우리는 우수한 기술 지원 안젤라 Kralemann - 쾰러 감사합니다. 여기에 기술 된 실험 연구는 실험실에서 수행되었으며, CK 및 BK와 BK에 대한 연구 및 교육의 독일 교육부 (BMBF)의 부여에 독일 연구 협회 (DFG)의 보조금에 의해 지원되었다.

윤리 문 본 연구는 정부의 동물 및 관리에 사용위원회, 국가 노스 라인 - 웨스트 팔리 아, (뒤셀도르프, 독일)의 LANUV의 규정에 따라 실시 하였다. 모든 동물 실험은 라이센스 번호 8.87-51.04.20.09.317 (LANUV, NRW)에서 LANUV, 뒤셀도르프에 의해 승인되었다. 모든 노력이 조난 및 연구에 필요한 동물의 수를 최소화하도록 하였다. 1. 동물 관리 및 주택 <ol><li> 연맹 유럽 실험 동물 과학 협회 (FELASA)에 의해 정의 된 명세서에 기술 된 프로토콜에 사용 된 모든 동물은 무균 상태에서 보관해야합니다. </li><li> HEPA 공기 여과와 마우스는 낮의 조건 (12 시간 빛 / 어둠주기)에 따라 온도와 습도 조절 (22 ° C) 방에 표준 케이지에 보관해야합니다. </li><li> 표준화 된 음식과 물을 임의로 제공한다. &lt;/ 리&gt; <li> IκB / TTA 및 IκB는 / IF - 대조군 마우스가 사용되는 7, 18에서 설명한 바와 같이, PCR-기반의 유전형은 각 동물에 대해 수행되어야한다. </li><li> 이하 사일의 나이 차이 말레 동물은 개별 변동을 줄이기 위해 사용되는 것이다. </li><li> (선택 사항) : NF-κB의 활성화의 실험을 위해, 독시 싸이클린은 적어도 14 일 동안 (2.5 % 자당 2 ㎎ / ㎖) 마시는 물을 관리해야합니다. </li></ol> 2. 공간 패턴 분리 - 반스 미로 (SPS-BM) <ol><li> 모든 행동 테스트는 국제 및 지역 가이드 라인에 따라 실시해야한다. </li><li> 중요! 6 개월 이상 연령이 만 수컷 마우스를 사용합니다. 하나의 테스트 시리즈의 동물 사이의 나이 차이가 적은 4 일 이상이어야합니다. 테스트는 각 시리즈에 대해 동일한 작업자가 수행해야합니다. 마우스는 또한 부분적으로 구동 동기를 부여하기 전에 테스트에 표준 식단을 받아야한다WEET 음식 보상. </li><li> 하드 플라스틱으로 만든 흰색 원형 접시를 설정 최소 4 × 80 (W)와 3 × 215 W 네온 형광 램프 조명, 습도 및 온도 조절 실 (22 ° C)에 (직경 120cm는,도 5a 참조) . 중요! 마우스의 동기가 부분적으로 밝은 노출 장소에 자신의 혐오에 의해 구동되는 음식의 주택을 입력으로, 올바른 조명이 사용되어 있는지 확인합니다. </li><li> 비디오 추적 시스템을 설정합니다. 카메라는 115cm 플레이트의 중앙 (그림 5A 참조) 위에 배치해야합니다. </li><li> 동물, 판의 경계에서 약 100 센티미터 (그림 5A 참조) 쉽게 볼 위치에 흰색 색 천에 여러 가지 빛깔 추가 미로 큐 (EMC)을 연결합니다. </li><li> 조심스럽게 실험 장치에서 모든 냄새를 제거 할 수있는 빠른 살균제 플레이트를 청소합니다. </li><li> 일곱 동일한 노란색 식품 주택 (12cm X 7cm × 8 cm의 그림 5A를 배치 </하얀 접시에)&gt; 강한. 위치는 (그림 5A 참조) 명백하게 표시해야한다. </li><li> 그림 5A에게 단 하나의 정의 음식 집은 동물 (위치 F에 자유롭게 접근 채 (그림 5A 참조) 정의 된 위치에있는 모든 음식을 집 안에 달콤한 음식 펠릿 보상 (Kellogs`의 Froot 루프 / 음식 집의 내무반)를 참조 배치 ). 투명 호일로 비 표적 식품 주택을 닫습니다. </li><li> 시험 전에, 습관화 (작업을 시작하기 전에 하루) 수행합니다. 모든 식품 주택 자유롭게 액세스 할 수있게하고, 마우스는 자유롭게 미로를 탐험하고 식품 펠​​렛 보상 (10 분 / 동물)를 검색 할 수 있습니다. </li><li> 컴퓨터와 카메라를 전환하고 영상 추적 시스템 소프트웨어를 시작합니다. </li><li> 녹음을 시작합니다. </li><li> 원형 접시에 정의 된 시작점 (그림 5A, S : 시작 위치)에 동물을 배치하고 마우스는 10 분 동안 대상 식품 하우스를 검색 할 수 있습니다. </li><li> 스토P 비디오 추적. </li><li> 중요! 빠른 살균제 각 시험 후 원형 접시와 음식의 주택을 청소합니다. </li><li> (각 동물에 대한) 일곱 연속 일 동안 매일 테스트를 반복합니다. </li><li> 적절한 통계 소프트웨어를 사용하여 결과 (대기 시간, 거리 적용 및 오류)를 분석합니다. 잘못된 음식 집 및 / 또는 입력하고 음식 펠릿 보상을 검색하지 않고 적절한 상자와의 접촉을 접근으로 오류를 정의합니다. 분류 분석을 위해 Bonferroni 사후 테스트를 양방향 ANOVA를 사용합니다. </li><li> (선택 사항) 쥐를 희생하고 아래에 설명 된대로 해마를 분석합니다. </li></ol> 3. BrdU의 라벨링 <ol><li> 삼일 (분화와 통합의 분석) 또는 단일 주사 (증식 분석) 200 ㎎ / ㎏ IP의 회 복강 내 50 ㎎ / ㎏의 IP가 BrdU를 주입. </li><li> , 동물을 희생 해마를 해부 아래에 설명 된대로 40 μm의 섹션을 준비합니다. </li><li> Denaturate10 분 동안 2 M HCl로 섹션 및 10 분 동안 0.1 M 보레이트 완충액 부화. </li><li> BrdU의에 대한 항체를 사용하여 아래에 설명 된대로, 면역 조직 화학 염색을 각 동물에서 40 μm의 섹션 (떨어져 240 μM)의 1 인 12 개의 시리즈 레이블을 지정합니다. </li><li> 과립 세포층과 subgranular 영역 rostrocaudal 범위에 걸쳐 공 촛점 현미경 분석에 의해 표지 된 세포를 정량화. DG 당 표지 세포의 수를 얻기 위해 두 가지에 의해 해마 및 분할 당 BrdU의 표지 세포의 예상 수를 얻기 위해 (12)에 의해 생성 된 숫자를 곱합니다. </li></ol> 4. 망막 비관 동물의 두뇌와 저온부의 제조 제거 <ol><li> 동물을 안락사에 대한 로컬 승인 절차를 준수하십시오. 마우스는 직접 자궁 전위에 의해 안락사 할 수있다. </li><li> (선택 사항) 동물 복강 인제에 의해 예를 들어, 지역 및 국제 가이드 라인에 따라 euthanization 전에 마취 할 수 있습니다(갓 식염수 나 생리 버퍼의 1.85 ㎖로 2.2 mg의 2,2,2 - tribromoethanol 이소 아밀 에탄올 ML 1에서 만든 150 ㎖의 원액을 혼합하여) 33g 마우스 0.8 ML Avertin의의의 ction. </li><li> 베타 딘 (10 % 포비돈 요오드)을 적신 70 % 에탄올에 적신 거즈로 그 후 거즈와 면봉을 사용하여 머리를 소독. </li><li> 적절한 수술 가위를 사용하여 동물의 목을 벨 옆 피부를 당겨. </li><li> (OPTIONAL) Fixators 뒤로 지연된 피부의 접는 피하기 위해 적용될 수있다. </li><li> 두개골의 중간 선 절개를 조심스럽게 옆으로 두개골 조각을 당기십시오. </li><li> 조심스럽게 적절한 외과 용 기기 (예 : 모리아 스푼)를 사용하여 뇌 전체를 제거합니다. </li><li> 드라이 아이스 -30 -40 ° C에서 50 ㎖ 비이커 (예 : Schott 쇼트 듀란)의 2 - 메틸 부탄의 Precool 25 ML. 