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이 동영상은 호기성 곰팡이로 리그노셀룰로오스성 식물 조직의 저하를 연구하기위한 통제된 환경의 접근 방식을 보여줍니다. 영양 소스 및 습기를 제어하는 능력은 한천 블록 microcosms의 주요 장점이지만, 그 접근 방식은 종종 혼합 성공을 산출. 우리는 재현성, 낮은 다양성의 결과를 얻을 수에 중요한 함정을 해결합니다.
리그노셀룰로오스성 식물 조직의 곰팡이 biodegradation를 공부에 대한 두 가지 주요 방법은 목재 방부제 테스트 (; 한천 블록 토양 블록)에 대한 개발되었습니다. 이것은 토양 블록 microcosms 높은 붕괴 속도, 적은 수분 문제, 연구 중 낮은 다양성, 그리고 방부제의 독성 높은 임계값을 얻을 것을 잘 허용됩니다. 토양 블록 테스트 따라서 더 활용 기법이며, 테스트 및 재료에 대한 미국 사회 (ASTM) (방법 D 1413-07)에 의해 표준화되었습니다. 토양 블록 디자인은 로컬 변수 토양 소스를 사용하지만, 단점을 가지고 있으며, 썩어 조직에 영양분을 외부 (외인성)의 통제를 제한 인치 이러한 단점은 다른, 점점 인기를 연구 목적으로이 방법을 적용의 문제로 등장했습니다. 이러한 현대의 목적은 네트워크 hyphal 함께 산화 메카니즘 및 추적 translocated 요소를 평가 공동 대사 toxics의 bioremediation 테스트 bioenergy 연구를위한 굴욕 lignocellulosics를 포함. 토양 - 블록은 이러한 응용 프로그램에 충분한 제어를 빌려하지 않습니다. 정제 한천 블록 접근 방식이 필요합니다.
여기, 우리는 나무 저하 곰팡이 Serpula lacrymans은 낮은 칼슘 한천과 함께 깊은 배양 접시를 이용하여 한천 블록 microcosms의 나무이 저하될 수있는 갈색 썩음을 사용합니다. 우리는 유틸리티 및 예상 다양성을 설명하는 시간 시리즈 부패에 대한 외인성 석고의 역할을 테스트합니다. 싱글 보드 격랑 (세로 컷)에서 블록은 냉방 무게, autoclaved, 플라스틱 메쉬 위에 무균 소개하고 있습니다. 외인성 석고는 인터페이스에서 추가로 곰팡이 예방 접종, 각 블록 얼굴을하고 있습니다. 수확은 최종 파괴 추수 때까지 무균 수 있습니다. 이러한 microcosms은 한천이나 배양 접시의 벽 블록 접촉을 피하기 위해 설계되었습니다. 결로는 접시 쏟아 도중 부화하는 동안 최소화합니다. 마지막으로, inoculum / 석고 / 목재 간격은 있지만 접촉을 허용하지 않고 최소화됩니다. 한천 블록 디자인이 덜 기술적인 관점은 또한 오류 및 연구 사이에 변화의 핵심 소스의 가장 흔한 원인입니다. 비디오 간행물이 경우에 따라서 유용합니다, 우리는 낮은 다양성, 높은 품질의 결과를 보여줍니다.
이 프로토콜은 물론 오븐이나 공기 건조 소재로로 설명, 우디 및 비 - 우디 기판에 적용됩니다. - 설정하기 전에, 그러나, 먼저 프로토콜을 통해 읽어보십시오. 여러 학업에 적용할 수 제기된 점, 이러한 포인트 (밑줄) 계획 필요가 있습니다. 또한, 우드 보호에 관한 국제 연구 그룹 (IRG - WP) 용기 (1978)에 의해 제출된 논문 따라 간혹 사용되는 두 출판 한천 블록 방식, 영국 표준 838 하나가 또있다는 것을 유의하십시오. 우리는 주로 소우주 디자인과 한천 배지의 컨트롤에 수정, 방법 838과 유사하지만, 다시 두 가지 접근법은 종종 산소 결핍과 변화를 일으키는, 나무 블록 역사 수분 관리 문제로 인해 피할 수 있습니다. 838 표준을 포함하여 한천 블록 디자인의 논의를 포함하고 이러한 검사 방법의 좋은 검토는, 니콜라스 (1973)에서 찾을 수 있습니다.
1) Microcosms 준비
이 실험에 대한 Microcosms 나무 블록 위에 머리 공간을 증가, 전형적인 배양 접시보다 1cm 키가 (깊이)입니다. 그들은 그들의 농도 이외에, 절대적인 영양소 금액을 제어하고, 잘 거리 (> 3mm) 뚜껑의 나무 블록을 유지하기 위해 한천의 겸손한과 정확한 금액으로 가득합니다. 석고 테스트의 경우에 사용되는 한천은 낮은 칼슘 타입 한천되지만, 우리는 블레이 크 슬리의 매체 테스트 (Wulfen : 프라이스) Serpula lacrymans의 분리 유지를위한 ATCC 권장 매체를 사용하는 대표적인 결과를 보여 Schroeter 변형 EMPA 65 ( ATCC 32750).
이 디자인은 한천 연락처 및 거리 접시 뚜껑과 벽에서 멀리 식물 조직을 유지합니다. 리그노셀룰로오스성 기판 가변 젖음는 한천 블록 시험에 변화의 주요 원천입니다. 수분 함량을 증가 젖음하면 산소 결핍을 만들고 억제하거나 중단 에어로빅의 biodegradation. 그것은 또한 누군가가 나무 분해에 대한 책임 갈색과 흰색 부패의 곰팡이의 산화 메커니즘을 연구에 대한 문제를 만듭니다. 플레이트 뚜껑에 응축 무료 물방울 양식하는 경우 문제이며, 기판 젖었어. 80 % 초과하는 수분 내용에 선도 (건조 WT. 기준)과 에어로빅 저하를 중단되면 연락을, 마찬가지로, 목재 및 기타 조직은 한천에서 빠르게 수분을 '심지'것입니다. 조직은 사상균이 기판 내에서 검색, 연결, 제어 습기 수 있도록,이 물 소스로부터 멀어져해야합니다.
2) '차단'기판 준비
이러한 프로토콜은 단단한 위해 개발하지만, 다른 식물의 조직에 대한 적응력 아르되었습니다. 질량 손실 filamentous 곰팡이에 의해 저하 나무 부식 진행을위한 표준 측정하기위한 한 방법입니다. 따라서, 우리의 접근 방식은 이후의 붕괴 대량 손실을 결정 및 예약 오븐 건조 중량을 사용합니다. 단, bioenergy 연구를 위해, 초점은 식물 조직 화학에 어디에, 많은 조직을 건조 공기가 좋습니다 것을 발견했습니다. 우리는 오븐 건조 시작 자료를 사용하기 위해 한천 블록의 문화를 준비 여기 프로토콜을 보여주지만, 가루 대신 고체 기판을 처리하는 것도 건조하고 공기에 다른 정보를 제공합니다.
3) Inoculating 및 라벨링
한천 - 블록 microcosms을 Inoculating하면 토양 블록의 단지를 inoculating 이상의 시간이 소요됩니다. 우리가, 우리는 3 분 복용 각 접종에 포함됩니다. 한천이 포함된 배양 접시하려면, 메쉬, 나무, 모든 외인성 영양 소스 (여기서, 석고 알약)을 위해 또한 지점 및 균류이다. 때문에 뚜껑이 열려있는 시간의 양과 내부 방문수의 오염에 대한 기회를가 증가합니다. 일반적으로이 단계에서 만든, 이들이 최상의 텍스트로 비디오를 결합하여 적용하는 여러 가지 중요한 실수도 있습니다. 동영상을보세요.
4) 잠복기 및 착취
플레이트는 온도 변화에 의한 결로를 방지하기 위해, 당신의 균류에 맞게 incubated 수 있지만, 생물 학적 보육 가능한 경우에 보관해야합니다. 시간 시리즈 수확은 마지막으로 수확을 제외하고, 무균 할 수 있습니다. 이러한 중간 수확이의 성장 이후에 완료되면기판은 번호판을 처리하면 균사 상호 링크 기판 때문에 쉽습니다, 중요하다.
5) 결과 해석
리그노셀룰로오스성 조직은 일반적으로 한천 블록 디자인에서 느리게 붕괴되지만,이 시점에서 당신은 심지어 중간 붕괴 수준에서 상대적으로 낮은 다양성이 있어야합니다. 당신은 또한 통제 조직의 중간 (20~50%), 높은 습기가없는 있어야합니다.
그림 1. 아가르 블록의 소우주로 부화하기 전에이 예제에서 설정할 수 있습니다.
그림 2. 한천 - 접촉 위에 블록을 상승 플라스틱 메쉬에서 쉬고있는 파인 우드 블록을 colonizing Serpula의 lacrymans. 이 균사체가 나무와 외인성 영양소 / 요소 소스 사이의 중요한 연결을 대표하고, 한천 또는 고체 물질로서 이러한 외인성 물질 소스를 제어하는 것은 비교 토양 블록 설계, 한천 블록 설계의 주요 장점이라고 생각합니다.
그림 3. %의 체중 감소를 의미, 한천 블록 microcosms에 소나무 5 15 주 부화 후 Serpula lacrymans하여 목재 부패의 범위의 측정으로. 아무것도 (CA - 무료), 5 MM CaCl 2 한천 (CaCl 2) 치료를 추가 없었다> 99% 순수 석고 (카소 4), 또는 1 % 석고 철 - 수정. 보호 ANOVA는 비교가 α = 0.05와 Tukey의 테스트를 사용하고 있던 것을 의미합니다. 각 수확 들어, 같은 편지 아래에 막대가 크게 다를 수 없습니다. 오차 막대는 표준 편차 =. 실링 (2010)에 게시.
그림 4. 오버헤드 사진 (A) 모두 다섯가 같은 갈색 썩음 시험 균류, Serpula lacrymans뿐만 아니라 블록 (B) 제거 오븐 건조하여 부패의 주 15 복제합니다. CA - 무료 치료 melanization 부족을 참고 순수 칼슘 트리 트먼트에 yellowing, 그리고 철 - 개정된 치료에 녹 모양. 치료는 비교를 위해 (B)가 아닌 주사되는 블록에 제어, 그림 3에서와 같이 표시됩니다.
그림 5. 높은 철 농도 매체, 블레이 크 슬리의 맥아 한천을 사용하여 다른 재판에서 오버헤드 그림. 그림 4와 비교 관찰 melanization의 손실을합니다. 제거하고 무게 블록 체중 감량에는 치료 효과를 보여주지. 이것은이 블록 시험의 외인성 구성 요소의 영향을 시범으로 제공됩니다. 이러한 효과는 이러한 외인성 입력 컨트롤이 너무 어렵습니다 어디에, 토양 블록의 병 디자인에 testable되지 것입니다.
우리 한천 블록 설정 (그림 1)를 사용 Serpula lacrymans은 (그림 3 제어 갈색 - 부패 소나무 블록에 60 % 이상의 체중 감소로 이어지는, 석고 표면과 나무 블록 (그림 2)에 직접 접촉하는 성장 ). 이것은 쉽게> 50 %의 부패의 ASTM 표준 목표를 만족하고,에서 부패에 변화의 평균 계수 (C V)는 주 16 0.055했다. 이 데이터는 실링 7 게시됩니다. 다시 다른 곰팡이는 토양 블록보다 한천 블록에...
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Petri dishes | Nalge Nunc international | 4014 | 25 x 150 mm |
Agar, Type A | Sigma-Aldrich | A4550 | |
Ammonium nitrate, NH4NO3 | Millinckrodt | 3436-12 | |
Potassium phosphate, KH2PO4 | JT Baker | 3246-01 | |
Magnesium sulfate 7-hydrate, MgSO4•7H2O | Sigma-Aldrich | 230391 | |
D-(+)-Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | Dextrose |
Boric acid, H3BO4 | Mallinckrodt Baker Inc. | 2549-04 | |
Zinc sulfate 7-hydrate, ZnSO4•7H2O | Mallinckrodt Baker Inc. | 8880-12 | |
Manganous chloride 4-hydrate, MnCl2•4H2O | JT Baker | 2540-04 | |
Copper(II) sulfate 5-hydrate, CuSO4•5H2O | Sigma-Aldrich | 209198 | |
Ammonium heptamolybdate 4-hydrate, (NH4)6Mo7O24•4H2O | Sigma-Aldrich | 431346 | |
Calcium chloride dihydrate, CaCl2•2H2O | Mallinckrodt Baker Inc. | 4160-12 | |
Sodium chloride, NaCl | Mallinckrodt Baker Inc. | 7581-12 | |
Ferrous sulfate 7-hydrate, FeSO4•7H2O | Mallinckrodt Baker Inc. | 5056-12 | |
Pipet-aid | Drummond Scientific | 4-000-110 | Cordless EtOH the surface |
10 ml sterile polystyrene pipette | BD Biosciences | 357551 | |
Gutter Guard | Thermwell Products Co. | VX620 | Pre-scrubbed with soap Hardware store |
Calcium sulfate hemihydrate, CaSO4•0.5H2O | Acros Organics | 385355000 | |
#4 cork borer | Boekel Scientific | 1601 | |
Parafilm "M" | Pechiney Plastic Packaging | PM-996 |
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