منذ اندلاع وباء مرض الفيروس التاجي الجديد ، تبدو طريقة بسيطة وفعالة مفيدة للحصول على تقسيم مناسب للآفات المرضية النموذجية لهذه العدوى في صور المسح المقطعي الصدري أساسية. وهكذا، هدفنا هو تقديم حزمة بداية من المعرفة من أجل السماح للناس أداء تجزئة سهلة وفعالة من هذه النتائج المرضية الرئة. ونأمل أن يساعد ذلك المجتمع العلمي على تطوير دراسات مخصصة للشعاع والذكاء الاصطناعي يمكن أن تحسن النهج التشخيصي لهؤلاء المرضى.
من متصفح DICOM من 3D Slicer ، انتقل إلى تحديد الدراسة التي تريد تقسيمها ، وانقر فوق تحميل. يمكنك مراجعة الحالة المحددة في قسم العارض. كما ترون، هذا المريض يقدم مع التعتيم الزجاج الأرض ثنائيا وتكسيخ المناطق على حد سواء، وهو حالة نموذجية من COVID-19.
ثم انتقل إلى المقطع الجزء، وإضافة ثلاثة أجزاء، واحد لمجموع حجم الرئة، واحد لالغموض الزجاج الأرض، واحد للمناطق الموحدة. انتقل إلى أداة العتبة، وتعيين العتبة العليا إلى ناقص 250 وحدة Hounsfield. فرز لتحديد الهواء فقط وترك خارج الأنسجة الرخوة والعظام والمناطق الموحدة على حد سواء، والتي لا يمكن أن النظام تمييز تلقائيا من الأنسجة الرخوة، ثم انقر فوق لتطبيق.
ثم، تريد إزالة الهواء خارج المريض، و للقيام بذلك، واستخدام أداة الجزيرة والذهاب إلى الجزيرة فقط الحفاظ على مختارة. ثم انقر داخل المريض. ترى أن الهواء في الخارج قد أزيل
الآن، تريد إضافة المناطق الموحدة إلى إجمالي حجم الرئة. للقيام بذلك، استخدم أداة الطلاء مع إعداد فرشاة Sphere، وضبط الحجم إلى احتياجاتك والحرص على تجنب الأنسجة الرخوة. مع فرشاة اسفير، يمكنك الطلاء صعودا وهبوطا فيما يتعلق شريحة كنت تعمل على، مما يسرع العملية.
الآن، تريد تقسيم المناطق الموحدة. للقيام بذلك، تأكد من أن تعمل داخل حجم الرئة الإجمالي دون مجموعة متنوعة من الأجزاء الأخرى. باستخدام أداة العتبة، رفع العتبة العليا للتأكد من أن تشمل الأنسجة الرخوة والدمج، وتعيين العتبة الأدنى إلى ناقص 250.
لاحظ أنك تقوم بتحديد كل من الأنسجة الرخوة والأوعية والدمج، ولكن عند النقر فوق تطبيق، تم تحديد مناطق موحدة فقط. الآن، لتجزئة مناطق الزجاج الأرضي، يمكنك تحديد قطعة الزجاج الأرض. حفظ الإعدادات من التجزئة السابقة، تعيين عتبة من ناقص 750 حتى ناقص 250 وحدة Hounsfield.
لاحظ أن هذه القيمة قد تختلف وفقا لإعدادات التصوير المقطعي. ضبط دائما وفقا لتعريف جمعية Fleischner من الزجاج الأرض. اختيار التعتيم مع أن السفينة مرئية في الأفق.
ثم انقر فوق تطبيق. ستلاحظ أنه تم أيضًا تحديد مساحات بينية. لضبط، انتقل إلى أداة السلس.
حدد أي مقعد يناسب أفضل خوارزمية البناء من الأشعة المقطعية الخاصة بك. وكما ترون، تمت إزالة المساحات الخلالية. يمكنك التحقق من نتائج التقسيم الخاص بك الانتقال إلى محرر المقطع، ويمكنك عرض نموذج ثلاثي الأبعاد من الشرائح التي قمت بتعريفها.
يمكنك استخدام شريط التمرير على الجانب الأيسر لضبط شفافية النموذج. يمكن استخدام طريقة العرض ثلاثية الأبعاد لتأكيد عملية التقسيم الصحيحة. لدينا الآن ثلاثة قطاعات متميزة، واحدة لمجموع حجم الرئة، والاثنان الآخران للنتائج النموذجية للتوحيد COVID-19 ومناطق الزجاج الأرضي.
يمكنك استخراج بعض الإحصائيات من المقطع الذي قمت بتعريفه بسبب الوحدة النمطية SegmentStatistics. قم بإزالة الخيار وحدة التخزين سكلار، ومن ثم لديك جدول يعبر عن حجم إجمالي الرئة والمناطق الموحدة ومناطق الزجاج الأرضي. يمكنك استخدام هذا لحساب شدة المرض.
يمكنك أيضاً تصدير الشريحة التي قمت بتحديدها. يمكنك الانتقال إلى قسم البيانات. ثم، جعل مرئية فقط الجزء الذي تريد تصدير، والنقر على أيقونة العين.
ثم انقر بزر الماوس الأيمن ثم تصدير صورة تسمية ثنائية مرئية فقط. يمكنك أن تبقى في تسمية كما تفضل. يجب عليك تكرار العملية لكل مقطع قمت بتعريفه.
بالقيام بذلك، لديك الآن ثلاث ملفات التسمية الموافقة إلى المقطع الذي قمت بتعريفه. يمكن تصدير هذا في أي نوع الملف الذي تفضله أو يناسب أفضل لتحليله. كما. مع هذه الطرق ، يمكن للباحثين الحصول بسرعة على تجزئة دقيقة للنتائج المرضية من COVID-19 التي يمكن استخراج ميزات محددة.
ويمكن، بتوفير هذه المعارف للمجتمع العلمي، وضع أساليب دقيقة مؤتمتة بالكامل للتجزئة وتحديد العوامل الدقيقة للتنبؤ.