참고 : 이상적으로 공 초점 레이저 주사 현미경에 적합하다 &quot;두께&quot;섹션의 자유 부동 염색의 경우, 뇌를 제거, 3 세척뇌 (보통 하룻밤) 아래로 아래로 침몰 할 때까지 인산 4 ° C에서 버퍼와 저장소에있는 시간은 50 ML 튜브에 30 % 자당 솔루션을 버퍼. </li><li> 조심스럽게 Nescofilm (파라 필름)의 조각에 뇌를 놓고 TissueTek의 OCT 화합물의 충분한 양 커버, -80 ° C에서 사용할 때까지 2 - 메틸 부탄, 저장소에 Nescofilm에 동결. 참고 : 9 % 자당, 7 mM의 MgCl2를, 50 mM의 인산염 완충액, 44 % 글리세롤에 -20 ° C 점에서 오랜 시간 보관하십시오. </li><li> 적절한 cryomicrotome에 10 ~ 12 μm의 두께 섹션으로 머리를 잘라. 참고 : 두께, 자유 부동 섹션의 경우 (예 : Reichert는 정, Frigomobil.) 및 -20 °에서 40 μm의 수평 부분을 잘라 적절한 cryotome의 cryotome 무대에서 뇌 동결 - 25 ° C. 미세 브러시와 나이프에서 섹션을 수집하고 버퍼에 수집하거나 장기간 저장을 위해 -20 ° C에서 (4.9 단계) 스토리지 솔루션을 유지. </li><li> 조심스럽게 하나의 현미경 슬라이드에 두 조각을 탑재합니다. 우리Superfrost UltraPlus 슬라이드 전자가 높은 부분의 접착 성을 극대화하는 것이 좋습니다. </li><li> 실온에서 5 분간 슬라이드를 건조. 슬라이드를 사용할 때까지 -80 ° C에 저장할 수 있습니다. </li></ol> 5. 관류 동물에서 섹션의 준비 <ol><li> (단계 8.4) 상술 한 바와 같이 동물을 마취. </li><li> 조심스럽게 10 ~ 15 분 동안 PBS에 4 % 파라 포름 알데히드 다음 2 ~ 4 분 동안 인산염 완충 헤파린을 함유하는 생리 식염수 (PBS) (0.025 100g 당 ml의 PBS) 및 프로 카인 (0.5 100g 당 ml의 PBS)로 transcardially 동물을 perfuse . 관류 최적으로 약 1.2-1.4 m 또는 약 15 ㎖ / 분으로 설정 연동 펌프를 사용의 수압을 이용하여 좌심실과 우심방의 개방을 통해 관류에 의해 수행된다. 더 붉은 혈관이 눈에 보이는 것없는 그 창백한 흰색 두뇌에 최적의 관류 결과. </li><li> 해부 및 24 시간 동안 4 ° C에서 4 % 파라 포름 알데히드의 뇌를 사후 수정. </li><li> 극저온최소 24 시간 동안 4 ° C에서 PBS의 30 % 자당의 머리를 보호합니다. </li><li> cryotome 무대에서 머리를 고정. </li><li> 적절한 cryotome를 사용하여 전체 forebrains에서 40 μm의 수평 섹션을 준비합니다. </li><li> 슬라이드는 -20 ° C에서 사용할 때까지 동결 방지제 용액 (0.1 M 인산염 완충액, 50 % 글리세롤, 0.14 %의 MgCl2를 8.6 % 자당)에 저장 될 수 있습니다. </li></ol> 6. 망막 비관 동물의 뇌 섹션의 면역 조직 화학 <ol><li> 10 분 동안 -20 ° C, 냉 메탄올을 사용하여, 전술 한 바와 같이 제조 저온부를 사후 고정한다. </li><li> 4 ℃에서 하룻밤 (이차 항체를 제기에 사용 된 종) 0.3 % 트리톤-X를 포함하는 5 % 정상 혈청 차단 </li><li> 1X PBS로 3 회 세척하고 4 ℃에서 밤새 차 항체와 부화 </li><li> 1X PBS로 3 회 헹구 1 시간 동안 실온에서 이차 항체와 함께 배양한다. </li><li> 1X PBS로 3 회 씻어 </li><li> 기SYTOX 녹색 또는 DAPI (또는 대안 DNA 염료)를 사용하여 DNA를위한 섹션 nterstain. </li><li> 1X PBS로 3 회 씻어 </li><li> 수성 삽입 매체의 섹션을 포함합니다. </li><li> 삽입 매체는 적어도 48 시간 동안 중합 보자. </li></ol> 7. 관류 동물의 뇌 섹션의 면역 조직 화학 <ol><li> 단계 6.2에서 설명하고 이후 4 ℃에서 하룻밤 동안 0.3 % 트리톤-X (자유 부동)를 포함하는 PBS에 희석 차 항체 용액에 고정 된 뇌 부분을 품어로 차단 </li><li> 1X PBS로 3 회 헹군 후 3 시간 동안 실온에서 0.3 % 트리톤 X-(부동성)를 함유하는 PBS에 희석 차 항체 용액에 부화. </li><li> 1X PBS로 3 회 씻어 </li><li> SYTOX 녹색 또는 DAPI (또는 다른 DNA 염료)를 사용하여 DNA에 대한 섹션을 Counterstain. </li><li> 1X PBS로 3 회 씻어 </li><li> 수성 삽입 매체의 섹션을 포함합니다. </li><li> 매립 매체에 대한 중합하자T 최소 48 시간. </li></ol> 8. 이끼 낀 섬유 계획 조사 <ol><li> , 동물을 희생 상술 한 바와 같이 40 μm의 코로나 섹션을 준비하고 신경 미세 섬유 M.에 대한 항체를 사용하여 해마 부분을 얼룩 </li><li> 이끼 섬유와 핵을 시각화하는 공 초점 레이저 주사 현미경을 사용하여 적절한 파장에서 섹션을 스캔. 낮은 배율에서 스캔을 시작합니다. </li><li> 방향의 낮은 배율 이미지를 사용하여 이끼 섬유 돌기 해마를 대상으로. </li><li> 높은 해상도와 높은 배율 섹션 (Z-절편)을 검사합니다. </li><li> NF-M에 대한 염색을 통해 시각화 이끼 섬유의 형태 학적 모양과 연결을 분석합니다. </li><li> (선택 사항) 해마 블레이드의 크기와 볼륨을 분석합니다. 측정을위한 DNA 신호를 사용합니다. </li></ol> 9. 플루오로 옥 C 분석 (신경 세포의 죽음) <ol><li> 동물을 희생 hippoc 해부ampus, 전술 한 바와 같이 12 μm의 섹션을 준비합니다. </li><li> 섹션은 실온에서 30 분 동안 건조 시키십시오. </li><li> 실온에서 40 분 동안 4 % PFA의 섹션을 고정한다. </li><li> 간단히 섹션 DDH 2 O.와 배 세척 </li><li> 연속, 부드러운 흔들림에서 10 분 동안 0.06 % 과망간산 칼륨 (의 KMnO4)과 섹션을 품어. </li><li> 섹션 DDH 2 O로 3 배 씻으 </li><li> 실온에서 20 분간 0.002 % 플루오로 옥 C 용액으로 섹션 부화. </li><li> (옵션)을 동시에 핵 염색에 들어, 0.002 % 플루오로 옥 C 솔루션은 10 ㎍ / ㎖의의 DAPI로 보충 할 수있다. </li><li> 간단히 섹션 DDH 2 O.와 배 세척 </li><li> 섹션은 실온에서 30 분 동안 건조 시키십시오. </li><li> 크실렌과 섹션을 품어 (1 분) </li><li> 크실렌 기반 설치 매체 (DPX)를 사용하여 섹션을 탑재합니다. </li></ol>

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저자는 이익에 대한 갈등이 없다는 것을 선언합니다.

성인 신경, 독시 싸이클린을 통해 신경 세포에서 NF-κB의 억제, 그 이후 재 활성화를 통해 그 조작의 가능성은 성인 뇌뿐만 아니라 신경 드 다시 세대에 신생아 뉴런에 수사 매혹적인 시스템을 제공합니다 . 이 시스템의 장점은 그 신경 세포의 죽음, 조상의 증식과 이동, 심각한 구조 및 해부학 적 변화뿐만 아니라, 명백한 학습 결함의 변화에​​ 신경 결과뿐만 아니라에서 NF-κB 신호 전달 경로를 ?...

론적, 해마는 알려진 가장 오래된 해부 뇌 구조의 하나이다. 그런 장기 기억, 공간 방향, 및 각각의 메모리 형성 및 통합의 조절에 중추적 인 기능 등 다양한 복잡한 태스크를 책임진다. 해부학, 해마는 subgranular 영역 내에서 과립 세포와 약간의 신경 전구 세포를 포함하는 뿔 Ammonis (CA1, CA2, CA3 및 CA4) 지역과 치아 이랑 (dentate gyrus) (이랑 dentatus), 등의 피라미드 세포 층 (지층 pyramidale)로 구성 . 과립 세포는 소위 이끼 섬유 (과립 세포의 축삭)를 통해 CA3 영역을 향해 돌출. 지난 세기 말까지, 성인 포유류의 뇌 세포의 가소성과 신경을 결여 정적 인 기관이 될 것으로 추정했다. 그러나 지난 20 년간, 기록의 성장 양이 명확하게 일어나고 성인 신경을 보여줍니다 이상두 뇌 영역, subventricular 영역 (SVZ) 및 해마의 subgranular 영역. 우리의 이전 연구와 다른 그룹의 사람들은 전사 인자 NF-κB가 성인 신경의 중요한 분자 규제 중 하나이며, 심각한 구조적 해마 결함과인지 장애 1-6에서의 규제 완화의 결과가 있다는 것을 보여 주었다. NF-κB는 다섯 DNA 결합 서브 유닛의 다른 이량 체의 조합으로 구성된 유도 전사 인자의 총칭이다 : P50, P52, C-상대, RelB 및 P65 (상대적), 후자의 세 전이 활성화 도메인이. 뇌 내에서 세포질에서 발견되는 가장 풍부한 형태는 P50와 카파 B (IκB) 단백질의 억제하여 비활성 형태로 유지 P65의 이종입니다. NF-κB 중심 신경을 공부하고 직접 조작하기 위해, 우리는 NF-κB의 subun의 모든 간단한 억제 할 수 있도록 유전자 변형 마우스 모델을 사용그는 구체적 전뇌 7 (도 1 참조). 및 -/tTA -이를 위해, 우리는 다음의 유전자 변형 마우스 라인 IκB / 교차 사육. 형질 전환 IκB / - 라인은 NF-κB 억제제 IκBa (슈퍼 억제 IκBa-AA1)의 트랜스 지배적 부정적인 돌연변이 체를 사용하여 생성 된 8. 야생형 IκBα 달리 IκBα-AA1은 억제제의 인산화와 후속 프로 테오 분해를 방해 알라닌 (V32 및 V36)에 변이 개의 세린 잔기를 갖는다. IκBa-AA1-유전자의 전뇌 신경 세포의 특정 표현, IκB / - 마우스는 마우스는 칼슘 - 칼 모듈 린 의존성 키나제를 숨겨와 교차 자란 IIα 테트라 사이클린 트랜스 활성제 (TTA)에 의해 구동 될 수있다 (CAMKIIα) 발기인 9. P65 녹아웃 마우스 인해 대규모 간 세포 사멸 (10), 배아 치명적인 표현형이있다, 그래서 여기에 표시된 방법은 우아한 방법을 제공출생 후 성인 신경에서 NF-κB의 역할을 조사하는. 공간 학습과 기억을 연구하는 고전적인 행동 시험은 리처드 모리스, 모리스 물 미로 (MWM) 11로 알려진 시험에 의해 1980 년대에 설명했다. 이 오픈 필드 물 미로에서, 동물은 방향과 추가 - 미로 단서에 따라 숨겨진 플랫폼에 불투명 한 물에서 탈출을 배웁니다. MWM의 건조 변형은 소위 반스 미로 (BM) 12. 이 테스트는 하나의 탈출 상자로 정의 된 구멍 및 방향에 대한 시각적 여분 미로 단서로, 판의 경계에 배치 (20)의 원형 구멍이있는 원형 접시를 사용합니다. 두 실험 패러다임은 짐승`의 물에 대한 혐오, 또는 오픈, 밝은 조명 공백으로 유도 비행 동작에 의존하고 있습니다. 두 시험은 공간 방향에 대한 조사 및 관련 메모리 성능을 할 수 있습니다. 해마는 공간 기억 형성의 일반적이고 필수적인 역할을하지만, 해마 R참여 egions 적용 시험에 따라 다릅니다. BM에서 테스트 메모리는 enthorinal 피질 (EC)와 DG 13-16의 기여없이 해마의 CA1 - 지역에있는 피라미드 뉴런 사이의 연결 활동에서 발생한다. 특히, 고전 BM은 주로 중요한 것은, DG가 결정적으로 처리뿐만 아니라 의미 소위 공간 패턴 인식 17 일에 관여 EC V.에 CA1에 EC III에서 monosynaptic 측두 - ammonic 경로를 통해 탐색에 의존 시각 및 공간 정보뿐만 아니라, 서로 다른, 겹치지 않는 표현으로 유사한 표현이나 기억의 변형. 이 작업은 CA1과 BM (15)에 테스트 할 수 없습니다 EC VI에 CA3에 DG에 EC II에서 기능 트라이 시냅스 회로가 필요합니다. 이러한 문제를 해결하기 위해, 우리는 구체적으로 공동의 치아 이랑 (dentate gyrus)에 의존하는인지 성능을 테스트하기 위해 행동 테스트로 SPS-BM을 고안했다ntrol 동물 및 NF-κB 억제 다음 IκB / TTA 슈퍼 억제 모델. 중요한 것은, MWM 또는 BM 대조적으로, SPS-BM은 신경의 손상으로 인해 발생하는 미묘한 행동 적자를 공개 할 수 있습니다. 공간 패턴 분리가 E​​C II와 DG와 CA3와 CA1과 EC VI 사이의 기능 회로에 엄격하게 의존하기 때문에,이 테스트는 내 잠재적 인 신경의 변화, 이끼 섬유 경로의 수정 또는 조직의 항상성의 변화에​​ 매우 민감 DG. 기술적으로, 우리의 테스트의 셋업은 Clelland 등의 연구를 기반으로합니다., 공간적 분리 패턴이 나무 8 팔 레이디 얼 미로 (RAM) 19를 사용하여 테스트 한에서. 우리의 수정 된 설정에있는 8 개의 팔은 일곱 동일한 노란색 식품 하우스로 대체되었다. 요약하면, 방법은 해마, 이끼 섬유 돌기, 신경 세포 드에게 내 doublecortin 발현 (DCX +) 세포의 분석을 포함하여, 여기에 표시ATH 특히 SPS-BM 여기서 제시된, 성인 신경에 영향을 도입 유전자를 도입 한 다른 마우스 모델 연구에 적용될 수있다. 또한 응용 프로그램이되는 약물의 연구와 DG 및 공간 패턴의 분리에 미치는 영향을 측정을 포함 할 수있다.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="872">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">Moria MC17 Perforated Spoon&#160;</td>
			<td style="width:127px;">FST</td>
			<td style="width:132px;">10370-18</td>
			<td style="width:167px;">removal of the brains</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Dissecting microscope</td>
			<td>Carl Zeiss</td>
			<td>Stemi SV8</td>
			<td>removal of the brains</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Surgical scissors&#160;</td>
			<td style="width:127px;">FST</td>
			<td>14084-08</td>
			<td>removal of the brains</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Surgical scissors&#160;</td>
			<td style="width:127px;">FST</td>
			<td>14381-43</td>
			<td>removal of the brains</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Dumont #5 forceps</td>
			<td style="width:127px;">FST</td>
			<td>11254-20</td>
			<td>removal of the brains</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">SuperFrost Slides</td>
			<td>Carl Roth&#160;</td>
			<td align="right">1879</td>
			<td>slides for immunohistochemistry</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">Paraformaldehyde</td>
			<td style="width:127px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>P6148</td>
			<td>fixative</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">TissueTek OCT compound</td>
			<td>Sakura Finetek</td>
			<td style="width:132px;">1004200018</td>
			<td>embedding of the brains</td>
		</tr>
		<tr height="35">
			<td height="35" style="height:35px;width:447px;">Normal Goat Serum</td>
			<td style="width:127px;">Jackson Immunolabs</td>
			<td style="width:132px;">005-000-001</td>
			<td>blocking in IHC</td>
		</tr>
		<tr height="35">
			<td height="35" style="height:35px;width:447px;">Normal Rabbit Serum</td>
			<td style="width:127px;">Jackson Immunolabs</td>
			<td style="width:132px;">011-000-001</td>
			<td>blocking in IHC</td>
		</tr>
		<tr height="35">
			<td height="35" style="height:35px;">Normal Donkey Serum</td>
			<td style="width:127px;">Jackson Immunolabs</td>
			<td style="width:132px;">017-000-001</td>
			<td>blocking in IHC</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">anti-Neurofilament-M antibody</td>
			<td>Developmental Studies Hybridoma Bank</td>
			<td>2H3</td>
			<td>IHC, Dilution 1:200</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">anti-doublecortin&#160;antibody</td>
			<td>sc-8066</td>
			<td>Santa Cruz</td>
			<td>IHC, Dilution 1:800</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">anti-GFP antibody</td>
			<td>ab290</td>
			<td>abcam</td>
			<td>IHC, Dilution 1:2000</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">anti-BrdU antibody</td>
			<td>OBT0030G</td>
			<td>Accurate Chemicals</td>
			<td>IHC, Dilution 1:2000&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">Fluoro Jade-C</td>
			<td>FJ-C</td>
			<td>HistoChem</td>
			<td>Determination of neuronal cell death</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">Betadine</td>
			<td style="width:127px;">&#160;MUNDIPHARMA</td>
			<td>D08AG02&#160;</td>
			<td>disinfectant</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">cryomicrotome</td>
			<td>Leica</td>
			<td>CM1900</td>
			<td>preparation of brain slices</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">Heparin sodium salt</td>
			<td style="width:127px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:132px;">H3393</td>
			<td>perfusion</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">circular plate made from hard-plastic (diameter 120 cm)</td>
			<td style="width:127px;">lab made</td>
			<td style="width:132px;">none</td>
			<td>plate for SPS-BM, diameter 120cm</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Buraton rapid disinfectant&#160;</td>
			<td style="width:127px;">Sch&#252;lke &#38; Mayr</td>
			<td style="width:132px;">113 911</td>
			<td>disinfectant</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">video-tracking system TSE VideoMot 2 with Software Package VideoMot2</td>
			<td>tse systems</td>
			<td style="width:132px;">302050-SW-KIT</td>
			<td>tracking and analysis of SPS-BM</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Triton X-100&#160;</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T8787</td>
			<td>permeabilisation/IHC</td>
		</tr>
		<tr height="35">
			<td height="35" style="height:35px;width:447px;">cryotome</td>
			<td style="width:127px;">Reichert&#160; Jung/Leica</td>
			<td style="width:132px;">Frigomobil 1206</td>
			<td>preparation of 40&#181;m brain slices</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">Mowiol 4-88</td>
			<td style="width:127px;">Carl Roth&#160;</td>
			<td>Art.-Nr. 0713</td>
			<td>embedding of the slides</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">SYTOX green</td>
			<td style="width:127px;">Invitrogen</td>
			<td>S7020</td>
			<td>Nuclear staining</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">Food pellets (Kellog`s Froot Loops)</td>
			<td>Kellog`s</td>
			<td style="width:132px;"></td>
			<td>SPS-BM</td>
		</tr>
		<tr height="52">
			<td height="52" style="height:52px;width:447px;">Prism, Version 3.0</td>
			<td style="width:127px;">Graph Pad Software, San Diego, USA&#160;</td>
			<td style="width:132px;"></td>
			<td>Statistical evaluation of SPS-BM</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">Zen 2008 or Zen 2011 Software</td>
			<td style="width:127px;">Carl Zeiss</td>
			<td style="width:132px;"></td>
			<td>Software (Confocal microscope)</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:447px;">D.P.X</td>
			<td style="width:127px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:132px;">317616</td>
			<td>mounting medium for Fluoro Jade C staining</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

