Enriquecimento de mRNA e preparação de bibliotecas de bissulfito-mRNA para sequenciamento de próxima geração

Esta pesquisa tem como objetivo estudar o papel da metilação do RNA, especificamente da modificação da 5-metilcitosina, no câncer de pâncreas. As perguntas que queremos responder são como upregulation ou downregulation de certos RNA metiltransferase afeta fenótipos de células cancerosas e também, através de quais substratos de RNA. Este estudo fornece a paisagem abrangente de RNA m5C em uma resolução de base única com equipamentos padronizados.

A partir deste estudo utilizando sequência de RNA bissulfito, os resultados relacionam a associação da modificação do RNA m5C com a pobre diferenciação de células cancerosas. Isso deve abrir caminho para estudos futuros em discernir os efeitos do passageiro versus o condutor da doença do m5C específico nos transcritos do RNA. Com essa técnica, podemos identificar o conjunto de RNAs diferencialmente metilados que podem participar da progressão tumoral.

Além disso, experimentos de base de molécula única podem fornecer um papel regulatório mais detalhado do RNA específico m5C.