Обработка данных визуализации анализа сдвига одиночных клеток

Для выполнения корреляции цифровых изображений (DIC) с помощью программного обеспечения DIC импортируйте изображения, полученные в результате записи чистого анализа, в программное обеспечение DIC, предпочтительно в формате файла TIF. Для оптимизации корреляции выберите опцию «Сумма дифференциалов», которая отслеживает деформацию нового изображения по отношению к последнему. Выберите размер подмножества 31 на 31 пиксель с шагом 20 пикселей.

Наметьте область интереса для выбранной отдельной ячейки. Для неправильной формы, такой как ячейка, используйте многоугольную маску для отображения геометрии ячейки. Выберите произвольные точки в пределах сопоставленной ячейки для отслеживания деформации.

После картирования выберите конкретные точки на клетке, такие как ядро или цитоплазма, для анализа, нажав кнопку «Добавить тензодатчик» и нарисовав отдельные тензодатчики в точках в пределах определенной клеточной границы. Нажмите кнопку «Пуск», чтобы начать обработку деформации и получить данные о зависимости деформации от времени. График времени деформации, построенный в результате этой корреляции, может быть экспортирован в виде файла CSV для дальнейшего анализа в MATLAB.

Дважды щелкните или щелкните правой кнопкой мыши на сгенерированном графике времени деформации и выберите «Экспорт данных». DIC кадров изображений, извлеченных из чистых записей анализа, успешно получил данные о времени деформации, совместимые с реакцией на напряжение ползучести. Результаты исследований с использованием метода чистого анализа показали, что раковые клетки, как правило, более механически податливы и менее вязки, чем нормальные клетки.

Было отмечено, что жесткость и вязкость клеток уменьшаются с увеличением прогрессирования рака от нормального клеточного состояния до слегка метастатического состояния и, наконец, до высокометастатического состояния. Тем не менее, время релаксации для этих типов клеток не показало существенных вариаций.