methods for the modulation and analysis of nf-&#954;b-dependent adult neurogenesis

해마는 일시적인 기억의 형성 및 통합에 중요한 역할을하며, 공간 방향. 역사적으로, 성인의 해마가 포유 동물 뇌의 매우 정적 인 해부학 적 영역으로 조회되었습니다. 그러나, 최근의 연구 결과는 해마의 치아 이랑은 기존의 연결 회로의 수정뿐만 아니라, 성인 신경뿐만 아니라 포함, 성인의 엄청난 가소성의 영역임을 증명하고있다. 이 소성은 전사 인자 NF-κB가 중요한 역할을 담당하는, 전사 복잡한 네트워크에 의해 조절된다. 성인 신경, NF-κB 활성의 전뇌 특정 신경 세포의 억제를위한 형질 전환 마우스 모델을 사용할 수를 연구하고 조작 할 수 있습니다. 본 연구 방법은 구조적 측면, 신경 세포의 사멸 및 전구 확산,인지 의미, whic 포함하여 NF-κB에 의존하는 신경의 분석에 대해 설명합니다H는 특히 치아 이랑 (DG)에 의존하는 행동 테스트, 공간 패턴 분리 - 반스 미로 (SPS-BM)을 통해 평가되었다. SPS-BM 프로토콜은 단순히 성인 해마 신경의 특정 유전자의 영향을 평가하기 위해 설계된 다른 트랜스 제닉 동물 모델에 사용하기 위해 적응 될 수있다. 또한, SPS-BM는 약리학 제제를 사용하여, 예를 들면, DG 의존 학습을 조사하고 조작 겨냥한 다른 실험 설정에서 사용될 수있다.

IκB /의 교배 - 그리고 TTA 유전자 변형 마우스 라인은 해마에서 NF-κB 활성의 조건 억제에 이르게한다. 이중 형질 전환 마우스 (그림 1A)에서 IκBα-AA1-유전자의 발현을 조사하기 위해, 뇌 절연, 저온 절단 및 GFP (녹색 형광 단백질)에 대한 항체를 사용하여 염색 하였다. 공 초점 레이저 주사 현미경은 CA1과 CA3 지역에서 유전자의 고 발현을 공개하고, DG <str...

