Method Article
* Эти авторы внесли равный вклад
Этот протокол демонстрирует роботизированный ультразвук (US) как практичную, экономически эффективную и быструю альтернативу традиционным неинвазивным методам изображения.
Общие методы визуализации грызунов in vivo включают позитронно-эмиссионную томографию (ПЭТ), компьютерную томографию (КТ), магнитно-резонансную томографию (МРТ) и ультразвук (УЗИ). Каждый метод имеет ограничения и преимущества, включая доступность, простоту использования, стоимость, размер и использование ионизирующего излучения или магнитных полей. Этот протокол описывает использование 3D-роботизированной УЗИ для визуализации in vivo почек и сердца грызунов, последующего анализа данных и возможных исследовательских приложений. Практическими приложениями роботизированной УЗИ являются количественная оценка общего объема почек (TKV), а также измерение кист, опухолей и сосудистой системы. Хотя разрешение не так высоко, как в других модальностях, роботизированные США позволяют более практичный сбор данных с высокой пропускной способностью. Кроме того, используя визуализацию УЗИ в М-режиме, сердечная функция может быть количественно определена. Поскольку почки получают 20%-25% сердечного выброса, оценка сердечной функции имеет решающее значение для понимания физиологии почек и патофизиологии.
Наиболее распространенные методы визуализации грызунов in vivo включают позитронно-эмиссионную томографию (ПЭТ), оптическую визуализацию (ОИ), компьютерную томографию (КТ), магнитно-резонансную томографию (МРТ) и ультразвук (УЗИ). Эти методы обеспечивают изображения с высоким разрешением in vivo, что позволяет исследователям количественно оценивать и продольно следовать моделям заболеваний неинвазивно1. Хотя каждый метод визуализации имеет ограничения, они также предоставляют бесценные инструменты для доклинических исследований.
Здесь исследование детализирует американскую систему и представляет протокол для роботизированной и 3D-визуализации грызунов. Американские волны производятся зондом, называемым преобразователем, который обычно удерживается вручную. Звуковые волны отражаются обратно, когда они взаимодействуют с тканями, а эхо реконструируется в изображения2. Протокол, описанный здесь, будет сосредоточен на визуализации почек и сердца с использованием роботизированного датчика и использования программного обеспечения, которое позволяет быструю 3D-реконструкцию для количественной оценки.
Robotic US - это быстрый, надежный и неинвазивный метод визуализации, который позволяет исследователям проводить высокопроизводительные и продольные исследования. По сравнению с ручными методами США, роботизированный метод США экономит время, так как до трех животных могут быть отсканированы за считанные минуты. Высокая пропускная способность для измерений почек предполагает, что может быть изображено до 20 мышей в час. Роботизированные преобразователи расположены под акустическими мембранами и движутся независимо от животного с двумя степенями свободы (рисунок 1А). Это позволяет начинающим пользователям получать высококачественные изображения, в то время как портативные методы США более подвержены ошибкам пользователя. Связанное программное обеспечение обеспечивает эффективную 3D-реконструкцию почек в режиме реального времени. Ранее магнитно-резонансная томография (МРТ) была распространенным методом неинвазивной визуализации из-за отличного контраста мягких тканей, отсутствия радиоактивности и глубины проникновения. Тем не менее, МРТ часто требует длительного времени приобретения и является дорогостоящим для выполнения. УЗИ был оценен как надежная и более быстрая альтернатива МРТ при оценке общего объема почек (TKV)3.
Все шаги в этом протоколе соответствуют рекомендациям по использованию животных клиники Майо (Рочестер, штат Миннесота) и были одобрены Комитетом по уходу и использованию животных клиники Майо.
1. Животная модель
2. Эпиляция
3. Позиционирование животных
4. Ультразвуковые измерения
5. Анализ почек (механика анализа)
6. Анализ сердца
Результаты анализа почек
Данные о площади поверхности и объеме получаются из сегментации почек. Эта информация может быть использована для сравнения экспериментальных и контрольных моделей или отслеживания изменений с течением времени. Инструмент суппортов полезен для быстрого измерения аномалий (например, кист, опухолей) и того, как они изменяются в длине с течением времени. Рисунок 3 предполагает, что как метод сегментации, так и метод суппорта могут быть использованы для точного измерения объемов кисты. Рисунок 4 демонстрирует четкую разницу в общем объеме почек (TKV) между контрольными и экспериментальными (Pkd1RC/RC) мышами. 3D-визуализация этих объемных рендеров может быть выполнена внутри системы, включая вращения в 3D-пространстве (рисунок 5). Эти 3D-реконструкции затем используются для расчета TKV (мм3; Рисунок 4) а также индивидуальный большой объем кисты.
Результаты сердечного анализа
Многие полезные параметры получаются при анализе изображений M Mode. Эти данные обеспечивают хороший снимок сердечной функции левого желудочка (LV) в этот момент времени. Выходные данные включают внутренний диаметр РН, заднюю стенку РН, диаметр передней стенки РН, фракционную фракцию, дробное укорочение, ударный объем, частоту сердечных сокращений, сердечный выброс, объем РН и массу РН. Успех сердечного анализа зависит от точной сегментации слоев на изображении M Mode. Большинство сердечно-сосудистых результатов рассчитываются по пиковым систолическим и диастолическим фазам заднего и переднего эндокардиального слоев. Задний эпикардиальный слой выглядит ярко-белым и следует рисунку, аналогичному заднему эндокардиальному слою. Трассировка заднего слоя эндокарда должна быть размещена на самом нижнем контуре. Передний эндокардиальный слой должен быть прорисован по самому высокому контуру этого слоя. Передний эпикардиальный слой выглядит линейным в нижней части изображения из-за наклонного положения животного (рисунок 2D). На рисунке 6 показан пример одного исследования без существенной разницы в сердечном выбросе между экспериментальными и контрольными мышами. Как и в случае с почечной визуализацией, возможна 3D-визуализация сердца. Тем не менее, 4D-визуализация сердечного цикла (дополнительный рисунок 1) позволяет исследователю визуализировать и точно определять как морфологические, так и циклодинамические аномалии у оцениваемого животного.
Оценка морфологии
Для быстрой и недорогой оценки УЗИ может эффективно контролировать физиологические параметры продольно. Тем не менее, многие исследования хотят дополнительно определить более тонкие морфологические характеристики, например, количество и размеры кист, кальцинатов (камней в почках), васкуляризации или степени фиброза. На рисунке 7 сравнивается нормальная почка мыши с кистозной почкой мыши с умеренно кальцинированной почкой мыши. При увеличении центральной частоты США (10 МГц с линейным массивом) до 35 МГц (усилитель воблера) можно получить изображения с возрастающей детализацией.
Рисунок 1: Размещение ультразвуковой системы и мыши. (А) Схема ультразвуковой системы и расположение датчиков. (B) Вид мышей в положении лежа на спине на ультразвуковой платформе. (C) Пример интересующего региона (ROI) для интересующей области (почки) с идентификаторами животных. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 2: Ультразвуковая визуализация сердца для получения физиологических параметров. (A) Использование изображения тепловой карты Heart Finder для позиционирования датчика в левом желудочке для визуализации m-mode. Расположение преобразователя в левом желудочке обозначено большой зеленой точкой. (B) Вид датчика при правильном размещении над сосочковыми мышцами (пунктирная коробка). (C) Пример представления слоев, необходимых для измерения параметров сердца. (D) Вид живого изображения M-Mode со слоями, обозначенными как на панели C. (Слои сверху вниз: задние эпикардиальные, задние эндокардиальные, передние эндокардиальные и передние эпикардиальные.) Е) Пример статистических данных, полученных на основе кардиологических измерений. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 3: Использование инструментов сегментации и суппортов для измерения почек и кисты. (А) Пример сегментации (осевой вид) обеих почек (синее и оранжевое затенение) и большой кисты (желтый) с объемами, перечисленными ниже. Несегментированные представления отображаются внизу, чтобы можно было просматривать незатененные США. (B) Пример использования суппортов для измерения одной и той же кисты (сагиттальный вид) из рисунка 3А с измерениями ниже. Объем вычислялся по формуле для эллипса (объем = (4/3)π x a x b x c, где a, b, c — относительные x, y, z соответственно). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 4: Распределение TKV WT и кистозных почек мыши. Представление TKV для мышей дикого типа (WT) (C57BL/6J) и больных (Pkd1RC/RC). n = 22 (WT) n = 9 (Pkd1RC/RC); Результаты двуххвостого t-теста: p < 0,0001. Коробка показывает значения 25-75-го процентиля, а усы показывают в 1,5 раза больше межквартильного диапазона. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 5: Анимированная 3D-реконструкция сегментированных почек и кисты. Используя программное обеспечение, 3D-проекции почек и кисты могут поворачиваться или раскачиваться в 3D-пространстве (синий = левая почка; желтый = большая киста; оранжевый = правая почка). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот рисунок.
