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Neste Artigo

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Resumo

Caenorhabditis elegans (C. elegans) é um bom modelo para estudar o transporte axonal e intracelular. Aqui, eu descrevo um protocolo para análise de transporte axonal e em c. eleganse in vivo de gravação.

Resumo

Transporte axonal e do transporte (IFT) são essenciais para a função e morfogênese axônio e cílios. Dineína e cinesina superfamília proteínas são motores moleculares que regulam anterógrada e retrógrada, transporte, respectivamente. Estes motores usam redes de microtúbulos como trilhos. Caenorhabditis elegans (C. elegans) é um organismo modelo poderoso para estudar o transporte axonal e IFT na vivo. Aqui, eu descrevo um protocolo para observar o transporte axonal e IFT na vida c. elegans. Carga transportada pode ser visualizada por marcação de proteínas de carga usando proteínas fluorescentes, tais como a proteína verde fluorescente (GFP). C. elegans é transparente e proteínas GFP-etiquetado carga podem ser expressa em células específicas sob promotores específicos de célula. Vermes vivos podem ser corrigidos por microbeads em gel de agarose 10% sem matar ou anestesiar os vermes. Nestas condições, movimentação de carga pode ser diretamente observada nos axônios e cílios de viver c. elegans sem dissecação. Esse método pode ser aplicado para a observação de qualquer molécula de carga em todas as células, modificando as proteínas alvo e/ou as células estão expressos em. As proteínas mais básicas tais como motores moleculares e proteínas do adaptador que estão envolvidas no transporte axonal e IFT são conservadas no c. elegans. Em comparação com outros organismos-modelo, os mutantes podem ser obtidos e mantidos mais facilmente em c. elegans. Combinar este método com vários mutantes de c. elegans pode esclarecer os mecanismos moleculares do transporte axonal e IFT.

Introdução

Imagem de célula viva é uma ferramenta essencial para a análise de transporte intracelular. Em biologia celular neuronal, análises de transporte axonal com imagens ao vivo da célula são essenciais para a compreensão de função e morfogênese neuronal1. Defeitos no transporte axonal fundamentam várias de doenças neurodegenerativas2. Proteínas de superfamília de cinesina e Dineína realizam transporte axonal anterogradely e retrogradely, respectivamente,1,2.

Cílios são outro compartimento celular em que a rede de microtúbulos e maquinaria de tráfico são altamente desenvolvidos3. Maquinaria de síntese de proteína não está localizada em cílios, o que significa que as proteínas ciliares devem ser transportadas do citoplasma para as pontas dos cílios. Específicos de cílios cinesina e Dineína, chamada cinesina-2 e citoplasmática Dineína-2, respectivamente, os componentes de cílios4, em um fenômeno chamado do transporte (IFT)5de transporte. Imparidade de IFT faz com que um espectro de doenças chamadas ciliopathies6. Assim, é necessária uma análise do mecanismo de IFT por imagens de células vivas para entender os mecanismos básicos de formação ciliar e patogênese.

Caenorhabditis elegans (C. elegans) é um bom modelo para estudar o transporte axonal e IFT7,8,9. Para observar o IFT, Chlamydomonas tem sido amplamente utilizado como um organismo modelo5,6. Como Chlamydomonas é um organismo unicelular, a relação do IFT com envelhecimento, função neuronal e comportamento seria difícil de analisar. Além disso, não foram aplicadas técnicas genéticas essenciais tais como CRISPR/Cas9 a Chlamydomonas. Em organismos superiores do modelo, tais como ratos e Drosophila, ruptura do transporte axonal e IFT frequentemente causa fenótipos letais porque transporte axonal e IFT são essenciais para a homeostase dos animais 10e a morfogênese 11. No caso dos ratos, transfection e cultura de células é geralmente necessária para observar o transporte axonal e IFT, que requer muitas habilidades e extenso de tempo12,13. Além disso, um monte de contexto fisiológico importante pode ser perdido em culturas de células e linhas celulares. Porque o sistema nervoso não é essencial para a sobrevivência dos vermes, c. elegans mutantes em que o transporte axonal ou IFT são rompidos muitas vezes não são letais7,9,14. Transporte axonal e IFT podem ser diretamente observado na vivo sem dissecação porque c. elegans é transparente e, portanto, é fácil observar marcadores GFP-etiquetado.

Existem vários protocolos para imobilizar o c. elegans, como o uso de um dispositivo de microfluidic15, almofadas de agarose com anestesia16ou microbeads17. A inclusão da anestesia pode inibir os tráfico de eventos em neurônios15. Uma clara desvantagem do método microfluidic-dispositivo é que preparar um dispositivo microfluidic não é sempre fácil. Em vez disso, imobilização por almofadas de agarose e microbeads é uma maneira fácil e conveniente de realizar imagens de lapso de tempo em c. elegans. Aqui, eu descrevo este protocolo básico para imobilizar o c. elegans e visualizar o transporte axonal e IFT na vivo em c. elegans. Comparado a outros métodos, o método descrito aqui não requer equipamentos especiais e é muito mais barato e mais fácil de realizar.

Protocolo

1. preparação da amostra

  1. gerar um transgénico c. elegans estirpe de interesse usando metodologias transgénicos 18. Como alternativa, obter cepas apropriadas de centro de genética o Caenorhabditis (CGC). Para visualizar o transporte axonal de precursores da vesícula sináptica, use a linha transgênicos wyIs251 [Pmig-13::gfp::rab-3] 7. Para observar o IFT, obter a linha transgênicos mnIs17 [osm-6::gfp] 19. Estas variedades são utilizadas neste protocolo.
    Nota: Qualquer matriz extracromossômico, integração genômica ou mesmo GFP bater-em obras. Para reduzir os sinais de fundo, usar promotores específicos de célula, ao invés de promotores pan-neuronal.
    Nota: Manutenção de vermes é descrita em outros protocolos de 20. Cepas foram mantidas nos relvados do alimentador Escherischia coli OP50 no crescimento de nematoides médio chapas (NGM) (agarose 1,7% (p/v), 50 mM de NaCl, 0,25% (p/v) de peptona, 1 mM CaCl 2, 5mg/mL colesterol, 25mm KH 2 PO 4, 1mm MgSO 4 pratos plásticos de 60 mm de diâmetro) a 20 ° C.
  2. Crescem vermes a 20 ° C em placas NGM para qualquer estágio do ciclo de vida dos vermes.
    Nota: Pode-se observar tanto o transporte axonal e o IFT em qualquer fase. L4 atrasado para o jovem adulto é um bom controlo positivo porque várias publicações têm usado estes estágios e eventos visualizado tráfico de 14 , 21 , 22 , 23.

2. Preparação de 10% Agarose

Nota: muitos fornecedores oferecem produtos similares, tais como pó de ágar-ágar, ágar e agarose. Use a electroforese da classe agarose (força do gel > 1200 g/cm 2). Pó de ágar barato não funcionam porque o gel resultante não é forte o suficiente para imobilizar vermes.

