Предметом наших исследований является характеристика репликации ДНК нестабильных патогенных повторов в клетках человека. Мы надеемся ответить на такие вопросы, как: какие конкретно повторы вызывают остановку репликационного форка? Какие уникальные вторичные структуры образуют эти повторы?
И как эти повторы расширяются во время репликации ДНК? Хотя мы знаем, что многие из этих структурообразующих повторов могут нарушить репликацию ДНК, до сих пор неясно, какие именно шаги будут предприняты дальше. Мы надеемся, что этот протокол поможет ответить на этот вопрос и прольет свет на механизмы распространения этих патогенных повторов.
Двухмерные гели предоставляют уникальную возможность фактически визуализировать структуры в относительных популяциях молекул, которые могут возникать во время репликации ДНК. В рамках одного эксперимента у вас, по сути, есть полная карта того, как выглядит прогрессия репликации через определенную последовательность ДНК.