JoVE Logo
Authors
Contact Us

Sign In

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • النتائج
  • Discussion
  • Disclosures
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

Here, we present a protocol for isolating and culturing single cells with a microfluidic platform, which utilizes a new microwell design concept to allow for high-efficiency single cell isolation and long-term clonal culture.

Abstract

Studying the heterogeneity of single cells is crucial for many biological questions, but is technically difficult. Thus, there is a need for a simple, yet high-throughput, method to perform single-cell culture experiments. Here, we report a microfluidic chip-based strategy for high-efficiency single-cell isolation (~77%) and demonstrate its capability of performing long-term single-cell culture (up to 7 d) and cellular heterogeneity analysis using clonogenic assay. These applications were demonstrated with KT98 mouse neural stem cells, and A549 and MDA-MB-435 human cancer cells. High single-cell isolation efficiency and long-term culture capability are achieved by using different sizes of microwells on the top and bottom of the microfluidic channel. The small microwell array is designed for precisely isolating single-cells, and the large microwell array is used for single-cell clonal culture in the microfluidic chip. This microfluidic platform constitutes an attractive approach for single-cell culture applications, due to its flexibility of adjustable cell culture spaces for different culture strategies, without decreasing isolation efficiency.

Introduction

ويتحقق وضع حاليا الخلايا واحدة على حدة في فضاء الثقافة عادة باستخدام الحد من التخفيف أو مضان تنشيط الخلايا الفرز (FACS). بالنسبة لكثير من المختبرات، والحد من التخفيف هو وسيلة مريحة، لأنه يتطلب فقط ماصة والأنسجة لوحات الثقافة، والتي هي متاحة بسهولة. في هذه الحالة، يتم المخفف تعليق خلية متسلسل إلى كثافة الخلية المناسبة، ومن ثم وضعها في آبار الثقافة باستخدام ماصة اليدوية. ثم يتم استخدام هذه الخلايا وحيدة compartmented لتحليل الخلايا، مثل التباين الجيني فحص (1) ومستعمرة تشكيل 2. ومع ذلك، وهذه الطريقة منخفضة الإنتاجية والعمالة الكثيفة، دون اللجوء إلى استخدام ذراع روبوتية لمساعدة، لأن طبيعة توزيع بواسون من طريقة التخفيف الحد من تقيد الأحداث وحيدة الخلية إلى احتمال الحد الأقصى من 37٪ 3. يمكن آلات FACS مع الذراع الروبوتية متكامل التغلب على الحد من توزيع بواسون التي كتبها بدقة PLACجي خلية واحدة في الثقافة بشكل جيد في وقت 4. ومع ذلك، فإن ارتفاع إجهاد القص الميكانيكية (وبالتالي، خفضت بقاء الخلية) 5 وشراء آلة والتكاليف التشغيلية محدودة استخدامه في العديد من المختبرات.

للتغلب على القيود المذكورة أعلاه، تم وضع أجهزة الميكروسكيل لبكفاءة عالية تحميل الخلايا وحيدة في microwells 6. ومع ذلك، فإن microwells لا توفر مساحة كافية للخلايا تحميل لتتكاثر، وذلك بسبب الحاجة إلى جعل حجم كل microwell قريب من خلية واحدة لتحقيق أقصى قدر من وحيد الخلية احتمال التحميل. كما يطلب فحوصات الثقافة في العديد من التطبيقات المستندة إلى خلية (على سبيل المثال، فحص مولد الرمع 7)، microwells أكبر (90-650 ميكرون في القطر أو في طول الجانب) كما تم استخدامها للسماح للثقافات خلية طويلة. ومع ذلك، مثل طريقة التخفيف الحد، فإنها تمتلك أيضا منخفضة وحيدة الخلية الكفاءات تحميل، تتراوح بين 10 - 30٪ 89

سابقا، قمنا بتطوير منصة عالية الإنتاجية ميكروفلويديك لعزل الخلايا وحيدة في microwells الفردية وإظهار تطبيقه في فحص مولد الرمع للخلايا معزولة. وقدم 10 على الجهاز مع بولي dimethylsiloxane (PDMS)، وتضم مجموعتين من صفائف microwell مع أحجام microwell المختلفة، التي يمكن أن تحسن إلى حد كبير كفاءة في تحميل خلية واحدة في microwell له حجم أكبر بكثير من الخلايا. والجدير بالذكر أن يسمح هذا "ثنائي جيد" مفهوم حجم منطقة ثقافة لتعديلها بمرونة دون التأثير على كفاءة القبض على خلية واحدة، مما يجعلها واضحة لضبط تصميم الجهاز لتناسب أنواع مختلفة من الخلايا والتطبيقات. وينبغي أن تكون هذه الطريقة ذات الكفاءة العالية ومفيدة لتجارب زراعة الخلايا على المدى الطويل للدراسات خلية التجانس وحيدة النسيلة إنشاء خط الخلية.

Protocol

ملاحظة: تم وضع التصاميم الضوئية الرئيسية لدينا تصنيع الجهاز ميكروفلويديك باستخدام التصميم بمساعدة الكمبيوتر (CAD) والبرمجيات. ثم تم استخدامها في التصاميم لافتعال photomasks الكروم باستخدام خدمة تجارية. وقدمت الأجهزة PDMS باستخدام تقنيات الطباعة الحجرية الناعمة. 11

1. تصنيع قوالب ماستر بواسطة الطباعة الحجرية

  1. قبل عملية ضوئيه 12، استخدام رقائق السليكون 4 بوصة باعتبارها الركيزة ويذوى رقائق في الفرن التقليدي عند 120 درجة مئوية لمدة 10 دقيقة.
  2. تنظيف رقائق السليكون المجففة باستخدام الأكسجين العلاج البلازما في 100 واط لمدة 30 ثانية في نظافة البلازما.
  3. سخن اثنين سخانات عند 65 درجة مئوية و 95 درجة مئوية، على التوالي، لعملية الخبز التالية.
  4. معطف 5 غرام من مقاومة للضوء سلبي (PR) على رقائق السليكون تنظيفها من قبل المغطي تدور. تدور في 1200 دورة في الدقيقة (SU-8 50) لمدة 30 ثانية لإنتاج طبقة متناهية.
  5. وضع العلاقات العامةالمغلفة رقاقة على موقد محمى على حرارة 65 درجة مئوية لمدة 12 دقيقة وتحويلها إلى موقد مسخن آخر في درجة حرارة 95 درجة مئوية لمدة 33 دقيقة (100 ميكرون أنماط سميكة) لتنفيذ عملية خبز لينة.
  6. بعد الخبز، ووضع العلاقات العامة المغلفة رقاقة السيليكون على حامل من اليجنر مؤتمتة شبه قناع ومحاذاته إلى 25400 نقطة لكل بوصة الدقة الشفافية الضوئية الرئيسية.
  7. فضح العلاقات العامة المغلفة رقاقة السيليكون لضوء الأشعة فوق البنفسجية (365 نانومتر) بجرعة 500 ميغا جول / سم 2 لإنشاء نمط العلاقات العامة على رقاقة السيليكون.
  8. إزالة الرقاقة من اليجنر ووضعه على موقد لمرحلة ما بعد الخبز في درجة حرارة 95 درجة مئوية لمدة 12 دقيقة.
  9. نقع رقائق في SU-8 مطور حل (البروبيلين جليكول monomethyl الأثير خلات، PGMEA) ليغسل العلاقات العامة uncrosslinked لمدة 12 دقيقة والجافة بلطف مع غاز النيتروجين لفضح علامات المحاذاة.
  10. مرة أخرى، ومعطف 5 غرام من مقاومة للضوء سلبي على رقائق من قبل المغطي تدور. تدور في 700 دورة في الدقيقة (SU-8 100) لمدة 30 ثانية و 1،200 دورة في الدقيقة (SU-8 10) لمدة 30 ثانية لمدة 300 &# 181؛ م نمط سميكة و 27 ميكرون نمط سميكة على التوالي لجعل طبقة microwell.
  11. وضع رقاقة العلاقات العامة المغلفة على موقد عند 65 درجة مئوية لمدة 4 دقائق وعلى 95 درجة مئوية لمدة 8 دقائق (27 ميكرون عميقة القبض جيدا طبقة)؛ وعند 65 درجة مئوية لمدة 40 دقيقة وعند درجة حرارة 95 درجة مئوية لمدة 110 دقيقة (300 ميكرون طبقة ثقافة بئر عميقة).
  12. بعد التبريد، ووضع العلاقات العامة المغلفة رقاقة السيليكون على اليجنر قناع مجهزة للأشعة فوق البنفسجية.
  13. فضح العلاقات العامة المغلفة رقاقة السيليكون لضوء الأشعة فوق البنفسجية (365 نانومتر) بجرعة 250 ميغا جول / سم 2 (27 ميكرون نمط سميكة) و 700 ميغا جول / سم 2 (300 ميكرون نمط سميك).
  14. خبز رقاق في درجة حرارة 95 درجة مئوية لمدة 5 دقائق (27 ميكرون نمط سميكة) و 30 دقيقة (300 ميكرون نمط سميك)، على التوالي.
  15. يغسل العلاقات العامة uncrosslinked من قبل PGMEA لمدة 6 دقائق (27 ميكرون نمط سميكة) و 25 دقيقة (300 ميكرون نمط سميك)، على التوالي، ومن ثم تجفيفها مع غاز النيتروجين.
  16. قياس ارتفاع نمط يتميز علىرقاقة مع profilometer المسح بالليزر عن طريق وضع رقاقة على مرحلة س ص من profilometer المسح بالليزر.
    1. ضبط البؤري لتظهر بوضوح ملامح نمط على الرقاقة باستخدام "عرض الكاميرا" واسطة المراقبة تحت 20X عدسة الهدف.
    2. تبديل وضع المراقبة من "وجهة نظر الكاميرا" إلى "عرض الليزر"، وتعيين المناصب العليا والسفلى من الميزات.
    3. ضبط وضع قياس، منطقة، والجودة، وض الملعب حتى شفاف (أعلى)، 1 خط (1،024 × 1)، عالية الدقة و 0.5 ميكرون، على التوالي، ثم اضغط على أسفل بداية لبدء القياس.

2. إعداد الأجهزة PDMS لعزل وحيدة الخلية

  1. قبل PDMS الصب، silanize القوالب رئيسية مع trichlorosilane لخلق سطح مسعور، مما يجعل من الاسهل لتقشر PDMS النسخ المتماثلة من القوالب الرئيسية.
    1. وضع القوالب الرئيسية وقارب الترجيح التي تحتوي على200 ميكرولتر من trichlorosilane في مجفف، وتطبيق فراغ (-85 كيلو باسكال) لمدة 15 دقيقة.
    2. وقف فراغ ثم تترك القوالب الرئيسية في مجفف لsilanize القوالب الماجستير في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 ساعة على الأقل.
    3. إزالة القوالب الرئيسية من المجفف ووضع كل القالب الرئيسي في 10 سم طبق بتري.
  2. مزيج بمبلغ إجمالي قدره 17.6 غرام عدة PDMS البوليمر تحتوي على قاعدة وكيل علاج في نسبة 10: 1، ثم صب PDMS على القالب الرئيسي في طبق بيتري.
  3. وضع طبق بتري في مجفف وتطبيق فراغ (-85 كيلو باسكال) لمدة 1 ساعة لإزالة فقاعات الهواء في PDMS.
  4. إزالة طبق بيتري من المجفف ووضعه في الفرن التقليدي عند 65 درجة مئوية لمدة 3-6 ساعة لعلاج PDMS.
  5. إزالة PDMS المقلدة الشفاء من القوالب الرئيسية ولكمة اثنين من الثقوب بمثابة مدخل ومخرج على طرفي متناهية على مجموعة PDMS متماثلة القبض جيدا من قبل الناخس مع الداخلية-قطر 0.75 ملم لقناة الموائعية (الشكل 2A).
  6. استخدام شريط لتنظيف السطح من النسخ المتماثلة PDMS، ثم قم بوضع النسخ المتماثلة PDMS في نظافة البلازما لوجيزة علاج الأوكسجين البلازما (100 واط لمدة 14 ثانية).
  7. إزالة النسخ المتماثلة PDMS من آلة الأكسجين البلازما.
  8. محاذاة أعلى (التي تحتوي على microwells القبض) وPDMS القاع (التي تحتوي على microwells الثقافة) نسخة باليد تحت مجهر تشريحي وتقديمهم إلى الاتصال.
  9. ضع PDMS المقلدة الانحياز في الفرن على 65 درجة مئوية لمدة 24 ساعة لتحقيق الترابط الدائم بين النسخ المتماثلة PDMS لتشكيل الجهاز النهائي.
  10. نقع الجهاز PDMS في منزوع الأيونات (DI) حاوية مملوءة للمياه ووضع الحاويات في مجفف تحت فراغ (-85 كيلو باسكال) لمدة 15 دقيقة لإزالة الهواء من متناهية من الجهاز PDMS.
  11. وضع الجهاز PDMS مملوءة بالماء DI في نسيج الثقافة هود واستخدام الأشعة فوق البنفسجية (الطول الموجي للضوء: 254 نانومتر) لتعقيم الجهاز لمدة 30 ميلن.
  12. استبدال الماء DI في الجهاز PDMS مع 5٪ مصل بقري الزلال (BSA) في حل برنامج تلفزيوني 1X واحتضان عند 37 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة لمنع الخلايا من الالتصاق على سطح PDMS.
    ملاحظة: طلاء BSA أمر بالغ الأهمية لتحسين كفاءة نقل الخلايا المعزولة من التقاط تماما لثقافة جيدا.
  13. استبدال حل BSA 5٪ في الجهاز PDMS مع تعقيمها حل برنامج تلفزيوني 1X.

3. إعداد وحيدة الخلية تعليق

  1. ثقافة العصبية الجذعية KT98 الخلية، وسرطان البشري A549 خلية وMDA-MB-435 نحن في طبق بتري في حاضنة الثقافة الخلية التقليدية (37 درجة مئوية، و 5٪ CO 2، و 95٪ رطوبة) لإعداد الخلايا لتجربة خلية جهاز PDMS .
  2. إزالة والتخلص من ثقافة المتوسط ​​قضى (DMEM المتوسطة القاعدية المتوفرة مع 10٪ الجنين مصل بقري و 1٪ المضادات الحيوية) من الطبق الثقافة مع الخلايا المزروعة إلى 70-80٪ التقاء.
  3. يغسل بلطف الخلايا مع تعقيمها برنامج تلفزيوني ثلاث مرات.
  4. إزالة والتخلص من برنامج تلفزيوني، وإضافة 2 مل من مزيج انزيم المؤتلف مع بروتين، حال الكولاجين، والأنشطة الدناز (يرجى الاطلاع على قائمة المواد للحصول على معلومات مفصلة).
  5. احتضان الطبق الثقافة في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق، ثم اضغط على طبق ثقافة لتسهيل مفرزة الخلية.
  6. إضافة 4 مل من برنامج تلفزيوني تعقيمها لتفريق الخلايا، ومن ثم نقل تعليق خلية إلى 15 مل أنبوب مخروطي الشكل.
  7. أنبوب الطرد المركزي في 300 x ج لمدة 3 دقائق وإزالة طاف.
  8. resuspend بلطف بيليه خلية في 1 مل تعقيمها برنامج تلفزيوني وحساب عدد الخلايا الحية باستخدام معيار التريبان الأزرق طريقة استبعاد 13.
    ملاحظة: هذه الخطوة إعادة تعليق أمر بالغ الأهمية لإعداد فصل جيدا تعليق وحيد الخلية إلى تحسين كفاءة العزل وحيدة الخلية.

4. عزل وحيدة الخلية والثقافة نسيلي

  1. تحميل 50 ميكرولتر من تعليق الخلية بتركيز 2،2-2،5 X10 6 خلية / مل في متناهية من الجهاز PDMS عبر فتحة منفذ للجهاز مع ماصة المحمولة.
    ملاحظة: تحميل ماصة تعليق خلية يحتاج إلى توقف والذي عقد في موقف المحطة الأولى لتجنب إدخال فقاعات الهواء إلى متناهية.
  2. تحميل 50 ميكرولتر آخر من تعليق الخلية من خلال ثقب مدخل لملء بالتساوي حتى متناهية كاملة مع الخلايا.
  3. اغلاق فتحة منفذ مع المكونات (أ، 1 مم قطع النايلون خط الصيد 3 مم طويل) لتجنب تدفق الناجم عن الضغط الهيدروليكي من قطرات على مدخل ومخرج الثقوب.
    ملاحظة: كانت المقابس الأشعة فوق البنفسجية تعقيم داخل الثقافة غطاء محرك السيارة الأنسجة قبل استخدامها.
  4. تملأ 1 مل محقنة معقمة مع مستنبت، إخراج فقاعات الهواء منها، وإعداده على ضخ حقنة.
  5. ربط المتوسطة تحميل الحقنة لثقب مدخل الجهاز PDMS عبر 23 G إبرة حادة و(PTFE) أنابيب البولي tetrafluoroethene.
  6. إزالة المكونات من ثقب منفذ وجميعآه فترة زمنية 2-دقيقة للسماح للخلايا ليستقر في خلية واحدة القبض على الآبار بواسطة قوة الجاذبية.
  7. يغسل خلايا uncaptured مع 300 ميكرولتر من مستنبت بمعدل تدفق 600 ميكرولتر / دقيقة يقودها ضخ حقنة.
  8. الانتظار لمدة 2 دقيقة لتحقيق الاستقرار في الجهاز، وختم مدخل ومخرج الثقوب بسدادات لتشكيل نظام الاستزراع المغلق.
  9. الوجه الجهاز باليد إلى نقل الخلايا وحيدة القبض على microwells الثقافة.
  10. وضع الجهاز PDMS في صحن زراعة الأنسجة 100 ملم، وإضافة 10 مل من برنامج تلفزيوني تعقيم حول الجهاز لتجنب ثقافة تبخر المتوسط ​​من متناهية.
  11. نقل الطبق الثقافة الحاضنة التقليدية الثقافة الخلية (37 درجة مئوية، و 5٪ CO 2، و 95٪ الرطوبة) للثقافة نسيلي من الخلايا واحدة.

5. الثقافة المتوسطة التجديد

  1. بعد 1 د الثقافة واستبدال مستنبت في الجهاز PDMS مع متوسطة جديدة لتحسين العلاقات العامة خليةoliferation.
  2. وضع اثنين من قطرات من مستنبت على رأس الجهاز PDMS بالقرب من المناطق مدخل ومخرج الثقوب لتجنب إدخال فقاعات الهواء إلى متناهية أثناء تنفيذ الخطوة التالية.
  3. لكمة اثنين من الثقوب من الجزء العلوي من الجهاز PDMS بالقرب من طرفي متناهية بمثابة مدخل ومخرج للمتناهية.
    ملاحظة: لا لكمة من خلال بأكملها طبقتين من الجهاز PDMS. بدلا من ذلك، فقط لكمة من خلال الطبقة العليا من PDMS.
  4. توصيل حقنة بلاستيكية 1 مل يحتوي متوسطة جديدة إلى مدخل طريق 23 G إبرة حادة وPTFE الأنابيب.
  5. تدفق المتوسطة 120 ميكرولتر جديدة في الجهاز لمدة 5 دقائق ليحل محل المتوسطة من العمر.
  6. إدراج اثنين من المقابس لاغلاق مدخل ومخرج الثقوب، ويعود الجهاز إلى حاضنة الثقافة الخلية.
  7. تحديث مستنبت كل د 2 خلال الفترة الثقافة عن طريق إزالة المقابس الختم، تليها بتكرار الخطوات 5،4-5،5.

النتائج

وتضم منصة ميكروفلويديك لعزل وحيدة الخلية وثقافة متناهية (200 ميكرومتر في الطول) مع مجموعتين من صفائف microwell (الشكل 2A). ويطلق على مجموعتين من صفائف microwell كما القبض جيدا (25 ميكرون في القطر و 27 ميكرون في العمق) والثقافة بشكل جيد (285 ميكرون في القطر و ...

Discussion

نظم جهاز المستندة إلى Microwell استخدمت 6،14 للتلاعب وحيدة الخلية والتحليل، مثل خلية واحدة على نطاق واسع لظاهرة الاحتباس 6 واحد الجذعية المكونة للدم تكاثر الخلايا 15. وعلى الرغم من حجم جيد والعدد والشكل يمكن تعديلها لتطبيقات محددة، ودائما يؤثر سلبا على كف...

Disclosures

The authors declare that they have no competing financial interests.

Acknowledgements

This work was supported by a grant from the National Health Research Institutes (03-A1 BNMP11-014).

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
AutoCAD softwareAutodeskAutoCAD LT 2011Part No. 057C1-74A111-1001
Silicon wafer Eltech corperationSPE0039
Conventional ovenYEONG-SHIN companyovp45
Plasma cleanerNordsonAP-300Bench-Top Plasma Treatment System
SU-8 50 negative photoresistMicroChemY131269
SU-8 100 negative photoresistMicroChemY131273
Spin coaterSynrex Co., Ltd.SC-HMI 2" ~ 6"
HotplateYOTEC companyYS-300S
Msak alignerDeya Optronic CO.A1K-5-MDA
SU-8 developerGrand Chemical CompaniesGP5002-000000-72GCPropylene glycol monomethyl ether acetate
Scanning laser profilometerKEYENCEVK-X 100
TrichlorosilaneGelest, IncSIT8174.0Tridecafluoro-1,1,2,2-tetrahydrooctyl. Hazardous. Corrosive to the respiratory tract, reacts violently with water.
DesiccatorBel-Art ProductsF42020-0000Space saver vacuum desiccator 190 mm white base
Polydimethylsiloxane (PDMS) kitDow corningSylgard 184
Harris Uni-Core puncherTed Pella Inc.15072with 0.75 mm inner-diameter
Removable tape3M CompanyScotch Removable Tape 811
StereomicroscopeLeica MicrosystemsLeica E24
Bovine serum albumin (BSA)Bersing TechnologyALB001.500
DMEM basal mediumGibco12800-017
Fetal bovine serumThermo HycloneSH30071.03HI
AntibioticsBiowestL0014-100Glutamine-Penicillin-Streptomycin
Recombinant enzyme mixtureInnovative cell technologyAM-105Accumax
DiIC12(3) cell membrane dyeBD Biosciences354218Used as a cell tracker
Syringe pumpHarvard Apparatus703007
Plastic syringe (1 ml)BD Biosciences309659
23 gauge blunt needlesEver Sharp Technology, Inc.TD21
Poly-tetrafluoroethene (PTFE) tubingEver Sharp Technology, Inc.TFT-23Tinner diameter, 0.51 mm; outer diameter, 0.82 mm

References

  1. Meacham, C. E., Morrison, S. J. Tumour heterogeneity and cancer cell plasticity. Nature. 501 (7467), 328-337 (2013).
  2. Vermeulen, L., et al. Single-cell cloning of colon cancer stem cells reveals a multi-lineage differentiation capacity. P Natl Acad Sci USA. 105 (36), 13427-13432 (2008).
  3. Shapiro, H. M. . Practical flow cytometry. , (2005).
  4. Leong, K. G., Wang, B. E., Johnson, L., Gao, W. Q. Generation of a prostate from a single adult stem cell. Nature. 456 (7223), 804-808 (2008).
  5. Shapiro, E., Biezuner, T., Linnarsson, S. Single-cell sequencing-based technologies will revolutionize whole-organism science. Nat Rev Genet. 14 (9), 618-630 (2013).
  6. Rettig, J. R., Folch, A. Large-scale single-cell trapping and imaging using microwell arrays. Anal. Chem. 77 (17), 5628-5634 (2005).
  7. Liu, J., et al. Soft fibrin gels promote selection and growth of tumorigenic cells. Nat Mater. 11 (8), 734-741 (2012).
  8. Charnley, M., Textor, M., Khademhosseini, A., Lutolf, M. P. Integration column: microwell arrays for mammalian cell culture. Integr. Biol. 1 (11-12), 11-12 (2009).
  9. Lindstrom, S., et al. High-density microwell chip for culture and analysis of stem cells. PloS one. 4 (9), e6997 (2009).
  10. Lin, C. H., et al. A microfluidic dual-well device for high-throughput single-cell capture and culture. Lab Chip. 15 (14), 2928-2938 (2015).
  11. Xia, Y. N., Whitesides, G. M. Soft lithography. Angew Chem Int Edit. 37 (5), 550-575 (1998).
  12. Shin, Y., et al. Microfluidic assay for simultaneous culture of multiple cell types on surfaces or within hydrogels. Nat Protoc. 7 (7), 1247-1259 (2012).
  13. Strober, W. Trypan blue exclusion test of cell viability. Curr. Protoc. Immunol. Appendix 3 (Appendix 3B), (2001).
  14. Lindstrom, S., Andersson-Svahn, H. Miniaturization of biological assays - Overview on microwell devices for single-cell analyses. Bba-Gen Subjects. 1810 (3), 308-316 (2011).
  15. Lecault, V., et al. High-throughput analysis of single hematopoietic stem cell proliferation in microfluidic cell culture arrays. Nat Methods. 8 (7), 581-593 (2011).
  16. Park, J. Y., et al. Single cell trapping in larger microwells capable of supporting cell spreading and proliferation. Microfluid Nanofluid. 8 (2), 263-268 (2010).
  17. Tirino, V., et al. Cancer stem cells in solid tumors: an overview and new approaches for their isolation and characterization. FASEB J. 27 (1), 13-24 (2013).
  18. Chen, P. C., Huang, Y. Y., Juang, J. L. MEMS microwell and microcolumn arrays: novel methods for high-throughput cell-based assays. Lab Chip. 11 (21), 3619-3625 (2011).
  19. Liang, P., et al. Drug Screening Using a Library of Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Reveals Disease-Specific Patterns of Cardiotoxicity. Circulation. 127 (16), 1677-1691 (2013).

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Explore More Articles

112 microfluidics

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Contact Us

Recommend to library

JoVE NEWSLETTERS

Research

Education

Authors

Librarians

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved