LWE ve RK Sağlık hibe R37 NS033506-16 ve R01 NS060699-03, ABD Ulusal Sağlık Enstitüleri tarafından desteklenmektedir. MPT bir Amerikan Kanser Derneği Doktora Sonrası Araştırma Bursu (PF-10-057-01-MPC) tarafından desteklenmiştir. Dr Matthew Lyman ve Dr Oren Kobiler bir tavsiye ve bilgi mikroskop yapılandırma ve canlı hücre görüntüleme yöntemleri tasarımında etkili olmuştur. Ayrıca mikroskop satın alma, kurulum ve performans teknik yardım için Neal Barlow ve Nikon Araçların Brian T. Kain için teşekkür ederiz.

Bölüm 1 - Canlı hücre Floresan Mikroskopi için Çevresel Kontrol Koşulları <ol><li> Herhangi bir görüntüleme deney öncesinde 30 dakika bağlanmak ve mikroskop sahne üst inkübatör ısınma başlar. <ol><li> Mikroskop, iletilen ve epifluorescent ışık kaynakları ve otomatik donanım kontrolleri açın. Mikroskop bağlanmak ve EM-CCD kamera soğutma başlamak için mikroskop kontrol yazılımı, NIS Elemanları, açın. </li><li> . Lens uygun objektif (ya 60X veya 100X immersiyon yağı) için sıcak Not takın: deney türüne göre objektif lens seçin. 60X faz amacı ileriye yayılması görselleştirmek için uygundur ise 100X diferansiyel girişim kontrast (DIC) ileriye taşıma virion meclislerinin takibi için en iyisidir. Bu örnek ile doğrudan temas yok gibi düşük büyütme, petrol dışı daldırma hedefleri bir lens sıcak gerektirmez. </li><li> Mi ve motorlu sahneye aşamasında üst inkübatör takın<html> croscope. Örnek yerde tutacaktır uygun eklemek emin olun. Inkübatör kontrolünden sahne üst inkübatör üzerindeki giriş portuna nemlendirilmiş hava hattı takın. </li><li> Inkübatör ve lens sıcak kontrolleri açın ve (tartışma) görüntülü olan objektif ve örnek için özel önceden doğrulanmış koşullarına sıcaklık ayarları. </li><li> % 5 CO 2 / üst inkübatör sahneye CO 2 ilave hava sağlamak için% 95 atmosferik tankı üzerindeki kontrol vanasını açın. Akış hızı dakikada gaz 60 ila 80 ml olmalıdır. Daha hızlı oranları nemlendirme odası rağmen geniş örnek dehidratasyon neden olacaktır. </li></ol></li><li> Objektif lens için lens yağ ekleyin ve hemen sahne üst inkübatör içine yansıması olan kültür yerleştirin. </li><li> 10 dakika içinde en az kültür sıcaklığının dengeleme izin verir. Bir saat, özellikle Bölüm 3&#39;te açıklanan gece görüntüleme için, tercih edilir. </li></ol>ve_title &quot;&gt; Bölüm 2 - İleriye Virion ulaşım etkinlik Protokol Gerçek zamanlı Görüntüleme <ol><li> Altı ile sekiz saat önce görüntüleme, Taylor ve de tarif edilen yöntem kullanılarak ilgi konusu virüs 1 x 10 6 plak oluşturan birim olgun, ayrışmış SCG nöron, bir 35 mm lamel alt çanak (örneğin virüsler için Tablo 1) hastalık ark. 2012A 11. 30-60 dakika tarafından birden fazla virüs, off-set aşılar test benzer zamanlarda, enfeksiyondan sıralı örneklerin görüntüleme sağlamak için eğer. </li><li> Herhangi bir deney çalıştırmadan önce 10 dakika en az sahne üst inkübatör içine çanak yerleştirin. Sıcaklık equilibrates ise, odak düzlemi kayıyor ve olumsuz herhangi bir görüntüleme deneyleri etkileyecektir. </li><li> Iletilen ışık ve mikroskop mercek kullanarak, açık bir şekilde izole akson uzantısı olan bir nöronal hücre gövdesi bulabilirsiniz. Alternatif olarak, algılama ifade eden bir hücre bulmak için uygun floresan aydınlatma kullanınfloresan proteinleri tablosu miktarda. Çünkü ışığın neden olduğu hücresel hasar ve floresan proteinleri beyazlatma, bu adım ve daha sonraki aşamalarda, floresan aydınlatma için bir örnek maruz kalmasını sınırlamak için önemlidir. </li><li> Hücrelerin maruz kaldığı uyarma ışık yoğunluğunu azaltmak için floresan aydınlatma zayıflatır. Nötr Yoğunluk (ND) floresan aydınlatma ışık yolu filtre hafifletici ışık meşgul. Uzun 1 dakika, ND4 en az uzun süren film floresan proteinleri fotoğraf beyazlatma ve akson foto-hasarı geniş önlemek için kullanılmalıdır için. Yüksek floresan yapıları genellikle yerde bir ND8 filtresi ile görüntülenebilir. </li><li> Mikroskop yazılım (Şekil 2 ve Ek Film 1A) kullanarak, EM-CCD kamera için ışık yolu açın. </li><li> Her floresan kanal için en iyi görüntüleme süreleri ve koşulları belirler. <ol><li> &quot;Play&quot; düğmesini kullanarak bir canlı görüntü penceresi başlatın. &lt;/ Li&gt; <li> Her floresan protein için en uygun kamera pozlama ayarları belirleyin. Hızlı hareket eden virion yapıların devinişsel sapmaları olarak kanal başına 300 milisaniye aşmayın meydana gelecektir. (Üretici maksimum kazanç önerilen), maruz kalma süresi en aza indirmek ve loş sinyallerin tespiti geliştirmek için 300 bir ayara kameranın EM kazanç yararlanın. Doğru pozlama süreleri düşük arka plan yoğunluğu ve yüksek özgül sinyalleri bir görüntü elde edilmelidir. </li></ol></li><li> Pozlama ayarı ve akson bir iyi tanımlanmış bir bölge bulduktan sonra, yazılım otomatik görüntü elde etme gerçekleştirmek için yapılandırılmalıdır. Ağartma örnek önlemek için canlı görüntüleme penceresi durdurun. <ol><li> NIS Elements yazılımı olarak, 6D seçin - Define / menü aşağı &quot;Uygulamalar&quot; açılan Deney uygulamasını çalıştırın. </li><li> ND satın alma penceresinde, görüntü elde etme sıklığını belirleyecek Zaman sekmesini tıklatın. &quot;Hayır Gecikme&quot; ve süresi 5 dk için Aralığı ayarlayın. The yazılımı daha sonra 5 dakika süresi için mümkün olan en yüksek frekansta görüntü kareleri kazanacaklardır. </li><li> Birden fazla floresan görüntü elde etmek için kullanılan önceden belirlenmiş donanım yapılandırmaları seçimi sağlar &quot;Lambda&quot; sekmesini seçin. Ilk kutusunu tıklatın ve menü aşağı sonraki açılan uygun bir donanım yapılandırması seçin. Yansıması için, flüoresan protein için tekrarlayın. </li><li> &quot;XY Pozisyonlar&quot;, &quot;Z-serisi&quot; ve &quot;büyük resim&quot; için sekmeleri de-seçilmiş olduğundan emin olun. </li><li> Sekmeler üzerinde, işaretli kutusu otomatik olarak satın alma sırasında sabit diske görüntüleri kaydetmek için &quot;Save to File&quot; seçeneğini seçin. Deney çıktı dosyasının konumunu ve dosya adını yapılandırın. Sıralı deneyler olduğundan, yazılım belirlenen dosya adının sonunda bir sıra numarası ekler. </li><li> Bir kez tüm sekmeleri seçilmiştir. &quot;Run-Now&quot; butonuna tıklayarak deneme başlatın. </li><li> Pozlama ayarları ile görüntü elde etme oranı optimize ve image boyutu. Görüntü mümkün alan küçük bir bölge kullanarak genellikle kare elde etme oranları hızlandırır. % 25 ve toplam görüntü alanının% 50 arasında bir alan seçerek, NIS-Elements ROI aracını kullanarak İlgi Bölge tanımlayın. Alternatif olarak, daha kısa pozlama süreleri kare elde etme oranlarını artırmak, ama (tartışma) sinyal kalitesini düşürür olacaktır. </li></ol></li></ol> Bölüm 3 - İleriye spread Olayların Gecelik Time-lapse Görüntüleme <ol><li> Görüntüleme önce dört saat, bir 35 mm μ-Bulaşık üzerine inşa edilmiş bir bölümlere nöronal kültür bulaştırmak. Taylor ve ark tarif edilen yöntem kullanılarak (örneğin virüsler için Tablo 1) ilgi konusu virüs 1 x 10 6 plak oluşturan birim nöronal hücre gövdeleri inoküle. 2012b 12. </li><li> Yavaşça sahne üst inkübatör içine kültür çanak yerleştirin. Nesnel yerini yemeğin tarafına ayarlandığından emin olun. Yavaş yavaş odak, ensur içine objektif getirmekamaç ing örnek içine itmek değildir. Odak alanı tespit edildikten sonra, yavaş yavaş akson bölmesinin iç tarafında demarking iç bariyer yakın, çanak merkezi haline amacı taşıyın. Hareket sırasında, odak derinliği korunmasını sağlamak ve örnek içine iterek kaçının. Amacı ile plastik yüzey sapma akson ve plastik zarar verir. </li><li> Sıcak (~ 37 ° C) fosfat Teflon ring dışında kültür çanak tamponlu tuzlu. Yaklaşık 2 ml Bu örnek, dehidratasyon en aza indirmek ve ısı yalıtımı sağlamak için PBS bir halka ile nöronal kültür çevreler. </li><li> Sıcaklığı otomatik görüntü elde etme (3.8) başlatmadan önce 1 saat en az gelmesini sağlayınız. 3.7 adımları 3.5 Bu süre içinde yapılandırılabilir. </li><li> Tüm nötral yoğunluk filtreleri yaparak mümkün olan en düşük seviyeye aydınlatma yoğunluğunu kısıtlayın. Bu sık sık görüntü elde etme ove sağlayacakfotoğraf-zarar aşırı olmadan r uzun süreler. Aydınlatma azaltılması uzun pozlama (tartışma) gerektiren, düşük sinyal neden olur. </li><li> Tarihsel pozlama ayarları veya set-up Bölüm 2.5 &#39;te açıklandığı gibi hedef floresan proteinleri pozlama ayarlarını yapmak için ifade enfekte epitel hücrelerinin paralel bir tabak oluşturmak deneysel önce kullanın. </li><li> Gerekli kanallar için pozlama ayarı sonra, otomatik görüntü elde etmek için yazılım yapılandırma zamanıdır. Ağartma örnek sınırlamak için canlı görüntüleme penceresi durdurun. <ol><li> Elements yazılımı (Şekil 2 ve tamamlayıcı film 2) olarak, 6D seçin - ND Toplama pencere açmak için aşağı &quot;Uygulamalar&quot; açılır menüsünden Deney uygulama tanımlayın / çalıştırın. </li><li> ND Toplama penceresinde, Zaman sekmesini tıklatın. &quot;5 dakika&quot; için Aralığı ayarlayın. 20 saat için süre ayarlayın. Döngüler alanı otomatik olarak progra tekrar sayısı için hesaplanırm gerçekleştirir. </li><li> &quot;Lambda&quot; sekmesini seçin. Ilk kutusunu tıklatın ve menü aşağı sonraki açılan Faz kontrast için uygun lambda yapılandırma seçin. Görüntülü her floresan protein için uygun konfigürasyonları seçerek, sonraki pozisyonlar için tekrarlayın. </li><li> Bir görüş tek bir büyük alana birleştirilmek üzere birden fazla görüntü parametrelerini belirleyen &quot;Büyük Resim&quot; sekmesini seçin. İyi bir büyüklükte alan 7% dikiş üst üste kullanarak 5 x 2 görüntü oluşur. Bu görüntü elde etme sıklığını etkilemeden yansıması için pozisyon başına hücre sayısı için izin verir. Ayrıca, &quot;Sahne hareketi sırasında Kapat Active Shutter&quot; için onay kutusunu kaldırın. Bu seçenek görüntüler arasında kepenkleri kapatarak değil tarafından satın hızını artırır. </li><li> , &quot;XY Pozisyonlar&quot; sekmesini seçin sırayla gecede filmin sırasında paralel olarak yansıması olacaktır birden fazla pozisyon belirlemek için. Merkezi po tanımlamak pozisyonları seçinher büyük resim aralıkları için int. Örnek 6-8 görüntü pozisyonları seçin. İyi bir görüntü alanı açıkça tanımlanmış akson yakın apozisyon hücrelerin küçük kümeler olacak. Hücreler en aza indirilmelidir birbirleriyle ve akson donatılacak üstüne yığılmış olmamalıdır. Odak noktası hücrenin çekirdeğini oluşturur. , Açık bir şekilde tanımlanmış çekirdek zarı hücrelerin çoğunluğu için görülür ki bu amaç yerleştirin. </li><li> &quot;Z-serisi&quot; sekmesi seçili olduğundan emin olun. </li><li> Yukarıda Bölüm 2.6.5 açıklandığı gibi otomatik kaydetme özelliği yapılandırın. </li><li> &quot;1 kez döngü&quot; tıklayarak pozlama ve pozisyon ayarları test edin. Iletilen ışık aydınlatma, odak ve çerçeveleme için çıkan görüntüler değerlendirin. Yoğunlaştırdığını ise, XY sekmesi altında her pozisyon için odak sıfırlayın. 10 dakika bekleyin ve odak istikrarlı kadar bu adımı tekrarlayın. </li><li> Tüm ayarları doğrulanmış ve test edildikten sonra, &quot;Şimdi Çalıştır&quot; butonuna tıklayarak otomatik deneme başlatmak. </li></ol></li&gt; </ol> Bölüm 4 - Görüntü İşleme ve İhracat Data Export <ol><li> Taşıma veya yaymak olayların canlı hücre görüntüleme sırasında elde edilen veri setleri sunumlar ve yayınlar (Ek Film 3) daha sonra kullanmak için sık kullanılan dosya türlerini içine NIS Elements yazılımı ihraç edilmelidir. NIS Elements film uygun ham. ND2 dosyasını açın ihracat ve istenen floresan kanalları görselleştirmek için &quot;bölünmüş bileşeni&quot; görünümü seçin. Oynatma uygun bir hızda dosya; saniyede 5 kare hızlı ulaşım görselleştirme için iyi bir başlangıç ​​noktasıdır. </li><li> Film oynatma sırasında gerçek zamanlı saat temsil etmek için bir zaman damgası ekleyin. Resmin üzerine sağ tıklayın ve, ND-bilgiler kat. Dijital sayaç sol üst köşesinde görünür. <ol><li> Bilgileri görüntülemek için zaman damgası düzenleyin. Sağ tezgahın üzerine tıklayın ve Edit ND-bilgileri seçin. Sonraki açılan pencerede, Hü yansıtmak için metni düzenlemekönemlidir ng parametreleri. Netlik için düzenleme yazı tipi, renk ve boyut. </li></ol></li><li> &quot;Düzenle&quot; menüsüne gidin ve &quot;görünümü anlık oluşturma&quot; ya da &quot;x&quot; tuşuna basın bulabilirsiniz. Bu komut &quot;görünümü anlık&quot; penceresi açılır. Seçin bir 8-bit, RGB, tüm filmden floresan kanalları içeren ihracata hazır dosyası oluşturmak için &quot;Tüm çerçeveler için geçerlidir&quot;. </li><li> Çapraz platform uyumluluğu için bir. Avi dosyası olarak kaydedin. Kare başına 200 msn de oynatma hızını ayarlayın. NIS Elemanları tarafından oluşturulan. Avi dosyaları sonra daha fazla istediğiniz dosya türünü içine diğer dönüştürme yazılımı ile sıkıştırılmış olabilir. </li></ol>

<ol>
	<li>Johnson, D. C., Baines, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Herpesviruses+remodel+host+membranes+for+virus+egress.">Herpesviruses remodel host membranes for virus egress.</a> Nature reviews. Microbiology. 9 (5), 382-394 (2011).</li><li>Mettenleiter, T. C., Klupp, B. G., Granzow, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Herpesvirus+assembly:+a+tale+of+two+membranes.">Herpesvirus assembly: a tale of two membranes.</a> Current Opinion in Microbiology. 9 (4), 423-429 (2006).</li><li>Saksena, M. M., Wakisaka, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Herpes+simplex+virus+type+1+accumulation,+envelopment,+and+exit+in+growth+cones+and+varicosities+in+mid-distal+regions+of+axons.">Herpes simplex virus type 1 accumulation, envelopment, and exit in growth cones and varicosities in mid-distal regions of axons.</a> Journal of Virology. 80 (7), 3592-3606 (2006).</li><li>Snyder, A., Wisner, T. W., Johnson, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Herpes+Simplex+Virus+Capsids+Are+Transported+in+Neuronal+Axons+without+an+Envelope+Containing+the+Viral+Glycoproteins.">Herpes Simplex Virus Capsids Are Transported in Neuronal Axons without an Envelope Containing the Viral Glycoproteins.</a> Journal of Virology. 80 (22), 11165-11177 (2006).</li><li>Snyder, A., Polcicova, K., Johnson, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Herpes+simplex+virus+gE/gI+and+US9+proteins+promote+transport+of+both+capsids+and+virion+glycoproteins+in+neuronal+axons.">Herpes simplex virus gE/gI and US9 proteins promote transport of both capsids and virion glycoproteins in neuronal axons.</a> Journal of Virology. 82 (21), 10613-10624 (2008).</li><li>Tomishima, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+conserved+alpha-herpesvirus+protein+necessary+for+axonal+localization+of+viral+membrane+proteins.">A conserved alpha-herpesvirus protein necessary for axonal localization of viral membrane proteins.</a> The Journal of Cell Biology. 154 (4), 741-752 (2001).</li><li>Schnell, U., Dijk, F., Sjollema, K. A., Giepmans, B. N. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunolabeling+artifacts+and+the+need+for+live-cell+imaging.">Immunolabeling artifacts and the need for live-cell imaging.</a> Nature Methods. 9 (2), 152-158 (2012).</li><li>Kratchmarov, R., Taylor, M. P., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Making+the+case:+Married+versus+Separate+models+of+alphaherpes+virus+anterograde+transport+in+axons.">Making the case: Married versus Separate models of alphaherpes virus anterograde transport in axons.</a> Reviews in Medical Virology. 22 (6), 378-391 (2012).</li><li>Antinone, S. E., Smith, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Two+modes+of+herpesvirus+trafficking+in+neurons:+membrane+acquisition+directs+motion.">Two modes of herpesvirus trafficking in neurons: membrane acquisition directs motion.</a> Journal of Virology. 80 (22), 11235-11240 (2006).</li><li>Del Rio, T., Ch'ng, T. H., Flood, E. A., Gross, S. P., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Heterogeneity+of+a+fluorescent+tegument+component+in+single+pseudorabies+virus+virions+and+enveloped+axonal+assemblies.">Heterogeneity of a fluorescent tegument component in single pseudorabies virus virions and enveloped axonal assemblies.</a> Journal of Virology. 79 (7), 3903-3919 (2005).</li><li>Taylor, M. P., Kramer, T., Lyman, M. G., Kratchmarov, R., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualization+of+an+alphaherpesvirus+membrane+protein+that+is+essential+for+anterograde+axonal+spread+of+infection+in+neurons.">Visualization of an alphaherpesvirus membrane protein that is essential for anterograde axonal spread of infection in neurons.</a> mBio. 3 (2), (2012).</li><li>Taylor, M. P., Kobiler, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alphaherpesvirus+axon-to-cell+spread+involves+limited+virion+transmission.">Alphaherpesvirus axon-to-cell spread involves limited virion transmission.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. , (2012).</li><li>Kobiler, O., Brodersen, P., Taylor, M. P., Ludmir, E. B., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Herpesvirus+replication+compartments+originate+with+single+incoming+viral+genomes.">Herpesvirus replication compartments originate with single incoming viral genomes.</a> mBio. 2 (6), (2011).</li><li>Shaner, N. C., Steinbach, P. A., Tsien, R. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+guide+to+choosing+fluorescent+proteins.">A guide to choosing fluorescent proteins.</a> Nature Methods. 2 (12), 905-909 (2005).</li><li>Snapp, E. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescent+proteins:+a+cell+biologist's+user+guide.">Fluorescent proteins: a cell biologist's user guide.</a> Trends in Cell Biology. 19 (11), 649-655 (2009).</li><li>Ch'ng, T. H., Flood, E. A., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Culturing+primary+and+transformed+neuronal+cells+for+studying+pseudorabies+virus+infection.">Culturing primary and transformed neuronal cells for studying pseudorabies virus infection.</a> Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). , 292-299 (2005).</li><li>Curanovic, D., Ch'ng, T. H., Szpara, M., Enquist, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Compartmented+neuron+cultures+for+directional+infection+by+alpha+herpesviruses.">Compartmented neuron cultures for directional infection by alpha herpesviruses.</a> Current protocols in cell biology. Chapter 26 (Unit 26.4), (2009).</li><li>Zareen, N., Greene, L. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protocol+for+culturing+sympathetic+neurons+from+rat+superior+cervical+ganglia+(SCG).">Protocol for culturing sympathetic neurons from rat superior cervical ganglia (SCG).</a> J. Vis. Exp. (23), e988 (2009).</li><li>Ch'ng, T. H., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neuron-to-Cell+Spread+of+Pseudorabies+Virus+in+a+Compartmented+Neuronal+Culture+System.">Neuron-to-Cell Spread of Pseudorabies Virus in a Compartmented Neuronal Culture System.</a> Journal of Virology. 79 (17), 10875-10889 (2005).</li><li>Campenot, R. B., Lund, K., Mok, S. -. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Production+of+compartmented+cultures+of+rat+sympathetic+neurons.">Production of compartmented cultures of rat sympathetic neurons.</a> Nature Protocols. 4 (12), 1869-1887 (2009).</li><li>Kramer, T., Greco, T. M., Taylor, M. P., Ambrosini, A. E., Cristea, I. M., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinesin-3+Mediates+Axonal+Sorting+and+Directional+Transport+of+Alphaherpesvirus+Particles+in+Neurons.">Kinesin-3 Mediates Axonal Sorting and Directional Transport of Alphaherpesvirus Particles in Neurons.</a> Cell Host &amp; Microbe. 12 (6), 806-814 (2012).</li><li>Smith, G. A., Gross, S. P., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Herpesviruses+use+bidirectional+fast-axonal+transport+to+spread+in+sensory+neurons.">Herpesviruses use bidirectional fast-axonal transport to spread in sensory neurons.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 98 (6), 3466 (2001).</li><li>Kramer, T., Enquist, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alphaherpesvirus+Infection+Disrupts+Mitochondrial+Transport+in+Neurons.">Alphaherpesvirus Infection Disrupts Mitochondrial Transport in Neurons.</a> Cell Host &amp; Microbe. 11 (5), 504-514 (2012).</li><li>Swedlow, J. R., Platani, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Live+cell+imaging+using+wide-field+microscopy+and+deconvolution.">Live cell imaging using wide-field microscopy and deconvolution.</a> Cell Structure and Function. 27 (5), 335-341 (2002).</li><li>Kaech, S., Huang, C. F., Banker, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Short-Term+High-Resolution+Imaging+of+Developing+Hippocampal+Neurons+in+Culture.">Short-Term High-Resolution Imaging of Developing Hippocampal Neurons in Culture.</a> Cold Spring Harbor Protocols. 2012 (3), (2012).</li><li>Frigault, M. M., Lacoste, J., Swift, J. L., Brown, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Live-cell+microscopy+-+tips+and+tools.">Live-cell microscopy - tips and tools.</a> Journal of Cell Science. 122 (6), 753-767 (2009).</li></ol>

Biz ifşa hiçbir şey yok.

Bu gözlem eylemi ile önemli değişiklik olmadan ortaya gibi canlı hücre görüntüleme amacı biyolojik süreçleri izlemektedir. Çevre kontrolü, görüntüleme hızı ve floresan aydınlatma: Bu amaç, üç değişken optimize ederek elde edilir. Bu arası bağımlı değişkenler uygun görüntüleme koşulları elde etmek için dengeli olmalıdır. Sunulan protokol temsili sonuçlar üretmek için özel koşullar kullanmaktadır. Biz kısaca sunulan özel yöntemler ayrıntılarına geçmeden önce çevresel k...

Alphaherpes herpes simpleks virüsü gibi virüsler (HSV) -1, -2, ve pseudorabies virüs periferik sinir sistemi (PNS) enfeksiyon (PRV) viral yaşam döngüsü boyunca çeşitli karmaşık ve oldukça düzenli bir adımdan oluşur. PNS nöronlar içinde Ulaştırma primer viral enfeksiyon ve sonraki arası ana yayılma hem de olaylar sırasında önemlidir. Viral yaşam döngüsü iki bileşeni modüle moleküler mekanizmalar; uzak akson (ileriye taşıma) ve duyarlı hücreleri (ileriye yayılması) için virionlar sonraki iletim içinde hücre organlarından viral meclislerin yönettiği taşıma anlayışı herpes patogenezinde için önemlidir. Nöronlarda viral parçacıkların taşıma ve çıkış olgun bir bulaşıcı virion 1,2 montajı bağlıdır. Immünofloresan (eğer varsa) ve elektron mikroskopisi (EM) dahil olmak üzere, daha önceden belirlenmiş deneyleri, parçacık montaj durumu ve prot incelemek için kullanılmıştırein etkileşimleri virion ulaşım ve yayılması 3-6 ile ilişkilidir. Ancak kimyasal sabitleme tarafından tanıtıldı taşıma virionların ve deneysel eserler dinamik yapısı sabit görüntülerin 7,8 yorumlanması eleştirilmiştir. Son zamanlarda, viral floresan füzyon proteinleri bir dizi protein fonksiyonu üzerinde ihmal edilebilir etkilere sahip HSV ve PRV için tarif edilmiştir. Kapsid, zar ve glikoprotein 9-11: Yeşil floresan proteini (GFP) ve Kırmızı floresan proteinleri (mCherry veya MRFP) fluorophores genellikle olgun bir virionun üç yapısal bileşenlerinin iki görüntüleme sağlamak için eşleştirilmiş. Çift etiketli virüs kullanarak ileriye taşıma hücre görüntüleme Canlı taşıma sırasında viral parçacıkların montaj durumunu görüntüler. Viral suşlar ifade Benzer florofor sayısı ve yayılma 12,13 aşağıdaki viral genomların çeşitliliği görselleştirmek için kullanılır. Floresan proteinleri özellikleri (14,15 gözden) büyük ölçüde etkileyebilirviral veya cep meclisleri görselleştirmek için yeteneği. Yabani tip işlevselliği korunması için yeni bir protein füzyonları, tasarımı ve test kendi kendine etkileşimleri ve kararlılığı dahil floresan protein içsel özellikleri, dikkate alınmalıdır. Floresan proteini füzyon, iki in vitro hücre kültürü sistemlerinde iyi karakterize ile birlikte herpes virüsü enfeksiyonu canlı hücre görüntüleme için kullanılır: ayrışmış 16 ve 17 (Şekil 1A) sıçan üstün servikal ganglion (SCG) nöronlar bölümlere. Her iki sistemde de, embriyonik SCG en tek hücre gövdeleri için ayrışmış, disseke edilir ve in vitro kültür 18 için kaplama. SCG nöronlar otonom sinir sisteminin bir parçasıdır ve kolayca olgun bir polarize devlet ex vivo olarak kültür ve nöronal büyüme faktörü (NGF) ile ayırt edilebilir. Ayrışmış SCG nöronlar f sağlayan akson uzun bir ağ oluşturmakya da anterograd ulaşım 6 geçmesi gibi viral parçacıkların görselleştirme. Bölümlere SCG kültürler nöronal hücre gövdesi (S bölmesi) ve distal akson Termini (N bölmesi) 19 akışkan izolasyonu sağlar. Orijinal 20 veya modifiye Campenot odaları 17 ile bölümlere nöronların yapımı ve kullanımı için ayrıntılı protokoller bir dizi daha önce yayınlanmıştır. Akışkan izolasyon nöronal hücre gövdeleri ve izole akson Termini ulaşım sonra döl virionlar tespit seçici enfeksiyonu için izin verir. Enfeksiyon öncesi termini üzerinde epitel hücreleri kaplama viral enfeksiyonun yayılması için alıcı hücreler içerir. Orada tüm canlı hücre görüntüleme deney için önemli birçok temel unsurlardır, ama bizim protokoller için en uygun olan: otomatik görüntü elde etme, floresan aydınlatma, görüntüleme hızı ve çevre kontrolü. Tüm görüntüleme deneyleri için, kullandığımızters, otomatik, Epifloresans aydınlatma mikroskobu (Şekil 1B). Mikroskop Nikon Eclipse Ti tabanı etrafında inşa ve hızlı bir şekilde yeniden otomatik görüntü alımı sırasında mikroskop için bilgisayar kontrollü motorlu sistemleri bir dizi istihdam etmektedir. Floresan aydınlatma için, aydınlatma yol boyunca nötral yoğunluk filtreleri ile zayıflatılmış olabilir geniş spektrumlu cıva ark lambası kullanın. Tahrik olma filtreleri floresan aydınlatma spektrum sınırlamak ve çok geçişli çift renkli aynalar ve floresan emisyon filtreleri özel floresan bileşikler görselleştirmek ile eşleştirilmiş. Uyarma ve emisyon filtreleri farklı floresan kanalların hızlı sıralı satın sağlamak için bağımsız, hızlı geçiş filtresi tekerlekler monte edilmiştir. Görüntü elde etme hızını daha düşük yoğunluklu sinyal ve kısa görüntü kez okundu tespiti için yararlı bir hassas ve hızlı EM-CCD kamera, ile geliştirilmiştir. Microsc üzerinde çevresel kontrolyerdir kuluçka ısıtılmış bir aşamada üst ve nemlendirilmiş bir CO2 ile zenginleştirilmiş bir atmosfer inkübatör içine geçirilir ise yüksek ısılarda örnekleri korumak için bir objektif lens ısıtıcı ile elde edilir. Mikroskop yakın 25 kadar muhafaza ortam sıcaklığı ile karanlık bir odada tutulur ° C ve tüm pencereler karartma perdeleri ile minimize dış ışık. Aşağıdaki protokoller ileriye taşıma ve yayılması deneyleri için bu sistemin kullanımını tarif eder. Alternatif bir dizi canlı hücre görüntüleme değişkenleri kontrol etmek için var. Mikroskopi ayarları kontrol elle ya da özel bir yazılım bağımlı otomatik sistemleri ile yapılabilir. Floresan aydınlatma, halojen, LED veya lazer kaynağı ile elde edilebilir. Görüntüleme hızı filtre anahtarlama hızını ve eşleştirilmiş algılama sistemi ile sinyal görselleştirmek için zaman değiştirilir. Çevre kontrolü mi üzerindeki özel donanım ile elde edilebilircroscope sahne, tamamını veya bir ısıtmalı ve nemlendirilmiş kutusuna mikroskop bir parçası, ya da mikroskop yapılacaktır oda sıcaklığı yükseltmek yoluyla bir muhafaza. Bu alternatiflerin her biri maliyet ve performans ile ilgili avantajları ve dezavantajları vardır. Sonraki protokol, detay rekombinant viral suşlar aracılığıyla hızlı ileriye taşıma ve alphaherpes virüslerin ileriye yayılmasını incelemek için canlı hücre görüntüleme kullanımı. Gerçek zamanlı canlı hücre görüntüleme kapsid, zar ve / veya akson 11 içinde ulaşım geçiren dinamik yapılara glikoprotein co-lokalizasyon görüntüler. Bölümlere nöronal kültürlerin bir gecede timelapse görüntüleme duyarlı hücrelerin 12 aksonal virionu çıkış ve enfeksiyon görüntüler. Burada sunulan protokolleri bizim özellikle görüntüleme sistemi ile kullanım için optimize edilmiş, ancak canlı hücre görüntüleme dört elementin göre geniş anlamda sunulmuştur. TartışmasındaDaha fazla ayrıntı deney başarılı için gerekli olan optimizasyon bazı olacaktır.

<table border="1">
 <tbody>
 <tr>
 <td>Name</td>
 <td>Company</td>
 <td>Catalogue number</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>35 mm glass bottom culture dish</td>
 <td>MatTek Corporation; Ashland, MA </td>
 <td>P35G-1.5-20-C</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>35 mm &mu;-Dish </td>
 <td>Ibidi USA LLC, Verona, WI </td>
 <td>81156</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Microscope body </td>
 <td>Nikon Instruments Inc. </td>
 <td>Nikon Eclipse Ti</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Motorized microscope X-Y stage</td>
 <td>Prior Scientific; Rockland, MA </td>
 <td>H117 ProScan Flat Top</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Motorized filter wheels</td>
 <td>Prior Scientific</td>
 <td>HF110 10 position filter wheel</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Fluorescent illumination source </td>
 <td>Lumen Dynamics; Mississauga, Ontario Canada </td>
 <td>X-Cite 120Q </td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Multi-band Fluorescence filter sets</td>
 <td>Chroma Technology Corp.; Bellows Falls, VT</td>
 <td>89000 Sedat Quad - ET 89006 ECFP/EYFP/mCherry - ET</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>EM-CCD camera</td>
 <td>Andor Technology USA; South Windsor, CT</td>
 <td>iXon3 897 </td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Chamlide stage top environmental incubator</td>
 <td>Live Cell Instruments; Seoul, South Korea</td>
 <td>TC-L-10</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Objective lens heater</td>
 <td>Bioptecs; Butler, PA</td>
 <td>150803 Controller 150819-12-08 Heater</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Analysis software</td>
 <td>Nikon Instruments Inc.; Melville, NY</td>
 <td>NIS Elements </td>
 </tr>
 </tbody>
</table>

live cell imaging of alphaherpes virus anterograde transport and spread

Canlı hücre floresan mikroskopi teknikleri, hem de floresan füzyon proteinleri ifade rekombinant viral suşlar yapımında gelişmeler taşıma ve nöron alphaherpes virüs enfeksiyonunun yayılmasını gerçek zamanlı görsel sağladı. Canlı hücre görüntüleme ile birlikte viral membran, zar ve capsids için yeni floresan füzyon proteinlerin programı, akson içinde ulaşım geçiren viral partikül meclisleri tespit. Benzer araçları başarıyla hücreler arasında iletilen virionlann sayısı ve çeşitliliği ölçmek için viral parçacıkların yayılması, hücre-hücre analizi için kullanılmıştır. Önemlisi, anterograd ulaşım ve yayılma canlı hücre görüntüleme teknikleri parçacık taşıma hızları, parçacıkların dağılımları, ve protein yerelleştirme zamansal analizleri de dahil olmak üzere bilgi hazinesi üretmek. Klasik viral genetik teknikleri yanı sıra, bu yöntem kritik bilgiler sağladıönemli mekanik soruları. Bu yazıda ayrıntılı olarak alphaherpes virüs taşıma ve yayılmasının temel sorulara cevap için geliştirilmiştir görüntüleme yöntemleri açıklar.

Anterograd Taşıma PRV 348 ile ayrışmış SCG kültürlerin enfeksiyonlara Bu protokolün uygulama, GFP-US9 ve gM-mCherry membran füzyon proteinleri ifade eden bir rekombinant PRV gerginlik, virionlar anterograd taşıma (Şekil 3 ve Ek Film 4) ve görselleştirme kolaylaştırmıştır. Puncta taşıma kendi algılama viral parçacıkların sonuçları ve söz konusu görüntüleme koşulları bu füzyon proteinlerin Ortaklığın filtre geçiş sırasınd...

Watch this Scientific Journal Video about Live Cell Imaging of Alphaherpes Virus Anterograde Transport and Spread at JoVE.com

Live Cell Imaging of Alphaherpes Virus Anterograde Transport and Spread

Alphaherpes virüs enfeksiyonlarının Canlı hücre görüntüleme yönelik ulaşım ve hücreler arası yayılma dinamik olayların analizi sağlar. Burada, birincil nöronların enfeksiyon sırasında viral meclislerinin görselleştirme kolaylaştırmak için floresan füzyon proteinleri ifade rekombinant viral suşlar kullanmak yöntemleri sunuyoruz.

Alphaherpes Virüs İleriye Taşıma ve Değişken Canlı Hücre Görüntüleme

Advances in live cell fluorescence microscopy  techniques, as well as the construction of recombinant viral strains that  express fluorescent fusion ...

live-cell-imaging-alphaherpes-virus-anterograde-transport

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

11.0K Görüntüleme.  Montana State University. Alphaherpes virüs enfeksiyonlarının Canlı hücre görüntüleme yönelik ulaşım ve hücreler arası yayılma dinamik olayların analizi sağlar. Burada, birincil nöronların enfeksiyon sırasında viral meclislerinin görselleştirme kolaylaştırmak için floresan füzyon proteinleri ifade rekombinant viral suşlar kullanmak yöntemleri sunuyoruz.

Video: Live Cell Imaging of Alphaherpes Virus Anterograde Transport and Spread

Use of an Optical Trap for Study of Host-Pathogen Interactions for Dynamic Live Cell Imaging

Dynamic live cell imaging allows direct visualization of real-time interactions between cells of the immune system1, 2; however, the lack of spatial and temporal control between the phagocytic cell and microbe has rendered focused observations into the initial interactions of host response to pathogens difficult. Historically, intercellular contact events such as phagocytosis3 have been imaged by mixing two cell types, and then continuously scanning the field-of-view to find serendipitous intercellular contacts at the appropriate stage of interaction. The stochastic nature of these events renders this process tedious, and it is difficult to observe early or fleeting events in cell-cell contact by this approach. This method requires finding cell pairs that are on the verge of contact, and observing them until they consummate their contact, or do not. To address these limitations, we use optical trapping as a non-invasive, non-destructive, but fast and effective method to position cells in culture.
Optical traps, or optical tweezers, are increasingly utilized in biological research to capture and physically manipulate cells and other micron-sized particles in three dimensions4. Radiation pressure was first observed and applied to optical tweezer systems in 19705, 6, and was first used to control biological specimens in 19877. Since then, optical tweezers have matured into a technology to probe a variety of biological phenomena8-13.
We describe a method14 that advances live cell imaging by integrating an optical trap with spinning disk confocal microscopy with temperature and humidity control to provide exquisite spatial and temporal control of pathogenic organisms in a physiological environment to facilitate interactions with host cells, as determined by the operator. Live, pathogenic organisms like Candida albicans and Aspergillus fumigatus, which can cause potentially lethal, invasive infections in immunocompromised individuals15, 16 (e.g. AIDS, chemotherapy, and organ transplantation patients), were optically trapped using non-destructive laser intensities and moved adjacent to macrophages, which can phagocytose the pathogen. High resolution, transmitted light and fluorescence-based movies established the ability to observe early events of phagocytosis in living cells. To demonstrate the broad applicability in immunology, primary T-cells were also trapped and manipulated to form synapses with anti-CD3 coated microspheres in vivo, and time-lapse imaging of synapse formation was also obtained. By providing a method to exert fine spatial control of live pathogens with respect to immune cells, cellular interactions can be captured by fluorescence microscopy with minimal perturbation to cells and can yield powerful insight into early responses of innate and adaptive immunity.

A method is described to individually select, manipulate, and image live pathogens using an optical trap coupled to a spinning disk microscope. The optical trap provides spatial and temporal control of organisms and places them adjacent to host cells. Fluorescence microscopy captures dynamic intercellular interactions with minimal perturbation to cells.

Dinamik Canlı Hücre Görüntüleme Konukçu-Patojen Etkileşimleri Çalışma Optik Tuzak

Dynamic live cell imaging allows direct visualization of real-time interactions between cells of the immune system1, 2; however, the lack of spatial and ...

İmmünoloji ve Enfeksiyon

Live Cell Imaging of Bacillus subtilis and Streptococcus pneumoniae using Automated Time-lapse Microscopy

During the last few years scientists became increasingly aware that average data obtained from microbial population based experiments are not representative of the behavior, status or phenotype of single cells. Due to this new insight the number of single cell studies rises continuously (for recent reviews see 1,2,3). However, many of the single cell techniques applied do not allow monitoring the development and behavior of one specific single cell in time (e.g. flow cytometry or standard microscopy).
Here, we provide a detailed description of a microscopy method used in several recent studies 4, 5, 6, 7, which allows following and recording (fluorescence of) individual bacterial cells of Bacillus subtilis and Streptococcus pneumoniae through growth and division for many generations. The resulting movies can be used to construct phylogenetic lineage trees by tracing back the history of a single cell within a population that originated from one common ancestor. This time-lapse fluorescence microscopy method cannot only be used to investigate growth, division and differentiation of individual cells, but also to analyze the effect of cell history and ancestry on specific cellular behavior. Furthermore, time-lapse microscopy is ideally suited to examine gene expression dynamics and protein localization during the bacterial cell cycle. The method explains how to prepare the bacterial cells and construct the microscope slide to enable the outgrowth of single cells into a microcolony. In short, single cells are spotted on a semi-solid surface consisting of growth medium supplemented with agarose on which they grow and divide under a fluorescence microscope within a temperature controlled environmental chamber. Images are captured at specific intervals and are later analyzed using the open source software ImageJ.

Live Cell Imaging of Bacillus subtilis and Streptococcus pneumoniae using Automated Time-lapse Microscopy

This protocol provides a step-by-step procedure to monitor single cell behavior of different bacteria in time using automated fluorescence time-lapse microscopy. Furthermore, we provide guidelines how to analyze the microscopy images.

Canlı Hücre Görüntüleme Bacillus subtilis Ve Streptococcus pneumoniae Otomatik Zaman atlamalı Mikroskopi

During the last few years scientists became increasingly aware that average data obtained from microbial population based experiments are not ...

Real-time Live Imaging of T-cell Signaling Complex Formation

Protection against infectious diseases is mediated by the immune system 1,2. T lymphocytes are the master coordinators of the immune system, regulating the activation and responses of multiple immune cells 3,4. T-cell activation is dependent on the recognition of specific antigens displayed by antigen presenting cells (APCs). The T-cell antigen receptor (TCR) is specific to each T-cell clone and determines antigen specificity 5. The binding of the TCR to the antigen induces the phosphorylation of components of the TCR complex. In order to promote T-cell activation, this signal must be transduced from the membrane to the cytoplasm and the nucleus, initiating various crucial responses such as recruitment of signaling proteins to the TCR;APC site (the immune synapse), their molecular activation, cytoskeletal rearrangement, elevation of intracellular calcium concentration, and changes in gene expression 6,7. The correct initiation and termination of activating signals is crucial for appropriate T-cell responses. The activity of signaling proteins is dependent on the formation and termination of protein-protein interactions, post translational modifications such as protein phosphorylation, formation of protein complexes, protein ubiquitylation and the recruitment of proteins to various cellular sites 8. Understanding the inner workings of the T-cell activation process is crucial for both immunological research and clinical applications.
Various assays have been developed in order to investigate protein-protein interactions; however, biochemical assays, such as the widely used co-immunoprecipitation method, do not allow protein location to be discerned, thus precluding the observation of valuable insights into the dynamics of cellular mechanisms. Additionally, these bulk assays usually combine proteins from many different cells that might be at different stages of the investigated cellular process. This can have a detrimental effect on temporal resolution. The use of real-time imaging of live cells allows both the spatial tracking of proteins and the ability to temporally distinguish between signaling events, thus shedding light on the dynamics of the process 9,10. We present a method of real-time imaging of signaling-complex formation during T-cell activation. Primary T-cells or T-cell lines, such as Jurkat, are transfected with plasmids encoding for proteins of interest fused to monomeric fluorescent proteins, preventing non-physiological oligomerization 11. Live T cells are dropped over a coverslip pre-coated with T-cell activating antibody 8,9, which binds to the CD3/TCR complex, inducing T-cell activation while overcoming the need for specific activating antigens. Activated cells are constantly imaged with the use of confocal microscopy. Imaging data are analyzed to yield quantitative results, such as the colocalization coefficient of the signaling proteins.

We describe a live-cell imaging method that provides insight into protein dynamics during the T-cell activation process. We demonstrate the combined usage of the T-cell spreading assay, confocal microscopy and imaging analysis to yield quantitative results to follow signaling complex formation throughout T-cell activation.

T hücre gerçek zamanlı Canlı Görüntüleme Kompleks Oluşum Sinyal

Protection against infectious diseases is mediated by the immune system 1,2. T lymphocytes are the master coordinators of the immune system, regulating ...

Neutrophil Isolation and Analysis to Determine their Role in Lymphoma Cell Sensitivity to Therapeutic Agents

Neutrophils are the most abundant (40% to 75%) type of white blood cells and among the first inflammatory cells to migrate towards the site of inflammation. They are key players in the innate immune system and play major roles in cancer biology. Neutrophils have been proposed as key mediators of malignant transformation, tumor progression, angiogenesis and in the modulation of the antitumor immunity; through their release of soluble factors or their interaction with tumor cells. To characterize the specific functions of neutrophils, a fast and reliable method is coveted for in vitro isolation of neutrophils from human blood. Here, a density gradient separation method is demonstrated to isolate neutrophils as well as mononuclear cells from the blood. The procedure consists of layering the density gradient solution such as Ficoll carefully above the diluted blood obtained from patients diagnosed with chronic lymphocytic leukemia (CLL), followed by centrifugation, isolation of mononuclear layer, separation of neutrophils from RBCsby dextran then lysis of residual erythrocytes. This method has been shown to isolate neutrophils &#8805; 90 % pure. To mimic the tumor microenvironment, 3-dimensional (3D) experiments were performed using basement membrane matrix such as Matrigel. Given the short half-life of neutrophils in vitro, 3D experiments with fresh human neutrophils cannot be performed. For this reason promyelocytic HL60 cells are differentiated along the granulocytic pathway using the differentiation inducers dimethyl sulfoxide (DMSO) and retinoic acid (RA). The aim of our experiments is to study the role of neutrophils on the sensitivity of lymphoma cells to anti-lymphoma agents. However these methods can be generalized to study the interactions of neutrophils or neutrophil-like cells with a large range of cell types in different situations.

Neutrophils are the most abundant type of white blood cells. The isolation of neutrophils from human blood by density gradient separation method and the differentiation of human promyelocytic (HL60) cells along the granulocytic pathway are described here; to test their role on sensitivity of lymphoma cells to anti-lymphoma agents.

Nötrofil İzolasyon ve Analiz Terapötik Ajanların için Lenfoma Hücre Duyarlılık kendi Rolü belirleme

Neutrophils are the most abundant (40% to 75%) type of white blood cells and among the first inflammatory cells to migrate towards the site of ...

Evaluation of the Efficacy And Toxicity of RNAs Targeting HIV-1 Production for Use in Gene or Drug Therapy

Small RNA therapies targeting post-integration steps in the HIV-1 replication cycle are among the top candidates for gene therapy and have the potential to be used as drug therapies for HIV-1 infection. Post-integration inhibitors include ribozymes, short hairpin (sh) RNAs, small interfering (si) RNAs, U1 interference (U1i) RNAs and RNA aptamers. Many of these have been identified using transient co-transfection assays with an HIV-1 expression plasmid and some have advanced to clinical trials. In addition to measures of efficacy, small RNAs have been evaluated for their potential to affect the expression of human RNAs, alter cell growth and/or differentiation, and elicit innate immune responses. In the protocols described here, a set of transient transfection assays designed to evaluate the efficacy and toxicity of RNA molecules targeting post-integration steps in the HIV-1 replication cycle are described. We have used these assays to identify new ribozymes and optimize the format of shRNAs and siRNAs targeting HIV-1 RNA. The methods provide a quick set of assays that are useful for screening new anti-HIV-1 RNAs and could be adapted to screen other post-integration inhibitors of HIV-1 replication.

Methods to evaluate the efficacy and toxicity of RNA molecules targeting post-integration steps of the HIV-1 replication cycle are described. These methods are useful for screening new molecules and optimizing the format of existing ones.

Bir gen ya da ilaç terapisinde kullanım için, HIV-1 üretim yapan RNA&#39;lar etkinlik ve toksisite Değerlendirilmesi

Small RNA therapies targeting post-integration steps in the HIV-1 replication cycle are among the top candidates for gene therapy and have the potential ...

Imaging Cell Interaction in Tracheal Mucosa During Influenza Virus Infection Using Two-photon Intravital Microscopy

The analysis of cell-cell or cell-pathogen interaction in vivo is an important tool to understand the dynamics of the immune response to infection. Two-photon intravital microscopy (2P-IVM) allows the observation of cell interactions in deep tissue in living animals, while minimizing the photobleaching generated during image acquisition. To date, different models for 2P-IVM of lymphoid and non-lymphoid organs have been described. However, imaging of respiratory organs remains a challenge due to the movement associated with the breathing cycle of the animal.
Here, we describe a protocol to visualize in vivo immune cell interactions in the trachea of mice infected with influenza virus using 2P-IVM. To this purpose, we developed a custom imaging platform, which included the surgical exposure and intubation of the trachea, followed by the acquisition of dynamic images of neutrophils and dendritic cells (DC) in the mucosal epithelium. Additionally, we detailed the steps needed to perform influenza intranasal infection and flow cytometric analysis of immune cells in the trachea. Finally, we analyzed neutrophil and DC motility as well as their interactions during the course of a movie. This protocol allows for the generation of stable and bright 4D images necessary for the assessment of cell-cell interactions in the trachea.

In this study, we present a protocol to perform two-photon intravital imaging and cell interaction analysis in the murine tracheal mucosa after infection with influenza virus. This protocol will be relevant for researchers studying immune cell dynamics during respiratory infections.

İki fotonlu Intravital mikroskobu kullanılarak grip virüsü enfeksiyonu sırasında trakeal mukozasında görüntüleme hücre etkileşimi

The analysis of cell-cell or cell-pathogen interaction in vivo is an important tool to understand the dynamics of the immune response to infection. ...

In Vitro ELISA Test to Evaluate Rabies Vaccine Potency

The growing global concern for the animal welfare is encouraging manufacturers and the National Control Laboratories (OMCLs) to follow the 3Rs strategy for the Replacement, Reduction, and Refinement of the laboratory animal testing. The development of in vitro approaches is recommended at the WHO and European levels as alternatives to the NIH test for evaluating the rabies vaccine potency. At the surface of the rabies virus (RABV) particle, trimers of glycoprotein constitute the major immunogen to induce Viral Neutralizing Antibodies (VNAbs). An ELISA test, where Neutralizing Monoclonal Antibodies (mAb-D1) recognize the trimeric form of the glycoprotein, has been developed to determine the contents of the native folded trimeric glycoprotein along with the production of the vaccine batches. This in vitro potency test demonstrated a good concordance with the NIH test and has been found suitable in collaborative trials by RABV vaccine manufacturers and OMCLs. Avoidance of animal use is an achievable objective in the near future.
The method presented is based on an indirect ELISA sandwich immunocapture using the mAb-D1 which recognizes the antigenic sites III (aa 330 to 338) of the trimeric RABV glycoprotein, i.e., the immunogenic RABV antigen. mAb-D1 is used for both coating and detection of glycoprotein trimers present in the vaccine batch. Since the epitope is recognized because of its conformational properties, the potentially denatured glycoprotein (less immunogenic) cannot be captured and detected by the mAb-D1. The vaccine to be tested is incubated in a plate sensitized with the mAb-D1. Bound trimeric RABV glycoproteins are identified by adding the mAb-D1 again, labeled with peroxidase and then revealed in the presence of substrate and chromogen. Comparison of the absorbance measured for the tested vaccine and the reference vaccine allows for the determination of the immunogenic glycoprotein content.

Here we describe an indirect ELISA sandwich immunocapture to determine the immunogenic glycoprotein contents in rabies vaccines. This test uses a neutralizing Monoclonal Antibody (mAb-D1) recognizing glycoprotein trimers. It is an alternative to the in vivo NIH test to follow the consistency of vaccine potency during production.

In Vitro ELISA Testi Kuduz Aşısı Potens Değerlendirmek için

The growing global concern for the animal welfare is encouraging manufacturers and the National Control Laboratories (OMCLs) to follow the 3Rs strategy ...

A Luciferase-fluorescent Reporter Influenza Virus for Live Imaging and Quantification of Viral Infection

Influenza A viruses (IAVs) cause human respiratory disease that is associated with significant health and economic consequences. As with other viruses, studying IAV requires the use of laborious secondary approaches to detect the presence of the virus in infected cells and/or in animal models of infection. This limitation has been recently circumvented with the generation of recombinant IAVs expressing easily traceable fluorescent or bioluminescent (luciferase) reporter proteins. However, researchers have been forced to select fluorescent or luciferase reporter genes due to the restricted capacity of the IAV genome for including foreign sequences. To overcome this limitation, we have generated a recombinant replication-competent bi-reporter IAV (BIRFLU) stably expressing both a fluorescent and a luciferase reporter gene to easily track IAV infections in vitro and in vivo. To this end, the viral non-structural (NS) and hemagglutinin (HA) viral segments of influenza A/Puerto Rico/8/34 H1N1 (PR8) were modified to encode the fluorescent Venus and the bioluminescent Nanoluc luciferase proteins, respectively. Here, we describe the use of BIRFLU in a mouse model of IAV infection and the detection of both reporter genes using an in vivo imaging system. Notably, we have observed a good correlation between the expressions of both reporters and viral replication. The combination of cutting-edge techniques in molecular biology, animal research and imaging technologies, provides researchers the unique opportunity to use this tool for influenza research, including the study of virus-host interactions and dynamics of viral infections. Importantly, the feasibility to genetically alter the viral genome to express two foreign genes from different viral segments opens up opportunities to use this approach for: (i) the development of novel IAV vaccines, (ii) the generation of recombinant IAVs that can be used as vaccine vectors for the treatment of other human pathogen infections.

Influenza A viruses (IAVs) are contagious respiratory pathogens that cause annual epidemics and occasional pandemics. Here, we describe a protocol to track viral infections in vivo using a novel recombinant luciferase and fluorescence-expressing bi-reporter IAV (BIRFLU). This approach provides researchers with an excellent tool to study IAV in vivo.

Canlı Görüntüleme ve Viral Enfeksiyon Quantification için Bir Luciferase-floresan Reporter Grip Virüsü

Influenza A viruses (IAVs) cause human respiratory disease that is associated with significant health and economic consequences. As with other viruses, ...

Intravital Widefield Fluorescence Microscopy of Pulmonary Microcirculation in Experimental Acute Lung Injury Using a Vacuum-Stabilized Imaging System

Intravital imaging of leukocyte-endothelial interactions offers valuable insights into immune-mediated disease in live animals. The study of acute lung injury (ALI)/acute respiratory distress syndrome (ARDS) and other respiratory pathologies in vivo is difficult due to the limited accessibility and inherent motion artifacts of the lungs. Nonetheless, various approaches have been developed to overcome these challenges. This protocol describes a method for intravital fluorescence microscopy to study real-time leukocyte-endothelial interactions in the pulmonary microcirculation in an experimental model of ALI. An in vivo lung imaging system and 3-D printed intravital microscopy platform are used to secure the anesthetized mouse and stabilize the lung while minimizing confounding lung injury. Following preparation, widefield fluorescence microscopy is used to study leukocyte adhesion, leukocyte rolling, and capillary function. While the protocol presented here focuses on imaging in an acute model of inflammatory lung disease, it may also be adapted to study other pathological and physiological processes in the lung.

Intravital fluorescence microscopy can be utilized to study leukocyte-endothelial interactions and capillary perfusion in real-time. This protocol describes methods to image and quantify these parameters in the pulmonary microcirculation using a vacuum-stabilized lung imaging system.

Vakumla Stabilize Edilmiş Bir Görüntüleme Sistemi Kullanılarak Deneysel Akut Akciğer Hasarında Pulmoner Mikrosirkülasyonun İntravital Geniş Alan Floresan Mikroskopisi

Intravital imaging of leukocyte-endothelial interactions offers valuable insights into immune-mediated disease in live animals. The study of acute lung ...

Fare Submandibular Bez Rejenerasyonunun Gerçek Zamanlı Canlı Görüntülenmesi

Interrogating Cell-Cell Interactions in the Salivary Gland via Ex Vivo Live Cell Imaging

Salivary gland regeneration is a complex process involving intricate interactions among various cell types. Recent studies have shed light on the pivotal role played by macrophages in driving the regenerative response. However, our understanding of this critical role has primarily relied on static views obtained from fixed tissue biopsies. To overcome this limitation and gain insights into these interactions in real time, this study outlines a comprehensive protocol for culturing salivary gland tissue ex vivo and capturing live images of cell migration.
The protocol involves several key steps: First, mouse submandibular salivary gland tissue is carefully sliced using a vibratome and then cultured at an air-liquid interface. These slices can be intentionally injured, for instance, through exposure to radiation, to induce cellular damage and trigger the regenerative response. To track specific cells of interest, they can be endogenously labeled, such as by utilizing salivary gland tissue collected from genetically modified mice where a particular protein is marked with green fluorescent protein (GFP). Alternatively, fluorescently-conjugated antibodies can be employed to stain cells expressing specific cell surface markers of interest. Once prepared, the salivary gland slices are subjected to live imaging using a high-content confocal imaging system over a duration of 12 h, with images captured at 15 min intervals. The resulting images are then compiled to create a movie, which can subsequently be analyzed to extract valuable cell behavior parameters. This innovative method provides researchers with a powerful tool to investigate and better understand macrophage interactions within the salivary gland following injury, thereby advancing our knowledge of the regenerative processes at play in this dynamic biological context.

Yazar Spotlight: Yaralanma Sonrası Tükürük Bezi Rejenerasyonunda Makrofaj-Epitel Hücre Etkileşimlerinin İncelenmesi 

Immunofluorescent imaging is constrained by the ability to observe complex, time-dependent biological processes in just a single snapshot in time. This study outlines a live-imaging approach conducted on precision-cut mouse submandibular gland slices. This approach allows for the real-time observation of cell-cell interactions during homeostasis and the processes of regeneration and repair.

Tükürük bezindeki hücre-hücre etkileşimlerinin ex vivo canlı hücre görüntüleme ile sorgulanması

Salivary gland regeneration is a complex process involving intricate interactions among various cell types. Recent studies have shed light on the pivotal ...