Tutorial de Análise Computacional para RNA Não-Codificante Pequeno Quimérico: Bibliotecas de Sequenciamento de RNA Alvo

Este protocolo abrange a instalação e as etapas práticas para o uso de um pipeline computacional projetado para analisar dados de sequenciamento de alto rendimento de interações de RNA-alvo não codificantes quiméricos. A estratégia molecular para formar RNAs quiméricos é um desenvolvimento relativamente recente que tem vantagens quando comparado com ferramentas de predição biocromática anteriores na compreensão inequívoca do cenário de interação RNA-alvo não-codificante do genoma. Os dados de sequenciamento gerados a partir do sequenciamento de alto rendimento dos RNAs quiméricos podem representar um desafio de análise para novos adotantes dessa estratégia.

Estabelecemos um pipeline computacional de plataforma cruzada de código aberto que é altamente anotado para permitir que usuários de nível básico analisem dados de seus experimentos de sequenciamento de RNA-alvo não codificante quimérico. Em experimentos futuros, o laboratório de Mefford planeja usar análise computacional por scrap em conjunto de dados gerados a partir de nossas investigações em andamento sobre regulação pós-transcricional no sistema nervoso de mamíferos, bem como manter uma atualização em nosso GitHub.