D.M.O. acknowledges European Research Council grant No. 337187 and the Marie-Curie Career Integration Grant No. 334303. P.W.W. acknowledges the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada's Discovery Grant program.

Not: görüntülemenin gününden önce 1 ve 2 almak yeri Aşamaları; Tüm ortam ve katkı önce veya görüntüleme gün dengelenir kullanılmak üzere olun. Dengeleme,% 5 CO2 ayarlanmış bir inkübatör içerisinde 37 ° C&#39;ye kadar ortam ve takviyeleri ısınma ile elde edilir. Tüm hücre kültürü çalışmaları ve lamel kaplama adımlar bir laminer akış kaputu altında steril koşullarda gerçekleşecek. 1. Hücre transfeksiyonu <ol><li> Transfect T hücreleri bir plazmid floresan füzyon F-aktin GFP etiketleme ve görüntüleme için inşa kodlama ile deneyden önce 24 saat görüntülü edilecek. Not: Hücreler önce transfeksiyon (önceki görüntüleme 48 saat) hücreler optimum sağlıkta ve logaritmik büyüme aşamasında olduğundan emin olmak için 24 saat bölünmüş olmalıdır. <ol><li> Dengelenmeye inkübatör içine 6-çukurlu plaka tek bir kuyuda RPMI ekinin 5 mL (RPMI 1640 artı% 10 FBS ve% 1 Pen-Strep (isteğe bağlı)) yerleştirin. </li><li> 2 x 10 7 T hücreleri kült pelet5 dakika boyunca 327 x g&#39;de santrifüj tüpü kullanılarak RPMI ek, 37 ° C 5% CO2 de edili- ve önceden ısıtılmış elektroporasyon ortamının bir eşit hacmi içinde yıkayın. Not: Elektroporasyon orta tamponlar ve takviyeleri (sarf bakınız) içeren bir azalma serum ortamıdır. </li><li> 5 dakika boyunca 327 x g&#39;de yeniden topaklama sonrası, elektroporasyon ortamı 500 ul hücre tekrar süspansiyon ve yavaş yavaş, bir küvete ilave markalama F-aktin PCR sınıf dH 2 O plazmidin 5 ug ekleyin. </li><li> Yavaşça elektrik kıvılcıma neden olabilir ve medya içinde eşit hücreleri dağıtmak için medyada herhangi bir hava kabarcığı, kaldırılmasını sağlamak için kaput çalışma alanında küveti dokunun. </li><li> 290 Ω elektroporasyon aparatı ve set gerilime 300 V ve kapasitans açın. 20 ms için bir üstel çürüme kullanarak electroporate örnek. Not: Optimizasyon farklı hücreler ve farklı plazma yapıları için gerekli olabilir. </li><li> Transfeksiyon protokolü kezdevam etmeden önce 1 dakika boyunca buz üzerinde, tam depolama hücreleri. </li><li> Dikkatle aşama 1.1.1 dengelenmiş RPMI ekinin 5 mL içeren 6 oyuklu plakaya küvetten gelen hücreler aktarın. </li><li> 37 ° C ile + 5% CO 2 hücreleri O / N inkübe edin. </li></ol></li></ol> 2. Kat Lameller ve Pre-sıcak Görüntüleme Ek <ol><li> Antikorlar ile kaplayın lamelleri T hücre stimülasyonlara. <ol><li> Kat 200 ul PBS içinde 1 ug / ml αCD3 ve αCD28 ile 8 oyuklu lamel her bir bölme. </li><li> 4 ° CO / N saklayınız. Seçenek olarak ise, 2 saat görüntü vermeden önce ve kılıf lamelleri lamel sıcaklık değişimleri en aza indirerek Görüntüleme işlemi sırasında kaymasını azaltmak için 37 ° C&#39;da bir kuluçka makinesi içinde tutar. </li></ol></li><li> 0.1 mikron alt kırınım floresan mikroküreler ile lamel test örneği oluşturun. <ol><li> Boncuk Vortex stok çözeltisi kümeleri önlemek için. </li><li> Th yeni, temiz bir lamel(üreticinin talimatlarına göre) yüzeye adım 2.1.1 kullanılanlar, pipet 5 ul floresan Microsphere stok solüsyonu olarak e aynı tip. </li><li> Pipet ile lamel üzerine Mikroküre çözümü yayıldı. </li><li> Daha sonra, kuruması gibi PBS gibi orta montaj 200 ul uygulamak için izin verin. Not: montaj orta o görüntüleme hücre örnekleri için kullanılan aynı olmalıdır. </li></ol></li><li> HBSS dengeye 37 ° C ± 5% CO2 de önceden sıcak O / N bir kuluçka makinesi içinde yerleştirerek bir santrifüj tüpüne (bundan böyle &#39;HBSS ek &quot;olarak adlandırılan + 20 mM HEPES,). Not: HEPES eklenmesi bu takviyesi atlamak CO 2 girişli bir kuluçka odasını kullanılıyorsa, CO 2 tampon olduğunu. </li></ol> 3. Mikroskop Set-up <ol><li> Tam gözü tabanını kapsayacak şekilde mikroskop haznesinde TIRF-SIM mikroskop ve yer yeterli distile su sahne top inkübatör açın. Su e izin ver37 ° C&#39;ye kadar quilibrate. Ayrıca 37 ° C olarak ayarlandı objektif lens, ısıtma yaka ekleyin. Not: set-up duyarlılığına, bu adımlar o kadar gece önce yapılır nedeniyle optik bileşenler sabit sıcaklıkta görüntüleme öncesinde bulunmaktadır. </li><li> Mikroskop ışık yolu TIRF 488 uyumlu ızgara blok yerleştirin ve yerine sabitleyin. <ol><li> TIRF-SIM modunda doğru optik yolunu yapmaya sırasıyla lazer yatak ve mikroskop sahnede &#39;Tek&#39; konumuna kanal modunu ve fiber kablo geçiş. Not: Bu adımı atlanıyor yazılım penceresi içinde bir hata (Şekil 1A) yol açacaktır. </li></ol></li><li> Tüm mikroskop ve bilgisayar bileşenleri açın ve satın alma kontrol yazılımı açın. <ol><li> OC panelini açın, Ti Pad, N-SIM Pad ve ND Acquisition pencereler (Şekil 1B). &#39;OC Panel&#39; seçeneğini &#39;TIRF 488&#39; (Şekil 2B, sarı ok) seçin. </li&gt; <li> N-SIM Pad penceresinde, &#39;TIRF-SIM&#39; ve &#39;Moving&#39; Ayarları (Şekil 2C, sarı oklar) seçin. Ayarlar düğmesine (Şekil 1C, sarı kutu) seçin ve açılır menüden, hit &#39;488 (100x TIRF 488nm için) TIRF&#39; &#39;OK&#39; &#39;Uygula&#39; seçeneğini seçin. </li><li> Frame Rate 50 msn, Okuma modu, EM Kazanç 14-bit 3 MHz, ve 1 Dönüşüm Kazancı ile EM Kazanç Çarpanı 300 (Şekil 1C, yeşil kutu): için &#39;DU897 ayarlarının&#39; içinde kamera ayarlarını yapın. Not: frame rate hususlar için Temsilcisi Sonuçlar bakın. </li><li> &#39;N-SIM Pad&#39; üzerine, 100x 1.49 NA CFI Apochromat TIRF objektif seçerek TIRF-SIM için mikroskop aydınlatma kalibre% 10 488 nm lazer açın. Not: Ham görüntülerin Piksel boyutu görünümünde bir 512 x 512 piksel alanı ile, 60 nm. </li><li> Toz ve yağı çıkarmak için mercek dokusu kullanarak objektif lens temizleyin. </li></ol></li&gt; <li> TIRF-SIM odak düzlemi bulun. <ol><li> Mümkün olan en düşük z-düzleminde hedefi ile başlayın. Objektif lens petrol bir damla koyun ve mikroskop aşamasına adım 2.2 floresan Microsphere örneği ekleyin. </li><li> Mikroskop gövdesi üzerinde bulunan Mükemmel Odak Sistemi (HTS) işlevini seçiniz. </li><li> PFS düğmesi ulaşıldı odak düzlemi onaylamak için yanıp sönmesi durana kadar yavaşça z-düzlemi ile objektif yukarı hareket ettirin. </li><li> Kontrol yazılımı ve görüntü PFS mikro-manipülatör tekerleği kullanılarak yapılan nihai ayarlamalar için mikroküreler üzerine &#39;Live&#39; görünümüne geçin. </li></ol></li><li> 75 nm fani dalga üzerinde hiçbir out-of-focus floresan emisyonu ile homojen aydınlatma gözlemleyin. Not: Yapılandırılmış aydınlatma floresan Microsphere örnek dalgalı bir aydınlatma deseni gözlemleyerek yerine onaylayın. </li><li> Floresan Microsphere örneği ölçün ve geliştirilmiş görüntüleme rezolüsyonlu ölçmekyoğunluk profilinin Yarım Maksimum Full Genişlik (FWHM) gözlemleyerek iyon. <ol><li> Yüklü NIS-A N-SIM Analiz modülü ile, analiz yazılımı (v4.20.01) açın ve &#39;Uygulamalar&#39; seçeneğini -&gt; &#39;Show N-SIM penceresi&#39;. </li><li> TIRF-SIM veri setleri (Şekil 2) için 1 olarak ayarlanır aydınlatma modülasyon kontrast (IMC) ve yüksek çözünürlüklü gürültü bastırma (HRNS) ile 30 piksel boyutunda 1024 x 1024 piksel yeniden görüntü oluşturmak için Microsphere örnek bir görüntüyü yeniden nm. </li><li> 1 piksel (Şekil 3A, sarı kutu) genişliğinde çizgi profil aracını kullanarak, tek bir mikro ortasından bir çizgi çizin. </li><li> FWHM düğmesini (Şekil 3B, sarı kutu) seçin ve yoğunluğu minimum ardından Gauss dağılım yoğunluğu maksima En tıklayın. </li><li> Mikrosfer FWHM 100 nm&#39;de (Şekil 3C) aralığındadır teyit edin. Not: Çözünürlük achhedeflenmektedir: görüntüleme biyolojik örnekler işaretleme verimliliğine ve arka plan floresanı sinyal-gürültü oranı bağlı olarak değişecektir. </li></ol></li></ol> Görüntüleme için 4. Numune Hazırlama <ol><li> Lamel hazırlanması. <ol><li> Buzdolabı veya inkübatör adım 2.1 αCD kaplı lamel Al ve her kuyudan PBS içeren αCD3 ve αCD28 kaldırın. </li><li> Lamel, her sıra için bir adım 2.3 önceden ısıtılmış HBSS ekinin 200 ul ekle. Yıkayın ve minimal αCD3 sağlamak için kaldırmak ve αCD28 çözeltisi içinde bırakılır. Lamel kuyularına HBSS ekinin başka bir 200 ul ekleyin. </li><li> Yağ ve partikülleri ortadan kaldırmak için mercek dokusu ile lamel alt temizleyin. </li></ol></li><li> Adım 3.4 bulunduğu gibi mikroskop sahnede Pozisyon lamel ve PFS z-düzlemi kullanarak lamel TIRF odak düzlemini bulmak. </li><li> Hücre hazırlanması. <ol><li> Medya con 200 ul pipetBir mikro santrifüj tüpüne aşama 1.1.8 transfekte hücrelerin taining. </li><li> 20 saniye boyunca 268 xg&#39;de bir mikro-santrifüj Pelet hücreleri ve hücre ortamı çıkarın. </li><li> 200 ul yeniden süspanse hücreleri adım 2.3 HBSS takviyesi ısıtılmış önceden. </li></ol></li></ol> 5. Görüntüleme Hücreleri <ol><li> Mikroskop hücre içeren HBSS takviyesi almak ve yavaşça kuyuların birine 200 ul pipetle. </li><li> (PFS modunda) lamel de TIRF odak düzlemi içinde kalırken, lamel yaklaşırken flüoresan hücreleri izlemek için mikroskoplar mercek ve bir epifluorışıma aydınlatma kullanıldığında. </li><li> Hücreler lamel arazi kez monitörde Görüntüyü getirmek ve hücreler bilgisayar ekranında odak olup olmadığını kontrol etmek, N-SIM Pad &#39;Canlı&#39; moduna geçin. </li><li> Tıklatın, Kuzey Dakota Toplama penceresini açın ve &#39;Zaman&#39; sekmesini seçin, zaman kurslar kaydetmek için Hiçbir gecikme, &#39;Süre&#39; için &#39;Ekle&#39; ve &#39;Aralığı&#39; set10 dakikaya kadar, 1 olarak ayarlandığında &#39;Loops&#39;. Not: Süre ilgi sürecine bağlı olarak değiştirilebilir; &#39;Hayır Gecikme&#39; ile yakalanan zaman ampüller yazılım ≈10 kare görüntü yığınları ile kantitatif sonuçlar elde edebilirsiniz. </li><li> Boncuk numune aynı satın alma ayarları ile, Kuzey Dakota Toplama penceresindeki &#39;şimdi çalıştır&#39; seçilerek verileri kaydetmeye başlayın. </li></ol> 6. Yeniden SIM Görüntüleri <ol><li> Görüntüleme işlemi tamamlandıktan sonra, yüklü NIS-A N-SIM Analiz modülü ile, analiz yazılımı (v4.20.01) açın ve &#39;Uygulamalar&#39; seçeneğini -&gt; &#39;Show N-SIM penceresi&#39;. </li><li> TIRF-SIM veri setleri için 1 olarak ayarlanır aydınlatma modülasyon kontrast (IMC) ve yüksek çözünürlüklü gürültü bastırma (HRNS) (Şekil 2) ile bir (ya da Toplu aracını kullanarak birden) bir yeniden SIM görüntü elde etmek için ham SIM dosyası yeniden. </li><li> Yeniden dosya teyit belirtilen 30 nm&#39;lik bir piksel boyutuna sahiptirGörüntü durum çubuğu. Not: Piksel boyutu ampüller analizini etkilemez ancak piksel arasındaki uzaysal ilişkiyi sağlamak için PSF mekansal çözünürlükte daha boyutunda en az 2x daha küçük olmalıdır. </li><li> Ampüller analize hazır .tiff dosyaları gibi verileri aktarın. </li></ol> 7. ampüller Analizi <ol><li> (; Ek bilgi olarak mevcuttur Wiseman laboratuarı) İndirme ve STIC (C) özü Matlab yazılım paketi S. Komut stics_vectormapping.m tek bir kanal ampüller analiz çekirdek ve kodunun ilk 30 satır kılavuzun bölüm 2.1&#39;de tanımlanan giriş parametreleri tanımlamak için kullanılır. Bu komut dosyasını açın ve TIRF-SIM veri analizi için giriş parametrelerini tanımlar. Kılavuzun ekinde ayrıntılı gibi, aynı zamanda yerel makine Matlab yoluna alt klasörler ile STIC (C) S klasör eklemek için önerilmektedir. <ol><li> Kod satırlarını gelen düzenleyerek veri analizi için girdi parametreleri tanımlayın </li><li> Ana gerçekleştirmek içinTIRF-SIM verilerinin parçalama, 1 vektör haritası oluşturmak vektör haritaları zaman serisi elde etmek için maksimum kare sayısı ve 1. hat 32 geçici bir değişikliğe hat 31 temporal bölgesinde bir yere geçici parametrelerini ayarlamak için bu parametreleri değişir . </li><li> Hareketsiz kaldırma filtresi için 21 &#39;MoveAverage&#39; parametresini (satır 24) &#39;ortalama Hareketli&#39; ve ayarlamak için parametre &#39;filtreleme&#39; (hat 23) ayarlayın. Not: analiz edilen çerçeveden seri kareleri çıkarılarak dayalı olarak bu ayar, yavaş hareketli ve büyük floresan sinyalleri için çalışmaya gösterilmiştir. </li><li> Değişim hatları 33-38 çıktı dosyalarını ve çıkış vektör haritaları başlıkları adını yanı sıra çıkış dizin yolunu ayarlamak ve vektör harita görüntüleri kaydedilmiş olmalıdır ne biçim içinde tanımlamak için kullanılır. </li></ol></li></ol><table><tbody><tr><td> Piksel boyutu (um) </td><td> 0.03 mikron </td><td> Satır 19 </td></tr><tr><td> Frame rate (sn) </td><td> 1 saniye </td><td> Satır 20 </td></tr><tr><td> Maksimum gecikme süresi (kare) </td><td> 20 kare </td><td> Satır 21 </td></tr><tr><td> Altbölge boyutu (piksel) </td><td> 8 piksel </td><td> Satır 29 </td></tr><tr><td> Altbölge aralığı (piksel) </td><td> 1 pixel </td><td> Satır 30 </td></tr></tbody></table><ol start="2"><li> Matlab Editör penceresinde komut run1ChannelSTICS açın. Çizgileri bu komut 1-23 çalıştırarak görüntü serisi yükleyin. Not: Bu komut dosyası yüklemek ve ön süreci görüntü serisi, vektörel haritalar ve hız histogramları arsa ve çok sayıda dosya için bir toplu işlem çalıştırmak için kullanılabilir. Gerekirse, bu komut satırı 24-26 kullanılarak ilgi bölgeye Görüntüyü kırpmak. <ol><li> Run çizgiler run1ChannelSTICS arasında 29-35 ampüller analizini başlatın. İstendiğinde, istenirse, faiz (ROI) belirli bir bölgesini belirtmek için bir çokgen seçin. Sınır eserler ortaya gibi ampüller bu yeniden analiz zaman ROI, hücre kenarı ile örtüşmeyen emin olungions. </li><li> Run satırlar 38-52 vektör haritaları görüntülemek için. Hız büyüklüğü histogram çizmek için çizgileri 53-72 çalıştırın. </li></ol></li></ol>

<ol>
	<li>Monks, C., Freiberg, B., Kupfer, H., Sciaky, N., Kupfer, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+segregation+of+supramolecular+activation+clusters+in+T+cells.">Three-dimensional segregation of supramolecular activation clusters in T cells.</a> Nature. 395, 82-86 (1998).</li><li>Lanzavecchia, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antigen-specific+interaction+between+T+and+B+cells.">Antigen-specific interaction between T and B cells.</a> Nature. 314, 537-539 (1985).</li><li>Grakoui, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+immunological+synapse:+a+molecular+machine+controlling+T+cell+activation.">The immunological synapse: a molecular machine controlling T cell activation.</a> Science. 285 (5425), 221-227 (1999).</li><li>Delon, J., Bercovici, N., Liblau, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+antigen+recognition+by+naive+CD4++T+cells:+compulsory+cytoskeletal+alterations+for+the+triggering+of+an+intracellular+calcium+response.">Imaging antigen recognition by naive CD4+ T cells: compulsory cytoskeletal alterations for the triggering of an intracellular calcium response.</a> European journal of Immunology. 28 (2), 716-729 (1998).</li><li>Varma, R., Campi, G., Yokosuka, T., Saito, T., Dustin, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=T+Cell+Receptor-Proximal+Signals+Are+Sustained+in+Peripheral+Microclusters+and+Terminated+in+the+Central+Supramolecular+Activation+Cluster.">T Cell Receptor-Proximal Signals Are Sustained in Peripheral Microclusters and Terminated in the Central Supramolecular Activation Cluster.</a> Immunity. 25 (1), 117-127 (2006).</li><li>Rust, M. J., Bates, M., Zhuang, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sub-diffraction-limit+imaging+by+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+(STORM).">Sub-diffraction-limit imaging by stochastic optical reconstruction microscopy (STORM).</a> Nature methods. 3, 793-796 (2006).</li><li>Betzig, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+intracellular+fluorescent+proteins+at+nanometer+resolution.">Imaging intracellular fluorescent proteins at nanometer resolution.</a> Science. 313 (5793), 1642-1645 (2006).</li><li>Klar, T. A., Jakobs, S., Dyba, M., Egner, A., Hell, S. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescence+microscopy+with+diffraction+resolution+barrier+broken+by+stimulated+emission.">Fluorescence microscopy with diffraction resolution barrier broken by stimulated emission.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 97 (15), 8206-8210 (2000).</li><li>Gustafsson, M. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Surpassing+the+lateral+resolution+limit+by+a+factor+of+two+using+structured+illumination+microscopy.">Surpassing the lateral resolution limit by a factor of two using structured illumination microscopy.</a> Journal of Microscopy. 198 (2), 82-87 (2000).</li><li>Hebert, B., Costantino, S., Wiseman, P. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatiotemporal+image+correlation+spectroscopy+(STICS)+theory,+verification,+and+application+to+protein+velocity+mapping+in+living+CHO+cells.">Spatiotemporal image correlation spectroscopy (STICS) theory, verification, and application to protein velocity mapping in living CHO cells.</a> Biophysical Journal. 88 (5), 3601-3614 (2005).</li><li>Ashdown, G. W., Cope, A., Wiseman, P. W., Owen, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+Flow+Quantified+beyond+the+Diffraction+Limit+by+Spatiotemporal+Image+Correlation+of+Structured+Illumination+Microscopy+Data.">Molecular Flow Quantified beyond the Diffraction Limit by Spatiotemporal Image Correlation of Structured Illumination Microscopy Data.</a> Biophysical Journal. 107 (9), 21-23 (2014).</li><li>Brown, C. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Probing+the+integrin-actin+linkage+using+high-resolution+protein+velocity+mapping.">Probing the integrin-actin linkage using high-resolution protein velocity mapping.</a> Journal of Cell Science. 19 (24), 5204-5214 (2006).</li><li>Yi, J., Xufeng, S. W., Crites, T., Hammer, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Actin+retrograde+flow+and+actomyosin+II+arc+contraction+drive+receptor+cluster+dynamics+at+the+immunological+synapse+in+Jurkat+T+cells.">Actin retrograde flow and actomyosin II arc contraction drive receptor cluster dynamics at the immunological synapse in Jurkat T cells.</a> Molecular Biology of the Cell. 23 (5), 834-852 (2012).</li><li>Watanabe, N., Mitchison, T. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single-molecule+speckle+analysis+of+actin+filament+turnover+in+lamellipodia.">Single-molecule speckle analysis of actin filament turnover in lamellipodia.</a> Science. 8 (5557), 1083-1086 (2002).</li></ol>

The authors declare that they have no competing financial interests.

Bu teknik görüntüye araştırmacıları izin ve floresan ifade eden hücrelerde daha önce çözümlenemeyen ayrıntıları ölçmek olacaktır. Bizim sonuçlarımıza biz F-aktin T hücresi IS hücre merkezine doğru hücre çevreden simetrik bir şekilde akar göstermektedir. Bu bulgular 1D çizgi profil kymograph verileri 13 önceki sonuçlar ile tutarlıdır ve 2D ve süper çözünürlüklü veri analizi kapasitesini artırmak. Sunulan teknik, zamanla tek 1D hat üzerinden...

Bu deneyin amacı görüntü ve imünolojik sinapsın (IS) formasyonu sırasında akış yönünü ve büyüklüğünü tespit etmek için kırılma sınırının ötesine, T hücreleri canlı filamentous- (F), aktin moleküler akışını karakterize eder. Bu teknik anti-CD3 ve anti-CD28 antikorları ile kaplı lamelleri aktive yapay bir sinaps meydana Jurkat T-hücreleri görüntüleme, toplam iç yansıma flüoresans (TIRF) modunda yapısal bir aydınlatma mikroskobu (SIM) kullanılarak yürütülecektir. Bir T hücresi ve hedef arasındaki IS formları; T hücresi reseptörü (TCR) aktivasyon 1,2 üzerine, bir antijen sunan hücre (APC). Bu adaptif immün sistemi, bir enfeksiyon, bir bağışıklık cevabı üretir belirleyen ilk adım olarak, uyaranlara yanıt doğru sonuçları bir dizi hastalığın neden olabilir. T hücre-APC etkileşiminin önemini iyi belgelenmiş, ancak, Olgun rolü (ler) ilk TCR si sonra ISgnal içselleştirme henüz tam olarak anlaşılmalıdır. Hücre iskeleti adımları aydınlatmak olacak geçici TCR aktivasyonu (plazma membranında moleküllerin hareket ve 3,4 hücre iskeletinin aktin bağımlı sinyal molekülleri kontrol), hücre iskeleti mekansal yeniden düzenler nasıl anlamak bağlantılı iki süreç yardım ve düşünülüyor gibi sinaps oluşumu sırasında moleküler yeniden yapılanma. F-aktin retrograd akım immünolojik sinaps merkezine doğru TCR kümeleri ağıl düşünülmektedir, bu translokasyon sinyal kesilmesi ve geri dönüşüm için hayati olduğuna inanılmaktadır; T hücre aktivasyonu 5 ince bir denge yardım. Standart floresan mikroskopi hücre-hücre etkileşimleri de dahil olmak üzere birçok biyolojik olaylar hakkında fikir vermeye devam etmektedir esnek bir araç olsa da, doğru bir diffr daha yakın ikamet eden birden fazla fluorophores çözmek için sistemin yeteneği ile sınırlıdırbirbirinden işlem sınırı (≈200 nm). Hücre içinde birçok moleküler olaylar moleküllerin yoğun popülasyonları içeren ve sükunet içinde veya belirli uyarılması üzerine ya dinamik yeniden düzenlenmesi sergilemek gibi geleneksel ışık mikroskobu tam resmini sağlamaz. Süper çözünürlüklü görüntüleme kullanımı araştırmacılar çeşitli teknikler kullanarak kırınım sınırı aşmak için izin verdi. PALM ve FIRTINA 6,7 yaklaşık 20 nm&#39;lik bir hassasiyetle moleküllerin yerini yukarı çözmek yeteneğine sahip tek molekül yerelleştirme mikroskobu (SMLM) gibi, ancak, bu teknikler pek çok karelerin üzerine bir görüntü kadar bina, uzun satın alma süreleri güveniyor . Genellikle bu sabit örnekleri gerektirir veya yapıların düşük hareketlilik sergilemek için çok tek flüoroforlar çok noktadan olarak yanlış değildir. Uyarılmış emisyon tükenmesi (STED) görüntüleme çok seçici konfokal uyarma 8, gerekli tarama yoluyla süper çözünürlük veriyor olsa dayaklaşım görünümünün tam hücre alanları üzerinde yavaş olabilir. STED nedeniyle de tükenme ışınının gücü artışı daha yüksek çözünürlükler için önemli fototoksisite göstermektedir. Yapılandırılmış aydınlatma mikroskobu (SİM 9) standart floresan mikroskop çözünürlüğü iki katına yeteneğine bu yöntemler, bir alternatif sağlar ve geçerli SMLM tekniklerine göre daha canlı hücre görüntüleme ile daha uyumludur. Bu bakış tüm hücre alanları için geniş alan sistemde alt lazer yetkilerini kullanır; satın alma hızları arttı ve standart fluorofor etiketleme ile uyumludur sağlamadan. SIM geniş alan doğa da &lt;100 nm eksenel boyutunda penetrasyon derinlikleri ile, son derece seçici uyarılması için toplam iç yansıma floresan (TIRF) kullanımını izin verir. Resim korelasyon spektroskopisi (ICS) flüoresan yoğunluğundaki değişiminin ölçülmesi için bir yöntemdir. ICS bir evrim; Uzay-zamansal imYaş korelasyon spektroskopisi (ampüller 10) zaman ve mekan hücre içi floresan sinyalleri ilişkilendirir. Korelasyon fonksiyonu ile geri kalmış çerçeveler içinde pikselleri çevreleyen piksel yoğunlukları ilişkilendirilerek, bilgi akışı hızları ve yön ile ilgili elde edilir. Statik nesneler ampüller analizi ile karışmaz sağlamak için, hareketsiz bir nesne filtre piksel yoğunluğunun bir hareketli ortalama çıkarılarak çalıştığı, uygulanmaktadır. Burada sunulan teknik, canlı hücreler 11 moleküler akışını ölçmek için süper çözünürlük mikroskopi verileri uygulanan görüntü korelasyon spektroskopisi görüldüğü ilk örnek olduğuna inanılmaktadır. Bu yöntem, ampüller analizi 12 üzerinden F-aktin akışının kırınım sınırlı görüntüleme geliştirir ve ışık kırınım sınırının ötesinde mekansal çözünürlükte elde edilen verilerden, canlı hücrelerde iki boyutlu moleküler akışını belirlemek için isteyen araştırmacıları uygun olur.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="799">
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:271px;">Consumables:</td>
			<td style="width:245px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:160px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Jurkat E6.1 cells</td>
			<td>APCC</td>
			<td>ATTC TIB-152</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">RPMI</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>21875-091</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">FBS</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>F7524-500ML</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Penicillin-Strepromycin&#160;</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>15140-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">HBSS</td>
			<td>&#160;Life Technologies</td>
			<td>14025-050</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">HEPES</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>15630-056</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">#1.5 8-well Labtek coverslips</td>
			<td>NUNC, Labtek</td>
			<td>155409</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">LifeAct GFP construct</td>
			<td>Ibidi</td>
			<td>60101</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">OptiMem</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>51985-042</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">anti-CD3</td>
			<td>Cambridge Bioscience</td>
			<td>317315</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">anti-CD28</td>
			<td>BD Bioscience / Insight Biotechnology</td>
			<td>555725</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">PBS</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>20012-019</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Lens oil</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Name</td>
			<td>Company</td>
			<td>Catalog number</td>
			<td>Comments</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Equipment:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Gene Pulsar Xcell System</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>165-2660</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Cuvette (0.4cm)</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>165-2088</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Centrifuge (5810R)</td>
			<td>Eppendorf&#160;</td>
			<td>5805 000.327</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Centrifuge (Heraeus)</td>
			<td>Biofuge pico</td>
			<td>75003235</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">6 well plate</td>
			<td>Corning</td>
			<td>3516</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Stage-top incubator</td>
			<td>Tokai Hit</td>
			<td>INUH-TIZSH</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Nikon N-SIM microscope</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>Contact company</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Nikon Analyse software</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>Contact company</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Incubator (190D)</td>
			<td>LEEC</td>
			<td>Contact company</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

cortical actin flow in t cells quantified by spatio-temporal image correlation spectroscopy of structured illumination microscopy data

İpliksi-aktin motilite ve bağışıklık hücrelerinde, immünolojik sinaps olarak bilinen önemli bir hücre-hücre etkileşim oluşumu dahil hücre işlemlerinin çoğunda önemli bir rol oynar. F-aktin, aynı zamanda, alt-membranöz vezikül dinamikleri ve protein kümelenme de dahil olmak üzere hücre zarı moleküler dağılımlarının düzenlenmesinde bir rol oynadığı düşünülmektedir. Standart ışık mikroskobu teknikleri genelleştirilmiş ve kırınım sınırlı gözlemler yapılmasına izin verirken, kümeleme ve moleküler akış dahil olmak üzere birçok hücresel ve moleküler olayların çok standart ışık mikroskobu çözme gücü altında uzunluk-ölçeklerde toplumlarda görülür. Süper çözünürlük görüntüleme yöntemi yapılandırılmış aydınlatma mikroskobu ile toplam iç yansıma floresan birleştirerek, T hücrelerinin bağışıklık sinaps F-aktin iki boyutlu moleküler akış kaydedildi. Ölçülebilir resul üretir uzay-zamansal görüntü korelasyon spektroskopisi (ampüller) daha sonra uygulandı,hız histogramlar ve akış yönünü ve büyüklüğünü temsil eden vektör haritaları şeklinde ts. Bu protokol detay alt kırınım seviyelerinde akış vektörleri oluşturmak için süper çözünürlüklü görüntüleme ve ampüller teknikleri kombinasyonunu açıklar. Bu teknik, sinaps formasyonu üzerine T hücrelerinin çevresi boyunca aktin simetrik retrograd akış ve merkeze doğru teyit etmek için kullanıldı.

Mikroskop ayarları Başarıyla elde ettikten sonra adımları araştırmacı olacak bir T hücresi sinaps F-aktin akış başarılı yapılandırılmış aydınlatma (SİM) görüntüleme var (Video 1) ve uzay-zamansal görüntü korelasyon spektroskopisi (Şekil 4 11) tarafından bu moleküler akış miktarı. Görüntüleri kaydetmeden önce, numune aydınlatma dokuz ham görüntüleri tektip ve ...

Watch this Scientific Journal Video about Cortical Actin Flow in T Cells Quantified by Spatio-temporal Image Correlation Spectroscopy of Structured Illumination Microscopy Data at JoVE.com

Cortical Actin Flow in T Cells Quantified by Spatio-temporal Image Correlation Spectroscopy of Structured Illumination Microscopy Data

To investigate flow velocities and directionality of filamentous-actin at the T cell immunological synapse, live-cell super-resolution imaging is combined with total internal reflection fluorescence and quantified with spatio-temporal image correlation spectroscopy.

Yapılandırılmış Aydınlatma Mikroskopi Verilerinin uzay-zamansal Görüntü Korelasyon Spektroskopisi nicel T Hücreleri kortikal Aktin Akışı

Filamentous-actin plays a crucial role in a majority of cell processes including motility and, in immune cells, the formation of a key cell-cell ...

cortical-actin-flow-t-cells-quantified-spatio-temporal-image

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

9.6K Görüntüleme.  King's College London. To investigate flow velocities and directionality of filamentous-actin at the T cell immunological synapse, live-cell super-resolution imaging is combined with total internal reflection fluorescence and quantified with spatio-temporal image correlation spectroscopy. 

Video: Cortical Actin Flow in T Cells Quantified by Spatio-temporal Image Correlation Spectroscopy of Structured Illumination Microscopy Data

Retroviral Transduction of T-cell Receptors in Mouse T-cells

T-cell receptors (TCRs) play a central role in the immune system. TCRs on T-cell surfaces can specifically recognize peptide antigens presented by antigen presenting cells (APCs)1. This recognition leads to the activation of T-cells and a series of functional outcomes (e.g. cytokine production, killing of the target cells). Understanding the functional role of TCRs is critical to harness the power of the immune system to treat a variety of immunology related diseases (e.g. cancer or autoimmunity).
It is convenient to study TCRs in mouse models, which can be accomplished in several ways. Making TCR transgenic mouse models is costly and time-consuming and currently there are only a limited number of them available2-4. Alternatively, mice with antigen-specific T-cells can be generated by bone marrow chimera. This method also takes several weeks and requires expertise5. Retroviral transduction of TCRs into in vitro activated mouse T-cells is a quick and relatively easy method to obtain T-cells of desired peptide-MHC specificity. Antigen-specific T-cells can be generated in one week and used in any downstream applications. Studying transduced T-cells also has direct application to human immunotherapy, as adoptive transfer of human T-cells transduced with antigen-specific TCRs is an emerging strategy for cancer treatment6.
Here we present a protocol to retrovirally transduce TCRs into in vitro activated mouse T-cells. Both human and mouse TCR genes can be used. Retroviruses carrying specific TCR genes are generated and used to infect mouse T-cells activated with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies. After in vitro expansion, transduced T-cells are analyzed by flow cytometry.

We present a protocol to produce antigen-specific mouse T-cells using retroviral transduction

Fare T-hücrelerinin, T-hücre reseptörleri retroviral İletimi

T-cell receptors (TCRs) play a central role in the immune system. TCRs on T-cell surfaces can specifically recognize peptide antigens presented by antigen ...

İmmünoloji ve Enfeksiyon

piggyBac Transposon System Modification of Primary Human T Cells

The piggyBac transposon system is naturally active, originally derived from the cabbage looper moth1,2. This non-viral system is plasmid based, most commonly utilizing two plasmids with one expressing the piggyBac transposase enzyme and a transposon plasmid harboring the gene(s) of interest between inverted repeat elements which are required for gene transfer activity. PiggyBac mediates gene transfer through a "cut and paste" mechanism whereby the transposase integrates the transposon segment into the genome of the target cell(s) of interest. PiggyBac has demonstrated efficient gene delivery activity in a wide variety of insect1,2, mammalian3-5, and human cells6 including primary human T cells7,8. Recently, a hyperactive piggyBac transposase was generated improving gene transfer efficiency9,10.
Human T lymphocytes are of clinical interest for adoptive immunotherapy of cancer11. Of note, the first clinical trial involving transposon modification of human T cells using the Sleeping beauty transposon system has been approved12. We have previously evaluated the utility of piggyBac as a non-viral methodology for genetic modification of human T cells. We found piggyBac to be efficient in genetic modification of human T cells with a reporter gene and a non-immunogenic inducible suicide gene7. Analysis of genomic integration sites revealed a lack of preference for integration into or near known proto-oncogenes13. We used piggyBac to gene-modify cytotoxic T lymphocytes to carry a chimeric antigen receptor directed against the tumor antigen HER2, and found that gene-modified T cells mediated targeted killing of HER2-positive tumor cells in vitro and in vivo in an orthotopic mouse model14. We have also used piggyBac to generate human T cells resistant to rapamycin, which should be useful in cancer therapies where rapamycin is utilized15.
Herein, we describe a method for using piggyBac to genetically modify primary human T cells. This includes isolation of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from human blood followed by culture, gene modification, and activation of T cells. For the purpose of this report, T cells were modified with a reporter gene (eGFP) for analysis and quantification of gene expression by flow cytometry.
PiggyBac can be used to modify human T cells with a variety of genes of interest. Although we have used piggyBac to direct T cells to tumor antigens14, we have also used piggyBac to add an inducible safety switch in order to eliminate gene modified cells if needed7. The large cargo capacity of piggyBac has also enabled gene transfer of a large rapamycin resistant mTOR molecule (15 kb)15. Therefore, we present a non-viral methodology for stable gene-modification of primary human T cells for a wide variety of purposes.

piggyBac Transposon System Modification of Primary Human T Cells

We describe a method to genetically modify primary human T cells with a transgene using the non-viral piggyBac transposon system. T cells modified to using the piggyBac transposon system exhibit stable transgene expression.

Primer insan T hücrelerinin piggyBac Transposon Sistem Modifikasyon

The piggyBac transposon system is naturally active, originally derived from the cabbage looper moth1,2. This non-viral system is plasmid based, most ...

Highly Resolved Intravital Striped-illumination Microscopy of Germinal Centers

Monitoring cellular communication by intravital deep-tissue multi-photon microscopy is the key for understanding the fate of immune cells within thick tissue samples and organs in health and disease. By controlling the scanning pattern in multi-photon microscopy and applying appropriate numerical algorithms, we developed a striped-illumination approach, which enabled us to achieve 3-fold better axial resolution and improved signal-to-noise ratio, i.e. contrast, in more than 100 &#181;m tissue depth within highly scattering tissue of lymphoid organs as compared to standard multi-photon microscopy. The acquisition speed as well as photobleaching and photodamage effects were similar to standard photo-multiplier-based technique, whereas the imaging depth was slightly lower due to the use of field detectors. By using the striped-illumination approach, we are able to observe the dynamics of immune complex deposits on secondary follicular dendritic cells &#8211; on the level of a few protein molecules in germinal centers.

High-resolution intravital imaging with enhanced contrast up to 120 &#181;m depth in lymph nodes of adult mice is achieved by spatially modulating the excitation pattern of a multi-focal two-photon microscope. In 100 &#181;m depth we measured resolutions of 487 nm (lateral) and 551 nm (axial), thus circumventing scattering and diffraction limits.

Germinal Merkezleri derece Çözülmüş Intravital Çizgili-aydınlatma Mikroskopi

Monitoring cellular communication by intravital deep-tissue multi-photon microscopy is the key for understanding the fate of immune cells within thick ...

Induction of Murine Intestinal Inflammation by Adoptive Transfer of Effector CD4+CD45RBhigh T Cells into Immunodeficient Mice

There are many different animal models available for studying the pathogenesis of human inflammatory bowel diseases (IBD), each with its own advantages and disadvantages. We describe here an experimental colitis model that is initiated by adoptive transfer of syngeneic splenic CD4+CD45RBhigh T cells into T and B cell deficient recipient mice. The CD4+CD45RBhigh T cell population that largely consists of na&#239;ve effector cells is capable of inducing chronic intestinal inflammation, closely resembling key aspects of human IBD. This method can be manipulated to study aspects of disease onset and progression. Additionally it can be used to study the function of innate, adaptive, and regulatory immune cell populations, and the role of environmental exposures, i.e., the microbiota, in intestinal inflammation. In this article we illustrate the methodology for inducing colitis with a step-by-step protocol. This includes a video demonstration of key technical aspects required to successfully develop this murine model of experimental colitis for research purposes.

Induction of Murine Intestinal Inflammation by Adoptive Transfer of Effector CD4+CD45RBhigh T Cells into Immunodeficient Mice

Here, we present a protocol to induce colonic inflammation in mice by adoptive transfer of syngeneic CD4+CD45RBhigh T cells into T and B cell deficient recipients. Clinical and histopathological features mimic human inflammatory bowel diseases. This method allows the study of the initiation of colonic inflammation and progression of disease.

Efektör CD4 Evlatlık transferi ile Kemirgen Bağırsak Enflamasyon indüksiyonu<sup&gt; +</sup&gt; CD45RB<sup&gt; Yüksek</sup&gt; Bağışık yetmezliği olan farelere içine T Hücreleri

There are many different animal models available for studying the pathogenesis of human inflammatory bowel diseases (IBD), each with its own advantages ...

T Cells Capture Bacteria by Transinfection from Dendritic Cells

Recently, we have shown, contrary to what is described, that CD4+ T cells, the paradigm of adaptive immune cells, capture bacteria from infected dendritic cells (DCs) by a process called transinfection. Here, we describe the analysis of the transinfection process, which occurs during the course of antigen presentation. This process was unveiled by using CD4+ T cells from transgenic OTII mice, which bear a T cell receptor (TCR) specific for a peptide of ovoalbumin (OVAp), which therefore can form stable immune complexes with infected dendritic cells loaded with this specific OVAp. The dynamics of green fluorescent protein (GFP)-expressing bacteria during DC-T cell transmission can be monitored by live-cell imaging and the quantification of bacterial transinfection can be performed by flow cytometry. In addition, transinfection can be quantified by a more sensitive method based in the use of gentamicin, a non-permeable aminoglycoside antibiotic killing extracellular bacteria but not intracellular ones. This classical method has been used previously in microbiology to study the efficiency of bacterial infections. We hereby explain the protocol of the complete process, from the isolation of the primary cells to the quantification of transinfection.

Here a protocol is presented to measure bacterial capture by CD4+ T cells which occurs during antigen presentation via transinfection from pre-infected dendritic cells (DC). We show how to perform the necessary steps: isolation of primary cells, infection of DC, DC/T cell conjugate formation, and measurement of bacterial T cell transfection.

T hücreleri dendritik hücreler gelen Transinfection tarafından Bakteriler Yakalama

Recently, we have shown, contrary to what is described, that CD4+ T cells, the paradigm of adaptive immune cells, capture bacteria from infected dendritic ...

The Use of Flow Cytometry to Assess the State of Chromatin in T Cells

During a proper immune response, quiescent T cells become activated upon antigen presentation to their antigen-specific T cell receptor. This leads to clonal proliferation of only those T cells that bear a receptor that recognizes the antigen. Chromatin decondensation is a hallmark of T cell activation and is required for T cells to acquire the ability to proliferate after antigen engagement. This change in chromatin condensation can be detected using antibodies raised against histone proteins. These antibodies cannot bind to their epitopes in na&#239;ve T cells as well as they can in activated T cells. We describe how to simultaneously stain T cell-specific surface markers, track viability with a fixable dead cell stain, and measure chromatin status via intracellular staining of Histone H3 proteins. Stained cells are analyzed by flow cytometry and chromatin condensation status is measured as the mean fluorescence intensity (MFI) of the Histone H3 stain. Chromatin decondensation during T cell activation is demonstrated as an increase in the MFI

Flow cytometry can be utilized to assess the state of chromatin within T cells. This protocol allows scientists to interpret evidence of chromatin decondensation during T cell activation demonstrated by an increase in the mean florescence intensity (MFI) of fluorescent Histone H3 antibodies

Akış Sitometrinin Kullanımı T Hücrelerinde Kromatin Devleti değerlendirmek için

During a proper immune response, quiescent T cells become activated upon antigen presentation to their antigen-specific T cell receptor. This leads to ...

Preparation of CD4+ T Cells for Analysis of GD3 and GD2 Ganglioside Membrane Expression by Microscopy

The methods described herein for activation of na&#239;ve CD4+ T cells in suspension and their adherence in coverslips for confocal microscopy analysis allow the spatial localization and visualization of gangliosides involved in CD4+ T cell activation, that complement expression profiling experiments such as flow cytometry, western blotting or real-time PCR. The quantification of ganglioside expression through flow cytometry and their cellular localization through microscopy can be obtained by the use of anti-ganglioside antibodies with high affinity and specificity. Nonetheless, an adequate handling of cells in suspension involves the treatment of culture plates to promote the necessary adherence required for fluorescence or confocal microscopy acquisition. In this work, we describe a protocol for determining GD3 and GD2 ganglioside expression and colocalization with the TCR during na&#239;ve CD4+ T cell activation. Also, real-time PCR experiments using &#60;40,000 cells are described for the determination of the GD3 and GM2/GD2 synthase genes, demonstrating that gene analysis experiments can be performed with a low number of cells and without the need of additional low input RNA kits.

Preparation of CD4+ T Cells for Analysis of GD3 and GD2 Ganglioside Membrane Expression by Microscopy

We describe a standard antibody staining protocol for use in microscopy to determine the membrane expression and localization of gangliosides in resting and activated human na&#239;ve CD4+ T cells. Also described are real-time PCR experiments using &#60;40,000 cells that do not require additional low input RNA kits.

CD4 hazırlanması<sup&gt; +</sup&gt; Mikroskopi GD3 ve GD2 Gangliozidleri Membran İfade Analizi T hücreleri

The methods described herein for activation of na&#239;ve CD4+ T cells in suspension and their adherence in coverslips for confocal microscopy analysis ...

Molecular Diffusion in Plasma Membranes of Primary Lymphocytes Measured by Fluorescence Correlation Spectroscopy

Fluorescence correlation spectroscopy (FCS) is a powerful technique for studying the diffusion of molecules within biological membranes with high spatial and temporal resolution. FCS can quantify the molecular concentration and diffusion coefficient of fluorescently labeled molecules in the cell membrane. This technique has the ability to explore the molecular diffusion characteristics of molecules in the plasma membrane of immune cells in steady state (i.e., without processes affecting the result during the actual measurement time). FCS is suitable for studying the diffusion of proteins that are expressed at levels typical for most endogenous proteins. Here, a straightforward and robust method to determine the diffusion rate of cell membrane proteins on primary lymphocytes is demonstrated. An effective way to perform measurements on antibody-stained live cells and commonly occurring observations after acquisition are described. The recent advancements in the development of photo-stable fluorescent dyes can be utilized by conjugating the antibodies of interest to appropriate dyes that do not bleach extensively during the measurements. Additionally, this allows for the detection of slowly diffusing entities, which is a common feature of proteins expressed in cell membranes. The analysis procedure to extract molecular concentration and diffusion parameters from the generated autocorrelation curves is highlighted. In summary, a basic protocol for FCS measurements is provided; it can be followed by immunologists with an understanding of confocal microscopy but with no other previous experience of techniques for measuring dynamic parameters, such as molecular diffusion rates.

A method to measure protein diffusion in membranes of primary immune cells using fluorescence correlation spectroscopy (FCS) is described. In this paper, the use of antibodies for fluorescent labeling is illustrated.

Flüoresan Korelasyon Spektroskopisi Ölçülen İlköğretim Lenfositler Plazma Membranlarda moleküler difüzyon

Fluorescence correlation spectroscopy (FCS) is a powerful technique for studying the diffusion of molecules within biological membranes with high spatial ...

Isolation and Flow Cytometric Analysis of Human Endocervical Gamma Delta T Cells

The female reproductive tract (FRT) mucosal immune system serves as the first line of defense. Better knowledge of the genital mucosa is therefore essential for understanding pathogenicity of different pathogens including HIV. Gamma delta (GD) T cells are the prototype of &#39;unconventional&#39; T cells and represent a relatively small subset of T cells defined by their expression of heterodimeric T-cell receptors (TCRs) composed of gamma and delta chains. This sets them apart from the classical and much better known CD4+ helper T cells and CD8+ cytotoxic T cells that are defined by alpha-beta TCRs. GD T cells often show tissue-specific localization and are enriched in epithelium. GD T cells orchestrate immune responses in inflammation, tumor surveillance, infectious disease, and autoimmunity.
Here, we present a method to reproducibly isolate and analyze human endocervical intraepithelial GD T lymphocytes. We have used endocervical cytobrush samples from women participating in the Women&#39;s Interagency HIV Infection Study (WIHS). Knowledge about GD T cells interactions during conditions in which there is an insult to the vaginal mucosal could be applied to any clinical study in which mucosal vulnerability is addressed, including the development of vaginal microbicides.In addition, knowledge about mucosal GD T cell responses has potential for application of GD T cell-based immune therapy in treating infectious diseases.

We describe here an isolation method to obtain human endocervical intraepithelial lymphocytes for the analysis of intraepithelial gamma delta T cells. This protocol can be extended for the purification of endocervical gamma delta T cells by magnetic beads or by cell sorting.

İnsan Endoservikal Gamma Delta T Hücreleri İzolasyon ve Akım Sitometrisi Analizi

The female reproductive tract (FRT) mucosal immune system serves as the first line of defense. Better knowledge of the genital mucosa is therefore ...

Induction of Paralysis and Visual System Injury in Mice by T Cells Specific for Neuromyelitis Optica Autoantigen Aquaporin-4

While it is recognized that aquaporin-4 (AQP4)-specific T cells and antibodies participate in the pathogenesis of neuromyelitis optica (NMO), a human central nervous system (CNS) autoimmune demyelinating disease, creation of an AQP4-targeted model with both clinical and histologic manifestations of CNS autoimmunity has proven challenging. Immunization of wild-type (WT) mice with AQP4 peptides elicited T cell proliferation, although those T cells could not transfer disease to na&#239;ve recipient mice. Recently, two novel AQP4 T cell epitopes, peptide (p) 135-153 and p201-220, were identified when studying immune responses to AQP4 in AQP4-deficient (AQP4-/-) mice, suggesting T cell reactivity to these epitopes is normally controlled by thymic negative selection. AQP4-/- Th17 polarized T cells primed to either p135-153 or p201-220 induced paralysis in recipient WT mice, that was associated with predominantly leptomeningeal inflammation of the spinal cord and optic nerves. Inflammation surrounding optic nerves and involvement of the inner retinal layers (IRL) were manifested by changes in serial optical coherence tomography (OCT). Here, we illustrate the approaches used to create this new in vivo model of AQP4-targeted CNS autoimmunity (ATCA), which can now be employed to study mechanisms that permit development of pathogenic AQP4-specific T cells and how they may cooperate with B cells in NMO pathogenesis.

Here, we present a protocol to induce paralysis and opticospinal inflammation by transfer of aquaporin-4 (AQP4)-specific T cells from AQP4-/- mice into WT mice. In addition, we demonstrate how to use serial optical coherence tomography to monitor visual system dysfunction.

Felç ve görsel sistem yaralanma tarafından Nöromyelitis Optica Autoantigen Aquaporin-4 T hücreleri belirli farelerde indüksiyon

While it is recognized that aquaporin-4 (AQP4)-specific T cells and antibodies participate in the pathogenesis of neuromyelitis optica (NMO), a human ...