DNA Origami Nanoantenna (DONA) Assembly and Gel Electrophoresis

Для сборки наноантенн ДНК-оригами или DONA используйте наночастицы золота с ДНК-покрытием и уже собранные вилки ДНК-оригами. Добавьте раствор нановилки к раствору наночастиц золота с покрытием, поддерживая конечное молярное отношение концентрации 1,5 к единице. К смеси добавляют хлорид магния из 50-миллимолярного исходного раствора, чтобы достичь конечной концентрации хлорида магния четыре миллимоля.

Отрегулируйте конечный объем до 20 микролитров, используя сверхчистую воду. Гибридизируйте DONA с помощью температурного градиента в термоциклере. Начиная с быстрого нагрева до 40 градусов по Цельсию, следуйте отображаемой программе градиента температуры шаг за шагом.

Для очистки DONA приготовьте 1%-ный агарозный гель, растворив 0,8 грамма агарозы в 80 миллилитрах ТА Е с добавлением пяти миллимолей хлорида магния. Добавьте 2,25 микролитра загрузочного буфера, содержащего 30% глицерина и 13 миллимоляров хлорида магния, к 18 микролитрам раствора Dona. Запустите гель в течение 60 минут при 70 вольтах на бане с ледяной водой.

Вырежьте интересующую полосу и поместите ее на предметное стекло микроскопа, обернутое парафиновой полиэтиленовой пленкой. Затем выдавите раствор с помощью второго предметного стекла для микроскопии, обернутого парафиновой пленкой. С помощью пипетки соберите выжатую жидкость в пробирку объемом 500 микролитров.

Во время очистки агарозного геля димерная полоса, соответствующая DONA, появилась над полосой свободных наночастиц золота, самой быстрой полосой в образце.