Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir. Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
* Bu yazarlar eşit katkıda bulunmuştur
Bu makalede, bir sükroz gradyanı üzerinde süreksiz bir ultra-santrifüj ile sinaptik plazma membranı ile bağlantılı proteinlerin zenginleştirme göstermektedir. Post-sinaptik yoğunluk proteinlerin takip eden hazırlama de tarif edilmektedir. Protein preparatları western blotting ya da 2 boyutlu DIGE analiz için uygundur.
Nöronal hücre altı bölme teknikleri ve sinaps kaçırılan proteinlerin ölçülmesine olanak sağlar. Başlangıçta 1960 lerin sonlarında tarif edildiği gibi, sinaptik plazma membranı ile ilgili proteinlerin bir sükroz yoğunluk gradyanında ultrasantrifugasyon sureti ile izole edilebilir. Sinaptik membranlar izole edildikten sonra, sinaptik sonrası yoğunluğu olarak tanımlanır, makromoleküler bir komplekstir, daha sonra nedeniyle deterjan çözülemediği için izole edilebilir. Sinaptik plazma zarları ve post-sinaptik yoğunluklu proteinleri izole etmek için kullanılan teknikler, esas olarak 40 yıl sonra aynı kalır, ve yaygın olarak mevcut nörolojik araştırma kullanılır. Bu makalede, sinaptik plazma membranı ve post-sinaptik yoğunluk kesintili bir sakroz gradyanı kullanılarak, ilişkili proteinlerin fraksiyonasyon göstermektedir. Elde edilen protein preparatları, batı lekeleme ya da 2 boyutlu DIGE analiz için uygundur.
Nöronlar, sinaps ile iletişim kurmak ve bu haberleşme kalitesi sinaps proteinlerin bileşiminde değişikliklerle büyük ölçüde kontrol edilir. Özel olarak, sinaptik sonrası yoğunluğu bulunan proteinlerin sinyal iletim sistemleri 1 ile iyice iskele nörotransmiter reseptörleri nöronal iletişiminde yer. Ayrıca, sinaptik etkinliğinin gücü kalıcı değişiklikler, sinaptik sonrası yoğunluğu 1-6 de ekleme ya da reseptörleri ayrılmasıyla kontrol edilir. Bu nedenle, sinaptik proteinlerin izolasyon ve miktar nöronlar uyaranlara ve sinaptik etkinliğini 7 değiştirmek yanıt yolları içgörü kazanmak için gerekli ve yararlı bir tekniktir. Bu makale süreksiz sakaroz Yokuşta ultrasantrifugasyon kemirgen beyin dokusundan sinaptik proteinler izole etmek ortak bir teknik anlatılmaktadır. Sinaptik plazma zarı fraksiyonu zenginleştirilmiş olabilir dayanan ve izoleampirik olarak 1.2 M sukroz ile benzer olduğu tespit edilmiştir sukroz yoğunluk,.
Biyolojik bir soru ile ilgili olarak, alt-hücresel fraksiyonlar sakaroz veya Percoll ya sürekli ya da süreksiz gradyentlerin ayrılabilir. Sürekli eğimleri çok sayıda kısmın içine proteinlerin ayrıştırılması için; Bu, belirli bir payın 8 içindeki proteinlerin birlikte-lokalizasyonunu göstermek için özellikle yararlı olabilir. Bununla birlikte, sürekli geçişlerini hazırlanması daha zahmetlidir ve birçok uygulama için gerekli değildir. Süreksiz gradyanlar hazırlamak için nispeten kolay olan ve az, genellikle tanımlanmış fraksiyonlar halinde proteinleri ayırmak için kullanılabilir. Artan molaritede üç sükroz katmanlardan oluşan çok süreksiz değişim ölçüleri geniş ölçüde sinaptik plazma zarı (SPM) ile ilişkili proteinler izole etmek için kullanılmıştır. Bu sinaptik plazma membranı fraksiyonu, sinaptik sonrası yoğunluk fraksiyonu yok etmek için işlenebilir;Deterjan-çözünmeyen fraksiyon deterjan muamelesi ile izolasyonu ve n, (PSD).
Bu işlem, ilk olarak 1960 de tarif 9,10 zaman, elektron mikroskopi kabaca sinaptik membranı ve post-sinaptik yoğunluğu 9-14 fraksiyonları tanımlamak organel ve membranlar göstermek için kullanılmıştır. Bu çalışmalar öncesi ve post-sinaptik zar ve SPM fraksiyonunda sinaptik veziküllerin dahil olduğunu gösterdi; Deterjan tedavisi öncelikle elektron-yoğun sonra sinaptik sonrası yoğunluğu görünür. Prosedürde, hipotonik şok hücre gövdesi 10 gelen sinaptik süreçleri çimdik için kullanılır. Bu adım, mitokondri ozmotik şoka, daha dayanıklı ve sağlam kalır ve bu nedenle bu yöntem sukroz gradyanı ile (Şekil 1) altındaki çöktürmek gerçeğinden yararlanır.
Bu aynı zenginleştirme tekniği kullanarak, SPM ve PSD fraksiyonlar biyokimyasal ilk idipoliakrilamid jel elektroforezi ve ana protein bileşenlerinin 15-17 sekans ile tanımlanmıştır. Daha sonra, western blot analizi (Şekil 2), bu kısımlar daha fazla tespit etmek ve tanımlamak sinaptik proteinlerin seviyelerini ölçmek ve kullanılmıştır. Biz Slc6a3 odağının farelerde 18 yineleniyor meydana dopamin taşıyıcı sinaptik seviyelerindeki değişiklikleri ölçmek için laboratuarlarda bu tekniği kullandık. Ayrıca DISC1 interactome 19 bir parçası olan proteinlerin sinaps özgü azalma ortaya çıkarmak için, NMDA reseptörü eksik olan farelerde, bu tekniği kullanılmıştır.
Bu fraksiyonlar SPM sinaptik vezikül zar proteinleri, endozom belirteçler, mitokondriyal protein, zar bağlı sentetik enzimler ve sinyal iletim molekülü olarak post-sinaptik yoğunluk tamamlayıcı bileşenleri ve sinaptik plazma zarlarını içeren 20-23, western blot analizi bellidir. Even PSD kısımlar bol mitokondriyal proteinleri ile kirlenmemiş olması ve bunları 13 ayrılması için bir ikinci meyilli sedimentasyon ya da ek saflaştırma adımları gerçekleştirmek gerekli olabilir. Son zamanlarda, tek başına nicel kütle spektrometrisi, sinaptik-sonrası yoğunluğu 100 proteinlerin bir listesi, aynı zamanda bu bileşenlerin 24,25 nispi bolluk bir gösterge sağlamıştır.
Aşağıdaki protokol Hayvan Bakımı Kanada Konseyi yönergelerine uygun ve Toronto Üniversitesi Tıp ve Eczacılık Hayvan Bakım Komitesi Fakültesi tarafından onaylanmıştır.
Tablo 1 Açıklandığı gibi 1. Gerekli Reaktifler hazırlayın
Uygun Beyin Bölgesi 2. Diseksiyon
Motorlu Cam-Teflon Homogenizer 3. Doku Homojenizasyon
4. Düşük Hız Santrifugasyon Nükleer Kesir Kaldır (Getirileri Supernatant S1)
Ham sinaptosomal Kesir 5. Zenginleştirme (Getirileri Pelet P2)
Ham sinaptosomal Kesir 6. Parçalama (Hypoosmotic Şok)
Sinaptosomal Membran Kesir 7. Zenginleştirme (P3)
Sürekli olmayan, sukroz gradyanlı 8. hazırlanması
Synaptic Plazma Membran 9. Fraksiyonu (SPM)
Yoğunluk postsinaptik Fraksiyon 10. Hazırlama (PSD)
Sükroz yoğunluk gradyanı preparasyonu sukroz (0.8, 1.0 ve 1.2 M sükroz) üç mol çözümler net bir ayrım ile sonuçlanmalıdır. Protein numunesi ilave edilmeden önce, gradyanın bir örnek için bakınız Şekil 3A. Degrade önceden çok hazırlanır, ya da diğer ekipmanların gelen titreşim ile bir tezgah yüzeyi üzerinde hazırlanmış ise, degrade tehlikeye olacak ve uygun ayırma elde edilemez olacaktır. Üç çözümler net bir ayrım görünür değilse, bu protein örneği eklemeden ...
Başarılı bir sonuç için kritik olan prosedür birkaç adım vardır. 3. adımda, bu homojenleştirme tutarlı bir derecesi, her bir numune için elde edilmesi önemlidir. Motor tahrikli homojenleştirici ile dokuyu, bir homojenizatör zaman, sabit hız havan eli döndürülmesi için değil, aynı zamanda vuruş sayısı ile de kullanılmaktadır. Hipotonik bir solüsyon içerisinde uzun bir homojen hale getirme ya da mitokondri lize edildi ve inkübasyon SPM örneği kontamine çünkü ozmotik şok, inkübasyon s?...
The authors have no conflicts of interest to disclose.
The authors thank Dr. Mike Ehlers and his laboratory members for originally demonstrating the protocol for subcellular fractionation of synaptic plasma membranes. We also thank Wendy Horsfall for management of the mouse colonies. This work was supported by operating grants from CIHR (AJR and AS).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1M HEPES, pH 7.4 | BioShop | HEP003.100 | |
HEPES | BioShop | HEP001.500 | |
Sucrose | BioShop | SUC507.1 | |
EDTA | BioBasic | EB0185 | |
PMSF | BioShop | PMS123.5 | |
Aprotinin | BioShop | APR600.1 | |
Leupeptin | BioShop | LEU001.1 | |
Pepstatin | BioShop | PEP605.5 | |
Benzamidine | BioShop | BEN601.25 | |
Sodium fluoride | BioShop | SFL001.100 | |
Sodium pyrophosphate | BioShop | SPP310.100 | |
Sodium orthovanadate | BioShop | SOV664.10 | |
β-glycerophosphate | BioShop | GYP001.10 | |
Triton X-100 | BioShop | TRX506.500 | |
18G x 1 ½” needle | BD | 305196 | |
1cc syringe | BD | 309659 | |
Name of Equipment | Company | Catalog number | |
Glass Teflon homogenizer Kontes Duall 23 | VWR | KT885450-0023 | |
IKA Model RW 16 Basic Stirrer | IKA Works | 2572100 | |
Sorvall SM-24 Fixed Angle Rotor | ThermoScientific | 29017 | |
Sorvall RC 6 Plus Centrifuge | ThermoScientific | 46910 | |
Thinwall Polyallomer Tubes (13.2mL) | Beckman Coulter | 331372 | |
SW 41 Ti Rotor Swinging Bucket | Beckman Coulter | 331362 | |
Beckman L-80 Floor Ultracentrifuge | Beckman Coulter | ||
Thickwall Polycarbonate Tubes (3.5mL) | Beckman Coulter | 349622 | |
TLA-100.3 Fixed Angle Rotor | Beckman Coulter | 349481 | |
Beckman TL-100 Tabletop Ultracentrifuge | Beckman Coulter |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiDaha Fazla Makale Keşfet
This article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır