discussi nel contesto delle altre funzioni fisiologiche potenziali per impianto LMCOs, come il metabolismo del ferro e la guarigione delle ferite.

Struttura del gene e l&#39;analisi molecolare della famiglia genica laccase-come multicopper ossidasi (LMCO) in Arabidopsis thaliana.

&#x5B8C;&#x4E86;&#x3057;&#x305F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x914D;&#x5217;&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x304C;&#x5E83;&#x304F;&#x9AD8;&#x7B49;&#x690D;&#x7269;&#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;&#x591A;&#x91CD;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x914D;&#x5E03;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;multicopper&#x306F;&#x30E9;&#x30C3;&#x30AB;&#x30FC;&#x30BC;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x30AA;&#x30AD;&#x30B7;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x3066;&#x304D;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30E9;&#x30C3;&#x30AB;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30DE;&#x30EB;&#x30C1;&#x9285;&#x30AA;&#x30AD;&#x30B7;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC;&#xFF08;LMCO&#xFF09;&#x306F;&#x3001;GenBank&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x304B;&#x3089;&#x629C;&#x7C8B;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x914D;&#x5217;&#x306F;&#x3001;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x304F;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7531;&#x6765;&#x306E;&#x3082;&#x306E;&#x306A;&#x3069;&#x3001;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082;3&#x3064;&#x306E;&#x3001;&#x305D;&#x306E;6&#x3064;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x306B;&#x306F;&#x3063;&#x304D;&#x308A;&#x3068;&#x5206;&#x304B;&#x308C;&#x3066;&#x690D;&#x7269;LMCOs&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7CFB;&#x7D71;&#x3092;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x88AB;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x3068;&#x88F8;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x5206;&#x5C90;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x3055;&#x304B;&#x306E;&#x307C;&#x308A;&#x3002;&#x4E88;&#x60F3;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x30A2;&#x30E9;&#x30A4;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x9175;&#x7D20;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x3092;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306B;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x9285;&#x7D50;&#x5408;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306B;&#x96A3;&#x63A5;&#x3057;&#x3001;&#x5909;&#x6570;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x9818;&#x57DF;&#x3092;&#x5F37;&#x8ABF;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4E88;&#x6E2C;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x304C;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x914D;&#x5217;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;17 LMCO&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;13&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306F;RT-PCR&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x305F;&#x958B;&#x767A;&#x306E;&#x3055;&#x307E;&#x3056;&#x307E;&#x306A;&#x6BB5;&#x968E;&#x3067;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7D44;&#x7E54;&#x3067;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4ED6;&#x306E;&#x4EBA;&#x306F;&#x3001;&#x958B;&#x767A;&#x306E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x6BB5;&#x968E;&#x3067;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x3067;&#x767A;&#x73FE;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x9593;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x591A;&#x69D8;&#x6027;&#x306F;&#x3001;&#x69CB;&#x6210;&#x7684;&#x306A;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x8868;&#x73FE;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3067;&#x5B9F;&#x8A3C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002; LMCO&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x307B;&#x3093;&#x306E;&#x6570;&#x306F;&#x3001;&#x30EA;&#x30B0;&#x30CB;&#x30F3;&#x5806;&#x7A4D;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x8003;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3067;&#x767A;&#x73FE;&#x3055;&#x305B;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x9244;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3068;&#x5275;&#x50B7;&#x6CBB;&#x7652;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x690D;&#x7269;LMCOs&#x4ED6;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x751F;&#x7406;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30AD;&#x30B9;&#x30C8;&#x3067;&#x8AAC;&#x660E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x69CB;&#x9020;&#x3068;&#x30E9;&#x30C3;&#x30AB;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30DE;&#x30EB;&#x30C1;&#x9285;&#x30AA;&#x30AD;&#x30B7;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC;&#xFF08;LMCO&#xFF09;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x89E3;&#x6790;

&#xC644;&#xC131; &#xB41C; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB294; multicopper oxidases laccase &#xAD00;&#xB828;&#xC774; &#xB192;&#xC740; &#xC2DD;&#xBB3C; multigene &#xAC00;&#xC871;&#xC73C;&#xB85C; &#xB110;&#xB9AC; &#xBC30;&#xD3EC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBD84;&#xBA85;&#xD788; &#xB9CC;&#xB4E4;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Laccase &#xAC19;&#xC740; multicopper &#xC0B0;&#xD654; &#xD6A8;&#xC18C; (LMCO) &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC740;&#xD589; &#xBC0F; Arabidopsis thaliana &#xAC8C;&#xB188; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC0C8;&#xB85C; &#xBCF5;&#xC81C; &#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD559;&#xC0B4; &#xB41C; angiosperms&#xC640; gymnosperms&#xC758; &#xC9C4;&#xD654; &#xBC1C;&#xC0B0; &#xC774;&#xC804;&#xC758; &#xC911; 3 &#xAC1C;&#xB294; &#xBA85;&#xD655; &#xD558; &#xAC8C; 6 &#xAC00;&#xC9C0; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4; &#xB098;&#xB204;&#xC5B4; &#xACF5;&#xC7A5; LMCOs &#xC801;&#xC5B4;&#xB3C4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xACC4;&#xD1B5; &#xAD6C;&#xC131; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC608;&#xCE21; &#xB41C; &#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; &#xB9DE;&#xCDA4; &#xBCC0;&#xC218; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xACE0;&#xB3C4;&#xB85C; &#xBCF4;&#xC874;&#xB41C; &#xAD6C;&#xB9AC; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC774; &#xD6A8;&#xC18C; &#xAC00;&#xC871;&#xC758; &#xAD6C;&#xC131;&#xC6D0;&#xC758; &#xD2B9;&#xC131;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD615;&#xBC8C;&#xC758; &#xC601;&#xC5ED;&#xC5D0; &#xAC15;&#xC870; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBA85;&#xBC31;&#xD55C; &#xC2E0;&#xD638; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD3EC;&#xD568;. A. thaliana&#xC5D0;&#xC11C; 17 LMCO &#xC720;&#xC804;&#xC790; 13 &#xC2DD; RT-PCR&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC758; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD3C9;&#xAC00; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC2DD; &#xD328;&#xD134;&#xC758; &#xB2E4;&#xC591;&#xC131;&#xC740; &#xB2E4;&#xB978; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD2B9;&#xC815; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xB9CC; &#xD45C;&#xD604; &#xD588;&#xB2E4; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC81C;&#xC815; &#xD328;&#xC158;&#xC5D0; &#xD45C;&#xD604; &#xB418; &#xACE0; &#xC77C;&#xBD80; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xC2DC;&#xC5F0; &#xD588;&#xB2E4;. LMCO &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC911; &#xC77C;&#xBD80;&#xB9CC; lignin &#xC99D; &#xCC29;&#xC5D0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC8FC;&#xC694; &#xC5ED;&#xD560;&#xACFC; &#xC77C;&#xCE58; &#xAC04;&#xC8FC; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xD328;&#xD134;&#xC73C;&#xB85C; &#xD45C;&#xD604; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACB0;&#xACFC; &#xCCA0; &#xBB3C;&#xC9C8; &#xB300;&#xC0AC; &#xB4F1; LMCOs, &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xB2E4;&#xB978; &#xC0DD;&#xB9AC; &#xC801; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC758; &#xB9E5;&#xB77D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB17C;&#xC758; &#xD558; &#xACE0; &#xC0C1;&#xCC98; &#xCE58;&#xC720;.

&#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAD6C;&#xC870;&#xC640; Arabidopsis thaliana&#xC758; &#xC0B0;&#xD654; &#xD6A8;&#xC18C; laccase &#xAC19;&#xC740; multicopper (LMCO) &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC00;&#xC871;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xBD84;&#xC11D;.

Completado secuencias del genoma han dejado claro que multicobre oxidasas relacionadas con lacasa se encuentran ampliamente distribuidos en familias multig&#xE9;nicas en las plantas superiores. Lacasa-como oxidasa multicobre (OCMl) las secuencias seleccionadas de GenBank y el genoma de Arabidopsis thaliana, as&#xED; como los de varios genes que han sido clonados, fueron utilizados para construir una filogenia del gen que claramente divide LMCOs plantas en seis clases distintas, por lo menos tres de los cuales anteriores a la divergencia evolutiva de las angiospermas y gimnospermas. Las alineaciones de la secuencias de amino&#xE1;cidos pronosticadas resaltado regiones de secuencia variable, flanqueada por los altamente conservadas de uni&#xF3;n de cobre-dominios que caracterizan a los miembros de esta familia de enzimas. Todas las prote&#xED;nas predichas conten&#xED;a secuencias aparentes de se&#xF1;al. La expresi&#xF3;n de 13 de los 17 genes OCMl en A. thaliana se evalu&#xF3; en diferentes tejidos en diversas etapas de desarrollo utilizando la RT-PCR. Una diversidad de patrones de expresi&#xF3;n se ha demostrado con algunos genes se expresan de manera constitutiva, mientras que otros se expresaron s&#xF3;lo en tejidos espec&#xED;ficos en una determinada fase de desarrollo. S&#xF3;lo unos pocos de los genes OCMl se expresaron en un patr&#xF3;n que puede considerarse coherente con un papel importante para estas enzimas en la deposici&#xF3;n de lignina. Estos resultados se discuten en el contexto de otras posibles funciones fisiol&#xF3;gicas para LMCOs vegetales, tales como el metabolismo del hierro y la cicatrizaci&#xF3;n de la herida.

La estructura del gen y el an&#xE1;lisis molecular de la Familia multicobre lacasa-oxidasa, como Gene (OCMl) en Arabidopsis thaliana

&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x5357;&#x82A5;&#x6839;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x54CD;&#x5E94;&#x7684;&#x5F39;&#x836F;&#xFF0C;hexahydro-1,3,5-&#x4E09;&#x785D;&#x57FA;&#x4E09;-1,3,5-&#x55EA; (RDX) &#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x8BC4;&#x4F30;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E32;&#x884C;&#x5206;&#x6790;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE; (SAGE)&#x3002;SAGE &#x56FE;&#x4E66;&#x9986;&#x4ECE;&#x63A7;&#x5236;&#x548C; RDX &#x66B4;&#x9732;&#x6839;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7684;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x63ED;&#x793A;&#x5DF2;&#x77E5;&#x54CD;&#x5E94;&#x7684;&#x4E00;&#x822C;&#x5F3A;&#x8C03;&#x5404;&#x79CD;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x3002;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x57FA;&#x56E0;&#x5F53;&#x4E2D;&#x51E0;&#x4E2A;&#x7F16;&#x7801;&#x5206;&#x5B50;&#x4F34;&#x4FA3;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x4EE5;&#x53CA;&#x6DB2;&#x6CE1;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x8FC7;&#x6C27;&#x5316;&#x7269;&#x9176;&#x3002;&#x5F3A;&#x70C8;&#x538B;&#x6291;&#x7684;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x5305;&#x62EC;&#x90A3;&#x4E9B;&#x7F16;&#x7801;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x86CB;&#x767D;&#x3001; &#x4EB2;&#x3001; katanin &#x548C;&#x8FC7;&#x6C27;&#x5316;&#x7269;&#x9176;&#x3002;&#x5BF9;&#x524D;&#x9762;&#x6240;&#x8FF0;&#x7684;&#x4E09;&#x785D;&#x57FA;&#x7532;&#x82EF; (TNT) &#x4F5C;&#x4E1A;&#x7684;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x6839;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x7684; RDX &#x53CD;&#x5E94;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x8868;&#x660E;&#x7684;&#x63A8;&#x65AD;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6A21;&#x5F0F;&#x7684;&#x91CD;&#x5927;&#x5DEE;&#x5F02;&#x3002;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x96C7;&#x7528;&#x5927;&#x5927;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x5E94;&#x4ED8;&#x8FD9;&#x4E24;&#x79CD;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3002;&#x5173;&#x4E8E;&#x5DE5;&#x7A0B;&#x5382;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x5BB9;&#x5FCD;&#x548C;&#x964D;&#x4F4E;&#x7206;&#x70B8;&#x7269;&#x53D7;&#x6C61;&#x67D3;&#x573A;&#x5740;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;&#x52A0;&#x5F3A;&#x7684;&#x4E0D;&#x540C;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x4EE3;&#x8C22;&#x9014;&#x5F84;&#x53EF;&#x80FD;&#x9700;&#x8981;&#x6709;&#x6548;&#x5730;&#x5904;&#x7406;&#x6BCF;&#x79CD;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x7206;&#x70B8;&#x7269;&#x3002;&#x8FD9;&#x4EE5;&#x6765;&#x5F71;&#x54CD;&#x690D;&#x7269;&#x4FEE;&#x590D;&#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x52AA;&#x529B;&#xFF0C;&#x8BB8;&#x591A;&#x6C61;&#x67D3;&#x7684;&#x573A;&#x5730;&#x6E2F;&#x6E7E;&#x8FD9;&#x4E24;&#x79CD;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3002;

&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x5357;&#x82A5;&#x5E7C;&#x82D7;&#x6839;&#x7CFB;&#x63A5;&#x89E6;&#x5230;&#x5F39;&#x836F; hexahydro-1,3,5-&#x4E09;&#x785D;&#x57FA;&#x4E09;-1,3,5-&#x55EA;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;

Arabidopsis thaliana root transcriptome responses to the munition, hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine (RDX), were assessed using serial analysis of gene expression (SAGE). Sequencing of SAGE libraries from control and RDX-exposed root tissues revealed induction of genes known to respond to a variety of general stresses. Among the highly induced genes were several encoding molecular chaperones and transcription factors as well as vacuolar proteins and peroxidases. Strongly repressed transcripts included ones encoding ribosomal proteins, a cyclophilin, a katanin, and a peroxidase. Comparison of the transcriptional profile for the RDX response to a profile previously described for Arabidopsis roots exposed to trinitrotoluene (TNT) revealed significant differences in the inferred gene expression patterns. This suggests that Arabidopsis employs drastically different mechanisms for coping with these two compounds. With respect to the goal of engineering plants to better tolerate and degrade explosives at contaminated sites, these results suggest that enhancement of different genes and metabolic pathways may be required to deal effectively with each type of explosive. This has ramifications for phytoremediation efforts since many contaminated sites harbor both compounds.

Gene expression changes in Arabidopsis thaliana seedling roots exposed to the munition hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine.

Arabidopsis thaliana r&#xE9;ponses profondes du transcriptome &#xE0; la munition, hexahydro-1 ,3,5-trinitro-1 ,3,5-triazine (RDX), ont &#xE9;t&#xE9; &#xE9;valu&#xE9;s en utilisant l&#x26;#39;analyse en s&#xE9;rie de l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique (SAGE). Le s&#xE9;quen&#xE7;age de banques SAGE du contr&#xF4;le et de RDX-expos&#xE9;e tissus racinaires a r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; l&#x26;#39;induction de g&#xE8;nes connus pour r&#xE9;pondre &#xE0; une vari&#xE9;t&#xE9; de stress g&#xE9;n&#xE9;ral. Parmi les g&#xE8;nes fortement induits &#xE9;taient chaperons mol&#xE9;culaires et d&#x26;#39;encodage de plusieurs facteurs de transcription ainsi que des prot&#xE9;ines vacuolaires et les peroxydases. Transcriptions fortement r&#xE9;prim&#xE9;e inclus ceux codant pour des prot&#xE9;ines ribosomiques, une cyclophiline, une katanin, et une peroxydase. Comparaison du profil transcriptionnel de la r&#xE9;ponse RDX &#xE0; un profil d&#xE9;crit pr&#xE9;c&#xE9;demment pour les racines d&#x26;#39;Arabidopsis expos&#xE9;s &#xE0; de trinitrotolu&#xE8;ne (TNT) a r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; des diff&#xE9;rences significatives dans les mod&#xE8;les d&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes inf&#xE9;r&#xE9;es. Ceci sugg&#xE8;re que Arabidopsis emploie radicalement diff&#xE9;rents m&#xE9;canismes pour faire face &#xE0; ces deux compos&#xE9;s. En ce qui concerne l&#x26;#39;objectif de plantes d&#x26;#39;ing&#xE9;nierie afin de mieux tol&#xE9;rer et de d&#xE9;grader les explosifs dans les lieux contamin&#xE9;s, ces r&#xE9;sultats sugg&#xE8;rent que l&#x26;#39;am&#xE9;lioration de diff&#xE9;rents g&#xE8;nes et les voies m&#xE9;taboliques peuvent &#xEA;tre n&#xE9;cessaires pour traiter efficacement avec chaque type d&#x26;#39;explosif. Ceci a des ramifications pour les efforts de phytorem&#xE9;diation depuis de nombreux sites pollu&#xE9;s abritent les deux compos&#xE9;s.

Changements d&#x26;#39;expression g&#xE9;n&#xE9;tique chez Arabidopsis Thaliana racines des plantules expos&#xE9;s &#xE0; la munition hexahydro-1 ,3,5-trinitro-1 ,3,5-triazine

Arabidopsis Thaliana Stamm Transkriptom Antworten zu der Munition, Hexahydro-1,3,5-Trinitro-1,3,5-triazin (RDX), wurden anhand der serielle Analyse der Genexpression (SAGE) gepr&uuml;ft. Sequenzierung der Salbei Bibliotheken aus Kontrolle und Wurzel RDX-exponierten Geweben offenbart Induktion von Genen, die bekannterma&szlig;en zu einer Vielzahl von allgemeinen Belastungen zu reagieren. Unter den hoch induzierten Genen wurden mehrere Codierung Molekulare Chaperone und Transkriptionsfaktoren und welches Proteine sowie Peroxidasen. Stark unterdr&uuml;ckte Abschriften enthalten solche Kodierung ribosomal Proteine, ein Cyclophilin, eine Katanin und eine Peroxydase. Vergleich des transkriptionelle Profils f&uuml;r die RDX-Antwort auf ein Profil, die zuvor beschrieben f&uuml;r Arabidopsis Wurzeln ausgesetzt Trinitrotoluol (TNT) ergab signifikante Unterschiede in der hergeleiteten Genausdruck Muster. Dies l&auml;sst vermuten, dass Arabidopsis drastisch unterschiedliche Mechanismen zur Bew&auml;ltigung dieser beiden Verbindungen besch&auml;ftigt. Im Hinblick auf das Ziel der technischen Anlagen um besser tolerieren und Sprengstoffen bei Altlasten beeintr&auml;chtigen, diese Ergebnisse legen nahe, dass die Verbesserung von verschiedenen Genen und Stoffwechselwege erforderlich, wirksam gegen jede Art von Sprengstoff vorzugehen sein. Dies hat Auswirkungen f&uuml;r Phytosanierung Bem&uuml;hungen, da viele Altlasten beider Verbindungen Hafen.

Gen Ausdruck &Auml;nderungen in Arabidopsis Thaliana S&auml;mling Wurzeln, die Munition Hexahydro-1,3,5-Trinitro-1,3,5-triazin ausgesetzt.

Arabidopsis thaliana radice transcriptome responses to il munition, esaidro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazina (RDX), sono stati valutati utilizzando serial analysis of gene expression (SAGE). Sequenziamento di salvia librerie da controllo e nei tessuti esposti RDX radice ha rivelato induzione dei geni noti per rispondere a una serie di stress generale. Tra i geni altamente indotti erano diversi codifica chaperoni molecolari e fattori di trascrizione come proteine vacuolare e perossidasi. Fortemente represse trascrizioni includevano quelle codifica proteine ribosomiali, un cyclophilin, un katanin e una perossidasi. Confronto del profilo trascrizionale per la risposta RDX a un profilo precedentemente descritto per le radici di Arabidopsis esposte di trinitrotoluene (TNT) ha rivelato differenze significative nei modelli di espressione genica inferito. Questo suggerisce che Arabidopsis impiega drasticamente differenti meccanismi per far fronte a questi due composti. Per quanto riguarda l&#39;obiettivo di ingegneria impianti per meglio tollerare e degradare gli esplosivi in siti contaminati, questi risultati suggeriscono che valorizzazione di diversi geni e vie metaboliche possono essere richiesti di affrontare efficacemente ogni tipo di esplosivo. Questo ha ramificazioni per la phytoremediation sforzi poich&eacute; molti siti contaminati porto entrambi i composti.

Cambiamenti di espressione genica in Arabidopsis thaliana semenzale radici esposte a munition esaidro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazina.

&#x8ECD;&#x9700;&#x54C1;&#x3001;&#x30D8;&#x30AD;&#x30B5;&#x30D2;&#x30C9;&#x30ED;-1,3,5  - &#x30C8;&#x30EA;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;-1,3,5  - &#x30C8;&#x30EA;&#x30A2;&#x30B8;&#x30F3;&#xFF08;RDX&#xFF09;&#x306B;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x9023;&#x7D9A;&#x5206;&#x6790;&#xFF08;SAGE&#xFF09;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;&#x304B;&#x3089;SAGE&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3068;RDX-&#x9732;&#x51FA;&#x6839;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x306F;&#x3001;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x3055;&#x307E;&#x3056;&#x307E;&#x306A;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306B;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x3046;&#x3061;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x30B7;&#x30E3;&#x30DA;&#x30ED;&#x30F3;&#x3084;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x306A;&#x3069;&#x6DB2;&#x80DE;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x53CA;&#x3073;&#x30DA;&#x30EB;&#x30AA;&#x30AD;&#x30B7;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x5F37;&#x304F;&#x6291;&#x5727;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x8EE2;&#x5199;&#x7269;&#x306F;&#x3001;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3001;&#x30B7;&#x30AF;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EA;&#x30F3;&#x3001;katanin&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DA;&#x30EB;&#x30AA;&#x30AD;&#x30B7;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x3082;&#x306E;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4EE5;&#x524D;&#x306F;&#x30C8;&#x30EA;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30C8;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#xFF08;TNT&#xFF09;&#x306B;&#x3055;&#x3089;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x3067;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x306B;RDX&#x5FDC;&#x7B54;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x63A8;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x5DEE;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x3001;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x4E8C;&#x3064;&#x306E;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306B;&#x5BFE;&#x51E6;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x63A1;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x826F;&#x3044;&#x8010;&#x3048;&#x3001;&#x6C5A;&#x67D3;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3067;&#x7206;&#x767A;&#x7269;&#x3092;&#x5206;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B8;&#x30CB;&#x30A2;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x76EE;&#x6A19;&#x306B;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3084;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x5897;&#x5F37;&#x304C;&#x7206;&#x767A;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x306E;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x306B;&#x52B9;&#x679C;&#x7684;&#x306B;&#x5BFE;&#x51E6;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x6C5A;&#x67D3;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x306F;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3092;&#x62B1;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x306E;&#x3067;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30C8;&#x30EC;&#x30E1;&#x30C7;&#x30A3;&#x30A8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3078;&#x306E;&#x53D6;&#x308A;&#x7D44;&#x307F;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x5B9F;&#x751F;&#x306E;&#x6839;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x8ECD;&#x9700;&#x54C1;&#x30D8;&#x30AD;&#x30B5;&#x30D2;&#x30C9;&#x30ED;-1,3,5  - &#x30C8;&#x30EA;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;-1,3,5  - &#x30C8;&#x30EA;&#x30A2;&#x30B8;&#x30F3;&#x306B;&#x9732;&#x51FA;

Arabidopsis thaliana &#xB8E8;&#xD2B8; transcriptome &#xC751;&#xB2F5; &#xAD70;&#xC218;&#xD488;, hexahydro-1.3.5-trinitro-1.3.5-triazine (RDX)&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; (&#xC138;&#xC774; &#xC9C0;)&#xC758; &#xC9C1;&#xB82C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD3C9;&#xAC00; &#xB410;&#xB2E4;. &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xC81C;&#xC5B4;&#xC640; RDX &#xB178;&#xCD9C; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC138;&#xC774; &#xC9C0; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC758; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xBC18;&#xC751;&#xC73C;&#xB85C; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC720;&#xB3C4;&#xB97C; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB192;&#xC740; &#xC720;&#xBC1C;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xBD84;&#xC790; &#xBCF4;&#xD638;&#xC790; &#xBC0F; &#xB179;&#xC74C; &#xBC29;&#xC1A1; &#xC694;&#xC778;&#xC73C;&#xB85C; vacuolar &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC0F; peroxidases &#xD588;&#xB2E4;. &#xAC15;&#xB825; &#xD558; &#xAC8C; &#xC5B5;&#xC555; &#xB41C; &#xC131;&#xC801; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; ribosomal &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xB294; cyclophilin, katanin, &#xBC0F;&#xB294; &#xACFC;&#xC0B0;&#xD654; &#xD6A8;&#xC18C; &#xB4E4;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568;. RDX &#xC751;&#xB2F5; Arabidopsis &#xBFCC;&#xB9AC; &#xD1A8;&#xB8E8;&#xC5D4; (TNT)&#xC5D0; &#xB178;&#xCD9C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC124;&#xBA85; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; transcriptional &#xD504;&#xB85C;&#xD544;&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; &#xC720;&#xCD94; &#xC9C4; &#xC2DD; &#xD328;&#xD134;&#xC5D0; &#xD070; &#xCC28;&#xC774;&#xAC00; &#xBC1D;&#xD600;. &#xC774; Arabidopsis &#xB300;&#xCC98; &#xC774;&#xB4E4; &#xB450; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xCCA0;&#xC800; &#xD558; &#xAC8C; &#xB2E4;&#xB978; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC81C;&#xC548; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBCF4;&#xB2E4; &#xC798; &#xC6A9;&#xB0A9; &#xD558; &#xACE0; &#xC624;&#xC5FC; &#xB41C; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD3ED;&#xBC1C;&#xBB3C; &#xC800;&#xD558; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xACF5;&#xD559;&#xC758; &#xBAA9;&#xD45C;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACB0;&#xACFC; &#xC81C;&#xC548; &#xADF8; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xB2E4;&#xB978; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBCC0;&#xD654; &#xD1B5;&#xB85C; &#xD3ED; &#xC57D;&#xC758; &#xAC01; &#xC720;&#xD615;&#xC5D0; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xCC98;&#xB9AC; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xB9CE;&#xC740; &#xC624;&#xC5FC; &#xB41C; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xD56D;&#xAD6C;&#xC758; &#xB450; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; phytoremediation &#xB178;&#xB825;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD30C;&#xAE09; &#xD6A8;&#xACFC;.

&#xC9C4; &#xC2DD; &#xBCC0;&#xD654; Arabidopsis thaliana &#xBAA8; &#xC885; &#xBFCC;&#xB9AC;&#xB294; &#xAD70;&#xC218;&#xD488; hexahydro-1.3.5-trinitro-1.3.5-triazine&#xC5D0; &#xB178;&#xCD9C;.

Arabidopsis thaliana respuestas transcriptoma de ra&#xED;z a la munici&#xF3;n, hexahidro-1 ,3,5-trinitro-1 ,3,5-triazina (RDX), se evaluaron mediante an&#xE1;lisis serial de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica (SAGE). La secuenciaci&#xF3;n de SAGE bibliotecas de control y RDX expuesto-tejidos de la ra&#xED;z revel&#xF3; la inducci&#xF3;n de los genes conocidos para responder a una variedad de tensiones generales. Entre los genes altamente inducidos eran acompa&#xF1;antes varios codificaci&#xF3;n moleculares y los factores de transcripci&#xF3;n, as&#xED; como prote&#xED;nas vacuolar y peroxidasas. Transcripciones fuertemente reprimidas incluyen los que codifican las prote&#xED;nas ribosomales, ciclofilina A, katanin uno, y una peroxidasa. Comparaci&#xF3;n del perfil transcripcional para la respuesta RDX a un perfil previamente descrito para las ra&#xED;ces de Arabidopsis expuestos a trinitrotolueno (TNT) revel&#xF3; diferencias significativas en los patrones de expresi&#xF3;n de genes inferidos. Esto sugiere que la Arabidopsis dr&#xE1;sticamente emplea diferentes mecanismos para hacer frente a estos dos compuestos. Con respecto a la meta de las plantas para tolerar mejor y se degradan explosivos en sitios contaminados, estos resultados sugieren que la mejora de diferentes genes y las v&#xED;as metab&#xF3;licas puede ser necesaria para tratar efectivamente con cada tipo de explosivo. Esto tiene implicaciones para los esfuerzos de fitorremediaci&#xF3;n, ya que muchos sitios contaminados albergar ambos compuestos.

Cambios de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica en Arabidopsis thaliana ra&#xED;ces de las pl&#xE1;ntulas expuestas a la munici&#xF3;n hexahidro-1 ,3,5-trinitro-1 ,3,5-triazina

&#x5E72;&#x65F1;&#x80C1;&#x8FEB;&#x662F;&#x5E7C;&#x82D7;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x5728;&#x7F8E;&#x56FD;&#x4E1C;&#x5357;&#x90E8;&#x7684;&#x677E;&#x6811;&#x6797;&#x548C;&#x8BB8;&#x591A;&#x5176;&#x4ED6;&#x7684;&#x68EE;&#x6797;&#x5730;&#x533A;&#xFF0C;&#x5728;&#x5168;&#x7403;&#x8303;&#x56F4;&#x5185;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x539F;&#x56E0;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x66F4;&#x5927;&#x7684;&#x52AA;&#x529B;&#x6765;&#x53D1;&#x73B0;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x4E00;&#x90E8;&#x5206;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x53D7;&#x5230;&#x751F;&#x6839;&#x5230;&#x4E09;&#x65E0;&#x5173;&#x7684;&#x677E;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x5BF9;&#x6D47;&#x6C34;&#x7684;&#x4E09;&#x4E2A;&#x7597;&#x7A0B;&#x3002;&#x4ECE;&#x4ECE;&#x6839;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x751F;&#x6210;&#x7684; 12,918 &#x968F;&#x673A;&#x9009;&#x62E9;&#x6269;&#x589E; 3&#39; &#x548C; 5&#39; &#x7AEF;&#x83B7;&#x5F97;&#x4E86;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x7B7E; (&#x65E0;&#x5BB3;&#x73AF;&#x5883;&#x6280;&#x672F;)&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x65E0;&#x5BB3;&#x73AF;&#x5883;&#x6280;&#x672F;&#x90FD;&#x805A;&#x96C6;&#x6765;&#x6807;&#x8BC6; 6,765 &#x72EC;&#x7279;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355; (UniScripts) &#x6765;&#x81EA; 6,202 &#x5047;&#x5B9A;&#x72EC;&#x7279;&#x57FA;&#x56E0; (UniGenes S)&#x3002;&#x6682;&#x5B9A;&#x6CE8;&#x91CA;&#x88AB;&#x5206;&#x914D;&#x5230;&#x86CB;&#x767D;&#x975E;&#x5197;&#x4F59;&#x53C2;&#x8003;&#x4FE1;&#x606F;&#x8D44;&#x6E90; &#xFF08;PIR-NREF) &#x6570;&#x636E;&#x5E93; BLASTX &#x6BD4;&#x8F83;&#x7684;&#x57FA;&#x7840;&#x4E0A;&#x3002;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684; 42 UniScripts &#x5177;&#x6709;&#x9AD8;&#x7684;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x610F;&#x4E49;&#xFF0C;&#x5728;&#x6CBB;&#x7597;&#x65B9;&#x9762;&#x5404;&#x4E0D;&#x76F8;&#x540C;&#x3002;&#x5176;&#x4E2D;&#x8BB8;&#x591A;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x8BC1;&#x660E;&#x662F;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x5728;&#x5176;&#x4ED6;&#x7269;&#x79CD;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x8131;&#x6C34;&#x3001; endochitinases&#x3001; &#x7EC6;&#x80DE;&#x8272;&#x7D20; p450 &#x6C27;&#x5316;&#x9176;&#x3001; &#x75C5;&#x7A0B;&#x76F8;&#x5173;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x5404;&#x79CD;&#x540E;&#x671F;&#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x751F;&#x4E30;&#x5BCC; (LEA) &#x57FA;&#x56E0;&#x4EA7;&#x54C1;&#x7684;&#x8010;&#x65F1;&#x6027;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4EA7;&#x54C1;&#x3002;&#x540C;&#x6837;&#xFF0C;110 UniScripts &#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x4E0E;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#xFF0C;&#x8868;&#x660E;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E00;&#x7269;&#x79CD;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x6BD4;&#x6CBB;&#x7597;&#x66F4;&#x591A;&#x4F9D;&#x8D56;&#x9AD8;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x610F;&#x4E49;&#x5404;&#x4E0D;&#x76F8;&#x540C;&#x3002;&#x5927;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x6C34;&#x5E94;&#x6FC0;&#x677E;&#x4F3C;&#x4E4E;&#x7F16;&#x7801;&#x4EA7;&#x54C1;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x4E8E;&#x5E72;&#x65F1;&#x516C;&#x5DEE;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x5176;&#x4ED6;&#x7269;&#x79CD;&#x7684; UniScripts &#x6700;&#x9AD8;&#x88AB;&#x5F15;&#x8BF1;&#x5728;&#x5355;&#x4E00;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#xFF0C;&#x6697;&#x793A;&#x6297;&#x65F1;&#x7279;&#x522B;&#x6709;&#x7528;&#x81EA;&#x9002;&#x5E94;&#x7684;&#x7B49;&#x4F4D;&#x57FA;&#x56E0;&#x53EF;&#x80FD;&#x5B58;&#x5728;&#x7684;&#x6269;&#x589E;&#x4ECE;&#x8FD9;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x5728;&#x96C6;&#x5408;&#x4E2D;&#x3002;&#x6316;&#x6398;&#x548C;&#x53EF;&#x89C6;&#x5316;&#x5B8C;&#x6574;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x4E0B;&#x8F7D;&#x7684; EST &#x548C; UniScript contig &#x5E8F;&#x5217;&#xFF0C;&#x6709;&#x53EF;&#x80FD;&#x5728; http://fungen.org/genediscovery/ &#x4F7F;&#x7528;&#x9B54;&#x6CD5;&#x57FA;&#x56E0;&#x53D1;&#x73B0;&#x3002;

&#x6C34;&#x5E94;&#x6FC0;&#x53CD;&#x5E94;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x7B7E;&#x5E93;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x7531;&#x6807;&#x8BC6;&#x7684;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E;) &#x6839;&#x7684;&#x3002;

Drought stress is the principal cause of seedling mortality in pine forests of the southeastern United States and in many other forested regions around the globe. As part of a larger effort to discover loblolly pine genes, this study subjected rooted cuttings of three unrelated pine genotypes to three watering regimens. Expressed sequence tags (ESTs) were obtained from both the 3' and 5' ends of 12,918 randomly selected cDNAs generated from root tissues. These ESTs were clustered to identify 6,765 unique transcripts (UniScripts) derived from 6,202 putative unique genes (UniGenes-S). Tentative annotations were assigned on the basis of BLASTX comparisons to the Protein Information Resource Nonredundant Reference (PIR-NREF) database. Expression levels of 42 UniScripts varied with high statistical significance with respect to treatment. Many of them resembled gene products shown to be important for drought tolerance in other species, including dehydrins, endochitinases, cytochrome P450 enzymes, pathogenesis-related proteins and various late-embryogenesis abundant (LEA) gene products. Similarly, expression levels of 110 UniScripts varied with high statistical significance among genotypes, indicating that gene expression patterns in this species are much more dependent on genotype than on treatment. Most of the water stress-induced pine UniScripts that appeared to encode products resembling drought tolerance factors in other species were most highly induced in a single genotype, suggesting that particularly useful adaptive alleles for drought tolerance might exist within the collection of cDNAs characterized from this genotype. Mining and visualizing the complete data set, as well as downloading of both EST and UniScript contig sequences, are possible using MAGIC Gene Discovery at http://fungen.org/genediscovery/.

Water stress-responsive genes in loblolly pine (Pinus taeda) roots identified by analyses of expressed sequence tag libraries.

Le stress hydrique est la principale cause de mortalit&#xE9; des semis dans les for&#xEA;ts de pins du sud-est des &#xC9;tats-Unis et dans beaucoup d&#x26;#39;autres r&#xE9;gions foresti&#xE8;res du monde entier. Dans le cadre d&#x26;#39;un vaste effort visant &#xE0; d&#xE9;couvrir les g&#xE8;nes de pins &#xE0; encens, cette &#xE9;tude soumis boutures racin&#xE9;es de trois g&#xE9;notypes de pin sans rapport avec trois sch&#xE9;mas d&#x26;#39;arrosage. &#xC9;tiquettes de s&#xE9;quences exprim&#xE9;es (EST) ont &#xE9;t&#xE9; obtenus &#xE0; la fois de la 3 &#x26;#39;et 5&#x26;#39; extr&#xE9;mit&#xE9;s de 12,918 ADNc choisis au hasard g&#xE9;n&#xE9;r&#xE9;s &#xE0; partir de tissus racinaires. Ces EST ont &#xE9;t&#xE9; regroup&#xE9;s afin d&#x26;#39;identifier 6,765 transcriptions uniques (UniScripts) provenant de 6,202 putatifs g&#xE8;nes uniques (unig&#xE8;nes-S). Annotations indicatives ont &#xE9;t&#xE9; attribu&#xE9;es sur la base de comparaisons BLASTX &#xE0; la Source de r&#xE9;f&#xE9;rence des prot&#xE9;ines de l&#x26;#39;information non redondant (PIR-NREF) base de donn&#xE9;es. Les niveaux d&#x26;#39;expression de 42 UniScripts vari&#xE9; avec une signification statistique &#xE9;lev&#xE9;e par rapport &#xE0; un traitement. Beaucoup d&#x26;#39;entre eux ressemblait &#xE0; des produits g&#xE9;niques r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9;es importante tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse dans d&#x26;#39;autres esp&#xE8;ces, y compris, les d&#xE9;hydrines endochitinases enzymes du cytochrome P450, li&#xE9;e &#xE0; la pathogen&#xE8;se des prot&#xE9;ines et divers en fin de l&#x26;#39;embryogen&#xE8;se abondantes produits g&#xE9;niques (LEA). De m&#xEA;me, les niveaux d&#x26;#39;expression de 110 UniScripts vari&#xE9; avec une signification statistique &#xE9;lev&#xE9; chez les g&#xE9;notypes, ce qui indique que l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes de cette esp&#xE8;ce sont beaucoup plus d&#xE9;pendants du g&#xE9;notype que sur le traitement. La plupart des UniScripts eau des pins induites par le stress qui semblaient codent pour des produits qui ressemblent &#xE0; des facteurs tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse dans d&#x26;#39;autres esp&#xE8;ces ont &#xE9;t&#xE9; les plus fortement induite dans un seul g&#xE9;notype, ce qui sugg&#xE8;re que particuli&#xE8;rement utiles all&#xE8;les adaptatifs pour tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse pourrait exister dans la collection d&#x26;#39;ADNc caract&#xE9;ris&#xE9;s &#xE0; partir de ce g&#xE9;notype . Mines et la visualisation de l&#x26;#39;ensemble complet des donn&#xE9;es, ainsi que le t&#xE9;l&#xE9;chargement &#xE0; la fois de l&#x26;#39;EST et UniScript s&#xE9;quences contigs, sont possibles en utilisant Gene Discovery MAGIC &#xE0; http://fungen.org/genediscovery/.

De stress hydrique g&#xE8;nes sensibles &#xE0; pin &#xE0; encens (Pinus taeda) Roots identifi&#xE9;s par des analyses de s&#xE9;quences exprim&#xE9;es biblioth&#xE8;ques de balises

Trockenstress ist die Hauptursache der S&auml;mling Sterblichkeit in Kiefernw&auml;lder der s&uuml;d&ouml;stlichen Vereinigten Staaten und in vielen anderen bewaldeten Regionen rund um den Globus. Als Teil einer gr&ouml;&szlig;eren Anstrengung Loblolly Pine Gene zu entdecken Wurzelreben von drei unabh&auml;ngigen Kiefer-Genotypen zu drei Tr&auml;nken Therapien dieser Studie unterzogen. Exprimierten Sequenz Markierungen (ESTs) stammen von die 3&#39; und 5&#39;-Enden der 12.918 zuf&auml;llig ausgew&auml;hlte cDNAs aus Stamm Gewebe generiert. Diese ESTs waren damals, um 6.765 einzigartige Transkripte (UniScripts) abgeleitet 6.202 vermeintliche eindeutigen Gene (UniGenes-S) zu identifizieren. Vorl&auml;ufige Anmerkungen wurden auf der Grundlage BLASTX Vergleiche der Protein Information Resource redundantes Reference (PIR-NREF)-Datenbank zugewiesen. Stufen von 42 UniScripts mit hohe statistische Signifikanz in Bezug auf Behandlung variiert. Viele von ihnen &auml;hnelte Genprodukte f&uuml;r Trockenheit sch&uuml;tzt andere Arten, einschlie&szlig;lich Dehydrins, Endochitinases, Zellfarbstoff P450 Enzyme, Pathogenese-&auml;hnliche Proteine und reichlich (LEA)-Genprodukte mit verschiedenen sp&auml;ten Embryogenese wichtig erwiesen. Ebenso vielf&auml;ltig Ausdruck Niveaus von 110 UniScripts mit hohe statistische Signifikanz zwischen den Genotypen, dass Genausdruck Muster in dieser Spezies Genotyp als Behandlung viel st&auml;rker abh&auml;ngig sind. Die meisten Wasser Stress-induced Kiefer UniScripts, die zum Codieren von Produkten wie D&uuml;rre Toleranz Faktoren bei anderen Arten erschienen waren h&ouml;chst induziert in einem einzigen Genotyp, darauf hindeutet, dass besonders n&uuml;tzlich adaptive Allele f&uuml;r Trockenheitstoleranz innerhalb der Auflistung von cDNAs gekennzeichnet von diesem Genotyp vorhanden sein k&ouml;nnen. Bergbau und Visualisierung das Daten-Komplettset, sowie Download der EST und UniScript Contig-Sequenzen, sind m&ouml;glich &uuml;ber MAGIC Gene Discovery am http://fungen.org/genediscovery/.

Wasser Druck-responsive Gene in Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda) Wurzeln durch Analysen der exprimierten Sequenz-Tag-Bibliotheken identifiziert.

Siccit&agrave; lo stress &egrave; la principale causa di mortalit&agrave; semenzale in pinete di Stati Uniti sudorientali e in molte altre regioni boscose intorno al globo. Come parte di un pi&ugrave; ampio sforzo per scoprire geni loblolly pine, questo studio sottoposto barbatelle franche di tre genotipi di pino non correlate a tre regimi d&#39;innaffiatura. Expressed sequence tags (ESTs) sono stati ottenuti da entrambi il 3&#39; e 5&#39; estremit&agrave; di 12.918 cDNAs selezionato casualmente generati dai tessuti della radice. Questi ESTs erano raggruppati per identificare 6.765 trascrizioni uniche (UniScripts) derivate da 6.202 putativi geni unici (UniGenes-S). Annotazioni provvisorie sono state assegnate sulla base di confronti BLASTX al database di proteine informazioni risorsa Nonredundant riferimento (NREF-PIR). I livelli di espressione di 42 UniScripts vario con elevata significativit&agrave; statistica rispetto al trattamento. Molti di loro somigliava a prodotti del gene indicati per essere importante per la tolleranza alla siccit&agrave; in altre specie, tra cui dehydrins, endochitinases, gli enzimi del citocromo P450, proteine correlate a patogenesi e vari tardo-embriogenesi abbondanti (LEA) prodotti del gene. Allo stesso modo, i livelli di espressione di 110 UniScripts vario con elevata significativit&agrave; statistica tra genotipi, che indica che il pattern di espressione genica in questa specie sono molto pi&ugrave; dipendente dal genotipo rispetto sul trattamento. La maggior parte del pino stress-induced acqua UniScripts che &egrave; apparso per la codifica dei prodotti simile a fattori di tolleranza alla siccit&agrave; in altre specie pi&ugrave; altamente sono stati indotti in un unico genotipo, suggerendo che gli alleli adattivi particolarmente utili per la tolleranza alla siccit&agrave; potrebbero esistere all&#39;interno dell&#39;insieme dei cDNAs caratterizzata da questo genotipo. Data mining e visualizzare il set di dati completo, cos&igrave; come download di sequenze contig sia EST e UniScript, sono possibili utilizzando MAGIC Gene Discovery a http://fungen.org/genediscovery/.

L&#39;acqua lo stress-responsive geni nelle radici loblolly pine (Pinus taeda) identificate da analisi di librerie di tag expressed sequence.

&#x4E7E;&#x71E5;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x7C73;&#x56FD;&#x5357;&#x6771;&#x90E8;&#x306E;&#x677E;&#x6797;&#x3067;&#x3001;&#x4E16;&#x754C;&#x4E2D;&#x306E;&#x4ED6;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x68EE;&#x6797;&#x5730;&#x57DF;&#x3067;&#x306E;&#x5B9F;&#x751F;&#x306E;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x539F;&#x56E0;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x52AA;&#x529B;&#x306E;&#x4E00;&#x74B0;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;3&#x6563;&#x6C34;&#x30EC;&#x30B8;&#x30E1;&#x30F3;&#x306B;3&#x3064;&#x306E;&#x7121;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306A;&#x677E;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x306E;&#x633F;&#x3057;&#x6728;&#x3092;&#x884C;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x767A;&#x73FE;&#x914D;&#x5217;&#x30BF;&#x30B0;&#xFF08;EST&#xFF09;&#x306F;&#x6839;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x304B;&#x3089;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x305F;12918&#x30E9;&#x30F3;&#x30C0;&#x30E0;&#x306B;&#x9078;&#x629E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;cDNA&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;3 &#x26;#39;&#x304A;&#x3088;&#x3073;5&#x26;#39;&#x672B;&#x7AEF;&#x304B;&#x3089;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;EST&#x306F;6202&#x306E;&#x63A8;&#x5B9A;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#xFF08;UniGenes-S&#xFF09;&#x304B;&#x3089;&#x6D3E;&#x751F;&#x3057;&#x305F;6765&#x306E;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#xFF08;UniScripts&#xFF09;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x66AB;&#x5B9A;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30CE;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x60C5;&#x5831;&#x30EA;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x975E;&#x5197;&#x9577;&#x30EA;&#x30D5;&#x30A1;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B9;&#xFF08;PIR-NREF&#xFF09;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x3078;&#x306E;BLASTX&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; 42 UniScripts&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x6CBB;&#x7642;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x3066;&#x9AD8;&#x3044;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x306B;&#x5909;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306F;dehydrins&#x3001;endochitinases&#x3001;&#x30C1;&#x30C8;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30E0;P450&#x9175;&#x7D20;&#x3001;&#x75C5;&#x56E0;&#x95A2;&#x9023;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3084;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x5F8C;&#x671F;&#x80DA;&#x767A;&#x751F;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#xFF08;LEA&#xFF09;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7523;&#x7269;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x4ED6;&#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x4E7E;&#x71E5;&#x8010;&#x6027;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7523;&#x7269;&#x306B;&#x4F3C;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3001;110 UniScripts&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x304C;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x6CBB;&#x7642;&#x306B;&#x6BD4;&#x3079;&#x3066;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x9AD8;&#x3044;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x306B;&#x5909;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4ED6;&#x306E;&#x7A2E;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8010;&#x4E7E;&#x6027;&#x56E0;&#x5B50;&#x306B;&#x4F3C;&#x305F;&#x88FD;&#x54C1;&#x3092;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x73FE;&#x308C;&#x305F;&#x6C34;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x8A98;&#x5C0E;&#x677E;UniScripts&#x306E;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x3082;&#x9AD8;&#x3044;&#x8010;&#x4E7E;&#x6027;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x7279;&#x306B;&#x6709;&#x7528;&#x306A;&#x9069;&#x5FDC;&#x306E;&#x5BFE;&#x7ACB;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x304B;&#x3089;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x308B;cDNA&#x306E;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x5185;&#x306B;&#x5B58;&#x5728;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306B;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x9271;&#x696D;&#x3001;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x53EF;&#x8996;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3068;&#x3082;&#x306B;&#x3001;EST&#x3068;UniScript&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30B0;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C9;&#x306F;&#x3001;http://fungen.org/genediscovery/&#x3067;MAGIC&#x30B8;&#x30FC;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30B9;&#x30AB;&#x30D0;&#x30EA;&#x30FC;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x767A;&#x73FE;&#x914D;&#x5217;&#x30BF;&#x30B0;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF09;&#x6839;&#x306E;&#x6C34;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6027;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;

&#xAC00;&#xBB44; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xBBF8;&#xAD6D; &#xB0A8;&#xB3D9;&#xBD80;&#xC758; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; &#xC232;&#xACFC; &#xC138;&#xACC4;&#xC758; &#xB2E4;&#xB978; &#xB9CE;&#xC740; &#xC232;&#xC774; &#xC6B0;&#xAC70;&#xC9C4;&#xB41C; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xBAA8; &#xC885; &#xC0AC;&#xB9DD;&#xB960;&#xC758; &#xC8FC; &#xC6D0;&#xC778;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD070; &#xB178;&#xB825;&#xC744;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC758; &#xC77C;&#xD658;&#xC73C;&#xB85C;,&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xB300;&#xC0C1;&#xC774; 3 &#xAE09;&#xC218; regimens &#xC138; &#xBB34;&#xAD00;&#xB41C; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; genotypes &#xC798;&#xB77C; &#xBFCC;&#xB9AC;. &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD0DC;&#xADF8; (ESTs) &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0DD;&#xC131; &#xB41C; 12,918 &#xBB34;&#xC791;&#xC704;&#xB85C; &#xC120;&#xD0DD; &#xB41C; Cdnas&#xC758; 3&#39;&#xC640; 5&#39; &#xB05D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5BB;&#xC740; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; ESTs &#xC2DD;&#xBCC4; &#xACE0;&#xC720; &#xC131;&#xC801;&#xD45C; (UniScripts) 6,202 &#xC0C1; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; (UniGenes S)&#xC5D0;&#xC11C; &#xD30C;&#xC0DD; &#xB41C; 6,765 &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBBF8;&#xC815; &#xC8FC;&#xC11D; BLASTX &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC815;&#xBCF4; &#xB9AC;&#xC18C;&#xC2A4; &#xBE44;&#xC911;&#xBCF5; &#xCC38;&#xC870; (PIR NREF) &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xBCA0;&#xC774;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBE44;&#xAD50;&#xB97C; &#xBC14;&#xD0D5;&#xC73C;&#xB85C; &#xC9C0;&#xC815; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. 42 &#xC2DD; &#xC218;&#xC900;&#xC758; UniScripts &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xB192;&#xC740; &#xD1B5;&#xACC4;&#xC801; &#xC758;&#xBBF8;&#xC640; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C;. &#xADF8;&#xB4E4; &#xC911; &#xB9CE;&#xC740; &#xB2EE;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC81C;&#xD488; dehydrins, endochitinases, &#xC2DC; &#xD1A0; &#xD06C;&#xB86C; P450 &#xD6A8;&#xC18C;, &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; pathogenesis &#xAD00;&#xB828; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xB2A6;&#xC740; embryogenesis &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; (&#xB808; &#xC544;) &#xC9C4; &#xC81C;&#xD488; &#xB4F1; &#xB2E4;&#xB978; &#xC885;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC00;&#xBB44; &#xB0B4;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xD45C;&#xC2DC;. &#xB9C8;&#xCC2C;&#xAC00;&#xC9C0;&#xB85C;, &#xC2DD; &#xC218;&#xC900;&#xC758; 110 UniScripts genotypes,&#xC774; &#xC885; &#xC9C4; &#xC2DD; &#xD328;&#xD134;&#xC740; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD615;&#xC5D0; &#xD6E8;&#xC52C; &#xB354; &#xC758;&#xC874;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xB192;&#xC740; &#xD1B5;&#xACC4;&#xC801; &#xC758;&#xBBF8;&#xC640; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C;. &#xBB3C; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xC720;&#xBC1C; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; &#xAC00;&#xBB44; &#xD5C8;&#xC6A9; &#xC624;&#xCC28; &#xC694;&#xC778; &#xB2E4;&#xB978; &#xC885;&#xC871;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC744; &#xB2EE;&#xC740; &#xC81C;&#xD488;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB09C; Uniscripts&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC740; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB192;&#xC740; &#xAC00;&#xBB44; &#xD5C8;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xD2B9;&#xD788; &#xC720;&#xC6A9; &#xC801;&#xC751;&#xD615; &#xB300;&#xB9BD;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD615; &#xD2B9;&#xC9D5; cDNAs &#xCEEC;&#xB809;&#xC158; &#xB0B4; &#xC788;&#xC744; &#xC81C;&#xC548; &#xB2E8;&#xC77C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD615;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xB3C4; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD; &#xBC0F; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC9D1;&#xD569;&#xC744; &#xC2DC;&#xAC01;&#xD654;&#xB85C; EST&#xC640; UniScript contig &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; &#xB2E4;&#xC6B4;&#xB85C;&#xB4DC; &#xB9E4;&#xC9C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC80;&#xC0C9;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; http://fungen.org/genediscovery/&#xC5D0; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xBC18;&#xC751; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD0DC;&#xADF8; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC758; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda) &#xBFCC;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xBB3C;.

El estr&#xE9;s h&#xED;drico es la principal causa de mortalidad de pl&#xE1;ntulas en los bosques de pinos en el sureste de los Estados Unidos y en muchas otras regiones forestales de todo el mundo. Como parte de un esfuerzo mayor para descubrir los genes de pino taeda, este estudio objeto de esquejes enraizados de tres genotipos de pino no est&#xE9;n relacionados con los tres reg&#xED;menes de riego. Etiquetas de secuencias expresadas (EST) se obtuvieron a partir tanto de la 3 &#x26;#39;y 5&#x26;#39; extremos de 12.918 ADNc seleccionados al azar generados a partir de tejidos de la ra&#xED;z. Estas tecnolog&#xED;as ecol&#xF3;gicamente racionales se agruparon para identificar 6.765 transcripciones &#xFA;nico (UniScripts) derivados de los 6.202 genes putativos &#xFA;nicos (unigenes-S). Anotaciones provisionales se asignaron sobre la base de comparaciones BLASTX a la prote&#xED;na de referencia de recursos de informaci&#xF3;n no redundante (PIR-nref) base de datos. Los niveles de expresi&#xF3;n de 42 UniScripts variaron con alta significaci&#xF3;n estad&#xED;stica con respecto al tratamiento. Muchos de ellos se parec&#xED;a a productos de los genes que han demostrado ser importante para la tolerancia a la sequ&#xED;a en otras especies, incluyendo dehidrinas y endochitinases, las enzimas del citocromo P450, prote&#xED;nas relacionadas con la patog&#xE9;nesis y varias finales de la embriog&#xE9;nesis abundantes (LEA) los productos g&#xE9;nicos. Del mismo modo, los niveles de expresi&#xF3;n de 110 UniScripts variado con alta significaci&#xF3;n estad&#xED;stica entre los genotipos, lo que indica que los patrones de expresi&#xF3;n gen&#xE9;tica en esta especie son mucho m&#xE1;s dependientes del genotipo que en el tratamiento. La mayor&#xED;a de los UniScripts pino de agua inducidos por el estr&#xE9;s que aparecieron para codificar los productos se asemejan a los factores de tolerancia a la sequ&#xED;a en otras especies fueron m&#xE1;s altamente inducida en un solo genotipo, lo que sugiere que los alelos de adaptaci&#xF3;n particularmente &#xFA;tiles para la tolerancia a la sequ&#xED;a podr&#xED;an existir dentro de la colecci&#xF3;n de ADNc caracterizado de este genotipo . La miner&#xED;a y la visualizaci&#xF3;n del conjunto completo de datos, as&#xED; como la descarga de dos secuencias de EST y UniScript contig, es posible descubrimiento de MAGIC en el uso de Gene http://fungen.org/genediscovery/.

Agua estr&#xE9;s genes de respuesta en el pino de incienso (Pinus taeda) Ra&#xED;ces identificados por el an&#xE1;lisis de las expresadas bibliotecas de secuencias de etiquetas

&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x7B7E; (&#x65E0;&#x5BB3;&#x73AF;&#x5883;&#x6280;&#x672F;) &#x4ECD;&#x7136;&#x662F;&#x8868;&#x5F81;&#x5404;&#x79CD;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x7F16;&#x7801;&#x90E8;&#x5206;&#x5360;&#x4E3B;&#x5BFC;&#x5730;&#x4F4D;&#x7684;&#x529E;&#x6CD5;&#x3002;&#x7531;&#x4E8E;&#x5B58;&#x5728;&#x56FA;&#x6709;&#x7684;&#x7F3A;&#x9677;&#xFF0C;&#x4F46;&#x540C;&#x65F6;&#x4E5F;&#x5E26;&#x6765;&#x4E25;&#x5CFB;&#x7684;&#x6311;&#x6218;&#xFF0C;&#x6570;&#x636E;&#x8D28;&#x91CF;&#x63A7;&#x5236;&#x3002;&#x5728;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6570;&#x636E;&#x5E93;&#x63D0;&#x4EA4;&#x4E4B;&#x524D; EST &#x5E8F;&#x5217;&#x901A;&#x5E38;&#x7504;&#x522B;&#x548C;&#x4FEE;&#x526A;&#x7684;&#x77E2;&#x91CF;&#x548C;&#x9002;&#x914D;&#x5668;/&#x94FE;&#x63A5;&#x5668;&#x5E8F;&#x5217;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x5229;&#x4E9A;/T &#x5C3E;&#x5DF4;&#x3002;&#x53BB;&#x9664;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5E8F;&#x5217;&#x8FDB;&#x884C;&#x6570;&#x636E;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x51FA;&#x9519;&#x7684;&#x65E0;&#x5BB3;&#x73AF;&#x5883;&#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x969C;&#x788D;&#xFF0C;&#x963B;&#x788D;&#x7684;&#x67D0;&#x4E9B;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x56FE;&#x6848;&#xFF0C;&#x5176;&#x68C0;&#x6D4B;&#x4F9D;&#x8D56;&#x4E8E;&#x51C6;&#x786E;&#x7684;&#x6CE8;&#x91CA;&#xFF0C;&#x6DFB;&#x52A0; posttranscriptionally &#x5229;&#x4E9A;&#x5C3E;&#x5DF4;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x4FE1;&#x606F;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x6316;&#x6398;&#x3002;&#x539F;&#x59CB; DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x4FE1;&#x606F;&#x4ECE;&#x516C;&#x5171;&#x8D44;&#x6599;&#x5E93;&#xFF0C;&#x5982; NCBI &#x8DDF;&#x8E2A;&#x5B58;&#x6863;&#xFF0C;&#x662F;&#x56E0;&#x8D8A;&#x6765;&#x8D8A;&#x591A;&#x5730;&#x63D0;&#x4F9B;&#x65B0;&#x7684;&#x5DE5;&#x5177;&#x5C06;&#x9700;&#x8981;&#x91CD;&#x65B0;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x6392;&#x96F7;&#x6B64;&#x6570;&#x636E;&#x7684;&#x65B0;&#x7684;&#x4FE1;&#x606F;&#x3002;WebTraceMiner (www.conifergdb.org/software/wtm) &#x7684;&#x76EE;&#x7684;&#x662F;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x52A0;&#x5DE5;&#x670D;&#x52A1;&#x5BF9;&#x4E8E;&#x539F;&#x6599;&#x7684; EST &#x8DDF;&#x8E2A;&#xFF0C;&#x91CD;&#x70B9;&#x653E;&#x5728;&#x68C0;&#x6D4B;&#x548C;&#x6316;&#x6398;&#x5E8F;&#x5217;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x53EF;&#x5E2E;&#x52A9;&#x5B9A;&#x6027;&#x7684; cDNA &#x63D2;&#x5165;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x77E2;&#x91CF;&#x7247;&#x6BB5; 3&#39; &#x548C; 5&#39; &#x603B;&#x7AD9;&#x516C;&#x5171;&#x5E8F;&#x5217;&#x3001; &#x9002;&#x914D;&#x5668;/&#x94FE;&#x63A5;&#x5668;&#x5E8F;&#x5217;&#x3001; &#x63D2;&#x5165;&#x4FA7;&#x7FFC;&#x9650;&#x5236;&#x6027;&#x5185;&#x5207;&#x9176;&#x8BC6;&#x522B;&#x7AD9;&#x70B9;&#x548C;&#x5229;&#x4E9A;&#x6216; polyT &#x7684;&#x5C3E;&#x5DF4;&#x3002;WebTraceMiner &#x8865;&#x5145;&#x5176;&#x4ED6;&#x516C;&#x5171; EST &#x8D44;&#x6E90;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5E94;&#x8BC1;&#x660E;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x5DE5;&#x5177;&#xFF0C;&#x4FBF;&#x4E8E;&#x6570;&#x636E;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x548C;&#x6613;&#x4E8E;&#x51FA;&#x9519;&#x7684;&#x65E0;&#x5BB3;&#x73AF;&#x5883;&#x6280;&#x672F; &#xFF08;&#x5982;&#x53D1;&#x73B0;&#x65B0;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x56FE;&#x6848;&#xFF09; &#x6316;&#x6398;&#x3002;

WebTraceMiner&#xFF1A; &#x4E3A;&#x5904;&#x7406;&#x548C;&#x6316;&#x6398; EST &#x5E8F;&#x5217;&#x8DDF;&#x8E2A;&#x6587;&#x4EF6; web &#x670D;&#x52A1;&#x3002;

Expressed sequence tags (ESTs) remain a dominant approach for characterizing the protein-encoding portions of various genomes. Due to inherent deficiencies, they also present serious challenges for data quality control. Before GenBank submission, EST sequences are typically screened and trimmed of vector and adapter/linker sequences, as well as polyA/T tails. Removal of these sequences presents an obstacle for data validation of error-prone ESTs and impedes data mining of certain functional motifs, whose detection relies on accurate annotation of positional information for polyA tails added posttranscriptionally. As raw DNA sequence information is made increasingly available from public repositories, such as NCBI Trace Archive, new tools will be necessary to reanalyze and mine this data for new information. WebTraceMiner (www.conifergdb.org/software/wtm) was designed as a public sequence processing service for raw EST traces, with a focus on detection and mining of sequence features that help characterize 3' and 5' termini of cDNA inserts, including vector fragments, adapter/linker sequences, insert-flanking restriction endonuclease recognition sites and polyA or polyT tails. WebTraceMiner complements other public EST resources and should prove to be a unique tool to facilitate data validation and mining of error-prone ESTs (e.g. discovery of new functional motifs).

WebTraceMiner: a web service for processing and mining EST sequence trace files.

&#xC9;tiquettes de s&#xE9;quences exprim&#xE9;es (EST) restent une approche dominante pour caract&#xE9;riser les parties codant une prot&#xE9;ine de diff&#xE9;rents g&#xE9;nomes. En raison de lacunes inh&#xE9;rentes, ils pr&#xE9;sentent &#xE9;galement de graves probl&#xE8;mes pour la qualit&#xE9; des donn&#xE9;es de contr&#xF4;le. Avant de soumettre GenBank, les s&#xE9;quences EST sont g&#xE9;n&#xE9;ralement projet&#xE9;s et par&#xE9;s de s&#xE9;quences de vecteurs et de l&#x26;#39;adaptateur / linker, ainsi que polyA / T queues. La suppression de ces s&#xE9;quences pr&#xE9;sente un obstacle pour la validation des donn&#xE9;es des sources d&#x26;#39;erreurs les TER et entrave l&#x26;#39;exploration de donn&#xE9;es de certains motifs fonctionnels, dont la d&#xE9;tection repose sur l&#x26;#39;annotation pr&#xE9;cise des informations de position pour queues polyA ajout&#xE9; posttranscriptionally. Comme premi&#xE8;re information sur la s&#xE9;quence d&#x26;#39;ADN est fait de plus en plus disponibles &#xE0; partir de r&#xE9;f&#xE9;rentiels publics, tels que NCBI Trace Archive, de nouveaux outils seront n&#xE9;cessaires pour r&#xE9;analyser et exploiter ces donn&#xE9;es pour de nouvelles informations. WebTraceMiner (www.conifergdb.org / logiciels / wtm) a &#xE9;t&#xE9; con&#xE7;u comme un service de traitement de s&#xE9;quence du public pour les traces EST premi&#xE8;res, avec un accent sur la d&#xE9;tection et l&#x26;#39;extraction de caract&#xE9;ristiques de s&#xE9;quences qui permettent de caract&#xE9;riser 3 &#x26;#39;et 5&#x26;#39; terminales des inserts d&#x26;#39;ADNc, y compris vecteur fragments, adaptateur / linker s&#xE9;quences, insert-flanquant les sites d&#x26;#39;endonucl&#xE9;ase de restriction de reconnaissance et de la queue polyA ou polyT. WebTraceMiner s&#x26;#39;ajoute &#xE0; d&#x26;#39;autres ressources publiques EST et devrait se r&#xE9;v&#xE9;ler un outil unique pour faciliter la validation des donn&#xE9;es et l&#x26;#39;exploitation de sources d&#x26;#39;erreurs les TER (par exemple la d&#xE9;couverte de nouveaux motifs fonctionnels).

WebTraceMiner: un service Web pour le traitement et mini&#xE8;res fichiers EST Trace s&#xE9;quences

Exprimierten Sequenz Schilder (ESTs) bleiben einen dominanten Ansatz zur Charakterisierung der Protein-Codierung Teile von verschiedenen Genomen. Aufgrund der inh&auml;renten Unzul&auml;nglichkeiten pr&auml;sentieren sie auch gro&szlig;e Herausforderungen f&uuml;r die Qualit&auml;tskontrolle der Daten. Vor Einreichung der GenBank sind EST-Sequenzen normalerweise geschirmt und getrimmt der Vektor sowie Adapter/Linker Sequenzen und PolyA/T Schw&auml;nze. Entfernung dieser Sequenzen pr&auml;sentiert ein Hindernis f&uuml;r die Datenvalidierung von fehleranf&auml;lligen Esten und behindert Datamining bestimmte funktionale Motive, deren erkennen auf genaue Anmerkung von Positionsinformationen f&uuml;r PolyA Tails posttranscriptionally hinzugef&uuml;gt beruht. Auch rohe DNA-Sequenz-Informationen aus &ouml;ffentlichen Repositories wie NCBI-Trace-Archiv, zunehmend zur Verf&uuml;gung gestellt wird ist neue Werkzeuge werden zu diagnostizieren und diese Daten nach neuen Informationen notwendig. WebTraceMiner (www.conifergdb.org/software/wtm) wurde als eine &ouml;ffentliche Sequenz Verarbeitung Service f&uuml;r rohe EST-Spuren, mit Schwerpunkt auf Erkennung und Bergbau Sequenz-Funktionen, die helfen, 3&#39; und 5&#39; Termini der cDNA-Eins&auml;tze, einschlie&szlig;lich Vektor Fragmente zu charakterisieren, Adapter/Linker Sequenzen, Insert-flankierenden Beschr&auml;nkung Endonuclease-Anerkennung Sites und PolyA oder PolyT Schw&auml;nze entworfen. WebTraceMiner erg&auml;nzt andere &ouml;ffentlichen EST-Ressourcen und sollte sich als ein einzigartiges Tool zur Daten&uuml;berpr&uuml;fung und Bergbau von fehleranf&auml;lligen Esten (z.B. bei der Entdeckung der neuen funktionalen Motiven) zu erleichtern.

WebTraceMiner: ein Webdienst f&uuml;r Verarbeitung und Bergbau EST-Sequenz-Trace-Dateien.

Expressed sequence tags (ESTs) rimangono un approccio dominante per caratterizzare le porzioni della proteina-codifica di genomi diversi. A causa di carenze intrinseche, essi presentano anche gravi sfide per il controllo di qualit&agrave; dei dati. Prima della presentazione GenBank, sequenze EST sono in genere proiettati e guarniti di vettore e sequenze di adattatore/linker, cos&igrave; come coda di polyA/T. Rimozione di queste sequenze presenta un ostacolo per la convalida dei dati di ESTs error-prone e ostacola il data mining di determinati motivi funzionali, cui rilevazione si basa sull&#39;accurata annotazione di informazioni posizionali per coda di polyA aggiunto posttranscriptionally. Come prime informazioni di sequenza del DNA sono fatta sempre pi&ugrave; disponibile da archivi pubblici, come ad esempio NCBI Trace Archive, nuovi strumenti sar&agrave; necessari rianalizzare e miniera di dati per nuove informazioni. WebTraceMiner (www.conifergdb.org/software/wtm) &egrave; stato progettato come una sequenza di pubblica servizio per prime tracce EST, con un focus sulla rilevazione e l&#39;estrazione di caratteristiche di sequenza che aiutano a caratterizzare il 3&#39; e 5&#39; termini di cDNA inserti, tra cui frammenti di vettore di elaborazione, adattatore/linker sequenze, siti di riconoscimento endonucleasi di restrizione che fiancheggiano inserto e coda di polyA o polyT. WebTraceMiner integra altre risorse pubbliche EST e dovrebbe dimostrare di essere uno strumento unico per facilitare la convalida dei dati e data mining di error-prone ESTs (per esempio la scoperta di nuovi motivi funzionali).

WebTraceMiner: un servizio web per l&#39;elaborazione e i file di traccia della sequenza data mining EST.

&#x767A;&#x73FE;&#x914D;&#x5217;&#x30BF;&#x30B0;&#xFF08;EST&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x90E8;&#x5206;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x652F;&#x914D;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306E;&#x307E;&#x307E;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;&#x6B20;&#x9665;&#x304C;&#x539F;&#x56E0;&#x3067;&#x3001;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x54C1;&#x8CEA;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6DF1;&#x523B;&#x306A;&#x8AB2;&#x984C;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002; GenBank&#x306B;&#x63D0;&#x51FA;&#x3059;&#x308B;&#x524D;&#x306B;&#x3001;EST&#x914D;&#x5217;&#x306F;&#x3001;&#x5178;&#x578B;&#x7684;&#x306B;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x30D9;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30A2;&#x30C0;&#x30D7;&#x30BF;&#x30FC;/&#x30EA;&#x30F3;&#x30AB;&#x30FC;&#x914D;&#x5217;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3001;&#x30DD;&#x30EA;A / T&#x5C3E;&#x306E;&#x30C8;&#x30EA;&#x30DF;&#x30F3;&#x30B0;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x9664;&#x53BB;&#x306F;&#x3001;&#x30A8;&#x30E9;&#x30FC;&#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x3084;&#x3059;&#x3044;EST&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x691C;&#x8A3C;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x969C;&#x5BB3;&#x7269;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x691C;&#x51FA;&#x30DD;&#x30EA;A&#x30C6;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x60C5;&#x5831;&#x306E;&#x6B63;&#x78BA;&#x306A;&#x6CE8;&#x91C8;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x8EE2;&#x5199;&#x5F8C;&#x306B;&#x8FFD;&#x52A0;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306A;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30DE;&#x30A4;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x59A8;&#x3052;&#x308B;&#x3002;&#x751F;&#x306E;DNA&#x914D;&#x5217;&#x60C5;&#x5831;&#x306F;NCBI&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30C8;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B9;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AB;&#x30A4;&#x30D6;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x516C;&#x958B;&#x30EA;&#x30DD;&#x30B8;&#x30C8;&#x30EA;&#x304B;&#x3089;&#x3001;&#x307E;&#x3059;&#x307E;&#x3059;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x306A;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3001;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x60C5;&#x5831;&#x304C;&#x3053;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x518D;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x3001;&#x63A1;&#x6398;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002; WebTraceMiner&#xFF08;www.conifergdb.org /&#x30BD;&#x30D5;&#x30C8;&#x30A6;&#x30A7;&#x30A2;/ WTM&#xFF09;&#x306F;&#x30D9;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3001;3 &#x26;#39;&#x304A;&#x3088;&#x3073;5&#x26;#39; cDNA&#x30A4;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC;&#x30C8;&#x306E;&#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x3092;&#x52A9;&#x3051;&#x308B;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x691C;&#x51FA;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DE;&#x30A4;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x7126;&#x70B9;&#x3092;&#x5F53;&#x3066;&#x3066;&#x3001;&#x751F;&#x306E;EST&#x30C8;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x516C;&#x5171;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x51E6;&#x7406;&#x30B5;&#x30FC;&#x30D3;&#x30B9;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x8A2D;&#x8A08;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x65AD;&#x7247;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30C0;&#x30D7;&#x30BF;&#x30FC;/&#x30EA;&#x30F3;&#x30AB;&#x30FC;&#x914D;&#x5217;&#x3001;&#x633F;&#x5165;&#x30D5;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AD;&#x30F3;&#x30B0;&#x5236;&#x9650;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x8A8D;&#x8B58;&#x90E8;&#x4F4D;&#x3068;&#x30DD;&#x30EA;A&#x53C8;&#x306F;&#x30DD;&#x30EA;T&#x5C3E;&#x3002; WebTraceMiner&#x306F;&#x3001;&#x4ED6;&#x306E;&#x516C;&#x5171;&#x306E;EST&#x8CC7;&#x6E90;&#x3092;&#x88DC;&#x5B8C;&#x3057;&#x3001;&#x30A8;&#x30E9;&#x30FC;&#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x3084;&#x3059;&#x3044;&#x306E;EST&#xFF08;&#x4F8B;&#x3048;&#x3070;&#x3001;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x6A5F;&#x80FD;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x306E;&#x767A;&#x898B;&#xFF09;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x691C;&#x8A3C;&#x3068;&#x30DE;&#x30A4;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x5BB9;&#x6613;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x8A3C;&#x660E;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

WebTraceMiner&#xFF1A;&#x51E6;&#x7406;&#x3068;&#x30DE;&#x30A4;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;EST&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x30C8;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B9;&#xB7;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;Web&#x30B5;&#x30FC;&#x30D3;&#x30B9;

&#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD0DC;&#xADF8; (ESTs) &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xBD80;&#xBD84;&#xC744; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; &#xC9C0;&#xBC30;&#xC801;&#xC778; &#xC811;&#xADFC; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xB2E4;. &#xB0B4;&#xC7AC; &#xB41C; &#xACB0;&#xD568;&#xC73C;&#xB85C; &#xC778;&#xD574; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xB610;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xD488;&#xC9C8; &#xAD00;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2EC;&#xAC01;&#xD55C; &#xB3C4;&#xC804;&#xC744; &#xC81C;&#xC2DC;. &#xC740;&#xD589; &#xC81C;&#xCD9C; &#xC804;&#xC5D0; EST &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB294; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0C1;&#xC601; &#xD558; &#xACE0; &#xBCA1;&#xD130; &#xC5B4;&#xB311;&#xD130;/&#xB9C1;&#xCEE4; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; polyA/T &#xAF2C;&#xB9AC;&#xC758; &#xC190;&#xC9C8;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC81C;&#xAC70; &#xC624;&#xB958;&#xAC00; Ests&#xC758; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC720;&#xD6A8;&#xC131; &#xAC80;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC7A5;&#xC560;&#xBB3C;&#xC744; &#xC120;&#xBB3C; &#xD558; &#xACE0; &#xB204;&#xAD6C;&#xC758; &#xD0D0;&#xC9C0; &#xC815;&#xD655;&#xD55C; &#xC8FC;&#xC11D; posttranscriptionally &#xCD94;&#xAC00; polyA &#xAF2C;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC704;&#xCE58; &#xC815;&#xBCF4;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD2B9;&#xC815; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xD504;&#xC758; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD;&#xC744; &#xBC29;&#xD574; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xC6D0;&#xC2DC; DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC815;&#xBCF4; NCBI &#xCD94;&#xC801; &#xBCF4;&#xAD00; &#xB4F1; &#xACF5;&#xC6A9; &#xC800;&#xC7A5;&#xC18C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC810;&#xC810; &#xB354; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218;&#xB85C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB3C4;&#xAD6C;&#xB97C; &#xB2E4;&#xC2DC; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; &#xACE0; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC815;&#xBCF4;&#xB97C;&#xC774; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xAC83;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. WebTraceMiner (www.conifergdb.org/software/wtm) &#xCC98;&#xB9AC; &#xC6D0;&#xC2DC; EST &#xCD94;&#xC801; &#xAC80;&#xC0C9; &#xBC0F; &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD; cDNA &#xC0BD;&#xC785;, &#xBCA1;&#xD130; &#xC870;&#xAC01; &#xB4F1;&#xC758; 3&#39;&#xC640; 5&#39; &#xD14C;&#xB974;&#xBBF8;&#xB2C8; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xB3C4;&#xC6C0;&#xC774; &#xB418;&#xB294; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xCD08;&#xC810;&#xC744; &#xB9DE;&#xCD98; &#xC11C;&#xBE44;&#xC2A4; &#xACF5;&#xC6A9; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;, &#xC5B4;&#xB311;&#xD130;/&#xB9C1;&#xCEE4; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;, &#xC0BD;&#xC785; &#xCE21;&#xBA74; endonuclease &#xC778;&#xC2DD; &#xBC0F; polyA &#xB610;&#xB294; polyT &#xAF2C;&#xB9AC; &#xC124;&#xACC4; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. WebTraceMiner &#xAE30;&#xD0C0; &#xACF5;&#xACF5; EST &#xB9AC;&#xC18C;&#xC2A4;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC644; &#xD558; &#xACE0; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xB3C4;&#xAD6C;&#xB97C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC720;&#xD6A8;&#xC131; &#xAC80;&#xC0AC; &#xBC0F; &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD; &#xC624;&#xB958;&#xAC00; ESTs (&#xC608;: &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xD504;&#xC758; &#xBC1C;&#xACAC;)&#xC744; &#xCD09;&#xC9C4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD558;&#xC5EC; &#xC99D;&#xBA85; &#xD55C;&#xB2E4;.

WebTraceMiner: &#xCC98;&#xB9AC; &#xBC0F; &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD; EST &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xCD94;&#xC801; &#xD30C;&#xC77C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC6F9; &#xC11C;&#xBE44;&#xC2A4;.

Etiquetas de secuencias expresadas (EST) siguen siendo un enfoque dominante para la caracterizaci&#xF3;n de las partes que codifican prote&#xED;nas de varios genomas. Debido a las deficiencias inherentes, tambi&#xE9;n presentan serios desaf&#xED;os para el control de calidad de los datos. Antes de la presentaci&#xF3;n GenBank, secuencias EST suelen ensayarse y recortado de secuencias del vector y el adaptador / enlazador, as&#xED; como las colas poliA / T. La eliminaci&#xF3;n de estas secuencias representa un obst&#xE1;culo para la validaci&#xF3;n de datos de error propensos a las tecnolog&#xED;as ecol&#xF3;gicamente racionales e impide la extracci&#xF3;n de datos de ciertos motivos funcionales, cuya detecci&#xF3;n se basa en la anotaci&#xF3;n precisa de la informaci&#xF3;n de posici&#xF3;n para las colas de poliA a&#xF1;adido posttranscriptionally. Como la informaci&#xF3;n en bruto secuencia de ADN se hace cada vez m&#xE1;s disponibles en los repositorios p&#xFA;blicos, como la Revista Archivo de seguimiento, las nuevas herramientas ser&#xE1; necesario volver a analizar y extraer estos datos para la nueva informaci&#xF3;n. WebTraceMiner (www.conifergdb.org / software / WTM) fue dise&#xF1;ado como un servicio p&#xFA;blico en la secuencia de procesamiento de crudos huellas EST, con un enfoque en la detecci&#xF3;n y extracci&#xF3;n de caracter&#xED;sticas que ayudan a caracterizar la secuencia 3 &#x26;#39;y 5&#x26;#39; termini de insertos de cDNA, incluyendo vectores fragmentos, adaptador / enlazador secuencias de inserci&#xF3;n, acompa&#xF1;amiento de restricci&#xF3;n de sitios de reconocimiento de endonucleasas y las colas polyA o poliT. WebTraceMiner complementa otros recursos p&#xFA;blicos de EST y debe ser una herramienta &#xFA;nica para facilitar la validaci&#xF3;n de datos y miner&#xED;a de propensos a errores de tecnolog&#xED;as ecol&#xF3;gicamente racionales (por ejemplo, el descubrimiento de nuevos motivos funcionales).

WebTraceMiner: un servicio web para el procesamiento y la Miner&#xED;a de archivos de secuencias EST de seguimiento

&#x4E0E;&#x4F4E;&#x6210;&#x672C;&#x7684;&#x5230;&#x6765;&#xFF0C;&#x9AD8;&#x901A;&#x91CF;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x7684;&#x516C;&#x5171;&#x57DF;&#x6A21;&#x578B;&#x548C;&#x975E;&#x6A21;&#x578B;&#x751F;&#x7269;&#x4F53;&#x6240;&#x4F9B;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x7B7E; (EST) &#x5E8F;&#x5217;&#x6570;&#x636E;&#x91CF;&#x5448;&#x6307;&#x6570;&#x7EA7;&#x589E;&#x957F;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7528;&#x4E8E;&#x63CF;&#x8FF0;&#x5404;&#x79CD;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#xFF0C;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x4E00;&#x4E2A;&#x4E25;&#x91CD;&#x6311;&#x6218;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x8D28;&#x91CF;&#x63A7;&#x5236;&#x548C;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x7531;&#x4E8E;&#x5176;&#x56FA;&#x6709;&#x7684;&#x7F3A;&#x9677;&#xFF0C;&#x7279;&#x522B;&#x662F;&#x5BF9;&#x4E8E;&#x65E0;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x7269;&#x79CD;&#x3002;

ConiferEST&#xFF1A; &#x7EFC;&#x5408;&#x751F;&#x7269;&#x4FE1;&#x606F;&#x5B66;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x540E;&#x5904;&#x7406;&#x548C;&#x6316;&#x6398;&#x7684;&#x9488;&#x53F6;&#x6811;&#x8868;&#x8FBE;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x7B7E; (&#x65E0;&#x5BB3;&#x73AF;&#x5883;&#x6280;&#x672F;)&#x3002;

With the advent of low-cost, high-throughput sequencing, the amount of public domain Expressed Sequence Tag (EST) sequence data available for both model and non-model organism is growing exponentially. While these data are widely used for characterizing various genomes, they also present a serious challenge for data quality control and validation due to their inherent deficiencies, particularly for species without genome sequences.

ConiferEST: an integrated bioinformatics system for data reprocessing and mining of conifer expressed sequence tags (ESTs).

Avec l&#x26;#39;av&#xE8;nement de faible co&#xFB;t, s&#xE9;quen&#xE7;age &#xE0; haut d&#xE9;bit, le montant du domaine public Exprim&#xE9; s&#xE9;quences de donn&#xE9;es de s&#xE9;quences Tag (HNE) disponibles pour le mod&#xE8;le et non-organisme mod&#xE8;le est en croissance exponentielle. Bien que ces donn&#xE9;es sont largement utilis&#xE9;es pour caract&#xE9;riser diff&#xE9;rents g&#xE9;nomes, ils pr&#xE9;sentent &#xE9;galement un s&#xE9;rieux d&#xE9;fi pour la qualit&#xE9; des donn&#xE9;es de contr&#xF4;le et de validation en raison de leurs lacunes inh&#xE9;rentes, en particulier pour les esp&#xE8;ces sans les s&#xE9;quences du g&#xE9;nome.

ConiferEST: un syst&#xE8;me int&#xE9;gr&#xE9; de bioinformatique pour le retraitement des donn&#xE9;es et des mines de conif&#xE8;res marqueurs de s&#xE9;quence exprim&#xE9;e (EST)

Mit dem Aufkommen der preiswerten w&auml;chst exponentiell Hochdurchsatz-Sequenzierung, die H&ouml;he der gemeinfreien ausgedr&uuml;ckt-Sequenz-Tag (EST)-Sequenzdaten f&uuml;r Modell und nicht als Modellorganismus zur Verf&uuml;gung. W&auml;hrend diese Daten zur Charakterisierung verschiedener Genome weit verbreitet sind, stellen sie auch eine ernste Herausforderung f&uuml;r die Qualit&auml;tskontrolle der Daten und Validierung aufgrund ihrer inh&auml;renten Defizite, insbesondere f&uuml;r Arten ohne Genomsequenzen.

ConiferEST: eine integrierte Bioinformatik-System f&uuml;r Daten, die Wiederaufbereitung und Abbau von Nadelbaum ausgedr&uuml;ckt Sequenz Markierungen (ESTs).

Con l&#39;avvento delle low-cost, high-throughput sequencing, la quantit&agrave; di pubblico dominio dati di sequenza Tag espressa di sequenza (EST) disponibili sia per modello e organismo di modello non sta crescendo esponenzialmente. Mentre questi dati sono ampiamente usati per caratterizzare vari genomi, presentano anche una seria sfida per controllo di qualit&agrave; dei dati e la convalida a causa di loro carenze intrinseche, specialmente per le specie senza sequenze di genoma.

ConiferEST: un sistema integrato di bioinformatica per la rielaborazione dei dati e data mining di conifera espresso sequence tags (ESTs).

&#x4F4E;&#x30B3;&#x30B9;&#x30C8;&#x3001;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x5230;&#x6765;&#x3068;&#x3068;&#x3082;&#x306B;&#x3001;&#x30D1;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x91CF;&#x306F;&#x3001;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3068;&#x975E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x3067;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x914D;&#x5217;&#x30BF;&#x30B0;&#xFF08;EST&#xFF09;&#x914D;&#x5217;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x6307;&#x6570;&#x95A2;&#x6570;&#x7684;&#x306B;&#x6210;&#x9577;&#x3057;&#x3066;&#x8868;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x5E83;&#x304F;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x914D;&#x5217;&#x305B;&#x305A;&#x306B;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x54C1;&#x8CEA;&#x7BA1;&#x7406;&#x3001;&#x7279;&#x306B;&#x7A2E;&#x306E;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;&#x6B20;&#x9665;&#x306B;&#x8D77;&#x56E0;&#x3059;&#x308B;&#x691C;&#x8A3C;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x91CD;&#x5927;&#x306A;&#x6311;&#x6226;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

ConiferEST&#xFF1A;&#x30B3;&#x30CB;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x518D;&#x51E6;&#x7406;&#x3068;&#x30DE;&#x30A4;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D5;&#x30A9;&#x30DE;&#x30C6;&#x30A3;&#x30AF;&#x30B9;&#xB7;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306F;&#x3001;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x30BF;&#x30B0;&#xFF08;EST&#xFF09;&#x3092;&#x767A;&#x73FE;

&#xC800;&#xAC00;&#xC758; &#xB3C4;&#xB798;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1;, &#xACF5;&#xAC1C; &#xD45C;&#xBA85; &#xD588;&#xB2E4; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD0DC;&#xADF8; (EST) &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xBAA8;&#xB378;&#xACFC; &#xC544;&#xB2CC; &#xBAA8;&#xB378; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4; &#xBAA8;&#xB450;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xAE08;&#xC561;&#xC740; &#xAE30; &#xD558; &#xAE09;&#xC218;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC131;&#xC7A5; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xB610;&#xD55C; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC5C6;&#xC774; &#xC218; &#xC885;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD2B9;&#xD788; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xACE0;&#xC720;&#xC758; &#xACB0;&#xD568; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xC720;&#xD6A8;&#xC131; &#xAC80;&#xC0AC; &#xBC0F; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xD488;&#xC9C8; &#xAD00;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2EC;&#xAC01;&#xD55C; &#xB3C4;&#xC804;&#xC744; &#xC81C;&#xC2DC;.

ConiferEST: &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC7AC;&#xCC98;&#xB9AC; &#xBC0F; &#xCE68; &#xC5FD; &#xC218;&#xC758; &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD; &#xD1B5;&#xD569;&#xB41C; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xC815;&#xBCF4;&#xD559; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD0DC;&#xADF8;&#xB97C; (ESTs)&#xB97C; &#xD45C;&#xBA85; &#xD588;&#xB2E4;.

Con el advenimiento de bajo costo y alto rendimiento de secuenciaci&#xF3;n, la cantidad de dominio p&#xFA;blico de etiquetas de secuencia expresada (EST) la secuencia de datos disponibles, tanto para el modelo y no modelo de organismo est&#xE1; creciendo de manera exponencial. Si bien estos datos son ampliamente utilizados para la caracterizaci&#xF3;n de genomas diferentes, tambi&#xE9;n presentan un serio desaf&#xED;o para el control de calidad y validaci&#xF3;n de datos, debido a sus deficiencias inherentes, en particular para las especies, sin secuencias del genoma.

ConiferEST: un Sistema Integrado de Bioinform&#xE1;tica para el reprocesamiento de datos y miner&#xED;a de con&#xED;feras etiquetas de secuencias expresadas (EST)

&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.&#xFF09;&#xFF0C;&#x6700;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x79CD;&#x690D;&#x6811;&#x79CD;&#x5728;&#x7F8E;&#x56FD;&#xFF0C;&#x662F;&#x6728;&#x6750;&#x548C;&#x6728;&#x6750;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7528;&#x4E8E;&#x5404;&#x79CD;&#x5404;&#x6837;&#x7684;&#x6D88;&#x8D39;&#x7C7B;&#x4EA7;&#x54C1;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x6765;&#x6E90;&#x3002;&#x6B21;&#x751F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#xFF0C;&#x4E3B;&#x8981;&#x662F;&#x7531;&#x6728;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x548C;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x3001; &#x534A;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x548C;&#x6728;&#x8D28;&#x7D20;&#x662F;&#x6728;&#x6750;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x7EC4;&#x6210;&#x90E8;&#x5206;&#x3002;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x5F62;&#x6001;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x6210;&#x5206;&#x662F;&#x6728;&#x5C5E;&#x6027;&#x51B3;&#x5B9A;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x56E0;&#x7D20;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7528;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5B66;&#x6765;&#x786E;&#x5B9A;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x7684;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x548C;&#x534A;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x7684;&#x5408;&#x6210;&#x6307;&#x8BA4;&#x662F;&#x5377;&#x5165;&#x88AB;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x5408;&#x6210;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x540C;&#x6E90;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x5047;&#x5B9A;&#x4E2D;&#x5B66;&#x5355;&#x5143;&#x5899;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x5408;&#x6210;&#x9176;&#x57FA;&#x56E0;&#x3001; &#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x5408;&#x9176;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x3001; &#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x819C;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x57FA;&#x56E0;&#x3001; &#x8517;&#x7CD6;&#x5408;&#x9176;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x7F16;&#x7801;&#x5E8F;&#x5217;&#xFF0C;UDP-&#x8461;&#x8404;&#x7CD6; pyrophosphorylase &#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x56FD;&#x5185;&#x751F;&#x4EA7;&#x603B;&#x503C;&#x7518;&#x9732;&#x7CD6; pyrophosphorylase &#x57FA;&#x56E0;&#x88AB;&#x786E;&#x5B9A;&#x4ECE;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x7B7E; (EST) &#x96C6;&#x5408;&#x4E2D;&#x3002;&#x4ECE;&#x4ECE;&#x4ECE;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E2D;&#x56FD;&#x5BB6;&#x6728;&#x8D28;&#x6784;&#x9020;&#x5E93;&#x9694;&#x79BB;&#x7684; cDNA &#x514B;&#x9686;&#x83B7;&#x5F97;&#x4E86;&#x5168;&#x957F;&#x7F16;&#x7801;&#x5E8F;&#x5217;&#x3002;&#x4ECE;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x88AB;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x7C7B;&#x7FA4;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x4EB2;&#x7F18;&#x5173;&#x7CFB;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x68C0;&#x67E5;&#xFF0C;&#x5728;&#x8840;&#x7BA1;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x4E2D;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5206;&#x6790;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x5B9E;&#x65F6;&#x5B9A;&#x91CF;&#x3001; &#x9006;&#x8F6C;&#x5F55;-&#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x94FE;&#x53CD;&#x5E94;&#x3002;&#x5047;&#x5B9A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x5408;&#x6210;&#x57FA;&#x56E0;&#x6709;&#x4EBA;&#x5728;&#x8840;&#x7BA1;&#x4E2D;&#x7684;&#x9AD8;&#x6C34;&#x5E73;&#x548C;&#x5B50;&#x96C6;&#x5DEE;&#x5F02;&#x52A0;&#x4EE5;&#x89C4;&#x8303;&#x7684;&#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x548C;&#x97E7;&#x76AE;&#x90E8;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x3002;&#x63A8;&#x65AD;&#x7684;&#x4EB2;&#x7F18;&#x5173;&#x7CFB;&#x548C;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x4ECE;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x6A21;&#x5F0F;&#x7B26;&#x5408;&#x5176;&#x4E2D;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x78B3;&#x6C34;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x5408;&#x6210;&#x4E2D;&#x7684;&#x89D2;&#x8272;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;&#x5728;&#x88F8;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x548C;&#x88AB;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x7C7B;&#x7FA4;&#x4E2D;&#x7684;&#x540C;&#x6E90;&#x6728;&#x6750;&#x5F62;&#x6210;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x4FDD;&#x62A4;&#x3002;

&#x78B3;&#x6C34;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x76F8;&#x5173;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x5408;&#x6210;&#x7684;&#x8840;&#x7BA1;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7684;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E;)&#x3002;

Loblolly pine (Pinus taeda L.), the most widely planted tree species in the United States, is an important source of wood and wood fibers for a multitude of consumer products. Wood fibers are primarily composed of secondary cell walls, and cellulose, hemicelluloses and lignin are major components of wood. Fiber morphology and cell wall composition are important determinants of wood properties. We used comparative genomics to identify putative genes for cellulose and hemicellulose synthesis in loblolly pine that are homologous to genes implicated in cell wall synthesis in angiosperms. Sequences encoding putative secondary cell wall cellulose synthase genes, cellulose synthase-like genes, a membrane-bound endoglucanase gene, a sucrose synthase gene, a UDP-glucose pyrophosphorylase gene and GDP-mannose pyrophosphorylase genes were identified in expressed sequence tag (EST) collections from loblolly pine. Full-length coding sequences were obtained from cDNA clones isolated from a library constructed from developing xylem. Phylogenetic relationships between the genes from loblolly pine and angiosperm taxa were examined and transcriptional profiling in vascular tissues was conducted by real-time quantitative, reverse transcriptase-polymerase chain reaction. The putative cell wall synthesis genes were expressed at high levels in vascular tissues and a subset was differentially regulated in xylem and phloem tissues. Inferred phylogenetic relationships and expression patterns for the genes from loblolly pine were consistent with roles in synthesis of complex carbohydrates of the cell wall. These studies suggest functional conservation of homologous wood formation genes in gymnosperm and angiosperm taxa.

Carbohydrate-related genes and cell wall biosynthesis in vascular tissues of loblolly pine (Pinus taeda).

Pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.), les esp&#xE8;ces d&#x26;#39;arbres les plus plant&#xE9;s dans les &#xC9;tats-Unis, est une source importante de bois et de fibres de bois pour une multitude de produits de consommation. Les fibres de bois sont principalement compos&#xE9;s des parois secondaires, et de la cellulose, h&#xE9;micelluloses et lignine sont des composantes majeures de bois. Morphologie de la fibre et la composition des parois cellulaires sont des d&#xE9;terminants importants de propri&#xE9;t&#xE9;s du bois. Nous avons utilis&#xE9; la g&#xE9;nomique comparative pour identifier les g&#xE8;nes putatifs pour la cellulose et l&#x26;#39;h&#xE9;micellulose de synth&#xE8;se en pin &#xE0; l&#x26;#39;encens qui sont homologues &#xE0; des g&#xE8;nes impliqu&#xE9;s dans la synth&#xE8;se de la paroi cellulaire chez les angiospermes. Les s&#xE9;quences codant pour les g&#xE8;nes putatifs de cellules secondaires mur de cellulose synthase, de la cellulose synthase-comme les g&#xE8;nes, un g&#xE8;ne endoglucanase li&#xE9;e &#xE0; la membrane, un g&#xE8;ne sucrose synthase, un g&#xE8;ne UDP-glucose pyrophosphorylase et les g&#xE8;nes pyrophosphorylase GDP-mannose ont &#xE9;t&#xE9; identifi&#xE9;s dans &#xE9;tiquette de s&#xE9;quence exprim&#xE9;e (EST) des collections &#xE0; partir de pin &#xE0; encens. Sur toute la longueur des s&#xE9;quences codantes ont &#xE9;t&#xE9; obtenus &#xE0; partir de clones d&#x26;#39;ADNc isol&#xE9;s &#xE0; partir d&#x26;#39;une biblioth&#xE8;que construite &#xE0; partir de l&#x26;#39;&#xE9;laboration du xyl&#xE8;me. Les relations phylog&#xE9;n&#xE9;tiques entre les g&#xE8;nes de pin &#xE0; encens et de taxa d&#x26;#39;angiospermes ont &#xE9;t&#xE9; examin&#xE9;s et le profilage transcriptionnel dans les tissus vasculaires a &#xE9;t&#xE9; men&#xE9;e par quantitative en temps r&#xE9;el, la r&#xE9;action en cha&#xEE;ne par polym&#xE9;rase de la transcriptase inverse-. Les g&#xE8;nes putatifs de la paroi cellulaire de synth&#xE8;se ont &#xE9;t&#xE9; exprim&#xE9;s &#xE0; des niveaux &#xE9;lev&#xE9;s dans les tissus vasculaires et un sous-ensemble a &#xE9;t&#xE9; r&#xE9;gul&#xE9;s diff&#xE9;remment dans les tissus du xyl&#xE8;me et le phlo&#xE8;me. Relations phylog&#xE9;n&#xE9;tiques inf&#xE9;r&#xE9;es et modes d&#x26;#39;expression pour les g&#xE8;nes de pin &#xE0; encens &#xE9;taient compatibles avec des r&#xF4;les dans la synth&#xE8;se des glucides complexes de la paroi cellulaire. Ces &#xE9;tudes sugg&#xE8;rent une conservation fonctionnelle des g&#xE8;nes homologues de formation du bois dans les gymnospermes et angiospermes taxons.

Glucides g&#xE8;nes li&#xE9;s et biosynth&#xE8;se de la paroi cellulaire dans les tissus vasculaires du pin &#xE0; encens (Pinus taeda)

Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda L.), die am h&auml;ufigsten Baumarten in den Vereinigten Staaten gepflanzt, ist eine wichtige Quelle von Holz und Holzerzeugnissen Fasern f&uuml;r eine Vielzahl von Konsumg&uuml;tern. Holzfasern bestehen haupts&auml;chlich aus sekund&auml;ren Zellw&auml;nde und Zellulose, Hemicelluloses und Lignin sind Hauptbestandteile des Holzes. Faser-Morphologie und Zellwand-Zusammensetzung sind wichtige Determinanten der Holzeigenschaften. Wir werden vergleichende Genomik vermeintliche Gene f&uuml;r Cellulose und Hemicellulose Synthese in Loblolly Pine identifiziert, die homologe Gene in die Zellwand-Synthese in Angiospermen verwickelt sind. Codierung vermeintliche Secondary Zelle Wand Zellulose Synthase Gene, Zellulose-Synthase-&auml;hnliche Gene, ein membrangebundener Endoglucanase-gen, ein Saccharose-Synthase-Gen-Sequenzen wurden ein UDP-Glukose Pyrophosphorylase gen und BIP-Mannose Pyrophosphorylase Gene im exprimierten Sequenz Tag (EST) Sammlungen von Loblolly Pine identifiziert. In kodierende Sequenzen wurden von cDNA Clones isoliert aus einer Bibliothek, gebaut von der Entwicklung von Xylem erzielt. Phylogenetische Beziehungen zwischen den Genen von Loblolly Pine und immergr&uuml;ne Taxa wurden untersucht und transkriptionelle Profilerstellung in vaskul&auml;re Gewebe von Echtzeit-quantitative, Reverse Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion durchgef&uuml;hrt wurde. Die vermeintliche Zellwand-Synthese-Gene wurden auf hohem Niveau in vaskul&auml;re Geweben ausgedr&uuml;ckt und eine Teilmenge wurde in Xylem und Phloem Gewebe differentiell geregelt. Hergeleiteten phylogenetic Relationships und Ausdrucksmuster f&uuml;r die Gene aus Loblolly Kiefer entsprachen Rollen bei der Synthese von komplexen Kohlenhydraten der Zellwand. Diese Studien legen nahe, funktionelle Erhaltung Holz Bildung homologe Gene in Nacktsamige und immergr&uuml;ne Taxa.

Kohlenhydrat-bezogenen Gene und Zellwand-Biosynthese in vaskul&auml;re Geweben der Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda).

Loblolly pine (Pinus taeda L.), il pi&ugrave; ampiamente piantato specie dell&#39;albero negli Stati Uniti, &egrave; un&#39;importante fonte di fibre di legna e per una moltitudine di prodotti di consumo. Fibre di legno sono principalmente composti da pareti della cellula secondaria e cellulosa, emicellulose e lignina sono componenti principali del legno. Composizione di morfologia e parete cellulare di fibra sono importanti fattori determinanti della propriet&agrave; legno. Abbiamo usato la genomica comparativa per identificare geni putativi per la sintesi di cellulosa ed emicellulosa loblolly Pine che sono omologhi ai geni implicati nella sintesi della parete cellulare nelle angiosperme. Le sequenze putative cella secondaria parete cellulosa sintasi geni, geni di cellulosa sintasi-come, un gene associato a membrana endoglucanase, un gene di saccarosio sintasi, un gene pyrophosphorylase UDP-glucosio e mannosio PIL pyrophosphorylase geni sono stati identificati nelle collezioni di expressed sequence tag (EST) da loblolly pine. Full-length sequenze codificanti sono stati ottenuti da cloni di cDNA isolati da una libreria costruita da sviluppare xilema. Relazioni filogenetiche tra i geni da loblolly pine e taxa di angiosperme sono stati esaminati e profilatura trascrizionale in tessuti vascolari &egrave; stata condotta da Real-Time quantitative, reverse transcriptase-polymerase chain reaction. I geni di sintesi putativo parete cellulare sono stati espressi ad alti livelli nei tessuti vascolari e un sottoinsieme differenzialmente era regolato nei tessuti xilema e floema. Dedotti Rapporti filogenetici e modelli di espressione per i geni da Pino loblolly erano coerenti con i ruoli nella sintesi di carboidrati complessi della parete cellulare. Questi studi suggeriscono la conservazione funzionale di geni omologhi formazione legno in taxa di gimnosperme e Angiosperme.

Geni correlati a carboidrati e biosintesi della parete cellulare nei tessuti vascolari del loblolly pine (Pinus taeda).

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x3001;&#x7C73;&#x56FD;&#x3067;&#x6700;&#x3082;&#x5E83;&#x304F;&#x690D;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x6A39;&#x7A2E;&#x306F;&#x3001;&#x6D88;&#x8CBB;&#x8005;&#x88FD;&#x54C1;&#x306E;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6728;&#x6750;&#x3084;&#x6728;&#x6750;&#x7E4A;&#x7DAD;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x6E90;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x6728;&#x8CEA;&#x7E4A;&#x7DAD;&#x306F;&#x3001;&#x4E3B;&#x306B;&#x4E8C;&#x6B21;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x3067;&#x69CB;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x3001;&#x30D8;&#x30DF;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x3001;&#x30EA;&#x30B0;&#x30CB;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x6728;&#x6750;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x6210;&#x5206;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7E4A;&#x7DAD;&#x306E;&#x5F62;&#x614B;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x7D44;&#x6210;&#x7269;&#x306F;&#x3001;&#x6728;&#x6750;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x8981;&#x56E0;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x88AB;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x5408;&#x6210;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306B;&#x76F8;&#x540C;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x3068;&#x30D8;&#x30DF;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x5408;&#x6210;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x63A8;&#x5B9A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x63A8;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x4E8C;&#x6B21;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x914D;&#x5217;&#x3001;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20;&#x69D8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3001;&#x819C;&#x7D50;&#x5408;&#x578B;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30B0;&#x30EB;&#x30AB;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3001;&#x30B9;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3001;UDP-&#x30B0;&#x30EB;&#x30B3;&#x30FC;&#x30B9;&#x30D4;&#x30ED;&#x30DB;&#x30B9;&#x30DB;&#x30EA;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x53CA;&#x3073;GDP-&#x30DE;&#x30F3;&#x30CE;&#x30FC;&#x30B9;&#x30D4;&#x30ED;&#x30DB;&#x30B9;&#x30DB;&#x30EA;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x767A;&#x73FE;&#x914D;&#x5217;&#x30BF;&#x30B0;&#xFF08;EST&#xFF09;&#x306E;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3067;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x304B;&#x3089;&#x3002;&#x30D5;&#x30EB;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B0;&#x30B9;&#x306E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x914D;&#x5217;&#x306F;&#x3001;&#x6728;&#x90E8;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x304B;&#x3089;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x304B;&#x3089;&#x5358;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x305F;cDNA&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3;&#x304B;&#x3089;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x3068;&#x88AB;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x5206;&#x985E;&#x304B;&#x3089;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x9593;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;&#x3068;&#x8840;&#x7BA1;&#x7D44;&#x7E54;&#x4E2D;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;&#x30EA;&#x30A2;&#x30EB;&#x30BF;&#x30A4;&#x30E0;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x9006;&#x8EE2;&#x5199;&#x9175;&#x7D20; - &#x30DD;&#x30EA;&#x30E1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x9023;&#x9396;&#x53CD;&#x5FDC;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5B9F;&#x65BD;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x63A8;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x5408;&#x6210;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x8840;&#x7BA1;&#x7D44;&#x7E54;&#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;&#x9AD8;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x767A;&#x73FE;&#x3057;&#x305F;&#x3068;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306F;&#x5DEE;&#x6728;&#x90E8;&#x3068;&#x5E2B;&#x90E8;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x4E2D;&#x306B;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x63A8;&#x8AD6;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3068;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306F;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x70AD;&#x6C34;&#x5316;&#x7269;&#x306E;&#x5408;&#x6210;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5F79;&#x5272;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x88F8;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x3068;&#x88AB;&#x5B50;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x5206;&#x985E;&#x7FA4;&#x306E;&#x76F8;&#x540C;&#x6728;&#x6750;&#x5F62;&#x6210;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x4FDD;&#x5168;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;

&#x7CD6;&#x8CEA;&#x95A2;&#x9023;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3068;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x8840;&#x7BA1;&#x7D44;&#x7E54;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x751F;&#x5408;&#x6210;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF09;

&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.), &#xAC00;&#xC7A5; &#xB110;&#xB9AC; &#xBBF8;&#xAD6D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD2B8;&#xB9AC; &#xC885; &#xC2EC;&#xC740;, &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC18C;&#xBE44;&#xC790; &#xC81C;&#xD488;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB098;&#xBB34;&#xC640; &#xB098;&#xBB34; &#xC12C;&#xC720;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC6D0;&#xCC9C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB098;&#xBB34; &#xC12C;&#xC720;&#xB294; &#xC8FC;&#xB85C; 2 &#xCC28; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD;&#xC758; &#xAD6C;&#xC131; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC140; &#xB8F0; &#xB85C;&#xC2A4;, hemicelluloses, lignin &#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xC8FC;&#xC694; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;. &#xC12C;&#xC720; &#xD615;&#xD0DC; &#xBC0F; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD; &#xC870;&#xC131;&#xC740; &#xB098;&#xBB34; &#xC18D;&#xC131;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xACB0;&#xC815; &#xC694;&#xC778;. &#xBE44;&#xAD50; &#xC720;&#xC804;&#xCCB4;&#xD559; &#xC720;&#xC804;&#xC790; angiosperms&#xC758; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xB8E8; &#xB41C; &#xB3D9;&#xC885;&#xACFC; &#xD30C;&#xC778; &#xC140; &#xB8F0; &#xB85C;&#xC2A4;&#xC640; hemicellulose &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC0C1; 2 &#xCC28; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD; &#xC140; &#xB8F0; &#xB85C;&#xC2A4; synthase &#xC720;&#xC804;&#xC790;, &#xC140; &#xB8F0; &#xB85C;&#xC2A4; synthase &#xAC19;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790;, &#xBA64;&#xBE0C;&#xB808;&#xC778; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; endoglucanase &#xC720;&#xC804;&#xC790;, &#xC790;&#xB2F9; synthase &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;, UDP-&#xD3EC;&#xB3C4; &#xB2F9; pyrophosphorylase &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; GDP &#xC2A4; pyrophosphorylase &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD0DC;&#xADF8; (EST) &#xCEEC;&#xB809;&#xC158;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB410;&#xB2E4;. &#xC804;&#xCCB4; &#xAE38;&#xC774; &#xCF54;&#xB529; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; xylem &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACE0;&#xB9BD; &#xB41C; cDNA &#xD074;&#xB860;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5BB;&#xC740; &#xD588;&#xB2E4;. &#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; angiosperm taxa phylogenetic &#xAD00;&#xACC4; &#xC870;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4; &#xD558; &#xACE0; &#xC591;&#xC801;, &#xC2E4;&#xC2DC;&#xAC04; &#xC5ED;&#xC804;&#xC0AC; &#xC911; &#xD569; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC5F0;&#xC1C4; &#xBC18;&#xC751;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2E4;&#xC2DC; &#xD558;&#xB294; transcriptional &#xD608;&#xAD00; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1;. &#xC0C1; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD; &#xD569;&#xC131; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD588;&#xB2E4; &#xD608;&#xAD00; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB192;&#xC740; &#xC218;&#xC900;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xACFC; &#xD558;&#xC704; &#xC9D1;&#xD569; &#xBB3C; &#xAD00; &#xBD80;&#xC640; &#xCCB4; &#xAD00; &#xBD80; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC28;&#xB3D9; &#xADDC;&#xC81C; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC720;&#xCD94; phylogenetic &#xAD00;&#xACC4;&#xC640; &#xC2DD; &#xD328;&#xD134;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD;&#xC758; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xD0C4;&#xC218;&#xD654;&#xBB3C;&#xC758; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xC5ED;&#xD560;&#xACFC; &#xC77C;&#xAD00; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; gymnosperm &#xBC0F; angiosperm taxa&#xC5D0; &#xB3D9;&#xC885; &#xB098;&#xBB34; &#xD615;&#xC131; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBCF4;&#xC874;&#xC744; &#xD558;&#xC2DC;&#xAE30; &#xBC14;&#xB78D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xD0C4;&#xC218;&#xD654;&#xBB3C; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda)&#xC758; &#xD608;&#xAD00; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD; &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;.

Pino taeda (Pinus taeda L.), las especies arb&#xF3;reas m&#xE1;s plantadas en los Estados Unidos, es una importante fuente de madera y fibras de madera para una multitud de productos de consumo. Las fibras de madera est&#xE1;n compuestos principalmente de las paredes celulares secundarias, y la celulosa, hemicelulosa y lignina son los principales componentes de la madera. Morfolog&#xED;a de la fibra y la composici&#xF3;n de la pared celular son determinantes importantes de propiedades de la madera. Hemos utilizado la gen&#xF3;mica comparativa para identificar genes implicados en la s&#xED;ntesis de la celulosa y la hemicelulosa de pino taeda que son hom&#xF3;logos a los genes implicados en la s&#xED;ntesis de la pared celular en las angiospermas. Secuencias que codifican supuestos secundarios de la pared celular de la celulosa sintasa genes, los genes de la celulosa sintasa-como, un gen endoglucanasa unida a la membrana, un gen de sacarosa sintasa, un gen pirofosforilasa UDP-glucosa y el PIB-manosa pirofosforilasa genes fueron identificados en la etiqueta de secuencia expresada (EST) colecciones de pino taeda. De longitud completa secuencias codificantes se obtuvieron a partir de clones de ADNc aislados a partir de una biblioteca construida a partir de desarrollo xilema. Las relaciones filogen&#xE9;ticas entre los genes de pino taeda y taxones de angiospermas fueron examinados y perfiles de transcripci&#xF3;n en los tejidos vasculares se llev&#xF3; a cabo en tiempo real de reacci&#xF3;n cuantitativa, en cadena de la polimerasa-transcriptasa. Las supuestas c&#xE9;lulas genes s&#xED;ntesis de la pared se expresa en altos niveles en los tejidos vasculares y un subconjunto se regul&#xF3; de manera diferencial en los tejidos del xilema y floema. Inferidos relaciones filogen&#xE9;ticas y patrones de expresi&#xF3;n para los genes de pino de incienso fueron consistentes con papeles en la s&#xED;ntesis de hidratos de carbono complejos de la pared celular. Estos estudios sugieren la conservaci&#xF3;n funcional de los genes hom&#xF3;logos de madera en la formaci&#xF3;n de gimnospermas y angiospermas.

Hidratos de carbono relacionadas con los genes y la bios&#xED;ntesis de la pared celular en los tejidos vasculares de pino taeda (Pinus taeda)

&#x4ECE; ACC &#x6C27;&#x5316;&#x9176;&#x57FA;&#x56E0; (PtACO1) &#x548C;&#x5176;&#x51E0;&#x4E4E;&#x76F8;&#x540C; paralog (NIP) (PtACO2) &#x7684;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.&#xFF09; &#x7684;&#x521B;&#x529E;&#x4EBA;&#x662F;&#x4ECE;&#x4F7F;&#x7528; PCR &#x6269;&#x589E;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; DNA &#x4E2D;&#x6062;&#x590D;&#x3002;&#x8F6C;&#x57FA;&#x56E0;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x690D;&#x7269;&#x5BB9;&#x9057;&#x4F20;&#x6784;&#x9020;&#x4ECE;&#x54EA;&#x4E2A;&#x75C5;&#x7406;&#x6027; (GUS) &#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x662F;&#x7531;&#x5168;&#x957F; &#xFF08;pACO1:GUS&#xFF0C;pACO2:GUS) &#x9A71;&#x52A8;&#x6216;&#x622A;&#x65AD; &#xFF08;pACO1-1.2:GUS&#x3001; pACO2-1.2:GUS) &#x706B;&#x70AC;&#x677E; ACC &#x6C27;&#x5316;&#x9176;&#x57FA;&#x56E0;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x663E;&#x793A;&#x4E3A;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6784;&#x9020;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x7684;&#x72EC;&#x7279;&#x6A21;&#x5F0F;&#x3002;&#x5168;&#x957F;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6784;&#x9020;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x90A3;&#x4E9B;&#x4F7F;&#x7528;&#x622A;&#x65AD;&#x7684;&#x5BA3;&#x4F20;&#x5458;&#xFF0C;&#x56DE;&#x7B54;&#x4E86;&#x5432;&#x54DA;-3-&#x4E59;&#x9178; (IAA) &#x548C;&#x4F24;&#x4EBA;&#x3002;PACO1:GUS &#x548C; pACO1-1.2:GUS &#x56DE;&#x5E94;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x7684;&#x653B;&#x51FB;&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x65E2;&#x4E0D;&#x7248;&#x672C;&#x7684; pACO2 &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x56DE;&#x5E94;&#x611F;&#x67D3;&#x3002;&#x5728;&#x82B1;&#x5E8F;&#x79F8;&#x79C6;&#x3001; &#x5168;&#x957F; pACO1 &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6784;&#x9020;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x88AB;&#x622A;&#x65AD;&#x7684; pACO1-1.2:GUS &#x6216;&#x4EFB;&#x4E00; pACO2 &#x6784;&#x9020;&#xFF0C;&#x5F2F;&#x66F2;&#x5E94;&#x529B;&#x7684;&#x54CD;&#x5E94;&#x3002;&#x5F53;&#x5F00;&#x82B1;&#x8F6C;&#x57FA;&#x56E0;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x690D;&#x7269;&#x88AB;&#x653E;&#x7F6E;&#x5728;&#x6C34;&#x5E73;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x4EE5;&#x7528;&#x4E8E; 48 h &#x65F6;&#xFF0C;&#x4ECE; pACO2:GUS&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x7684;&#x5176;&#x4ED6;&#x6784;&#x9020;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x88AB;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x4E0B;&#x4FA7;&#x82BD;&#x7ECF;&#x5386;&#x4E0B;&#x90E8;&#x8C03;&#x6574;&#x65B9;&#x5411;&#x3002;PACO2:GUS &#x6784;&#x9020;&#x8F6C;&#x57FA;&#x56E0;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x4E2D;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x6A21;&#x5F0F;&#x662F;&#x7B26;&#x5408;&#x53EF;&#x80FD;&#x88AB;&#x671F;&#x671B;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x53C2;&#x4E0E;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x7684;&#x538B;&#x7F29;&#x6728;&#x53CD;&#x5E94;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x9644;&#x8FD1; PtACO1 &#x548C; PtACO2 &#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5B8C;&#x6574;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x8BC6;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x963B;&#x6B62;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4EA7;&#x54C1;&#x7684;&#x5B9A;&#x91CF;&#xFF0C;&#x5728;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x63D0;&#x51FA;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x8868;&#x8FBE;&#x5206;&#x6790;&#x63D0;&#x4F9B;&#x6709;&#x529B;&#x7684;&#x8BC1;&#x636E;&#x4E24;&#x4E2A; ACC &#x6C27;&#x5316;&#x9176;&#x57FA;&#x56E0;&#x53EF;&#x80FD;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x793A;&#x5E76;&#x56DE;&#x5E94;&#x4E0D;&#x540C;&#x5916;&#x90E8;&#x523A;&#x6FC0;&#x7684;&#x677E;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x5728;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x5BF9;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E4B;&#x95F4;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x5DEE;&#x5F02;&#x3002;

&#x4ECE;&#x51E0;&#x4E4E;&#x5B8C;&#x5168;&#x76F8;&#x540C;&#x7684;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.) paralogs &#x5BA3;&#x4F20;&#x5458;&#x7684;&#x4E0D;&#x540C;&#x53CD;&#x5E94;ACC &#x6C27;&#x5316;&#x9176;&#x5BF9;&#x8F6C;&#x57FA;&#x56E0;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x4E2D;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x548C;&#x975E;&#x751F;&#x7269;&#x538B;&#x529B;&#x3002;

Promoters from an ACC oxidase gene (PtACO1) and its nearly identical paralog (NIP) (PtACO2) of loblolly pine (Pinus taeda L.) were recovered from genomic DNA using PCR amplification. Transgenic Arabidopsis plants harboring genetic constructs from which beta-glucuronidase (GUS) expression was driven by the full-length (pACO1:GUS, pACO2:GUS) or truncated (pACO1-1.2:GUS, pACO2-1.2:GUS) loblolly pine ACC oxidase gene promoters displayed distinctive patterns of expression for the different promoter constructs. Both full-length promoter constructs, but not those using truncated promoters, responded to indole-3-acetic acid (IAA) and wounding. Both pACO1:GUS and pACO1-1.2:GUS responded to pathogen attack, while neither version of the pACO2 promoter responded to infection. In the inflorescence stalks, the full-length pACO1 promoter construct, but not the truncated pACO1-1.2:GUS or either pACO2 construct, responded to bending stress. When flowering transgenic Arabidopsis plants were placed in a horizontal position for 48 h, expression from pACO2:GUS, but not the other constructs, was induced on the underside of shoots undergoing gravitropic reorientation. The expression pattern for the pACO2:GUS construct in transgenic Arabidopsis was consistent with what might be expected for a gene promoter involved in the compression wood response in loblolly pine. Although near complete sequence identity between PtACO1 and PtACO2 transcripts prevented quantitation of specific gene products, the promoter expression analyses presented in this study provide strong evidence that the two ACC oxidase genes are likely differentially expressed and responded to different external stimuli in pine. These results are discussed with respect to the potential functional differences between these two genes in loblolly pine.

Differential responses of the promoters from nearly identical paralogs of loblolly pine (Pinus taeda L.) ACC oxidase to biotic and abiotic stresses in transgenic Arabidopsis thaliana.

Les promoteurs d&#x26;#39;un g&#xE8;ne ACC oxydase (PtACO1) et son paralogue presque identique (PIN) (PtACO2) de pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.) ont &#xE9;t&#xE9; r&#xE9;cup&#xE9;r&#xE9;s &#xE0; partir d&#x26;#39;ADN g&#xE9;nomique en utilisant l&#x26;#39;amplification par PCR. Plants transg&#xE9;niques d&#x26;#39;Arabidopsis abritant des constructions g&#xE9;n&#xE9;tiques &#xE0; partir de laquelle la beta-glucuronidase (GUS) a &#xE9;t&#xE9; stimul&#xE9;e par l&#x26;#39;expression de la pleine longueur (pACO1: GUS, PaCO2: GUS) ou tronqu&#xE9;e (pACO1-1.2: GUS, PaCO2-1.2: GUS) oxydase pin &#xE0; encens ACC promoteurs de g&#xE8;nes affich&#xE9; motifs distinctifs d&#x26;#39;expression pour les constructions de promoteur diff&#xE9;rentes. Les deux constructions de promoteur de longue dur&#xE9;e, mais pas celles des promoteurs utilisant tronqu&#xE9;es, ont r&#xE9;pondu &#xE0; l&#x26;#39;indole-3-ac&#xE9;tique (IAA) et en blessant. Les deux pACO1: GUS et pACO1-1.2: GUS a r&#xE9;pondu aux attaques des agents pathog&#xE8;nes, tandis que ni la version du promoteur PACO2 r&#xE9;pondu &#xE0; l&#x26;#39;infection. Dans les tiges des inflorescences, la pleine longueur pACO1 promoteur de construire, mais pas le tronc pACO1-1.2: GUS ou soit construit PaCO2, a r&#xE9;pondu &#xE0; la flexion. Lorsque fleurs plants transg&#xE9;niques d&#x26;#39;Arabidopsis ont &#xE9;t&#xE9; plac&#xE9;s dans une position horizontale pendant 48 h, l&#x26;#39;expression de PaCO2: GUS, mais pas les autres constructions, a &#xE9;t&#xE9; induite sur la face inf&#xE9;rieure des pousses en cours de r&#xE9;orientation gravitropique. Le profil d&#x26;#39;expression de la PaCO2: GUS construire chez Arabidopsis transg&#xE9;nique &#xE9;tait compatible avec ce qu&#x26;#39;on pourrait attendre d&#x26;#39;un promoteur du g&#xE8;ne impliqu&#xE9; dans la r&#xE9;ponse du bois de compression dans le pin &#xE0; encens. Bien que pr&#xE8;s de l&#x26;#39;identit&#xE9; de s&#xE9;quence compl&#xE8;te entre PtACO1 et PtACO2 transcriptions emp&#xEA;ch&#xE9; la quantification de produits de g&#xE8;nes sp&#xE9;cifiques, les analyses d&#x26;#39;expression promoteur pr&#xE9;sent&#xE9;s dans cette &#xE9;tude fournissent des preuves solides que les deux g&#xE8;nes sont susceptibles ACC oxydase diff&#xE9;rentiellement exprim&#xE9;s et ont r&#xE9;pondu aux diff&#xE9;rents stimuli externes en pin. Ces r&#xE9;sultats sont discut&#xE9;s en ce qui concerne les diff&#xE9;rences de potentiel fonctionnelles entre ces deux g&#xE8;nes chez le pin &#xE0; encens.

Les r&#xE9;ponses diff&#xE9;rentielles des promoteurs de paralogues presque identique de pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.) ACC oxydase aux stress biotiques et abiotiques chez Arabidopsis thaliana transg&#xE9;nique

Projekttr&auml;ger aus einem ACC-Oxydase-gen (PtACO1) und seine fast identische Paralog (NIP) (PtACO2) der Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda L.) wurden von genomic DNA mit PCR Verst&auml;rkung erholt. Arabidopsis transgene Pflanzen Entwurfsdokumente genetischen Konstrukte aus dem Beta-Glukuronidase (GUS) Ausdruck war getrieben von den in (pACO1:GUS, pACO2:GUS) oder abgeschnitten (pACO1-1.2:GUS, pACO2-1.2:GUS) Loblolly Pine-ACC-Oxydase-gen-Promotoren angezeigt charakteristischen Muster des Ausdrucks f&uuml;r die verschiedenen Projekttr&auml;ger-Konstrukte. Sowohl in Projekttr&auml;ger Konstrukte, aber nicht jene, die mit abgeschnittene Promotoren, reagierte auf die Indol-3-Essigs&auml;ure (IAA) und Verwundung. PACO1:GUS und pACO1-1.2:GUS reagierte auf Erreger Angriff, w&auml;hrend keiner Fassung des Projekttr&auml;gers pACO2 auf Infektionen reagiert. In der Bl&uuml;tenstand Stiele, die in pACO1-Promotor-Konstrukt, aber nicht die abgeschnittene pACO1-1.2:GUS oder entweder pACO2-Konstrukt, reagierte auf die Biegespannung. Transgene Arabidopsis Bl&uuml;tenpflanzen in einer horizontalen Position f&uuml;r 48 h platziert wurden, war Ausdruck von pACO2:GUS, aber nicht die andere Konstrukte, auf der Unterseite der Triebe Gravitropic Neuorientierung unterzogen induziert. Die Muster des Ausdrucks f&uuml;r die pACO2:GUS-Konstrukt in transgenen Arabidopsis wurde im Einklang mit was f&uuml;r ein Gen-F&ouml;rderer der Kompression Holz Antwort in Loblolly Pine beteiligt zu erwarten. Obwohl in der N&auml;he von komplette Sequenz Identit&auml;t zwischen PtACO1 und PtACO2 Abschriften quantitative Bestimmung der spezifischen Genprodukte verhindert, bieten die Projekttr&auml;ger Ausdruck-Analysen, die in dieser Studie vorgestellt zuverl&auml;ssig nachgewiesen, dass die beiden ACC-Oxydase-Gene sind wahrscheinlich differenziell ausgedr&uuml;ckt und auf verschiedene &auml;u&szlig;ere Reize in Kiefer reagiert. Diese Ergebnisse werden in Bezug auf die m&ouml;glichen funktionale Unterschiede zwischen diesen zwei Gene in Loblolly Pine diskutiert.

Differenzielle Antworten der F&ouml;rderer von nahezu identische Paralogs der Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda L.) ACC-Oxydase, biotische und abiotische Belastungen in transgenen Arabidopsis Thaliana.

Promotori da un ACC ossidasi gene (PtACO1) e relativo paralog quasi identico (NIP) (PtACO2) del loblolly pine (Pinus taeda L.) sono stati recuperati dal DNA genomico mediante amplificazione di PCR. Arabidopsis transgenico piante harboring costrutti genetici da cui beta-glucuronidasi (GUS) espressione era guidato da full-length (pACO1:GUS, pACO2:GUS) o troncato (pACO1-1.2:GUS, pACO2-1.2:GUS) promotori di pino loblolly ACC ossidasi gene visualizzato caratteristico pattern di espressione per i costrutti diversi promotore. Sia costrutti full-length promotore, ma non quelli tramite promotori troncati, ha risposto a Acido indol-3-acetico (IAA) e ferendo. Sia pACO1:GUS e pACO1-1.2:GUS ha risposto all&#39;attacco del patogeno, mentre nessuna versione del promotore della pACO2 reagito all&#39;infezione. I gambi di infiorescenza, il costrutto di promotore pACO1 full-length, ma non il tronco pACO1-1.2:GUS o sia costrutto pACO2, ha risposto alle sollecitazioni di flessione. Quando la fioritura piante transgeniche di Arabidopsis sono stati collocati in posizione orizzontale per 48 h, espressione da pACO2:GUS, ma non gli altri costrutti, &egrave; stata indotta sulla parte inferiore dei germogli in fase di riorientamento gravitropic. Il pattern di espressione per il costrutto pACO2:GUS in Arabidopsis transgenico &egrave; stato coerenza con quello che potrebbe essere previsto per un promotore del gene coinvolti nella risposta a loblolly pine legno compressione. Anche se nei pressi di identit&agrave; della sequenza completa tra PtACO1 e PtACO2 trascrizioni ha impedito la quantificazione dei prodotti del gene specifico, l&#39;analisi di espressione promotore ha presentati in questo studio forniscono forte evidenza che i due geni ACC ossidasi sono probabilmente differenzialmente espressi e ha risposto a diversi stimoli esterni in legno di pino. Questi risultati sono discussi per quanto riguarda le potenziali differenze funzionali tra questi due geni loblolly Pine.

Risposte differenziale dei promotori da paralogs quasi identica del loblolly pine (Pinus taeda L.) Ossidasi ACC a stress biotici e abiotici in thaliana di Arabidopsis transgenico.

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;ACC&#x9178;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#xFF08;PtACO1&#xFF09;&#x3068;&#x307B;&#x307C;&#x540C;&#x3058;&#x30D1;&#x30E9;&#x30ED;&#x30B0;&#xFF08;NIP&#xFF09;&#xFF08;PtACO2&#xFF09;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x7531;&#x6765;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;PCR&#x5897;&#x5E45;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;DNA&#x304B;&#x3089;&#x56DE;&#x53CE;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5207;&#x308A;&#x6368;&#x3066;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#xFF08;pACO1-1.2&#xFF1A;GUS&#x3001;&#x30AC;&#x30B9;&#x5206;&#x6790;-1.2&#xFF1A;GUS&#xFF09;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;ACC&#x30AA;&#x30AD;&#x30B7;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC;&#x3001;&#x3B2;-&#x30B0;&#x30EB;&#x30AF;&#x30ED;&#x30CB;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC;&#xFF08;GUS&#xFF09;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306F;&#x30D5;&#x30EB;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B0;&#x30B9;&#xFF08;&#xFF1A;GUS&#x3001;&#x30AC;&#x30B9;&#x5206;&#x6790;GUS pACO1&#xFF09;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x99C6;&#x52D5;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x69CB;&#x7BC9;&#x7269;&#x3092;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CB;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x69CB;&#x7BC9;&#x7269;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x7279;&#x5FB4;&#x7684;&#x306A;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x304C;&#x8868;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30D5;&#x30EB;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B0;&#x30B9;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x69CB;&#x7BC9;&#x7269;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x5207;&#x308A;&#x6368;&#x3066;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x30FC;&#x30EB;-3  - &#x9162;&#x9178;&#xFF08;IAA&#xFF09;&#x3068;&#x8CA0;&#x50B7;&#x306B;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3057;&#x305F;&#x3002; pACO1&#x4E21;&#x65B9;GUS&#x3068;pACO1-1.2&#xFF1A;&#x30AC;&#x30B9;&#x5206;&#x6790;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x3069;&#x3061;&#x3089;&#x306E;&#x30D0;&#x30FC;&#x30B8;&#x30E7;&#x30F3;&#x3067;&#x306F;&#x611F;&#x67D3;&#x75C7;&#x306B;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3057;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x3001;GUS&#x306F;&#x3001;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x306E;&#x653B;&#x6483;&#x306B;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x82B1;&#x5E8F;&#x830E;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x30D5;&#x30EB;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B0;&#x30B9;pACO1&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B3;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C8;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x3001;pACO1-1.2&#x5207;&#x308A;&#x6368;&#x3066;&#xFF1A;GUS&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x306E;&#x30AC;&#x30B9;&#x5206;&#x6790;&#x30B3;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x66F2;&#x3052;&#x5FDC;&#x529B;&#x306B;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x958B;&#x82B1;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CB;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x690D;&#x7269;&#x306F;48&#x6642;&#x9593;&#x3001;&#x30AC;&#x30B9;&#x5206;&#x6790;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6C34;&#x5E73;&#x65B9;&#x5411;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x306B;&#x914D;&#x7F6E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5834;&#x5408;&#xFF1A;GUS&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x4ED6;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x3001;&#x91CD;&#x529B;&#x65B9;&#x5411;&#x8EE2;&#x63DB;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x3066;&#x30B7;&#x30E5;&#x30FC;&#x30C8;&#x306E;&#x4E0B;&#x5074;&#x200B;&#x200B;&#x306B;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x30AC;&#x30B9;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#xFF1A;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CB;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;GUS&#x30B3;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x5727;&#x7E2E;&#x6728;&#x6750;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x671F;&#x5F85;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3082;&#x306E;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x305F;&#x3002; PtACO1&#x3068;PtACO2&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x307B;&#x307C;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x914D;&#x5217;&#x540C;&#x4E00;&#x6027;&#x306F;&#x3001;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7523;&#x7269;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x3092;&#x59A8;&#x3052;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x767A;&#x73FE;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x306F;&#x3001;2&#x3064;&#x306E;ACC&#x9178;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x9AD8;&#x3044;&#x793A;&#x5DEE;&#x7684;&#x306B;&#x767A;&#x73FE;&#x3055;&#x3068;&#x677E;&#x306E;&#x3055;&#x307E;&#x3056;&#x307E;&#x306A;&#x5916;&#x90E8;&#x523A;&#x6FC0;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x5F37;&#x3044;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x3053;&#x308C;&#x3089;2&#x3064;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x9593;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x306B;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x8AAC;&#x660E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x307B;&#x307C;&#x540C;&#x3058;&#x30D1;&#x30E9;&#x30ED;&#x30B0;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x5F62;&#x8CEA;&#x8EE2;&#x63DB;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x751F;&#x7269;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x975E;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x3078;&#x306E;ACC&#x9178;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x5DEE;&#x52D5;&#x5FDC;&#x7B54;

ACC &#xC0B0;&#xD654; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; (PtACO1)&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.)&#xC758; &#xAC70;&#xC758; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; paralog (NIP) (PtACO2)&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xAC8C;&#xB188; DNA&#xB294; PCR &#xD655;&#xB300;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD68C;&#xC218; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCC0;&#xD615; Arabidopsis &#xC740;&#xB2C9; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAD6C;&#xC870;&#xB294; &#xBCA0;&#xD0C0;-glucuronidase (&#xAC70; &#xC2A4;)&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2DD;&#xC740; &#xC804;&#xCCB4; &#xAE38;&#xC774; (pACO1:GUS, pACO2:GUS)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xAD6C;&#xB3D9; &#xB610;&#xB294; &#xC798;&#xB9B0; &#xC2DD;&#xBB3C; (pACO1-1.2:GUS, pACO2-1.2:GUS)&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; ACC &#xC0B0;&#xD654; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; &#xB2E4;&#xB978; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xAD6C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2DD;&#xC758; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC804;&#xCCB4; &#xAE38;&#xC774; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xAD6C;&#xBB38;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xADF8; &#xC798;&#xB9B0;&#xB41C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC751;&#xB2F5; indole 3 &#xCD08;&#xC758; &#xC0B0; (IAA) &#xBC0F; &#xBD80;&#xC0C1;. PACO1:GUS &#xBC0F; pACO1-pACO2 &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC758; &#xC5B4;&#xB290; &#xBC84;&#xC804; &#xAC10;&#xC5FC;&#xC5D0; &#xBC18;&#xC751; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; 1.2:GUS &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4;&#xC758; &#xACF5;&#xACA9;&#xC5D0; &#xB300;&#xC751; &#xD588;&#xB2E4;. &#xAF43;&#xC774; &#xD54C; &#xC904;&#xAE30;, &#xC804;&#xCCB4; &#xAE38;&#xC774; pACO1 &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xAD6C;&#xC131;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xC798;&#xB9B0;&#xB41C; pACO1-1.2:GUS &#xB610;&#xB294; &#xC808;&#xACE1; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xBC18;&#xC751;&#xC744; pACO2 &#xAD6C;&#xBB38; &#xC911; &#xD558;&#xB098;. &#xAF43; &#xD53C;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCC0;&#xD615; Arabidopsis &#xC2DD;&#xBB3C; 48 h&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC00;&#xB85C; &#xC704;&#xCE58;&#xC5D0; &#xBC30;&#xCE58; &#xD588;&#xB2E4;, pACO2:GUS, &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD558;&#xC9C0; &#xB2E4;&#xB978; &#xAD6C;&#xBB38;&#xC5D0;&#xC11C; gravitropic &#xC7AC;&#xAD50;&#xC721;&#xC744; &#xBC1B;&#xACE0; &#xCD2C;&#xC601; &#xBC11;&#xBA74;&#xC5D0; &#xC720;&#xB3C4; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCC0;&#xD615; Arabidopsis pACO2:GUS &#xAD6C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2DD; &#xD328;&#xD134; &#xBB34;&#xC2A8; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xC555;&#xCD95; &#xBAA9;&#xC7AC; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC608;&#xC0C1; &#xB420; &#xC218;&#xB3C4;&#xC640; &#xC77C;&#xCE58; &#xD588;&#xB2E4;. Ptaco1&#xC640; PtACO2 &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC815;&#xCCB4;&#xC131; &#xADFC;&#xCC98; &#xB179;&#xCDE8; &#xB85D;&#xC744; &#xD2B9;&#xC815; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC81C;&#xD488;&#xC758; &#xC815;&#xB7C9; &#xBC29;&#xD574;,&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC81C;&#xC2DC; &#xD558;&#xB294; &#xBAA8;&#xD130; &#xC2DD; &#xBD84;&#xC11D; &#xB450; ACC &#xC0B0;&#xD654; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB294; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; &#xCC28;&#xB3D9; &#xD45C;&#xD604; &#xBC0F; &#xC751;&#xB2F5; &#xD558;&#xB294; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC678;&#xBD80; &#xC790;&#xADF9;&#xC5D0; &#xAC15;&#xD55C; &#xC99D;&#xAC70;&#xAC00; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACB0;&#xACFC;&#xACFC; &#xD30C;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC774; &#xB450; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC04;&#xC758; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xAE30;&#xB2A5; &#xCC28;&#xC774; &#xB300;&#xD574; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.)&#xC758; &#xAC70;&#xC758; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; paralogs&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xCC28;&#xB3D9; &#xC751;&#xB2F5; ACC &#xC0B0;&#xD654; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCC0;&#xD615; Arabidopsis thaliana&#xC5D0;&#xC11C; biotic &#xBC0F; abiotic &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4;&#xC5D0;.

Los promotores de un gen de la ACC oxidasa (PtACO1) y su paralog casi id&#xE9;ntico (PIN) (PtACO2) de pino taeda (Pinus taeda L.) se recuperaron a partir de ADN gen&#xF3;mico utilizando amplificaci&#xF3;n por PCR. Las plantas transg&#xE9;nicas de Arabidopsis que albergan construcciones gen&#xE9;ticas de la que fue impulsada beta-glucuronidasa (GUS) la expresi&#xF3;n por la de larga duraci&#xF3;n (pACO1: GUS, PaCO2: GUS) o truncado (pACO1-1.2: GUS, PaCO2-1.2: GUS) oxidasa pino tea ACC promotores de genes muestran patrones distintivos de expresi&#xF3;n para las construcciones del promotor diferentes. Ambos de larga duraci&#xF3;n en construcciones del promotor, pero no las promotores utilizando truncados, respondieron a indol-3-ac&#xE9;tico (IAA) y heridas. Tanto pACO1: GUS y pACO1 1.2: GUS respondi&#xF3; al ataque de pat&#xF3;genos, mientras que ninguna de las versiones del promotor paCO2 respondi&#xF3; a la infecci&#xF3;n. En los tallos de la inflorescencia, el de larga duraci&#xF3;n pACO1 promotor construir, pero no el tronco pACO1-1.2: GUS o bien construir la PaCO 2, respondi&#xF3; a la flexi&#xF3;n. Cuando florecientes plantas transg&#xE9;nicas de Arabidopsis se colocaron en una posici&#xF3;n horizontal durante 48 h, la expresi&#xF3;n de paCO2: GUS, pero no las otras construcciones, se indujo en la parte inferior de brotes sometidos reorientaci&#xF3;n gravitr&#xF3;pico. El patr&#xF3;n de expresi&#xF3;n de la PaCO 2: GUS construir en Arabidopsis transg&#xE9;nica fue consistente con lo que cabr&#xED;a esperar para un promotor del gen implicado en la respuesta de la madera de compresi&#xF3;n en Pinus taeda. Aunque la identidad de secuencia casi completa entre PtACO1 y transcripciones PtACO2 impidi&#xF3; la cuantificaci&#xF3;n de los productos de genes espec&#xED;ficos, los an&#xE1;lisis de la expresi&#xF3;n del promotor que se presentan en este estudio proporcionan una fuerte evidencia de que los dos genes ACC oxidasa es probable expresados &#x200B;&#x200B;diferencialmente y respondi&#xF3; a diferentes est&#xED;mulos externos en madera de pino. Estos resultados se discuten con respecto a las diferencias de potencial funcionales entre estos dos genes en pino de incienso.

Las respuestas diferenciales de los promotores de paralogs casi id&#xE9;nticas de pino taeda (Pinus taeda L.) oxidasa ACC a estr&#xE9;s bi&#xF3;tico y abi&#xF3;tico en Arabidopsis thaliana transg&#xE9;nicas

&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.&#xFF09; &#x5168;&#x7403;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5206;&#x6790;&#x662F;&#x7531;&#x4E8E;&#x6709;&#x9650;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x5DE5;&#x5177;&#x5177;&#x6709;&#x6311;&#x6218;&#x6027;&#x3002;PtGen2&#xFF0C;26,496 &#x529F;&#x80FD;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#xFF0C;&#x662F;&#x634F;&#x9020;&#xFF0C;&#x5E76;&#x7528;&#x4E8E;&#x8BC4;&#x4F30;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x7E41;&#x6B96;&#x4F53;&#x6839;&#x5E72;&#x65F1;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x4E0E;&#x52A0;&#x6743;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x76F8;&#x5173;&#x6027;&#x7F51;&#x7EDC;&#x5206;&#x6790;&#x88AB;&#x7528;&#x6765;&#x786E;&#x5B9A;&#x5E72;&#x65F1;&#x654F;&#x611F;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x8FA8;&#x522B;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x6297;&#x65F1;&#x6027;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x7840;&#x3002;

&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x65E0;&#x6807;&#x5EA6;&#x7F51;&#x7EDC;&#x786E;&#x5B9A;&#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x5E72;&#x65F1;&#x5F3A;&#x8C03;&#x6839;&#x7684;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x4F53;&#x80B2;&#x706B;&#x70AC; L.&#xFF09; &#x7684;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x3002;

Global transcriptional analysis of loblolly pine (Pinus taeda L.) is challenging due to limited molecular tools. PtGen2, a 26,496 feature cDNA microarray, was fabricated and used to assess drought-induced gene expression in loblolly pine propagule roots. Statistical analysis of differential expression and weighted gene correlation network analysis were used to identify drought-responsive genes and further characterize the molecular basis of drought tolerance in loblolly pine.

Microarray analysis and scale-free gene networks identify candidate regulators in drought-stressed roots of loblolly pine (P. taeda L.).

Analyse globale de la transcription de pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.) est difficile en raison de l&#x26;#39;insuffisance des outils mol&#xE9;culaires. PtGen2, un micror&#xE9;seau d&#x26;#39;ADNc 26496 fonctionnalit&#xE9;, a &#xE9;t&#xE9; fabriqu&#xE9; et utilis&#xE9; pour &#xE9;valuer l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes induite par la s&#xE9;cheresse dans les racines de pins &#xE0; encens de propagules. L&#x26;#39;analyse statistique de l&#x26;#39;expression diff&#xE9;rentielle et l&#x26;#39;analyse de r&#xE9;seau pond&#xE9;r&#xE9;e g&#xE8;ne de corr&#xE9;lation ont &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;s pour identifier les g&#xE8;nes sensibles &#xE0; la s&#xE9;cheresse et de mieux caract&#xE9;riser la base mol&#xE9;culaire de la tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse chez le pin &#xE0; encens.

Analyse de Microarray et des r&#xE9;seaux de g&#xE8;nes sans &#xE9;chelle identifier des r&#xE9;gulateurs candidats dans la s&#xE9;cheresse de stress Racines de pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.)

Transkriptionelle Gesamtanalyse der Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda L.) ist eine Herausforderung aufgrund der begrenzten Molekulare Werkzeuge. PtGen2, ein 26.496 Feature cDNA-Microarray, war hergestellt und zur Bewertung der D&uuml;rre-induzierte Genexpression in Loblolly Pine Diaspore Wurzeln verwendet. Statistische Analyse der differenziellen Ausdruck und gewichteten Gen Korrelation Netzwerkanalyse wurden zur D&uuml;rre-responsive Gene zu identifizieren und weitere charakterisieren die molekulare Basis Trockenheitstoleranz Loblolly Pine.

Microarray Analyse und skalenfreies gen Netzwerke identifizieren Kandidaten Regulatoren in D&uuml;rre-betonte Wurzeln der Weihrauch-Kiefer (p. Taeda L.).

Analisi globale di transcriptional del loblolly pine (Pinus taeda L.) sono difficile a causa della limitata strumenti molecolari. PtGen2, un 26.496 caratteristica cDNA microarray, &egrave; stato fabbricato e utilizzato per valutare l&#39;espressione genica indotta da siccit&agrave; nelle radici propagule loblolly pine. Analisi statistica dell&#39;espressione differenziale e analisi di rete di correlazione ponderata gene sono stati utilizzati per identificare i geni sensibili alla siccit&agrave; e caratterizzare ulteriormente le basi molecolari della tolleranza alla siccit&agrave; in loblolly pine.

Analisi di Microarray e reti scale-free gene identificano regolatori candidato nella siccit&agrave;-ha sottolineato le radici di pino loblolly (p. taeda L.).

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x8EE2;&#x5199;&#x89E3;&#x6790;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x9650;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x5206;&#x5B50;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6311;&#x6226;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; PtGen2&#x3001;26496&#x6A5F;&#x80FD;cDNA&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306F;&#x3001;&#x88FD;&#x4F5C;&#x3057;&#x3001;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x7E41;&#x6B96;&#x306E;&#x6839;&#x3067;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F;&#x3068;&#x91CD;&#x307F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x76F8;&#x95A2;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6027;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x4E7E;&#x71E5;&#x8010;&#x6027;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x76E4;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x89E3;&#x6790;&#x3068;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30EB;&#x30D5;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x3001;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C4;&#xFF08;P.&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x306E;&#x5019;&#x88DC;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;

&#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; transcriptional &#xBD84;&#xC11D;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.)&#xC758; &#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; &#xBD84;&#xC790; &#xB3C4;&#xAD6C; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xB3C4;&#xC804; &#xC774;&#xB2E4;. PtGen2, 26,496 &#xAE30;&#xB2A5; cDNA microarray &#xC870;&#xC791; &#xB418;&#xC5C8;&#xACE0;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; propagule &#xBFCC;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xAC00;&#xBB44;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD;&#xC758; &#xD1B5;&#xACC4; &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F;&#xAC00; &#xC911;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xBD84;&#xC11D; &#xAC00;&#xBB44; &#xBC18;&#xC751; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; &#xCD94;&#xAC00; &#xD2B9;&#xC131; &#xAC00;&#xBB44; &#xAD00;&#xC6A9;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xAE30;&#xC900;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;.

Microarray &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F; &#xADDC;&#xBAA8; &#xBB34;&#xB8CC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD6C4;&#xBCF4; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130; (P. taeda L.)&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xBFCC;&#xB9AC; &#xAC00;&#xBB44;&#xC744; &#xAC15;&#xC870; &#xD588;&#xB2E4;.

An&#xE1;lisis global de la transcripci&#xF3;n de pino taeda (Pinus taeda L.) es un reto debido a la escasez de herramientas moleculares. PtGen2, un microarray de 26.496 funci&#xF3;n de ADNc, se fabric&#xF3; y se utiliza para evaluar la sequ&#xED;a inducida por la expresi&#xF3;n de genes en las ra&#xED;ces de pino taeda de prop&#xE1;gulos. El an&#xE1;lisis estad&#xED;stico de la expresi&#xF3;n diferencial y el an&#xE1;lisis ponderado de la correlaci&#xF3;n gen&#xE9;tica de la red se utiliza para identificar genes de respuesta a la sequ&#xED;a y caracterizar las bases moleculares de la tolerancia a la sequ&#xED;a en el pino de incienso.

An&#xE1;lisis de microarrays y redes libres de escala de genes reguladores Identificar candidatos en la sequ&#xED;a estr&#xE9;s ra&#xED;ces del pino tea (P. taeda L.)

Jeffrey F. D. Dean

Warnell School of Forestry and Natural Resources

University of Georgia (UGA)

Processing the Loblolly Pine PtGen2 cDNA Microarray

An Improved Method of RNA Isolation from Loblolly Pine (P. taeda L.) and Other Conifer Species

Jeffrey F. D. Dean

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Warnell School of Forestry and Natural Resources

University of Georgia (UGA)

Processing the Loblolly Pine PtGen2 cDNA Microarray

An Improved Method of RNA Isolation from Loblolly Pine (P. taeda L.) and Other Conifer Species

Warnell School of Forestry and Natural Resources