Sideroforo high-throughput Screening da campioni ambientali: tessuti, Bulk terreni e suoli rizosfera della pianta

Siderofori (composti di chelatazione metallo di basso peso molecolare) sono importanti in varie fenomeno ecologico che vanno dal ferro (Fe) ciclismo biogeochimici in terreni, a concorrenza di agente patogeno, promozione della crescita di pianta e cross-Unito della segnalazione. Inoltre, siderofori sono anche di interesse commerciale di bioleaching e bioweathering del metallo-cuscinetto minerali e minerali. Un mezzo rapido, conveniente e affidabile di valutare quantitativamente la produzione sideroforo in campioni complessi è la chiave per identificare gli aspetti importanti delle ramificazioni ecologiche di sideroforo attività, tra cui, romanzo sideroforo producendo i microbi. Il metodo qui presentato è stato sviluppato per valutare l'attività di sideroforo delle Comunità in tatto microbiome, in campioni ambientali, quali i tessuti del suolo o delle piante. I campioni sono sono omogeneizzati e diluiti in un mezzo di M9 modificato (senza Fe) e colture di arricchimento sono state incubate per 3 giorni. Produzione di sideroforo è stata valutata nei campioni a 24, 48 e 72 ore (ore) utilizzando una micropiastra a 96 pozzetti CAS (Chrome azurol solfonato) romanzo-saggio agar Fe, un adattamento del metodo colorimetrico tradizionalmente noioso e richiede tempo di valutazione sideroforo attività svolta su singoli isolati microbici coltivati. Abbiamo applicato il nostro metodo a 4 diversi genotipi/linee di grano (Triticum aestivum L.), tra cui Lewjain, Madsen e PI561725 e PI561727 comunemente coltivata nel nord-ovest pacifico dell'entroterra. Sideroforo produzione chiaramente è stata influenzata dal genotipo del grano con i tipi specifici di tessuti vegetali osservati. Abbiamo utilizzato con successo il nostro metodo per selezionare rapidamente per l'influenza del genotipo di pianta il sideroforo produzione, una funzione chiave negli ecosistemi terrestri e acquatici. Abbiamo prodotto molti tecnici replicati, producendo le differenze statistiche molto affidabile nel suolo e all'interno di tessuti vegetali. D'importanza, i risultati mostrano che il metodo proposto può essere utilizzato per esaminare rapidamente sideroforo produzione in campioni complessi con un alto grado di affidabilità, in un modo che permette alle comunità di essere conservato per lavoro successivo identificare taxa e geni funzionali.