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Methods for the Modulation and Analysis of NF-&amp;#954;B-dependent Adult Neurogenesis

NF-κB에 의존하는 성인의 해마 신경의 조작 및 분석을위한 방법이 설명되어 있습니다. 자세한 프로토콜은 마우스의인지 결과의 조사를 위해 치아 이랑 (dentate gyrus)에 의존하는 행동 테스트 (공간 패턴 분리 - 바네스의 미로라고합니다)에 제공된다. 이 기술은 또한 다른 실험 설정에서 조사를 활성화하는 데 도움이됩니다.

NF-κB에 의존하는 성인 신경 발생의 변조 및 분석을위한 방법

The hippocampus plays a pivotal role in the formation and consolidation of episodic memories, and in spatial orientation. Historically, the adult ...

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Research

JoVE Journal

Neuroscience

Methods for the Modulation and Analysis of NF-&#954;B-dependent Adult Neurogenesis

14.2K 조회수.  University of Bielefeld.  NF-κB에 의존하는 성인의 해마 신경의 조작 및 분석을위한 방법이 설명되어 있습니다. 자세한 프로토콜은 마우스의인지 결과의 조사를 위해 치아 이랑 (dentate gyrus)에 의존하는 행동 테스트 (공간 패턴 분리 - 바네스의 미로라고합니다)에 제공된다. 이 기술은 또한 다른 실험 설정에서 조사를 활성화하는 데 도움이됩니다. 

비디오: Methods for the Modulation and Analysis of NF-&#954;B-dependent Adult Neurogenesis

Cerebrovascular Casting of the Adult Mouse for 3D Imaging and Morphological Analysis

Vascular imaging is crucial in the clinical diagnosis and management of cerebrovascular diseases, such as brain arteriovenous malformations (BAVMs). Animal models are necessary for studying the etiopathology and potential therapies of cerebrovascular diseases. Imaging the vasculature in large animals is relatively easy. However, developing vessel imaging methods of murine brain disease models is desirable due to the cost and availability of genetically-modified mouse lines. Imaging the murine cerebral vascular tree is a challenge. In humans and larger animals, the gold standard for assessing the angioarchitecture at the macrovascular (conductance) level is x-ray catheter contrast-based angiography, a method not suited for small rodents.
In this article, we present a method of cerebrovascular casting that produces a durable skeleton of the entire vascular bed, including arteries, veins, and capillaries that may be analyzed using many different modalities. Complete casting of the microvessels of the mouse cerebrovasculature can be difficult; however, these challenges are addressed in this step-by-step protocol. Through intracardial perfusion of the vascular casting material, all vessels of the body are casted. The brain can then be removed and clarified using the organic solvent methyl salicylate. Three dimensional imaging of the brain blood vessels can be visualized simply and inexpensively with any conventional brightfield microscope or dissecting microscope. The casted cerebrovasculature can also be imaged and quantified using micro-computed tomography (micro-CT)1. In addition, after being imaged, the casted brain can be embedded in paraffin for histological analysis.
The benefit of this vascular casting method as compared to other techniques is its broad adaptation to various analytic tools, including brightfield microscopic analysis, CT scanning due to the radiopaque characteristic of the material, as well as histological and immunohistochemical analysis. This efficient use of tissue can save animal usage and reduce costs. We have recently demonstrated application of this method to visualize the irregular blood vessels in a mouse model of adult BAVM at a microscopic level2, and provide additional images of the malformed vessels imaged by micro-CT scan. Although this method has drawbacks and may not be ideal for all types of analyses, it is a simple, practical technique that can be easily learned and widely applied to vascular casting of blood vessels throughout the body.

In this article, we present a simple, practical technique for cerebrovascular casting that is easy to perform and can be utilized to image the vascular tree of the adult mouse brain.

3D 이미징 및 형태학의 분석을위한 성인 마우스 뇌혈관 캐스팅

Vascular imaging is crucial in the clinical diagnosis and management of cerebrovascular diseases, such as brain arteriovenous malformations (BAVMs). ...

연구

신경과학

Functional Interrogation of Adult Hypothalamic Neurogenesis with Focal Radiological Inhibition

The functional characterization of adult-born neurons remains a significant challenge. Approaches to inhibit adult neurogenesis via invasive viral delivery or transgenic animals have potential confounds that make interpretation of results from these studies difficult. New radiological tools are emerging, however, that allow one to noninvasively investigate the function of select groups of adult-born neurons through accurate and precise anatomical targeting in small animals. Focal ionizing radiation inhibits the birth and differentiation of new neurons, and allows targeting of specific neural progenitor regions. In order to illuminate the potential functional role that adult hypothalamic neurogenesis plays in the regulation of physiological processes, we developed a noninvasive focal irradiation technique to selectively inhibit the birth of adult-born neurons in the hypothalamic median eminence. We describe a method for Computer tomography-guided focal irradiation (CFIR) delivery to enable precise and accurate anatomical targeting in small animals. CFIR uses three-dimensional volumetric image guidance for localization and targeting of the radiation dose, minimizes radiation exposure to nontargeted brain regions, and allows for conformal dose distribution with sharp beam boundaries. This protocol allows one to ask questions regarding the function of adult-born neurons, but also opens areas to questions in areas of radiobiology, tumor biology, and immunology. These radiological tools will facilitate the translation of discoveries at the bench to the bedside.

The function of adult-born mammalian neurons remains an active area of investigation. Ionizing radiation inhibits the birth of new neurons. Using computer tomography-guided focal irradiation (CFIR), three-dimensional anatomical targeting of specific neural progenitor populations can now be used to assess the functional role of adult neurogenesis.

초점 방사선 억제와 성인 시상 하부의 신경 발생의 기능 심문

The functional characterization of adult-born neurons remains a significant challenge. Approaches to inhibit adult neurogenesis via invasive viral ...

