Desde el brote de la nueva pandemia de la enfermedad del coronavirus, un método simple y eficaz útil para obtener una segmentación adecuada de las lesiones patológicas típicas de esta infección en las imágenes de la tomografía computarizada del tórax parece fundamental. Por lo tanto, nuestro objetivo es ofrecer un paquete inicial de conocimiento con el fin de permitir a las personas realizar una segmentación fácil y eficiente de estos hallazgos patológicos pulmonares. Con suerte, esto ayudará a la comunidad científica a desarrollar estudios específicos de radiomómica e inteligencia artificial que podrían mejorar el enfoque diagnóstico de estos pacientes.
En el navegador DICOM de 3D Slicer, vaya a seleccionar el estudio que desea segmentar y haga clic en Cargar. Puede revisar el caso seleccionado en la sección del visor. Como se puede ver, este paciente presenta con opacidades de vidrio molido bilateralmente y áreas consolidativas por igual, que es un caso típico de COVID-19.
A continuación, vaya a la sección Segmento y agregue tres segmentos, uno para el volumen total de pulmón, otro para las opacidades del vidrio molido y otro para las áreas de consolidación. Vaya al instrumento Umbral y establezca el umbral superior en menos 250 unidadEs Hounsfield. Ordenar para seleccionar sólo aire y dejar fuera los tejidos blandos, huesos y áreas de consolidación por igual, que el sistema no puede discernir automáticamente de los tejidos blandos, a continuación, haga clic para aplicar.
A continuación, desea eliminar el aire fuera del paciente, y para hacerlo, utilice la herramienta Isla y vaya a Mantener sólo la isla seleccionada. A continuación, haga clic dentro del paciente. Ves que el aire exterior ha sido removido.
Ahora, desea agregar las áreas de consolidación al volumen total de pulmón. Para ello, utilice el instrumento De pintura con el ajuste Pincel de esfera, ajustando el tamaño a sus necesidades y teniendo cuidado de evitar el tejido blando. Con el pincel Esfera, pintas arriba y abajo con respecto a la rebanada en la que estás trabajando, lo que acelera el proceso.
Ahora, desea segmentar las áreas de consolidación. Para ello, asegúrese de estar trabajando dentro del volumen total del pulmón sin una variedad de otros segmentos. Usando el instrumento Umbral, suba el umbral superior para asegurarse de incluir los tejidos blandos y las consolidaciones, y establezca el umbral inferior en menos 250.
Tenga en cuenta que está seleccionando ambos tejidos blandos, recipientes y consolidación, pero al hacer clic en Aplicar, solo se han seleccionado áreas de consolidación. Ahora, para segmentar las áreas de vidrio de tierra, seleccione el segmento de vidrio molido. Manteniendo los ajustes de la segmentación anterior, establezca el umbral desde menos 750 hasta menos 250 unidadEs Hounsfield.
Tenga en cuenta que estos valores pueden variar según la configuración de la tomografía computarizada. Ajuste siempre de acuerdo con la definición de vidrio molido de la Sociedad Fleischner. Elija una opacidad con ese recipiente visible a la vista.
A continuación, haga clic en Aplicar. Observará que también se han seleccionado espacios intersticiales. Para ajustar, vaya al instrumento Suavizar.
Seleccione el asiento que mejor se adapte al algoritmo de construcción de su tomografía computarizada. Y como pueden ver, los espacios intersticiales han sido eliminados. Puede comprobar los resultados de la segmentación en el Editor de segmentos y puede ver un modelo 3D de los segmentos que ha definido.
Puede utilizar el control deslizante del lado izquierdo para ajustar la transparencia del modelo. La vista 3D se puede utilizar para confirmar el proceso de segmentación correcto. Ahora tenemos tres segmentos distintos, uno para el volumen total de pulmón, y los otros dos para los hallazgos típicos de consolidaciones COVID-19 y áreas de vidrio molido.
Puede extraer algunas estadísticas del segmento que ha definido debido al módulo SegmentStatistics. Retire la opción Volumen escalar y, a continuación, tiene una tabla que expresa el volumen del pulmón total y las áreas de consolidación y las áreas de vidrio de tierra. Puede utilizar esto para calcular la gravedad de la enfermedad.
También puede exportar el segmento que ha definido. Puede ir a la sección Datos. A continuación, haga visible solo el segmento que desea exportar, haciendo clic en el icono del ojo.
A continuación, haga clic con el botón derecho y exporte el mapa de etiquetas binario solo visible. Puede seguir siendo el mapa de etiquetas como prefiera. Debe repetir el proceso para cada segmento que haya definido.
Al hacerlo, ahora tiene tres mapas de etiquetas correspondientes al segmento que ha definido. Esto se puede exportar en el tipo de archivo que prefiera o se adapta mejor para un análisis posterior. Además. Con estos métodos, los investigadores pueden obtener rápidamente una segmentación precisa para los hallazgos patológicos de COVID-19 para los cuales se pueden extraer características específicas.
Proporcionar ese conocimiento a la comunidad científica, se pueden desarrollar métodos de segmentación precisos y totalmente automatizados y determinar factores de pronóstico precisos.
