Her seferinde 30 saniye boyunca yaklaşık 30 ila 50 gram kuru buzu iki kez öğüterek ticari bir kahve öğütücüyü soğutmaya başlayın. Kuru buz tozunu atın ve önceden soğutulmuş kahve değirmeninde üç gram donmuş maya hücreli spagetti ile yaklaşık 30 ila 50 gram kuru buzla karıştırın. Kapak ve öğütücü arasındaki bağlantıyı Parafilm ile kapatın.
Maya hücresi kuru buz karışımını her biri 30 saniye olacak şekilde 10 kez karıştırın ve her tur arasında 30 saniyelik aralıklarla karıştırın. Elde edilen maya hücresi kuru buz tozunu temiz ve kuru bir spatula kullanarak plastik bir behere aktarın. Kuru buz buharlaşmasından sonra, maya hücresi tozuna proteaz ve fosfataz inhibitörleri ile 2.25 mililitre manyetik boncuk veya MB tamponu ekleyin.
Hücre tampon karışımını kuvvetlice pipetledikten sonra, hücre süspansiyonunu 15 mililitrelik konik bir tüpe aktarın. Daha sonra, DNA için ham hücre ekstraktlarından %0,1 ve protein analizi için %0,05 numuneleri eksi 20 santigrat derecede saklayın. Kalan hücre süspansiyonunu düşük bağlayıcı iki mililitrelik reaksiyon tüplerine aktarın ve tüpleri santrifüjleyerek hücre kalıntılarını ayırın.
Bittiğinde, tüm süpernatantları 15 mililitrelik bir konik tüpe çekin. Yine, DNA için süpernatantın %0.1'ini eksi-20 santigrat derecede ve protein analizi için süpernatantın %0.05'ini saklayın. Daha sonra, 500 mikrolitre immünoglobulin G-bağlı manyetik boncuk bulamacını, proteaz ve fosfataz inhibitörleri içeren 500 mikrolitre soğuk MB tamponu ile iki kez, her biri beş dakika boyunca, dört santigrat derecede, 20 RPM'de döndürerek yıkayın.
Manyetik bir raf kullanarak süpernatanı boncuklardan çıkarmadan önce, manyetik boncukları 500 mikrolitre soğuk MB tamponunda dört santigrat derecede bir saat boyunca, 20 RPM'de dönerek inkübe edin. Dengelenmiş manyetik boncuk bulamacını, daha önce elde edilen hücre lizatı ile karıştırın ve 15 mililitrelik konik bir tüpe çekin. Dört santigrat derece ve 20 RPM'de iki saat inkübe ettikten sonra, tam manyetik boncuk hücresi lizat süspansiyonunu düşük bağlayıcı reaksiyon tüplerine aktarın.
İlgilenilen kromatin halkalarını taşıyan manyetik boncukları, manyetik bir raf kullanarak hücre lizatından ayırın. DNA ve protein analizi için bazı numuneleri eksi 20 santigrat derecede saklamadan önce, her tüpten kalan akışı 15 mililitrelik yeni bir konik tüpe aktarın. Daha sonra, manyetik boncuğu her 15 mililitrelik konik tüpten 300 mikrolitre soğuk MB tamponunda askıya alın ve boncukları bir reaksiyon tüpünde birleştirin.
Proteaz ve fosfataz inhibitörleri içeren 750 mikrolitre soğuk MB tamponu kullanarak, 20 RPM'de dönerken dört santigrat derecede her biri 10 dakikalık beş yıkama gerçekleştirin. Ardından, proteaz ve fosfataz inhibitörleri olmadan 750 mikrolitre soğuk MB tamponu ile son yıkamayı gerçekleştirin. Hazırlanan boncukları proteaz ve fosfataz inhibitörleri olmadan 40 mikrolitre soğuk MB tamponunda süspanse edin.