Рисунок 6: Физиологические параметры сердца из измерений УЗИ. Представление сердечного выброса (мл/мин) для WT и больных (Pkd1RC/RC) мышей. n = 22 (WT) n = 9 (Pkd1RC/RC). Более низкие табличные данные показывают, что для этих двух групп нет существенной разницы в фракции выброса, объеме удара, частоте сердечных сокращений (HR) или сердечном выбросе (CO). Результаты двуххвостого т-теста: p > 0,05. В поле показаны значения 25-75-го процентиля. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 7: Сравнение сагиттальных участков УЗИ нормальной и двух патологий. (А) Почка дикого типа (штамм C57BL/6J) (TKV = 143,202 мм3). (B) Кистозная почка с повышенным TKV (мышь Pkd1RC/RC ) (TKV = 333,158 мм3). Кисты обозначены желтыми стрелками. (C) Почки с сосудистыми кальцификациями (Модель = Дефицит липопротеинов низкой плотности, мышь только с аполипопротеином B100, получавшая западную диету в течение 12 месяцев5) (TKV = 127,376 мм3). Почечные камни обозначены зелеными стрелками. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Дополнительный рисунок 1: 4D фильм сердечного цикла из измерений США. Используя программное обеспечение, представление бьющегося сердца захватывается в 3D US и проецируется через сердечный цикл. Зеленая стрелка указывает на аортальный клапан. (Модель = Дефицит липопротеиновых рецепторов низкой плотности, мышь только с аполипопротеином B100, получавшая западную диету в течение 12 месяцев5). Эта модель генерирует сосудистые кальцинаты, что позволяет легче визуализировать сердце и клапаны благодаря большей акустической отражательной способности кальцинатов в США. Подобные 4D-реконструкции возможны с мышами WT; однако захваченный акустический контраст будет не таким высоким. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.
Ультразвук использует звуковые волны, и любые барьеры для распространения звуковых волн будут мешать качеству изображения. Таким образом, полная эпиляция области, подлежащей изображению, имеет решающее значение. Также важно обеспечить полное удаление крема для депиляции, так как он может вызвать ожоги/раздражение кожи животного и обесцвечивать прозрачную мембрану сканера. Адекватные уровни воды в заливах необходимы для оптимального распространения звуковой волны, что необходимо для получения самого высокого разрешения изображения. Однако, когда животное находится в положении лежа, убедитесь, что морда животного находится выше уровня воды, иначе животное подвергается риску вдыхания воды. Оптимизация параметров изображения, особенно глубины фокусировки, имеет решающее значение для получения высококачественных изображений. Изменения параметров могут потребоваться для отдельных животных.
Роботизированные США предоставляют много преимуществ по сравнению с традиционными ручными американскими модальностями. Во-первых, система использует простой интерфейс на основе камеры «укажи и щелкни». Эта функция решает сложность обычных США и создает согласованные данные даже при работе с начинающим пользователем6. Во-вторых, система позволяет использовать воду, а не традиционный американский гель в качестве акустической среды. Ранее использование американского геля позволяло образовывать пузырьки, которые мешали качественному получению изображения. Кроме того, американский гель грязный и создает проблемы для очистки. Далее вода нагревается тепловой лампой и помогает поддерживать температуру тела животного. В-третьих, роботизированные США быстрее, поэтому артефакты от дыхательного движения не проблематичны. Увеличенная скорость обработки изображений позволяет практически завершить сбор данных с высокой пропускной способностью. В-четвертых, роботизированные США получают 3D-изображения, и поэтому делают 3D-реконструкцию объектов простой (рисунок 4). МРТ и другие методы являются дорогостоящими, трудоемкими и не всегда доступными. Важно отметить, что роботизированная американская система помещается на столе или скамейке и является более экономичной. Наконец, предыдущая работа показала, что роботизированные США могут предоставлять сопоставимые данные измерений для более дорогих методов, таких как MRI3.
Хотя качество изображения и разрешение роботизированной системы США, описанные в этой работе, были адекватны для предлагаемого приложения (рисунок 7), существует несколько способов улучшения качества изображения в будущем. Например, использование высокочастотных преобразователей (например, 50-70 МГц) приведет к получению изображений с более высоким разрешением и лучшей четкостью функций. Хотя использование более высоких частот приведет к снижению глубины проникновения, изображений должно быть достаточно для визуализации in vivo поверхностных органов, таких как почки мыши. Как и в случае с другими методами визуализации, контрастные вещества могут использоваться для улучшения конкретных функций. Для США это обычно означает использование чего-то, что сильно отражает звуковые волны. Внутрисосудистые микропузырьки, в которых липиды окружают очень маленькие пузырьки газа, являются одним из таких агентов. Пузырьки газа микронного размера обладают высокой отражающей способностью и, таким образом, обеспечивают второй отчетливый сигнал, который переводится в сосудистую систему с высоким разрешением7. Хотя этот метод акустического контраста может быть весьма полезным, он может иметь несколько недостатков. Во-первых, микропузырьки должны быть свежими и сохраняться in vivo только в течение 5-10 минут. Во-вторых, внутрисосудистая инъекция in vivo обычно требует катетеризации хвостовой вуали для инъекции, и это может быть технически сложной задачей. При определенных обстоятельствах и пульсирующих режимах микропузырьковая визуализация сама по себе может привести к повреждению почечных сосудов8.
Существуют также некоторые более общие ограничения конкретной используемой системы США. Во-первых, в роботизированное шасси включен только один линейный массив (центрированный на частоте 18 МГц), поэтому переход на зонды с более высокой или низкой частотой в настоящее время невозможен. Это может повлиять на широту моделей (больших или меньших), которые могут быть оценены с помощью системы. Будущие итерации прибора должны включать в себя несколько линейных массивов, охватывающих весь спектр доклинических моделей животных. Во-вторых, угол преобразователя относительно животного субъекта не может контролироваться. Поэтому выполнение методов визуализации, зависящих от угла, таких как допплерография, или достижение альтернативных плоских видов определенных органов (например, вид почек с длинной осью) требует перепозиционирования животного и может быть трудно достижимым. Дополнительные степени свободы могут быть добавлены к роботизированному движению, чтобы улучшить эту проблему. В-третьих, иногда мы наблюдали артефакты реверберации, возникающие из акустической мембраны, которая отделяет животное от преобразователя, что может скрывать визуализацию поверхностных особенностей и границ. В этих случаях использование гелевого противостояния для поднятия животного от мембраны может исправить ситуацию. Наконец, контроль температуры с помощью тепловой лампы неточен, и поэтому при визуализации необходимо уделять пристальное внимание температуре тела животного. Более контролируемые механизмы нагрева, такие как интегрированная грелка, вероятно, улучшат управление гомеостазом и пропускную способность визуализации.
Использование роботизированных США может быть применимо к различным областям исследований. Эта технология позволяет визуализировать грубые тканевые структуры, таким образом, может быть использована для отслеживания прогрессирования опухоли и потенциальных методов лечения6,9, а также почечной морфологии, представленной здесь. Возможность сегментации специфических особенностей изображений делает его привлекательным инструментом для изучения моделей поликистоза почек (ПОКД)3. Изображения в М-режиме позволяют просто количественно оценить многие важные параметры сердца, что позволяет in vivo оценивать физиологию сердца. Поскольку почки получают 20%-25% сердечного выброса10, важно понимать сердечную функцию во время продольной оценки почечной патологии. С помощью этих протоколов США мы попытались проиллюстрировать, что визуализация США не только практична для исследований in vivo и продольных почек, но и что все более американские инструменты позволяют как морфологические, так и физиологические оценки мышей в доклинических исследованиях.
Несколько авторов либо работают, либо имеют значительный финансовый интерес, либо являются соавторами патентов, лицензированных SonoVol, Inc. (CJM, RCG, TJC).
Эта работа была поддержана NIH (R43-DK126607, TJC, TLK, MFR) и Фондом Майо.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Electric Razor | Braintree Scientific, Inc | CLP-9868 14 | |
C57bk6j | The Jackson laboratory | https://www.jax.org/ | |
Cotton gauze pads | Fisher Scientific | ||
Cotton tipped applicators | Fisher Scientific | ||
Depilatory cream | N/a | N/a | This study used Nair |
Heat lamp | Included with SonoVol Vega system | ||
Robotic Ultrasound System | SonoVol Inc | SonoVol Vega system includes anesthesia system | |
SonoEQ Software | SonoVol | Included with SonoVol Vega system | |
TERRELL Isoflurane | Piramal Critical Care, Inc | NDC 66794-019-10 |
An erratum was issued for: Use of 3D Robotic Ultrasound for In Vivo Analysis of Mouse Kidneys. An author name was updated, along with the Protocol and Representative Results.
The name of an author was updated from:
Ryan C. Gesser
to:
Ryan C. Gessner
Step 3.1 of the Protocol was updated from:
Turn on the US machine and the heat lamp above the US platforms. Turn on the appropriate anesthesia valves for the corresponding US bays that will be used.
to:
Turn on the US machine and the switch for the internal heating element for the US bays. Turn on the appropriate anesthesia valves for the corresponding US bays that will be used.
Figue 1 in the Representative Results was updated from:
Figure 1: Ultrasound system and mouse placement. (A) Diagram of ultrasound system and location of transducers. (B) View of mice in supine position on ultrasound platform with heat lamp. (C) Example of region of interest (ROI)s in place for area of interest (kidneys) with animal IDs. Please click here to view a larger version of this figure.
to:
Figure 1: Ultrasound system and mouse placement. (A) Diagram of ultrasound system and location of transducers. (B) View of mice in supine position on ultrasound platform. (C) Example of region of interest (ROI)s in place for area of interest (kidneys) with animal IDs. Please click here to view a larger version of this figure.
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены