Bakteri enfeksiyonları insan sağlığı için büyük bir tehdittir. Antimikrobiyal direnç artmaktadır ve bazı ana patojenler için aşılar hala eksiktir. Kontrol stratejileri için yeni yollar belirlemek için, patojenlerin konakçı bağışıklık sistemine ve enfekte olmuş dokularda in vivo antibiyotiklere nasıl tepki verdiği hakkında daha fazla bilgi sahibi olmamız gerekir.
Hayatta kalan bakteriler, antimikrobiyaller bir enfeksiyonu ortadan kaldıramazsa nükslere neden olabilir. Seri tomografi kullanarak, salmonellaya neden olan tifo ateşinin dalağın belirli bir bölümünde tedavi sırasında devam edebileceğini gösterdik. Enflamasyon bu bölgede zayıftır, bu da etkili temizleme için antibiyotikler ve inflamasyon arasındaki kritik sinerjiyi bozar.
Bakteriler mikrometre büyüklüğünde nesnelerdir. Bu kadar küçük nesneleri doku bağlamlarında lokalize etmek zordur. Seri iki foton tomografisi, santimetre büyüklüğündeki organlarda tek bir bakteriyi tespit edebilir ve replikasyon hızını belirleyebilir.
Ayrıca nötrofiller gibi bağışıklık hücrelerini tespit edebilir ve bakterilerle mekansal ilişkilerini belirleyebiliriz. Bakteriyostatik antibiyotiklerin aktivitelerini inceliyoruz. Bu antibiyotikler enfeksiyonları tedavi edebilir, ancak patojeni öldürmeden sadece bakteri üremesini engelleyebilirler.
Ayrıca, belirli virülans faktörlerinden yoksun bakteriyel mutantların yayılmasını ve bağışıklık kusurlarının enfeksiyon ve tedavi üzerindeki etkisini de belirleriz.
