The author thanks Hugo Juraver-Geslin, Marion Wassef and Anne H&#233;l&#232;ne Monsoro-Burq for their help and advice, and the Animal Facility of the Institut Curie. The author thanks Paul Johnson for his editing work on the manuscript. This work was supported by the Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS UMR8197, INSERM U1024) and by grants from the "Association pour la Recherche sur le Cancer" (ARC 4972 and ARC 5115; FRC DOC20120605233 and LABEX Memolife) and the Fondation Pierre Gilles de Gennes (FPGG0039).

Deneyler bilimsel amaçlarla ve yedek, azaltılması ve arıtma uluslararası kurulan ilkeleri ile kullanılan hayvanların korunması konusunda ulusal ve Avrupa yönetmelik ile uyumlu. Xenopus 1. Düz montaj sonrası Tadpoles Anterior Sinir Tube laevis in Situ Hibridizasyon Tüm montaj <ol><li> X edinin standart prosedürler 4 ve 26 ve üzeri (Nieuwkoop ve Faber gelişimsel tabloya göre 17 neurula sahne ulaşana kadar onları yaş göre embriyolar laevis. </li><li> Fix X. % 4 paraformaldehit (PFA) içindeki bir çözeltisi içinde inkübe edilerek kurbağa yavrularını laevis. 38 embriyolar, daha sonraki aşamalarda embriyolar için oda sıcaklığında 2 saat sahne sahne 26 için, 1 saat oda sıcaklığında 1.5 Kaya ve 2 ml cam şişe embriyolar döndürün. DİKKAT: PFA temas ve şüpheli karsinojen tarafından toksiktir. Bir başlık altında manipüle edilmelidir. NOT: Bir X laevis damızlık olduğunugenellikle 2 ml&#39;lik bir cam şişe içinde sabit, ancak daha büyük bir cam şişe kullanılabilir. </li><li> Iki kez,% 0.1 Tween (PBT) ile 1x PBS kullanarak aynı şişe içinde embriyolar, oda sıcaklığında 3 dakika yıkayın. NOT: Aksi kullanılan PBS belirtmek sürece veya kalsiyum ve magnezyum olmadan. </li><li> Aynı şişe içinde oda sıcaklığında en az 12 saat süre ile 100% metanol (MeOH) içerisinde embriyolar kurutmak. Plastik mikropipet kullanarak başlık altında en az iki kez MeOH% 100 olarak değiştirin. NOT: MeOH içinde çözündürülmüş lipitlerin hafif sarı bir döner. MeOH Solunduğunda toksik ve bir başlık altında manipüle edilmelidir Dikkat. </li><li> PBS, MeOH PBS içinde% 50, iki kez PBS, PBS içinde% 25 MeOH, oda sıcaklığında her banyo 5-10 dakika içinde MeOH 75:% kademeli MeOH banyolarının dizi, aynı şişeyi kullanarak embriyolar rehidrate. MeOH çözümleri plastik mikropipet kullanarak başlık altında değiştirilir. </li><li> Plastik bir pipet kullanarak, embriyo PBT üstüne dolu bir 60 mm Petri kabındaki disseke transfer. İki ince forseps bakım kullanmaTamamen optik sapı düzeyinde, gözler ve nöral tüp arasındaki tek ince forseps takarak gözlerini çıkarın. Nöral tüp gözleri ayırın. Dikkatle nöral tüp örten ektoderm altında forseps tanıtmak. Bakım ile, başın arkasında başlayarak ektoderm soyulabilir ve atın. </li><li> Kullanarak bir çift veya tek ISH gerçekleştirme digoksigenin işaretli ya da daha önceden olarak fluoresan etiketli problar 18,19 tarif. </li><li> ISH PBT plastik pipet kullanarak üstüne dolu yeni bir 60 mm Petri kabındaki embriyoların transferi sonrasında. </li><li> Ince forseps kullanarak dikkatlice embriyo geri kalanından nöral tüp ayırın. Bu aşamada, ön nöral tüp posterior nöral tüp ayırır. Dikkatle nöral tüp, gevşek nöral tüp, otik veziküller ve mezodermin kalan parçaları aşağıda bağlı olduğu Notokordun örten ektoderm kalan kısımlarını ayırın. Nöral tüp herhangi ekler yoksun olduğundan emin olunbu aşamada. NOT: Gerekirse ucunda bir uç kesim ile plastik transfer pipet yardımıyla tüm nöral tüp / embriyo transferi veya bir mikropipet gerçekleştirmek nöral tüp zarar görmesini önlemek için. Burun ucunun çapı nöral tüpün büyüklüğü ayarlanır. </li><li> Parçalara nöral tüp transfer PBS içinde seyreltilmiş 50% gliserol ile doldurulmuş, 1.5 ml bir tüp içinde (not adım 1.9). Nöral borular gliserol çözeltisi altına düşene kadar 4 ° C &#39;de, genellikle O / N, dur. </li><li> % 50 gliserol çözeltisi kaldır / PBS mikropipet P1000 ile aynı 1.5 ml tüp içinde bir mikropipet P1000 olarak% 90 gliserol / PBS çözeltisi ilave edilir. Nöral tüpler 4 ° C&#39;de, genellikle,% 90 gliserol / PBS çözeltisi altına O / N düşene kadar bekleyin. NOT: Uzun süreli depolama için, bakteri gelişimini önlemek için% 90 gliserol / PBS artı antibiyotik kullanımı. </li><li> Bir cam plaka, ya da bir plastik transfer pipet yardımıyla bir mikroskop lamı üzerinde sinir tüpleri aktarın. </li><li> Disdorsal ve tungsten iğneler kullanılarak ventral midlines boyunca sinir tüpleri mezhep. Bu adım sırasında sinir tüpleri% 90 gliserol / PBS tutulur. </li><li> Bir cam lamel ile kaplı takviye halkaları kullanılarak% 90 gliserol / PBS nöral tüpün iki tarafını monte edin. </li><li> Vernikle lamelleri düzeltmek ve 4 ° C&#39;de tutun. </li></ol> Anyon Değişim Reçine Boncuk kullanma 2. Hayvan Cap Eksplantlar İndüksiyon <ol><li> Mikropipet P1000 kullanılarak 2 ml tüp içine anyon değiştirici reçine boncuk 100 ul aktarın. Steril damıtılmış su ile boncuk en az beş ardışık kez yıkayın. Boncuk tüpün dibinde tortu ve mikropipet P1000 kullanılarak steril distile su yerine izin verin. Boncuk dokunmayın. </li><li> Boncuklar, 4 ° C&#39;de Sığır Serum Albumin (BSA) (10 mg / ml) ile steril damıtılmış su ile dolu bir 2 ml tüp içinde, O / N ıslatın. </li><li> İki saat yeni bir 1.5 ml komisyonlarda, boncuk yeri yarısını toplayarak öncemikropipet P1000 kullanılarak tüp. Molekülünü içeren bir maddenin 500 ul de endüktif potansiyeli için test ya da belirli bir kaderi indüklediği bilinen steril damıtılmış su değiştirin. Bir negatif kontrol olarak kullanılmak gibi, boncukların diğer yarısını tutun. </li><li> En az 2 saat süreyle 4 ° C&#39;de inkübe edin boncuklar. </li><li> Stereomicroscope altında sonraki tüm adımları uygulayın ve bir mikropipet ile tüm AC transferini gerçekleştirmek. </li><li> Plastik bir transfer pipeti kullanılarak% 0.2 BSA ile tamamlanmaktadır kalsiyum ve magnezyum ile PBS içine Blastula ya da çok erken gastrula embriyolar aktarın. NOT: Embriyolar 20 ila 24 saat içinde 12 ° C ulaşmak blastula ve gastrula aşamalarında geliştirilmesi. </li><li> Daha önce açıklandığı gibi 20 forseps kullanarak embriyonun vitellin membran çıkarın. Tek forseps ile embriyo sabitleyin. Diğer forseps tarafı vitellin membran sıkıştırın. Zarının Holding, yavaş yavaş embriyo onu sıyırın. Ven bu yordamı gerçekleştirmekEmbriyonun tral (bitkisel) taraf. Embriyonun hayvan tarafını zarar vermeyin. </li><li> Daha önce açıklandığı gibi 21 küçük komisyonlarda izole edin. Hayvan kutup embriyonun pigmentli bir parçasıdır. Kullanımı ince forseps hayvan kutup dışarı doku küçük bir kare kesip. AC dokusu sadece ektodermal hücreler içerir. Doku muntazam kalınlıkta olduğundan emin olun. Değilse, analize AC kaldırın. </li><li> Barth&#39;ın Salin (MBS) 4 Değiştirilmiş 0.5x bir Terasaki multiwell plakalarda her ac yerleştirin. Iyi yuvarlak alt ile temas halinde, aşağı pigmentli hayvan tarafı ile kuyunun içine ac yerleştirin. NOT: Bir% 0.1 BSA çözeltisi ile kaplama pipetler plastik yapışkan doku küçük parçalara yapışmasını önler. </li><li> Mikropipet P20 kullanarak her kapakta tek boncuk yerleştirin. Gerekirse, dikkatle kapağın ortasına boncuk yerleştirmek için forseps kullanabilir. NOT: klimalı ortamda batırılmış zaman boncuk pembe renklidir. En co Seçinlored boncuklar. </li><li> Terasaki oyuklu bir plaka hareket RT&#39;de 6 saat boyunca (18 22 ° C) inkübe edin. Boncuk az 2 saat ac yapışıyor. </li><li> Su ile ıslatılmış kağıt üstünde Terasaki çukurlu bir levha yerleştirin. Plastik bir kap ile plaka örtün. NOT: Bu &#39;nem odası&#39; kuyuların erken buharlaşmasını önler. </li><li> Kardeş embriyolar senin faktörün etkisini test etmek doğru aşamaya kadar Kültür 0.5x MBS veya 3/4 NAM ACs 15-20 ° C&#39;de nem odasında (adım 4.1). </li><li> Taze hazırlanmış% 4 PFA 1 saat komisyonlarda düzelt. Daha önce (Adım 1.4) açıklandığı gibi% 100 MeOH içinde komisyonlarda kurutmak. </li></ol> 3. Hayvan Cap Hücre Ayrılma ve reaggregation bir Xenopus laevis neurula içinde Aşılama önce <ol><li> Kaplama petri kaplarına (60 mm) ya da kalsiyum ve magnezyum içermeyen PBS, steril su içinde ya da% 3 agaroz ile 12 kuyucuklu plak. B karşılamak için yeterli agaroz eklepetri veya kuyunun ottom. RT (18-22 ° C) plakaları ön ısıtmak. İsteğe bağlı olarak, su kaybını önlemek için 4 ° C&#39;de birkaç gün için tabak saklı. </li><li> Hazırlama kalsiyum içermeyen Holtfreter tuz (60 mM NaCI, 0.7 mM KCI, 4.6 mM HEPES,% 0.1 BSA (A-7888 Sigma pH 7.6)) ile Holtfreter tuzlu su (60 mM NaCI, 0.7 mM KCI, 0.9 mM CaCl2, 4.6 mM HEPES,% 0.1 BSA, pH 7.6) 5. Not: CaCI2 çözeltisi Otoklava. </li><li> Agarozun kaplı Kalsiyum içermeyen Holtfreter tuzlu su ile üstüne de doldurun. </li><li> Daha önce açıklandığı gibi kendi komisyonlarda izole etmek blastula veya çok erken gastrula embriyolar hazırlayın (2.7 2.5 adımları). </li><li> En az 15 ya da 30, küçük bir ACs 21 kadar izole edin. Kullanımı ince forseps hayvan kutup dışarı doku küçük bir kare kesip. AC dokusunun sadece ektodermal hücreler içerir ve bu nedenle aynı kalınlığa sahip olan. Değilse, analize AC kaldırın. NOT: Hayvan kutup Embry olduğunuo&#39;in en pigmentli kısmı. </li><li> Bir içine komisyonlarda aktarın iyi Kalsiyum içermeyen Holtfreter tuzlu su ile üst dolu agaroz kaplı. Onların pigmentli tarafı yukarı bakacak şekilde komisyonlarda yerleştirin. NOT: ayrışma süreci kalsiyum ücretsiz Holtfreter tuzlu su içinde hızla başlar. </li><li> Hücreler dissociating başlamak için birkaç dakika bekleyin. Dokuların ayrıştırma ile bu gözlemleyin. Ince forseps kullanarak, AC geri kalanından pigmentli tabakayı ayırmak ve bir mikropipet P20 ile atın. Tam hücre ayrışma işlemi birbirinden hücrelerinin ayrılmasını belirtir. NOT: Bir veya iki pigmentli katmanları aşılama sırasında görselleştirme yardımcı olmak için yeniden toplanmış eksplant içinde bırakılabilir. </li><li> Plaka dairesel hareketler kullanarak hücreleri merkezi. Bir mikropipet kullanarak dikkatle mümkün olduğunca orta kaldırmak P1000. Hücreleri dokunmamaya özen gösterin. </li><li> Çukuruna kalsiyum ile Holtfreter tuzlu su 1 ml ilave edilir. Ayrışmış komisyonlarda aktarın1.5 ml tüp içine. NOT: 2 ml tüpler da yuvarlak tabanlı nedeniyle kullanılamaz. </li><li> Bir tezgah santrifüj (500 xg) için 2000 rpm maksimum hızda santrifüj, 5 dakika ile pelet hücreleri. Mikropipet P1000 ile dikkatlice süpernatantı. </li><li> Ayrışmış hücrelere kalsiyum ile Holtfreter tuzlu su (60 mM NaCI, 0.7 mM KCI, 0.9 mM CaCI2, 4.6 mM HEPES 20 ul ekle,% 0.1 BSA (Sigma A-7888 pH 7.6) 5. </li><li> Ayrışmış komisyonlarda, 3 (18-22 ° C) oda sıcaklığında saat 6 tutun. NOT: Bu hücreler yeniden agrega için gerekli zamandır. Hücreler tüpün dibinde küçük bir top form olarak yeniden toplanma görülebilir. </li><li> 0.5x MBS ya da 3/4 NAM 1 ml 1 ml ekleyerek tüp alt dikkatle ayırın eksplant (adım 4.1). Plastik transfer pipet kullanarak bir un kaplı levhada eksplant aktarın. </li><li> Kendi kontrol kardeşleri ile eksplantlar Sahne. Uzun süreli kültür kullanımı antibiyotik: kanamycin (50 ug / ml), ampisilin (50 ug / ml) ve gentamisin (50 ug / ml). </li></ol> Animal 4. Tırnak X&#39;in Sinir Plate eksplantlar Caps laevis Embriyo <ol><li> 3/4 NAM hazırlanması (110 mM NaCI, 2 mM KCI, 1 mM Ca (NO 3) 2, 1 mM MgSO 4, 0.1 mM EDTA, 1 mM NaHCO 3, 0.2x PBS, 50 ug / ml gentamisin). 4 ° C&#39;de diseksiyon ve mağaza için fazla 1 hafta tutmayın. Yaşlı NAM agaroz kaplı diseksiyon yemekler (aşağıda) hazırlanması için kullanılabilir. </li><li> Coat petri küçük delikler silikon kalıp veya bir masa tenisi raketi kapağını kullanarak yapılmış içine 3/4 NAM% 3 agaroz ile (60 mm). NOT: Agaroz petri alt kapsar. Petri 3/4 NAM ile doldurmak, böylece biraz boşluk bırakın. Alternatif kurutmayan modelleme kil ile diseksiyon yemekleri yapmak. Kil içinde diseksiyon işlemi sırasında hafifçe embriyolar sıkın. Küçük delik kazmakagaroz yuvarlak forseps Bu &#39;diseksiyon çanak&#39; kullanarak diseksiyon işlemi sırasında embriyoların tutmak için yardımcı olur. </li><li> Diseksiyon araçları toplayın: plastik transferi pipetler, 22, iki ince diseksiyon forseps, P1000 mikropipet ve ipuçları, büyütme 8-40X bir stereosmicroscope (cam Pasteur pipeti ucundaki parafin gömülü kaş saç ile yapılan) bir &#39;kaş bıçak&#39;, fiber optik kılavuzları ile parlak bir ışık kaynağı. Temiz bütün kesme aletleri tutun; Her deneyden sonra, bir kez% 100 etanol ile, distile su ile iki kez yıkayın ve kurumaya bırakın. Metal kesme aletleri tozdan ve gerekli otoklav eğer uzakta saklayın. </li><li> Let ayrışmış ve yeniden toplanan Klimalar (protokol 3) ve onların kardeşleri X. Onlar sahne 13 (neurula) ulaşana kadar laevis embriyoların Nieuwkoop ve Faber gelişimsel tabloya göre 17 gelişir. 15 embriyolar sahne nöral plak aşamasında 13 içinde nakil için kullanılır. </li><li> Tüm yürütmekstereomicroscope altında sonraki adımlar. </li><li> Plastik bir transfer pipeti kullanarak,% 0.2 BSA ile tamamlanmaktadır kalsiyum ve magnezyumlu PBS içine embriyo aktarımı. Daha önce açıklandığı gibi 20 embriyonun vitellin membran çıkarın. Tek forseps ile embriyo sabitleyin. Diğer forseps tarafı vitellin membran sıkıştırın. Sıkıca zarı Holding, yavaş yavaş embriyo onu sıyırın. NOT: Embriyonun ventral (bitkisel) tarafında bu yordamı yapın. Embriyolar nöral plakayı zarar vermeyin. Embriyolar Vitellin zar çıkarma aşaması sırasında zarar görmüş ise, plastik bir transfer pipet kullanarak 3/4 NAM içeren 60 mm petri kabına embriyo transferine ve 15 dakika, iyileşme süreci gerçekleşmesi için yeterli bir süre bekleyin. </li><li> Taze 3/4 NAM üstüne diseksiyon çanak doldurun. </li><li> Plastik bir transfer pipet kullanarak, diseksiyon çanak içine kendi vitellin membran olmadan embriyo transferi. Içine embriyolar dorsal yüzü koyunkuyular. Transfer işlemi sırasında embriyo X beri hava-sıvı arayüzü ile temas girmesine izin yok laevis yüzey gerilimi ile lize edilmiştir. </li><li> AC eksplant aktarın plastik transfer pipet veya mikropipet P1000 kullanılarak diseksiyon plaka içine aşılı olması. Pipet sıvı içinde sonra, eksplantlar yavaş yavaş yerçekimi tarafından aşağı lavabo, ya da çok hafifçe itin izin verir. </li><li> Yuvarlak forseps ile embriyolar koruyun. Kaş bıçak ile size eksplant taşının greft niyetinde sinir tabak içine bir kesi yapmak. NOT: Nöral plakasının ön bükme bir dönüm noktası olarak kullanmak olabilir aşamada 14 anda, diencephalon toprakları (Şekil 4) işaretler. </li><li> , Neuroepithelium küçük bir parça kesip yuvarlak forseps ve bir kaş knive kullanarak. Kaş bıçakla eksplant küçük bir parça kesin. NOT: eksplant parçası neuroepithelium ablasyon alanı olarak aynı boyut ve şekil konusunda olmalıdır. </li&gt; <li> Kaş bıçak ve ince forseps kullanarak neuroepithelium kesi içine eksplant parçası yerleştirin. Eksplant hızla embriyo verdiği emin olun. </li><li> Alternatif yerinde greft korumak için aşılı embriyo üzerine cam lamel bir parça yerleştirin. Bunu yapmak için, kaba forseps kullanarak çok küçük parçalar halinde ince bir cam lamel kesti. Boyutu yaklaşık 1,5 mm 2 olduğundan emin olun. 3/4 NAM veya PBS kullanarak forseps içeren bir Petri kabı içine parçaları bırakın. Hasar görmesini önlemek için embriyo daha büyük bir cam parçası seçin. Embriyo biraz basık olacaktır. </li><li> Taşımadan en az 30 dakika bekleyin, ya da sadece hafifçe diseksiyon plakasını taşıyın. Embriyo 2 saat 30 dakika için kurtarmak ve gerekirse yavaşça lamel kaldırmak edelim. Dikkatle plastik transfer pipet kullanarak, 3/4 NAM dolu temiz bir çanak içine aşılı embriyolar pipetle. NOT: Aşılı embriyolar bakteri veya mantar kontaminasyonu geliştirmek eğilimindedir. Uzun vadeli ckanamisin (50 ug / ml), ampisilin (50 ug / ml) ve gentamisin (50 ug / ml ug): ulture antibiyotik kullanır. </li></ol>

<ol>
	<li>Nieuwkoop, P. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=IIB,+Pattern+formation+in+the+developing+central+nervous+system+(CNS)+of+the+amphibians+and+birds+(English).">IIB, Pattern formation in the developing central nervous system (CNS) of the amphibians and birds (English).</a> Proceedings of the Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen. 94, 121-127 (1991).</li><li>Nieuwkoop, P. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+neural+induction+process;+its+morphogenetic+aspects.">The neural induction process; its morphogenetic aspects.</a> Int J Dev Biol. 43, 615-623 (1999).</li><li>Harland, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neural+induction.">Neural induction.</a> Curr Opin Genet Dev. 10, 357-362 (2000).</li><li>Sive, H. L., Grainger, R. M., Harland, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Early development of Xenopus laevis : a laboratory manual. , (2000).</li><li>Hoppler, S., Vize, P. D., Hoppler, S., Vize, P. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Xenopus protocols : post-genomic approaches. , (2012).</li><li>Franklin Hughes, W., La Velle, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effects+of+early+tectal+lesions+on+development+in+the+retinal+gonglion+cell+layer+of+chick+embryos.">The effects of early tectal lesions on development in the retinal gonglion cell layer of chick embryos.</a> J Comp Neurol. 163, 265-283 (1975).</li><li>Theveneau, E., Mayor, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Beads+on+the+run:+beads+as+alternative+tools+for+chemotaxis+assays.">Beads on the run: beads as alternative tools for chemotaxis assays.</a> Methods Mol Biol. 769, 449-460 (2011).</li><li>Juraver-Geslin, H. A., Gomez-Skarmeta, J. L., Durand, B. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+conserved+barH-like+homeobox-2+gene+barhl2+acts+downstream+of+orthodentricle-2+and+together+with+iroquois-3+in+establishment+of+the+caudal+forebrain+signaling+center+induced+by+Sonic+Hedgehog.">The conserved barH-like homeobox-2 gene barhl2 acts downstream of orthodentricle-2 and together with iroquois-3 in establishment of the caudal forebrain signaling center induced by Sonic Hedgehog.</a> Dev Biol. 396, 107-120 (2014).</li><li>Green, J. B., New, H. V., Smith, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Responses+of+embryonic+Xenopus+cells+to+activin+and+FGF+are+separated+by+multiple+dose+thresholds+and+correspond+to+distinct+axes+of+the+mesoderm.">Responses of embryonic Xenopus cells to activin and FGF are separated by multiple dose thresholds and correspond to distinct axes of the mesoderm.</a> Cell. 71, 731-739 (1992).</li><li>Wallingford, J. B., Ewald, A. J., Harland, R. M., Fraser, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Calcium+signaling+during+convergent+extension+in+Xenopus.">Calcium signaling during convergent extension in Xenopus.</a> Curr Biol. 11, 652-661 (2001).</li><li>Kiecker, C., Niehrs, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+morphogen+gradient+of+Wnt/beta-catenin+signalling+regulates+anteroposterior+neural+patterning+in+Xenopus.">A morphogen gradient of Wnt/beta-catenin signalling regulates anteroposterior neural patterning in Xenopus.</a> DEVELOPMENT. 128, 4189-4201 (2001).</li><li>Wilson, P. A., Hemmati-Brivanlou, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Induction+of+epidermis+and+inhibition+of+neural+fate+by+Bmp-4.">Induction of epidermis and inhibition of neural fate by Bmp-4.</a> Nature. 376, 331-333 (1995).</li><li>Afouda, B. A., Hoppler, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Xenopus+explants+as+an+experimental+model+system+for+studying+heart+development.">Xenopus explants as an experimental model system for studying heart development.</a> Trends in cardiovascular medicine. 19, 220-226 (2009).</li><li>Afouda, B. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stem-cell-like+embryonic+explants+to+study+cardiac+development.">Stem-cell-like embryonic explants to study cardiac development.</a> Methods Mol Biol. 917, 515-523 (2012).</li><li>Milet, C., Monsoro-Burq, A. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissection+of+Xenopus+laevis+neural+crest+for+in+vitro+explant+culture+or+in+vivo+transplantation.">Dissection of Xenopus laevis neural crest for in vitro explant culture or in vivo transplantation.</a> Journal of visualized experiments: JoVE. , (2014).</li><li>Milet, C., Maczkowiak, F., Roche, D. D., Monsoro-Burq, A. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pax3+and+Zic1+drive+induction+and+differentiation+of+multipotent,+migratory,+and+functional+neural+crest+in+Xenopus+embryos.">Pax3 and Zic1 drive induction and differentiation of multipotent, migratory, and functional neural crest in Xenopus embryos.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 110, 5528-5533 (2013).</li><li>Nieuwkoop, P. D., Faber, J., Nieuwkoop, P. D., Faber, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Normal table of Xenopus laevis (Daudin): a systematical and chronological survey of the development from the fertilized egg till the end of metamorphosis. , (1994).</li><li>Harland, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+situ+hybridization:+an+improved+whole-mount+method+for+Xenopus+embryos.">In situ hybridization: an improved whole-mount method for Xenopus embryos.</a> Methods Cell Biol. 36, 685-695 (1991).</li><li>Turner, D. L., Weintraub, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expression+of+achaete-scute+homolog+3+in+Xenopus+embryos+converts+ectodermal+cells+to+a+neural+fate.">Expression of achaete-scute homolog 3 in Xenopus embryos converts ectodermal cells to a neural fate.</a> Genes Dev. 8, 1434-1447 (1994).</li><li>Sive, H. L., Grainger, R. M., Harland, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Removing+the+Vitelline+Membrane+from+Xenopus+laevis+Embryos.">Removing the Vitelline Membrane from Xenopus laevis Embryos.</a> CSH protocols. , (2007).</li><li>Sive, H. L., Grainger, R. M., Harland, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Animal+Cap+Isolation+from+Xenopus+laevis.">Animal Cap Isolation from Xenopus laevis.</a> CSH protocols. , (2007).</li><li>Sive, H. L., Grainger, R. M., Harland, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Embryo+dissection+and+micromanipulation+tools.">Embryo dissection and micromanipulation tools.</a> CSH protocols. , (2007).</li><li>Wilson, S. W., Houart, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Review:+Early+Steps+in+the+Development+of+the+Forebrain.">Review: Early Steps in the Development of the Forebrain.</a> Developmental Cell. 6, 167-181 (2004).</li><li>Juraver-Geslin, H. A., Durand, B. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Early+development+of+the+neural+plate:+new+roles+for+apoptosis+and+for+one+of+its+main+effectors+caspase-3.">Early development of the neural plate: new roles for apoptosis and for one of its main effectors caspase-3.</a> Genesis. 53, 203-224 (2015).</li><li>Heasman, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Patterning+the+early+Xenopus+embryo.">Patterning the early Xenopus embryo.</a> Development. 133, 1205-1217 (2006).</li><li>Rubenstein, J. L., Martinez, S., Shimamura, K., Puelles, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+embryonic+vertebrate+forebrain:+the+prosomeric+model.">The embryonic vertebrate forebrain: the prosomeric model.</a> Science. 266, 578-580 (1994).</li><li>Puelles, L., Rubenstein, J. L. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Forebrain+gene+expression+domains+and+the+evolving+prosomeric+model.">Forebrain gene expression domains and the evolving prosomeric model.</a> Trends in Neurosciences. 26, 469-476 (2003).</li><li>Martinez-Ferre, A., Martinez, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+regionalization+of+the+diencephalon.">Molecular regionalization of the diencephalon.</a> Frontiers In Neuroscience. 6, 73-73 (2012).</li><li>Scholpp, S., Lumsden, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Review:+Building+a+bridal+chamber:+development+of+the+thalamus.">Review: Building a bridal chamber: development of the thalamus.</a> Trends in Neurosciences. 33, 373-380 (2010).</li><li>Coffman, C., Harris, W., Kintner, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Xotch,+the+Xenopus+homolog+of+Drosophila+notch.">Xotch, the Xenopus homolog of Drosophila notch.</a> Science. 249, 1438-1441 (1990).</li><li>Pera, E. M., Acosta, H., Gouignard, N., Climent, M., Arregi, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Active+signals,+gradient+formation+and+regional+specificity+in+neural+induction.">Active signals, gradient formation and regional specificity in neural induction.</a> Exp Cell Res. 321, 25-31 (2014).</li><li>Stern, C. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neural+induction:+old+problem,+new+findings,+yet+more+questions.">Neural induction: old problem, new findings, yet more questions.</a> Development. 132, 2007-2021 (2005).</li><li>Juraver-Geslin, H. A., Ausseil, J. J., Wassef, M., Durand, B. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Barhl2+limits+growth+of+the+diencephalic+primordium+through+Caspase3+inhibition+of+beta-catenin+activation.">Barhl2 limits growth of the diencephalic primordium through Caspase3 inhibition of beta-catenin activation.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 108, 2288-2293 (2011).</li><li>Sive, H. L., Grainger, R. M., Harland, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissociation+and+Reaggregation+of+Xenopus+laevis+Animal+Caps.">Dissociation and Reaggregation of Xenopus laevis Animal Caps.</a> CSH protocols. , (2007).</li><li>Harland, R. M., Grainger, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Xenopus+research:+metamorphosed+by+genetics+and+genomics.">Xenopus research: metamorphosed by genetics and genomics.</a> Trends Genet. 27, 507-515 (2011).</li><li>Beccari, L., Marco-Ferreres, R., Bovolenta, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+logic+of+gene+regulatory+networks+in+early+vertebrate+forebrain+patterning.">The logic of gene regulatory networks in early vertebrate forebrain patterning.</a> Mech Dev. 130, 95-111 (2013).</li><li>Pani, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ancient+deuterostome+origins+of+vertebrate+brain+signalling+centres.">Ancient deuterostome origins of vertebrate brain signalling centres.</a> Nature. 483, 289-294 (2012).</li><li>Holland, L. Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolution+of+bilaterian+central+nervous+systems:+a+single+origin?.">Evolution of bilaterian central nervous systems: a single origin?.</a> Evodevo. 4, 27 (2013).</li><li>Pratt, K. G., Khakhalin, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+human+neurodevelopmental+disorders+in+the+Xenopus+tadpole:+from+mechanisms+to+therapeutic+targets.">Modeling human neurodevelopmental disorders in the Xenopus tadpole: from mechanisms to therapeutic targets.</a> Disease models &amp; mechanisms. 6, 1057-1065 (2013).</li><li>Sasai, Y., Ogushi, M., Nagase, T., Ando, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bridging+the+gap+from+frog+research+to+human+therapy:+a+tale+of+neural+differentiation+in+Xenopus+animal+caps+and+human+pluripotent+cells.">Bridging the gap from frog research to human therapy: a tale of neural differentiation in Xenopus animal caps and human pluripotent cells.</a> Development, growth &amp; differentiation. 50, s47-s55 (2008).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

