Управление кластером первоначальный 3D клеток в гибрид геля куб устройство для повторяющихся шаблон образований

Резюме

Мы представляем процедуру для контроля первоначальная клеточная кластера фигуру в 3D внеклеточного матрикса получить воспроизводимые модели формирования. Кубических устройство, содержащее два разных гидрогели, используемых для достижения многоцелевые изображения для формирования узор ткани.

Аннотация

В пробирке 3D культур значительно подчеркнуто в культуре ткани клеток. Однако отсутствие экспериментальных повторяемость является одним из его ограничений. Несколько повторяемые результаты формирования шаблона ухудшается анализ механизмов, лежащих в основе самоорганизации. Сокращение различий в условиях первоначальной культуры, таких как плотность клеток и распределения в внеклеточного матрикса (ECM), имеет решающее значение для улучшения повторяемости 3D культуры. В этой статье мы демонстрируем простые, но надежные процедуры для контроля первоначальная клеточная кластера фигуру в 3D внеклеточной матрицы для получения высокой повторяемости шаблон образований. Micromold с желаемой формы производилась с помощью фотолитографии или процесс обработки, и он сформировал 3D карман в ECM, содержащихся в Кубе гибрид геля (КГЧ). Высококонцентрированных клетки затем вводили в кармане, так что форма ячеек кластер соответствует сфабрикованные плесень формы. Занятых КГЧ допускается многоцелевые сканирование его вращения, которая позволила изображений с высоким разрешением и захват структуры всей ткани, хотя низкий увеличение объектива была использована. Нормальные человеческие бронхиальной эпителиальные клетки были использованы для демонстрации методологии.

Введение

Значение 3D культуры, который лучше имитирует биологических сред, чем 2D культуры, значительно подчеркнул в ткани клеток культуры^1,2,3. Взаимодействие между клетками и внеклеточного матрикса (ECM) предоставляет важные подсказки относительно морфогенеза^4,5. Многие ткани образований может возникнуть только в 3D средах, таких как складной процесса^6,7, invagination⁸и трубчатых формирования^9,10. Однако многочисленные трудности предотвратить исследователей от перехода к 3D эксперименты 2D экспериментов на блюдо. Одна из основных трудностей в 3D экспериментов является вопрос о визуализации 3D образцов. По сравнению с плоской эксперименты, приобретения соответствующей 3D изображения по-прежнему сложным во многих случаях. В частности получение соответствующей 3D изображения является трудной задачей, когда размер выборки достигает миллиметрового диапазона из-за большой глубины очага низкой увеличение линз. К примеру глубины очага достигает более чем 50 мкм, когда 10 x увеличение объектива используется в то время как размер одной ячейки составляет обычно менее 10 мкм. Для повышения качества изображения, в настоящее время разрабатываются высокими технологиями микроскопии систем (например, два Фотон микроскопии¹¹ и свет лист микроскопии системы¹²), но их доступность ограничена ввиду их дорогой ценой. В качестве альтернативы мы разработали ранее гибрид геля устройства куб (КГЧ)¹³. Устройство состоит из двух видов гидрогели: как гель поддержки и ECM как коллаген или Matrigel как культура гель агарозы. HGC позволяет нам собирать образца при культивировании и вращать куб для достижения многоцелевые изображений, который устраняет проблему глубины очага¹⁴.

Еще одна трудность в 3D экспериментов является их низкая воспроизводимость вследствие плохой управляемости 3D средах. В отличие от плоской культуры на пластиковые блюдо вариации в условиях первоначальной культуры легко произойти в трехмерном пространстве, окруженный мягким материалом. Значительные различия в результатах экспериментальной ухудшается после анализа и маски основных механизмов. Многие инженерные технологии были разработаны пространственно выровнять единичных клеток, таких как подложке^15,16, волокна, ткачество¹⁷и¹⁸леса, но они требуют сложной предварительной обработки или специально Дизайн оборудования. В отличие от этого мы разработали методологию для достижения 3D клеток выравнивания в КГЧ¹⁹.

В этом протоколе мы иллюстрируется простая процедура с часто используемым оборудованием для контроля 3D первоначальная клеточная форма кластера в КГЧ. Во-первых был продемонстрирован процесс изготовления КГЧ. Затем micromolds сфабрикованы фотолитографии или процесс обработки были помещены в КГЧ производить карман с произвольной формы в ECM. Впоследствии весьма плотной клетки после центрифугирования вводили в карман, чтобы контролировать форму первоначальная клеточная кластера в КГЧ. Точно контролируемой клеток кластера может образы из многих направлений благодаря КГЧ. Нормальные человеческие бронхиальной эпителиальных клеток (NHBE) были использованы для демонстрации элемента управления формы кластера первоначальная клеточная и изображений ветвей с нескольких направлений повышения качества изображений.

протокол

1. Изготовление гибрид геля куб устройства

1. Подготовьте кубических кадр поликарбонат (PC), либо с помощью обработки или 3D-принтер. Размер кадра ПК зависит от размера выборки. В этом исследовании мы использовали кадр 5 мм на каждой стороне, так что ветви было достаточно пространства для удлиненное во время культивирования.
2. Место Рамка ПК на предварительно охлажденным стеклянное скольжение или другой гладкой поверхности в коробке льда (< 0 ° C) (рис. 1A).
3. Мкл 12 подогретую агарозы 1,5% (w/v) из верхней грани кубический кадра к нижней поверхности с пипеткой. Инсульта пипетки, так что агарозы спреды для создания плоской поверхности (рис. 1B).
4. В течение нескольких минут будет вылечить агарозы. Выберите вверх PC кадра, сдвинув его к краю стекла слайда с помощью пинцета. Обратите внимание, что вертикально поднимая кадр из стекла слайд может привести к отсоединение от агарозы из кубической кадра из-за силы сцепления между агарозы и стеклянное скольжение (рис. 1 c).
5. Вращайте куб кадра, чтобы сделать открытым лицом вниз, а затем поместить на слайде стекло снова (рис. 1 d).
6. Повторите шаги 1.3-1.5 до тех пор, пока три поверхности заполнены с агарозы (Рисунок 1E).
7. Сформировать агарозы стены на четвертом и пятом лица, падение агарозы с открытым лицом (Рисунок 1F). После того как стена агарозы формируется на пятой лицо, завершена подготовка КГЧ.

2. Изготовление micromolds фотолитографии или процесс обработки

1. Изготовление по фотолитографии
   1. Очистить пластины кремния (Si) через ультразвуковой очистки с помощью ацетона, изопропиловый спирт (IPA), затем дистиллированной воды (DI) за 5 мин. После азота дует Si пластин с азотом обезвоживанию в духовке при 140 ° C в течение 20 мин (Рисунок 2а(i)).
   2. Спин пальто жертвенного слоя как ЛОР и Az сопротивляется на Si пластины (2000 об/мин, 30 s) с помощью спин coater под желтым светом. Сразу же после отжима покрытие тепло пластин на горячей плите на 90 ° C на 3 мин (Рисунок 2а(ii)). Желаемую толщину жертвенного слоя является более 1 мкм, так что подъема процесс может осуществляться легко, но точной толщины не является необходимым.
   3. Поместите пластины на горячей плите при 70 ° C, а затем прокатанный лист толщиной негативного фоторезиста с требуемой толщины на жертвенный слой с помощью рук ролика (рис. 2а(iii))
   4. Через пять минут после ламинирования, поместите пластины на маска выравниватель для УФ-облучения. Photomask с желаемый узор на лист сопротивляться и разоблачить с ультрафиолетовым светом для соответствующего срока. Время воздействия определяется толщина фоторезиста и интенсивность УФ-излучения. Впоследствии Поместите пластины на горячей плите для постконтактная выпекать при температуре 60 ° C за 5 мин, после чего выпечки на 90 ° C в течение 10 минут (рис. 2A(iv))
   5. Разработка негативного фоторезиста, погружая вафельные в пропиленгликоля монометиловый эфир ацетат (PGMEA), до тех пор, пока неэкспонированные области полностью не растворится (около 20 мин) (рисунок 2A(v)).
   6. Растворите жертвенного слоя с помощью АПИ для ультразвуковой очистки для подъема микроструктуры. Как только микроструктуры отрывании от пластины, промойте водой ди ультразвуковой очистки 10 мин (рисунок 2A(vi)).
   7. Погружайте плесень в 30 мкл MPC полимера для 30 мин при комнатной температуре (примерно 20 ° C), чтобы полностью высохнуть. Рисунок 2B показывает сфабрикованные Призма плесень.
2. Изготовление цилиндров плесень
   1. Изготовить стальной цилиндр плесень с нужного размера, процесс обработки. Кроме того использование коммерчески доступных из нержавеющей стали. (В этом исследовании используется φ цилиндра 600 мкм.)
   2. Погружайте стальной цилиндр в 30 мкл MPC полимера для 30 мин при комнатной температуре (примерно 20 ° C), чтобы полностью высохнуть.
   3. Подготовка жидких полидиметилсилоксан (PDMS) путем смешивания базы смолы и ее катализатора (см. Таблицу материалы) в соотношении 10:1, следуют дегазация с вакуумной дегазации системы за 20 мин. Затем налейте PDMS 12-хорошо пластины.
   4. Установите стальной цилиндр перпендикулярно поверхности датум и фиксированной линейной z-сцену так, что он может быть перпендикулярно вставлен в неотвержденных поверхности PDMS в 12-хорошо плита размещены на одной и той же поверхности datum, перемещая z этап. Инкубируйте PDMS с стальной цилиндр в духовке 20 минут при 90 ° C для лечения. Вырежьте PDMS для формирования боковой поверхности, так что накапайте могут быть вставлены в процессе следующих (рис. 2 c).

3. Управление первоначальная клеточная форма кластера в Гидрогель

1. Внедрить соответствующие ECM для нужной ячейки культуры, таких как коллаген и искусственных базальной мембраны, в КГЧ для заполнения пространства в культуре (рис. 3A).
2. Комплект готовых micromold на КГЧ прямо или косвенно соответствующий держатель, как показано на рисунке 3B. Впоследствии место КГЧ в CO₂ инкубатора для 25 мин при 37 ° C для лечить его.
3. Осторожно выньте micromold, так что ECM не ухудшится (рис. 3 c). Карман, как форму желаемой формы, будут изготовлены в ECM.
4. Урожай клетки культивировали блюдо трипсина ЭДТА или его эквивалент в зависимости от типов клеток. Впоследствии, центрифуга клетки для получения высококонцентрированных клеток (для NHBE культуры, применить трипсин 0.25%-ЭДТА и инкубации клеток на 3 мин, а затем нейтрализовать с FBS-содержащих среднего и центрифугирование в 300 x g 4 мин).
5. После центрифугирования, удалить супернатант средне-и уплотнить клетки и придать высококонцентрированных клетки (3.0 × 10⁴ клеток/мкл для NHBE клеток) в карман в ECM (рис. 3D).
6. Инкубируйте КГЧ с ячейками в CO₂ инкубатора для 20 минут при 37 ° C, так что клетки попадают в карман ECM для заполнения пространства, созданный micromolds. Если чрезмерное среднего или клетки присутствуют на верхней поверхности, тщательно удалите с помощью пипетки.
7. КГЧ состоится 24-хорошо пластины и 100 мкл соответствующего среднего (Рисунок 3E). Для NHBE клеток используйте 1:1 смесь коммерчески доступных специализированных средних для NHBE и эндотелиальных клеток (см. Таблицу материалы).
8. Внедрить дополнительные ECM закрыть кармана в ECM, и затем инкубации при 37 ° C 25 мин.
9. Охладить разогретой агарозы 1,5% до комнатной температуры (примерно 20 ° C). Падение приблизительно 10 мкл агарозы на верхней поверхности КГЧ закрыть поверхности и предотвратить выпадение КГЧ во время культивирования и обработки изображений (Рисунок 3F) ECM. Затем Инкубируйте КГЧ для еще 20 минут при 37 ° C вылечить агарозы.
10. Добавление средних для покрытия всего КГЧ так что осмотическое давление может помочь в обеспечении питания для клетки внутри КГЧ.

4. Многоцелевые изображения

1. Неинвазивная 3D формы признания многоцелевые наблюдения
   1. Место культуры блюдо или хорошо пластины, содержащие КГЧ на микроскопе и ориентировать КГЧ в кадре. Затем получите пример изображения, яркий контраст поле или фазы.
   2. Возьмите и повернуть КГЧ разместить различные поверхности вниз.
   3. Повторите шаги 4.1.1 и 4.1.2 получаются изображения со всех шести сторон.
2. Иммуно люминесцентные изображения с разнонаправленными наблюдения
   1. Для фиксации применяются параформальдегида 4% к образцу над КГЧ при комнатной температуре (примерно 20 ° C) для 20 минут, следуют два полоскания PBS на 10 мин.
   2. Разрушения КГЧ с PBS содержащих 0,5% Тритон X-100 10 мин при температуре 4 ° C, затем смывают 3 x 10 мин с PBS.
   3. Инкубировать КГЧ с 10% козьего сыворотки в IF-буфера (0,2% Тритон X-100, 0.1% бычьего сывороточного альбумина и 0,05% Tween-20 в PBS) 60 мин при комнатной температуре для первичного блокировки шага.
   4. Для окрашивания конкретных молекулы, используйте соответствующие антитела. Соблюдать коллективные клетки геометрии, Alexa Fluor 488 Фаллоидин может использоваться для пятно актина.
   5. Место КГЧ на блюдо дно стекла под микроскопом лазер или люминесцентных и выполнять сканирование с шести сторон для получения изображения весь пример.

Результаты

Нормальные человеческие бронхиальной эпителиальных клеток (NHBE) были использованы для демонстрации иллюстрируется методологии и контроля геометрии первоначального коллективного клеток для достижения цилиндрической формы и формы Призма, соответственно в среде ECM. М?...

Обсуждение

Метод, представленный в настоящем документе проста и может выполняться без высокотехнологичного оборудования. Одновременно можно получить точное ячейки кластера форму управления результат в 3D пространстве гидрогеля. После первоначального контроля клетки могут расти в КГЧ как они ку...

Материалы

Name	Company	Catalog Number	Comments
12-well-plate	Corning  Inc.	3513
2-Methoxy-1-methylethyl Acetate	FUJIFILM Wako Pure Chemical Co.	130-10505	PGMEA, CAS: 108-65-6
4% paraformaldehyde	FUJIFILM Wako Pure Chemical Co.	161-20141	CAS: 30525-89-4
Agarose, low gelling temperature  BioReagent	Sigma-Aldrich	A9414
Alexa fluor 488 phalloidin	Thermo Fisher Scientific	A12379
AZ1512	Merck
BEGM bullet kit	Lonza	CC-3170	Specialized medium for NHBE cells
Bovine Serum Albumin solution (10 %)	Sigma-Aldrich	A1595
EGM-2 bullet kit	Lonza	CC-3162	Specialized medium for endothelial cells
Lipidure	NOF co.		MPC polymer
Matrigel growth factor reduced basement membrane matrix	Corning  Inc.	354230
Normal Goat Serum (10%)	Thermo Fisher Scientific	50197Z
Normal human bronchial epithelial cells	Lonza	CC-2541
SILPOT 184 W/C	Dow Corning Co.	3255981	Base resin and catalyst for PDMS
SUEX D300		DJ MicroLaminates, Inc	Thick negative photoresist (thichness: 300 mm)
Triton X-100 (1%)	Thermo Fisher Scientific	HFH10
Trypsin-EDTA (0.25%)	Thermo Fisher Scientific	25200056
TWEEN 20	Sigma-Aldrich	P9416