Для начала аккуратно промойте оболочку листьев кукурузы, инокулированную спорами гриба, в деионизированной воде. Поместите тубус на предметное стекло чистого стекла микроскопа адаксиальной поверхностью вниз, а абаксиальной поверхностью вверх. Используя лезвие бритвы с одним лезвием, обрежьте примерно один сантиметр от концов ножен и удалите большую часть ткани пластинки по обе стороны от средней жилки.
Держите лезвие бритвы под углом 90 градусов, чтобы сбрить ткань от абаксиальной средней жилки, обнажая эпидермальный слой на адаксиальной поверхности над инокулированным местом. Осторожно приподнимите секцию тубуса с одного края и перенесите ее на новое предметное стекло адаксиальной поверхностью, обращенной к самой верхней части объектива. Нанесите на секцию 60 микролитров деионизированной воды и установите стеклянную крышку без внесения пузырьков воздуха.
Stenocarpella maydis быстро проникает в клетки эпидермиса непосредственно через недифференцированные гифальные отеки. В то время как Colletotrichum graminicola продуцировал меланизированные аппрессории. Окрашивание трипановым синим цветом показало природу и степень колонизации гиф грибов, при этом C.graminicola первоначально проникал через толстые первичные гифы, а затем перешел в некротрофную стадию.
C.graminicola проникает в клетки живой кукурузы с помощью толстых первичных гиф, отделенных от цитоплазмы хозяина мембраной. Напротив, S. maydis продуцирует фитотоксин, который убивает клетки эпидермиса перед их вторжением. У C. graminicola образование темно-коричневого осадка в оболочках листьев кукурузы указывало на окислительный взрыв, связанный с реакцией на устойчивость хозяина.