Nöral gelişim (3,31,32 yılında yorum) çevre dokulardan hücresel gelişim programları ve sinyaller arasındaki karmaşık bir etkileşim tarafından orkestra edildiği. Burada X kullanılabilecek protokoller kümesini tarif dışsal ve sinirsel kader tayini ve in vitro ve in vivo nöral morfogenez katılan içsel faktörlerin keşfetmek için embriyolar laevis. Bu protokoller, X&#39;te gibi kullanılabilir tropicalis embriyolar, ancak X. tropical...

Omurgalı sinir sistemi nöroepitelyal homojen bir hücreler katmanı olarak nöral plaka ortaya çıkar. Gelişimsel programlar nöral plaka bölgeselleşme sırasında, uyarılan kodlanmış, ve kurulan nasıl anlamak, şu anda, gelişim biyolojisi önemli bir hedeftir. Diğer sistemlere göre, deneysel müsait Xenopus embriyo sinir gelişim 1,2 erken adımları analiz için tercih edilen bir modeldir. Bu embriyoların çok sayıda elde etmek kolaydır ve dış gelişme nörülasyon 3 ilk adımlar erişim sağlar. Birçok araç deneysel Xenopus laevis (X. laevis) embriyonik gelişim işlemek için kullanılabilir. Mikro enjeksiyon birlikte biyokimyasal ve farmakolojik araçlar ile indüklenebilir MOS dahil mRNA veya morpholinos (MO), bir, fonksiyon kazanç (GOF) ve fonksiyon (LOF) kaybı ve yolları 4,5 sinyal belirli değişiklik kontrollü verir. Blastocoel çatı ektoderm, bir blastulanın veya çok erken gastrula embriyo hayvan kutup etrafında yer alan ve &quot;Hayvan Cap &#39;(AC) olarak adlandırılır, gen ekspresyonunun önce manipülasyonu ile programlanabilir pluripotent hücreler kaynağıdır hazırlık eksplant. Bu yazıda X. kullanmak için ayrıntılı protokoller laevis AC eksplantları vitro ve in vivo moleküler mekanizmalar ve hücresel süreçleri altta yatan nöral gelişim test etmek. Bir teknik Xenopus iribaş nöral tüp içinde gen ekspresyonu ince gözlem, kader tayini ipuçları belirlenmesinde bir ön adımı izin sunulmuştur. Düz monte dokuların gözlenmesi yaygın piliç embriyoları 6 çalışmada kullanılan Oysa, düzgün Xenopus tarif edilmemiştir. 2 veya 4 hücreli dönem embriyoların blastomer içine sentetik mRNA veya MO enjekte ederek gen ifadesinin Manipülasyon AC programlanmasına olanak tanır4 eksplant. Anti-BMP faktörü Noggin sentezlenmesiyle Kemik Morfogenetik Proteini (BMP) yolunun, örneğin inhibisyonu için, AC hücreleri 3 için bir sinir kimlik vermektedir. Protokol bir anyon değiştirme reçinesi boncuk ile doğrudan temas yoluyla dışsal uyaranlara AC eksplant yerel ve zaman kontrollü pozlama gerçekleştirmek için ayrıntılı. Son olarak bir teknik ayrılmış ve yeniden ilişkili programlanan farklı hücrelerden hazırlanan karışık eksplant nakli in vivo sinir progenitörlerin gelişim özelliklerini test etmek için bir işlem açıklanmaktadır. Kurbağa embriyo erken omurgalı nöral gelişimini incelemek için güçlü bir modeldir. Gen ifadesinin manipülasyonu birleştiren in vitro kültürleri eksplantasyona için neuroepithelium bölgeselleşme, çoğalması ve morfojenezinin 7-12 çalışmada önemli bilgiler sağlar. AC eksplant programlama ex vivo 13,14 fonksiyonel kalp gelişimini izin verdi. Kullanımaşılama eksplant 15 nöral tepe farklılaşma programı 16 indükleyici az transkripsiyonel anahtarın tanımlamasına yol açmıştır. Zona limitans intrathalamica (ZLI) kaudal ön beyin gelişimini ve bölgeselleşme kontrol sonik kirpi (Sus) salgılar bir sinyal merkezidir. Sürekli Shh maruz kaldığında, üç transkripsiyon faktör genleri coexpressing nöroepitelyal hücreler - barH benzeri homeobox-2 (barhl2), orthodenticle-2 (otx2) ve Iroquois-3 (irx3) - ZLI bölmenin iki özelliklerini kazanmak: yeterliğinin şşş ifade ve ön nöral plak hücrelerden ayırmak yeteneği. Bir model sistem olarak, nöroepitelyal hücrelere bir ZLI kaderin indüksiyonu 8 sunulacaktır. Bu protokoller temel mec keşfetmek için gelişimsel biyologlar ve diğer araştırmacılar için basit, ucuz ve verimli araçlar sağlamayı amaçlıyorAnahtar nöral hücre davranışları hanisms. Bu protokoller çok yönlü ve dışsal ve içsel nöral belirleme ipuçları geniş bir ürün yelpazesi soruşturma izin verir. Bu sinir soy bağlılığı, endüktif etkileşimleri ve hücre davranışlarının in vivo analizlerde uzun vadeli izin verir.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Paraformaldehyde</td>
			<td>VWR</td>
			<td>&#160;20909.290</td>
			<td>Toxic</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anion exchange resin beads</td>
			<td>Biorad</td>
			<td>140- 1231</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bovine Serum Albumin&#160;</td>
			<td>SIGMA</td>
			<td>A-7888</td>
			<td>For culture of animal cappH 7.6</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gentamycine&#160;</td>
			<td>GIBCO</td>
			<td>15751-045&#160;</td>
			<td>antibiotic</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bovine Serum Albumin</td>
			<td>SIGMA</td>
			<td>A7906</td>
			<td>&#160;for bead preparation</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

stem cell-like xenopus embryonic explants to study early neural developmental features in vitro and in vivo

Understanding the genetic programs underlying neural development is an important goal of developmental and stem cell biology. In the amphibian blastula, cells from the roof of the blastocoel are pluripotent. These cells can be isolated, and programmed to generate various tissues through manipulation of genes expression or induction by morphogens. In this manuscript protocols are described for the use of Xenopus laevis blastocoel roof explants as an assay system to investigate key in vivo and in vitro features of early neural development. These protocols allow the investigation of fate acquisition, cell migration behaviors, and cell autonomous and non-autonomous properties. The blastocoel roof explants can be cultured in a serum-free defined medium and grafted into host embryos. This transplantation into an embryo allows the investigation of the long-term lineage commitment, the inductive properties, and the behavior of transplanted cells in vivo. These assays can be exploited to investigate molecular mechanisms, cellular processes and gene regulatory networks underlying neural development. In the context of regenerative medicine, these assays provide a means to generate neural-derived cell types in vitro that could be used in drug screening.

Farklı türler, embriyolojik manipülasyonları ve düzenleyici genlerin ifade deseninde morfolojik değerlendirmeler dayanarak, bir kavramsal model nöral plak farklı histogenez alanları üreten bir gelişimsel ızgara tanımlayan enine ve boyuna parçalara bölünür savunur. Nöral plaka olarak, ön beyin, orta beyin, Beyin ve omurilik taslakları tüm zaten (23-25 ​​gözden) gastrulasyon sırasında ön-arka (AP) ekseni boyunca kurulmuştur. Nörülasyon sırasında...

Watch this Scientific Journal Video about Stem cell-like Xenopus Embryonic Explants to Study Early Neural Developmental Features In Vitro and In Vivo at JoVE.com

Stem cell-like Xenopus Embryonic Explants to Study Early Neural Developmental Features In Vitro and In Vivo

In Xenopus embryos, cells from the roof of the blastocoel are pluripotent and can be programmed to generate various tissues. Here, we describe protocols to use amphibian blastocoel roof explants as an assay system to investigate key in vivo and in vitro features of early neural development.

Kök hücre benzeri<em&gt; Xenopus</em&gt; Embriyonik Eksplantlarındaki Erken Nöral Gelişim Özellikleri Okuyacak<em&gt; İn Vitro</em&gt; Ve<em&gt; İn Vivo</em

Understanding the genetic programs underlying neural development is an important goal of developmental and stem cell biology. In the amphibian blastula, ...

stem-cell-like-xenopus-embryonic-explants-to-study-early-neural

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Stem cell-like Xenopus Embryonic Explants to Study Early Neural Developmental Features In Vitro and In Vivo

7.9K Görüntüleme.  Institut Curie. In Xenopus embryos, cells from the roof of the blastocoel are pluripotent and can be programmed to generate various tissues. Here, we describe protocols to use amphibian blastocoel roof explants as an assay system to investigate key in vivo and in vitro features of early neural development. 

Video: Stem cell-like Xenopus Embryonic Explants to Study Early Neural Developmental Features In Vitro and In Vivo

Understanding Early Organogenesis Using a Simplified In Situ Hybridization Protocol in Xenopus

Organogenesis is the study of how organs are specified and then acquire their specific shape and functions during development. The Xenopuslaevis embryo is very useful for studying organogenesis because their large size makes them very suitable for identifying organs at the earliest steps in organogenesis. At this time, the primary method used for identifying a specific organ or primordium is whole mount in situ hybridization with labeled antisense RNA probes specific to a gene that is expressed in the organ of interest. In addition, it is relatively easy to manipulate genes or signaling pathways in Xenopus and in situ hybridization allows one to then assay for changes in the presence or morphology of a target organ. Whole mount in situ hybridization is a multi-day protocol with many steps involved. Here we provide a simplified protocol with reduced numbers of steps and reagents used that works well for routine assays. In situ hybridization robots have greatly facilitated the process and we detail how and when we utilize that technology in the process. Once an in situ hybridization is complete, capturing the best image of the result can be frustrating. We provide advice on how to optimize imaging of in situ hybridization results. Although the protocol describes assessing organogenesis in Xenopus laevis, the same basic protocol can almost certainly be adapted to Xenopus tropicalis and other model systems.

Understanding Early Organogenesis Using a Simplified In Situ Hybridization Protocol in Xenopus

The Xenopus laevis embryo continues to be exceptionally useful in the study of early development due to its large size and ease of manipulation. A simplified protocol for whole mount in situ hybridization protocol is provided that can be used in the identification of specific organs in this model system.

Anlamak Basitleştirilmiş kullanma Erken Organogenez<em&gt; In Situ</emIçinde&gt; Hibridizasyon Protokolü<em&gt; Ksenopus</em

Organogenesis is the study of how organs are specified and then acquire their specific shape and functions during development.  The Xenopuslaevis embryo ...

Gelişim Biyolojisi

Zebrafish Keratocyte Explants to Study Collective Cell Migration and Reepithelialization in Cutaneous Wound Healing

Due to their unique motile properties, fish keratocytes dissociated from explant cultures have long been used to study the mechanisms of single cell migration. However, when explants are established, these cells also move collectively, maintaining many of the features which make individual keratocytes an attractive model to study migration: rapid rates of motility, extensive actin-rich lamellae with a perpendicular actin cable, and relatively constant speed and direction of migration. In early explants, the rapid interconversion of cells migrating individually with those migrating collectively allows the study of the role of cell-cell adhesions in determining the mode of migration, and emphasizes the molecular links between the two modes of migration. Cells in later explants lose their ability to migrate rapidly and collectively as an epithelial to mesenchymal transition occurs and genes associated with wound healing and inflammation are differentially expressed. Thus, keratocyte explants can serve as an in vitro model for the reepithelialization that occurs during cutaneous wound healing and can represent a unique system to study mechanisms of collective cell migration in the context of a defined program of gene expression changes. A variety of mutant and transgenic zebrafish lines are available, which allows explants to be established from fish with different genetic backgrounds. This allows the role of different proteins within these processes to be uniquely addressed. The protocols outlined here describe an easy and effective method for establishing these explant cultures for use in a variety of assays related to collective cell migration.

Zebrafish keratocytes migrate in cell sheets from explants and provide an in vitro model for the study of the mechanisms of collective cell migration in the context of epithelial wound healing. These protocols detail an effective way to establish primary explant cultures for use in collective cell migration assays.

Zebra balığı Keratosit Eksplantlarındaki Deri Yara İyileşmesi Toplu Hücre Göç ve reepithelialization Eğitim için

Due to their unique motile properties, fish keratocytes dissociated from explant cultures have long been used to study the mechanisms of single cell ...

Manipulation and In Vitro Maturation of Xenopus laevis Oocytes, Followed by Intracytoplasmic Sperm Injection, to Study Embryonic Development

Amphibian eggs have been widely used to study embryonic development. Early embryonic development is driven by maternally stored factors accumulated during oogenesis. In order to study roles of such maternal factors in early embryonic development, it is desirable to manipulate their functions from the very beginning of embryonic development. Conventional ways of gene interference are achieved by injection of antisense oligonucleotides (oligos) or mRNA into fertilized eggs, enabling under- or over-expression of specific proteins, respectively. However, these methods normally require more than several hours until protein expression is affected, and, hence, the interference of gene functions is not effective during early embryonic stages. Here, we introduce an experimental system in which expression levels of maternal proteins can be altered before fertilization. Xenopus laevis oocytes obtained from ovaries are defolliculated by incubating with enzymes. Antisense oligos or mRNAs are injected into defolliculated oocytes at the germinal vesicle (GV) stage. These oocytes are in vitro matured to eggs at the metaphase II (MII) stage, followed by intracytoplasmic sperm injection (ICSI). By this way, up to 10% of ICSI embryos can reach the swimming tadpole stage, thus allowing functional tests of specific gene knockdown or overexpression. This approach can be a useful way to study roles of maternally stored factors in early embryonic development.

Manipulation and In Vitro Maturation of Xenopus laevis Oocytes, Followed by Intracytoplasmic Sperm Injection, to Study Embryonic Development

We describe methods of manipulating Xenopus laevis immature oocytes, in vitro maturation of oocytes to eggs, and intracytoplasmic sperm injection. This protocol allows degradation of some maternal proteins and overexpression of genes of interest at fertilization, and hence is valuable to study roles of specific factors in early embryonic development.

Manipülasyon ve<em&gt; İn Vitro</emVe&gt; Olgunlaşma<em&gt; Xenopus laevis</emIntrasitoplazmik sperm enjeksiyonu izledi&gt; oositler, Embriyonik Geliştirme Çalışması

Amphibian eggs have been widely used to study embryonic development. Early embryonic development is driven by maternally stored factors accumulated during ...

Neural Differentiation of Mouse Embryonic Stem Cells in Serum-free Monolayer Culture

The ability to differentiate mouse embryonic stem cells (ESC) to neural progenitors allows the study of the mechanisms controlling neural specification as well as the generation of mature neural cell types for further study. In this protocol we describe a method for the differentiation of ESC to neural progenitors using serum-free, monolayer culture. The method is scalable, efficient and results in production of ~70% neural progenitor cells within 4 - 6 days. It can be applied to ESC from various strains grown under a variety of conditions. Neural progenitors can be allowed to differentiate further into functional neurons and glia or analyzed by microscopy, flow cytometry or molecular techniques. The differentiation process is amenable to time-lapse microscopy and can be combined with the use of reporter lines to monitor the neural specification process. We provide detailed instructions on media preparation and cell density optimization to allow the process to be applied to most ESC lines and a variety of cell culture vessels.

This protocol describes in detail the method for generating neural progenitors from embryonic stem cells using a serum-free monolayer method. These progenitors can be used to derive mature neural cell types or to study the process of neural specification and is amenable to multiwell format scaling for compound screening.

Serum serbest Tek tabakalı Kültüründe Fare Embriyonik Kök Hücre Sinir Farklılaşma

The ability to differentiate mouse embryonic stem cells (ESC) to neural progenitors allows the study of the mechanisms controlling neural specification as ...

Generating CRISPR/Cas9 Mediated Monoallelic Deletions to Study Enhancer Function in Mouse Embryonic Stem Cells

Enhancers control cell identity by regulating tissue-specific gene expression in a position and orientation independent manner. These enhancers are often located distally from the regulated gene in intergenic regions or even within the body of another gene. The position independent nature of enhancer activity makes it difficult to match enhancers with the genes they regulate. Deletion of an enhancer region provides direct evidence for enhancer activity and is the gold standard to reveal an enhancer's role in endogenous gene transcription. Conventional homologous recombination based deletion methods have been surpassed by recent advances in genome editing technology which enable rapid and precisely located changes to the genomes of numerous model organisms. CRISPR/Cas9 mediated genome editing can be used to manipulate the genome in many cell types and organisms rapidly and cost effectively, due to the ease with which Cas9 can be targeted to the genome by a guide RNA from a bespoke expression plasmid. Homozygous deletion of essential gene regulatory elements might lead to lethality or alter cellular phenotype whereas monoallelic deletion of transcriptional enhancers allows for the study of cis-regulation of gene expression without this confounding issue. Presented here is a protocol for CRISPR/Cas9 mediated deletion in F1 mouse embryonic stem (ES) cells (Mus musculus129 x Mus castaneus). Monoallelic deletion, screening and expression analysis is facilitated by single nucleotide polymorphisms (SNP) between the two alleles which occur on average every 125 bp in these cells.

Experimental validation of enhancer activity is best approached by loss-of-function analysis. Presented here is an efficient protocol that uses CRISPR/Cas9 mediated deletion to study allele-specific regulation of gene transcription in F1 ES cells which contain a hybrid genome (Mus musculus129 x Mus castaneus).

Yaratma CRISPR / Cas9 aracılığı monoallelik Delesyonlar Fare Embriyonik Kök Hücreleri Artırıcı Fonksiyonu Eğitim için

Enhancers control cell identity by regulating tissue-specific gene expression in a position and orientation independent manner. These enhancers are often ...

Transcriptome Profiling of In-Vivo Produced Bovine Pre-implantation Embryos Using Two-color Microarray Platform

Early embryonic loss is a large contributor to infertility in cattle. Moreover, bovine becomes an interesting model to study human preimplantation embryo development due to their similar developmental process. Although genetic factors are known to affect early embryonic development, the discovery of such factors has been a serious challenge. Microarray technology allows quantitative measurement and gene expression profiling of transcript levels on a genome-wide basis. One of the main decisions that have to be made when planning a microarray experiment is whether to use a one- or two-color approach. Two-color design increases technical replication, minimizes variability, improves sensitivity and accuracy as well as allows having loop designs, defining the common reference samples. Although microarray is a powerful biological tool, there are potential pitfalls that can attenuate its power. Hence, in this technical paper we demonstrate an optimized protocol for RNA extraction, amplification, labeling, hybridization of the labeled amplified RNA to the array, array scanning and data analysis using the two-color analysis strategy.

Transcriptome Profiling of In-Vivo Produced Bovine Pre-implantation Embryos Using Two-color Microarray Platform

Microarray technology allows quantitative measurement and gene expression profiling of transcripts on a genome-wide basis. Therefore, this protocol provides an optimized technical procedure in a two-color custom made bovine array using Day 7 bovine embryos to demonstrate the feasibility of using low amount of total RNA.

Transcriptome Profil<em&gt; In-vivo</emİki renkli Mikroarray Platformu Kullanma&gt; Üretilen Sığır pre-implantasyon Embriyolar

Early embryonic loss is a large contributor to infertility in cattle. Moreover, bovine becomes an interesting model to study human preimplantation embryo ...

Technique to Target Microinjection to the Developing Xenopus Kidney

The embryonic kidney of Xenopus&#160;laevis (frog), the pronephros, consists of a single nephron, and can be used as a model for kidney disease. Xenopus embryos are large, develop externally, and can be easily manipulated by microinjection or surgical procedures. In addition, fate maps have been established for early Xenopus embryos. Targeted microinjection into the individual blastomere that will eventually give rise to an organ or tissue of interest can be used to selectively overexpress or knock down gene expression within this restricted region, decreasing secondary effects in the rest of the developing embryo. In this protocol, we describe how to utilize established Xenopus fate maps to target the developing Xenopus kidney (the pronephros), through microinjection into specific blastomere of 4- and 8-cell embryos. Injection of lineage tracers allows verification of the specific targeting of the injection. After embryos have developed to stage 38 - 40, whole-mount immunostaining is used to visualize pronephric development, and the contribution by targeted cells to the pronephros can be assessed. The same technique can be adapted to target other tissue types in addition to the pronephros.

Technique to Target Microinjection to the Developing Xenopus Kidney

Here, we present a protocol to use fate maps and lineage tracers to target injections into individual blastomeres that give rise to the kidney of Xenopus laevis embryos.

Gelişmekte olan mikroenjeksiyon Hedef Tekniği<em&gt; Xenopus</em&gt; Böbrek

The embryonic kidney of Xenopus&#160;laevis (frog), the pronephros, consists of a single nephron, and can be used as a model for kidney disease. Xenopus ...

In Vitro and In Vivo Models to Study Corneal Endothelial-mesenchymal Transition

Corneal endothelial cells (CECs) play a crucial role in maintaining corneal clarity through active pumping. A reduced CEC count may lead to corneal edema and diminished visual acuity. However, human CECs are prone to compromised proliferative potential. Furthermore, stimulation of cell growth is often complicated by gradual endothelial-mesenchymal transition (EnMT). Therefore, understanding the mechanism of EnMT is necessary for facilitating the regeneration of CECs with competent function. In this study, we prepared a primary culture of bovine CECs by peeling the CECs with Descemet's membrane from the corneal button and demonstrated that bovine CECs exhibited the EnMT process, including phenotypic change, nuclear translocation of &#946;-catenin, and EMT regulators snail and slug, in the in vitro culture. Furthermore, we used a rat corneal endothelium cryoinjury model to demonstrate the EnMT process in vivo. Collectively, the in vitro primary culture of bovine CECs and in vivo rat corneal endothelium cryoinjury models offers useful platforms for investigating the mechanism of EnMT.

In Vitro and In Vivo Models to Study Corneal Endothelial-mesenchymal Transition

A primary culture of bovine corneal endothelial cells was used to investigate the mechanism of corneal endothelial-mesenchymal transition. Furthermore, a rat corneal endothelium cryoinjury model was used to demonstrate corneal endothelial-mesenchymal transition in vivo.

Vitro ve in vivo Modelleri Kornea Endotel-mezenkimal Geçiş Çalışması için

Corneal endothelial cells (CECs) play a crucial role in maintaining corneal clarity through active pumping. A reduced CEC count may lead to corneal edema ...

Visualization and Quantitative Analysis of Embryonic Angiogenesis in Xenopus tropicalis

Blood vessels supply oxygen and nutrients throughout the body, and the formation of the vascular network is under tight developmental control. The efficient in vivo visualization of blood vessels and the reliable quantification of their complexity are key to understanding the biology and disease of the vascular network. Here, we provide a detailed method to visualize blood vessels with a commercially available fluorescent dye, human plasma acetylated low density lipoprotein DiI complex (DiI-AcLDL), and to quantify their complexity in Xenopus tropicalis. Blood vessels can be labeled by a simple injection of DiI-AcLDL into the beating heart of an embryo, and blood vessels in the entire embryo can be imaged in live or fixed embryos. Combined with gene perturbation by the targeted microinjection of nucleic acids and/or the bath application of pharmacological reagents, the roles of a gene or of a signaling pathway on vascular development can be investigated within one week without resorting to sophisticated genetically engineered animals. Because of the well-defined venous system of Xenopus and its stereotypic angiogenesis, the sprouting of pre-existing vessels, vessel complexity can be quantified efficiently after perturbation experiments. This relatively simple protocol should serve as an easily accessible tool in diverse fields of cardiovascular research.

Visualization and Quantitative Analysis of Embryonic Angiogenesis in Xenopus tropicalis

This protocol demonstrates a fluorescence-based method to visualize the vasculature and to quantify its complexity in Xenopus tropicalis. Blood vessels can be imaged minutes after the injection of a fluorescent dye into the beating heart of an embryo after genetic and/or pharmacological manipulations to study cardiovascular development in vivo.

Embriyonik Anjiyojenezin Görselleştirilmesi ve Nicel Analizi<emXenopus tropicalis</em

Blood vessels supply oxygen and nutrients throughout the body, and the formation of the vascular network is under tight developmental control. The ...

Using In Vivo and Tissue and Cell Explant Approaches to Study the Morphogenesis and Pathogenesis of the Embryonic and Perinatal Aorta

The aorta is the largest artery in the body. The aortic wall is composed of an inner layer of endothelial cells, a middle layer of alternating elastic lamellae and smooth muscle cells (SMCs), and an outer layer of fibroblasts and extracellular matrix. In contrast to the widespread study of pathological models (e.g., atherosclerosis) in the adult aorta, much less is known about the embryonic and perinatal aorta. Here, we focus on SMCs and provide protocols for the analysis of the morphogenesis and pathogenesis of embryonic and perinatal aortic SMCs in normal development and disease. Specifically, the four protocols included are: i) in vivo embryonic fate mapping and clonal analysis; ii) explant embryonic aorta culture; iii) SMC isolation from the perinatal aorta; and iv) subcutaneous osmotic mini-pump placement in pregnant (or non-pregnant) mice. Thus, these approaches facilitate the investigation of the origin(s), fate, and clonal architecture of SMCs in the aorta in vivo. They allow for modulating embryonic aorta morphogenesis in utero by continuous exposure to pharmacological agents. In addition, isolated aortic tissue explants or aortic SMCs can be used to gain insights into the role of specific gene targets during fundamental processes such as muscularization, proliferation, and migration. These hypothesis-generating experiments on isolated SMCs and the explanted aorta can then be assessed in the in vivo context through pharmacological and genetic approaches.

Using In Vivo and Tissue and Cell Explant Approaches to Study the Morphogenesis and Pathogenesis of the Embryonic and Perinatal Aorta

Protocols for studying the embryonic and perinatal murine aorta using in vivo clonal analysis and fate mapping, aortic explants, and isolated smooth muscle cells are detailed here. These diverse approaches facilitate the investigation of the morphogenesis of the embryonic and perinatal aorta in normal development and the pathogenesis in disease.

Morfogenez ve embriyonik ve Perinatal aort patogenezi okumaya vivo içinde ve doku ve hücre Explant yaklaşımları kullanma

The aorta is the largest artery in the body. The aortic wall is composed of an inner layer of endothelial cells, a middle layer of alternating elastic ...