이것은 항체 염색을 통해 면역형광을 위한 생식계열 샘플을 생성하거나 DNA를 시각화하기 위한 간단한 DAPI 염색을 위해 C. elegans 생식선 해부 후 동결 균열에 일반적으로 사용되는 방법입니다. 이 프로토콜은 연구실과 과정 기반 학부 연구 경험의 학부생에게 성공적이었습니다.
C. elegans 생식계열은 부분적으로 해부된 동물에 대한 세포학적 분석을 쉽게 수행할 수 있기 때문에 감수 분열을 연구하기 위한 훌륭한 모델을 만듭니다. 전체 마운트 준비는 감수 분열 핵의 구조를 보존하며, 중요한 것은 각 생식선 팔이 감수 분열의 모든 단계를 포함하고 있으며, 시간적-공간적 진행으로 구성되어 있어 여러 단계에서 핵을 쉽게 식별할 수 있다는 것입니다. 성체 자웅동체는 두 개의 생식선 팔을 가지고 있으며, 각각은 원위 폐쇄 끝에 증식하는 생식선 줄기 세포와 자궁 중앙에 합류하는 근위 열린 끝에 세포화된 난모세포가 있는 닫힌 관으로 구성됩니다. 해부는 체강에서 한쪽 또는 양쪽 생식선 팔을 방출하여 감수 분열 전체를 시각화 할 수 있습니다. 여기에서는 관심 단백질에 대한 면역 형광에 대한 일반적인 프로토콜이 제시되고 모든 염색체를 표시하기위한 DAPI 염색이 이어집니다. 젊은 성인은 levamisole에 고정되어 있으며 두 개의 주사기 바늘을 사용하여 신속하게 해부됩니다. 생식계열 압출 후 액체 질소에서 동결 균열을 겪기 전에 샘플을 고정하여 큐티클 및 기타 조직을 투과시키는 데 도움이 됩니다. 그런 다음 샘플을 에탄올에서 탈수하고 재수화하고 1 차 및 2 차 항체와 함께 배양 할 수 있습니다. DAPI는 장착 매체의 샘플에 추가되어 DNA를 안정적으로 시각화하고 형광 현미경으로 이미지화할 동물을 쉽게 찾을 수 있습니다. 이 기술은 해부 방법 자체를 연습하는 데 몇 시간을 보낸 후 C. elegans를 다루는 데 익숙한 사람들이 쉽게 채택할 수 있습니다. 이 프로토콜은 연구실에서 일하는 고등학생 및 학부생에게 가르쳐졌으며 인문 대학의 코스 기반 학부 연구 경험에 통합되었습니다.
감수 분열은 모든 성 생식 유기체 1,2에서 배우자 (난자 및 정자 / 꽃가루)를 만드는 데 사용되는 특수 세포 분열입니다. 교차 재조합은 상동 염색체 사이의 DNA의 상호 교환입니다. 감수 분열은 유전 적 다양성의 중요한 원천을 제공하고 세대를 거쳐 게놈 안정성을 촉진하는 데 필수적입니다. 감수 분열 동안 적어도 하나의 교차를 형성하지 못하는 염색체는 무작위로 분리되어 염색체가 분리되지 않아 잘못된 수의 염색체를 가진 배우자를 생성 할 수 있습니다 - 일반적으로 자손3에 치명적인 상태입니다. 감수 분열 동안, 교차는 프로그램 된 이중 가닥 DNA 파괴4에 의해 유도된다. 이러한 단절의 하위 집합은 세포 분열5를 준비하기 위해 상동 염색체의 방향을 지정하는 데 도움이 되는 교차점(chiasmata)이라고 하는 DNA의 물리적 연결을 제공하는 교차로 복구됩니다. 감수 분열 단계는 모든 진핵 생물에 걸쳐 고도로 보존되어 있으며 염색체 형태로 쉽게 식별 할 수 있습니다.
생물학의 기본 개념인 감수 분열은 학생들이 다양한 생물학 과정에서 여러 번 접하는 주제입니다. 그들은 종종 고등학교에서 감수 분열 염색체 분리의 역학에 소개되는 반면, 대학 수준의 과정은 분리의 세포 생물학과 교차 재조합의 유전 적 영향에 중점을 둡니다. 그러나 감수 분열은 많은 학생들에게 악명 높은 까다로운 개념입니다1. 유전자, DNA, 염색체 및 감수 분열 사이의 관계를 이해하지 못하면 유전 유전에 대한 완전한 이해를 방해하는 학생의 오해와 이해 격차가 발생할 수 있습니다 6,7. 추상적 인 주제에 대한 학생의 이해를 향상시키는 한 가지 방법은 구체적인 실습 활동을 제공하는 것입니다. 예를 들어, 감수 분열을 가르칠 때 강사는 분자 분석8을 모방하는 활동, 학생들이 분자를 조작할 수 있는 3D 모델9 또는 학생들이 직접 분자 안무1를 연기하는 역할극중에서 선택할 수 있습니다. 알려지지 않은 결과와 연구를 통합하는 것은 학생의 이해를 향상시키는 특히 효과적인 방법입니다. 이 관행은 코스 기반 학부 연구 경험(CURE)으로 알려져 있으며 특히 STEM10,11에서 과소 대표되는 그룹에 속한 학생들의 태도와 선택의지를 강화하는 추가 이점이 있습니다. 선충류 벌레 Caenorhabditis elegans는 행동, 생식력 및 유전 적 교배에 대한 교실 연구에 특히 적합하며 학생들에게 생물학적 연구를 소개하는 효과적인 모델입니다12.
C. elegans는 분자 유전학과 간단한 세포 학적 분석을 결합하여 세포 생물학을위한 강력한 모델 유기체를 만듭니다. 또한 생물학 교실 13,14,15에서 사용하기에 특히 적합합니다. 실험실에서 유지 관리가 쉽고 경제적이며 표준 실온 또는 가장 일반적인 배양 온도인 20°C에서 3일마다 수백 마리의 자손을 생산합니다. 중요한 것은 글리세롤 스톡으로 냉동하고 -80 ° C 냉동고에 보관할 수 있으므로 초보 연구원이 저지른 축산 실수를 쉽게 수정할 수 있습니다16. 또한 주석이 잘 달린 게놈은 정방향 및 역방향 유전 기술17,18을 허용하여 C. elegans를 사용하여 분자에서 진화에 이르는 생물학적 질문을 해결할 수 있습니다. 마지막으로, C. elegans 연구자들은 신진 과학자들에게 종종 도움과 조언을 기꺼이 제공하는 지원 커뮤니티를 만들었습니다19. 이러한 장점으로 인해 C. elegans는 다양한 유형의 기관 12,19,20,21,22,23에서 다수의 CURE에 통합되었습니다.
연구 및 교육에 대한 이점 외에도 C. elegans는 감수 분열 및 생식선 발달 연구에 널리 사용되는 모델이되었습니다24,25,26. 이 동물의 광학적 선명도는 세포학적 접근을 단순화하고27, 성인의 경우 생식선은 동물의 거의 절반을 차지하여 연구할 수백 개의 감수 분열 세포를 제공합니다. 생식선에서 감수 분열 생식선 핵은 조립 라인처럼 배열됩니다(그림 1). 유사분열 복제는 생식선의 말단부에서 발생하며, 핵은 수정란이 외음부에서 나오는 생식선의 근위부로 이동하면서 감수 분열 단계를 통해 진행됩니다. 고정 관념의 공간 조직은 또한 감수 분열을 통한 시간적 진행을 나타내기 때문에 염색체 조직과 생식선에서의 위치에 따라 다른 단계를 쉽게 식별 할 수 있습니다. 마지막으로, 감수 분열을 방해하고 이수성 (aneuploidy)을 유발하는 과정은 초보자에게도 특성화하기 쉬운 표현형을 만듭니다 : 불임, 배아 치사율 또는 남성의 높은 발병률 (He 표현형)28.
이것은 C. elegans에서 감수 분열 염색체를 시각화하기위한 간단한 프로토콜입니다. 장착, 해부, 고정 및 항체 염색이 모두 동일한 현미경 슬라이드에서 수행되므로 프로토콜이 간소화되고 거의 완벽한 샘플 회수가 가능합니다. 이 방법은 염색체를 시각화하는 간단한 DAPI 염색에 사용되며 생식선에서 단백질의 국소화를 시각화하기 위해 면역 형광법에 사용할 수 있습니다. 학생들은 기본 해부 현미경을 사용하여 생식선을 해부하고, DNA 또는 면역 형광의 시각화를 위한 전체 마운트 준비를 생성하고, 복합 형광 현미경으로 이미지화합니다. 이 프로토콜은 C. elegans 연구실에서 일하는 고등학생 및 학부생에게 가르쳐졌으며 인문 대학의 CURE에 통합되었습니다12. CURE는 상대적으로 작은 학급 규모를 가졌지 만,이 프로토콜은 웜 균주 및 시약의 상대적으로 저렴한 비용으로 인해 다양한 기관의 수업에 적합합니다. 강사는 사용할 수 있는 해부 현미경의 수에 의해서만 제한됩니다. 이전 구현에서는 학생들이 단일 현미경을 공유하기 위해 세 그룹으로 작업했으며 첫 번째는 해부 연습, 두 번째는 해부 및 DAPI 염색을 구현하고 세 번째는 광시야 형광 현미경으로 슬라이드를 이미지화하는 등 세 번의 90분 세션에 걸쳐 진행되었습니다. 학부 연구에 참여하면 학업 및 개인 학생11,29에게 많은 이점이 있습니다. CURE를 통해 코스에 연구를 포함하면 학생들이 정규 수업 시간 11,30,31 동안 연구에 참여할 수 있으므로 이러한 혜택에 대한 노출이 보다 접근가능하고 공평합니다.
1. C. 엘레 간스 축산
참고: 자세한 내용은 C. elegans 유지 관리 프로토콜16 및 Elgin et al.32를 참조하십시오. C. elegans 균주는 Caenorhabditis Genetics Center (https://cgc.umn.edu)에서 쉽게 얻을 수 있으며 일반 우편을 통해 미국의 모든 지역으로 배송됩니다. 각 균주의 비용은 $10이며 각 실험실/사용자는 $30의 연회비를 지불합니다.
2. 생식선 박리
3. 항체 염색
4. 장착 및 이미징
DAPI는 DNA에 강하게 결합하며 다양한 조건에서도 염색이 강력합니다 (그림 3A, B). 그것은 모든 핵에 존재해야하므로 슬라이드에있는 웜 조직의 존재와 현미경에서 형광을 검출하는 능력에 대해 효과적인 양성 대조군이됩니다. 염색은 항체가 감수 분열 핵 내에 존재할 때 효과적입니다 (그림 3A, B). 예를 들어, 그림 3A, B 는 DAPI로 염색된 중간 파키틴 핵과 이중 가닥 절단의 마커인 RAD-51을 표적으로 하는 항체를 보여줍니다. KLE-2는 유사분열과 감수분열에 대비하여 염색체를 구성하는 고도로 보존된 단백질 복합체인 콘덴신의 성분입니다. kle-2/+ 돌연변이체는 약간 무질서한 DAPI 염색과 더 많은 수의 RAD-51 초점에 반영된 이중 가닥 절단 수의 증가에서 알 수 있듯이 염색체 구조에 경미한 결함이 있습니다(그림 3B). 면역형광법의 일반적인 실수는 샘플을 수정 용액에 너무 오래 두는 것입니다. 과도한 고정은 일반적으로 항체가 핵으로 확산되는 것을 방지하기 때문에 염색에 실패할 수 있습니다. 이 실수는 항체가 생식선의 세포질 영역에서 확산 될 때 확인 될 수 있지만 핵에서 제외되는 것으로 보입니다.
생식계열(그림 1)에서 핵은 원위 끝에서 유사분열적으로 증식하고, 전이 영역 동안 감수 분열에 들어가고, 디플로텐과 마지막으로 디아키네시스에 들어가기 전에 파키텐(종종 여러 핵 열에 의해 3개의 동일한 단계로 나뉩니다)을 통해 진행됩니다. 이완증의 난모세포는 정자와의 근접성에 따라 번호가 매겨지며, -1 난모세포는 정자에 가장 근접하고 -2 난모세포는 다음 원위부입니다. C. elegans는 6 개의 염색체를 가지고 있으며, 이는 이완 핵에서 조밀 한 타원형으로 나타납니다. 이들 각각은 2가 (도 3C)라고도하는 교차 (chiasma)에 의해 함께 고정 된 두 자매 염색체의 상동 쌍을 나타냅니다 (그림 3C). 교차 형성을 방해하는 spo-11과 같은 돌연변이는 교차 결합을 형성하지 못합니다. 따라서 디아키네시스 핵은 각 자매 염색분체에 대해 하나씩 12개의 개별 DAPI 몸체(단가라고도 함)를 갖게 됩니다(그림 3D).
그림 1: 생식계열 핵은 감수 분열을 통한 진행을 나타내는 공간-시간적 방식으로 배열되어 있습니다. (A) DAPI로 염색 된 전체 마운트 젊은 성인 자웅 동체. 생식선과 감수 분열 단계는 원위 끝 (별표)에서 정자 (삼각형)를 포함하는 근위 영역 (화살표로 표시된 -1 난 모세포)까지 윤곽이 그려져 있습니다. 스케일 바는 100 μm를 나타낸다. (B) DAPI로 염색된 해부된 자웅동체 생식선의 투영된 형광 이미지. 감수 분열 단계가 표시되며 대표적인 핵이 인셋으로 표시됩니다 (모든 인셋은 서로 스케일링되는 것으로 표시됨). 핵은 생식계열에서의 위치와 특징적인 염색체 형태에 따라 쉽게 병기될 수 있으며, 원위 끝(별표)의 유사분열 영역에서 파키텐, 디플로텐 및 디아키네시스를 통해 전이 영역으로 진행됩니다. 정자는 삼각형으로 표시됩니다. 이 수치는 Hillers et al. 라이센스 CC BY 3.028. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 2: 해부 설정 데모. (A) 해부 중 현미경 단계. 동물은 홀딩 슬라이드에 놓인 커버 슬립에 4 μL의 해부 용액으로 해부되며, 이는 커버 슬립을 시야로 옮기는 데 사용됩니다. 다이어그램은 이상적인 바늘 배치를 보여줍니다. 바늘은 경 사진 가장자리가 아래를 향하도록 잡고 인두 부위를 교차시킵니다. 분홍색 화살표는 바늘에 대한 가위와 같은 움직임을 보여줍니다. 분홍색 점선은 이상적인 절단 위치를 나타냅니다. (B) 전체 압출 및 불완전 압출의 예와 함께 해부된 동물의 이미지. 압출 된 생식선과 내장의 섹션에는 레이블이 붙어 있습니다. (C) 동결-균열 단계를 나타내는 이미지. 슬라이드는 커버슬립 쪽이 몸에서 반대쪽을 향하도록 한 손으로 단단히 잡아야 합니다. 반대쪽 가장자리는 벤치에 고정되어 있습니다. 면도기는 다른 손으로 잡아야합니다. 분홍색 화살표는 면도기가 슬라이드에서 커버슬립을 튕기는 이동 방향을 나타내며, 커버슬립이 몸에서 멀어지도록 약간 돌립니다. 커버슬립은 한쪽 모서리가 슬라이드의 긴 가장자리에 걸리도록 배치되었습니다. (D) 유리 배아 염색 접시에서 해부 실습을 위한 설정 이미지. 동물을 50-200 μL의 해부 용액에 넣어 증발 문제를 무효화하고 해부 시간을 연장시킵니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 3: 생식계열 핵의 대표적인 형광 결과. (A, B) 야생형 및 (B) kle-2/+ 이형접합체에서 RAD-51 항체(녹색) 및 DAPI(빨간색)로 염색된 후기 파키틴 핵의 Z-스택 투영. (씨,디) (C) 야생형(6개의 DAPI 염색체 포함) 및 (D) spo-11 돌연변이체(12개의 DAPI 염색체 포함)에서 DAPI로 염색된 단일 디아키네시스 핵의 Z-스택 투영. 스케일 바는 5μm를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
유성 생식은 감수 분열의 특수 세포 분열을 통해 생성되는 반수체 배우자의 생성을 필요로합니다. C. elegans는 광학 투명성, 편리한 생식선 해부학 및 강력한 유전학28로 인해 감수 분열의 세포학적 연구에 인기 있는 모델이 되었습니다. 생식력과 배아 치사율을 평가하는 간단한 유기체 실험을 분자 유전학과 결합하여 실험실이나 교실에서 많은 질문을 해결할 수 있습니다. 예를 들어, 교차는 적절한 염색체 분리에 필수적이기 때문에 형성이나 분해를 방해하는 과정은 이수성 배우자를 생성합니다. 차례로, 이수성 (aneuploidy)은 자손을 세거나 배아 치사율을 결정하는 약간 더 복잡한 방법을 통해 쉽게 평가할 수있는 생존 가능한 자손으로 이어진다. 세포학적으로, 크로스오버의 부족은 운동증 동안 관찰되는 DAPI 염색체의 수에 영향을 미칠 것이다. DAPI 염색의 견고성과 채점의 용이성은 세포학 기술을 가르치는 이상적인 실험입니다. 자웅 동체 생식 세포에서 핵의 시간적 공간 레이아웃은 한 순간에 감수 분열의 각 단계에 대한 스냅 샷을 제공합니다. 핵은 생식세포의 원위 유사분열 말단에서 근위 말단으로 진행하는 데 약 54시간이 걸립니다(예를 들어, Jaramillo-Lambert et al.33, Stamper et al.34 및 Libuda et al.35 참조). 감수 분열 진행의 잘 정립 된 타이밍은 펄스 추적 라벨링 또는 DNA 손상 실험을 허용합니다.
DAPI 염색은 거의 항상 작동하기 때문에 형광 현미경 검사에 유용한 기술 제어 역할을 합니다(훈련 중인 현미경 검사자에게 만족을 제공할 수 있음). 항체 염색은 더 가변적일 수 있으며 반복실험 간의 재현성을 측정하는 좋은 척도입니다. C.elegans 생식선은 염색체 구조를 보존하는 동시에 충분한 항체 확산을 허용하는 것 사이의 균형이 필요하기 때문에 일관되게 수정하기 어려울 수 있습니다. 포름알데히드로 고정하면 염색체 형태가 가장 잘 보존되고 파라포름알데히드 앰플에서 신선한 포름알데히드를 준비하면 가장 재현 가능한 결과를 얻을 수 있습니다. 포르말린 (37 % 수성 포름 알데히드 및 메탄올)으로부터 제조 된 포름 알데히드를 사용할 수도 있습니다. 고정 강도 및 타이밍은 각각의 항체에 대해 경험적으로 결정될 필요가 있을 수 있다. 대안적인 방법은 단계 2.4에서 포름알데히드 고정을 건너뛰고, 동결-균열 후, -20°C에서 100% 에탄올에 침지하거나, 100% 메탄올에 10분 동안 침지한 후 -20°C에서 10분 동안 100% 아세톤에 침지하는 것을 포함한다. 이러한 수정 조건은 더 나은 항체 침투를 허용하지만 조직 형태에 부정적인 영향을 미칩니다(염색체가 날아가고 더 부풀어 오를 것입니다).
타이밍은 2단계에서 설명한 해부 및 수정 단계에서 매우 중요합니다. 해부 용액의 부피가 너무 작기 때문에 증발은 최종 수정 농도에 영향을 미쳐 다양한 항체 염색을 유발할 수 있습니다. 숙련 된 C. elegans 핸들러는 시작 (2.3 단계)에서 2 분 이내에 슬라이드를 준비하여 수정 (2.4 단계)할 수 있습니다. 주요 기술적 장애물은 동물을 해부 용액 방울로 골라 신속하게 해부하는 능력입니다. 더 큰 볼륨으로 해부하는 방법을 배우는 것이 더 쉬울 수 있습니다. 새로운 연수생은 먼저 유리 배아 염색 접시에 50-200 μL의 해부 용액에 동물을 따는 것으로 시작합니다 (그림 2D). 더 넓은 표면은 좋은 생식선 압출을 위한 이상적인 바늘 위치를 식별할 때 더 많은 기동 공간을 제공하는 반면, 더 많은 양의 액체는 증발을 덜 문제로 만듭니다. 해부 동작에 익숙해지면 교육생은 접시에서 50μL만 사용하여 해부를 시작한 다음 슬라이드에서 20μL로 해부로 전환합니다. 슬라이드에서 해부한 후에는 연수생이 증발을 무시할 수 있을 정도로 4μL에서 작업할 수 있을 만큼 충분히 빨라질 때까지 용액의 양을 빠르게 줄이기 시작할 수 있습니다.
해부 시기가 여전히 문제가 되는 경우 연수생은 2.3단계에서 해부 용액의 8μL를 해부할 수 있습니다. 그런 다음 2.4단계에서 8μL의 고정 용액을 추가하고 부드럽게 피펫팅하여 완전히 혼합하고(시체가 파손되거나 피펫팅되지 않도록 면밀히 관찰) 혼합 용액에서 8μL를 제거할 수 있습니다. 이 대안적인 접근법은 8 μL의 동일한 최종 부피와 동일한 최종 수정 농도를 초래합니다. 이 부피는 2.5단계에서 동결 균열 동안 시체가 커버슬립과 슬라이드 표면 모두에 접촉하도록 하는 데 중요합니다. 더 큰 해부 부피에서도 각 슬라이드를 준비하는 타이밍이 문제로 남아 있는 경우, 생식계열 면역형광 프로토콜을 위한 현탁 방법이 Gervaise 및 Arur26에 의해 설명됩니다.
제자리 단백질을 시각화하기 위해 면역형광법을 사용하는 주요 한계는 관심 있는 특정 단백질을 표적으로 하는 1차 항체의 가용성입니다. 그러나 태그가 지정된 버전의 단백질이 설계된 경우 이 프로토콜을 조정하여 단백질 태그를 시각화할 수 있습니다. FLAG, HA 또는 GFP와 같은 일반적인 태그를 표적으로 하는 항체가 일반적으로 이용 가능합니다. GFP와 같은 형광 태그는 종종 고정 단계에 의해 소광될 수 있으므로 네이티브 형광 신호 자체에 의존하기보다는 GFP를 표적으로 하는 1차 항체를 사용하는 것이 좋습니다. 이 프로토콜의 또 다른 한계는 단일 기간 내에 생식세포를 포착한다는 것입니다(난자 생성의 모든 단계는 생식계열 내에서 표시되지만). 따라서이 기술은 난 모세포가 난자 생성을 통해 진행됨에 따라 발생할 수있는 동적 변화를 놓칠 수 있습니다. 그러나 배우자 생성시기는 C. elegans에서 잘 연구되었습니다. 야생형 젊은 성인에서 난 모세포는 생식 세포의 말단 끝 (유사 분열 영역)에서 이완 된33으로 진행되는 데 약 60 시간이 걸립니다. 따라서 맥박 추적 또는 조사와 같은 특정 개입 후 시간 경과를 통해 감수 분열의 여러 단계에서 효과를 관찰 할 수 있습니다.
결론적으로, 이 프로토콜은 C. elegans 생식선 해부와 형광 현미경을 위한 DAPI 및 항체 염색을 설명합니다. 해부 및 고정 (2 단계)은 생성 된 슬라이드 수에 따라 60-90 분이 걸립니다. 항체 염색(3단계)은 대부분 손을 떼고 항체 배양 시간에 따라 최소 7시간에서 1.5일까지 걸릴 수 있습니다. 장착 (4.1-4.7 단계)은 약 15 분이 소요됩니다. 생식계열 염색체와 생식선을 시각화하는 이 일반적인 접근 방식은 항체 또는 형광 태그 시약이 존재하는 경우 모든 단백질의 세포학적 연구에 사용할 수 있습니다. 가장 간단한 형태로, 이완 핵의 DAPI 염색은 감수 분열 재조합에 영향을 미치는 인자를 스크리닝하는 데 사용될 수 있습니다. 자손 수, 수컷 발생률(He 표현형) 및 배아 치사율에 대한 유기체 분석과 함께 이 세포학적 접근 방식은 인구 기반 분석에 대한 단일 세포 대위법을 제공합니다.
저자는 공개 할 이해 상충이 없습니다. 이 원고의 내용은 전적으로 저자의 책임입니다. 반드시 국립 보건원 (National Institutes of Health) 또는 국립 과학 재단 (National Science Foundation)의 공식 견해를 나타내는 것은 아닙니다.
Lee 연구실에서의 작업은 국립 보건원의 수상 번호 1R15GM144861과 수상 번호 1R15HD104115의 국립 아동 및 인간 발달 연구소의 지원을 받았습니다. DA는 UML Kennedy College of Sciences Science Scholars 프로그램의 지원을 받았습니다. NW는 UML Honors College Fellowship 및 UMLSAMP Fellowship (보조금 번호 HRD-1712771에 따라 National Science Foundation에서 자금 지원)의 지원을 받았습니다. RAD-51 항체에 대해 A. Gartner에게 감사드립니다. 모든 C. elegans 균주는 Caenorhabditis 유전학 센터에서 제공했으며, 이 센터는 수상 번호P40 OD010440으로 국립 보건원의 연구 인프라 프로그램 사무소에서 자금을 지원합니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Alexa Fluor 488 Donkey Anti-Rabbit IgG Secondary Antibody | Molecular Probes | 711-545-152 | |
Aluminum heating/cooling block | Millipore Sigma | Z743497 | |
Bacto Peptone | Gibco | DF0118 17 0 | |
Borosilicate Glass Pasteur Pipets, Disposable, 5.75 inches | Fisherbrand | 13 678 20B | Used to make worm picks |
BSA, Bovine Serum Albumin | VWR | 97061 420 | |
C. elegans wild type (ancestral) | Caenorhabditis Genetics Center | N2 (ancestral) | |
C. elegans kle-2 (ok1151) mutants | Caenorhabditis Genetics Center | VC768 | The full genotype of this strain is: kle-2(ok1151) III/hT2 [bli-4(e937) let-?(q782) qIs48] (I;III). It has kle-2 balanced with a balancer chromosome marked with pharangeal GFP. Pick non-green animals to identify homozygous kle-2 mutants. |
C. elegans spo-11 (me44) mutants | Caenorhabditis Genetics Center | TY4342 | The full genotype of this strains is: spo-11(me44) IV / nT1[qIs51] (IV:V). It has spo-11 balanced with a balancer chromosome marked with pharangeal GFP. Pick non-green animals to identify homozygous spo-11 mutants. |
Calcium Chloride Anhydrous | VWR | 97062 590 | |
Cholesterol | Sigma Aldrich | 501848300 | |
DAPI | Life Technologies | D1306 | |
EDTA, Disodium Dihydrate Salt | Apex Bioresearch Products | 20 147 | |
Embryo Dish, glass, 30mm cavity | Electron Microscopy Services | 100492-980 | Used to practice dissecting; glass is preferred because dissected animals can stick to plastic |
Escherichia coli | Caenorhabditis Genetics Center | OP50 | |
Food storage container, plastic | various | n/a | Plastic containers with (1) relatively flat bottoms, to allow slides to rest level; (2) lids that are air-tight, but can still be easily removed without disturbing contents of container, and (3) are about 9 inches long by 6 inches wide are preferred |
Glass Coplin Jar | DWK Life Sciences Wheaton | 08-813E | |
Hydrophobic Barrier PAP Pen | ImmEdge | NC9545623 | |
Kimwipes | Kimtech Science | 06 666A | |
Levamisole Hydrochloride | Sigma Aldrich | L0380000 | |
Magnesium Sulfate Anhydrous | Fisher Chemical | M65 500 | |
Needles, Single-use, 25 G | BD PrecisionGlide | 14 821 13D | blue, 1 inch |
NGM Agar, Granulated | Apex Bioresearch Products | 20 249NGM | |
Parafilm | Bemis | 16 101 | |
Paraformaldehyde (16% w/v) Aqueous Solution | Electron Microscopy Sciences | 50 980 487 | |
PBS, Phosphate Buffered Saline (10x Solution) | Fisher BioReagents | BP399500 | |
Petri Dishes, 60-mm | Tritech Research | NC9321999 | Non-vented, sharp edge |
Platinum wire (90% platinum, 10% iridium) | Tritech Research | PT 9010 | Used to make worm picks |
Potassium Chloride | Fisher | BP366-500 | |
Potassium Phosphate Dibasic | VWR BDH Chemicals | BDH9266 500G | |
Potassium Phosphate Monobasic | VWR BDH Chemicals | BDH9268 500G | |
Premium Cover Glasses 18 mm x 18 mm | Fisherbrand | 12-548-AP | 0.13–0.17 mm thickness |
Razor Blades, Single Edge | VWR | 55411 055 | |
SlowFade Gold Antifade Mountant | Molecular Probes | S36937 | Alternatives: VectaShield Antifade Mounting Medium (Vector Laboratories, H-1000-10) or ProLong Diamond Antifade (Thermo Fisher Scientific, P36970). If using ProLong Diamond, no nail polish is required for sealing, but slides must cure for 24 hours before imaging. |
Sodium Azide | Fisher BioReagents | BP922I 500 | |
Sodium Chloride | Fisher Chemical | S271 500 | |
Sodium Phosphate Dibasic Anhydrous | Sigma Aldrich | 7558 79 4 | |
Sodium Phosphate Dibasic Heptahydrate | Sigma Aldrich | S9390 | |
Styrofoam box | various | n/a | Approximate dimensions of interior: 12 inches long, 9 inches wide, 8 inches deep |
Superfrost Plus Microscope Slides | Fisherbrand | 22 037 246 | |
Triton X-100 | Fisher BioReagents | BP151 500 | |
Tryptone | Apex Bioresearch Products | 20 251 | |
Tween 20 | Fisher Chemical | BP337 500 | |
Yeast Extract | Apex Bioresearch Products | 20 254 |
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