Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir. Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
Method Article
Ultra kısa yankı süresi (UTE) Manyetik Rezonans Görüntüleme (MRI) kullanılarak akciğerlerin yüksek çözünürlüklü yapısal görüntülerini oluşturmak için bir protokol tanımlanmıştır. Bu protokol, serbest nefes alma sırasında basit bir MRI nabız dizisi kullanılarak görüntülerin elde edilmesini sağlar.
Akciğerlerin yüksek kaliteli MRG'si, düşük doku yoğunluğu, hızlı MRG sinyali gevşemesi ve solunum ve kalp hareketi ile zorlanır. Bu nedenlerden dolayı, akciğerlerin yapısal görüntülemesi neredeyse sadece Bilgisayarlı Tomografi (BT) kullanılarak gerçekleştirilir. Bununla birlikte, BT görüntüleme iyonlaştırıcı radyasyon verir ve bu nedenle bazı savunmasız popülasyonlar (örneğin, pediatri) veya araştırma uygulamaları için daha az uygundur. Alternatif olarak, ultra kısa yankı süreleri (UTE) kullanan MRG ilgi çekmektedir. Bu teknik, ~ 5-10 dakikalık bir tarama boyunca serbest nefes alma sırasında gerçekleştirilebilir. Solunum hareketi bilgisi görüntülerle birlikte kodlanır; Bu bilgiler, görüntüleri "kendi kendine geçit" etmek için kullanılabilir. Bu nedenle, kendi kendine geçitleme, gelişmiş MRI nabız dizisi programlama veya solunum körüklerinin kullanımı gereksinimini ortadan kaldırır ve bu da görüntü alımını basitleştirir. Bu protokolde, akciğerlerin yüksek kaliteli UTE MRG'sini elde etmek için basit, sağlam ve hesaplama açısından verimli elde etme ve rekonstrüksiyon yöntemleri sunulmaktadır. Bu protokol, bir 3T MRI tarayıcısında kullanılmak üzere geliştirilmiştir, ancak aynı prensipler daha düşük manyetik alan kuvvetinde de uygulanabilir. Protokol, 3D radyal UTE görüntü alımı için önerilen parametre ayarlarının yanı sıra, farklı solunum aşamalarında görüntüler oluşturmak için kendi kendine kapılı görüntü rekonstrüksiyonu için yönergeleri içerir. Bu protokolün uygulanmasıyla, kullanıcılar minimum veya minimum veya hiç hareket artefaktları ile akciğerlerin yüksek çözünürlüklü UTE görüntülerini oluşturabilirler. Bu görüntüler, çeşitli pulmoner durumlarda araştırma kullanımı için uygulanabilen pulmoner yapıyı değerlendirmek için kullanılabilir.
Pulmoner yapının yüksek çözünürlüklü görüntülenmesi, birçok pulmoner durum için tanısal çalışmaların önemli bir parçasıdır. Tipik olarak bu, akciğerlerin yüksek çözünürlüklü görüntülerini oluşturmak için ideal olan Bilgisayarlı Tomografi (BT) görüntüleme kullanılarak gerçekleştirilir1. Bununla birlikte, BT görüntüleme, önemsiz olmayan bir iyonlaştırıcı radyasyon dozu sağlar, bu da onu düzenli tekrar görüntüleme, birden fazla farklı solunum fazında görüntüleme veya belirli popülasyonları (örn. pediatri) görüntüleme için uygun hale getirmez. Manyetik rezonans görüntüleme (MRG) aynı iyonlaştırıcı radyasyon riskini taşımaz ve bu nedenle bu tür görüntüleme görevlerine uygundur. Bununla birlikte, düşük doku yoğunluğu, solunum ve kardiyak hareket ve çok hızlı sinyal gevşemesi nedeniyle MRG kullanarak akciğerleri görüntülemek zordur 2,3,4.
Bu zorlukları hafifletebilen bir MRG tekniği, ultra kısa yankı süresi (UTE) MRI 4,5,6'dır. UTE MRG'de, MRI sinyali, sinyal uyarımından hemen sonra örneklenir, bu da hızlı sinyal gevşemesinin etkisini azaltır. Ayrıca, bu teknik, k-uzayını merkezden dışa doğru örnekler, bu da k-uzayının merkezinde önemli ölçüde aşırı örneklemeye yol açar. K-uzayının merkezindeki bu aşırı örnekleme, bu görüntüleme tekniğini harekete karşı dayanıklı hale getirir. Harekete karşı bu doğal sağlamlığa ek olarak, k-uzayının merkezinin tekrar tekrar örneklenmesi, solunum hareketi hakkındaki bilgileri kodlar ve bu da görüntülerin kendi kendine kapılanmasını sağlar 7,8,9. Bu kendi kendine geçitleme, çeşitli solunum aşamalarında görüntüler oluşturmak için kullanılabilir. İnsanlar solunum fazının çoğunu son kullanma tarihinde geçirdikleri için, bu aşama elde edilen en fazla görüntüleme verisine sahip olduğundan, son kullanma tarihi için bir görüntü oluşturmak yaygındır.
Pulmoner MRG'de kendi kendine solunum yolu için çeşitli stratejiler vardır. Yapılması gereken ilk ayrım görüntü tabanlı vs. k-uzay tabanlı geçit10 (Şekil 1). Görüntü tabanlı geçitlemede, görüntüleme verilerinin küçük zamansal alt kümelerinin yeniden oluşturulmasıyla yüksek zamansal çözünürlüğe sahip bir dizi görüntü oluşturulur. Daha sonra, bu görüntülerdeki diyaframın konumu, belirli bir görüntü projeksiyonuseti 10,11 için solunum fazını tanımlamak için kullanılır. K-uzayı tabanlı geçitlemede, k-uzayının merkezinden ("k0") gelen veriler incelenir 8,9,12. Görüntünün sinyal yoğunluğu k0 olarak kodlanmıştır ve bu nedenle k0 noktasının yoğunluğu solunuma göre değişir. Böylece projeksiyonlar, k0 yoğunluğuna bağlı olarak farklı solunum fazlarına bağlanabilir. Hem görüntü tabanlı hem de k-uzay tabanlı geçitlemede, benzer solunum fazlarına sahip projeksiyonlar, görüntünün yeniden yapılandırılması için gruplandırılır. Görüntü tabanlı geçitlemenin, solunum fazını tahmin etmede daha iyi doğruluk sağladığı ve böylece daha az bulanıklığa sahip görüntüler sağladığı öne sürülmüştür10,13.
Şekil 1: Görüntü tabanlı ve k-uzay tabanlı kendi kendine geçit teknikleri. (A) Görüntü tabanlı geçitlemede, diyaframı gösteren düşük uzamsal çözünürlüklü, yüksek zamansal çözünürlüklü görüntüler, genel verilerin zamansal alt kümelerinden oluşturulur. Diyafram üzerinde bir çizgi kullanılarak, solunum hareketi görselleştirilebilir ve görüntünün yeniden yapılandırılması için birleştirilebilir. (B) K-uzayı tabanlı geçitlemede, solunum hareketini görselleştirmek için merkezden dışarı k-uzayı projeksiyonundaki ("k0") ilk nokta kullanılır. K0 yumuşatıldıktan sonra, solunum döngüsüne dayalı sinyal yoğunluğu farkları açıkça görülebilir ve farklı solunum fazlarını tanımlamak için kullanılabilir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Hem görüntü hem de k-uzay tabanlı geçitleme, sert geçit veya yumuşak geçit11,14 kullanılarak gerçekleştirilebilir. Sert kapılamada, sadece istenen solunum fazına karşılık gelen çıkıntılar yeniden yapılandırılır. Bununla birlikte, istenmeyen projeksiyonların bu şekilde atılması, görüntü sinyal-gürültü oranının (SNR) azalmasına ve yetersiz örnekleme artefaktlarının artmasına neden olabilir. Bu istenmeyen etkiler, yumuşak geçit kullanılarak azaltılabilir. Yumuşak geçitlemede, tüm projeksiyonlar görüntünün yeniden yapılandırılması için kullanılır, ancak istenmeyen bir solunum evresinden gelen projeksiyonlar, nihai görüntü üzerinde daha az etkiye sahip olacak şekilde ağırlıklandırılır. Bunu yaparken, görüntüler solunum hareketinin etkisini bastırırken minimum artefaktlar ve yüksek SNR ile yeniden yapılandırılabilir.
UTE MRG ediniminin çekim sonrası kendi kendine geçit ile kombinasyonu sayesinde, BT'ye eşdeğer olmasa da, BT görüntülemeninkine yaklaşan bir kontrast ve çözünürlüğe sahip yüksek kaliteli görüntüler oluşturulabilir 6,15,16,17,18,19. Burada, pulmoner yapının yüksek kaliteli görüntülerini oluşturmak için UTE MRG görüntülerinin toplanması ve yeniden yapılandırılması için basit bir protokol sağlanmıştır.
Bu protokol öncelikle 3T MRI tarayıcıları için yazılmıştır; 3T, araştırma MRG'si için kullanılan en yaygın alan kuvvetidir. 1.5T veya yakın zamanda piyasaya sürülen 0.55 T20 gibi daha düşük manyetik alan kuvvetleri, akciğerler içindeki sinyal gevşemesi bu alan kuvvetlerinde daha yavaş olduğundan, akciğerler içinde gelişmiş görüntü kalitesi ve sinyal yoğunluğu sağlayabilir.
Bu protokolde ve sağlanan görüntü rekonstrüksiyon kodunda netlik ve basitlik sağlamak için her türlü girişimde bulunulmuş olsa da, protokol muhtemelen MRI tarayıcısında uygun bir UTE MRI dizisi oluşturmak için özel bir MRI fizikçisi (veya benzer bir MRI uzmanı) gerektirecektir. MRI dizisi, Merkezden çıkış k-uzayı yörüngeleri ile 3B Kartezyen olmayan bir kodlama stratejisi uygulamalıdır. Örnekler arasında 3D radyal veya 3D spiral (örneğin, "FLORET")21,22 görüntüleme dizisi bulunur. Daha da önemlisi, projeksiyonların sırası iyi bir zamansal kararlılığa sahip olmalıdır: Herhangi bir zaman alt kümesi boyunca, projeksiyonlar k-uzayı23'ün tamamını kapsamalıdır. İyi zamansal kararlılığa sahip projeksiyon sıralama stratejilerine örnek olarak altın araçlar veya Halton randomize Arşimet spirali verilebilir. Zayıf zamansal kararlılığa sahip bir projeksiyon sıralaması kullanılırsa, edinme sonrası kendi kendine geçitleme, k-uzayının geniş bölgelerini atlayarak görüntü artefaktlarına yol açacaktır. Son olarak, dizi <100 μs'lik bir yankı süresi (TE) elde edebilmelidir. 3T'de akciğerlerdeki T2* gevşeme süresi <1 ms24'tür, bu nedenle yüksek kaliteli görüntüler oluşturmak için çok kısa bir TE kullanmak çok önemlidir.
Tüm insan denek görüntülemesi KUMC IRB'nin onayı ile gerçekleştirildi. Tüm katılımcılardan yazılı bilgilendirilmiş onam alındı. Bu çalışmadaki görüntüler, genel bir teknik geliştirme protokolü kapsamında elde edilmiştir ve dahil etme/hariç tutma kriterleri kasıtlı olarak geniştir. Dahil Edilme Kriterleri: Yaş ≥ 18. Dışlama Kriterleri: MRG tarama anketine verilen yanıtlara ve hamileliğe dayalı olarak MRG kontrendikedir. Bu çalışma için kullanılan aksesuarlar ve ekipmanlar Malzeme Tablosunda listelenmiştir.
1. UTE görüntü alımı
Parametre | Genel Önerilen Ayarlar | Burada Uygulanan Ayarlar |
Görüntüleme Dizisi | 3D Kartezyen Olmayan, Merkezden çıkışlı k-uzay yörüngeleri ile | Altın Araçlar ile 3D Radyal Projeksiyon siparişi |
Görüş Alanı | 400 x 400 x 400 mm3 | 400 x 400 x 400 mm3 |
Matris Boyutu | Hedef çözünürlük için istenildiği gibi | 320 x 320 x 320 (1,25 mm izotropik çözünürlük) |
Bant genişliği | Okuma süresi için gerektiği gibi < 1,0 ms | 888 Hz/piksel |
TE'LER | < 0,1 ms | 0,07 ms |
TR | Minimum (Hedef 3 – 4 ms) | 3,5 ms |
Çevirme Açısı | Yaklaşık 5° | 4.8° |
Projeksiyon Sayısı | En az 100.000 | 1,35,386 |
Görüntü Süresi | Minimum 5 dk | 7 dk, 54 sn |
Tablo 1: UTE görüntüleme için önerilen ayarlar. Protokol kurulumuna rehberlik etmek için kullanılabilecek genel önerilen ayarlar sağlanmıştır. Veriler için kullanılan belirli önerilen ayarlar da, temsili sonuçlar olarak gösterildiği gibi sağlanır. Parametre belirtimleri, bant genişliği dışında satıcılar arasında geneldir. Bazı büyük MRI satıcıları bant genişliğini Hz/Pixel olarak belirtir. Diğer büyük MRI satıcıları mutlak bant genişliği belirtir. Önerilen bant genişliği (888 Hz/Piksel), 284.160 Hz'lik mutlak bant genişliğine karşılık gelir.
2. Görüntü tabanlı solunum yumuşak geçit kullanarak UTE görüntü rekonstrüksiyonu
NOT: Aşağıdaki adımları tamamlamak için MATLAB kodu https://github.com/pniedbalski3/UTE_Reconstruction'da verilmiştir.
Şekil 2: Görüntü tabanlı kendi kendine geçit. (1) Az sayıda projeksiyondan (hesaplama verimliliği için) yeniden oluşturulan düşük çözünürlüklü bir görüntü kullanarak, diyaframı açıkça gösteren bir koronal dilim belirleyin. (2) Tek tek bobin elemanlarından gelen görüntüleri inceleyerek, diyaframa en yakın bobin elemanlarını seçin. (3) Yalnızca diyaframa en yakın bobin elemanlarının kayar pencere rekonstrüksiyonunun gerçekleştirilmesi (hesaplama verimliliği için). Görüntüler, 200 projeksiyonun alt kümelerinden oluşturulabilir (~0,8 s'ye karşılık gelir); Üst üste binen projeksiyonlarla, görüntülerde ~0,5 s'lik bir sözde zamansal çözünürlük elde edilebilir. (4) Solunum navigatörü olarak kullanılacak diyaframa dik bir çizginin belirlenmesi. (5) Bu çizgideki görüntü verilerinin görselleştirilmesi, görüntüleri bölmek için kullanılabilecek solunum hareketini gösterir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
3. K-uzay tabanlı solunum yumuşak geçit kullanarak UTE görüntü rekonstrüksiyonu
Temsili sonuçlar (Şekil 3), Tablo 1'de gösterilen ayarlar kullanılarak oluşturulmuştur. Kullanılan görüntüleme süresi, çoğu katılımcı tarafından tolere edilebilecek yüksek kaliteli görüntüler sağlar.
Şekil 3: Oluşturulan temsil...
Akciğerlerin UTE görüntülemesi yapılırken, akciğerlerin görüntülerini oluşturmak için hem edinim hem de rekonstrüksiyonun birçok varyasyonu kullanılabilir. Bu protokol, uygulama kolaylığı ve hesaplama verimliliğine odaklanır. 3D radyal UTE kullanarak görüntüleme nispeten basittir ve görüntüleme dizileri genellikle büyük MRI satıcılarından temin edilebilir. MATLAB tabanlı araçlar, veri işleme ve kendi kendine oturum açma için sağlanmıştır. Çoğu ak...
Peter Niedbalski, Ulusal Skleroderma Vakfı, Amerikan Kalp Derneği ve NIH'den araştırma fonu alıyor. Hiperpolarize 129Xe MRI teknolojisi geliştiren bir şirket olan Polarean Imaging Plc.'nin danışmanıdır.
Bu protokolün geliştirilmesi ve temsili sonuçlar olarak gösterilen görüntüler Ulusal Skleroderma Vakfı tarafından desteklenmiştir.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Chest MRI Coil | Siemens, GE, Philips,, Other Clinical MRI Imaging Coil Vendor | N/A | A 26 - 32 channel Chest coil should be used |
High Performance Workstation | HP, Apple, or other Computer Hardware company | N/A | A computer with a minimum of 64 GB of Memory is needed for image reconstruction |
Matlab | Mathworks | R2016A or newer | A Matlab license is needed to run the provided computer code |
MRI Phantom | Siemens, GE, Philips, or Other MRI Phantom Vendor | N/A | Any Phantom can be used to test the MRI sequence prior to its use in human subjects. |
MRI Scanner | Siemens, GE, Philips, or Other Clinical MRI Scanner Vendor | N/A | The protocol was developed on a 3T scanner, but 1.5T or 0.55T would also work with minimal adaptation |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır