يغطي هذا البروتوكول التثبيت والخطوات العملية لاستخدام خط أنابيب حسابي مصمم لتحليل بيانات التسلسل عالية الإنتاجية من تفاعلات الحمض النووي الريبي غير المشفرة الوهمية. تعد الإستراتيجية الجزيئية لتشكيل الحمض النووي الريبي الوهمي تطورا حديثا نسبيا له مزايا عند مقارنته بأدوات التنبؤ بالألوان الحيوية السابقة في فهم لا لبس فيه لمشهد تفاعل الحمض النووي الريبي المستهدف على مستوى الجينوم. يمكن أن تمثل بيانات التسلسل الناتجة عن التسلسل عالي الإنتاجية للحمض النووي الريبي الوهمي تحديا تحليليا للمتبنين الجدد لهذه الاستراتيجية.
لقد أنشأنا خط أنابيب حسابي مفتوح المصدر عبر الأنظمة الأساسية مشروح للغاية للسماح للمستخدمين المبتدئين بتحليل البيانات من تجارب تسلسل الحمض النووي الريبي غير المشفرة غير المشفرة. في التجارب المستقبلية ، يخطط مختبر Mefford لاستخدام التحليل الحسابي عن طريق الخردة على مجموعة البيانات الناتجة عن تحقيقاتنا المستمرة في تنظيم ما بعد النسخ في الجهاز العصبي للثدييات ، بالإضافة إلى الحفاظ على خردة التحديث على GitHub الخاص بنا.