Heat-Induced Antigen Retrieval: An Effective Method to Detect and Identify Progenitor Cell Types during Adult Hippocampal Neurogenesis

Traditional methods of immunohistochemistry (IHC) following tissue fixation allow visualization of various cell types. These typically proceed with the application of antibodies to bind antigens and identify cells with characteristics that are a function of the inherent biology and development. Adult hippocampal neurogenesis is a sequential process wherein a quiescent neural stem cell can become activated and proceed through stages of proliferation, differentiation, maturation and functional integration. Each phase is distinct with a characteristic morphology and upregulation of genes. Identification of these phases is important to understand the regulatory mechanisms at play and any alterations in this process that underlie the pathophysiology of debilitating disorders. Our heat-induced antigen retrieval approach improves the intensity of the signal that is detected and allows correct identification of the progenitor cell type. As discussed in this paper, it especially allows us to circumvent current problems in detection of certain progenitor cell types.

During adult hippocampal neurogenesis, a distinct set of genetic markers are expressed when a quiescent neural stem cell sequentially progresses and develops into a functionally integrated neuron in the circuit. Using heat-induced antigen retrieval, progenitor cell types that are otherwise difficult to detect are identified with improved effectiveness.

Traditional  methods of immunohistochemistry (IHC) following tissue fixation allow visualization  of various cell types. These typically proceed with the ...

Stab Wound Injury of the Zebrafish Adult Telencephalon: A Method to Investigate Vertebrate Brain Neurogenesis and Regeneration

Adult zebrafish have an amazing capacity to regenerate their central nervous system after injury. To investigate the cellular response and the molecular mechanisms involved in zebrafish adult central nervous system (CNS) regeneration and repair, we developed a zebrafish model of adult telencephalic injury.
In this approach, we manually generate an injury by pushing an insulin syringe needle into the zebrafish adult telencephalon. At different post injury days, fish are sacrificed, their brains are dissected out and stained by immunohistochemistry and/or in situ hybridization (ISH) with appropriate markers to observe cell proliferation, gliogenesis, and neurogenesis. The contralateral unlesioned hemisphere serves as an internal control. This method combined for example with RNA deep sequencing can help to screen for new genes with a role in zebrafish adult telencephalon neurogenesis, regeneration, and repair.

To shed light on the cellular and molecular mechanisms of zebrafish adult neurogenesis and regeneration, we developed a protocol for invasive surgery causing mechanical injuries in the zebrafish adult telencephalon and subsequent monitoring of changes in the stabbed hemisphere by immunohistochemistry or in situ hybridization.

Zebrafish의 성인 Telencephalon의 자상 부상 : 척추 동물의 뇌 신경 발생과 재생을 조사하는 방법

Adult zebrafish have an amazing capacity to regenerate their central nervous system after injury. To investigate the cellular response and the molecular ...

Immunohistochemistry and Multiple Labeling with Antibodies from the Same Host Species to Study Adult Hippocampal Neurogenesis

Adult neurogenesis is a highly regulated, multi-stage process in which new neurons are generated from an activated neural stem cell via increasingly committed intermediate progenitor subtypes. Each of these subtypes expresses a set of specific molecular markers that, together with specific morphological criteria, can be used for their identification. Typically, immunofluorescent techniques are applied involving subtype-specific antibodies in combination with exo- or endogenous proliferation markers. We herein describe immunolabeling methods for the detection and quantification of all stages of adult hippocampal neurogenesis. These comprise the application of thymidine analogs, transcardial perfusion, tissue processing, heat-induced epitope retrieval, ABC immunohistochemistry, multiple indirect immunofluorescence, confocal microscopy and cell quantification. Furthermore we present&#160;a sequential multiple immunofluorescence protocol which circumvents problems usually arising from the need of using primary antibodies raised in the same host species. It allows an accurate identification of all hippocampal progenitor subtypes together with a proliferation marker within a single section. These techniques are a powerful tool to study the regulation of different progenitor subtypes in parallel, their involvement in brain pathologies and their role in specific brain functions.

This video article illustrates a comprehensive protocol to detect and quantify all stages of adult hippocampal neurogenesis within the same tissue section. We elaborated a method to overcome the limitations of indirect multiple immunofluorescence that arise when suitable antibodies from different host species are unavailable.

동일한 호스트 종에서 항체와 면역 조직 화학 및 다중 라벨은 성인 해마 신경 발생을 연구하기 위해

Adult neurogenesis is a highly regulated, multi-stage process in which new neurons are generated from an activated neural stem cell via increasingly ...

Assessing Primary Neurogenesis in Xenopus Embryos Using Immunostaining

Primary neurogenesis is a dynamic and complex process during embryonic development that sets up the initial layout of the central nervous system. During this process, a portion of neural stem cells undergo differentiation and give rise to the first populations of differentiated primary neurons within the nascent central nervous system. Several vertebrate model organisms have been used to explore the mechanisms of neural cell fate specification, patterning, and differentiation. Among these is the African clawed frog, Xenopus, which provides a powerful system for investigating the molecular and cellular mechanisms responsible for primary neurogenesis due to its rapid and accessible development and ease of embryological and molecular manipulations. Here, we present a convenient and rapid method to observe the different populations of neuronal cells within Xenopus central nervous system. Using antibody staining and immunofluorescence on sections of Xenopus embryos, we are able to observe the locations of neural stem cells and differentiated primary neurons during primary neurogenesis.

Assessing Primary Neurogenesis in Xenopus Embryos Using Immunostaining

This article presents a convenient and rapid method for visualizing different neuronal cell populations in the central nervous system of Xenopus embryos using immunofluorescent staining on sections.

에서 차 신경 발생 평가<em&gt; Xenopus의</em&gt; 배아 사용하여 면역 염색

Primary neurogenesis is a dynamic and complex process during embryonic development that sets up the initial layout of the central nervous system. During ...

Analyzing Synaptic Modulation of Drosophila melanogaster Photoreceptors after Exposure to Prolonged Light

The nervous system has the remarkable ability to adapt and respond to various stimuli. This neural adjustment is largely achieved through plasticity at the synaptic level. The Active Zone (AZ) is the region at the presynaptic membrane that mediates neurotransmitter release and is composed of a dense collection of scaffold proteins. AZs of Drosophila melanogaster (Drosophila) photoreceptors undergo molecular remodeling after prolonged exposure to natural ambient light. Thus the level of neuronal activity can rearrange the molecular composition of the AZ and contribute to the regulation of the functional output.
Starting from the light exposure set-up preparation to the immunohistochemistry, this protocol details how to quantify the number, the spatial distribution, and the delocalization level of synaptic molecules at AZs in Drosophila photoreceptors. Using image analysis software, clusters of the GFP-fused AZ component Bruchpilot were identified for each R8 photoreceptor (R8) axon terminal. Detected Bruchpilot spots were automatically assigned to individual R8 axons. To calculate the distribution of spot frequency along the axon, we implemented a customized software plugin. Each axon&#39;s start-point and end-point were manually defined and the position of each Bruchpilot spot was projected onto the connecting line between start and end-point. Besides the number of Bruchpilot clusters, we also quantified the delocalization level of Bruchpilot-GFP within the clusters. These measurements reflect in detail the spatially resolved synaptic dynamics in a single neuron under different environmental conditions to stimuli.

Analyzing Synaptic Modulation of Drosophila melanogaster Photoreceptors after Exposure to Prolonged Light

Here we show how to quantify the number and spatial distribution of synaptic active zones in Drosophila melanogaster&#160;photoreceptors, highlighted with a genetically encoded molecular marker, and their modulation after prolonged exposure to light.

의 시냅틱 변조 분석<em&gt; 노랑 초파리</em&gt; 장시간 빛에 노출 후 광수

The nervous system has the remarkable ability to adapt and respond to various stimuli. This neural adjustment is largely achieved through plasticity at ...

The Mouse Hindbrain As a Model for Studying Embryonic Neurogenesis

The mouse embryo forebrain is the most commonly employed system for studying mammalian neurogenesis during development. However, the highly folded forebrain neuroepithelium is not amenable to wholemount analysis to examine organ-wide neurogenesis patterns. Moreover, defining the mechanisms of forebrain neurogenesis is not necessarily predictive of neurogenesis in other parts of the brain; for example, due to the presence of forebrain-specific progenitor subtypes. The mouse hindbrain provides an alternative model for studying embryonic neurogenesis that is amenable to wholemount analysis, as well as tissue sections to observe the spatiotemporal distribution and behavior of neural progenitors. Moreover, it is easily dissected for other downstream applications, such as cell isolation or molecular biology analysis. As the mouse hindbrain can be readily analyzed in the vast number of cell lineage reporter and mutant mouse strains that have become available, it offers a powerful model for studying the cellular and molecular mechanisms of developmental neurogenesis in a mammalian organism. Here, we present a simple and quick method to use the mouse embryo hindbrain for analyzing mammalian neural progenitor cell (NPC) behavior in wholemount preparations and tissue sections.

This article demonstrates how the mouse embryonic hindbrain can be used as a model for studying developmental neurogenesis in both whole organ and tissue section preparations.

마우스 Hindbrain 배아 신생 공부에 대 한 모델

The mouse embryo forebrain is the most commonly employed system for studying mammalian neurogenesis during development. However, the highly folded ...

Metabolic Analysis of Drosophila melanogaster Larval and Adult Brains

This protocol describes a method for measuring the metabolism in Drosophila melanogaster larval and adult brains. Quantifying metabolism in whole organs provides a tissue-level understanding of energy utilization that cannot be captured when analyzing primary cells and cell lines. While this analysis is ex vivo, it allows for the measurement from a number of specialized cells working together to perform a function in one tissue and more closely models the in vivo organ. Metabolic reprogramming has been observed in many neurological diseases, including neoplasia, and neurodegenerative diseases. This protocol was developed to assist the D. melanogaster community&#39;s investigation of metabolism in neurological disease models using a commercially available metabolic analyzer. Measuring metabolism of whole brains in the metabolic analyzer is challenging due to the geometry of the brain. This analyzer requires samples to remain at the bottom of a 96-well plate. Cell samples and tissue punches can adhere to the surface of the cell plate or utilize spheroid plates, respectively. However, the spherical, three-dimensional shape of D. melanogaster brains prevents the tissue from adhering to the plate. This protocol requires a specially designed and manufactured micro-tissue restraint that circumvents this problem by preventing any movement of the brain while still allowing metabolic measurements from the analyzer&#39;s two solid-state sensor probes. Oxygen consumption and extracellular acidification rates are reproducible and sensitive to a treatment with metabolic inhibitors. With a minor optimization, this protocol can be adapted for use with any whole tissue and/or model system, provided that the sample size does not exceed the chamber generated by the restraint. While basal metabolic measurements and an analysis after a treatment with mitochondrial inhibitors are described within this protocol, countless experimental conditions, such as energy source preference and rearing environment, could be interrogated.

Metabolic Analysis of Drosophila melanogaster Larval and Adult Brains

We present a protocol for measuring oxygen consumption and extracellular acidification in Drosophila melanogaster larval and adult brains. A metabolic analyzer is utilized with an adapted and optimized protocol. Micro-tissue restraints are a critical component of this protocol and were designed and created specifically for their use in this analysis.

초파리 melanogaster Larval 및 성인 두뇌의 변화 분석

This protocol describes a method for measuring the metabolism in Drosophila melanogaster larval and adult brains. Quantifying metabolism in whole organs ...

Isolation of Adult Spinal Cord Nuclei for Massively Parallel Single-nucleus RNA Sequencing

Probing an individual cell&#39;s gene expression enables the identification of cell type and cell state. Single-cell RNA sequencing has emerged as a powerful tool for studying transcriptional profiles of cells, particularly in heterogeneous tissues such as the central nervous system. However, dissociation methods required for single cell sequencing can lead to experimental changes in the gene expression and cell death. Furthermore, these methods are generally restricted to fresh tissue, thus limiting studies on archival and bio-bank material. Single nucleus RNA sequencing (snRNA-Seq) is an appealing alternative for transcriptional studies, given that it accurately identifies cell types, permits the study of tissue that is frozen or difficult to dissociate, and reduces dissociation-induced transcription. Here, we present a high-throughput protocol for rapid isolation of nuclei for downstream snRNA-Seq. This method enables isolation of nuclei from fresh or frozen spinal cord samples and can be combined with two massively parallel droplet encapsulation platforms.

Here, we present a protocol to rapidly isolate high-quality nuclei from the fresh or frozen tissue for downstream massively parallel RNA sequencing. We include detergent-mechanical and hypotonic-mechanical tissue disruption and cell lysis options, both of which can be used for isolation of nuclei.

대규모 병렬 단일 핵 RNA 시퀀싱에 대 한 성인 척수 핵의 절연

Probing an individual cell&#39;s gene expression enables the identification of cell type and cell state. Single-cell RNA sequencing has emerged as a ...