  1. Mix 0,4 g de agarose em 4 mL de água destilada (DW) de água em um tubo de vidro (1,5 x 10,5 cm). Coloque uma tampa do tubo de vidro para evitar a evaporação.
  2. Colocar o tubo de vidro em um bloco de calor de 95 ° C por 90 min. Além disso, preparar um outro tubo de vidro (1,5 cm x 10,5 cm) repleto de DW e mantê-lo em 95 ° C. colocar uma pipeta Pasteur na 95 ° C DW ( Figura 1 A). Será visto um monte de pequenas bolhas no tubo de agarose e a solução deve ser turva. Deixá-lo até que a solução torna-se claro. Em seguida, misture pipetando acima e para baixo até que a solução de agarose torna-se homogênea.
    Nota: O micro-ondas não podem ser usadas para preparar a solução de agarose de 10% quando feita de DW e agarose. Pequenas bolhas causadas por microondas evitar derretimento de agarose. No entanto, solidificado 10% gel de agarose facilmente pode ser derretido novamente usando um microondas. Tubos de vidro contendo 10% de gel de agarose podem ser preparados antecipadamente e armazenados a 4 ° C durante pelo menos 6 meses. Se fazê-lo, derreter o estoque usando microondas quando necessário e começar a partir do passo 3 neste protocolo.
    Nota: Agarose perde gradualmente a capacidade de solidificar-se incubada a 95 ° C por um longo tempo ou após repetidas de solidificação e fusão. Se isso acontecer, prepare-se nova 10% agarose.

3. Preparação de Agarose Pad

  1. usando a pipeta de Pasteur aquecida preparada no passo 2.2, colocar 2 gotas de agarose de 10% em um slide 76 x 22 mm.
  2. Rapidamente a tampa com um slide de 2 76 x 22 mm segundo antes da queda de agarose solidifica como mostrado na Figura 1 B e empurrar para baixo o segundo slide para achatar a solução de agarose. A espessura deve ser de 0,5-1 mm.
  3. Rapidamente lave a pipeta Pasteur por pipetagem 95 ° C DW acima e para baixo até que a solução de agarose é lavada para fora. Caso contrário, a pipeta vai ficar obstruída por gel de agarose. Deixar a pipeta de pé na 95 ° C DW.
  4. Espera por 1 min. A almofada de agarose forma e torna-se turva. Em seguida, deslize os slides separados pela mão ( Figura 1 C).

4. Montagem de vermes

Nota: mesmo pequenas quantidades de movimento worm impedem boa observação. Levamisole tradicionalmente tem sido utilizada para prevenir o movimento worm a almofada de agarose 24 , 25. No entanto, Levamisole inibe receptores neuronais em c. elegans e, portanto, pode afetar os eventos de tráfico em neurônios 15. Usar o poliestireno microbeads descrito aqui é uma boa alternativa 17.

  1. Sob um microscópio estéreo equipado com uma transiluminação espelho deslizável, transfer ~ 30 vermes transgênicos expressando os marcadores apropriados para um novo NGM placa sem bactérias usando um fio de platina escolher.
    Nota: Escolher um fio de platina é feita de fio de platina e pipeta Pasteur (5 polegadas), e a ponta do fio de platina foi achatada. A preparação das picaretas fio de platina e manipulação de vermes com estes são descritos no Wormbook (http://www.wormbook.org).
  2. Deixar o prato para 1 min. bactérias são removidas automaticamente das superfícies de vermes como os vermes se move em gel de agarose NGM sem bactérias.
  3. Colocar um 0,5-1,0 µ l queda de 2,6% 100 nm de diâmetro poliestireno microbeads em água sobre a placa de ágar-ágar ( Figura 1 D). Transferi 10-20 vermes da placa NGM livre de bactérias para o microbeads. Gota e espalhar os vermes usando o fio de platina escolher para evitar a sobreposição de verme corpos ( Figura 1 E).
  4. Uma lamela 22 x 40 mm 2 ( Figura 1-F). Empurre suavemente para remover as bolhas de ar, mas evitar o esmagamento de vermes. A amostra está agora pronta para tratamento de imagens.
    Nota: Porque sem anestesia é administrada, vermes são fixados apenas pela força friccional gerada pelo bloco de ágar e poliestireno microbeads lamela 17. A presença de bactérias do alimentador e/ou demais solução fará com que a força de fricção mais fraco.
    Nota: Tamanhos diferentes de lamelas (por exemplo, 22 x 22mm 2, 18 x 18 mm 2) de trabalho. No entanto, as lamelas de maiores podem evitar imersão água ou óleo a partir da lente objetiva vazando para amostras durante a observação.

5. Observação

Nota: parâmetros de imagem apropriados (poder do laser, ganho, binning, etc.) serão diferentes para cada sistema de microscópio e câmera. Aqui, um microscópio widefield equipado com um scanner confocal de disco giratório e uma câmera CCD digital é usado.

  1. Regule a temperatura da fase de 20 ° C, ou ajustar a temperatura ambiente de 20 ° C.
  2. Colocar o slide de amostra no palco microscópio. Use x 100 (abertura numérica = 1.3 ou superior) da lente objetiva.
  3. Olha para as áreas indicadas na Figura 2 (para wyIs251 e transporte axonal) ou Figura 2 B (para mnIs17 e IFT) como controles positivos . Outras áreas podem ser analisadas como bem 22.
  4. Conjunto de parâmetros (CCD ganho = 200, Binning = 1 ou 2, a potência do laser em 488 nm = 1.0-1.3 mW). Executar a gravação de lapso de tempo em 4 frames/s para até 1 min. salvar arquivos como mutli-TIFF formato.
    Nota: Se a GFP sinais de desaparecer e é difícil continuar a observar GFP::RAB-3 ou OSM-6::GFP por 30 s, a potência do laser é muito forte. Nesse caso, reduza a potência do laser. Por outro lado, se nenhum movimento vesicular é registrado, a potência do laser é muito fraca. Nesse caso, aumentar a potência do laser.
  5. Observar um worm diferente e repetir 5.3 e 5.4. As observações podem durar por até 20 min., mas cada verme deve ser registrada apenas uma vez para evitar os efeitos de pAcredita danos.
    Nota: Worms foram observados pelo menos 20 min sem defeitos significativos de 27 , 7 , 28. Mais observação pode ser possível, mas refúgio ' t sido testado ainda. Um sinal claro da morte neuronal é a mudança da morfologia neuronal, tais como inchaço do axônio. Como sinais fracos do GFP podem ser vistos nos axônios e dendritos em wyIs251 e mnIs17, morfologia do axônio pode ser facilmente verificada olhando apenas axônios ou dendritos. Morfologia neuronal é mostrada na Figura 2.
  6. Gerar arquivos de filme.
    1. Aberto o TIFF multi arquivo usando software de Fiji. Vá para arquivo > abrir selecione o arquivo TIFF multi salvou na etapa 5.4.
      Nota: Fiji pode ser baixado em jttps://fiji.sc. Imagem J e plugins também pode ser usado para gerar kymographs. Se fazer isso, siga as instruções relevantes para o plugin escolhido...
    2. clique a " seleção retangular " botão ( Figura 3 A, seta) e selecione a área de interesse pelo desenho de um retângulo com um mouse de computador (retângulo amarelo na Figura 3 A). Vá até Image > pilhas > ferramentas > fazer Substacks e selecione os números de fatia que estão incluídos no filme. Um substack é gerado.
    3. Ativar a janela de substack clicando e vá até Image > ajuste > brilho/contraste. Mostra-se uma janela para ajustar o brilho e contraste. Na janela, deslize a parte superior da barra (mínimo) para a direita para que o sinal de fundo desaparece e o segundo top bar (máximo) para a esquerda assim que o movimento vesículas e partículas podem ser vistas muito bem sobre o fundo.
    4. Vá até Image > pilhas > tempo Stamper. Como o filme é gravado em 4 frames/s na etapa 5.4, o intervalo de tempo é 0,25 s. Assim, digite " 0.25 " no intervalo.
    5. Gerar um arquivo de filme, selecionando salvar como > AVI do menu arquivo (filme 1 e 2).
      Nota: Usando plugins apropriado, você pode salvar o arquivo como outros formatos tais como " mpeg4 " ou " mov " arquivos.
  7. Gerar kymographs.
    1. Abrir os arquivos originais do filme usando software de FIji novamente e repita os passos 5.6.2 e 5.6.3 para ajustar o brilho e o contraste.
    2. Clique " segmentado linha " ( Figura 3 B, seta). Usando um mouse, desenhe uma linha segmentada ao longo dos cílios ou axônio (linha amarela, na Figura 3 B).
    3. Ir para analisar > Multi Kymograph > Multi Kymograph ( Figura 3 C). Aparece a janela de largura de linha ( Figura 3-D). Tipo " 3 " na janela Linewidth e clique Okey ( Figura 3-D).
    4. Kymograph janela é criada. Salvar a imagem em formato TIFF ou JPEG.

Resultados

Transporte axonal em DA9 neurônio
Usando a linha de wyIs251 , o anterógrada e retrógrada transporte axonal de GFP::RAB-3 pode ser gravada simultaneamente no neurônio motor DA9. A velocidade média de anterógrada e retrógrada transporte no axônio do neurônio DA9 dorsal proximal é cerca de 1,8 e 2,6 μm/s, respectivamente22. O número de vesículas em movimento é sobre 0,03 e 0,018 por μm de axônio por s. Assim, para uma obser...

Discussão

Limitação no que diz respeito a métodos existentes
O método descrito aqui é otimizado para observar eventos rápidos como transporte axonal e IFT. Assim, a imobilização é mais priorizada de incubação mais longa. Enquanto nós fomos capazes de observar eventos de tráfico pelo menos 20 min sem perturbação significativa, esse método pode não ser sempre adequado para observar eventos lentos, exigindo mais observações, tais como alongamento do axônio e migração celular. Para mais observ...

Divulgações

O autor não tem nada para divulgar.

Agradecimentos

O autor agradece profundamente Dr. Asako Sugimoto (Universidade de Tohoku) para a discussão útil. wyIs251 foi um presente generoso do Dr. Kang Shen (Universidade de Stanford). mnIs17 foi fornecido pelo CGC, que é financiado pelo NIH escritório de programas de infra-estrutura de pesquisa (OD010440 P40). Este trabalho foi apoiado por grant JSPS KAKENHI #17 H 05010 e #16 H 06536 e Daiichi Sankyo foundation, Fundação da ciência do cérebro e Fundação Naito.

Materiais

NameCompanyCatalog NumberComments
Slideglass (76  x 26 mm)MatsunamiS1111
Coverglass (22  x 40 mm)MatsunamiC024401
AgaroseWako318-01195
Polystylene microbeads 0.1 micronPolysciences#00876
Heat blockTAITEC0063288-000CTU-mini
MicroscopeOlympusIX-71widefield microscope
Spinning disk ScannerYokogawaCSU-X1spinning disc confocal scanner 
Digital CCD cameraHamamatsu PhotonicsC10600-10BORCA-R2 degital CCD camera
Objective lens (x100, NA1.4)OlympusUPLSAPO 100XO
Pasteur pipette (5 inch)IWAKIIK-PAS-5P
Glass tube (1.5 cm diameter x 10.5 cm)IWAKI9820TST15-105NP
TV9211: wyIs251Laboratory of Kang ShenN/A
OTL11: mnIs17Ref. 27, 29N/ASP2101 was backcrossed with wild type for 6 times
Stereo microscopeCarl Zeiss435064-9000-000STEMI 508 
Mirror transillumination unitCarl Zeiss435425-9010-000
platinum wire (0.2 mm)Nilaco Corporationm78483501
60 mm plastic dishFalcon#351007
FijiN/AN/Ahttps://fiji.sc/
nematode growth medium (NGM)  1.7% (w/v) agarose, 50mM NaCl, 0.25% (w/v) Peptone, 1 mM CaCl2, 5 mg/mL Cholesterol, 25 mM KH2PO4, 1 mM MgSO4 

Referências

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